4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
4QSQA 5D24A 5FE3A 5KCHA 5KE3A 4A9NA 3SVHA 3QZVA 3OYBA 4BW1A 3P1EA 4MENA 3DWYA 5FE7A 3OYLA 4ZTFA 4Z6HA 4NRBA 4QSPA 4PCIA 5EPRA 4YABA 4YYHA 5FRMA 5L98A 3F70A 2IG0A 2QQSA 5I89A 3QBYA 5L99A 4YADA 4LYSA 3O35A 4TTEA 5A5QA 4QEWA 4QR3A 5EVAA 5FG4A 2EKOA 2QQRA 2PQWA 5CUGA 4HXOA 5CUAA 5FE4A 4QR5A 5I83A 2GFAA 4IUUA 5D6XA 2EQUA 5F25A 2YW5A 4HBWA 1OZ3A 2D82A 5FE9A 2O4XA 5E0RA 2E7NA 3QZSA 5HRVA 4HXMA 4HBXA 4Q0NA 5F2PA 2M0OA 3DAIA 4O74A 5TCMA 4QEVA 5F3AA 3AADA 4NS5A 5FG6A 2RI7A 2RFJA 1X0JA 4NR9A 3OYDA 5A85A 3HMEA 4UITA 4YBMA 4UC4A 2DAQA 4LZRA 5CUCA 5F63A 3LH0A 2RI5A 4N3WA 4TU6A 3P8DA 4PY6A 3U5NA 3QZTA 3UW9A 4N4IA 4J0RA 5CUDA 5HQ6A 3JVLA 2K3XA 2E3KA 4YC9A 4QUUA 5DLXA 4LDFA 5CQ5A 4NR6A 2LCCA 4XYAA 5C7NA 4YBSA 5LKUA 2X4WA 3H6ZA 5HFQA 5E7DA 3OYIA 2DKWA 4QYLA 4YATA 4PKLA 3RCWA 3O33A 3U5LA 4ZTJA 4CL9A 5D3JA 2L89A 5J26A 2D9EA 5KCOA 5F62A 2M1HA 4CURA 3SVGA 5C89A 3OYGA 3JVJA 5LUUA 2RNXA 5KO4A 4O70A 5ETBA 4CFLA 2H60A 4IR6A 4X34A 4NYWA 3PFSA 5D25A 5KH6A 5CGPA 5F60A 4N4FA 3L42A 5KU3A 4QR4A 1WJRA 4QVZA 2LSPB 4Q5WA 4QC3A 5LKTA 4E7HA 5DY7A 4HBVA 4J3IA 4NYXA 2E6NA 2XDPA 4A4HA 1ZS5A 5A5NA 4A4FA 3UV4A 5DBMA 3UV5A 5I80A 5H1TA 4CUUA 5FE5A 4NXJA 4O7CA 5E9KA 5D7XA 1WJQA 3OMGA 2BKDN 2RJDA 4QSVA 3PNWC 2X4YA 5D3NA 5ENGA 5A5PA 3G0LA 5EU1A 5DFCA 5K29A 2B8AA 4A4GA 1OYXA 4Z02A 5F1HA 5A82A 3OY9A 5E9IA 1MHNA 4PLIA 5EISA 4BHWA 4ZC9A 3S3MA 5CY9A 4CRIA 4C5HA 4NR8A 2L84A 5E74A 3FLGA 5J0DA 5TB6A 1OZ2A 3MQMA 5H1VA 4C5EA 5F61A 3P1DA 5D3RA 2MWPA 2DWWA 4BE0A 5DYUA 4IR4A 4NUCA 2RNWA 5KTWA 5LJ2A 3MP8A 2D9TA 3OYHA 2KTBB 5FE8A 5DYAA 3UVDA 5AD2A 3OS1A 5FDZA 3EAEA 4TU4A 5EV9A 5FB0A 3META 5DFDA 4QQGA 5KE2A 4L59A 5CZGA 4NQNA 2RHZA 5G4RA 5ENCA 4O78A 2BIVA 5F36A 2YEKA 4MR5A 1WUMA 3U5PA 5EWWA 4BE1A 2LVMA 3MP6A 5CQ6A 4NR5A 5D3TA 4CUSA 1RI0A 3S6WA 3G0JA 5D0CA 3JVKA 5IGMA 5CUBA 5C4QA 2R58A 3LGFA 3FEOA 5D3LA 3OYKA 5HCLA 1SSFA 4LYWA 4RVRA 4E7KA 4MR3A 5EPSA 5CUEA 5FFWA 5HEMA 5JI8A 5DX4A 3TLPA 4A9EA 4LD6A 2MWOA 5L8TA 2R10A 3LLRA 4F3IA 4ZW1A 5II1A 4C66A 5ACYA 3ASKA 5AD3A 4YY6A 2VYTA 2DVSA 4LZSA 5DW1A 2R0SA 4BJXA 4QSWA 4NRCA 5FFVA 5LJ0A 5FE2A 4NQMA 5DKHA 4DONA 3L2QA 4WHWA 4HXLA 5EWDA 2RO1A 5HQ7A 5E9MA 4QUTA 3E9GA 3MO8A 5FE0A 4OUFA 5CS8A 4IUQA 5F1LA 2RI3A 1WGSA 5HENA 4IOQA 4XY9A 4QW2A 2R0YA 1N27A 2MJVB 5LVRA 3DB3A 4NYVA 3L2UA 4XUBA 5IGNA 3OB9A 4PS5A 3OYCA 5CRMA 4O72A 5HM0A 4QYDA 3QKJA 3LXJA 4HXPA 3P8HA 4WIVA 4X2IA 5AMEA 4HXRA 2N9GA 3MXFA 5FH8A 3DLMA 3NTKA 2DIGA 5EI4A 2L85A 2FHDA 3IU6A 4MEPA 4IR5A 5D6WA 4BW4A 4UIYA 4YH3A 5I86A 5EICA 5C85A 3C4SA 4PLLA 5I88A 4QB3A 4ALGA 4TT6A 2YYNA 4KV1A 3FDRA 5DKDA 5FH6A 2E7OA 4QSUA 2GFUA 4FL6A 2F5KA 4A9OA 4O71A 5AMFA 3HMFA 5E3DA 5A5RA 5BT5A 5LKZA 5COIA 4TS8A 5HRWA 2RJFA 4B9WA 5HFRA 2RHIA 5DYCA 5KHMA 5ENBA 5EPBA 3L2WA 5IN1A 4BW2A 4HBYA 1JSPB 5C0MA 4FLPA 2L3RA 5F5ZA 5H85A 3OS2A 3LJWA 3OYAA 4NUDA 4O7AA 2DVQA 5DYXA 3UV2A 4O76A 5G4SA 2GRCA 4ALHA 2WP2A 4O77A 4OGJA 3I3JA 2NXBA 5ENHA 4CFKA 4E7LA 5FE1A 2HQXA 3U5KA 4BDZA 4TT4A 4MR6A 2E5QA 3GG3A 4YBTA 2EQJA 3Q2EA 4A9LA 5BT3A 5A83A 4QZSA 4O7BA 3UVXA 4LRGA 4A9MA 2FSAA 4AKNA 4QSSA 4LZ2A 5D3SA 5DKCA 3P5OA 3OMCA 4A9IA 3SD4A 3O34A 3LGLA 3MB4A 5ENFA 3MEVA 4J1PA 3PMTA 5CFWA 3UVYA 3S92A 4IURA 5IIDA 3UT1A 4IUVA 4GY5A 3AQAA 2G3RA 3L2VA 3LX7A 4QNSA 3H8ZA 4UIWA 3NTIA 3OYNA 3MULA 4QQDA 3OYJA 2EFIA 4MR4A 2JZ2A 5CIUA 2I8NA 3BDLA 2X35A 2LRQA 2YELA 2R5AA 4CUQA 5E3GA 1XNIA 4Z6IA 4YAXA 5CTLA 3DB4A 5IG6A 4UYEA 4YYGA 3LQIA 4QSRA 4Q0OA 3ZYUA 5C6SA 5DFBA 4J0SA 5CU8A 2DIQA 3MUKA 4MEOA 4C67A 5FB1A 5ETDA 2NLUA 1KHCA 2RJCA 3PMIA 4KCXA 3IU5A 4GPJA 3OQ5A 2GF7A 5E9VA 3LQJA 4HXSA 3U5MA 3ONIA 3KUFA 4UYFB 3OYEA 1E6IA 4TZ2A 3O36A 1N72A 5D3HA 5EWCA 1JM4B 2RHUA 4QSTA 4OVAA 2HQEA 1EQFA 4UYDA 4RG2A 4O75A 5ENIA 2DATA 5JWMA 5FROA 2P0KA 3MEUA 5CQ8A 3QJ6A 5LJ1A 2YEMA 2LDMA 4C5IA 5EWHA 4A9KA 5BT4A 3M9QA 2F6JA 2LTOA 4A4EA 4O7EA 4BW3A 3MEWA 5ENEA 5J39A 4YK0A 5CRZA 5L8UA 4CLBA 3NXBA 4TQNA 5EA1A 5I40A 4LC2A 2RJEA 3P1CA 5D3PA 3S3NA 5HLSA 5IBNA 4UIZA 4A9FA 5C8GA 4QY4A 5HQ5A 4PTBA 2K3YA 3MP1A 4Z93A 2JTFA 5EK9A 4OGIA 4EDUA 1H3ZA 4IUPA 3FC3A 4CUPA 5I1QA 4BACA 4ZQLA 3UWNA 3NTHA 5FRNA 4UYHA 2L8DA 3Q2FA 4HXKA 3OS0A 5A5SA 2XK0A 2WACA 4YYNA 4N4GA 5II2A 4IUTA 4LR6A 5FE6A 2YRVA 5CQ3A 5L96A 4LYIA 3JVMA 4QEUA 5CQAA 4Y03A 5CQ4A 4BD3A 4QBMA 5CPEA 4N4HA 2R5MA 2CKKA 4NUEA 5CQTA 5I7XA 3D7CA 2F6NA 5L97A 4II1A 5CQ7A 5HRXA 2RO0A 3HMHA 2RHXA 4UIUA 2L5EA 2RS9B 1WJSA 4YH4A 2YQDA 3S3OA 4FU6A 2WP1A 5E9LA 4YYKA 4C5GA 5KTXA 4PCEA 1F68A 5I7YA 4E7IA 3MEAA 5FH7A 4IR3A 3U5JA 2OO1A 4WHUA 5E73A 4XY8A 3U5OA 5LKXA 3P1FA 5LVQA 4TT2A 2O4XB 4BE2A 4B9XA 2R0VA 4TZ8A 2R57A 2M16A 4Z1QA 3O8VA 3GOXA 5DW2A 4PL6A 5A7CA 4O7FA 4HCZA 3OYMA 2OSSA 5HELA 3QIIA 5ENJA 2RNYA 3ME9A 4E96A 4YYIA 3OYFA 5EWVA 5CP5A 5FFYA 3Q1JA 5EM3A 4MEQA 5D6YA 2YDWA 4UYFA 3E9FA 3K2JA 5A81A 4UIVA 3LYIA 3SVFA 2RHYA 2RI2A 3FKMX 3LQHA 3OA6A 4NR4A 5EGUA 4IKFA 4CUTA 5DLZA 3UVWA 4IORA 2DVRA 2OUOA 5C87A 4YY4A 5IAYA 5H1UA 5D26A 4YYMA 5EP7A 5I29A 4QQ6A 4UIXA 4UYGA 2G4AA 4QSXA 4Z1SA 3L2RA 4XUAA 5M9OA 1OI1A 4YYJA 3MB3A 5A5OA 5EQ1A 3ZEHA 4NRAA 4QC1A 4IOOA 2X4XA 4NR7A 4YYDA 5HJCA 2EQKA 5IGKA 4E7JA 3O37A 5KTUA 2BUDA 4A9JA 5IGLA 2I7KA 4HXNA 1G5VA 3S91A 4BDYA 4KV4A 5FG5A 1WUGA 4A9HA 4TYLA 5FBXA 2DVVA 3CEYA 5E9YA 2EQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSQA 2DRMA 2K3BA 2OJ2A 5KE3A 2DMOA 4FCYA 4BW1A 2XICA 1K8AR 3CC4Q 2EPDA 4QSPA 5FRMA 4GBQA 4MMKA 2AZSA 1RAEB 2DTHA 4M7AC 3QBYA 5GAN6 5A5QA 2CZ7B 4QEWA 4LUDA 2V1QA 4QR3A 5EVAA 1YBYA 2CSQA 2QQRA 2FO0A 5CUAA 1JQQA 4M7DF 5D6XA 5GMKj 4J9DA 4ESRA 2F69A 1Y96A 4RTYA 1OZ3A 3QZSA 4HXMA 1RAGB 3EHRA 4HBXA 1PD0A 1ABQA 1KD1R 3WXMB 4HVUA 4O74A 3JCMh 1U3OA 2C0IA 4K11A 4M75G 1Q86C 5F3AA 3OYYA 2E41A 4NS5A 2RI7A 1G2BA 1WIEA 3I55Q 3OYDA 3M0PA 2DAQA 4OMLA 3CCJA 1AD5A 4CC7A 4E7ZA 5GAMh 3I5SA 3J80E 2E12A 3JCMQ 2C06A 3CCMQ 5KYXA 3QZTA 2FPEA 1B3QA 5HQ6A 2HMAA 3DLLA 4M7AG 2E3KA 4M7DE 3C0CA 5CQ5A 2LCCA 4XYAA 4YBSA 2DEUA 3A5ZB 2DKWA 4YATA 4PKLA 3LW5E 3O33A 3UPUA 3FJ5A 2L89A 5J26A 2D9EA 2MI6A 1SG5A 2CZ1B 3SEMA 3I35A 3JVJA 4A53A 1B34A 5GAOn 3CPWS 3PFSA 4QR4A 3QZ5B 4QVZA 1RABB 4Q5WA 1VQNT 4QC3A 2D0QB 3E1SA 4C0ZA 2E6NA 2QG9B 5KYUA 1GCQA 3UV5A 5GMKe 4CUUA 2CP6A 2J6KA 2V8KA 1VQ5Q 2KT1A 3EFOA 2RJDA 4LDVA 4RTXA 2KGTA 1TU0B 1Q82C 2JNGA 5D3NA 3QUIA 3G6ET 5I11A 3X20B 2KNBB 1TOVA 3DKMA 3S3MA 5KYWA 4VUBA 2A37A 1QVFS 1GBRA 2XDBA 2WSFE 1Q95G 4NUCA 5IXFA 1B07A 4EMGA 1K76A 1QVGS 1K0SA 2E70A 3JCMf 4AT1B 1UGRB 1NBEB 3UVDA 2MOXA 5FDZA 2O9VA 1K73R 4FYVB 4AKIA 5DFDA 4QQGA 5KE2A 4DQ2A 5CZGA 1C0MA 3H41A 2BIVA 4M75D 3VS0A 2YEKA 5GAMf 1VQ9A 4MR5A 3PVLA 1WUMA 3CD6T 5EWWA 1AOJA 5CK9A 2CZ6B 3UF4A 5D3TA 1VYTA 4OMNA 2V8IA 4XTZA 2MF2A 3M0QA 2V1RA 4M75A 1WZOA 4E7KA 5GMKi 4LD6A 5DX4A 3TLPA 1VA7A 2OAUA 4Z89A 5L8TA 4RKUE 2DPPB 1KC8C 2QI2A 4M7AD 4ZW1A 5II1A 1PG5B 2YDLA 3ASKA 5AD3A 1BYMA 1Q81U 4XK8E 4LZSA 4BJXA 4QSWA 4NRCA 5DLOA 4HXLA 1RAHB 2RO1A 1I07A 3A8OB 3E9GA 4IUQA 5F1LA 2RI3A 1G3YA 1O9SA 1N27A 2MJVB 2XG8D 4RTTA 5LVRA 3VKIA 2DD4A 4C0FA 2L3QA 3EH1A 4JRPA 3JAME 5HM0A 4HXPA 3P8HA 1QVGA 5LJ5j 4WIVA 4X2IA 2PTKA 5CQXA 2KR3A 2YLBA 4MEPA 4IR5A 4BW4A 2DZ9A 4YH3A 1IREB 2A08A 3VS1A 3CCLQ 3C4SA 4PLLA 4TT6A 3FDRA 3CCSA 2GFUA 4FL6A 2HCKA 4A9OA 4O71A 3JB9H 5BT5A 5COIA 2EJ9A 4M7DC 2QA4T 5ENBA 1IHWA 5EPBA 3X28B 3L2WA 4HCCA 3M54A 2FEIA 2QAZA 4FLPA 2L3RA 5F5ZA 1X2KA 3OS2A 1Y0MA 3OYAA 2GTJA 1W2BS 2VKNA 1WHHA 2VVKA 3UV2A 3I3JA 2YUPA 4CFKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5CQ4 A;  4BD3 A;  4QBM A;  5CPE A;  4N4H A;  2R5M A;  2CKK A;  4NUE A;  5CQT A;  5I7X A;  3D7C A;  2F6N A;  5L97 A;  4II1 A;  5CQ7 A;  5HRX A;  2RO0 A;  3HMH A;  2RHX A;  4UIU A;  2L5E A;  2RS9 B;  1WJS A;  4YH4 A;  2YQD A;  3S3O A;  4FU6 A;  2WP1 A;  5E9L A;  4YYK A;  4C5G A;  5KTX A;  4PCE A;  1F68 A;  5I7Y A;  4E7I A;  3MEA A;  5FH7 A;  4IR3 A;  3U5J A;  2OO1 A;  4WHU A;  5E73 A;  4XY8 A;  3U5O A;  5LKX A;  3P1F A;  5LVQ A;  4TT2 A;  2O4X B;  4BE2 A;  4B9X A;  2R0V A;  4TZ8 A;  2R57 A;  2M16 A;  4Z1Q A;  3O8V A;  3GOX A;  5DW2 A;  4PL6 A;  5A7C A;  4O7F A;  4HCZ A;  3OYM A;  2OSS A;  5HEL A;  3QII A;  5ENJ A;  2RNY A;  3ME9 A;  4E96 A;  4YYI A;  3OYF A;  5EWV A;  5CP5 A;  5FFY A;  3Q1J A;  5EM3 A;  4MEQ A;  5D6Y A;  2YDW A;  4UYF A;  3E9F A;  3K2J A;  5A81 A;  4UIV A;  3LYI A;  3SVF A;  2RHY A;  2RI2 A;  3FKM X;  3LQH A;  3OA6 A;  4NR4 A;  5EGU A;  4IKF A;  4CUT A;  5DLZ A;  3UVW A;  4IOR A;  2DVR A;  2OUO A;  5C87 A;  4YY4 A;  5IAY A;  5H1U A;  5D26 A;  4YYM A;  5EP7 A;  5I29 A;  4QQ6 A;  4UIX A;  4UYG A;  2G4A A;  4QSX A;  4Z1S A;  3L2R A;  4XUA A;  5M9O A;  1OI1 A;  4YYJ A;  3MB3 A;  5A5O A;  5EQ1 A;  3ZEH A;  4NRA A;  4QC1 A;  4IOO A;  2X4X A;  4NR7 A;  4YYD A;  5HJC A;  2EQK A;  5IGK A;  4E7J A;  3O37 A;  5KTU A;  2BUD A;  4A9J A;  5IGL A;  2I7K A;  4HXN A;  1G5V A;  3S91 A;  4BDY A;  4KV4 A;  5FG5 A;  1WUG A;  4A9H A;  4TYL A;  5FBX A;  2DVV A;  3CEY A;  5E9Y A;  2EQM A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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