The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
CASPASE-3 SUBUNIT P17
|
| publication title |
In Silico Identification and Crystal Structure Validation of Caspase-3 Inhibitors without a P1 Aspartic Acid Moiety.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2010-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GJS B; 3SIP B; 2QL7 B; 5IC6 B; 2H5I B; 3GJR B; 1NME B; 3R7B B; 1RHJ B; 1RWK B; 4ZVT B; 1RHQ B; 1RWM B; 2QLJ B; 2CNN B; 3EDR B; 3P45 B; 1QDU B; 3GJT B; 2CNK B; 3P4U B; 1RWO B; 2Y1L B; 3D6M B; 2H5J B; 2CDR B; 2C1E B; 2C2K B; 3NS7 B; 2CNO B; 1SC4 B; 2XYH B; 2Y0B B; 2XYG B; 3KJF B; 4ZVQ B; 1RHM B; 1SC3 B; 1BMQ B; 3IBC B; 3R6G B; 4ZVU B; 4LSZ B; 2QLF B; 4ZVO B; 2HBZ B; 3EDQ B; 2H4W B; 3KJQ B; 5IC4 B; 1RWP B; 2H48 B; 4DCJ B; 5K20 B; 4ZVP B; 2CNL B; 1PAU B; 1IBC B; 1I3O B; 1RWW B; 3D6H B; 3GJQ B; 4DCP B; 3D6F B; 1RHR B; 2CJX B; 2H65 B; 2DKO B; 3R7S B; 2QL5 B; 2H54 B; 1GFW B; 1RE1 B; 2HBY B; 2QL9 B; 2CJY B; 1F9E B; 2C2O B; 2XYP B; 2H4Y B; 2XZT B; 1I51 B; 3R6L B; 4JB8 B; 1PYO B; 2FQQ B; 2H51 B; 1RWN B; 1RHU B; 2HBR B; 3R5J B; 4ZVS B; 2C2M B; 2C2Z B; 1RWV B; 2HBQ B; 3R7N B; 2XZD B; 1SC1 B; 3RJM B; 1ICE B; 2P2C B; 3IBF B; 2QLB B; 1RWX B; 4DCO B; 3QNW B; 1QTN B; 1RHK B; 3KJN B; 4ZVR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DH9 A; 4ZK7 M; 1K1Q A; 2LQJ A; 2DO0 A; 3KDO A; 2P9C A; 2RRN A; 3IG1 B; 1U2F A; 4RW4 B; 4OHV A; 1YI2 S; 3P45 B; 1D9D A; 2V2Q A; 2DYA A; 3OL8 A; 2R4F A; 1C1C B; 3HI9 A; 4TU8 A; 3MED B; 4OI2 A; 1OMS A; 3BGR A; 1Q5Y A; 4CO5 A; 5THW A; 4DV0 J; 2XGP A; 5DDQ C; 1Q86 T; 3CPW R; 1SQG A; 1FJG J; 2DY9 A; 3PIP Q; 1S6U A; 4OV1 A; 2LP4 A; 1YSJ A; 2KHC A; 4ZHR B; 2XHC A; 3E2E A; 4LF6 F; 4DR2 J; 4X4V A; 1UFL A; 2GQQ A; 1ZPV A; 1HWK A; 3E51 A; 4AYB D; 5EWE A; 2E5J A; 2JEG A; 1TMM A; 1RZM A; 2CJQ A; 4H4M A; 4DUY J; 4FS2 A; 2HND A; 2V0N A; 2LEC A; 4WXO A; 1WKJ A; 2HGN A; 2ZBQ A; 5KG6 A; 1CS4 B; 3HHL B; 1VC5 A; 1T05 B; 3OVS A; 3CJ4 A; 4NLP A; 3HJV A; 1KHW A; 3MM7 A; 4HT5 A; 3MEC A; 3RAM A; 3DOK B; 3Q23 A; 2VG5 A; 2KM8 C; 1U09 A; 1QM9 A; 2Z2L A; 4NCG B; 5KT5 A; 4WYL A; 2DR5 A; 2IBK A; 2CAJ A; 2D7S A; 4PYA A; 3Q86 A; 1M5H A; 3TX8 A; 3JSY A; 3MUV P; 4XIU A; 2R2U A; 2XMV A; 3UNG C; 1Q8K A; 2DO4 A; 4AUK A; 4IDK A; 4I4B A; 1YIJ S; 1IKX B; 2XZT B; 5I42 A; 2MDA A; 2XSJ B; 1V3R A; 3QWP A; 3CIZ A; 4WFX A; 1HL6 A; 3JXO A; 3A13 A; 3HD1 A; 3AQP A; 3I56 S; 2GAG C; 2VFU A; 3KLG B; 2EKY A; 2JHE A; 1OSC A; 3R1L A; 4NYO A; 1MU2 B; 2MQM A; 3FUY A; 3QSI A; 3H2U B; 2QJ3 A; 1Y00 A; 3FSI A; 6FD1 A; 1KFD A; 1WEY A; 1D9F A; 2VG7 A; 1M1G A; 1NJW A; 1BD6 A; 2C2K B; 4YS2 A; 3DXB A; 5I3P A; 4RU2 A; 2MKI A; 2MQO A; 2ASL A; 1SJ1 A; 3GFH A; 4KB7 A; 3QPI A; 4WK1 A; 2KG1 A; 1S9G A; 3M2V A; 4F4W A; 3BH7 B; 8ATC B; 2HSE B; 1S6P B; 4PG4 A; 3GFZ A; 2I5J B; 2W2M P; 2N82 B; 3OXF A; 2DGW A; 3GFY A; 3VF0 B; 1IKW A; 1HI0 P; 3OR1 B; 2FHJ A; 2QA1 A; 2EBE A; 3T5H A; 4YY3 J; 4RJV A; 1I1G A; 2PT0 A; 2BRL A; 1Y9O A; 1GMW D; 4XPE A; 1S7H A; 5KT3 A; 3MM8 B; 3P8B B; 5KFK A; 4LRE A; 3JSM A; 4RWW A; 5ETM A; 3M8R A; 3EYZ A; 3I0R B; 2E1M C; 3W66 A; 1U0H B; 3AB2 B; 4PPD A; 5EWF A; 5IT9 U; 1UL3 A; 3DRR B; 1DRZ A; 3FCV A; 1LWF B; 1WG4 A; 3I0S A; 1H3D A; 2CQP A; 2W8L A; 2N7C A; 1B70 B; 4DI6 A; 4P2X A; 2CPD A; 3TAN A; 4CO0 A; 3POT A; 1FK9 B; 4F26 A; 3DLG A; 2HHW A; 1GX5 A; 1S1U B; 3CT9 A; 2DGV A; 3T1H F; 3JAM U; 1U8W A; 2A6O A; 4ZCI A; 4FXW A; 3TUI C; 4C98 A; 1NHU A; 2YXL A; 4V1A k; 3H25 A; 3ILL A; 5BYR A; 2ILY A; 3GFX A; 2OPR B; 3FSY A; 3IM9 A; 1D09 B; 5L9N A; 3DGP B; 3LP0 A; 2BQR A; 4C7Q A; 4HH1 A; 2Q66 A; 3TUJ C; 5HQM A; 1RWV B; 3GP9 A; 3HUL A; 3D5M A; 4UZC A; 2XC9 A; 2B4U A; 1HNW J; 4J9O A; 4CH0 S; 1N34 J; 3WC2 A; 3BYR A; 3BM7 A; 5DDO C; 1WI8 A; 2G13 A; 2B51 A; 1MML A; 1F5A A; 4TXS A; 2EVZ A; 1HQE A; 4USW A; 1HBN A; 4KO0 B; 3BGF A; 3KLF A; 4M5I A; 3TO8 A; 4Q8F A; 3MAQ A; 2OPP A; 2HNZ B; 1FDB A; 1VCT A; 2RS2 A; 2R7W A; 1VQL S; 5HJY A; 1VQS A; 1RT5 A; 3PW4 A; 4DCP B; 3R7S B; 4EMD A; 3FRY A; 1FNM A; 4DR5 F; 1RLC L; 4JI4 F; 1S9F A; 5L46 A; 3BSA A; 2FYX A; 1RHU B; 4WCE Q; 5IQQ A; 3TEG A; 2XO6 A; 1SL1 A; 3RAQ A; 3C14 A; 4U95 A; 2RIJ A; 3CCV S; 2KJW A; 2P2C B; 4J7C A; 3KK2 A; 1R8A A; 1SIW B; 4L3N A; 3S8S A; 2YBV A; 2F8E X; 2WW8 A; 3CDB A; 3VGV A; 2O01 C; 4Y2A A; 4Y0F A; 4FDF A; 3TQ1 A; 4Y2I A; 2IJF A; 3PY8 A; 1OJ4 A; 1J5E J; 3HDS A; 2HZA A; 2IYG A; 1R27 B; 2B8P A; 1S0N A; 2IHR 1; 2WZ1 A; 1RBO B; 3D28 A; 4EFA C; 1HWJ A; 1XBW A; 2UUA F; 5IV4 A; 2ZNZ A; 1CVJ A; 1PKU A; 3ZZ0 A; 4RZR A; 4TY8 B; 1X4A A; 2BQ3 A; 5D78 A; 2LEA A; 2XTJ P; 4OYZ A; 4DU7 A; 2XYP B; 4C0O C; 2BDP A; 5KFA A; 1WKL A; 2YWE A; 3LAL A; 4CM2 A; 3PRD A; 4YFU A; 4OYW A; 1S59 A; 1IBL F; 1CUL B; 3HVA A; 3KFW X; 3R5J B; 1RJJ A; 3QRP A; 1VHI A; 1IBM F; 3H4B A; 4JI0 F; 2XNR A; 4QIF A; 3RB0 A; 2XCA A; 2ADB A; 1IVZ A; 3OXL A; 5ETO A; 3OVB A; 2U1A A; 2ZEJ A; 5FII A; 3PYD A; 3HKZ D; 4CQ1 A; 4DX5 A; 4ECS A; 3NGD A; 4AE5 A; 5DM7 Q; 2OAU A; 3BZQ A; 4KGK A; 4RW9 A; 1JLQ A; 2FHK A; 1EIY B; 3JSB A; 1NPK A; 1SL2 A; 3TA1 A; 1K8A T; 4P73 A; 1FX4 A; 1YJ9 S; 1TKX B; 4IOA Q; 1SJ3 P; 4OX9 J; 4J37 A; 4F4A A; 3CJQ A; 1HW9 A; 4DUZ F; 2JLF A; 2VDI A; 3OLB A; 2OPS B; 1U02 A; 3LP2 A; 2BMB A; 2MLX A; 5ETT A; 4B3O A; 4UY8 5; 2B9E A; 2V63 A; 1R6V A; 1U1N A; 1N52 B; 1S6Q A; 1VQM S; 4B9U A; 3MAA A; 5HBM A; 3TR5 A; 3MMA A; 2D3O R; 2HFZ A; 2YKM A; 1RU1 A; 2DBB A; 1FD2 A; 1SJR A; 4R0J A; 2VBZ A; 4P7T A; 1V5I B; 2HK3 A; 4U8Y A; 5F9N A; 1LV5 A; 3MD3 A; 1M5K C; 3TUP A; 1FTC A; 2BAC A; 2VH7 A; 1VIO A; 1GMV A; 2X3G A; 2OEJ A; 4JI3 J; 3BQ2 A; 4OYM A; 1QDU B; 4I56 A; 5KT6 A; 3OTC A; 1QY7 A; 1VK8 A; 3GWC A; 1VHF A; 3GCW P; 3PYG A; 1C0U A; 4F50 A; 1UPP A; 1DJ0 A; 3BDP A; 3IAS 9; 1SQE A; 1FRI A; 4QWA A; 2CXE A; 4LSZ B; 2XMJ A; 2HBZ B; 2AJ0 A; 3T9N A; 1FWL A; 2G2O A; 2YX1 A; 4K4W A; 2E44 A; 3UQS A; 4CCH A; 1BUX A; 6FDR A; 3SCI E; 3VAK A; 5D8H B; 5KFN A; 3GMG A; 1OS5 A; 3D68 A; 2IMO A; 5CYQ B; 5ITH A; 3SV3 A; 2RU9 A; 2FLL A; 4OLP A; 4X4T A; 2HZV A; 3CJR A; 5GAD I; 3O8W A; 4UQG A; 5ETS A; 1UW4 A; 2LYV A; 3NCQ A; 1X60 A; 5HLF B; 3TAR A; 3KK1 A; 1C0T B; 2R3V A; 1ZOT A; 4OZJ A; 1XEZ A; 4NLU A; 1N5Y A; 4WKY A; 2P6T A; 5HRO B; 2ZJR Q; 2GMH A; 3QO9 A; 1U45 A; 2UU9 J; 1BWV A; 3I6P A; 5LXY A; 2JLE A; 1HBM B; 1DAX A; 4DFJ A; 1KRP A; 1S7I A; 2HFV A; 3N79 A; 2RNE A; 2X1A A; 5JMN A; 5HK4 A; 1FER A; 3BGU A; 1Q1K A; 1N56 A; 4D3G A; 1PO6 A; 3D6T B; 2IC3 B; 5KG2 A; 3MPD A; 4A8X A; 3H2V E; 2UVW A; 4N8N A; 3DLH A; 1ZM2 A; 4U7U K; 2BJ9 A; 4X2B A; 3BEG B; 2UXD F; 4GKK F; 2HUR A; 2AYM A; 2FC8 A; 3CIM A; 4QIV A; 2YPZ A; 1FJ7 A; 3I4P A; 4IR1 A; 3RB6 A; 3AH6 A; 3JSR A; 3VZH A; 1I5O B; 1SC1 B; 3PYE A; 1SIZ A; 2C3U A; 4A8Q A; 3NAH A; 2FJB B; 1CLF A; 1UPM B; 1UEU A; 4Y2C A; 2MGZ A; 1CJV B; 1IJE B; 4LF7 F; 2IMW P; 5F41 A; 4NZ0 A; 4WP3 A; 2EEY A; 8AT1 B; 4X66 F; 3EDR B; 1WEL A; 5B0B A; 4ZN3 A; 4FPR A; 1REV B; 1VIX A; 2VOP A; 4I7F A; 4M94 A; 2ZHB A; 1ZAX A; 3G6Y A; 2R7X A; 2M2B A; 3MM6 B; 4C3M A; 4A8S A; 5EUH A; 1TKT B; 3D0I E; 1JQG A; 1YBT A; 4OX7 A; 2GS8 A; 1EET B; 1VBZ A; 2HHT A; 1N0V C; 2PEB A; 3V81 A; 4QIE A; 2CJX B; 1F9F A; 1SV5 A; 4EO8 A; 2JOQ A; 1ZZF A; 1HYS A; 3B78 A; 5H9E J; 2WBR A; 4JI2 F; 3Q8V A; 1V6H A; 4P2S A; 1TUV A; 1X8D A; 2OI2 A; 3QYY A; 4DN0 A; 2HVI A; 2ZM6 J; 3UD4 P; 1VRT A; 5E2Q A; 2E1C A; 3TX0 A; 2R7V A; 5H9F J; 4OQJ A; 5CD4 A; 1ZTW A; 3D2W A; 3BKT A; 3QAU A; 1IQT A; 2LVW A; 2ZH9 A; 2WTF A; 4LRB A; 1C1C A; 2K06 A; 2KN4 A; 4MT1 A; 3MED A; 5FJ4 A; 3VAG A; 2P9G A; 1GTE A; 3N01 A; 3V6H A; 2HS0 A; 4RW8 B; 4TQS A; 4EWT A; 1M90 T; 4ZHR A; 2DR7 A; 3K5P A; 2MKH A; 3HFZ B; 1K0T A; 2H3E B; 4WE1 B; 3W2W A; 3BSO A; 3E01 B; 4HH0 A; 4KGM A; 1TP7 A; 1FRL A; 4M63 A; 2OLW A; 2GV1 A; 1F2G A; 4DPT A; 1L3V A; 1I94 F; 3BQ1 A; 1NDL A; 5C24 B; 4ID5 B; 5L1L A; 2OO4 A; 1UVN A; 4IUF A; 3EGW B; 4ZCL A; 4ETZ A; 4K4Y A; 3PYF A; 3MEK A; 3J80 U; 4TNO A; 5IT9 Y; 4YP3 A; 4ICL B; 4M5K A; 4TVA B; 1T05 A; 3P5B P; 4OV6 A; 1Q8B A; 3RJM B; 2DD8 S; 1WJ9 A; 3D1H A; 1JJH A; 2R8I A; 5D15 A; 4YDD B; 2HHQ A; 4CT8 A; 4USH A; 1X4D A; 3DOK A; 3U27 A; 2AGO A; 4KT0 C; 1FO1 A; 1E6V A; 3AOD A; 1DZ5 A; 3OLA A; 4NCG A; 3ETM A; 5DLG A; 1JWW A; 3KUH A; 3LPY A; 3JAM Y; 4IFV B; 4FVM A; 4JI6 F; 3KJV B; 1FEH A; 3OUY A; 3GYN A; 5LMN F; 2JRS A; 4LFC J; 5HVH A; 3MAH A; 4OZ3 A; 2HQ3 A; 3QRQ A; 2KHD A; 5G4D A; 3EM1 A; 1X9S A; 4DSF A; 5HVF A; 2IAJ A; 1HNX J; 2K2P A; 5FLX U; 1NUE A; 1M5P C; 3CCZ A; 3ZTP A; 3MR2 A; 2XSJ A; 2AKW B; 4PG8 A; 3NCR A; 4MYU A; 2VQF J; 4ZVP B; 1PAU B; 2G2Y A; 4NLV A; 5A8W B; 1ZAW A; 1QSY A; 5CA5 A; 5F8J A; 1ZS6 A; 2M3D A; 1IR0 A; 3VZI A; 2HBY B; 3RBX A; 4JP8 A; 2DNN A; 1UW9 A; 5KT4 A; 2AYE A; 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3DGP A; 3OW2 R; 3UD3 P; 3NS6 A; 4RR5 A; 1Q53 A; 2AWZ A; 3KNG A; 3THP A; 5DGA A; 2QL9 B; 1HD1 A; 2LDI A; 2AEJ A; 3DOM A; 1FNO A; 1YBA A; 2M4M A; 3G8Q A; 5J2M A; 1H74 A; 4KHM A; 1IM6 A; 1N32 F; 2VAS A; 2PMZ D; 1TAQ A; 2IFX A; 2HGL A; 2LQB A; 2B8Q A; 2PDA A; 4C97 A; 2FUG 9; 1WF1 A; 1VQK S; 5GAE U; 3DYA B; 3AJ2 A; 4Y6I A; 2QMU B; 2DNQ A; 3FGV A; 1XMQ F; 5KFO A; 2MTL A; 1NJY A; 3VGU A; 2CZ9 A; 2QSW A; 4RNF A; 2Y3Y A; 4LBI A; 1H0H B; 4K4U A; 5KFX A; 2K3K A; 4ZVU B; 3N28 A; 2V67 A; 3H59 A; 4ZPB A; 3FBE A; 4DFP A; 1HHT P; 3J7Z T; 1BHN A; 4F25 A; 4DV5 J; 2V8D A; 1S0O A; 4J9R A; 4LF9 F; 2OKQ A; 4M5D B; 1RAJ A; 5B0C A; 1FHT A; 1REG X; 4BCA A; 5GAG I; 1X4C A; 1U49 A; 1FXL A; 2BBE A; 2MY7 A; 1OQ6 A; 4ID8 A; 3L7O A; 2E5G A; 3SSQ A; 3OTO F; 2QLB B; 2B5J B; 1F3V A; 1M5O C; 1RLD A; 2XMU A; 3CCU S; 1S9E B; 3SIP B; 3PXG a; 5D0G A; 4O44 A; 3TW0 A; 2K8G A; 4X65 F; 5HMX A; 2JL9 A; 2KXH A; 1N4L A; 1DLO B; 3ZZU A; 4HLB A; 4USU A; 1NLK L; 3FRZ A; 3DN9 A; 5IQ6 A; 3J7A N; 3OT9 A; 3TOQ A; 3MMB B; 1RT4 B; 5L38 A; 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