5DKHA

Crystal structure of the bromodomain of human brm (smarca2) in complex with a hydroxyphenyl propenone inhibitor 17
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L2
publication title Crystal structure of the bromodomain of human BRM (SMARCA2) in complex with a hydroxyphenyl propenone inhibitor 17
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.6.4.-:
pdb deposition date 2015-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5dkhA00
4HXLA 5EPBA 5CUAA 4IORA 4O78A 4DONA 3QZSA 5II2A 5A7CA 2YEMA 4UITA 5FG4A 4XY9A 5ENEA 3UVDA 2R0YA 3MB3A 3UV5A 5A5SA 4N4GA 4HXOA 3Q2EA 5E9YA 5CP5A 5C7NA 5HM0A 5CQAA 2YEKA 4PS5A 5LJ2A 5E9IA 4LZRA 2YELA 5LUUA 2DVRA 5FE9A 2DWWA 4WIVA 5HLSA 4UIXA 4A9IA 4TS8A 5ENCA 5CQ5A 5F60A 4GPJA 3AQAA 2RS9B 5L97A 2LSPB 4NS5A 4NYVA 4A9FA 2YQDA 5D3PA 4ZQLA 4ZC9A 4HBVA 3HMEA 4IOQA 3NXBA 4WHWA 3UVXA 4PCIA 5CY9A 4NXJA 5C8GA 2MJVB 5E73A 5DYXA 4J3IA 5F2PA 4LDFA 2F6JA 5FH8A 4LZSA 3U5JA 5DYCA 5F25A 4QC1A 2I8NA 4O7AA 4OUFA 5EWVA 3JVKA 5L98A 5CRZA 4N4HA 4YYNA 5L8TA 1EQFA 4J1PA 4J0SA 4CURA 5FE5A 5JWMA 3G0LA 3ONIA 5FE0A 5FE3A 2E3KA 4UIVA 2R0SA 3SVGA 4NQMA 2OO1A 5CQ7A 5ETBA 2FSAA 4TYLA 4HXRA 5CFWA 3MB4A 5I80A 4UYFA 3HMFA 4YADA 5EWCA 5KO4A 4UYHA 2YDWA 5DW2A 4YY4A 5D3RA 5K29A 4YBTA 5FE8A 4HXKA 4C67A 5HEMA 3U5LA 5J0DA 4O74A 5FH6A 2L84A 3UVWA 2YW5A 5I7YA 2RO1A 5DKDA 4QSUA 5IGLA 5AMFA 4QR4A 5HCLA 5FB1A 5IIDA 5F63A 5DLZA 4PCEA 2D9EA 2OUOA 1JM4B 4IR5A 5FG6A 4NUEA 5DLXA 5DYAA 4YYMA 4BJXA 2DATA 5DW1A 5ETDA 5EVAA 4MR6A 2E7OA 5FE4A 4CUTA 3LJWA 4O70A 2G4AA 5EPSA 5TCMA 4BW3A 4YATA 4Z1SA 5LVQA 4MEOA 4YABA 4CFKA 4NR9A 5LKZA 3P1FA 5CQ4A 1F68A 4NR4A 5EISA 5COIA 4FLPA 4NRCA 4MR3A 3U5MA 4YYJA 3O33A 2H60A 3DAIA 2DVSA 4F3IA 5CRMA 4O7FA 4YYDA 4TZ2A 5F61A 5E9MA 5D3SA 2NXBA 2WP1A 2R10A 4Q0OA 4PTBA 4QC3A 5E3GA 5DKCA 4CLBA 3LXJA 5DFDA 4OGIA 5D26A 3P5OA 5IGKA 1X0JA 4O76A 4LYIA 3GG3A 5BT5A 4QUUA 5EPRA 4UIYA 5HENA 5A5RA 4QEWA 3MULA 3JVJA 4QSRA 3O35A 5AD3A 4UYDA 3P1CA 2F6NA 5FE7A 3S92A 4LZ2A 5FBXA 5EGUA 4NYXA 5D24A 3LQJA 4YY6A 5A81A 1WUGA 5A85A 5KU3A 4BW4A 3MXFA 4BW2A 4TZ8A 4Z6HA 4YH4A 5EK9A 5HQ6A 4ALHA 4QSVA 4LR6A 5C87A 4UIWA 4Q0NA 5EI4A 5JI8A 2KTBB 5I86A 5CU8A 5L96A 4NUDA 4TT6A 5D3LA 2DKWA 4HXMA 4NR6A 4NR8A 2OSSA 5BT3A 3U5OA 5TB6A 3DWYA 5I29A 5ENJA 5HJCA 5EWWA 5FE2A 5D3JA 5FB0A 5A5OA 5C85A 5CUCA 5I89A 5HELA 4LC2A 5HFQA 4BW1A 4QSPA 4QR5A 3UVYA 5KTWA 5KTXA 4QSSA 4C66A 4Z6IA 2I7KA 4QUTA 5C4QA 5DKHA 4A9LA 5E9KA 4QYDA 4A9HA 1JSPB 4NR5A 4A9OA 4QSXA 5FG5A 5BT4A 4XYAA 4UIZA 2RNYA 5AMEA 4N3WA 4A9EA 5LKXA 5A5PA 2RNXA 3TLPA 4MEQA 4YH3A 5E9VA 5IGNA 2E7NA 5CPEA 5LKUA 3IU5A 5F1LA 4UYEA 5CQ3A 4Z93A 5I40A 5IGMA 4NRBA 5CGPA 4QNSA 3P1DA 5KTUA 4O7EA 5H1UA 4NR7A 5EU1A 5F5ZA 2RFJA 5ENHA 5A5NA 5DFBA 5KHMA 5CS8A 4CUQA 4CUPA 5HQ5A 3K2JA 1ZS5A 4IR4A 5ENGA 3QZVA 4O77A 4NRAA 5G4RA 5II1A 4LYWA 4OGJA 4QYLA 3S91A 5D3TA 4NYWA 4YK0A 5D25A 2D82A 3UW9A 5EP7A 4E96A 4QEVA 5EQ1A 3LQHA 3AADA 2DVQA 4NUCA 5D3HA 4XY8A 3QZTA 4AKNA 4HXSA 5F36A 4TQNA 5D7XA 5I7XA 5DY7A 3LQIA 4HBYA 2L85A 3HMHA 4MENA 5FH7A 4HXNA 4Y03A 5E0RA 3O37A 4HXPA 5F1HA 3JVMA 5HRXA 4Z1QA 5CQTA 5CUEA 3U5KA 3D7CA 5DYUA 5C89A 4TU4A 5ENBA 3O34A 3O36A 3JVLA 4HBWA 3UV4A 4N4IA 5F62A 5G4SA 3G0JA 3U5PA 5LJ0A 3FKMX 5CQ6A 4N4FA 5LKTA 4XUAA 4QB3A 4TT4A 5LJ1A 4A9KA 5H1TA 5E7DA 4O72A 4A9NA 4O75A 4ALGA 3I3JA 4QEUA 4YBSA 3MQMA 4J0RA 4CUSA 5E74A 5DBMA 4KV4A 5I1QA 4O7BA 1N72A 4KV1A 4TTEA 5HRWA 3Q2FA 5FE6A 4BHWA 4CL9A 5LVRA 5FFVA 5DFCA 4UIUA 5L99A 5CQ8A 4TT2A 4YC9A 1WUMA 3MUKA 2WP2A 5E3DA 3P1EA 4IR6A 4YBMA 5HQ7A 3U5NA 4YYHA 4YYKA 4QSWA 5I83A 5DX4A 4A9MA 5CUDA 4TU6A 5EWDA 5FFYA 2RI7A 2DVVA 5IBNA 4QSQA 5CZGA 5CUBA 4YYIA 5EWHA 4IR3A 4O71A 5AD2A 5D3NA 4UYFB 4NQNA 3SVHA 5ACYA 4CFLA 4QBMA 3SVFA 4QR3A 4A9JA 5CTLA 4KCXA 5CUGA 4YAXA 2YYNA 4O7CA 4PKLA 2R0VA 4RVRA 5HFRA 2N9GA 4QY4A 4CUUA 4MR4A 4YYGA 4PY6A 5H85A 4LRGA 5EICA 5EA1A 3ZYUA 4QZSA 5EM3A 4WHUA 5F3AA 5H1VA 5FE1A 5FDZA 5ENIA 5IG6A 5E9LA 5I88A 4HBXA 4MEPA 3RCWA 2GRCA 4IOOA 4UYGA 1E6IA 4MR5A 5ENFA 5EV9A 4X2IA 4ZW1A 4QSTA 5A82A 5A5QA 5FFWA 5A83A 2RNWA 3UV2A 5HRVA 5D0CA 2L5EA 5L8UA 3IU6A 4XUBA 4LYSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXLA 5EPBA 5CUAA 4IORA 4O78A 4DONA 3QZSA 5II2A 5A7CA 2YEMA 4UITA 5FG4A 4XY9A 5ENEA 3UVDA 2R0YA 3MB3A 3UV5A 5A5SA 4N4GA 4HXOA 3Q2EA 5E9YA 5CP5A 5C7NA 5HM0A 5CQAA 2YEKA 4PS5A 5LJ2A 5E9IA 4LZRA 2YELA 5LUUA 2DVRA 5FE9A 2DWWA 4WIVA 5HLSA 4UIXA 4A9IA 4TS8A 5ENCA 5CQ5A 5F60A 4GPJA 3AQAA 2RS9B 5L97A 2LSPB 4NS5A 4NYVA 4A9FA 2YQDA 5D3PA 4ZQLA 4ZC9A 4HBVA 3HMEA 4IOQA 3NXBA 4WHWA 3UVXA 4PCIA 5CY9A 4AKHA 4NXJA 5C8GA 2MJVB 5E73A 5DYXA 4J3IA 5F2PA 4LDFA 2F6JA 5FH8A 4LZSA 3U5JA 5DYCA 5F25A 4QC1A 2I8NA 4O7AA 4OUFA 5EWVA 3JVKA 5L98A 5CRZA 4N4HA 4YYNA 5L8TA 1EQFA 4J1PA 4J0SA 4CURA 5FE5A 5JWMA 3G0LA 3ONIA 5FE0A 5FE3A 2E3KA 4UIVA 2R0SA 3SVGA 4NQMA 2OO1A 4AI6A 5CQ7A 5ETBA 2FSAA 4TYLA 4HXRA 5CFWA 3MB4A 5I80A 4UYFA 3HMFA 4YADA 5EWCA 5KO4A 4UYHA 2YDWA 5DW2A 4YY4A 5D3RA 5K29A 4YBTA 5FE8A 4HXKA 4C67A 5HEMA 3U5LA 5J0DA 4O74A 5FH6A 2L84A 3UVWA 2YW5A 5I7YA 2RO1A 5DKDA 4QSUA 5IGLA 5AMFA 4QR4A 5HCLA 5FB1A 5IIDA 5F63A 5DLZA 4PCEA 2D9EA 2OUOA 1JM4B 4IR5A 5FG6A 4NUEA 5DLXA 5DYAA 4YYMA 4BJXA 2DATA 5DW1A 5ETDA 5EVAA 4MR6A 2E7OA 5FE4A 4CUTA 3VKGA 3LJWA 4O70A 2G4AA 5EPSA 5TCMA 4BW3A 4YATA 4Z1SA 5LVQA 4MEOA 4YABA 4CFKA 4NR9A 5LKZA 3P1FA 5CQ4A 1F68A 4NR4A 5EISA 5COIA 4FLPA 4NRCA 4MR3A 3U5MA 4YYJA 3O33A 2H60A 3DAIA 2DVSA 4F3IA 5CRMA 4O7FA 4YYDA 4TZ2A 5F61A 5E9MA 5D3SA 2NXBA 2WP1A 2R10A 4Q0OA 4PTBA 4QC3A 5E3GA 5DKCA 4CLBA 3LXJA 5DFDA 4OGIA 5D26A 3P5OA 5IGKA 1X0JA 4O76A 4LYIA 3GG3A 5BT5A 4QUUA 5EPRA 4UIYA 5HENA 5A5RA 4QEWA 3MULA 3JVJA 4QSRA 3O35A 5AD3A 4UYDA 4AKGA 3P1CA 2F6NA 5FE7A 3S92A 4LZ2A 5FBXA 5EGUA 4NYXA 5D24A 3LQJA 4YY6A 5A81A 1WUGA 5A85A 5KU3A 4BW4A 3MXFA 4BW2A 4TZ8A 4Z6HA 4YH4A 5EK9A 5HQ6A 4ALHA 4QSVA 4LR6A 5C87A 4UIWA 4Q0NA 5EI4A 5JI8A 2KTBB 5I86A 5CU8A 5L96A 4NUDA 4TT6A 5D3LA 2DKWA 4HXMA 4NR6A 4NR8A 2OSSA 5BT3A 3U5OA 5TB6A 3DWYA 5I29A 5ENJA 5HJCA 5EWWA 5FE2A 5D3JA 5FB0A 5A5OA 5C85A 5CUCA 5I89A 5HELA 4LC2A 5HFQA 4BW1A 4QSPA 4QR5A 3UVYA 5KTWA 5KTXA 4QSSA 4C66A 4Z6IA 2I7KA 4QUTA 5C4QA 5DKHA 4A9LA 5E9KA 4QYDA 4A9HA 1JSPB 4NR5A 4A9OA 4QSXA 5FG5A 5BT4A 4XYAA 4UIZA 2RNYA 5AMEA 4N3WA 4A9EA 5LKXA 3D1DA 5A5PA 2RNXA 3TLPA 4MEQA 4YH3A 5E9VA 5IGNA 2E7NA 5CPEA 5LKUA 3IU5A 5F1LA 4UYEA 3D1BA 5CQ3A 4Z93A 5I40A 5IGMA 4NRBA 5CGPA 4QNSA 3P1DA 5KTUA 4O7EA 3ERRA 5H1UA 4NR7A 5EU1A 5F5ZA 2RFJA 5ENHA 5A5NA 5DFBA 5KHMA 5CS8A 4CUQA 4CUPA 5HQ5A 3K2JA 1ZS5A 4IR4A 5ENGA 3QZVA 4O77A 4NRAA 5G4RA 5II1A 4LYWA 4OGJA 4QYLA 3S91A 5D3TA 4NYWA 4YK0A 5D25A 2D82A 3UW9A 5EP7A 1ZKRA 4E96A 4QEVA 5EQ1A 3LQHA 3AADA 2DVQA 4NUCA 5D3HA 4XY8A 3QZTA 4AKNA 4HXSA 5F36A 4TQNA 3VKHA 5D7XA 5I7XA 5DY7A 3LQIA 4HBYA 2L85A 3HMHA 4MENA 5FH7A 4HXNA 4Y03A 5E0RA 2EJNA 3O37A 4HXPA 5F1HA 3JVMA 5HRXA 4Z1QA 5CQTA 5CUEA 3U5KA 3D7CA 5DYUA 5C89A 4TU4A 5ENBA 3O34A 3O36A 3JVLA 4HBWA 3UV4A 4N4IA 5F62A 5G4SA 3G0JA 3U5PA 5LJ0A 3FKMX 5CQ6A 4N4FA 5LKTA 4XUAA 4QB3A 4TT4A 5LJ1A 4A9KA 5H1TA 5E7DA 4O72A 4A9NA 4O75A 4ALGA 3I3JA 4QEUA 4YBSA 3MQMA 4J0RA 4CUSA 5E74A 5DBMA 4KV4A 5I1QA 4O7BA 1N72A 4KV1A 4TTEA 5HRWA 3Q2FA 5FE6A 4BHWA 4CL9A 5LVRA 5FFVA 5DFCA 4UIUA 5L99A 5CQ8A 4TT2A 4YC9A 1WUMA 3MUKA 2WP2A 5E3DA 3P1EA 4IR6A 4YBMA 5HQ7A 3U5NA 4YYHA 4YYKA 4QSWA 5I83A 5DX4A 4A9MA 5CUDA 4TU6A 5EWDA 5FFYA 4AKIA 2RI7A 2DVVA 5IBNA 4QSQA 5CZGA 5CUBA 4YYIA 5EWHA 4IR3A 4O71A 5AD2A 5D3NA 4UYFB 4NQNA 1PUOA 3SVHA 5ACYA 4CFLA 4QBMA 3SVFA 4QR3A 4A9JA 5CTLA 4KCXA 5CUGA 4YAXA 2YYNA 4O7CA 4PKLA 2R0VA 4RVRA 5HFRA 2N9GA 4QY4A 4CUUA 4MR4A 4YYGA 4PY6A 5H85A 4LRGA 5EICA 5EA1A 3ZYUA 4QZSA 5EM3A 4WHUA 5F3AA 5H1VA 5FE1A 5FDZA 5ENIA 5IG6A 5E9LA 5I88A 4HBXA 4MEPA 3RCWA 2GRCA 4IOOA 4UYGA 1E6IA 4MR5A 5ENFA 5EV9A 4X2IA 4ZW1A 4QSTA 5A82A 5A5QA 5FFWA 5A83A 2RNWA 3UV2A 5HRVA 5D0CA 2L5EA 5L8UA 3IU6A 4XUBA 4LYSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4HXL A;  5EPB A;  5CUA A;  4IOR A;  4O78 A;  4DON A;  3QZS A;  5II2 A;  5A7C A;  2YEM A;  4UIT A;  5FG4 A;  4XY9 A;  5ENE A;  3UVD A;  2R0Y A;  3MB3 A;  3UV5 A;  5A5S A;  4N4G A;  4HXO A;  3Q2E A;  5E9Y A;  5CP5 A;  5C7N A;  5HM0 A;  5CQA A;  2YEK A;  4PS5 A;  5LJ2 A;  5E9I A;  4LZR A;  2YEL A;  5LUU A;  2DVR A;  5FE9 A;  2DWW A;  4WIV A;  5HLS A;  4UIX A;  4A9I A;  4TS8 A;  5ENC A;  5CQ5 A;  5F60 A;  4GPJ A;  3AQA A;  2RS9 B;  5L97 A;  2LSP B;  4NS5 A;  4NYV A;  4A9F A;  2YQD A;  5D3P A;  4ZQL A;  4ZC9 A;  4HBV A;  3HME A;  4IOQ A;  3NXB A;  4WHW A;  3UVX A;  4PCI A;  5CY9 A;  4NXJ A;  5C8G A;  2MJV B;  5E73 A;  5DYX A;  4J3I A;  5F2P A;  4LDF A;  2F6J A;  5FH8 A;  4LZS A;  3U5J A;  5DYC A;  5F25 A;  4QC1 A;  2I8N A;  4O7A A;  4OUF A;  5EWV A;  3JVK A;  5L98 A;  5CRZ A;  4N4H A;  4YYN A;  5L8T A;  1EQF A;  4J1P A;  4J0S A;  4CUR A;  5FE5 A;  5JWM A;  3G0L A;  3ONI A;  5FE0 A;  5FE3 A;  2E3K A;  4UIV A;  2R0S A;  3SVG A;  4NQM A;  2OO1 A;  5CQ7 A;  5ETB A;  2FSA A;  4TYL A;  4HXR A;  5CFW A; 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