4CURA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-3 n09555
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-3 N09553
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4curA00
4UYEA 4QC3A 4IOOA 4UYHA 5FE7A 5A85A 5CGPA 2YQDA 4HXNA 5LKTA 5CQ5A 3QZVA 5CQTA 3SVGA 2LSPB 4NRCA 2FSAA 4TYLA 5CQ7A 2L5EA 2DATA 2F6NA 2R0SA 3ONIA 5I1QA 5ENJA 5EM3A 5AMFA 4YY4A 5HQ7A 4LC2A 5HRXA 2RO1A 4QSPA 5BT4A 3P5OA 5HCLA 5F60A 4UYFA 5LKUA 5C85A 5KU3A 5D3TA 3Q2FA 4BW4A 5KTUA 4A9IA 2RNXA 5IGLA 1X0JA 5IGKA 4Z6HA 5HM0A 2DVQA 5FH7A 3MUKA 5I7YA 5DYXA 2RI7A 5LUUA 5HFRA 5L99A 4HBYA 5FH6A 4QYDA 5ETBA 4O7AA 4UYDA 5I89A 5EP7A 3G0LA 3UVWA 5FB1A 5ENBA 4A9LA 4QR4A 5CS8A 5CZGA 3AQAA 2R0YA 4ALHA 4QSTA 5E73A 5EU1A 5HFQA 5ETDA 3MULA 4TU6A 5D7XA 4TS8A 3QZSA 4QY4A 4QUUA 4NRAA 4QEWA 5F3AA 4LZ2A 2YELA 2YYNA 4TZ8A 4A9NA 3O33A 3U5OA 4WHWA 4O7CA 4FLPA 4DONA 3DAIA 4KV4A 2RNYA 4UYFB 4IR5A 5EWDA 5FE1A 4MR3A 5DYAA 3AADA 4YBSA 5COIA 5L8UA 5HELA 5E7DA 5HLSA 5DFCA 4NRBA 5HRWA 4HXLA 4Z1SA 4N4HA 5H85A 2G4AA 4C67A 5LJ1A 4NXJA 5E9KA 5DKHA 2WP2A 5CUDA 5F5ZA 5IIDA 4LR6A 4QUTA 5FE3A 1E6IA 2E3KA 4O74A 4OGJA 3RCWA 4YYKA 3P1EA 4BJXA 2D9EA 5EV9A 4TQNA 4UYGA 4ALGA 4A9HA 4O7FA 4UIZA 4XY8A 5CY9A 5L98A 4MENA 4NUDA 5HJCA 5F36A 4HBVA 4HXRA 4KCXA 4UIYA 4XUBA 5EQ1A 3HMHA 5BT5A 4O7BA 2R10A 5FG4A 5CP5A 4YYGA 4YYHA 4F3IA 3O35A 5G4RA 5D3JA 3LQJA 5DKDA 4Z93A 5D3HA 3U5KA 1WUGA 4MEOA 3HMFA 5E74A 5DLXA 5E9MA 5CQ3A 5ENCA 5JWMA 4Q0NA 4NYWA 4O71A 1JSPB 4YYDA 5K29A 3K2JA 3G0JA 5CUEA 4GPJA 4HXSA 5DX4A 5A5PA 4HXMA 3UVXA 4UITA 4LZSA 5E9YA 4NR9A 3MB3A 4NUEA 2OSSA 4RVRA 5LJ2A 2RNWA 5D26A 1EQFA 4O78A 5J0DA 4LYSA 5CQ6A 5FE5A 4Y03A 5LJ0A 3D7CA 2YEKA 4QSWA 4Q0OA 5HQ6A 2MJVB 4ZC9A 4IR4A 4KV1A 4MR4A 5A5NA 5IBNA 4NR5A 5D3RA 4O76A 5CQAA 2YEMA 5C89A 5II1A 3P1FA 4HBXA 4HBWA 5FB0A 3FKMX 4XYAA 5DYCA 5A5RA 4AKNA 4BW2A 5A82A 5H1UA 2OO1A 4CFKA 4TZ2A 4YBMA 5D3PA 2YW5A 5CFWA 5F61A 3UVYA 4QB3A 4C66A 5EPSA 5ENFA 4NS5A 5CUCA 3ZYUA 3JVMA 4UIUA 4QR5A 5D25A 4HXPA 1N72A 3QZTA 5C7NA 4MEPA 1ZS5A 5DLZA 2I7KA 3NXBA 5A5QA 4LZRA 2YDWA 4YABA 4LYWA 5I40A 5E9LA 4TTEA 4WIVA 3TLPA 4CUQA 3JVKA 4QSSA 4BHWA 4QSRA 5L8TA 4YYNA 4O70A 4QEVA 3U5PA 5CUAA 2H60A 4A9OA 5LKXA 4WHUA 4LDFA 5DKCA 2DVRA 4NQMA 5ENGA 3U5NA 4J1PA 3UVDA 3O36A 4O72A 4QZSA 5EVAA 5EPRA 5C87A 5CU8A 4CLBA 5IGNA 4J0RA 4MR5A 4O77A 5CUGA 5JI8A 5FFWA 4BW3A 4HXOA 5I88A 5D3SA 5G4SA 5DW2A 2R0VA 4A9FA 2KTBB 2OUOA 5C4QA 5KTWA 2DVSA 2F6JA 4A9JA 4Z1QA 5CQ8A 5I83A 4QBMA 3IU5A 5TB6A 4YH3A 5KHMA 5EPBA 5E0RA 4QC1A 4QSQA 4PTBA 4NYXA 4N4IA 3S91A 4CUPA 5F1HA 4CUTA 2DKWA 2DWWA 3MXFA 3IU6A 4LYIA 4PCIA 5EICA 4UIWA 5ACYA 2GRCA 4IORA 4PKLA 5FE9A 5A7CA 5AD3A 4QSXA 4MEQA 5CPEA 5ENHA 5FE2A 4YC9A 5L97A 4A9KA 4YH4A 4X2IA 5EWWA 5LVRA 5F62A 4YYJA 3JVJA 4NUCA 5FE6A 4QSUA 3MB4A 3I3JA 5F25A 3UW9A 5FDZA 4E96A 4NQNA 5DFDA 5FE4A 2RFJA 5AD2A 3UV2A 4IOQA 5EK9A 5FBXA 4UIXA 4IR3A 4PCEA 5EISA 5KO4A 5E9VA 2L84A 3SVHA 5FE8A 4NR7A 3LXJA 5HQ5A 5D0CA 5KTXA 4J0SA 5I80A 5CRMA 3U5LA 5EWCA 5ENEA 5D3LA 5E9IA 5DY7A 3MQMA 3U5MA 3U5JA 3GG3A 3HMEA 4O75A 5EI4A 3UV4A 4BW1A 4CFLA 4OUFA 3O34A 4A9EA 4YY6A 4N4FA 4YBTA 4CUSA 4NR4A 5L96A 5H1VA 5F63A 5F1LA 2I8NA 5LVQA 4ZW1A 5E3DA 5HENA 2DVVA 4UIVA 5HRVA 5DBMA 2WP1A 3LJWA 4QSVA 1JM4B 2E7NA 4TT2A 1WUMA 4NYVA 1F68A 5A81A 5LKZA 5ENIA 4QEUA 5FE0A 2D82A 4CURA 5FG6A 3P1DA 4QNSA 5TCMA 4N3WA 3SVFA 4TU4A 4OGIA 5A83A 4HXKA 4YADA 5DW1A 4YYIA 4IR6A 4YYMA 5FG5A 5FFYA 5II2A 2RS9B 5CUBA 5CTLA 3DWYA 5F2PA 4NR8A 5I29A 5CRZA 3LQHA 5DYUA 4A9MA 4TT6A 5E3GA 5FFVA 3UV5A 4MR6A 3JVLA 2NXBA 4CUUA 3LQIA 5EWVA 2N9GA 4QYLA 2L85A 3O37A 4N4GA 5A5OA 5DFBA 4XUAA 4J3IA 4XY9A 5AMEA 3S92A 5I86A 3P1CA 4YAXA 4CL9A 5IG6A 5BT3A 4ZQLA 4Z6IA 5D24A 5FH8A 4LRGA 4YATA 4QR3A 5EA1A 4TT4A 5D3NA 5CQ4A 4PY6A 5EGUA 5A5SA 5EWHA 2E7OA 4PS5A 5H1TA 3Q2EA 5C8GA 5HEMA 4NR6A 5I7XA 4YK0A 5IGMA 4O7EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UYEA 4QC3A 4IOOA 4UYHA 5FE7A 5A85A 5CGPA 2YQDA 4HXNA 5LKTA 5CQ5A 3QZVA 5CQTA 3SVGA 2LSPB 4NRCA 2FSAA 4TYLA 5CQ7A 2L5EA 2DATA 2F6NA 2R0SA 3ONIA 5I1QA 5ENJA 5EM3A 5AMFA 4YY4A 5HQ7A 4LC2A 5HRXA 2RO1A 4QSPA 5BT4A 3P5OA 5HCLA 5F60A 4UYFA 5LKUA 5C85A 5KU3A 5D3TA 3Q2FA 4BW4A 5KTUA 3D1BA 4A9IA 2RNXA 5IGLA 1X0JA 5IGKA 4Z6HA 5HM0A 2DVQA 5FH7A 3MUKA 5I7YA 5DYXA 2RI7A 5LUUA 5HFRA 5L99A 4HBYA 5FH6A 4QYDA 5ETBA 4AKIA 4O7AA 4UYDA 5I89A 5EP7A 3G0LA 3UVWA 5FB1A 5ENBA 4A9LA 4QR4A 5CS8A 5CZGA 3AQAA 2R0YA 4ALHA 4QSTA 5E73A 5EU1A 5HFQA 5ETDA 3MULA 4TU6A 5D7XA 4TS8A 3QZSA 4QY4A 4QUUA 4NRAA 4QEWA 5F3AA 4LZ2A 2YELA 2YYNA 4TZ8A 4A9NA 3O33A 3U5OA 4WHWA 4O7CA 4FLPA 4DONA 3DAIA 4KV4A 2RNYA 4UYFB 4IR5A 5EWDA 5FE1A 4MR3A 5DYAA 3AADA 4YBSA 5COIA 5L8UA 5HELA 5E7DA 5HLSA 5DFCA 4NRBA 5HRWA 4HXLA 4Z1SA 4N4HA 5H85A 2G4AA 4C67A 5LJ1A 4NXJA 5E9KA 5DKHA 2WP2A 5CUDA 5F5ZA 5IIDA 4LR6A 4QUTA 5FE3A 1E6IA 2E3KA 4O74A 4OGJA 3RCWA 4YYKA 3P1EA 4BJXA 2D9EA 5EV9A 4TQNA 4UYGA 4ALGA 4A9HA 4O7FA 4UIZA 4AKHA 4XY8A 5CY9A 5L98A 4MENA 4NUDA 5HJCA 5F36A 4HBVA 4HXRA 4KCXA 4UIYA 4XUBA 5EQ1A 3HMHA 5BT5A 4O7BA 2R10A 5FG4A 5CP5A 4YYGA 4YYHA 4F3IA 3O35A 5G4RA 5D3JA 3LQJA 5DKDA 1PUOA 4Z93A 5D3HA 3U5KA 1WUGA 4MEOA 3HMFA 5E74A 5DLXA 5E9MA 5CQ3A 5ENCA 5JWMA 4Q0NA 4NYWA 4O71A 1JSPB 4YYDA 5K29A 3K2JA 3G0JA 5CUEA 4GPJA 4HXSA 5DX4A 5A5PA 4HXMA 3UVXA 4UITA 4LZSA 5E9YA 4NR9A 3MB3A 4NUEA 2OSSA 4RVRA 5LJ2A 2RNWA 5D26A 3ERRA 1EQFA 4O78A 5J0DA 4LYSA 5CQ6A 5FE5A 4Y03A 5LJ0A 3D7CA 2YEKA 4QSWA 4Q0OA 5HQ6A 2MJVB 4ZC9A 4IR4A 4KV1A 4MR4A 5A5NA 5IBNA 4NR5A 5D3RA 4O76A 5CQAA 2YEMA 5C89A 5II1A 3P1FA 4HBXA 4HBWA 5FB0A 3FKMX 4XYAA 5DYCA 5A5RA 4AKNA 4BW2A 5A82A 5H1UA 2OO1A 4CFKA 4TZ2A 4YBMA 5D3PA 2YW5A 5CFWA 5F61A 3UVYA 4QB3A 4C66A 5EPSA 5ENFA 4NS5A 5CUCA 3ZYUA 3JVMA 4UIUA 4QR5A 5D25A 4HXPA 1N72A 3QZTA 5C7NA 4MEPA 1ZS5A 5DLZA 2I7KA 3NXBA 5A5QA 4LZRA 2YDWA 4YABA 4LYWA 5I40A 5E9LA 4TTEA 4WIVA 3TLPA 4CUQA 3JVKA 4QSSA 4BHWA 4QSRA 5L8TA 4YYNA 4O70A 4QEVA 3U5PA 5CUAA 2H60A 4A9OA 5LKXA 4WHUA 4LDFA 5DKCA 2DVRA 4NQMA 5ENGA 3U5NA 4J1PA 3UVDA 3O36A 4O72A 4QZSA 5EVAA 5EPRA 5C87A 5CU8A 4CLBA 5IGNA 4J0RA 4MR5A 4O77A 5CUGA 5JI8A 5FFWA 4BW3A 4HXOA 5I88A 5D3SA 5G4SA 5DW2A 3D1DA 2R0VA 4A9FA 2KTBB 2OUOA 5C4QA 5KTWA 2DVSA 2F6JA 4A9JA 4Z1QA 5CQ8A 5I83A 4QBMA 3IU5A 5TB6A 4YH3A 5KHMA 5EPBA 5E0RA 4QC1A 4QSQA 4PTBA 4NYXA 4N4IA 3S91A 4CUPA 5F1HA 4CUTA 2DKWA 2DWWA 3MXFA 1ZKRA 3IU6A 4LYIA 4PCIA 5EICA 4UIWA 5ACYA 2GRCA 4IORA 4PKLA 5FE9A 5A7CA 5AD3A 4QSXA 4MEQA 5CPEA 5ENHA 5FE2A 4YC9A 5L97A 4A9KA 4YH4A 4X2IA 5EWWA 5LVRA 5F62A 4YYJA 3JVJA 4NUCA 5FE6A 4QSUA 3MB4A 3I3JA 5F25A 3UW9A 5FDZA 4E96A 4NQNA 5DFDA 5FE4A 2RFJA 5AD2A 3UV2A 4IOQA 5EK9A 5FBXA 4UIXA 4IR3A 4PCEA 5EISA 5KO4A 5E9VA 2L84A 3SVHA 5FE8A 4NR7A 3LXJA 5HQ5A 5D0CA 5KTXA 4J0SA 5I80A 5CRMA 3U5LA 5EWCA 5ENEA 5D3LA 5E9IA 5DY7A 3MQMA 3U5MA 3U5JA 3GG3A 3HMEA 4O75A 5EI4A 3UV4A 4BW1A 4CFLA 4OUFA 3O34A 4A9EA 4YY6A 4N4FA 4YBTA 4CUSA 4NR4A 5L96A 5H1VA 5F63A 5F1LA 2I8NA 5LVQA 4ZW1A 5E3DA 5HENA 2DVVA 4UIVA 5HRVA 5DBMA 2WP1A 3LJWA 4QSVA 1JM4B 2E7NA 4TT2A 1WUMA 4NYVA 1F68A 5A81A 5LKZA 5ENIA 4QEUA 5FE0A 2D82A 4CURA 5FG6A 3P1DA 4QNSA 5TCMA 4N3WA 3SVFA 4TU4A 4OGIA 5A83A 4HXKA 4YADA 5DW1A 4YYIA 4IR6A 4YYMA 5FG5A 5FFYA 5II2A 2RS9B 5CUBA 5CTLA 3DWYA 5F2PA 4NR8A 5I29A 5CRZA 3LQHA 5DYUA 4A9MA 4TT6A 5E3GA 5FFVA 3UV5A 4MR6A 4AKGA 3JVLA 2NXBA 4CUUA 3LQIA 5EWVA 2N9GA 4QYLA 2L85A 3O37A 4N4GA 5A5OA 5DFBA 4XUAA 4J3IA 4XY9A 5AMEA 3S92A 5I86A 3P1CA 4YAXA 4CL9A 5IG6A 2EJNA 5BT3A 4ZQLA 4Z6IA 3VKHA 5D24A 5FH8A 4LRGA 4YATA 4QR3A 5EA1A 4TT4A 5D3NA 5CQ4A 4PY6A 5EGUA 5A5SA 5EWHA 2E7OA 4PS5A 5H1TA 3Q2EA 5C8GA 3VKGA 5HEMA 4NR6A 5I7XA 4YK0A 5IGMA 4AI6A 4O7EA
chains in the Genus database with same CATH topology
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