4QSPA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) in complex with acetyl-lysine
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qspA00
5HFQA 4A9JA 4A9FA 3P1DA 4QC1A 4UYGA 2F6JA 5IGMA 3JVJA 2L85A 3G0JA 4LDFA 4NR7A 5AD2A 4XUBA 5F1LA 4TQNA 5F2PA 3DAIA 4YYKA 3NXBA 1E6IA 3P1EA 5DYUA 5C87A 5LJ1A 3U5OA 5TCMA 5FE3A 4O77A 3U5KA 3ONIA 4HXRA 2D82A 4O74A 4J0SA 5EP7A 5ENIA 2OUOA 5L98A 4UYFA 3U5NA 5E9IA 4TT2A 5KHMA 5F5ZA 4TT4A 5EI4A 5DYAA 5DKHA 4RVRA 5JWMA 4KV1A 5LKZA 4QC3A 4E96A 3U5MA 3LXJA 1X0JA 5ENBA 4CURA 4XYAA 4NUEA 5FBXA 5I86A 5EWCA 2D9EA 2DVQA 3G0LA 4Z93A 4CL9A 4MEOA 5EWHA 5DY7A 5D26A 4MR4A 5A7CA 4BW1A 4WHWA 4X2IA 2WP1A 1N72A 3O34A 4BW3A 5G4SA 5ACYA 5DBMA 4KV4A 4HBXA 2RFJA 5EWWA 4QYLA 5F3AA 5FG4A 2LSPB 5JI8A 5DLXA 4CUSA 5COIA 5E9VA 4O7AA 4IR5A 1EQFA 2I8NA 5CQ3A 5H1UA 5FB1A 4TTEA 4QEUA 4N4FA 3AQAA 4A9EA 5EICA 2E7NA 4CFLA 2WP2A 3LJWA 4LYSA 3ZYUA 4YH4A 4O78A 2YQDA 5HM0A 5CZGA 3LQHA 4TU6A 5DKDA 4HBWA 5I80A 4QSPA 4BJXA 4XY8A 4MR3A 5HRWA 5EM3A 3UV5A 2R0YA 5EWVA 5EISA 4A9MA 5FFYA 4YYGA 2DVRA 4GPJA 4Z1SA 5FFWA 3LQIA 4YATA 5E9KA 4YAXA 4QSQA 3U5JA 2MJVB 1WUGA 4Y03A 3K2JA 5HQ5A 3GG3A 4A9IA 3IU6A 4UIZA 5KTWA 4QB3A 4YYMA 5ETDA 4A9KA 4TZ2A 5LKXA 2N9GA 5FH8A 5DW1A 4HXNA 4N4IA 4YYJA 5EPRA 4YADA 5KTXA 4Z6HA 4NYVA 5IGNA 5FE0A 4XY9A 4UITA 4UYEA 4NR8A 5EPSA 2OO1A 5EQ1A 3DWYA 4YH3A 5D3SA 4N4HA 4WIVA 3O36A 4CUPA 5F36A 4QSXA 5HENA 5EK9A 3UV4A 4QSTA 4O71A 4A9LA 4QUUA 5A5RA 2DVSA 5II2A 5CUEA 2NXBA 4O75A 4YYIA 5FE2A 2L84A 5EVAA 5A5QA 5I7XA 4LC2A 3UW9A 4HXLA 3P1CA 4CFKA 5CUCA 5FG5A 5LUUA 3FKMX 5CUAA 5FE1A 3HMHA 3SVFA 5BT3A 2E7OA 5CQ5A 4C67A 5HRVA 5TB6A 3SVHA 4NR5A 5I29A 5C8GA 5DYXA 3S92A 5E7DA 5D3TA 4QSUA 4MEPA 5ENEA 4NS5A 5I7YA 5FE9A 3I3JA 5HQ7A 4PTBA 5C7NA 4IR6A 5FE4A 4HXPA 5F1HA 5EA1A 4PCIA 5HRXA 5A5NA 5EV9A 4UYDA 5ENFA 5FE7A 5E9YA 5ETBA 4NRCA 4YC9A 5E3DA 5C4QA 1ZS5A 3JVKA 5DW2A 5CQ4A 5A5SA 5ENHA 4TU4A 3HMEA 5HEMA 5CTLA 4O70A 4O7EA 5IG6A 4MENA 5E9LA 5F61A 3D7CA 4UIVA 5HJCA 4ZC9A 4QNSA 5CP5A 4LZ2A 5DFCA 5KTUA 3UVDA 4NQMA 3UV2A 3U5PA 2GRCA 4C66A 4Z6IA 4IR3A 4QR4A 5H1TA 4HXMA 5CS8A 5I83A 2FSAA 4OGIA 5C89A 4QZSA 5L8UA 4MEQA 2R0VA 5EPBA 5A5PA 4Q0NA 5D3HA 5E74A 5J0DA 3Q2EA 5D3RA 4O7FA 2YW5A 2E3KA 4NRBA 5AD3A 5D24A 4QSVA 5E3GA 4YBMA 5A82A 5CRZA 3TLPA 5F25A 5DFBA 5G4RA 4FLPA 5DFDA 5H85A 4PS5A 3UVWA 5A85A 5HCLA 5FE6A 4A9HA 5IGKA 5CQ7A 5LVRA 5E73A 4YY6A 2YYNA 2YEMA 3UVXA 4QY4A 4J0RA 3MUKA 4Z1QA 4UIWA 4TS8A 5LVQA 5F60A 4HBVA 3MB3A 5CQTA 3MQMA 4LR6A 5I1QA 5ENGA 2OSSA 5EGUA 4ALGA 5F62A 4MR5A 5H1VA 4QR3A 3P1FA 4HXOA 5D3JA 5II1A 4UYFB 3QZTA 4TZ8A 2I7KA 3UVYA 5FB0A 5DX4A 4Q0OA 5LKTA 4A9NA 2DATA 5CGPA 5HQ6A 2RI7A 4QBMA 4UIXA 4QEWA 2R10A 4IR4A 5CUDA 5C85A 4N4GA 5F63A 1JM4B 1JSPB 3O35A 4CUTA 5BT5A 4NR6A 5LJ0A 4BW2A 2YEKA 5CUGA 4NXJA 4YK0A 5HELA 5A5OA 5D3PA 4TYLA 4UIUA 4ZQLA 4CUQA 5CFWA 5I89A 5LJ2A 4YABA 5FE8A 5HLSA 4PY6A 4XUAA 3JVMA 3QZVA 5AMEA 5D0CA 5ENCA 4NR4A 5A83A 4YYHA 5EWDA 3HMFA 5CU8A 2KTBB 4LZRA 4UIYA 5AMFA 4NRAA 2RNWA 4IOOA 4YBTA 2RO1A 4CUUA 5DYCA 5KU3A 4ALHA 2DWWA 4YYDA 4NUCA 4F3IA 4QSSA 5IIDA 5ENJA 4QYDA 5FDZA 5KO4A 2RNXA 4QSRA 5CQ6A 2L5EA 4QUTA 5A81A 5CY9A 4OGJA 4J3IA 4LZSA 2R0SA 4QSWA 5D7XA 2RNYA 4LYIA 5FH6A 5I40A 3JVLA 4CLBA 3O33A 4IOQA 4BHWA 5DLZA 5CPEA 5CUBA 5FE5A 4MR6A 5CQAA 5D3LA 5D3NA 5E0RA 4J1PA 4QR5A 4PKLA 5L97A 4TT6A 3MXFA 4PCEA 4OUFA 4YYNA 3SVGA 5E9MA 5BT4A 2G4AA 2DVVA 3O37A 5FFVA 4DONA 2RS9B 4O72A 3AADA 4BW4A 5HFRA 4NR9A 3U5LA 3IU5A 4NQNA 4N3WA 2F6NA 5D25A 4HXKA 5IGLA 5I88A 2H60A 3P5OA 5DKCA 5EU1A 5FH7A 4O7BA 5CQ8A 4ZW1A 1WUMA 3RCWA 2YDWA 4HXSA 4LRGA 4KCXA 4LYWA 4O7CA 4WHUA 4NYWA 4AKNA 3LQJA 5CRMA 4YBSA 3Q2FA 3S91A 4O76A 5K29A 4YY4A 4HBYA 4QEVA 5L96A 2DKWA 3MB4A 4NUDA 4IORA 3QZSA 5IBNA 1F68A 5L99A 5LKUA 5FG6A 2YELA 3MULA 4A9OA 5L8TA 4UYHA 4NYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D1DA 5HFQA 4A9JA 4A9FA 3P1DA 4QC1A 4UYGA 2F6JA 5IGMA 3JVJA 2L85A 3G0JA 4LDFA 4NR7A 5AD2A 4XUBA 5F1LA 4TQNA 5F2PA 3DAIA 4YYKA 3NXBA 1E6IA 3P1EA 5DYUA 5C87A 5LJ1A 3U5OA 5TCMA 5FE3A 4O77A 3U5KA 3ONIA 4HXRA 2D82A 4O74A 4J0SA 5EP7A 5ENIA 2OUOA 5L98A 4UYFA 3U5NA 5E9IA 4TT2A 5KHMA 5F5ZA 4TT4A 5EI4A 5DYAA 5DKHA 4RVRA 5JWMA 4KV1A 5LKZA 4QC3A 4E96A 3U5MA 3LXJA 1X0JA 5ENBA 4CURA 4XYAA 4NUEA 5FBXA 5I86A 5EWCA 2D9EA 2DVQA 3G0LA 4Z93A 4CL9A 4MEOA 5EWHA 5DY7A 5D26A 4MR4A 5A7CA 4BW1A 4WHWA 4X2IA 2WP1A 1N72A 3O34A 4BW3A 5G4SA 5ACYA 5DBMA 4KV4A 4HBXA 2RFJA 5EWWA 4QYLA 5F3AA 5FG4A 2LSPB 5JI8A 5DLXA 4CUSA 5COIA 4AKIA 5E9VA 4O7AA 4IR5A 1EQFA 2I8NA 5CQ3A 5H1UA 5FB1A 4TTEA 4QEUA 4N4FA 3AQAA 4A9EA 5EICA 2E7NA 4CFLA 2WP2A 3LJWA 4LYSA 3ZYUA 4YH4A 4O78A 2YQDA 5HM0A 5CZGA 3LQHA 4TU6A 5DKDA 4HBWA 5I80A 4QSPA 4BJXA 4XY8A 4MR3A 5HRWA 5EM3A 3UV5A 2R0YA 5EWVA 5EISA 4A9MA 5FFYA 4YYGA 2DVRA 4GPJA 4Z1SA 5FFWA 3LQIA 4YATA 5E9KA 4YAXA 4QSQA 3U5JA 2MJVB 1WUGA 4Y03A 3K2JA 5HQ5A 3GG3A 4A9IA 3IU6A 4UIZA 5KTWA 4QB3A 4YYMA 5ETDA 4A9KA 4TZ2A 5LKXA 2N9GA 5FH8A 5DW1A 4HXNA 4N4IA 4YYJA 5EPRA 4YADA 5KTXA 4Z6HA 4NYVA 5IGNA 5FE0A 4XY9A 4UITA 4UYEA 4NR8A 5EPSA 2OO1A 5EQ1A 3DWYA 4YH3A 5D3SA 4N4HA 4WIVA 3O36A 4CUPA 5F36A 4QSXA 5HENA 5EK9A 3UV4A 4QSTA 4O71A 4A9LA 4QUUA 5A5RA 2DVSA 5II2A 5CUEA 2NXBA 4O75A 4YYIA 5FE2A 2L84A 5EVAA 5A5QA 5I7XA 4LC2A 3UW9A 4HXLA 3P1CA 4CFKA 5CUCA 5FG5A 5LUUA 3FKMX 5CUAA 5FE1A 3HMHA 3SVFA 5BT3A 2E7OA 5CQ5A 4C67A 5HRVA 5TB6A 3SVHA 4NR5A 5I29A 5C8GA 5DYXA 3S92A 5E7DA 5D3TA 4QSUA 4MEPA 5ENEA 4NS5A 5I7YA 5FE9A 3I3JA 5HQ7A 4PTBA 5C7NA 4IR6A 5FE4A 4HXPA 5F1HA 5EA1A 4PCIA 5HRXA 5A5NA 5EV9A 4UYDA 5ENFA 5FE7A 5E9YA 5ETBA 4NRCA 4YC9A 5E3DA 5C4QA 1ZS5A 3VKHA 3JVKA 5DW2A 5CQ4A 5A5SA 5ENHA 4TU4A 3HMEA 5HEMA 5CTLA 4O70A 4O7EA 5IG6A 4MENA 5E9LA 4AI6A 5F61A 3D7CA 4UIVA 5HJCA 4ZC9A 4QNSA 5CP5A 4LZ2A 5DFCA 5KTUA 3UVDA 4NQMA 3UV2A 3U5PA 2GRCA 4C66A 4Z6IA 4IR3A 4QR4A 5H1TA 4HXMA 5CS8A 5I83A 2FSAA 4OGIA 5C89A 4QZSA 5L8UA 4MEQA 2R0VA 5EPBA 5A5PA 4Q0NA 5D3HA 5E74A 5J0DA 3Q2EA 5D3RA 4O7FA 2YW5A 2E3KA 4NRBA 5AD3A 5D24A 4QSVA 5E3GA 4YBMA 5A82A 5CRZA 3TLPA 5F25A 5DFBA 5G4RA 4FLPA 5DFDA 5H85A 4PS5A 3UVWA 5A85A 5HCLA 5FE6A 4A9HA 5IGKA 5CQ7A 5LVRA 5E73A 2EJNA 4YY6A 2YYNA 2YEMA 3UVXA 4QY4A 4J0RA 3MUKA 4Z1QA 4UIWA 4TS8A 5LVQA 5F60A 4HBVA 3MB3A 5CQTA 3MQMA 4LR6A 5I1QA 5ENGA 2OSSA 4AKGA 5EGUA 4ALGA 5F62A 4MR5A 5H1VA 4QR3A 3P1FA 4HXOA 1ZKRA 5D3JA 5II1A 4UYFB 3QZTA 4TZ8A 2I7KA 3UVYA 5FB0A 5DX4A 4Q0OA 5LKTA 4A9NA 2DATA 5CGPA 5HQ6A 2RI7A 4QBMA 4UIXA 4QEWA 2R10A 4IR4A 5CUDA 5C85A 4N4GA 5F63A 1JM4B 1JSPB 3O35A 4CUTA 5BT5A 4NR6A 5LJ0A 4BW2A 2YEKA 5CUGA 4NXJA 4YK0A 5HELA 5A5OA 5D3PA 4TYLA 4UIUA 4ZQLA 4CUQA 5CFWA 5I89A 5LJ2A 4YABA 5FE8A 5HLSA 4PY6A 4XUAA 3JVMA 3QZVA 5AMEA 3ERRA 5D0CA 5ENCA 4NR4A 5A83A 4YYHA 5EWDA 3HMFA 5CU8A 2KTBB 4LZRA 4UIYA 4AKHA 5AMFA 4NRAA 2RNWA 4IOOA 4YBTA 2RO1A 4CUUA 5DYCA 5KU3A 4ALHA 2DWWA 4YYDA 1PUOA 4NUCA 4F3IA 4QSSA 5IIDA 5ENJA 4QYDA 5FDZA 5KO4A 2RNXA 4QSRA 5CQ6A 2L5EA 4QUTA 5A81A 5CY9A 4OGJA 4J3IA 3VKGA 4LZSA 2R0SA 4QSWA 5D7XA 2RNYA 4LYIA 5FH6A 5I40A 3JVLA 4CLBA 3O33A 4IOQA 4BHWA 5DLZA 5CPEA 5CUBA 5FE5A 4MR6A 5CQAA 5D3LA 5D3NA 5E0RA 4J1PA 4QR5A 4PKLA 5L97A 4TT6A 3MXFA 4PCEA 4OUFA 4YYNA 3D1BA 3SVGA 5E9MA 5BT4A 2G4AA 2DVVA 3O37A 5FFVA 4DONA 2RS9B 4O72A 3AADA 4BW4A 5HFRA 4NR9A 3U5LA 3IU5A 4NQNA 4N3WA 2F6NA 5D25A 4HXKA 5IGLA 5I88A 2H60A 3P5OA 5DKCA 5EU1A 5FH7A 4O7BA 5CQ8A 4ZW1A 1WUMA 3RCWA 2YDWA 4HXSA 4LRGA 4KCXA 4LYWA 4O7CA 4WHUA 4NYWA 4AKNA 3LQJA 5CRMA 4YBSA 3Q2FA 3S91A 4O76A 5K29A 4YY4A 4HBYA 4QEVA 5L96A 2DKWA 3MB4A 4NUDA 4IORA 3QZSA 5IBNA 1F68A 5L99A 5LKUA 5FG6A 2YELA 3MULA 4A9OA 5L8TA 4UYHA 4NYXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5HFQ A;  4A9J A;  4A9F A;  3P1D A;  4QC1 A;  4UYG A;  2F6J A;  5IGM A;  3JVJ A;  2L85 A;  3G0J A;  4LDF A;  4NR7 A;  5AD2 A;  4XUB A;  5F1L A;  4TQN A;  5F2P A;  3DAI A;  4YYK A;  3NXB A;  1E6I A;  3P1E A;  5DYU A;  5C87 A;  5LJ1 A;  3U5O A;  5TCM A;  5FE3 A;  4O77 A;  3U5K A;  3ONI A;  4HXR A;  2D82 A;  4O74 A;  4J0S A;  5EP7 A;  5ENI A;  2OUO A;  5L98 A;  4UYF A;  3U5N A;  5E9I A;  4TT2 A;  5KHM A;  5F5Z A;  4TT4 A;  5EI4 A;  5DYA A;  5DKH A;  4RVR A;  5JWM A;  4KV1 A;  5LKZ A;  4QC3 A;  4E96 A;  3U5M A;  3LXJ A;  1X0J A;  5ENB A;  4CUR A;  4XYA A;  4NUE A;  5FBX A;  5I86 A;  5EWC A;  2D9E A;  2DVQ A;  3G0L A;  4Z93 A;  4CL9 A;  4MEO A;  5EWH A;  5DY7 A;  5D26 A;  4MR4 A;  5A7C A;  4BW1 A;  4WHW A;  4X2I A;  2WP1 A;  1N72 A;  3O34 A;  4BW3 A;  5G4S A;  5ACY A;  5DBM A;  4KV4 A;  4HBX A;  2RFJ A;  5EWW A;  4QYL A;  5F3A A;  5FG4 A;  2LSP B;  5JI8 A;  5DLX A;  4CUS A;  5COI A;  5E9V A;  4O7A A;  4IR5 A;  1EQF A;  2I8N A;  5CQ3 A;  5H1U A;  5FB1 A;  4TTE A;  4QEU A;  4N4F A;  3AQA A;  4A9E A; 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