3U5LA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a benzo-triazepine ligand (bzt-7)
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Benzodiazepines and benzotriazepines as protein interaction inhibitors targeting bromodomains of the BET family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3u5lA01
5I1QA 5DKCA 5ENFA 3AQAA 5DFDA 4QEUA 3UV2A 5F60A 1ZS5A 5LKTA 2E7NA 4YBTA 4LZSA 4UIYA 5KTUA 4UIVA 5IG6A 5FG5A 5LKXA 5FG6A 5E73A 5DY7A 5HJCA 5DFCA 5DYUA 5HRWA 4HXMA 5CQ6A 2OSSA 5EI4A 3SVHA 4YATA 5DYXA 4WIVA 5CUCA 5D3JA 5COIA 5AD2A 5G4RA 4TZ2A 4TYLA 5ENEA 4A9MA 4RVRA 3UV4A 5CUBA 4OUFA 3Q2FA 2DVRA 2RO1A 4ALGA 5ACYA 4QUUA 4UIWA 3LQIA 4YBSA 5EWCA 5ENJA 4Q0NA 3UVWA 4O77A 5A82A 3IU6A 4UYFB 5A5RA 4QYDA 2YW5A 1JM4B 3AADA 4QZSA 5CP5A 4J0RA 2RFJA 5LJ1A 5FE4A 3U5OA 4NRCA 3D7CA 3UVXA 5BT3A 2GRCA 5IGKA 5L99A 2YELA 3HMEA 5EPBA 4YYGA 3MB3A 4NYVA 4YK0A 5H85A 5C4QA 2E3KA 4LYWA 2NXBA 4NRAA 3NXBA 4J1PA 4FLPA 4O7EA 4YADA 4IR4A 5ETDA 5EISA 5CPEA 4C66A 4C67A 4HBXA 4PCIA 4N4FA 5L8UA 5HM0A 2OUOA 5FH6A 5HQ5A 4GPJA 4UYDA 3DWYA 2RNYA 2DWWA 5D25A 4KCXA 4Z1QA 5FB1A 3ONIA 5ENIA 5A83A 5HENA 5KHMA 5K29A 4UYEA 5CUEA 5E9IA 4XYAA 4A9JA 4YYDA 5EU1A 4MR5A 5HQ7A 2DVSA 4QYLA 4QB3A 5IIDA 4TQNA 5D24A 4J3IA 5C87A 4MR3A 5E9YA 2RS9B 5E7DA 5L97A 5CU8A 5FE6A 5CTLA 1JSPB 5TCMA 4MEOA 5CUDA 5I80A 5D26A 5H1UA 4UIZA 5E74A 3P5OA 4BW3A 4YYKA 3P1EA 3Q2EA 5A7CA 3MULA 4YYHA 4QSQA 5H1TA 5D3LA 2DATA 4CFKA 5C7NA 5FE5A 5DX4A 5D3PA 5KTXA 5I7YA 1WUMA 5FB0A 5CQTA 4MR6A 4TU4A 4NYXA 4TT2A 4HXNA 2WP1A 4O78A 3O34A 5DLXA 1E6IA 4AKNA 5II1A 5FBXA 4NR5A 5F1LA 4QR5A 5D3SA 4A9EA 1WUGA 4QUTA 4BW2A 4NR7A 5CS8A 5HFQA 3RCWA 5ETBA 5AD3A 5EICA 5DW1A 5BT5A 3S92A 3U5KA 3ZYUA 3O37A 3JVJA 5EA1A 4A9HA 5HQ6A 5D3RA 5BT4A 2R10A 4NQNA 4A9OA 5D3NA 3QZTA 5C85A 2WP2A 4HXRA 4QBMA 3P1CA 2DKWA 2YEMA 5KTWA 5EK9A 3U5LA 5CY9A 5DBMA 5LJ2A 5LVQA 4E96A 4TS8A 4O7AA 5DFBA 2YEKA 4TZ8A 4MEQA 5HEMA 4QY4A 3GG3A 2MJVB 5A5QA 4YC9A 5D3HA 1EQFA 2KTBB 2L85A 4HBYA 5CFWA 5EP7A 5C8GA 4O75A 4LC2A 2F6JA 5FFYA 1F68A 4IR5A 1N72A 3HMFA 5CUAA 4CL9A 3LJWA 5CQ3A 4QEVA 4Z6IA 5I83A 5F62A 4YBMA 5G4SA 3TLPA 4O7CA 5L8TA 5H1VA 4UITA 5EWWA 5LVRA 5IGNA 4CFLA 5EPRA 3HMHA 4HXOA 5FG4A 2RNWA 4BJXA 5DW2A 4YABA 2D82A 3UW9A 4YYIA 4Z1SA 5A5OA 4NR8A 5E9MA 2I7KA 5AMEA 4Y03A 3UVYA 4CUTA 4HBWA 3MUKA 3SVFA 2D9EA 3K2JA 5F63A 5EV9A 5HELA 2I8NA 4TU6A 4Z93A 5L98A 5ENGA 5E3DA 4UYHA 4LDFA 4X2IA 3JVLA 5ENCA 4NR4A 4QSSA 4PCEA 4IR3A 4QSXA 4F3IA 4MEPA 4MR4A 5CQ7A 5FE8A 2L84A 4TT4A 2YQDA 5HLSA 5CQAA 4YY4A 4PTBA 5I89A 5EGUA 3P1DA 4QR4A 5EWVA 4Q0OA 5EQ1A 3U5MA 4YYMA 3U5PA 5HFRA 4CUSA 3MB4A 5ENHA 4KV4A 4PKLA 5FFVA 4NUEA 5E9KA 5IBNA 5A85A 4IR6A 4O71A 4O74A 4HXKA 5CQ4A 5JI8A 3P1FA 5F61A 4LYSA 3DAIA 4O7BA 2H60A 5II2A 5I29A 5FE3A 5CGPA 5JWMA 5A5NA 3G0JA 5KO4A 5FH7A 4QC1A 4YY6A 2R0SA 3S91A 3O35A 4LZ2A 3UV5A 4O76A 5CUGA 2LSPB 2R0VA 4HXSA 4NR9A 4UIUA 3UVDA 2OO1A 3U5JA 4BW4A 4XY9A 5CQ5A 4CLBA 4QSTA 5DKDA 5TB6A 4NXJA 4YYJA 4XY8A 4ZW1A 4UIXA 5FFWA 5DYAA 3SVGA 4NR6A 5D3TA 4CURA 4YH4A 3G0LA 4A9NA 4QSWA 4TT6A 5EWDA 2L5EA 4O70A 4YH3A 5LKZA 4A9KA 4TTEA 5A81A 2YDWA 5FDZA 5EWHA 5FE7A 4QSPA 4PY6A 4UYGA 5AMFA 3LXJA 4BHWA 4LZRA 3MQMA 4IORA 5I88A 4N4IA 5CQ8A 4NUDA 4UYFA 5E9LA 4ZQLA 2E7OA 5D0CA 4OGJA 4NUCA 4QR3A 5F1HA 5HRVA 4N4GA 5ENBA 3LQJA 4LRGA 3FKMX 4NRBA 4O7FA 4HXLA 5E3GA 3QZSA 4IOOA 5F3AA 4N4HA 4LYIA 4MENA 4YAXA 5EVAA 4QSVA 3O33A 5HRXA 1X0JA 4YYNA 3LQHA 5DKHA 5EM3A 4NS5A 4IOQA 2RNXA 5IGMA 4CUPA 4ALHA 3I3JA 4CUUA 4NQMA 5F25A 5FE0A 4QSRA 5LUUA 4PS5A 5A5SA 5FH8A 5A5PA 5LJ0A 3U5NA 4ZC9A 5KU3A 5LKUA 5DLZA 4XUAA 4NYWA 5I86A 5I7XA 5CRMA 5HCLA 2DVQA 2R0YA 2G4AA 3MXFA 5C89A 5FE1A 2N9GA 5F36A 5F5ZA 4A9FA 4BW1A 4KV1A 5E0RA 2FSAA 4QC3A 3QZVA 4DONA 2RI7A 4A9IA 2DVVA 4XUBA 5DYCA 4WHUA 5CZGA 3O36A 5CRZA 4CUQA 5D7XA 4QNSA 4HBVA 4A9LA 5EPSA 4HXPA 3IU5A 4J0SA 4LR6A 3JVMA 4QSUA 5F2PA 4N3WA 5L96A 4O72A 4Z6HA 5E9VA 3JVKA 2YYNA 5FE9A 4QEWA 5IGLA 5FE2A 4OGIA 2F6NA 5J0DA 4WHWA 5I40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I1QA 5DKCA 5ENFA 3AQAA 5DFDA 4QEUA 3UV2A 5F60A 1ZS5A 5LKTA 2E7NA 4YBTA 4LZSA 4UIYA 5KTUA 4UIVA 5IG6A 5FG5A 5LKXA 5FG6A 5E73A 5DY7A 5HJCA 5DFCA 5DYUA 5HRWA 4HXMA 5CQ6A 2OSSA 5EI4A 3SVHA 4YATA 5DYXA 1PUOA 4WIVA 5CUCA 5D3JA 5COIA 5AD2A 5G4RA 4TZ2A 4TYLA 5ENEA 4A9MA 4RVRA 3UV4A 5CUBA 4OUFA 3Q2FA 2DVRA 2RO1A 4ALGA 2EJNA 5ACYA 4QUUA 4UIWA 3LQIA 4YBSA 5EWCA 5ENJA 4Q0NA 3UVWA 4O77A 5A82A 3IU6A 4UYFB 5A5RA 4QYDA 2YW5A 1JM4B 3AADA 4QZSA 5CP5A 4J0RA 2RFJA 5LJ1A 5FE4A 3U5OA 4NRCA 3D7CA 3UVXA 5BT3A 2GRCA 5IGKA 5L99A 2YELA 3HMEA 5EPBA 4YYGA 3MB3A 4NYVA 4YK0A 5H85A 5C4QA 2E3KA 4LYWA 2NXBA 4NRAA 3NXBA 4J1PA 4FLPA 4O7EA 4YADA 4IR4A 5ETDA 5EISA 5CPEA 4C66A 4C67A 4HBXA 4PCIA 4N4FA 5L8UA 5HM0A 2OUOA 5FH6A 5HQ5A 4GPJA 4UYDA 3DWYA 2RNYA 2DWWA 5D25A 4KCXA 4Z1QA 5FB1A 3ONIA 5ENIA 5A83A 5HENA 5KHMA 5K29A 5CUEA 4UYEA 5E9IA 4XYAA 4A9JA 4YYDA 5EU1A 4MR5A 5HQ7A 2DVSA 4QYLA 4QB3A 5IIDA 4TQNA 5D24A 4J3IA 5C87A 4MR3A 5E9YA 2RS9B 5E7DA 5L97A 5CU8A 5FE6A 5CTLA 1JSPB 5TCMA 4MEOA 5CUDA 5I80A 5D26A 5H1UA 4UIZA 5E74A 3P5OA 4BW3A 4YYKA 3P1EA 3Q2EA 5A7CA 3MULA 4YYHA 4QSQA 5H1TA 5D3LA 2DATA 4CFKA 5C7NA 5FE5A 5DX4A 5D3PA 5KTXA 5I7YA 1WUMA 5FB0A 5CQTA 4MR6A 4TU4A 4NYXA 4TT2A 4HXNA 2WP1A 4O78A 3O34A 5DLXA 1E6IA 4AKNA 5II1A 5FBXA 4NR5A 5F1LA 4QR5A 5D3SA 4A9EA 1WUGA 4QUTA 4BW2A 4NR7A 5CS8A 5HFQA 3RCWA 5ETBA 5AD3A 5EICA 5DW1A 4AKGA 5BT5A 3S92A 3U5KA 3ZYUA 3O37A 3JVJA 5EA1A 4A9HA 5HQ6A 5D3RA 5BT4A 2R10A 4NQNA 4A9OA 5D3NA 3QZTA 5C85A 2WP2A 4HXRA 4QBMA 3P1CA 2DKWA 2YEMA 5KTWA 5EK9A 3U5LA 5CY9A 5DBMA 5LJ2A 5LVQA 4E96A 4TS8A 4O7AA 5DFBA 2YEKA 4TZ8A 4MEQA 5HEMA 4QY4A 3GG3A 2MJVB 5A5QA 3VKGA 3ERRA 5D3HA 4YC9A 1EQFA 2KTBB 2L85A 3D1BA 4HBYA 5CFWA 5EP7A 5C8GA 4O75A 4LC2A 2F6JA 5FFYA 1F68A 4IR5A 1N72A 3HMFA 5CUAA 4CL9A 3LJWA 5CQ3A 4QEVA 4Z6IA 5I83A 5F62A 4YBMA 5G4SA 3TLPA 4O7CA 5L8TA 5H1VA 4UITA 5EWWA 5LVRA 5IGNA 4CFLA 5EPRA 3HMHA 4HXOA 5FG4A 2RNWA 4BJXA 5DW2A 4YABA 2D82A 3UW9A 4YYIA 4Z1SA 5A5OA 4NR8A 5E9MA 2I7KA 5AMEA 4Y03A 3UVYA 4CUTA 4HBWA 3MUKA 3SVFA 2D9EA 3K2JA 5F63A 5EV9A 5HELA 2I8NA 4TU6A 4Z93A 5L98A 5ENGA 5E3DA 4UYHA 4LDFA 4X2IA 3JVLA 5ENCA 4NR4A 4QSSA 4PCEA 4IR3A 4QSXA 4F3IA 4MEPA 4MR4A 5CQ7A 5FE8A 2L84A 4TT4A 2YQDA 5HLSA 5CQAA 4YY4A 4PTBA 5I89A 5EGUA 3P1DA 4QR4A 5EWVA 4Q0OA 5EQ1A 3U5MA 4YYMA 3U5PA 5HFRA 3VKHA 4CUSA 3MB4A 5ENHA 4KV4A 4PKLA 5FFVA 4NUEA 5E9KA 5IBNA 5A85A 4IR6A 4O71A 4O74A 4HXKA 5CQ4A 5JI8A 3P1FA 5F61A 4LYSA 3DAIA 4O7BA 2H60A 5II2A 5I29A 5FE3A 5CGPA 5JWMA 5A5NA 3G0JA 5KO4A 5FH7A 4QC1A 4YY6A 2R0SA 3S91A 3O35A 4LZ2A 3UV5A 4O76A 5CUGA 2LSPB 2R0VA 4HXSA 4NR9A 4UIUA 3UVDA 2OO1A 3U5JA 4BW4A 4XY9A 5CQ5A 4CLBA 4QSTA 5DKDA 5TB6A 4NXJA 4YYJA 4XY8A 4ZW1A 4UIXA 5FFWA 3D1DA 5DYAA 3SVGA 4NR6A 5D3TA 4CURA 4YH4A 3G0LA 4AKIA 4A9NA 4QSWA 4TT6A 5EWDA 2L5EA 4O70A 4YH3A 5LKZA 4A9KA 4TTEA 5A81A 2YDWA 5FDZA 5EWHA 5FE7A 4QSPA 4PY6A 4UYGA 5AMFA 3LXJA 4BHWA 4LZRA 3MQMA 4IORA 5I88A 4N4IA 5CQ8A 4NUDA 4UYFA 5E9LA 4ZQLA 2E7OA 5D0CA 4OGJA 4NUCA 4QR3A 5F1HA 5HRVA 4N4GA 5ENBA 3LQJA 4LRGA 3FKMX 4NRBA 4O7FA 4HXLA 5E3GA 3QZSA 4IOOA 5F3AA 4N4HA 4LYIA 4MENA 4YAXA 5EVAA 4QSVA 3O33A 5HRXA 1X0JA 4AKHA 4YYNA 4AI6A 3LQHA 5DKHA 5EM3A 4NS5A 4IOQA 2RNXA 5IGMA 4CUPA 4ALHA 3I3JA 4CUUA 4NQMA 5F25A 5FE0A 4QSRA 5LUUA 4PS5A 5A5SA 5FH8A 5A5PA 5LJ0A 3U5NA 4ZC9A 5KU3A 5LKUA 5DLZA 4XUAA 4NYWA 5I86A 5I7XA 5CRMA 5HCLA 2DVQA 2R0YA 2G4AA 3MXFA 5C89A 5FE1A 2N9GA 5F36A 5F5ZA 4A9FA 4BW1A 4KV1A 5E0RA 2FSAA 4QC3A 3QZVA 4DONA 2RI7A 4A9IA 2DVVA 4XUBA 5DYCA 4WHUA 5CZGA 3O36A 5CRZA 4CUQA 5D7XA 4QNSA 4HBVA 4A9LA 5EPSA 4HXPA 3IU5A 4J0SA 4LR6A 3JVMA 4QSUA 5F2PA 4N3WA 5L96A 4O72A 4Z6HA 5E9VA 3JVKA 2YYNA 5FE9A 4QEWA 5IGLA 1ZKRA 4OGIA 2F6NA 5FE2A 5J0DA 4WHWA 5I40A
chains in the Genus database with same CATH topology
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