The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
115
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sequence length |
325
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structure length |
319
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Chain Sequence |
SQLVECVPNFSEGKNQEVIDAISRAVAQTPGCVLLDVDSGPSTNRTVYTFVGRPEDVVEGALNAARAAYQLIDMSRHHGEHPRMGALDVCPFIPVRGVTMDECVRCAQAFGQRLAEELGVPVYLYGEAARTAGRQSLPALRAGEYEALPEKLKQAEWAPDFGPSAFVPSWGATVAGARKFLLAFNINLLSTREQAHRIALDLREQGGRLKKVQAIGWYLDEKNLAQVSTNLLDFEVTGLHTVFEETCREAQELSLPVVGSQLVGLVPLKALLDAAAFYCEKENLFLLQDEHRIRLVVNRLGLDSLAPFKPKERIIEYLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| molecule keywords |
FORMIMINOTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE
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| publication title |
The crystal structure of the formiminotransferase domain of formiminotransferase-cyclodeaminase: implications for substrate channeling in a bifunctional enzyme.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Sus scrofa
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| total genus |
115
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| structure length |
319
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| sequence length |
325
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.1.2.5: Glutamate formimidoyltransferase. |
| pdb deposition date | 1999-07-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02971 | FTCD | Formiminotransferase domain |
| A | PF07837 | FTCD_N | Formiminotransferase domain, N-terminal subdomain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Formiminotransferase, C-terminal subdomain | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Formiminotransferase-cyclodeaminase; Chain B, domain 1 | Formiminotransferase, N-terminal subdomain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QD1 A; 2PFD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HKW A; 2QMU B; 3TZW A; 3QSY B; 3UFC X; 1FTC A; 4USH A; 3O44 A; 3ULH A; 1E6Y A; 5LSL A; 5M2U A; 3M6U A; 1TP7 A; 4RLE A; 4O3P A; 1JLE A; 3R6L B; 3CB4 A; 3G6E S; 3AQP A; 3I9Z A; 5DS7 A; 5HVG A; 4K4S A; 1RT2 A; 3I0S A; 1G4C A; 1TV6 B; 1ARO P; 3H2L A; 1SBR A; 3IXQ A; 1NJY A; 3DGP B; 3SDE B; 4EU0 A; 2UV8 A; 1HNZ J; 4YHH J; 2XGP A; 1YIJ S; 4DFM A; 1BQX A; 2DCL A; 1NDK A; 3GSD A; 2Q6C A; 2BUN A; 3AOA A; 1LW0 A; 1ZA2 B; 1NSQ A; 2N7Y A; 3V5R A; 4LFA F; 1APS A; 2V8D A; 5AE2 A; 1R0B G; 3O6Q A; 3BSN A; 2BE2 A; 3MTJ A; 4ER8 A; 3NBP B; 2BJ1 A; 4K50 A; 1U49 A; 2YWK A; 3TYT A; 4J9U E; 1IBL F; 1Q95 G; 4B9N A; 3A1Y G; 2GA7 A; 3Q8R B; 4JI1 J; 3RR8 A; 2WZ1 A; 2U1A A; 2R7X A; 4ANE A; 2F9D A; 1S6O A; 2CNL B; 3CJT A; 1HBU B; 2F8E X; 2IFX A; 5AJ3 F; 1KQS R; 3WZ0 A; 2YX4 A; 1QM9 A; 3BN4 A; 2J8S A; 1GXT A; 2CJB A; 3F73 A; 3CVK A; 1XMQ F; 2OPQ B; 3TVY A; 2V2Z A; 2RDD A; 2ZEJ A; 4LF7 F; 1HKA A; 4A8M P; 2OD6 A; 3BSC A; 2R7S A; 3ZZ0 A; 2JC1 A; 5K9F A; 1KQK A; 2XWY A; 4QZV B; 1IKX B; 3Q8P B; 3L9Z A; 2GQ2 A; 3ISN D; 3HT3 A; 4A8S A; 5HN0 A; 4DQR A; 4OI0 A; 3DOL B; 1U8W A; 2XC9 A; 1QDU B; 2ZH3 A; 1CJT A; 2G2O A; 2GMH A; 2RRN A; 1L3T A; 1DY3 A; 3CW2 C; 4ZHR A; 3L3C A; 2DY9 A; 3UDC A; 4IDK B; 2DEJ A; 1HMV B; 5KG2 A; 1SQE A; 3FVY A; 1AZS B; 3M30 B; 4ZP6 A; 2GHW A; 4MKV A; 4QBU A; 4ZJL A; 1ZPW X; 1IWG A; 1S7I A; 3OV7 A; 2ZH4 A; 9ATC B; 2BJ7 A; 2BDP A; 3J7Z T; 2ZFH A; 3N79 A; 2ZH8 A; 2DHG A; 3MMB B; 2AYM A; 3PHT A; 4NWB A; 1JLQ A; 1Y4Z B; 1LWC A; 3KLH A; 1HPZ A; 4EFA C; 4EBD A; 4DZD A; 2PEB A; 1SV5 B; 2PFF B; 3PTW A; 2YKM A; 2OLW A; 3GYN A; 3AD9 C; 2ZD1 B; 1X4C A; 1U45 A; 3ISN C; 4B9S A; 5EX0 A; 2RQK A; 4DV3 J; 5F8H A; 1RE1 B; 2HHV A; 3R9L A; 4MMO A; 2GNK A; 5A76 A; 3BH6 B; 2AMC B; 3VQT A; 1RAE B; 1YDL A; 1WWH A; 3KG0 A; 1YJT A; 4NLQ A; 4NXN F; 1J5E J; 5KT7 A; 3OFE A; 1TFW A; 1NDL A; 4YDX A; 1NEE A; 4EGL A; 3TW0 A; 2VL1 A; 1VQL S; 1UVI A; 1OYD A; 3OL7 A; 3EYZ A; 3N4W A; 4U67 Q; 3ETM A; 3H8Y A; 2IA0 A; 1PYS B; 1RLC L; 2BW7 A; 3KK1 B; 1HBM A; 4TVA B; 1U1N A; 1J5O A; 4ECS A; 3RAQ A; 3UWT A; 2GO8 A; 3NOG A; 2D3O R; 3KLI A; 5BXI A; 1N4L A; 4IYQ A; 4O0N A; 1YJW S; 3HK2 A; 2IY5 B; 1XK8 A; 3UDL A; 1RWU A; 2C3O A; 2K7K A; 2LDY A; 5KFY A; 2UUC F; 2C3M A; 2HNZ B; 3Q2T C; 1VQK S; 2DJW A; 1NJI T; 1FVS A; 4C3M A; 1WI6 A; 4B3M F; 3ZTO A; 1FFG B; 1X0P A; 4URG A; 2KM8 B; 4KH1 B; 1RA7 A; 2BOA A; 2KHC A; 1IR2 A; 4ED6 A; 2QA4 G; 4Y2A A; 2AYG A; 2HFS A; 1OY8 A; 1JB0 C; 1UW9 A; 3ADA C; 4HEA 9; 4YDD B; 2FDN A; 4I2P A; 4M5D B; 1U2F A; 3FUY A; 4EBE A; 3QWP A; 2C2E A; 3DRX A; 3L7O A; 4F50 A; 1REG X; 4C6A A; 3G82 B; 5E3A A; 1GMW D; 1B70 B; 2AP6 A; 1KN6 A; 2UUA J; 4N8O A; 2VBX A; 3GMG A; 1RK8 A; 3RG6 A; 2ZE2 B; 2JLG A; 4F02 A; 3UCG A; 2MKS A; 3V6K A; 1EKS A; 4DV0 F; 4WFZ A; 4KPY A; 1WDT A; 3U7J A; 5IZH A; 2LQ5 A; 1VQY A; 2GAH C; 1CQN A; 5B0F A; 4MJK A; 1DTQ B; 3RW7 A; 1G6B A; 4K59 A; 4AL6 A; 1TK0 A; 4QU7 A; 3MD1 A; 1FF2 A; 5THW A; 1X9S A; 1PAE X; 2AEJ A; 1KOH A; 2X3G A; 3KUH A; 1OO0 B; 2FHK A; 3KDN A; 4KT0 C; 3CJQ A; 1S9E B; 2HQ3 A; 2J8A A; 3MEK A; 5ETN A; 3K5L A; 2JFD A; 1NB2 A; 2DNH A; 1SJ3 P; 3LF0 A; 2DPI A; 1I94 F; 2OPR A; 1JLF A; 4DN9 A; 4JI5 F; 2ZVS A; 1JNR B; 2LA6 A; 3E3X A; 5GME A; 5I42 B; 4QW8 A; 2CPI A; 1HNV B; 3NP5 A; 2D74 B; 2LEB A; 3G8T A; 1MLA A; 3CMQ A; 2CJK A; 1Y11 A; 4X62 J; 4U9R A; 5KFW A; 4ECQ A; 1HWJ A; 4IOA Q; 1YI2 S; 5HMZ A; 4HHH A; 4TN2 A; 1VHI A; 2IJF A; 2K8G A; 1OJ4 A; 1S77 D; 1VRU A; 1GTH A; 1TKZ B; 2E5I A; 1MG7 A; 3EPG A; 1XR6 A; 3PAC A; 1M5P C; 3W9J A; 4BWJ A; 3RGI A; 1S12 A; 1WAC A; 1LNQ A; 2FLP A; 3Q89 A; 2K1R A; 4XDD A; 1ZBT A; 5JVG Q; 2G1H A; 3G6Y A; 1I5O B; 1FDN A; 1A7G E; 1T0T V; 4OZJ A; 4I2Q A; 3FNN A; 1RXO B; 3JQM A; 2M5Y A; 4TY8 A; 1RYS A; 5HL7 Q; 4PPZ A; 3GR0 A; 1MMN A; 3SEO A; 2BKO A; 1HBO B; 2DHS A; 3WC2 A; 4KY3 A; 2Z30 B; 1SC6 A; 5K8M A; 4MK8 A; 1S1X A; 3HM9 A; 4LRE A; 3T5J A; 3TJA A; 4PXD A; 3C16 B; 1IJE B; 1VFJ A; 1TKT B; 2HFU A; 4FVM A; 5B0E A; 2J6T A; 3N6N A; 4DEZ A; 3JSM A; 3DOM A; 2W7A A; 1WC5 A; 4LR7 A; 2YNF A; 1WOS A; 1IBK J; 1LWF A; 1QE1 A; 3F41 A; 2L9W A; 4LVN P; 1FRK A; 1BXN A; 2C2K B; 4XTT A; 2N82 B; 3PJX A; 3E01 A; 4YME A; 1NK0 A; 2CVI A; 2QJ3 A; 2XY7 A; 5LXY A; 4QU6 A; 3KK3 A; 2IDE A; 3V4I B; 3I56 S; 2VIC A; 4B3T F; 1NO8 A; 5BJR A; 2ZH1 A; 1XNR J; 1K1S A; 3K0J A; 3TAN A; 2ZBI A; 1RT6 A; 3HPO A; 3IR6 B; 2ATL A; 2B4P A; 1KON A; 1N5S A; 2OFG X; 3HD2 A; 1HQU A; 1UVN A; 3PCO B; 2JFK A; 1FER A; 2U2F A; 4KTQ A; 1YIT S; 1RTJ A; 3IA0 A; 4DFP A; 2G9O A; 3JYT A; 4LF8 J; 4YEA A; 1R8P A; 4DCP B; 4IH6 A; 4P7T A; 2HRY A; 4NOH A; 1JJC B; 2UUB J; 1N5Y A; 3PYF A; 2ASL A; 3DDK A; 2MQL A; 3VHQ A; 1KLM A; 1H72 C; 4FXW A; 1GH8 A; 4FBT A; 2IC3 B; 3ISZ A; 4CLT A; 1L5U A; 3AB2 B; 5DLF A; 5EX3 A; 3SCL E; 3QZ7 A; 2VC0 A; 2JJ4 D; 3H2U B; 3OL6 A; 2VA3 A; 1XN9 A; 5A8R A; 4C7Q A; 3LAL A; 4XO0 A; 2RS8 A; 1S1V B; 4ZVO B; 2BAC A; 3SFG A; 3CIM A; 4Q8E A; 2HHH F; 2OH2 A; 2KU7 A; 2ZOM A; 5IOL A; 4JP8 A; 2M0G B; 3OL8 A; 3LP0 B; 1SVD A; 5DG9 A; 2MQQ A; 1SC1 B; 1R0A B; 2YNH A; 1LEO A; 1XJW B; 1Y9O A; 3KUG A; 3MAH A; 2D3O 1; 5KFS A; 3V6D B; 4UOF A; 1FVQ A; 3GJR B; 1TKX B; 3HVT A; 1U6F A; 3MEG B; 1JMT A; 2GJI A; 2Z8Q A; 4I7F A; 1U02 A; 3PV8 A; 5HQL A; 1SL2 A; 4K4Z A; 2DHA A; 3M05 A; 1VRQ C; 4OLO A; 4N77 A; 3UCZ P; 2GW8 A; 1U1L A; 5E33 A; 3EM1 A; 2VOP A; 2KDO A; 1B3T A; 2DGT A; 2HFV A; 1ZS6 A; 2XMV A; 4RNH A; 1MN7 A; 4L74 A; 5HVH A; 1WHW A; 1FNX H; 4ZP7 A; 3RRG A; 4LMZ A; 2QLX A; 1SIW B; 3V81 A; 4ZVF A; 5F8J A; 1F60 B; 1QLN A; 2BOP A; 2JVR A; 2H1Y A; 1S59 A; 3AQO A; 1RKI A; 4P2M A; 2QA2 A; 1IKW A; 4OYI A; 4Q2M A; 2PI5 A; 1TK5 A; 2CZ9 A; 5KFV A; 2O67 A; 1VLO A; 2JL9 A; 1NK8 A; 3O2I A; 2OPP A; 3AJ2 A; 2ZM6 F; 2ACY A; 1LWE A; 2CDR B; 3H7H B; 2BEF A; 3Q24 A; 3BR8 A; 4WBF A; 4WCE Q; 4LFB F; 3BKF A; 3POT B; 4WXO A; 4HI2 A; 4WF9 Q; 1CUL A; 3D0H E; 2CAD A; 2AJ2 A; 2MXY A; 1VQO S; 3K8W A; 2DH9 A; 1ZH5 A; 3IS9 B; 1H7X A; 4ES3 A; 3SV3 A; 2LEC A; 7FD1 A; 3G6X A; 2HUR A; 3MM6 A; 1RHQ B; 2QFJ A; 3OFF A; 3MUM P; 1RHU B; 3GIJ A; 3OJS A; 2HQD A; 1YTY A; 1N0U A; 3A3N B; 5G0R A; 2JX2 A; 2PI4 A; 4ILL A; 4GO7 X; 2VBW A; 4ID8 A; 4A46 A; 5KFE A; 2OIH A; 2AJ0 A; 1WC0 A; 5DO2 A; 1MN9 A; 2V5H G; 5LXR A; 1F9E B; 4ZPD A; 2DIT A; 5D3G A; 5E41 A; 5DGB A; 2MST A; 2KT3 A; 5KT4 A; 3HUL A; 1QTM A; 4ZPA A; 2QMW A; 4M5I A; 3BBB A; 4GKJ F; 4HTJ A; 2GVD B; 4JI7 J; 4DR7 F; 4X65 J; 4HHJ A; 4DHV A; 1RT1 A; 4Y2K A; 1XMB A; 1U0S A; 1IKV B; 4AUK A; 5M2P A; 3UR0 A; 1B0V A; 5DQH A; 3RYL A; 2D3Z A; 3CJR A; 1FWL A; 4LBP A; 4OX7 A; 1K0T A; 1U2R A; 3LP1 A; 4FDF A; 4WJB A; 3NL0 A; 1HW9 A; 4B3S F; 2VQF J; 4BWM A; 1FXD A; 2E1C A; 2B4V A; 4M5N A; 3W60 A; 1T9W A; 3RR7 A; 4Q7A A; 2ZWO A; 4ED7 A; 1UCN A; 2DH8 A; 3CJS A; 4AD6 A; 4DQP A; 3D54 A; 1R6V A; 2C2N A; 4ZJO A; 1FX4 A; 2R7T A; 1SJ4 P; 2HVI A; 4AQY J; 5LM7 E; 5H9E K; 5B0B A; 2IBO A; 3CDA A; 3CCR S; 1TUV A; 3S8S A; 5C25 B; 4X4V A; 1JIH A; 3PNI A; 1QAJ A; 2IM2 A; 2JHE A; 2HHP A; 3H4D A; 3D67 A; 1WSV A; 2Q6B A; 2DGO A; 2UVR A; 4C8K A; 2XI2 A; 4F4X A; 1HNX J; 3KWM A; 2IAJ B; 1O8B A; 1M1H A; 3DXS X; 3DRY A; 4WE1 A; 3UVJ B; 4KGX B; 3WX8 A; 4NLV A; 2HZV A; 4M95 A; 2YQ1 A; 1CJV A; 2C42 A; 1U0H B; 4HAC B; 3MMC A; 3A3O B; 1U1Q A; 2BJD A; 3KK2 A; 2CDQ A; 3DMJ B; 4DUY J; 3MPD A; 3TR5 A; 2OKQ A; 4DR2 F; 2V8V A; 2VFR A; 4IOC Q; 5KFK A; 4DFJ A; 3IRX A; 4N5S A; 3K17 A; 2ZBP A; 4QR1 A; 4X64 F; 2BQU A; 1S49 A; 1VQ6 S; 2Q3P A; 3NKY A; 1VQN S; 1UVJ A; 2HSE B; 2VIH A; 2GV1 A; 4B9M A; 2DB1 A; 3MCM A; 1HQE B; 4NA2 A; 3W66 A; 3TX0 A; 2WVE A; 4DV6 F; 4AXI A; 1E6V B; 1LXN A; 2ZJR Q; 1KC8 T; 4NLS A; 2OEM A; 4C0H A; 5LMN J; 3KLF B; 5F0U A; 2YX7 A; 3BDP A; 3OR1 B; 3AJ1 A; 1KVI A; 2K06 A; 4JI4 F; 1QAY A; 2YWF A; 1VI7 A; 1VJW A; 1IUJ A; 2DHX A; 4DG1 B; 1P8G A; 3LAK A; 1YK9 A; 3K58 A; 2AEM A; 4NYO A; 1LWX A; 1NME B; 4KGK A; 3KLE B; 2L48 A; 1JK9 B; 3ILI A; 3G71 S; 4Q0B B; 4QQB A; 5HI7 A; 5KFB A; 1YRU A; 4KE5 A; 2RF2 B; 1TUG B; 3CCW A; 4M63 A; 4ZPC A; 4CIO A; 5K14 A; 5H9E J; 4PPD A; 2DNP A; 2DO4 A; 3MUV P; 2IMO A; 3OHB A; 3CD0 A; 4EUV A; 2E5H A; 4WII A; 4C8N A; 4Y2M A; 5GAE U; 3GV7 B; 3P45 B; 2CWK A; 2NQP A; 3FFI B; 2CZV C; 2XCP A; 1WC6 A; 2LXF A; 3QBC A; 5HSP A; 4LFA J; 3QFW A; 2XYG B; 1PYO B; 1FRL A; 5A8W A; 4ED1 A; 2IPO B; 2W4C A; 4LSN A; 5KFZ A; 3DRP B; 2MGZ B; 4L73 A; 4QW9 A; 3SQG A; 4R5P A; 2BV3 A; 2IHR 1; 4EO6 A; 4AFF A; 1ICE B; 1DLO A; 3C8Y A; 1IBL J; 2KXH A; 4OZ2 A; 5IT9 Y; 4H4M A; 1RWW B; 2MKK A; 1P6T A; 4F8R A; 6AT1 B; 4DV4 F; 4PWW A; 3T5K A; 3U1L A; 4FZV A; 1RBL A; 5AJ3 J; 3LP2 B; 3BQ1 A; 3J7Z 5; 3ZZP A; 3GTY X; 3CDB A; 3M8S A; 2MQO A; 3GSI A; 1TKD A; 4K2J A; 5DDQ C; 2C2O B; 3MR7 A; 4ZK7 M; 1XMQ J; 2FD2 A; 1Q86 T; 3C6U A; 1GFW B; 4LF7 J; 3NGD A; 1FJG F; 1GXU A; 4IG3 A; 2V8P A; 2MZR A; 5L38 A; 1X5T A; 1WHY A; 2XZD B; 3BJY A; 2ZH6 A; 1NXI A; 2VG7 B; 4WU2 A; 2PFD A; 1RT7 B; 1RT4 A; 4P2X A; 1G2E A; 3J7A N; 2RRA A; 5E3P A; 2HAF A; 2QO3 A; 3MD3 A; 4HT7 A; 5DDP C; 1H38 A; 3M9N B; 5IC6 B; 1AT1 B; 3BS9 A; 1U09 A; 3NEK A; 4LF6 F; 4IO9 Q; 1MWY A; 2EBG A; 1VRT A; 2WSF C; 4O4G B; 2Z56 B; 4MK9 A; 4CYU B; 2YKQ A; 2RH3 A; 4BCA A; 4GVB B; 1UPP A; 5BYR A; 1S0V A; 1S1T B; 4ZLJ A; 4KHP F; 5ETM A; 1YKW A; 3TO8 A; 1RAI B; 1YJR A; 1WEY A; 5ETO A; 3IM8 A; 3MR6 A; 1RTH B; 4QIG A; 2XYH B; 4CZC A; 1RI7 A; 3DGV A; 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