The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
91
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structure length |
91
|
Chain Sequence |
KIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Apoptosis
|
| molecule keywords |
Caspase-3 subunit p17
|
| publication title |
Caspase-3 binds diverse P4 residues in peptides as revealed by crystallography and structural modeling.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
|
| structure length |
91
|
| sequence length |
91
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2009-03-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GFW B; 1RWP B; 1RWO B; 2CNO B; 2QLF B; 1RWK B; 1PYO B; 2XZT B; 2P2C B; 1RHU B; 2H5J B; 4ZVT B; 1SC1 B; 4DCO B; 2C1E B; 2QL5 B; 1SC4 B; 1RHQ B; 3GJR B; 2C2M B; 5IC6 B; 2XYG B; 3IBF B; 3NS7 B; 4ZVO B; 3KJQ B; 2DKO B; 2HBZ B; 1RWM B; 3RJM B; 2CJX B; 1ICE B; 4ZVR B; 3R6G B; 1RHJ B; 1I3O B; 2H54 B; 2QL9 B; 3SIP B; 3IBC B; 4ZVP B; 1F9E B; 2XYH B; 4ZVQ B; 2Y1L B; 4LSZ B; 4DCP B; 2C2O B; 4ZVS B; 1RE1 B; 2H4W B; 2HBR B; 2C2Z B; 3EDQ B; 1SC3 B; 3P4U B; 2CNK B; 3QNW B; 1RWX B; 3KJN B; 1RWW B; 3EDR B; 3KJF B; 2HBY B; 2Y0B B; 2CNN B; 2CNL B; 3R5J B; 2H5I B; 1RHM B; 2FQQ B; 4ZVU B; 5IC4 B; 1RWN B; 3R6L B; 3P45 B; 2H4Y B; 1QDU B; 3R7N B; 2CDR B; 3R7B B; 1NME B; 3GJS B; 2CJY B; 1PAU B; 3GJQ B; 2H51 B; 2C2K B; 3D6F B; 3R7S B; 1QTN B; 2HBQ B; 1BMQ B; 1RHK B; 2XZD B; 2H65 B; 3D6H B; 4JB8 B; 1I51 B; 5K20 B; 2QL7 B; 2H48 B; 3GJT B; 1IBC B; 3D6M B; 4DCJ B; 1RWV B; 1RHR B; 2QLJ B; 2QLB B; 2XYP B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S6P B; 5A2Q U; 2DR9 A; 1RIS A; 4PWD A; 1YTY A; 4C2M A; 2N4D A; 2B4P A; 2YTC A; 1EX8 A; 3TAN A; 4QOT A; 4ZPD A; 4MKA A; 1KVI A; 3NP5 A; 3RBZ A; 1W25 A; 4WCE Q; 1XIQ A; 2IRX A; 2GIQ A; 2RKI A; 3FBC A; 1ACM B; 1U1L A; 4KHP J; 3VF0 B; 2LEP A; 1SKS A; 3MPV A; 5BYS A; 4XAK A; 1IBK F; 5J2P A; 2CPI A; 2W2P P; 1Q8B A; 1T03 B; 1LW2 B; 2F1F A; 2F4F A; 3PCO B; 3NOG A; 4MAK A; 1CJK A; 3PX4 A; 1S79 A; 1HL6 A; 1UVJ A; 4NLG A; 3EX7 B; 5DDO C; 1H0H B; 5DGA A; 2HVE A; 1KOO A; 4M5K A; 4U7U K; 4I1T A; 2V5H G; 1RUS A; 2WSC C; 2QG9 B; 5FJ4 A; 2R4F A; 1GXU A; 2V4J A; 3BGF A; 2WZ1 A; 4G1Q A; 2A1B A; 3KLI A; 4KHM A; 1S76 D; 5FDL A; 1X8D A; 5SUH A; 3ISN D; 2AEM A; 3WIU A; 1S9F A; 2B8Q A; 1FWK A; 1RAB B; 4CM2 A; 5DZ6 A; 3CE8 A; 4ZP6 A; 4IFV B; 3UO0 A; 3BPD A; 4YDD B; 1HMV B; 2GVD A; 2GMJ A; 1FX2 A; 3B82 A; 3PYF A; 5A0Y A; 5F8H A; 1WOO A; 5L1L A; 2ZFH A; 4OYB A; 2B8P A; 2R7S A; 2XLJ A; 5HQ8 A; 3RTV A; 1BC6 A; 4OJ1 A; 5D3G A; 3PW2 A; 5L9X A; 4XPC A; 4JI5 F; 3DLH A; 2ZOG A; 5AJ3 F; 4OL8 A; 1P9Q C; 2NPF A; 3OTD A; 1KSP A; 4X66 J; 1YZ7 A; 1S59 A; 1CPZ A; 2AU0 A; 1JKH B; 4KGK A; 3BYP A; 4DG1 B; 3BGL A; 2ADC A; 3Q2T C; 2F9D A; 4NLP A; 1EIY B; 2NLW A; 1ITP A; 4BCA A; 2SXL A; 3MMA B; 3FCV A; 1XC9 A; 4LFB J; 2GHP A; 1UVN A; 1ULR A; 4ZHR B; 5M2P A; 4DFP A; 1TQL A; 3UPF A; 2CUY A; 4DV2 F; 4JI0 F; 2MXY A; 3GIJ A; 2HZC A; 2CAJ A; 1GMW D; 3ET6 B; 1HWJ A; 2B4V A; 4WP3 A; 2HBR B; 3MMJ A; 4LF8 F; 4DQP A; 2BOA A; 5L8R C; 4ZVF A; 2JEF A; 3CJK A; 2EC0 A; 4PRF A; 4J37 A; 4Q2M A; 3GCX P; 3HLU A; 2ZC3 A; 1R89 A; 2YKN B; 1NBE B; 1URR A; 2DEJ A; 1NSK L; 2FVQ A; 2OPS A; 1WOS A; 5LXR A; 1RTD B; 2OHD A; 1JLF A; 2LQ9 A; 3M8Y A; 4W92 B; 3BSC A; 1T94 A; 1LFW A; 2ZVI A; 5CA5 A; 3TP2 A; 2W9B A; 3W5Y A; 3RW6 A; 3EPG A; 2XY6 A; 3V6H A; 2NYI A; 6FDR A; 2WTF A; 2ZE2 B; 4N56 A; 4UQT A; 1Y5N B; 4K4V A; 3JXO A; 4NCB A; 4WZQ A; 4DSL A; 4KBI A; 1IUJ A; 4DCO B; 2IJR A; 1Q82 T; 9RUB A; 3EPI A; 2RAQ A; 4GKJ F; 1WDD A; 2V69 A; 1WEL A; 5D4L A; 3Q24 A; 4QIE A; 4ETX A; 1X5S A; 4IQM A; 1KQK A; 4OI2 A; 1KR4 A; 1X4A A; 1QJH A; 1VC0 A; 4J9M A; 2R2T A; 4NLT A; 3FFI B; 3AA9 A; 1U2R A; 1ZET A; 4A48 A; 2BYC A; 3KHH A; 2KYZ A; 2W9C B; 4EUV A; 4O3S A; 2DPJ A; 2VG7 B; 3QQC D; 1NJZ A; 5KFN A; 1FWL A; 1RT2 B; 5KG1 A; 1T8E A; 2HBY B; 2HEK A; 4I64 A; 1JNR B; 1DY3 A; 1QD1 A; 4DPU A; 1YGY A; 4I68 A; 4P71 A; 2GA7 A; 4Q0B B; 3MHY A; 1FKA F; 5D78 A; 5ITH A; 4DUZ J; 4F4Y A; 5FD1 A; 2VFU A; 3QSY B; 3NWG A; 1RHK B; 3KWM A; 4Q2L A; 4DL0 C; 1JLE B; 2IIH A; 2P9C A; 2VQF F; 3T1H J; 4LSN B; 4R5P B; 2F8E X; 4FYX B; 2P6T A; 4QR1 A; 3MTK A; 2BW7 A; 2UV8 G; 4W4M A; 3GII A; 3DLE B; 1B7F A; 1CJV B; 4NI2 A; 1F6T A; 2ZHA A; 2I9S A; 1N0U A; 1GMV A; 5HP1 A; 2V8G A; 3P3D A; 2Z2M A; 2LQB A; 1F9E B; 1ZPW X; 2OP5 A; 3G82 A; 3KHL A; 2RRA A; 3U1N A; 3D4J A; 3PKY A; 3VAM A; 1I6J A; 1GT8 A; 3T1Y J; 1KQF B; 4DSE A; 3IC1 A; 1BLU A; 4CLS A; 4DR6 F; 4C8O A; 4KV8 B; 3EDR B; 4CLL A; 2KFY A; 1KLN A; 2JEJ A; 1RWN B; 4YB7 A; 1IKY B; 5LJ3 Y; 4CP5 A; 3BH6 B; 4ZN3 A; 2Z58 B; 2D41 A; 5E7O B; 1PAU B; 3HZG A; 3R27 A; 3GFH A; 4CT8 A; 2DR6 A; 2FC9 A; 4Z7C A; 3KK1 B; 2WVB A; 2BJD A; 4IFY A; 2FD2 A; 4USW A; 2O5D A; 1B0T A; 3LQV A; 4JBC A; 1LOU A; 1RWV B; 2IRY A; 4RWW A; 4LF5 J; 4FDF A; 4ER8 A; 3PJW A; 2QL5 B; 4W98 A; 1HPZ A; 3GJR B; 2HVH A; 4ZIT A; 4Q43 A; 1ZM9 A; 3G96 A; 1UET A; 1XK8 A; 3RZA A; 2L41 A; 5CYJ A; 4AT1 B; 1CG2 A; 4ZMM A; 1Q5V A; 1RHJ B; 2XO7 A; 5RUB A; 3U7J A; 3DLK B; 1N48 A; 1U0H A; 3SFG A; 1NJI T; 4ALZ A; 2HHH F; 2VPX B; 1TTH B; 4PKD B; 5GMD A; 4WXW A; 1AT1 B; 3MFH A; 1ZOT A; 3MTJ A; 3N5F A; 2VG6 B; 2ACY A; 4M95 A; 1XEZ A; 2N7C A; 2DRD A; 3CD5 A; 3AQP A; 3AD8 C; 1NPK A; 3C16 B; 4K50 A; 3SBM A; 1Q5Y A; 1YBA A; 3TO8 A; 1RDR A; 4EZ9 A; 4DR2 J; 3N6N A; 1TV6 A; 4JYA J; 4L73 A; 4GMK A; 1GX5 A; 3V81 A; 2BR0 A; 3LOU A; 1SVD A; 3CJ0 A; 1VHF A; 2OPQ A; 2YNF A; 2O67 A; 1N33 F; 3QWP A; 4O4G A; 4JUZ A; 3TZX A; 4PPZ A; 1FRJ A; 4J9N A; 4OLP A; 2HWI A; 1C0U B; 2A2C A; 3ZZU A; 3M8S A; 2KYX A; 3W64 A; 2VPW B; 4NA1 A; 3K5N A; 2F4V F; 3Q83 A; 4LMZ A; 4TN2 A; 4UOG A; 3HVW A; 3IG1 B; 3MGJ A; 1Q8K A; 2W8L A; 3OHA A; 3RAQ A; 2AV5 A; 2BBE A; 4OX6 A; 3IS9 A; 2A6M A; 1FD8 A; 3K5L A; 5KFC A; 4JI1 F; 1J27 A; 1X5O A; 4FYV B; 1Q78 A; 2MKY A; 2FQQ B; 3IWX A; 2F3J A; 1C0T B; 1Y5L B; 4DV6 J; 1OPI A; 1TAQ A; 2Y1I A; 1VOM A; 4ZIW A; 4XPE A; 4ZIV A; 4DZD A; 1NRK A; 4X4N A; 2V0N A; 3P6Y C; 4KTQ A; 2XSJ A; 3TUZ C; 2BAB A; 2ABY A; 4ECS A; 1WF2 A; 3HSJ A; 2K06 A; 1ROF A; 3W9I A; 2Y8Y A; 5GAG U; 4H4M B; 4EGL A; 2GJF A; 2W9A A; 2MLZ A; 3J7Z T; 1O6X A; 2AD9 A; 4DFM A; 2HRU A; 3M8Q A; 1RKJ A; 4ERD A; 1N88 A; 3N4W A; 1XQI A; 1KQG B; 1BQN A; 4I2P A; 4E8U A; 1VI7 A; 3DGP A; 1VQL S; 1HLW A; 2Z56 B; 5JMN A; 3CD0 A; 2W1B A; 2QZ8 A; 2PI4 A; 2GJ2 A; 3B4D A; 2VFV A; 1S7H A; 4J9R A; 3SV3 A; 5T7L A; 3VAI A; 3OD2 A; 2H9Z A; 4FKY A; 2WVD A; 4BWM A; 2B9E A; 3GFZ A; 1YJW S; 1YVF A; 3VHQ A; 2YWH A; 4A46 A; 1TFW A; 5EWG A; 4B9N A; 4YB6 A; 3KUE A; 1D9D A; 4DV5 F; 4XDD A; 4DN9 A; 3HHL D; 3IM9 A; 5KT6 A; 2CRL A; 3MUT P; 2LXF A; 4HYK A; 2UXD J; 3SI8 A; 2IA6 A; 3ZZ0 A; 1SJF A; 1RAD B; 1FDN A; 4X62 F; 4P73 A; 3NBP B; 2DNO A; 4RU9 A; 2R8I A; 2V2V A; 2EPI A; 2HLU A; 5A8R A; 1VQ9 S; 2RQ4 A; 2WBR A; 2K1R A; 4L72 B; 3D1Q A; 2EI5 A; 2AJ4 A; 4RUB A; 1W7W A; 2DTJ A; 4PXC A; 1EP4 B; 2R42 A; 1H2T Z; 2J6U A; 2AX0 A; 1MN7 A; 1S6Q A; 3S1T A; 1YJ7 A; 3MR7 A; 2NSB A; 1RAO A; 3M1V A; 4ZP9 A; 3PR5 B; 2J6T A; 3DLG A; 2VDI A; 1E6Y A; 1SUQ A; 3QNW B; 4QZV B; 1HBM A; 2YPY A; 3KNA A; 4KT0 C; 1HNX J; 3H8Y A; 1GX6 A; 3MAA B; 4N7T A; 1H2U X; 3FK4 A; 1TL7 B; 2PO4 A; 3MUV P; 2IJN A; 1F9F A; 1YRU A; 4AND A; 2OGU A; 3DGV A; 3PYG A; 3WZ0 A; 3IGN A; 3CCR S; 3PIO Q; 4X4V A; 1XTZ A; 5K8M A; 1VCT A; 1YSJ A; 4B9U A; 2MJN A; 1BQX A; 1YDL A; 4WYW A; 3GIL A; 1S10 A; 3C46 A; 4F02 A; 2GCF A; 2MZ1 A; 4YB5 A; 1U1R A; 4GC6 A; 4ID5 A; 2XZW A; 4QW8 A; 3GG0 A; 1BHN A; 4UOH A; 1MN9 A; 3MI7 X; 2IM0 A; 4K4Y A; 5B0E A; 3GE9 A; 4NA3 A; 1NEE A; 1NU4 A; 1AFJ A; 4K4U A; 3E51 A; 1NM2 A; 1RK8 A; 2GVZ A; 4LQ3 A; 1RAG B; 4G65 A; 3K57 A; 1AFI A; 2E7W A; 4KIA A; 1KLM B; 2IYG A; 3FJ2 A; 3M6V A; 3J7A 1; 2Z2Z A; 3L7U A; 5KFF A; 2RS8 A; 4DV3 J; 2B9W A; 1MG7 A; 1KEK A; 4EYH B; 2H51 B; 1VLY A; 3OXF A; 4DQQ A; 5B08 A; 1Y3J A; 2MMY A; 3JTN A; 1IBL F; 4O3R A; 2JX2 A; 1NO8 A; 1HQE A; 4ED3 A; 3EZU A; 3UDL A; 3KG4 A; 1YX2 A; 3C14 B; 3BKF A; 2KFN A; 2ASD A; 3MMB A; 4AXI A; 2MZS A; 2I2Y A; 2MQL A; 1KC8 T; 4K5S A; 1BXN A; 1NKC A; 2CWK A; 1JXL A; 1NDK A; 5F3Z A; 2FJW A; 1FDB A; 2K3K A; 3M2V B; 1NB2 A; 4HI1 A; 1FRL A; 1VQM S; 3LP2 A; 1FE0 A; 1NAQ A; 1IR0 A; 1T02 A; 3IGV A; 2ACM A; 4PG4 A; 4ZK7 M; 1XNQ J; 3V4I A; 4PWD B; 4UY8 T; 3OTC A; 1QDU B; 3K5P A; 4M5L A; 3QRP A; 3DC2 A; 2XI2 A; 2CA9 A; 3CMA S; 4CYU A; 1HQU B; 2CQG A; 2N3O A; 4CWB A; 1FXD A; 2IAJ A; 4JB8 B; 3UWT A; 2X1G A; 5H1S V; 1JK9 B; 2P8I A; 2RQK A; 1HHQ A; 2AJ1 A; 4B9V A; 1N6Q A; 2HHU A; 1R8B A; 1PJ7 A; 1RCO B; 4C6A A; 4M5D A; 4AFF A; 1RT7 B; 2OPP A; 3CNQ P; 2ZH4 A; 2IM1 A; 3CCE S; 3I9V 9; 2AYB A; 3VCD A; 2RS2 A; 5J2M B; 4DQI A; 1CJK B; 1OY8 A; 3J81 j; 4ZPA A; 1D09 B; 3EGV A; 4LRE A; 2PMH A; 3C6T A; 1TUW A; 2KTQ A; 5BJR A; 4PUO A; 4ELV A; 2C28 A; 3LGN A; 1EB0 A; 4DR3 J; 4P7T A; 1S72 S; 2MQN A; 2XMM A; 4AE5 A; 3UDE A; 3D28 A; 2QJ3 A; 1X9M A; 1S48 A; 2BE2 A; 4O3N A; 2FLL A; 1S1U A; 3R7N B; 2V4J B; 1RT5 A; 4LBP A; 1RA7 A; 3KHG A; 1LW0 A; 2PI5 A; 1RGV A; 1S77 D; 4RUH A; 2QGF B; 3SCL E; 3ZTP A; 4K0K F; 3MCN A; 3V6D A; 1UVL A; 3LP1 B; 2NR0 A; 1MRO A; 2WHO A; 4S0M A; 6AT1 B; 3OW2 R; 2DR5 A; 2UU9 J; 3OHB A; 5A0Y B; 2PMZ D; 4MKB A; 1Y0H A; 4IDK A; 3CJ5 A; 1HAR A; 3MEG B; 2DXE A; 1FK9 A; 4KFB A; 3VV2 B; 3CJR A; 5L1K A; 5D3G B; 2ZOF A; 1N5V A; 4HAC A; 3MCS A; 5J1E A; 3M4X A; 1FD2 A; 2G9O A; 3EVW A; 4TKT A; 3CDW A; 3RB4 A; 4JI7 J; 3ZC4 A; 5DQG A; 3W63 A; 1VQ6 S; 2Z57 B; 1FXR A; 2CNK B; 2K7J A; 3UN2 A; 3ZZR A; 1S97 A; 1MWQ A; 1VLO A; 1H7X A; 3MPW A; 4I6W A; 2DNQ A; 3L95 X; 3IR7 B; 3LP0 A; 4X4O A; 1N32 J; 4USU A; 1NK8 A; 1FJE B; 4HTJ A; 2RH3 A; 4ZDN A; 4ZA1 A; 5KFH A; 4PG8 A; 1IKX A; 2KG1 A; 1RWU A; 3E01 A; 2FJE B; 1N34 F; 5HMZ A; 1XMB A; 4WTY A; 2ZKU A; 2FY8 A; 2MGZ A; 1V5V A; 1DTQ B; 4DU7 A; 1DZ5 A; 1H38 A; 3CJK B; 3L7O A; 2EKY A; 2E1P A; 1CQM A; 2KG0 A; 1R0C B; 2AYM A; 4UOC A; 5I3U A; 3K7R A; 3PFO A; 4Z7Y A; 4DLG A; 2DO4 A; 4PZV A; 4FPR A; 2OPS B; 4C48 A; 1T95 A; 2G0C A; 4B3M J; 3GFY A; 1KOH A; 1KQS R; 4ITS A; 1NJX A; 4OJ3 A; 1SI9 A; 3SCK E; 2H4W B; 3PEH A; 5E3P A; 1BGX T; 3GZ7 A; 2AIR B; 4YR0 A; 4KGX B; 3UFC X; 1U1M A; 5HVH A; 1VQY A; 5BYQ A; 2HUR A; 1DFD A; 2CQH A; 4JI4 J; 4DUT A; 1SQG A; 4CTA B; 3TUJ C; 3FVY A; 2E9R X; 3ILJ A; 1B0P A; 3JSR A; 2CFX A; 3DRY A; 3ZXW A; 3TAP A; 2GGP B; 2YWW A; 3Q2S C; 2R7R A; 1JJ2 R; 4NOH A; 2JFK A; 3C15 A; 1GFW B; 3GG1 A; 2XHW A; 4N47 A; 4NYO A; 2KM8 C; 3R5D A; 3B6B A; 4LFC F; 1VQO S; 1HR0 F; 4YB1 P; 3CCW A; 4TXS A; 2VON A; 1AZS A; 3PX0 A; 1RWM B; 1NPP A; 1QAX A; 1U6Z A; 1ZAV A; 5FII A; 4O3O A; 1WKL A; 1YJT A; 5DQI A; 1YIT S; 1BQM A; 2CQ2 A; 2RU9 A; 1XN9 A; 4HH0 A; 2QV6 A; 1CEZ A; 4I2Q B; 5E33 A; 2W24 A; 1RTI B; 4RW9 A; 3C19 A; 2ZZM A; 4OI1 A; 2ILY A; 1YRX A; 4UUX A; 2DGQ A; 3M9O B; 3W5Z A; 2XGP A; 3LAN A; 4NI2 B; 2GIF A; 2CVI A; 1LK7 A; 1RZM A; 2ZIT A; 2E66 A; 4KYZ A; 4NLO A; 2X1B A; 3BSN A; 3WIV A; 3PXG a; 5HP1 B; 3DI6 B; 5E3C A; 1ZTW A; 1WAC A; 2UUA F; 2MQP A; 4QYR A; 3UI3 A; 1X4E A; 4PAA A; 2R7Q A; 5G0R A; 2UXB F; 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