The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
82
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structure length |
82
|
Chain Sequence |
NTQTVLPFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDRGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDRGNNRVVKLAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
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| molecule keywords |
Pizza2-SR protein
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| publication title |
Computational design of a self-assembling symmetrical beta-propeller protein.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
12
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-06-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WWB A; 5F53 A; 5CHB A; 3WWF A; 4ZCN A; 3WW7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FU7 A; 6GCH F; 1GBB A; 3WWB A; 5KED A; 2GV6 A; 1GI4 A; 4FUF A; 5HMA A; 3RUO A; 1HAO H; 1C1W H; 1FIW A; 3BIV H; 1P12 E; 3FN8 A; 1ZPC A; 1EAT A; 1JWT A; 1O2X A; 1AFQ B; 1UVT H; 1O2M A; 1RTK A; 3A7X A; 3MH6 A; 1RS0 A; 3HAT H; 3SOR A; 1GI5 A; 3QTV H; 1SLX B; 1QL8 A; 2VIQ A; 2DUC A; 3VB6 A; 3VGC C; 1ACB E; 2R3U A; 1C2G A; 1DDJ A; 1FIZ A; 3SV9 A; 4DIH H; 1GHY H; 1VIT F; 2P3F H; 3RU4 T; 1E37 B; 1YPH E; 2H5C A; 5HKK D; 1NRS H; 3BSQ A; 2I6Q A; 2ZHD A; 3A7Z A; 3IG6 B; 4IMQ A; 4BTU B; 4ABD A; 1GJ4 H; 1LCY A; 2GX4 A; 2ODQ A; 1W8B H; 1GMD G; 4X1N U; 3EA7 A; 1NM6 A; 7KME H; 2VBC A; 2KCP A; 5FX5 A; 1YLD A; 3ZVD A; 1C5S A; 4F49 A; 4OGY A; 4Y11 E; 4OS4 A; 1VGC C; 1V2S T; 1C1P A; 3SV2 H; 1ZTK A; 2J97 A; 1KMH B; 3OFN D; 3U28 C; 5ABW A; 1QB6 A; 1SGD E; 1QNJ A; 1GHV H; 4AFS A; 2FIR H; 4VGC B; 5L2Y H; 1PFX C; 3DA9 B; 5DG6 A; 1TGN A; 1GJ6 A; 1HBT H; 2A7H A; 4XFQ A; 4CRC A; 4BNR A; 1ID5 H; 2EI6 A; 1QTF A; 1N8O C; 2V3O H; 3RXU A; 1H9H E; 1HAG E; 1MKX H; 2QCY A; 3MH5 A; 1VCW A; 1DS2 E; 2OTV A; 1TQ0 B; 5JB8 S; 1UCY E; 2GZ8 A; 1RJX B; 1G32 B; 3WWF A; 4WY3 A; 1ZYO A; 2RCE A; 5F8Z A; 1E36 B; 4BAN B; 2VIO A; 2FS9 A; 3S9B A; 1E0F D; 8KME 2; 3RXR A; 1LHD H; 1RTF B; 1EAW A; 1O3G A; 1P2J A; 3RXC A; 1MTU A; 5DPA A; 1BMA A; 3MO9 A; 4GSO A; 5C5N A; 1HJA B; 2A0Q B; 3I78 A; 3MWI U; 1TRN A; 4JZE H; 4K3J A; 3U1J B; 1SGY E; 3SYJ A; 1C1Q A; 2LNC A; 2EC9 H; 4ASU D; 3GIS B; 5GPI B; 1RTL A; 3UNR A; 1L1N A; 1AN1 E; 1ZGV A; 3PV5 A; 4AFQ A; 5DP8 A; 3QGJ A; 2AHM E; 1WQV H; 4NWL A; 2F9U A; 2QAA A; 4I8H A; 3GCH B; 1UVO A; 1SSX A; 4X0W U; 1C2K A; 4YM9 A; 1EQ9 A; 2AH4 X; 4JYU H; 1FPC H; 2GMT C; 1TGT A; 1AB9 C; 2G51 A; 4D7G A; 1BRU P; 1TMB H; 2ZU4 A; 3A83 A; 4TY6 A; 4X2W A; 2GD4 B; 3UR6 A; 2R2M B; 4YES B; 3PV4 A; 2JIZ D; 1CSO E; 3F0O A; 3LDX H; 5JB9 S; 3GOV B; 1GCD A; 2A7C A; 2WV5 A; 4DY7 B; 4D7F A; 1MAB B; 1AD8 H; 3UTU H; 3GCO A; 4AGJ A; 3T26 A; 5EQQ A; 4Z6A H; 1O2S A; 2QF5 A; 3QK1 A; 4A5T S; 1H1B A; 3PTB A; 1QZ8 A; 1K0H A; 2GCH F; 1WUN H; 1O35 A; 2GT7 A; 1BJV A; 5JBB S; 4CBN A; 3F2F A; 1Z8I B; 3GYL B; 1GI9 B; 2D1J A; 1ZML A; 3BV9 B; 1DPO A; 1P2I A; 1TMU H; 1XKA C; 4Y8Y A; 2EY4 C; 3T5F H; 2VIW A; 1GJB B; 1O0D H; 2VH6 A; 1CA8 B; 2UUK B; 2FOM B; 3LKW A; 2J2U A; 3D65 E; 1FXY A; 4DVA U; 1PQ5 A; 1C2J A; 4TPY A; 4WF8 A; 2QC2 A; 1O2G H; 3HGN A; 4K8B A; 2O8W A; 5EQR A; 4NCY A; 2P93 A; 3UQO A; 2BQW B; 2BDC A; 2ZDA H; 1GVZ A; 2M2A A; 1TLD A; 2GTB A; 1CGJ E; 2EI8 A; 1MKW K; 5EXN A; 1FI8 A; 1MTN C; 1O2H A; 1SGT A; 1ELE E; 3A87 A; 4ISN A; 3V7T A; 4A1T A; 3U9A H; 2ZA5 A; 1BML A; 3M3V A; 3VB3 A; 3FVF B; 2UUY A; 5T3H A; 1NN6 A; 4FUE A; 3A84 A; 3PM3 A; 2W26 A; 1COW D; 3SU2 A; 3SUE A; 1OS8 A; 2B0F A; 2HWL B; 1GBI A; 3ZYD A; 4GCH F; 1TBR H; 5J4S A; 5ESB A; 3GCT G; 2LEL A; 2CV3 A; 1O33 A; 1T32 A; 1T8L A; 5FAH A; 1SGR E; 2ZPS A; 1FUJ A; 3MO3 A; 1Y5B T; 5A8Y A; 1EPT C; 2CF8 H; 2GP9 B; 3LC5 A; 5AF9 H; 1TGB A; 3PO1 C; 3TGI E; 3A80 A; 5C3N A; 3A85 A; 1TON A; 1IHS H; 3P17 H; 1IQH A; 1WYK A; 1HIA A; 1K1P A; 4DUR A; 4JMY A; 2W6J D; 1YPL H; 1BJU A; 3F0P A; 3TNS A; 5FBI A; 3SV8 A; 1WU1 A; 2TGA A; 1TWX B; 4BXW A; 1FY4 A; 3ZVE A; 1C5N H; 2FEQ H; 1L4D A; 4DII H; 4NSV A; 1U6Q A; 2A32 A; 2JET C; 1ETT H; 2BDB A; 2PSX A; 3NPS A; 1TPA E; 1ELA A; 2FS8 A; 4B6E A; 3RM2 H; 2OC0 A; 3Q3K A; 4TYD A; 1C4V 2; 4AFZ A; 3HGP A; 4NZQ A; 1MUE B; 1F2S E; 4BAQ B; 1B5G H; 3SU6 A; 1CA0 B; 3OY6 U; 4K5Z A; 2V3H H; 2ZHQ H; 1KXC A; 1SPJ A; 1O2U A; 2ZFQ H; 1NFY A; 1BTU A; 5FHT A; 5CHB A; 2ANW A; 2C8Z B; 4QT8 C; 1OWH A; 4FUG A; 5TCA A; 3TGK E; 1G37 A; 1O3B A; 2EEK A; 3ZZA A; 1LO6 A; 2Z6B D; 2RA3 A; 1SR5 C; 4AG2 A; 3UY9 A; 1HUT H; 1AWF H; 1O38 A; 3OYP A; 2JJ2 D; 1WBG B; 1UTM A; 1F5R A; 3F2G A; 3UOU A; 1EJM A; 3ITI A; 1Y3W A; 4MLF B; 1S83 A; 4B75 A; 1O2L A; 1C4U 2; 3QN7 A; 2V7Q D; 3E1X B; 1XUH A; 2WPD D; 5EJ1 A; 4D8N A; 1GJ7 B; 2QY0 B; 3RXB A; 1NC6 A; 2ZFP H; 3UWI A; 1G36 A; 2XND D; 1Q2W A; 1UK4 A; 1G3C A; 1GG6 C; 1SMF E; 2QXG A; 2RDE A; 3KN2 A; 1EUF A; 4FOU C; 5PTP A; 1O2T A; 3AW0 A; 2W7U A; 2BLO A; 2JJ1 D; 1LVO A; 2PW8 H; 3GY6 A; 3U8R H; 4FXG H; 4AB8 A; 1YWU A; 2H1U A; 3I29 A; 2A31 A; 2CHA B; 4Y0Z E; 3LON A; 5T6D A; 3FKS D; 2STB E; 5FBE A; 5GXP A; 2KZ4 A; 1AVW A; 5CMX H; 3LGT A; 4X6O A; 3RXQ A; 3PMJ A; 3RXJ A; 1FY3 A; 1GL0 E; 2ILN A; 2ZDK A; 3OU0 A; 1YCP H; 5FPY A; 1O2Y A; 1YY3 A; 3ZZ6 A; 3O8D A; 1MBQ A; 2GKV E; 1LHE H; 1SGN E; 3BEF B; 2AMP A; 4K2Y A; 1SLW B; 1SFQ B; 2FWW A; 2GCT B; 1AQ7 A; 4AG1 A; 1C2D A; 2BYA X; 1EKB B; 1WTH D; 2PKS B; 5DGJ A; 4CBO A; 5T6F A; 1BRB E; 1UTN A; 3P8F A; 5AHG H; 1ZSL A; 3E0P B; 2G5N A; 5A8X A; 1C5X B; 1NS3 A; 2PHB A; 3FO8 D; 2J98 A; 2GGV B; 4E7N A; 4FUC A; 3ZZ5 A; 1FLE E; 3O8B A; 4P02 A; 1HAH H; 2FP7 B; 1GI1 A; 2QF3 A; 1A46 H; 2CMY A; 5EXL A; 3B9F H; 2QA9 E; 5EQS A; 5F8T A; 5A0C A; 2RFK C; 2ZI2 H; 5EJZ A; 1QRW A; 4X2V A; 1Z8R A; 1HDT H; 3URE A; 1TYN A; 3TJV A; 1O3F A; 1PQ8 A; 1MCV A; 3PWC A; 1Y3X A; 2PKA A; 1Z7K A; 4RKJ B; 1C5Y B; 4X6N A; 1SQR A; 3T29 A; 5E2O A; 3ZZC A; 1WOF A; 1W3C A; 1W0J D; 2GDD A; 2WPI S; 2D8W A; 4CR5 A; 2FPZ A; 1MKX K; 1E1R D; 1P0S H; 3MU5 A; 9EST A; 2EI7 A; 2SGQ E; 1K2I 1; 1OP2 A; 3RXH A; 3SU0 A; 2G81 E; 1A0J A; 4CHA B; 4GAW A; 1W10 U; 2FOE A; 4O3U A; 3ZVC A; 4F48 B; 1VR1 H; 2WUB A; 2PWX A; 4HGC A; 4KGA A; 1FY8 E; 2XC5 A; 2C3S A; 3RXL A; 1EB1 H; 2ODP A; 3ODF A; 3SUD A; 2R9P A; 1H8D H; 1IQL A; 1SBW A; 4MQA A; 4NIV A; 1O5A B; 3MQK C; 1HB0 B; 4ZHA A; 1PQ7 A; 1QBO A; 1SGP E; 1W12 U; 2BVR H; 2AGG X; 2HPQ H; 3M7U A; 2ZG0 H; 3NXP A; 1C2M A; 3LIW A; 1GJ8 B; 2XNI A; 2AGE X; 1EOL A; 3RXE A; 1YPK H; 3HKJ B; 2Q6F A; 2OC8 A; 3KQD A; 3RXG A; 1GMH F; 4H6T A; 3BTK E; 1YPE H; 3LOX A; 1A5G H; 3H7O A; 3SGB E; 5AVD A; 5J4Q A; 1MAX A; 1WXR A; 1CGH A; 3TK6 A; 1F0T A; 1T8N A; 1TOC B; 1ETR H; 1GJ9 B; 1TMT H; 4ISO A; 2G52 A; 5GCH G; 4YOI A; 1SHH B; 2PSY A; 1Z8J B; 5G4B A; 1DUE A; 2BOK A; 2ZU3 A; 2W7S A; 4DCD A; 1Y59 T; 2BVX H; 1CU1 A; 2VID A; 1UCY K; 4K1E A; 2HGT H; 4K1T A; 2C8W B; 1Q3X A; 4I86 A; 1BHX B; 5LPR A; 1P10 A; 5H4I B; 4FUI A; 5JDU B; 5A09 A; 2Q6G A; 1UO6 A; 3LJO A; 1HJ8 A; 1GPZ A; 2HVX A; 4ZXX H; 2ANM H; 1TE0 A; 4DJZ B; 3TH3 H; 2F91 A; 3STI A; 1G2M A; 2R0L A; 2P16 A; 3S7K B; 3L3T A; 3M5M A; 3TJU A; 2FOB A; 1JMO H; 4IC6 A; 1KXE A; 2ZTY A; 2OD3 B; 2VB0 A; 1DLK B; 4X1S U; 1FZZ A; 3TPI Z; 1RIW C; 1O3P B; 2CK3 D; 3IWM A; 3T62 A; 1O2Q A; 2FMJ A; 4Q4L A; 5JBC S; 1GVK B; 2UUF B; 1XM1 A; 2A2Q H; 2FTM A; 1K1L A; 5BRR E; 2H9H A; 1EX3 A; 5C1Y A; 1O3H A; 1ZLR A; 3UQV A; 1H9I E; 4X1R U; 2F3C E; 1PPB H; 2VIP A; 1NFX A; 3QGN B; 1UK3 A; 1MH0 A; 1FQ3 A; 3CNR A; 3D62 A; 3RXA A; 3RP2 A; 4X8U H; 4TSF D; 1S6H A; 1EFR D; 3MNC A; 3KHV A; 3UPE A; 5DP9 A; 3GIC B; 1GDU A; 1V2K T; 3LT3 A; 2Y7Z A; 3GS9 A; 3ZVF A; 4AOR A; 4ZAE A; 3R3G B; 3ZIA D; 3P92 A; 1ZTJ A; 2FYQ A; 2VWN A; 3ZZ3 A; 1GJD B; 3KL6 A; 4RT0 A; 3LJJ A; 1BMF D; 3SU3 A; 2F9B H; 1Y5U T; 4R0I A; 2NU2 E; 2XBX A; 3V0X A; 2BQ7 B; 1YM0 A; 4I8G A; 3W1E A; 1ELT A; 4XOJ A; 2A4O A; 4FVD A; 2QN5 T; 3MMG A; 1P09 A; 3BG4 B; 3A8B A; 2WUC A; 4YT7 H; 1KIG H; 2Z3C A; 3TIU A; 1CHO G; 2QXH A; 5C94 A; 1EAS A; 4U2W A; 1CT2 E; 1DFP A; 1G3D A; 3BTM E; 3UFA A; 2ZDV H; 3UUZ A; 3KF2 A; 2ZDL A; 1GBT A; 3MNB A; 4MPX A; 1AIX H; 5EOD A; 6CHA B; 1EZQ A; 3A7Y A; 4Z1M D; 1QUR H; 1GMD F; 3M36 A; 4B76 A; 1C1V H; 1HAV A; 1O36 A; 1YKT A; 1O3E A; 1XUK A; 2WPJ S; 1BCU H; 2F83 A; 4BAM B; 1BBR E; 2WPK S; 1DY9 A; 4B73 A; 2GJG A; 2Y7X A; 1GI8 B; 1CGI E; 1O2R A; 3PRB A; 1KDQ A; 2UWP A; 2BB4 A; 3T28 A; 3TLO A; 1THP B; 2O9Q A; 1SGQ E; 1C5Q A; 3ENS B; 1ZJD A; 4JZF H; 2A4G A; 3E16 B; 2PTC E; 2J38 A; 1ZTL A; 3T2N A; 2OBO A; 1E79 D; 2C4F H; 4J1Y A; 2ZNK H; 1V2L T; 3KID U; 1UMA H; 2LP6 A; 1SHY A; 2EA3 A; 1BTH H; 2BZA A; 3MU1 A; 1LPK B; 1TNI A; 3ATM A; 4A7I B; 4GHT A; 4KTS A; 1ANC A; 3KQ5 A; 4Y0Y E; 1J15 A; 1NBM D; 4AYY B; 2D2D A; 5CHA B; 5A0A E; 1AFQ C; 1GBJ A; 2KAI B; 2PUQ H; 1F0U A; 5EST E; 1O5F H; 1BUI A; 4WXI A; 3U69 H; 1O34 A; 2AS9 A; 1O2J A; 2BDI A; 3SI3 H; 1KLI H; 1C2E A; 4TT3 D; 1FN6 A; 5CDF E; 3SJI A; 1C5L H; 4IS5 A; 2GT8 A; 4ABJ A; 3P8G A; 1QRX A; 3E6P H; 3BTT E; 1C5U A; 1GHA G; 1S85 A; 3H5C B; 3SJ8 A; 1YCP K; 4RN6 A; 2V0B A; 1YLN A; 2PP6 A; 2Y5G A; 5JPM H; 4HTC H; 4INH A; 2FOA A; 3EA8 A; 3ZVA A; 3MHW U; 1AZZ A; 4H6S B; 1FDP A; 3CS0 A; 1ZZZ A; 5EIY A; 2FLR H; 1QBV H; 2ALP A; 4DG4 A; 4ZUH A; 3WY8 A; 1NZQ H; 3M61 U; 6GCH G; 1N8O B; 1A7S A; 4VGC C; 3S9C A; 3M5N A; 4IN1 A; 5C20 A; 2ZWL H; 5F6M A; 4B2A A; 1DSU A; 2H9E H; 2ZIQ H; 5GIB A; 2P8O C; 2HOB A; 4FET A; 4UE7 H; 2Z3D A; 2IOT A; 1TAB E; 2ULL A; 2UUJ B; 1BOQ A; 3UIR A; 3F1S B; 1TB6 H; 2WPM S; 2NU3 E; 2BDY A; 4NG9 H; 1CQQ A; 3RXT A; 2OC1 A; 1NRN H; 1GCT B; 1P2Q A; 4FU8 A; 1O2O A; 1DY8 A; 3VEQ B; 2L74 A; 1L0Z A; 1GJA B; 1WQS A; 4FUH A; 1A4W H; 2XTT B; 2SFA A; 4XBD A; 1T4V H; 1IHT H; 2ANY A; 1C2F A; 1D3P B; 1TX8 A; 4BXS A; 2J98 B; 1S5S A; 2J4I A; 1NT1 A; 1MTV A; 2W3I A; 2ZFT A; 4UDW H; 4UFF H; 3LH3 A; 1LHF H; 2A4R A; 2W5E A; 2Z94 A; 1AKS A; 1W13 U; 4DGJ A; 1ETS H; 4ZKS U; 2A5I A; 2CXV A; 4TPI Z; 3SGA E; 2XRC A; 1J8A A; 2H2Z A; 2A1D B; 5DK1 A; 2STA E; 2Z9I A; 5FCK A; 2J9N A; 3A8D A; 3GDV A; 2C8X B; 1HPG A; 2GMT B; 1BTY A; 1UCY H; 2Y5H A; 4CRB A; 1AB9 B; 4Y8X A; 2PKA B; 4UEH H; 1Z71 A; 3GCH C; 1A1R A; 3K6Y A; 2FO9 A; 3PRO A; 4BAH B; 1BZX E; 4D9Q A; 4I33 A; 1HAX B; 3GCT F; 3RXF A; 4AN7 A; 1D3Q B; 2XW9 A; 3M35 A; 4SGA E; 1AMH A; 3EGK H; 2FOF A; 1VJA U; 2KFW A; 1T8M A; 3T27 A; 2WYG A; 2YNB A; 1C1S A; 1O2P A; 1P57 B; 2VVC A; 1MTS A; 1GBC A; 2M5T A; 3DHK H; 5EJL A; 1UVS H; 1CE5 A; 1XX9 A; 1DLE A; 3LU9 B; 5DN6 D; 1TBZ H; 1SQO A; 1C1R A; 1SGE E; 1ZHR A; 1V2N T; 1D6W A; 1Y5A T; 3EAJ A; 1HCG A; 1H8H D; 1K1I A; 1UTK A; 2F9V A; 1AFE H; 1IQI A; 1PPF E; 4WH8 A; 1GHX H; 2ZTZ A; 2BY5 X; 1V2W T; 1C1M A; 2H5D A; 4Y8Z A; 2ZPQ A; 3V12 A; 1UTJ A; 2TGP Z; 2YOL A; 1LVM A; 1OWJ A; 1MQ6 A; 3NKK A; 1Q31 A; 3SU1 A; 4NIX A; 3SQE E; 3SUF A; 4U32 A; 4UFE H; 3LGU A; 3L6P A; 1GI2 A; 3AAU A; 2ZQ1 A; 3MTY A; 1S6F A; 2SGF E; 3FP8 E; 2EST E; 1LDT T; 1LHC H; 4OM9 A; 2BX4 A; 5FL7 D; 1RGQ A; 1P3E A; 2VIV A; 2ZHF H; 1D3T B; 4O9V A; 5A8Z A; 2BMG B; 1CT4 E; 4GVU A; 5HGG A; 1J14 A; 4A6L A; 4F55 A; 2A7J A; 3VXF H; 3S69 A; 4CRA A; 3FZZ A; 3SV7 A; 1UW7 A; 3SN8 A; 3U8O H; 2B7D H; 1FN8 A; 2ASU B; 3RU4 D; 2Q1J A; 1EPT B; 2BD2 A; 1AND A; 1VZQ H; 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