5A5NA

Crystal structure of human atad2 bromodomain in complex with (2s)-2,6- diacetamido-n-methylhexanamide
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords ATPASE FAMILY AAA DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 2
publication title Fragment-Based Discovery of Low-Micromolar Atad2 Bromodomain Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2015-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5a5nA00
5FFWA 5ETDA 4NR5A 4NR9A 4HBXA 2L85A 2F6NA 3O35A 4QC1A 3U5PA 4O7BA 2RFJA 4QYLA 4HXLA 2YQDA 2E7OA 4QYDA 4IOOA 4QUTA 5EISA 5G4RA 5A5PA 5F62A 2D9EA 2R0VA 5LJ0A 5I1QA 4YH4A 5CQAA 5L97A 3HMFA 5ENEA 4LZ2A 3MQMA 5FE8A 4TZ8A 5DW2A 4NRCA 5ENGA 4UIVA 5EGUA 4IR5A 2I7KA 3AADA 5J0DA 2DKWA 1JSPB 4UITA 3P1EA 5CUDA 3K2JA 5TCMA 4MR6A 4FLPA 4Y03A 4UIZA 5C87A 3O33A 5A5RA 4YYDA 2GRCA 4IR3A 5FBXA 5DYXA 3U5KA 5CQ3A 3UV5A 4J0SA 4PTBA 4TU4A 4XUAA 4HXOA 4CUTA 4YY4A 3U5LA 4O7CA 5EI4A 4BW2A 5HCLA 4NYXA 4QC3A 5IG6A 5E9VA 4A9OA 4QSSA 2D82A 3JVJA 3AQAA 5EPSA 3IU6A 5HQ6A 5I88A 3UV2A 4UYDA 4YYGA 4QSTA 2RNXA 3D7CA 5FE0A 4BW3A 4A9MA 3TLPA 3Q2FA 3UV4A 4AKNA 4IR6A 2YEMA 5E7DA 5ENIA 4PKLA 4YATA 5ENHA 4CL9A 5C85A 3U5OA 5E74A 5D3NA 5LKUA 2MJVB 5ACYA 5DLZA 5TB6A 5D3JA 3JVMA 4PY6A 3MULA 3ZYUA 5E9KA 4OGIA 3ONIA 4IOQA 3UVWA 4MEQA 5CUGA 5E9YA 4YYNA 5KTUA 4O74A 5FE2A 5DX4A 4J3IA 5CGPA 4IORA 3G0LA 5EV9A 4YY6A 5A5SA 4TYLA 2OO1A 5I7YA 4WHWA 4LZRA 4CFLA 4MEPA 5LVQA 5C7NA 5KU3A 3LQJA 5DFDA 5F1LA 4HXKA 4RVRA 4J1PA 5FH8A 2YELA 4TS8A 2RO1A 3UW9A 3I3JA 5D26A 4LR6A 5I40A 5IGLA 5A5QA 5FH7A 4QR5A 5CTLA 4BHWA 4A9HA 5FE7A 4CUUA 3P1FA 4KCXA 3P1DA 5FE6A 5D3PA 5HQ7A 4XY8A 4TT4A 5ENJA 5DYCA 4PS5A 5EM3A 5E9MA 4BJXA 4X2IA 4LYSA 4QBMA 5FG5A 2RNWA 4NQNA 5EQ1A 5EA1A 2L5EA 4A9FA 2RI7A 5EPBA 4LYWA 5A85A 4ALHA 5BT5A 3FKMX 5LVRA 5BT3A 5D7XA 4QSRA 2RS9B 4QSVA 2DVQA 2RNYA 4N4IA 5DKHA 1JM4B 3O34A 4XY9A 5FG4A 2WP1A 4Z6IA 3MB3A 4XUBA 4WIVA 3MUKA 4YYMA 2YEKA 5C4QA 4N4FA 4LZSA 4N4HA 5CS8A 5FE3A 5I86A 5EPRA 3DWYA 5CU8A 5CPEA 4Z1SA 2E7NA 2YYNA 4QEVA 4YC9A 5HRWA 4QSPA 2E3KA 2R10A 3SVHA 5ENFA 5HFQA 3HMEA 3UVXA 4NUCA 5FG6A 5A5NA 4HXSA 4LC2A 5AD3A 5LJ1A 4MR5A 5L8TA 5F36A 3LQHA 4NR7A 4O71A 4O72A 4E96A 5LUUA 5D3SA 4DONA 5D3TA 4QSXA 3QZTA 4TTEA 4CFKA 5EU1A 5KO4A 4IR4A 4QSQA 5HRXA 5I29A 4UYFA 5IBNA 5FB1A 5FH6A 5CQ5A 3JVLA 4MR4A 5FFYA 4TT2A 2DVRA 4QR4A 3LJWA 2H60A 4YABA 4QR3A 5FE4A 3UVYA 2YW5A 5A5OA 5DY7A 4CUPA 4YADA 3MB4A 4MR3A 2WP2A 5C8GA 3U5MA 5CQ4A 4UIYA 4NUEA 5CY9A 2YDWA 4LYIA 4ALGA 1EQFA 5CQTA 4UIWA 3S91A 2DATA 5L96A 4HBVA 4HXPA 4QEUA 4YAXA 5FB0A 4QNSA 4YBSA 5D3LA 5DKDA 1WUGA 4O75A 2OUOA 4OUFA 5F61A 1WUMA 4HBWA 5IGKA 5HRVA 5HLSA 5HJCA 4HXMA 4O7EA 2I8NA 2DWWA 5H85A 2FSAA 5C89A 2N9GA 4YYJA 4CUQA 3SVFA 3IU5A 4QB3A 4WHUA 5JWMA 5F3AA 5FFVA 3UVDA 5E3DA 5I80A 5EWCA 5HFRA 3P5OA 4Z93A 4YBMA 2L84A 5D0CA 5F60A 5E9IA 5HENA 4C66A 4O7FA 4YYIA 4BW4A 4KV4A 5H1VA 3MXFA 5D3HA 4YBTA 5DBMA 5F63A 4UIXA 3HMHA 5KTXA 5IGNA 5H1TA 5CUAA 4PCEA 2KTBB 5DFCA 2DVVA 4YYKA 5LKTA 3JVKA 5L99A 3NXBA 5LKZA 2DVSA 5EWWA 4BW1A 5II2A 5COIA 5HELA 4HXNA 4UIUA 5ENCA 3O36A 5H1UA 4CURA 5DW1A 5ENBA 4CUSA 4QUUA 2LSPB 4HXRA 4TT6A 4QSUA 3Q2EA 5LJ2A 2F6JA 5JI8A 4YK0A 4PCIA 5KTWA 4Q0OA 4TZ2A 5AMEA 5F25A 5L8UA 2R0YA 5E9LA 5F2PA 4QY4A 5CP5A 5F1HA 4ZC9A 5HEMA 4J0RA 5A81A 4XYAA 4QEWA 5DKCA 1F68A 5ETBA 5KHMA 5D24A 3LXJA 5IIDA 5CUBA 5LKXA 5E73A 4NS5A 5DYAA 4NRAA 5HM0A 5EWHA 4Z1QA 5AD2A 4N4GA 4MENA 4NQMA 5L98A 4NUDA 5A7CA 5BT4A 3QZVA 4F3IA 4N3WA 5A83A 4CLBA 4OGJA 3SVGA 5EICA 5G4SA 4O76A 3DAIA 5EVAA 5EWDA 5AMFA 3G0JA 5CRMA 5K29A 5FE5A 5FE9A 4KV1A 4HBYA 5I83A 4QSWA 4TU6A 4O7AA 5DFBA 4NRBA 4O78A 4A9EA 5EWVA 5I89A 4TQNA 4NXJA 4A9LA 5FE1A 5CQ6A 5II1A 4YH3A 4NR6A 5CUCA 5D25A 4Z6HA 5CQ8A 4UYGA 1X0JA 3U5NA 2NXBA 4UYEA 4LDFA 4NR8A 2G4AA 4QZSA 4NYWA 5CRZA 1ZS5A 5DYUA 4NR4A 4ZQLA 4A9JA 3RCWA 5CFWA 4O77A 5CQ7A 3S92A 5E0RA 4GPJA 5IGMA 4LRGA 4C67A 5CUEA 4UYHA 4A9NA 5HQ5A 4NYVA 3O37A 5A82A 1N72A 2OSSA 4MEOA 4UYFB 5D3RA 1E6IA 2R0SA 5F5ZA 5FDZA 4A9KA 3LQIA 5DLXA 4YYHA 3QZSA 5CZGA 4A9IA 4O70A 3GG3A 3P1CA 3U5JA 5EK9A 5EP7A 5I7XA 4Q0NA 4ZW1A 5E3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FFWA 5ETDA 4NR5A 4NR9A 4HBXA 2L85A 2F6NA 3O35A 4QC1A 3U5PA 4O7BA 2RFJA 4QYLA 4HXLA 2YQDA 2E7OA 4QYDA 4IOOA 4QUTA 5EISA 5G4RA 5A5PA 5F62A 2D9EA 2R0VA 5LJ0A 5I1QA 4YH4A 5CQAA 5L97A 3HMFA 5ENEA 4LZ2A 3MQMA 5FE8A 4TZ8A 5DW2A 4NRCA 5ENGA 4UIVA 5EGUA 4IR5A 2I7KA 3AADA 5J0DA 2DKWA 1JSPB 4UITA 3P1EA 5CUDA 3K2JA 5TCMA 4MR6A 4FLPA 4Y03A 4UIZA 5C87A 3O33A 5A5RA 4YYDA 2GRCA 4IR3A 5FBXA 5DYXA 3U5KA 5CQ3A 3UV5A 4J0SA 4PTBA 4TU4A 4XUAA 4HXOA 4CUTA 4YY4A 3U5LA 4O7CA 5EI4A 4BW2A 5HCLA 4NYXA 4QC3A 5IG6A 5E9VA 4A9OA 4QSSA 2D82A 3JVJA 3AQAA 5EPSA 3IU6A 5HQ6A 5I88A 3UV2A 4UYDA 4YYGA 4QSTA 3VKGA 2RNXA 3D7CA 5FE0A 4BW3A 4A9MA 3TLPA 3Q2FA 3UV4A 4AKNA 4IR6A 2YEMA 5E7DA 5ENIA 4PKLA 4YATA 5ENHA 4CL9A 5C85A 3U5OA 5E74A 5D3NA 5LKUA 2MJVB 5ACYA 5DLZA 5TB6A 5D3JA 3JVMA 4PY6A 3MULA 3ZYUA 5E9KA 4OGIA 3ONIA 4IOQA 3UVWA 4MEQA 5CUGA 5E9YA 4YYNA 5KTUA 4O74A 5FE2A 5DX4A 4J3IA 5CGPA 4IORA 3G0LA 5EV9A 4YY6A 3ERRA 5A5SA 4TYLA 2OO1A 5I7YA 4WHWA 4LZRA 4CFLA 4MEPA 5LVQA 5C7NA 5KU3A 3LQJA 5DFDA 5F1LA 4HXKA 4RVRA 4AKHA 4J1PA 5FH8A 2YELA 4TS8A 2RO1A 3UW9A 3I3JA 5D26A 4LR6A 5I40A 5IGLA 5A5QA 5FH7A 4QR5A 5CTLA 4BHWA 4A9HA 5FE7A 4CUUA 3P1FA 4KCXA 3P1DA 5FE6A 5D3PA 5HQ7A 4XY8A 4TT4A 5ENJA 5DYCA 4PS5A 5EM3A 5E9MA 4BJXA 4X2IA 4LYSA 4QBMA 5FG5A 2RNWA 4NQNA 5EQ1A 5EA1A 2L5EA 4A9FA 2RI7A 5EPBA 4LYWA 5A85A 4ALHA 5BT5A 3FKMX 5LVRA 5BT3A 5D7XA 4QSRA 2RS9B 4QSVA 2DVQA 2RNYA 4N4IA 5DKHA 1JM4B 3O34A 4XY9A 5FG4A 2WP1A 4Z6IA 3MB3A 4XUBA 4WIVA 3MUKA 4YYMA 2YEKA 5C4QA 4N4FA 4LZSA 4N4HA 5CS8A 5FE3A 5I86A 5EPRA 3DWYA 5CU8A 5CPEA 4Z1SA 2E7NA 2YYNA 4QEVA 4YC9A 5HRWA 4QSPA 2E3KA 2R10A 3SVHA 5ENFA 5HFQA 3HMEA 3UVXA 4NUCA 5FG6A 5A5NA 4HXSA 4LC2A 5AD3A 5LJ1A 4MR5A 5L8TA 4AI6A 5F36A 3LQHA 4NR7A 4O71A 4O72A 4E96A 5LUUA 5D3SA 4DONA 5D3TA 4QSXA 3QZTA 4TTEA 4CFKA 5EU1A 5KO4A 4IR4A 4QSQA 5HRXA 5I29A 4UYFA 5IBNA 5FB1A 5FH6A 4AKIA 5CQ5A 2EJNA 3D1DA 3JVLA 4MR4A 5FFYA 4TT2A 2DVRA 4QR4A 3LJWA 2H60A 4YABA 4QR3A 5FE4A 3UVYA 2YW5A 5A5OA 5DY7A 4CUPA 4YADA 3MB4A 4MR3A 2WP2A 5C8GA 3U5MA 1ZKRA 5CQ4A 1PUOA 4UIYA 4NUEA 5CY9A 2YDWA 4LYIA 4ALGA 1EQFA 5CQTA 4UIWA 3S91A 2DATA 5L96A 4HBVA 4HXPA 4QEUA 4YAXA 5FB0A 4QNSA 4YBSA 5D3LA 5DKDA 1WUGA 4O75A 2OUOA 4OUFA 5F61A 1WUMA 4HBWA 5IGKA 5HRVA 5HLSA 5HJCA 4HXMA 4O7EA 2I8NA 2DWWA 5H85A 2FSAA 5C89A 2N9GA 4YYJA 4CUQA 3SVFA 3IU5A 4QB3A 4WHUA 5JWMA 5F3AA 5FFVA 3UVDA 5E3DA 5I80A 5EWCA 5HFRA 3P5OA 4Z93A 4YBMA 2L84A 5D0CA 5F60A 5E9IA 5HENA 4C66A 4O7FA 4YYIA 4BW4A 4KV4A 5H1VA 3MXFA 5D3HA 4YBTA 5DBMA 5F63A 4UIXA 3D1BA 3HMHA 5KTXA 5IGNA 5H1TA 5CUAA 4PCEA 2KTBB 5DFCA 2DVVA 4YYKA 5LKTA 3JVKA 5L99A 3NXBA 5LKZA 2DVSA 5EWWA 4BW1A 5II2A 5COIA 5HELA 4HXNA 4UIUA 5ENCA 3O36A 5H1UA 4CURA 5DW1A 5ENBA 4CUSA 4QUUA 2LSPB 4HXRA 4TT6A 4QSUA 3Q2EA 5LJ2A 2F6JA 5JI8A 4YK0A 4PCIA 5KTWA 4Q0OA 4TZ2A 5AMEA 5F25A 5L8UA 2R0YA 5E9LA 5F2PA 4QY4A 5CP5A 5F1HA 4ZC9A 5HEMA 4J0RA 5A81A 4XYAA 4QEWA 5DKCA 1F68A 5ETBA 5KHMA 5D24A 3LXJA 5IIDA 5CUBA 5LKXA 5E73A 4NS5A 5DYAA 4NRAA 5HM0A 5EWHA 4Z1QA 5AD2A 4N4GA 4MENA 4NQMA 5L98A 4NUDA 5A7CA 5BT4A 3QZVA 4F3IA 4N3WA 5A83A 4CLBA 4OGJA 3SVGA 5EICA 5G4SA 4O76A 3DAIA 5EVAA 5EWDA 5AMFA 3G0JA 5CRMA 5K29A 5FE5A 5FE9A 4KV1A 4HBYA 5I83A 4QSWA 4TU6A 4O7AA 5DFBA 4NRBA 4O78A 4A9EA 5EWVA 5I89A 4TQNA 4NXJA 4A9LA 5FE1A 5CQ6A 5II1A 4YH3A 4NR6A 5CUCA 5D25A 4Z6HA 5CQ8A 4UYGA 1X0JA 4AKGA 3U5NA 2NXBA 4UYEA 4LDFA 4NR8A 2G4AA 4QZSA 4NYWA 5CRZA 1ZS5A 5DYUA 4NR4A 4ZQLA 4A9JA 3RCWA 5CFWA 4O77A 5CQ7A 3S92A 5E0RA 4GPJA 3VKHA 5IGMA 4LRGA 4C67A 5CUEA 4UYHA 4A9NA 5HQ5A 4NYVA 3O37A 5A82A 1N72A 2OSSA 4MEOA 4UYFB 5D3RA 1E6IA 2R0SA 5F5ZA 5FDZA 4A9KA 3LQIA 5DLXA 4YYHA 3QZSA 5CZGA 4A9IA 4O70A 3GG3A 3P1CA 3U5JA 5EK9A 5EP7A 5I7XA 4Q0NA 4ZW1A 5E3GA
chains in the Genus database with same CATH topology
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