4C66A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c66A01
3AQAA 4N4GA 5E3GA 4MR4A 4LYIA 5CUBA 5E73A 5CUGA 5L8TA 4QSPA 5BT3A 5EQ1A 5F25A 5CUDA 3P1DA 4NXJA 5E9IA 4HBYA 3AADA 4O76A 5E0RA 4NR5A 5I1QA 4UYHA 5LJ2A 5D3RA 1F68A 5L8UA 4HBXA 4QC3A 2DWWA 4NUEA 4QUUA 4XY8A 5L97A 5FE9A 5LKZA 2L5EA 5CRZA 4NRBA 3P1EA 3LXJA 3MB3A 4YBTA 5CZGA 4NUDA 5CUCA 3UV5A 5LJ0A 4TS8A 5I83A 4MR6A 4MEOA 5A5SA 5CY9A 2R0VA 2I8NA 3ONIA 4YY6A 3U5JA 5HFRA 4YK0A 4HXKA 4LR6A 3LQHA 4O7EA 4IR4A 3G0JA 5BT5A 5DLXA 5D3HA 4A9EA 4QSTA 4NYXA 4YBMA 2YDWA 3QZSA 4YH3A 5FFVA 5F5ZA 4OGIA 4Y03A 1N72A 4O7FA 5FE4A 5A82A 3SVHA 5CQ3A 5E9VA 2YEMA 5EWCA 5I88A 5DW2A 5IGMA 5LUUA 5D26A 5E9MA 5AD2A 5F63A 2RNWA 5FB0A 5KU3A 5E9YA 4NRAA 4OUFA 5LKUA 4RVRA 3S91A 5KO4A 5DBMA 4LRGA 4Z1SA 4A9IA 2E7OA 3MULA 5CRMA 5HQ5A 5HRVA 3MXFA 2DVSA 4UYFB 4QSXA 4QNSA 4YYHA 4MEQA 5CQ7A 4WHUA 5EVAA 1ZS5A 4O7BA 2G4AA 4CUPA 2YQDA 5HEMA 3QZTA 4Z1QA 4IR5A 5DFBA 5G4RA 3P5OA 5LKTA 2R0YA 4UIUA 5D25A 4KV1A 4ALGA 5ACYA 4HBWA 3DAIA 5KHMA 2N9GA 4LYSA 2YW5A 5H1VA 5E9KA 3UVXA 5DFDA 5DY7A 3NXBA 5AD3A 2E7NA 5EWWA 5D24A 4Q0OA 2L84A 4J0RA 2OSSA 5CPEA 3LQJA 4QY4A 3U5MA 2OUOA 4O78A 4O72A 5F3AA 3UV4A 3O36A 5D0CA 5FG4A 4CL9A 2NXBA 4AKNA 2DVQA 5EWVA 5I89A 3G0LA 5H1UA 3UVDA 5H1TA 4CFKA 5EP7A 5H85A 5HENA 5HRXA 4UIZA 5E9LA 5F2PA 4YH4A 4O70A 4HXSA 3DWYA 5A85A 4UYEA 5ENCA 3D7CA 2F6JA 2I7KA 5L96A 4E96A 4ZC9A 4A9MA 5I40A 5FE7A 5ENGA 5HFQA 5EPSA 1JSPB 5EA1A 4TTEA 4UYDA 5ENHA 5FH6A 5HQ7A 5L99A 5IGNA 5C4QA 4UIYA 2DVVA 5DKCA 1E6IA 5FG6A 4XUBA 4NR8A 4LZRA 1X0JA 2H60A 4TU4A 4QZSA 5FE5A 4QYLA 4YYIA 5BT4A 4NR9A 4O71A 5DKHA 4UYGA 4A9LA 4QR5A 4BJXA 4QSSA 4YADA 4DONA 4XYAA 5IBNA 5EPBA 4Z6HA 4UYFA 4A9FA 4N4HA 2L85A 5ETDA 5ENEA 4A9HA 4IR3A 4A9NA 2R0SA 3RCWA 3O34A 2LSPB 3JVMA 4TT4A 4BW4A 5FE2A 5IGKA 5DW1A 3MQMA 4QEWA 5FG5A 4A9JA 4HXMA 4QSQA 5KTWA 2MJVB 1WUMA 4LC2A 4HBVA 5IIDA 5EM3A 3K2JA 5EWHA 5HQ6A 4NR4A 5D3NA 4N4FA 5FE3A 3QZVA 5FB1A 3ZYUA 5EU1A 4YAXA 4LYWA 5C7NA 5KTXA 4PCEA 4A9OA 4YYKA 5JI8A 5II2A 5CU8A 3HMFA 5DFCA 5K29A 4O7CA 4MR5A 5F1HA 3SVFA 2YELA 5ENBA 4FLPA 4F3IA 4YATA 4OGJA 3U5PA 4LDFA 5DLZA 3IU5A 5CQAA 5L98A 4HXLA 5F36A 5II1A 2RO1A 5I29A 4QR3A 3IU6A 4J3IA 5AMEA 3GG3A 5HLSA 3SVGA 4TT2A 1JM4B 5CQTA 4NRCA 3Q2EA 5LVQA 3UVWA 4UIXA 4CLBA 4O7AA 5JWMA 5DYXA 4PY6A 4IR6A 4YABA 4KCXA 4ZW1A 2R10A 5LVRA 4O74A 4Z6IA 4ALHA 4NUCA 4QSWA 5EI4A 4NYVA 5A5PA 5F60A 4CFLA 3P1FA 4CUTA 5F61A 3FKMX 4IOOA 3U5LA 4O75A 2OO1A 3TLPA 2RS9B 5A83A 4CURA 5FFWA 5FH8A 4TQNA 4YYDA 4IORA 5E74A 4YYGA 3O37A 5FE1A 4HXNA 5CS8A 5CTLA 3U5KA 4C67A 4BW2A 5DYAA 2E3KA 5EISA 3UVYA 5C89A 5FE0A 5A81A 4KV4A 5EGUA 5KTUA 4PS5A 4QYDA 5HCLA 4N4IA 2FSAA 4MR3A 4QC1A 5FFYA 5FBXA 5A5QA 5C8GA 5IG6A 5EPRA 5FE8A 4YBSA 5FH7A 4IOQA 5EICA 5C87A 4NR6A 4O77A 2WP1A 5D3SA 5HJCA 4QUTA 3Q2FA 5EK9A 5COIA 4QBMA 5DKDA 4C66A 5I80A 5CFWA 3JVJA 4TZ2A 2YYNA 4MEPA 2RNYA 4CUSA 5A5NA 3HMEA 3LJWA 4BW1A 2RFJA 5I7XA 3UW9A 5F62A 4CUQA 5HM0A 4LZ2A 4QSUA 4A9KA 4N3WA 2GRCA 2D82A 4ZQLA 4LZSA 5FDZA 3LQIA 5D3PA 3JVLA 5HRWA 4XY9A 5CQ4A 4J1PA 5EV9A 2RI7A 4TYLA 1EQFA 5EWDA 3U5OA 5I7YA 3HMHA 4NR7A 2D9EA 5TB6A 5HELA 5A7CA 5E7DA 3MUKA 5ENJA 3MB4A 5G4SA 4UIWA 4TU6A 4YC9A 4CUUA 4PCIA 2DVRA 5AMFA 4TT6A 2DKWA 5CGPA 5CUEA 4BHWA 5LJ1A 5CP5A 5DYUA 5A5RA 5C85A 3P1CA 5ENFA 5DX4A 4QSVA 4PTBA 5DYCA 5ENIA 2WP2A 2RNXA 5CQ5A 5CQ8A 4PKLA 4QEUA 4HXOA 2YEKA 4J0SA 1WUGA 4WHWA 5I86A 4X2IA 4BW3A 4HXRA 5LKXA 5F1LA 4UIVA 4NS5A 2F6NA 5D3TA 4TZ8A 5FE6A 4MENA 4Z93A 4YY4A 3I3JA 4NQMA 4NQNA 4YYMA 2DATA 5D3LA 5CQ6A 5CUAA 4WIVA 3UV2A 3O33A 3U5NA 4UITA 5IGLA 4Q0NA 5A5OA 3JVKA 4QEVA 4QR4A 5J0DA 5ETBA 2KTBB 4GPJA 4QB3A 5E3DA 4XUAA 4YYNA 3S92A 4NYWA 4HXPA 4YYJA 4QSRA 5TCMA 3O35A 5D3JA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AQAA 4N4GA 5E3GA 4MR4A 4LYIA 5CUBA 5E73A 5CUGA 5L8TA 4QSPA 5BT3A 5EQ1A 5F25A 5CUDA 3P1DA 4NXJA 5E9IA 4HBYA 3AADA 4O76A 5E0RA 4NR5A 5I1QA 4UYHA 5LJ2A 5D3RA 1F68A 5L8UA 4HBXA 4QC3A 2DWWA 4NUEA 4QUUA 4XY8A 5L97A 5FE9A 5LKZA 2L5EA 4AI6A 5CRZA 4NRBA 3P1EA 3LXJA 3MB3A 4YBTA 5CZGA 4NUDA 5CUCA 3UV5A 5LJ0A 4TS8A 5I83A 4MR6A 4MEOA 5A5SA 5CY9A 2R0VA 2I8NA 3ONIA 4YY6A 3U5JA 5HFRA 4YK0A 4HXKA 4LR6A 3LQHA 4O7EA 4IR4A 3G0JA 5BT5A 5DLXA 5D3HA 4A9EA 4QSTA 4NYXA 4YBMA 2YDWA 3QZSA 4YH3A 5FFVA 5F5ZA 4OGIA 4Y03A 1N72A 4O7FA 5FE4A 5A82A 3SVHA 5CQ3A 5E9VA 2YEMA 5EWCA 5I88A 5DW2A 5IGMA 5LUUA 5D26A 5E9MA 5AD2A 5F63A 2RNWA 5FB0A 5KU3A 5E9YA 4NRAA 4OUFA 5LKUA 4RVRA 3S91A 5KO4A 5DBMA 4LRGA 4Z1SA 4A9IA 2E7OA 3MULA 5CRMA 5HQ5A 5HRVA 3MXFA 2DVSA 4UYFB 4QSXA 4QNSA 4YYHA 4MEQA 5CQ7A 4WHUA 5EVAA 1ZS5A 4O7BA 2G4AA 4CUPA 2YQDA 5HEMA 3QZTA 4Z1QA 4IR5A 5DFBA 5G4RA 3P5OA 5LKTA 2R0YA 4UIUA 5D25A 4KV1A 4ALGA 5ACYA 4HBWA 3DAIA 5KHMA 2N9GA 4LYSA 2YW5A 5H1VA 5E9KA 3UVXA 5DFDA 5DY7A 3NXBA 5AD3A 2E7NA 5EWWA 5D24A 4Q0OA 2L84A 4J0RA 2OSSA 5CPEA 3LQJA 4QY4A 3U5MA 2OUOA 4O78A 4O72A 5F3AA 3UV4A 3O36A 5D0CA 5FG4A 4CL9A 2NXBA 4AKNA 2DVQA 5EWVA 5I89A 3G0LA 5H1UA 3UVDA 5H1TA 4CFKA 3VKHA 5EP7A 5H85A 5HENA 5HRXA 4UIZA 5E9LA 1PUOA 5F2PA 4YH4A 4O70A 4HXSA 3DWYA 5A85A 4UYEA 5ENCA 3D7CA 2F6JA 2I7KA 5L96A 4E96A 4ZC9A 4A9MA 5I40A 5FE7A 5ENGA 5HFQA 5EPSA 1JSPB 5EA1A 4TTEA 4UYDA 5ENHA 5FH6A 5HQ7A 5L99A 5IGNA 5C4QA 4UIYA 2DVVA 5DKCA 1E6IA 5FG6A 4XUBA 4NR8A 4LZRA 1X0JA 2H60A 4TU4A 4QZSA 5FE5A 4QYLA 4YYIA 5BT4A 4NR9A 4O71A 5DKHA 4UYGA 4A9LA 4QR5A 4BJXA 4QSSA 4YADA 4DONA 4XYAA 5IBNA 5EPBA 4Z6HA 4UYFA 4A9FA 4N4HA 2L85A 5ETDA 5ENEA 4A9HA 4IR3A 4A9NA 2R0SA 3RCWA 3O34A 2LSPB 3JVMA 4TT4A 4BW4A 5FE2A 5IGKA 5DW1A 3MQMA 4QEWA 5FG5A 4A9JA 4HXMA 4QSQA 5KTWA 2MJVB 1WUMA 4LC2A 4HBVA 5IIDA 5EM3A 3K2JA 5EWHA 5HQ6A 4NR4A 5D3NA 4N4FA 5FE3A 3QZVA 5FB1A 3ZYUA 5EU1A 4YAXA 4LYWA 4AKIA 5C7NA 5KTXA 4PCEA 4A9OA 4YYKA 5JI8A 1ZKRA 5II2A 5CU8A 3HMFA 5DFCA 5K29A 4O7CA 4MR5A 5F1HA 3SVFA 2YELA 5ENBA 4FLPA 4F3IA 3D1DA 4YATA 4OGJA 3U5PA 4LDFA 5DLZA 3IU5A 5CQAA 5L98A 4HXLA 5F36A 5II1A 2RO1A 5I29A 4QR3A 3IU6A 4J3IA 5AMEA 3GG3A 5HLSA 3SVGA 4TT2A 1JM4B 5CQTA 4NRCA 3Q2EA 5LVQA 3UVWA 4UIXA 4CLBA 4O7AA 5JWMA 5DYXA 4PY6A 4IR6A 4YABA 4KCXA 4ZW1A 2R10A 5LVRA 4O74A 4Z6IA 4ALHA 4NUCA 4QSWA 5EI4A 4NYVA 5A5PA 5F60A 4CFLA 3P1FA 4CUTA 5F61A 3FKMX 4IOOA 3U5LA 4O75A 2OO1A 3TLPA 2RS9B 5A83A 3D1BA 4CURA 5FFWA 5FH8A 3ERRA 4TQNA 4YYDA 4IORA 5E74A 4YYGA 3O37A 5FE1A 4HXNA 5CS8A 5CTLA 3U5KA 4C67A 4BW2A 5DYAA 2E3KA 5EISA 3UVYA 5C89A 5FE0A 5A81A 4KV4A 5EGUA 5KTUA 4PS5A 4QYDA 5HCLA 4N4IA 2FSAA 4MR3A 4QC1A 5FFYA 5FBXA 5A5QA 2EJNA 5C8GA 5IG6A 5EPRA 5FE8A 4YBSA 5FH7A 4IOQA 5EICA 5C87A 4NR6A 4O77A 2WP1A 5D3SA 5HJCA 4QUTA 3Q2FA 5EK9A 5COIA 4QBMA 5DKDA 4C66A 5I80A 5CFWA 3JVJA 4TZ2A 2YYNA 4MEPA 2RNYA 4CUSA 5A5NA 3HMEA 3LJWA 3VKGA 4BW1A 2RFJA 5I7XA 3UW9A 5F62A 4CUQA 5HM0A 4LZ2A 4AKHA 4QSUA 4A9KA 4N3WA 4AKGA 2GRCA 2D82A 4ZQLA 4LZSA 5FDZA 3LQIA 5D3PA 3JVLA 5HRWA 4XY9A 5CQ4A 4J1PA 5EV9A 2RI7A 4TYLA 1EQFA 5EWDA 3U5OA 5I7YA 3HMHA 4NR7A 2D9EA 5TB6A 5HELA 5A7CA 5E7DA 3MUKA 5ENJA 3MB4A 5G4SA 4UIWA 4TU6A 4YC9A 4CUUA 4PCIA 2DVRA 5AMFA 4TT6A 2DKWA 5CGPA 5CUEA 4BHWA 5LJ1A 5CP5A 5DYUA 5A5RA 5C85A 3P1CA 5ENFA 5DX4A 4QSVA 4PTBA 5DYCA 5ENIA 2WP2A 2RNXA 5CQ5A 5CQ8A 4PKLA 4QEUA 4HXOA 2YEKA 4J0SA 1WUGA 4WHWA 5I86A 4X2IA 4BW3A 4HXRA 5LKXA 5F1LA 4UIVA 4NS5A 2F6NA 5D3TA 4TZ8A 5FE6A 4MENA 4Z93A 4YY4A 3I3JA 4NQMA 4NQNA 4YYMA 2DATA 5D3LA 5CQ6A 5CUAA 4WIVA 3UV2A 3O33A 3U5NA 4UITA 5IGLA 4Q0NA 5A5OA 3JVKA 4QEVA 4QR4A 5J0DA 5ETBA 2KTBB 4GPJA 4QB3A 5E3DA 4XUAA 4YYNA 3S92A 4NYWA 4HXPA 4YYJA 4QSRA 5TCMA 3O35A 5D3JA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AQA A;  4N4G A;  5E3G A;  4MR4 A;  4LYI A;  5CUB A;  5E73 A;  5CUG A;  5L8T A;  4QSP A;  5BT3 A;  5EQ1 A;  5F25 A;  5CUD A;  3P1D A;  4NXJ A;  5E9I A;  4HBY A;  3AAD A;  4O76 A;  5E0R A;  4NR5 A;  5I1Q A;  4UYH A;  5LJ2 A;  5D3R A;  1F68 A;  5L8U A;  4HBX A;  4QC3 A;  2DWW A;  4NUE A;  4QUU A;  4XY8 A;  5L97 A;  5FE9 A;  5LKZ A;  2L5E A;  5CRZ A;  4NRB A;  3P1E A;  3LXJ A;  3MB3 A;  4YBT A;  5CZG A;  4NUD A;  5CUC A;  3UV5 A;  5LJ0 A;  4TS8 A;  5I83 A;  4MR6 A;  4MEO A;  5A5S A;  5CY9 A;  2R0V A;  2I8N A;  3ONI A;  4YY6 A;  3U5J A;  5HFR A;  4YK0 A;  4HXK A;  4LR6 A;  3LQH A;  4O7E A;  4IR4 A;  3G0J A;  5BT5 A;  5DLX A;  5D3H A;  4A9E A;  4QST A;  4NYX A;  4YBM A;  2YDW A;  3QZS A;  4YH3 A;  5FFV A;  5F5Z A;  4OGI A;  4Y03 A;  1N72 A;  4O7F A;  5FE4 A;  5A82 A;  3SVH A;  5CQ3 A;  5E9V A;  2YEM A;  5EWC A;  5I88 A;  5DW2 A;  5IGM A;  5LUU A;  5D26 A;  5E9M A;  5AD2 A;  5F63 A;  2RNW A;  5FB0 A;  5KU3 A;  5E9Y A;  4NRA A;  4OUF A;  5LKU A;  4RVR A;  3S91 A;  5KO4 A;  5DBM A;  4LRG A;  4Z1S A; 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