5KTWA

Crebbp bromodomain in complex with cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1h-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-n-isopropylbenzamide)
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
AAFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5ktwA00
2NXBA 5CFWA 3HMHA 4WHWA 2L85A 4NXJA 4UYHA 3JVJA 4MEQA 4NYXA 5CUGA 5D3NA 5L8UA 1WUMA 3AADA 4FLPA 4QYLA 5HRWA 5I7YA 4X2IA 3K2JA 4HBWA 2KTBB 4LZ2A 4CL9A 4J3IA 4UIZA 4TZ2A 5HQ6A 5CUAA 2RI7A 5I83A 4BHWA 4NR8A 5HFQA 4IOOA 3HMFA 3IU6A 4HXOA 5CQ5A 5ENIA 4O72A 4A9LA 5J0DA 4TZ8A 5CUCA 5F3AA 5ETBA 2YYNA 4UYGA 4UIWA 5FE1A 2YELA 5LKZA 5DFBA 5ENBA 4YBMA 5HLSA 5E3GA 4PY6A 4LZRA 3Q2FA 4PCIA 4TT2A 5DYUA 3TLPA 4F3IA 5I29A 4A9NA 5F36A 4HBVA 5DKDA 3FKMX 2R0YA 3SVFA 3NXBA 4QBMA 5CPEA 5DYCA 4NRAA 4LYWA 2E7OA 3D7CA 5KTWA 4QSTA 5A5QA 4UYDA 5AD2A 5TB6A 5E0RA 4O7BA 5E9MA 4XY8A 5DLZA 3O35A 4NUCA 5FE5A 4Q0NA 5EWCA 4QSSA 3P5OA 5FH7A 5I40A 3Q2EA 5EGUA 2RFJA 2YEMA 4YAXA 5G4RA 3U5PA 4QYDA 4MEOA 3MUKA 5F62A 5A7CA 4HXSA 4CLBA 5FG4A 4UYFA 5IGKA 4IR3A 4UITA 5HQ7A 5EWHA 3LQIA 5FB0A 5DW2A 5CP5A 5II1A 4XY9A 5L98A 1F68A 4UIXA 4O75A 4NR7A 4QR5A 3MB3A 5EK9A 2L84A 4YATA 4O71A 4NR5A 5A5SA 4BW1A 3MXFA 5ENEA 2DWWA 4O7AA 4KV1A 5I7XA 5CTLA 5FE9A 5IGLA 5I89A 5KU3A 3AQAA 4C66A 4HBXA 4QC1A 5A81A 4LYSA 5F63A 2YEKA 5HRVA 5CY9A 4CUUA 5CQ6A 4QUUA 4TYLA 4XYAA 4ZW1A 5CQAA 5EWVA 5D3HA 4MR4A 4LC2A 4QSPA 3UW9A 4QY4A 5DX4A 5L8TA 4QSUA 4QR3A 5CZGA 5FH8A 4BW3A 5I1QA 5E3DA 5EICA 4NQNA 5D3PA 4A9JA 4OUFA 5CRZA 4YADA 4C67A 2R0VA 2H60A 5E9IA 5E9VA 4QR4A 5EISA 5C4QA 4XUAA 4GPJA 5COIA 4YH3A 5EA1A 5JWMA 4IORA 4HXMA 4MR6A 3U5LA 5H1TA 4WIVA 4OGJA 4ZC9A 3UV2A 5LKXA 3JVLA 4QEUA 5L97A 2YW5A 5ACYA 5CUBA 5EPRA 2D82A 4A9IA 2YDWA 3UV4A 4QSVA 4Y03A 4BW4A 2DVQA 2E3KA 3IU5A 2LSPB 2FSAA 2YQDA 5A83A 2I8NA 5LJ0A 3U5OA 5A5PA 4YYDA 5F1HA 5E9LA 4MEPA 3LQHA 4QSQA 3UVDA 4NR9A 4CFLA 5BT5A 4QEWA 4YYJA 2D9EA 4IR5A 4WHUA 5HEMA 4YYNA 4LR6A 3U5MA 5A5OA 5LVQA 3LQJA 3QZTA 4YY4A 2RNYA 4QUTA 5TCMA 4O78A 5DBMA 4HXLA 5F61A 5D7XA 5C89A 4A9OA 2RNWA 3O36A 5DYAA 4PTBA 4YBSA 5CQTA 4QC3A 4QSRA 5LKTA 5E9KA 3UVYA 5C7NA 5IIDA 4MENA 2N9GA 4NRBA 5DLXA 3ONIA 4YK0A 5A85A 5EI4A 5FE4A 3SVHA 5K29A 4TT6A 5FE0A 4YBTA 2G4AA 4TU6A 5HQ5A 5CQ7A 5D25A 5D3JA 4YYGA 5FB1A 5EWDA 5I86A 3G0LA 4BW2A 5D3RA 5F60A 4NR4A 4UIYA 5LVRA 3LXJA 4RVRA 5FE8A 5I80A 5CGPA 3ZYUA 4YABA 4TT4A 5HM0A 5F1LA 4O7FA 5FFWA 5ENJA 5FE2A 4J0SA 4UYFB 4Z1QA 4NQMA 5C85A 3O37A 4YC9A 4TS8A 1E6IA 3QZSA 3P1CA 5A5NA 5KTUA 3DAIA 2DKWA 4N4IA 4N4GA 5ENGA 1ZS5A 4CFKA 5C8GA 3P1EA 5CUEA 5ENCA 4IR6A 3S92A 2RNXA 4NS5A 2DVSA 5ENFA 4Z1SA 2OUOA 3JVKA 5ENHA 5H1VA 5DFDA 5DKHA 5IGMA 5KTXA 5AMEA 4MR5A 5CUDA 4NR6A 3U5NA 4J0RA 5IGNA 4TQNA 3JVMA 2WP1A 4CUPA 5D24A 3G0JA 4QEVA 5FH6A 4O77A 3GG3A 5CQ4A 4N3WA 4Q0OA 3LJWA 3QZVA 5A5RA 2DVVA 5FDZA 3RCWA 5CQ3A 1EQFA 2R0SA 4UIUA 4UIVA 3S91A 5D3TA 5HELA 4YYKA 5H1UA 5HRXA 5F5ZA 5HCLA 4A9HA 5LJ2A 5DYXA 2MJVB 5EWWA 4HXNA 4O7CA 4Z6HA 4YY6A 4HXKA 4CUQA 4HBYA 4O7EA 5HENA 4BJXA 4YYIA 2DATA 4A9KA 4OGIA 5E9YA 5KO4A 5FE3A 5E7DA 5FG5A 4DONA 4YYMA 4XUBA 2F6JA 5EV9A 4NUDA 4LRGA 4TTEA 5DW1A 2DVRA 4QZSA 3HMEA 5DFCA 4Z93A 4TU4A 4LDFA 5JI8A 5C87A 5D26A 5IG6A 3O33A 5ETDA 5EM3A 5HJCA 4HXRA 4KV4A 4ALGA 2OSSA 4J1PA 5G4SA 5HFRA 4LZSA 4CURA 5E74A 5LKUA 5E73A 2RO1A 5FE6A 4AKNA 1WUGA 3SVGA 2E7NA 1N72A 4O70A 4PKLA 5CS8A 3UVWA 5AMFA 4MR3A 5EP7A 4CUTA 5A82A 5CRMA 4NUEA 4YYHA 5LUUA 3I3JA 3U5KA 4N4HA 5CU8A 2RS9B 4IOQA 2I7KA 4O76A 5II2A 4YH4A 4KCXA 5CQ8A 4E96A 1JSPB 4A9EA 4PCEA 3P1FA 5EPBA 5LJ1A 5EU1A 5FFYA 2L5EA 2OO1A 5F2PA 5L99A 4A9MA 5D3LA 5EVAA 3MQMA 5F25A 3O34A 1JM4B 5KHMA 1X0JA 5H85A 3U5JA 5FBXA 2R10A 4LYIA 5EPSA 4NRCA 5BT4A 4IR4A 4QSWA 3UVXA 5D0CA 3DWYA 5BT3A 5AD3A 5D3SA 4QB3A 3MULA 4A9FA 5FG6A 4NYWA 4QSXA 5DY7A 5I88A 2F6NA 4NYVA 4ALHA 4HXPA 3UV5A 5DKCA 4PS5A 4Z6IA 4N4FA 4O74A 2GRCA 5FFVA 5IBNA 4QNSA 3P1DA 4UYEA 4CUSA 5L96A 3MB4A 4ZQLA 5EQ1A 2WP2A 5FE7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NXBA 5CFWA 3HMHA 4WHWA 2L85A 4NXJA 4UYHA 3JVJA 4MEQA 4NYXA 5CUGA 5D3NA 5L8UA 1WUMA 3AADA 4FLPA 4QYLA 5HRWA 5I7YA 4X2IA 3K2JA 4HBWA 2KTBB 4LZ2A 4CL9A 4J3IA 4UIZA 4TZ2A 5HQ6A 5CUAA 2RI7A 5I83A 4BHWA 4NR8A 5HFQA 4IOOA 3HMFA 3IU6A 4HXOA 5CQ5A 5ENIA 4O72A 4A9LA 5J0DA 4TZ8A 5CUCA 5F3AA 5ETBA 2YYNA 4UYGA 4UIWA 5FE1A 2YELA 5LKZA 5DFBA 5ENBA 4YBMA 5HLSA 5E3GA 4PY6A 1ZKRA 4LZRA 3Q2FA 4PCIA 3D1BA 4TT2A 5DYUA 3TLPA 4F3IA 5I29A 4A9NA 5F36A 4HBVA 5DKDA 3FKMX 2R0YA 3SVFA 3NXBA 4QBMA 5CPEA 5DYCA 4NRAA 4LYWA 2E7OA 3D7CA 5KTWA 4QSTA 5A5QA 4UYDA 5AD2A 5TB6A 5E0RA 4O7BA 5E9MA 4XY8A 5DLZA 3O35A 4NUCA 5FE5A 4Q0NA 5EWCA 4QSSA 3P5OA 5FH7A 5I40A 3Q2EA 5EGUA 2RFJA 2YEMA 4YAXA 5G4RA 3U5PA 4QYDA 4MEOA 3MUKA 5F62A 5A7CA 4HXSA 4CLBA 5FG4A 4UYFA 5IGKA 4IR3A 4UITA 5HQ7A 5EWHA 3LQIA 5FB0A 5DW2A 5CP5A 5II1A 4XY9A 5L98A 1F68A 4UIXA 4O75A 4NR7A 4QR5A 3MB3A 5EK9A 2L84A 4YATA 4O71A 4NR5A 5A5SA 4BW1A 3MXFA 5ENEA 2DWWA 4O7AA 4KV1A 5I7XA 5CTLA 5FE9A 5IGLA 5I89A 5KU3A 3AQAA 4C66A 4HBXA 4QC1A 5A81A 4LYSA 5F63A 2YEKA 5HRVA 5CY9A 4CUUA 5CQ6A 4QUUA 4TYLA 4XYAA 4ZW1A 5CQAA 5EWVA 5D3HA 4MR4A 4LC2A 4QSPA 3UW9A 4QY4A 5DX4A 5L8TA 4QSUA 4QR3A 5CZGA 5FH8A 4BW3A 5I1QA 5E3DA 5EICA 4NQNA 5D3PA 4A9JA 4OUFA 5CRZA 4YADA 4C67A 2R0VA 2H60A 5E9IA 5E9VA 4QR4A 5EISA 5C4QA 4XUAA 3VKHA 4GPJA 5COIA 4YH3A 4AI6A 5EA1A 5JWMA 4IORA 4HXMA 4MR6A 3U5LA 5H1TA 4WIVA 4OGJA 4ZC9A 3UV2A 5LKXA 3JVLA 4AKIA 4QEUA 5L97A 2YW5A 5ACYA 5CUBA 5EPRA 2D82A 4A9IA 2YDWA 3UV4A 4QSVA 4Y03A 4BW4A 2DVQA 2E3KA 3IU5A 2LSPB 2FSAA 2YQDA 5A83A 2I8NA 5LJ0A 3VKGA 3U5OA 5A5PA 4YYDA 5F1HA 5E9LA 4MEPA 3LQHA 4QSQA 3UVDA 4NR9A 4CFLA 5BT5A 4QEWA 4YYJA 2D9EA 4IR5A 4WHUA 5HEMA 4YYNA 4LR6A 3U5MA 5A5OA 5LVQA 3LQJA 3QZTA 4YY4A 2RNYA 4QUTA 5TCMA 4O78A 5DBMA 4HXLA 5F61A 5D7XA 5C89A 4A9OA 2RNWA 3O36A 5DYAA 4PTBA 4YBSA 5CQTA 4QC3A 4QSRA 5LKTA 5E9KA 3UVYA 5C7NA 5IIDA 4MENA 2N9GA 4NRBA 5DLXA 3ONIA 4YK0A 5A85A 5EI4A 5FE4A 3SVHA 5K29A 4TT6A 5FE0A 4YBTA 2G4AA 4TU6A 5HQ5A 5CQ7A 5D25A 5D3JA 4YYGA 5FB1A 5EWDA 5I86A 3G0LA 4BW2A 5D3RA 5F60A 4NR4A 4UIYA 5LVRA 3LXJA 4RVRA 5FE8A 5I80A 5CGPA 3ZYUA 4YABA 4TT4A 5HM0A 5F1LA 4O7FA 5FFWA 5ENJA 5FE2A 4J0SA 4UYFB 4Z1QA 4NQMA 5C85A 3O37A 4YC9A 4TS8A 1E6IA 3QZSA 3P1CA 5A5NA 5KTUA 3DAIA 2DKWA 4N4IA 4N4GA 5ENGA 1ZS5A 4CFKA 5C8GA 3P1EA 5CUEA 1PUOA 5ENCA 4IR6A 3S92A 2RNXA 4NS5A 2DVSA 5ENFA 4Z1SA 2OUOA 3JVKA 5ENHA 5H1VA 5DFDA 5DKHA 5IGMA 5KTXA 5AMEA 4MR5A 5CUDA 4NR6A 3U5NA 4J0RA 5IGNA 4TQNA 3JVMA 2WP1A 4CUPA 5D24A 3G0JA 4QEVA 5FH6A 4O77A 3GG3A 5CQ4A 4N3WA 3ERRA 4Q0OA 3LJWA 3QZVA 5A5RA 2DVVA 5FDZA 3RCWA 5CQ3A 1EQFA 2R0SA 4UIUA 4UIVA 3S91A 5D3TA 5HELA 4YYKA 5H1UA 5HRXA 5F5ZA 5HCLA 4A9HA 5LJ2A 5DYXA 2MJVB 4AKGA 5EWWA 4HXNA 4O7CA 4Z6HA 4YY6A 4HXKA 4CUQA 4HBYA 4O7EA 5HENA 4BJXA 4YYIA 2DATA 4A9KA 4OGIA 5E9YA 5KO4A 5FE3A 5E7DA 5FG5A 4DONA 4YYMA 4XUBA 2F6JA 5EV9A 4NUDA 4LRGA 4TTEA 5DW1A 2DVRA 4QZSA 3HMEA 5DFCA 4Z93A 4TU4A 4LDFA 5JI8A 5C87A 5D26A 5IG6A 3O33A 5ETDA 5EM3A 5HJCA 4HXRA 4KV4A 4ALGA 2OSSA 4J1PA 5G4SA 5HFRA 4LZSA 4CURA 5E74A 5LKUA 5E73A 4AKHA 2RO1A 5FE6A 4AKNA 1WUGA 3SVGA 2E7NA 1N72A 4O70A 4PKLA 5CS8A 3UVWA 5AMFA 4MR3A 5EP7A 4CUTA 5A82A 5CRMA 4NUEA 4YYHA 5LUUA 3I3JA 3U5KA 4N4HA 5CU8A 2RS9B 4IOQA 2I7KA 4O76A 5II2A 4YH4A 4KCXA 5CQ8A 4E96A 1JSPB 4A9EA 4PCEA 3P1FA 5EPBA 5LJ1A 5EU1A 3D1DA 5FFYA 2L5EA 2OO1A 5F2PA 5L99A 4A9MA 5D3LA 5EVAA 3MQMA 5F25A 3O34A 1JM4B 5KHMA 1X0JA 5H85A 3U5JA 5FBXA 2R10A 4LYIA 5EPSA 4NRCA 5BT4A 4IR4A 4QSWA 3UVXA 5D0CA 3DWYA 5BT3A 5AD3A 5D3SA 4QB3A 3MULA 4A9FA 5FG6A 4NYWA 4QSXA 5DY7A 5I88A 2EJNA 2F6NA 4NYVA 4ALHA 4HXPA 3UV5A 5DKCA 4PS5A 4Z6IA 4N4FA 4O74A 2GRCA 5FFVA 5IBNA 4QNSA 3P1DA 4UYEA 4CUSA 5L96A 3MB4A 4ZQLA 5EQ1A 2WP2A 5FE7A
chains in the Genus database with same CATH topology
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