4YY6A

Crystal structure of brd9 bromodomain bound to a butyryllysine peptide
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
publication title A Subset of Human Bromodomains Recognizes Butyryllysine and Crotonyllysine Histone Peptide Modifications.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yy6A00
2RS9B 4KV1A 5E9LA 4BW2A 5CU8A 5EVAA 3S92A 4ZC9A 2RNYA 5FH8A 4NUEA 4UYEA 4YYDA 5F5ZA 5E9MA 4QY4A 5D3HA 4QYDA 2YELA 3LJWA 4UYFA 4YAXA 2YQDA 5CRZA 4IOOA 5E3DA 5HRVA 4NYVA 2YYNA 3NXBA 5KTUA 4O70A 3P5OA 4WHUA 5FE1A 5I1QA 5FE9A 5DY7A 5EISA 5DYAA 5CQ4A 4LZ2A 4ALHA 5HRXA 5LUUA 3HMFA 2RO1A 5I7YA 4TZ8A 5CUEA 5FE3A 4J0RA 2DATA 5H1VA 3P1CA 2F6JA 2I7KA 5F3AA 4C66A 4HBVA 5ACYA 4QYLA 4HXRA 4NUDA 4O75A 5ENEA 5EWHA 4A9NA 3O37A 5D24A 5FE5A 4Z6IA 4NUCA 4O76A 5CQ7A 3FKMX 5CZGA 4IOQA 5A5OA 4ALGA 5HQ5A 5HRWA 4MR6A 4LC2A 5HCLA 4NYXA 1N72A 4O7CA 5D25A 4QC3A 5A81A 3LQIA 3DAIA 5DLXA 4UIVA 5F63A 3O33A 4KCXA 5FH6A 5CGPA 4UYDA 5FG5A 5D26A 5A5PA 5DYXA 5L98A 5KO4A 4A9HA 5D3TA 2DVSA 5EWDA 2YEKA 4YBMA 5LJ0A 5FG4A 5ETBA 5E9KA 4YYMA 2OO1A 4TT2A 5J0DA 5ENHA 4QR3A 5DW1A 5DW2A 4HXMA 4HBWA 5ENBA 5A5NA 4UIXA 5EV9A 3ONIA 3MUKA 4TT6A 1X0JA 4QSUA 3U5MA 5CS8A 3QZVA 3O34A 4C67A 4TYLA 5EICA 5IIDA 4A9OA 3U5NA 4IR3A 2GRCA 3IU6A 4CFLA 5BT4A 4LZRA 4HXLA 5CPEA 4YK0A 2E3KA 5IGNA 5F25A 5JI8A 4N4GA 4YADA 2YEMA 1EQFA 3P1FA 3AQAA 4O7BA 4IR4A 4QEVA 5D0CA 5H85A 5LKZA 4TU6A 2DWWA 2RI7A 5DYUA 5IGKA 4TS8A 5KHMA 4ZW1A 5HFQA 4HXKA 5CQ3A 5A5QA 5E73A 5DX4A 4J1PA 4TT4A 2WP1A 4HBXA 4LR6A 3UV2A 5G4RA 1JSPB 5I83A 5ENFA 5F1LA 4A9JA 4UIZA 5I80A 2F6NA 4O77A 5L97A 4J3IA 5LKTA 4NR6A 4O7FA 4UITA 5E9VA 3JVMA 4NYWA 5DFDA 4O72A 5FBXA 4QSSA 5FB0A 4BW1A 3JVKA 5I86A 5EK9A 4MR3A 5F62A 5CUGA 5CUDA 3UVXA 4QSXA 5LJ1A 4CFKA 4Z93A 4YY4A 4NR4A 3UVWA 4OGIA 5CY9A 4BJXA 4LYSA 4QSWA 5FFVA 5FE7A 4MEOA 4IR6A 4QSVA 3UV5A 5IGLA 5HFRA 5KTXA 5CQAA 5F36A 4A9IA 5F2PA 4HBYA 4UIYA 5E7DA 2R10A 5KTWA 4OGJA 4XY8A 5II1A 4NXJA 1F68A 4Z1QA 4YC9A 2LSPB 3O36A 4YBSA 4PCEA 4QC1A 5E3GA 5FE6A 5DKHA 4QEWA 5HM0A 5FFWA 3SVGA 4NR9A 5CUBA 5FE8A 2DVVA 4YATA 1ZS5A 4HXOA 2E7OA 5ENIA 5L99A 2DVRA 2D82A 5F61A 4IORA 2YDWA 4Q0NA 4UIWA 4QNSA 2DVQA 4YYHA 5C89A 4BW3A 4O74A 5KU3A 5CP5A 2NXBA 5FH7A 4YYIA 5BT5A 5EPRA 5AMFA 4QR5A 4PCIA 4PTBA 4O78A 5FB1A 4YYGA 5A85A 5FE2A 2N9GA 3SVFA 4CLBA 4ZQLA 5D3LA 4YYNA 5JWMA 4QR4A 4XUBA 5DKCA 4CUUA 3SVHA 5D7XA 3ZYUA 4CURA 3GG3A 4QZSA 3G0LA 5LVRA 2L5EA 4A9FA 4AKNA 5CUAA 4PS5A 4LZSA 3MULA 2YW5A 4O7AA 5CQ6A 5EQ1A 2MJVB 4NR8A 4LYIA 4Z6HA 5LKXA 4TTEA 5ENCA 2RNWA 4J0SA 5DKDA 3MQMA 2FSAA 5E74A 4Z1SA 5ENGA 5C85A 3QZSA 5C8GA 4QSQA 4UYFB 3HMHA 3UW9A 5I40A 5IG6A 5I88A 5E9YA 4NRAA 5E0RA 3QZTA 4HXNA 4WIVA 2G4AA 4HXPA 4NRCA 5LVQA 4Y03A 3UV4A 5EPBA 1WUGA 4BW4A 5LKUA 3LXJA 4QUTA 3JVLA 5CRMA 5D3NA 5EI4A 5LJ2A 5D3SA 2WP2A 3U5OA 5A83A 5L96A 3MXFA 3UVDA 5K29A 4NR7A 2R0SA 4X2IA 5L8UA 4NRBA 4Q0OA 5CFWA 4TQNA 2RNXA 4N4HA 4O71A 5FDZA 5I29A 4YH4A 3AADA 4N3WA 2KTBB 4YH3A 5H1TA 3U5LA 5CQ8A 4YYJA 5A82A 5CQTA 4TZ2A 5EWVA 3HMEA 4BHWA 5HQ7A 4OUFA 3U5PA 3K2JA 4KV4A 4QSTA 4LDFA 5G4SA 4QSPA 5DFCA 5A7CA 2DKWA 4GPJA 5CQ5A 5AD3A 5AD2A 4UYHA 5HJCA 4QEUA 5DFBA 4YY6A 4NQNA 4N4FA 2OUOA 5II2A 5HENA 3JVJA 3MB4A 5BT3A 4MEQA 5FE4A 5HELA 5FG6A 5FFYA 5EWWA 5DBMA 5ENJA 4A9LA 5TCMA 4YYKA 4QSRA 3DWYA 5D3RA 5EU1A 1WUMA 3IU5A 4PY6A 3U5JA 3LQJA 5C4QA 3RCWA 5EP7A 4CUSA 4MR5A 4WHWA 2E7NA 3Q2FA 4RVRA 5IGMA 5A5RA 5FE0A 5EM3A 5IBNA 5TB6A 5C87A 3MB3A 4QB3A 5EGUA 5CTLA 5HLSA 5COIA 4TU4A 5H1UA 4A9EA 2H60A 4CUPA 3D7CA 4XY9A 3I3JA 5DLZA 3LQHA 4FLPA 4MR4A 4QBMA 5EA1A 2RFJA 5A5SA 4CUTA 3TLPA 2OSSA 4A9MA 4NR5A 1E6IA 5D3JA 4N4IA 5HQ6A 1JM4B 3UVYA 2I8NA 5EWCA 4LYWA 4NS5A 4UIUA 4UYGA 4E96A 5AMEA 4NQMA 3S91A 4YBTA 4MEPA 5E9IA 5EPSA 4CL9A 3Q2EA 2L84A 3O35A 5L8TA 3G0JA 4PKLA 2D9EA 5F1HA 3P1EA 3P1DA 4XYAA 2R0VA 5D3PA 5I7XA 2L85A 4XUAA 4CUQA 5F60A 5CUCA 2R0YA 4QUUA 5DYCA 5C7NA 4F3IA 4HXSA 4DONA 4YABA 4IR5A 4O7EA 5ETDA 4A9KA 5HEMA 5I89A 3U5KA 4MENA 4LRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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