4TZ2A

Fragment-based screening of the bromodomain of atad2
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
129
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRAALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Fragment-Based Screening of the Bromodomain of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 129
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tz2A00
5FE2A 4KV4A 5ENJA 5E9YA 4DONA 4YABA 3O37A 3P5OA 5HQ6A 2MJVB 3SVHA 4O77A 3O35A 4ALGA 5DKHA 4TT2A 4HXSA 4O70A 5E7DA 5FG5A 2NXBA 5DYCA 5EPRA 4O72A 4HXOA 5HQ5A 3HMFA 2FSAA 4YBTA 4LZRA 5A7CA 5CRMA 2GRCA 2RO1A 4QSSA 5ENEA 4QSXA 4QYDA 5I7XA 5C87A 5CQ6A 5ENFA 2OO1A 4HBXA 4YAXA 4NR4A 4CLBA 4KV1A 4HXPA 5AMFA 5DFBA 4NXJA 2RNYA 5A82A 5C89A 5TCMA 2R10A 5H1TA 4MEPA 4CUQA 5C8GA 3UV4A 2OSSA 4ZW1A 5CU8A 4UIUA 2RNXA 4C67A 2DKWA 5F63A 5EWWA 3S92A 3MXFA 5D3TA 2YELA 5DYUA 3NXBA 3JVMA 1X0JA 5CQAA 2RNWA 4X2IA 5FH8A 4IOOA 2R0SA 5CQ3A 2L84A 4OGIA 5ENHA 4GPJA 3TLPA 5EK9A 5CY9A 4HBYA 5F1HA 5DBMA 5E9MA 4O78A 5F36A 4IORA 5A5RA 4MR5A 5FBXA 4TYLA 2DATA 5C4QA 3UVXA 4YYJA 3MB4A 4TZ2A 4QBMA 4QSQA 3SVGA 5E73A 5D26A 4O7CA 3P1EA 5LUUA 5A81A 1JSPB 4OGJA 5LKTA 2N9GA 4NYXA 5D3RA 5KU3A 4XYAA 5DY7A 4PY6A 4YK0A 2H60A 4MEQA 4A9FA 5LVQA 4IR4A 4PCIA 5D0CA 5DKCA 5F25A 5IGNA 4UYFA 5CQ7A 5A5NA 3DAIA 5LJ1A 5FFVA 1JM4B 4MR6A 4TZ8A 5D3NA 5C85A 4UYDA 5D25A 4YYMA 3LQIA 4MR3A 5EISA 4BW1A 5E9IA 5FE1A 4A9KA 4Z1QA 5HRWA 5HEMA 2DVRA 4TT4A 3I3JA 5CUEA 3ZYUA 5FE6A 4OUFA 1N72A 5CTLA 5F3AA 5EWCA 4LZ2A 4PKLA 5HJCA 4QEVA 4NR8A 4LYWA 3GG3A 5CQTA 5I89A 5A83A 5CZGA 4NRAA 4CUPA 5JWMA 5FG6A 2YW5A 3HMHA 2G4AA 5L96A 3IU6A 3JVJA 3UV5A 4QUUA 4NQMA 5F60A 4A9MA 3U5KA 5HLSA 2OUOA 4A9HA 4F3IA 4NYWA 4NR7A 4TU4A 5ENGA 4A9JA 3S91A 4LYIA 5E74A 5EGUA 4QSPA 3MULA 4LRGA 1E6IA 5I86A 5I1QA 5EVAA 5CQ8A 4QSTA 4ZQLA 4UYGA 5A5PA 5FE9A 4NS5A 4N4IA 4PS5A 5BT5A 5J0DA 5FE7A 5EWDA 5DLXA 5FB1A 4QB3A 5ENBA 3JVLA 5CQ5A 3UVWA 4IR3A 3P1DA 5I40A 3G0JA 5F2PA 5HM0A 5AD2A 2R0VA 4TU6A 5CGPA 4YH3A 5C7NA 5DW2A 4AKNA 4UITA 2DWWA 2I7KA 4XUAA 5H85A 4O74A 4BW3A 5EI4A 5KTUA 5HRVA 4HBWA 5CUBA 3QZSA 5LKZA 5IBNA 4QSUA 4UYHA 5LJ2A 4WHUA 4O75A 2DVSA 4YYKA 5FE5A 5EP7A 4HBVA 4A9NA 3UV2A 5JI8A 4RVRA 5EQ1A 2L85A 4O7EA 5H1VA 4J0SA 4N4HA 5ENIA 4QEUA 4Z6HA 4LYSA 4TQNA 3LQHA 4FLPA 5EM3A 4NR6A 5I88A 4PTBA 5EICA 3DWYA 5E9VA 2L5EA 4HXMA 2WP1A 5ETDA 4ZC9A 3MB3A 5LJ0A 4NUCA 4NR9A 4J3IA 5DFCA 3P1CA 5DYAA 5G4SA 4CUSA 4YYDA 4KCXA 2RS9B 3LXJA 1WUGA 3SVFA 2RI7A 5LVRA 5G4RA 5FB0A 4HXKA 3D7CA 4LC2A 5CUAA 2D82A 4E96A 5E0RA 4YADA 5E9KA 4HXLA 5IIDA 5F61A 3K2JA 4NR5A 4YYHA 5L98A 2YDWA 3AADA 4NQNA 4O7FA 5K29A 4ALHA 4QY4A 1F68A 5IGMA 4UIZA 5EPBA 2YYNA 4TTEA 3UVYA 2YEKA 5HENA 2YEMA 3UW9A 3Q2EA 5KTWA 4J1PA 4NUEA 5HELA 4N3WA 5BT3A 4NYVA 3FKMX 4BHWA 2E7OA 3O34A 5CUDA 4N4GA 5L97A 4YYNA 5A5SA 4IR5A 4IR6A 3G0LA 4Z6IA 5EA1A 4QNSA 5HCLA 4QR3A 4CUTA 5I83A 5FFYA 3IU5A 4YYIA 4BW4A 4CL9A 5I7YA 5I29A 5CFWA 2WP2A 5D3HA 5E3DA 4YH4A 5AD3A 5D3LA 4A9OA 2YQDA 5FH6A 4QEWA 4YBSA 3AQAA 4WIVA 5TB6A 4XY8A 5DX4A 1WUMA 5CUGA 2R0YA 5D3SA 4O7BA 5H1UA 5CS8A 5DW1A 5A5QA 3LQJA 3RCWA 3O36A 4QSWA 2D9EA 5COIA 3U5PA 4Q0NA 2I8NA 5DKDA 5HFRA 4NRCA 4Z1SA 5FE8A 5II2A 4J0RA 3O33A 3LJWA 2DVQA 3MUKA 4BJXA 3U5JA 5L8TA 5A85A 5EU1A 2RFJA 2KTBB 4XUBA 4CFLA 4CFKA 1ZS5A 3JVKA 2E7NA 5HFQA 5IGLA 5EPSA 5II1A 5F1LA 5KTXA 4TT6A 4YY4A 4YATA 4YY6A 4A9LA 5ACYA 2DVVA 4BW2A 3ONIA 3UVDA 5HRXA 4QC1A 5FE4A 5FDZA 5EV9A 5FG4A 4CURA 4N4FA 5L99A 1EQFA 4Z93A 5FFWA 5CQ4A 5I80A 5LKXA 5IGKA 5D3JA 5D24A 4O76A 5A5OA 2F6NA 5ENCA 4C66A 4IOQA 4YC9A 4UYEA 4PCEA 5EWVA 5FH7A 5D3PA 4HXNA 4NRBA 4UYFB 4MENA 5CP5A 3P1FA 3QZVA 5CUCA 4QC3A 5IG6A 4A9EA 4CUUA 5FE0A 4LDFA 4WHWA 5BT4A 4Q0OA 5DYXA 5F5ZA 2E3KA 4LZSA 5KHMA 3U5OA 4Y03A 3Q2FA 3MQMA 3QZTA 2LSPB 4HXRA 4TS8A 5LKUA 5D7XA 4UIWA 5HQ7A 4QR4A 3HMEA 5E3GA 4MR4A 5ETBA 4QZSA 5CRZA 3U5MA 4QSRA 3U5NA 4UIVA 5E9LA 4QUTA 5KO4A 4QYLA 5EWHA 4O7AA 2F6JA 4UIXA 4NUDA 4XY9A 5DFDA 4A9IA 4YYGA 4UIYA 5F62A 3U5LA 5AMEA 4O71A 4YBMA 5CPEA 4QSVA 5FE3A 5L8UA 4MEOA 4QR5A 5DLZA 4LR6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE2A 4KV4A 5ENJA 5E9YA 4DONA 4YABA 3O37A 3P5OA 5HQ6A 2MJVB 3SVHA 4O77A 3O35A 4ALGA 5DKHA 4TT2A 4HXSA 4O70A 5E7DA 5FG5A 2NXBA 5DYCA 5EPRA 4AKIA 4O72A 4HXOA 5HQ5A 3HMFA 2FSAA 4YBTA 4LZRA 5A7CA 5CRMA 2GRCA 2RO1A 4QSSA 5ENEA 4QSXA 4AI6A 4QYDA 5I7XA 5C87A 5CQ6A 5ENFA 2OO1A 4HBXA 4YAXA 4NR4A 4CLBA 4KV1A 4HXPA 5AMFA 5DFBA 4NXJA 2RNYA 5A82A 5C89A 5TCMA 2R10A 5H1TA 4MEPA 4CUQA 5C8GA 3UV4A 2OSSA 4ZW1A 5CU8A 4UIUA 2RNXA 4C67A 2DKWA 5F63A 5EWWA 3S92A 3VKGA 3MXFA 5D3TA 2YELA 5DYUA 3NXBA 3JVMA 1X0JA 5CQAA 2RNWA 4X2IA 5FH8A 4IOOA 2R0SA 5CQ3A 2L84A 4OGIA 5ENHA 4GPJA 3TLPA 5EK9A 5CY9A 4HBYA 5F1HA 5DBMA 5E9MA 4O78A 5F36A 4IORA 5A5RA 4MR5A 5FBXA 4TYLA 2DATA 5C4QA 3UVXA 4YYJA 3MB4A 4TZ2A 4QBMA 4QSQA 3SVGA 5E73A 5D26A 4O7CA 3P1EA 5LUUA 5A81A 1JSPB 4OGJA 5LKTA 2N9GA 4NYXA 5D3RA 5KU3A 4XYAA 5DY7A 4PY6A 4YK0A 2H60A 4MEQA 4A9FA 5LVQA 4IR4A 4PCIA 5D0CA 5DKCA 5F25A 5IGNA 4UYFA 5CQ7A 5A5NA 3DAIA 5LJ1A 5FFVA 1JM4B 4MR6A 4TZ8A 5D3NA 5C85A 4UYDA 5D25A 4YYMA 3LQIA 4MR3A 5EISA 4BW1A 5E9IA 5FE1A 4A9KA 4Z1QA 5HRWA 5HEMA 2DVRA 4TT4A 3I3JA 5CUEA 3ZYUA 5FE6A 4OUFA 1N72A 5CTLA 5F3AA 5EWCA 4LZ2A 4PKLA 5HJCA 4QEVA 4NR8A 4LYWA 3GG3A 3VKHA 5CQTA 5I89A 5A83A 5CZGA 4NRAA 3D1DA 4CUPA 5JWMA 5FG6A 2YW5A 3HMHA 2G4AA 5L96A 3IU6A 3JVJA 3UV5A 4QUUA 4NQMA 5F60A 4A9MA 3U5KA 5HLSA 2OUOA 4A9HA 4F3IA 4NYWA 4NR7A 4TU4A 5ENGA 4A9JA 3S91A 4LYIA 5E74A 5EGUA 4QSPA 3MULA 4LRGA 1E6IA 5I86A 5I1QA 5EVAA 5CQ8A 4QSTA 4AKHA 4ZQLA 4UYGA 5A5PA 5FE9A 4NS5A 4N4IA 4PS5A 5BT5A 5J0DA 5FE7A 5EWDA 5DLXA 5FB1A 4QB3A 5ENBA 3JVLA 5CQ5A 3UVWA 4IR3A 3P1DA 5I40A 3G0JA 5F2PA 5HM0A 5AD2A 2R0VA 1PUOA 4TU6A 5CGPA 4YH3A 5C7NA 5DW2A 4AKNA 4UITA 2DWWA 2I7KA 4XUAA 5H85A 4O74A 4BW3A 5EI4A 5KTUA 5HRVA 4HBWA 5CUBA 3QZSA 5LKZA 5IBNA 4QSUA 4UYHA 5LJ2A 4WHUA 4O75A 2DVSA 4YYKA 5FE5A 5EP7A 4HBVA 4A9NA 3UV2A 5JI8A 4RVRA 5EQ1A 2L85A 4O7EA 5H1VA 4J0SA 4N4HA 5ENIA 4QEUA 4Z6HA 4LYSA 4TQNA 3LQHA 4FLPA 5EM3A 4NR6A 5I88A 4PTBA 5EICA 3DWYA 5E9VA 2L5EA 4HXMA 2WP1A 5ETDA 4ZC9A 3MB3A 5LJ0A 4NUCA 4NR9A 4J3IA 5DFCA 3P1CA 5DYAA 5G4SA 3ERRA 4CUSA 4YYDA 4KCXA 2RS9B 3LXJA 1WUGA 3SVFA 2RI7A 5LVRA 5G4RA 5FB0A 4HXKA 3D7CA 4LC2A 5CUAA 2EJNA 2D82A 4E96A 5E0RA 4YADA 5E9KA 4HXLA 5IIDA 5F61A 3K2JA 4NR5A 4YYHA 5L98A 2YDWA 3AADA 4NQNA 4O7FA 5K29A 4ALHA 1ZKRA 4QY4A 1F68A 5IGMA 4UIZA 5EPBA 2YYNA 4TTEA 3UVYA 2YEKA 5HENA 2YEMA 3UW9A 4AKGA 3Q2EA 5KTWA 4J1PA 4NUEA 5HELA 4N3WA 5BT3A 4NYVA 3FKMX 4BHWA 2E7OA 3O34A 5CUDA 4N4GA 5L97A 4YYNA 5A5SA 4IR5A 4IR6A 3G0LA 4Z6IA 5EA1A 4QNSA 5HCLA 4QR3A 4CUTA 5I83A 5FFYA 3IU5A 4YYIA 4BW4A 4CL9A 5I7YA 5I29A 5CFWA 2WP2A 5D3HA 5E3DA 4YH4A 5AD3A 5D3LA 4A9OA 2YQDA 5FH6A 4QEWA 4YBSA 3AQAA 4WIVA 5TB6A 4XY8A 5DX4A 1WUMA 5CUGA 2R0YA 5D3SA 4O7BA 5H1UA 5CS8A 5DW1A 5A5QA 3LQJA 3RCWA 3O36A 4QSWA 2D9EA 5COIA 3U5PA 4Q0NA 2I8NA 3D1BA 5DKDA 5HFRA 4NRCA 4Z1SA 5FE8A 5II2A 4J0RA 3O33A 3LJWA 2DVQA 3MUKA 4BJXA 3U5JA 5L8TA 5A85A 5EU1A 2RFJA 2KTBB 4XUBA 4CFLA 4CFKA 1ZS5A 3JVKA 2E7NA 5HFQA 5IGLA 5EPSA 5II1A 5F1LA 5KTXA 4TT6A 4YY4A 4YATA 4YY6A 4A9LA 5ACYA 2DVVA 4BW2A 3ONIA 3UVDA 5HRXA 4QC1A 5FE4A 5FDZA 5EV9A 5FG4A 4CURA 4N4FA 5L99A 1EQFA 4Z93A 5FFWA 5CQ4A 5I80A 5LKXA 5IGKA 5D3JA 5D24A 4O76A 5A5OA 2F6NA 5ENCA 4C66A 4IOQA 4YC9A 4UYEA 4PCEA 5EWVA 5FH7A 5D3PA 4HXNA 4NRBA 4UYFB 4MENA 5CP5A 3P1FA 3QZVA 5CUCA 4QC3A 5IG6A 4A9EA 4CUUA 5FE0A 4LDFA 4WHWA 5BT4A 4Q0OA 5DYXA 5F5ZA 2E3KA 4LZSA 5KHMA 3U5OA 4Y03A 3Q2FA 3MQMA 3QZTA 2LSPB 4HXRA 4TS8A 5LKUA 5D7XA 4UIWA 5HQ7A 4QR4A 3HMEA 5E3GA 4MR4A 5ETBA 4QZSA 5CRZA 3U5MA 4QSRA 3U5NA 4UIVA 5E9LA 4QUTA 5KO4A 4QYLA 5EWHA 4O7AA 2F6JA 4UIXA 4NUDA 4XY9A 5DFDA 4A9IA 4YYGA 4UIYA 5F62A 3U5LA 5AMEA 4O71A 4YBMA 5CPEA 4QSVA 5FE3A 5L8UA 4MEOA 4QR5A 5DLZA 4LR6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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