The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
|
sequence length |
76
|
structure length |
76
|
Chain Sequence |
SAGKFIVIFKNDVSEDKIRETKDEVIAEGGTITNEYNMPGMKGFAGELTPQSLTKFQGLQGDLIDSIEEDHVAHAY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/protein binding
|
| molecule keywords |
Subtilisin BPN'
|
| publication title |
Crystal structure of serine protease inhibitor POIA1 in complex with subtilisin BPN'
rcsb |
| source organism |
Bacillus amyloliquefaciens
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| total genus |
22
|
| structure length |
76
|
| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2W2M P; 3T41 A; 3A3N B; 3BGO P; 1V5I B; 2Z58 B; 4NE9 C; 2W2O P; 1ITP A; 2E1P A; 2PMW A; 3WHI A; 3SQO P; 3CO0 P; 3WIU A; 1SCJ B; 3WIV A; 2ZWO A; 3CNQ P; 2W2N P; 2W2P P; 3GCW P; 2Z57 B; 1R6V A; 3GCX P; 2QTW A; 4YN3 B; 3VV2 B; 3P5B P; 1SPB P; 3BPS P; 3H42 A; 2Z2Y B; 3AFG A; 2Z56 B; 4OV6 A; 3QFH A; 3A3P B; 2W2Q P; 4JP8 A; 2ZWP A; 2Z2Z A; 3VHQ A; 4K8R A; 3A3O B; 2XTJ P; 2Z30 B; 4NMX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OFG X; 3B54 A; 4X66 J; 3ISZ A; 1FO1 A; 5CXT A; 3GQC A; 3HSG A; 1CJU A; 4DSF A; 4DUZ J; 4K50 A; 2RDJ A; 2KHD A; 1T05 B; 1NM2 A; 4PUO A; 5HN0 A; 2CKW A; 3DRR B; 3PM9 A; 4KV8 B; 1D3W A; 1E6Y A; 2C3U A; 4B9S A; 2Y1I A; 3LP2 B; 2CPJ A; 3PZP A; 2X1B A; 2VPZ B; 1EP4 A; 1X4F A; 3AJ2 A; 3CT9 A; 4EI2 A; 5K8N A; 4OHW A; 4DR4 F; 3KHH A; 2FY1 A; 1WTF A; 1O8B A; 3V6J A; 2DNL A; 1UEU A; 3NP5 A; 3GCW P; 3I9V 9; 4C3L A; 1DRZ A; 3KUE A; 2EPI A; 2QL9 B; 1FFW B; 1GTH A; 3R5J B; 5DZ6 A; 2CJA A; 3BBB A; 2GX8 A; 2DEI A; 3SQO P; 3BYR A; 2HVZ A; 3TAR A; 4HI2 A; 1RHU B; 2B43 A; 5ETN A; 8AT1 B; 1XMQ J; 5BR8 J; 1HBO B; 4IDK A; 2C22 A; 3SQG B; 1RAD B; 5KFH A; 3FQK A; 2JVO A; 2FVS A; 3SCK E; 4P10 A; 4LRB A; 4Y34 A; 4NYO A; 1Q8L A; 1IJF B; 3HX9 A; 3Q22 A; 2ASY A; 2AZ3 A; 4ALZ A; 2X1F A; 3MD3 A; 4AXJ A; 5KFC A; 3HHL A; 3ITH B; 1WEZ A; 3M6U A; 3MMJ A; 4P2X A; 1FXR A; 3TA0 A; 2MZJ A; 1I5O B; 1D8Y A; 4LF5 J; 1C0T B; 3D66 A; 2OTJ S; 2DR8 A; 5ETR A; 1QSY A; 1CG2 A; 4LFC F; 3EX7 B; 3CCR S; 2X1A A; 2DH9 A; 3U1N A; 5A0Y A; 4NA3 A; 1HI0 P; 3BBF A; 3MMA A; 4ZP7 A; 4GRS A; 3KLV A; 4DL2 A; 3U7J A; 2O66 A; 5CZX A; 4CT9 A; 4W92 B; 2D3U A; 1MN7 A; 1PAE X; 2PD1 A; 3CPW R; 5J2M A; 1QUP A; 2G0I A; 3SI8 A; 2CJK A; 1SH0 A; 4UUX A; 4ECW A; 3DLL Q; 5I4M A; 4DR1 J; 2ZIT A; 4IQM A; 4TLR A; 3DI6 B; 2YNF B; 2QMU B; 4DPX A; 4G1P A; 4L3K A; 3GU0 A; 2R2T A; 2XGP A; 2QG9 B; 3FQL A; 3RW6 A; 1RWN B; 4NLD A; 3SEO A; 1LWC B; 2HEK A; 3PTW A; 2Y1L B; 4DV4 J; 1WEY A; 2AHO B; 3FCH A; 3BV8 A; 4WFX A; 2FLL A; 2N4C A; 3OTE A; 3OVA A; 5DRK A; 5EWF A; 3VR1 A; 3TWZ A; 4U95 A; 1TKX B; 2QYC A; 1TL4 A; 2N4D A; 1FKA F; 3DYA A; 2QSF A; 3Q8S B; 3A1Y G; 2OLW A; 2KXF A; 2QLX A; 1WSR A; 1ZYQ A; 4PG5 A; 4C3M A; 3T5H A; 4OI1 A; 5CH7 B; 2C2N A; 2GJI A; 2NXN A; 4KH1 B; 4OYP A; 1Y11 A; 2KH9 A; 1D9F A; 4J9U E; 4DR2 J; 2PA3 A; 3TQ1 A; 1F5C A; 3N4W A; 2RJZ A; 2KRB A; 2NXE A; 4WU2 A; 2LCW A; 4DL3 A; 3KKF A; 3UFC X; 3ILI A; 2ACM A; 3CCV S; 4LIW A; 4HL9 A; 2FTR A; 2HHV A; 4QBU A; 2F9J A; 5J2Q B; 3CC2 S; 2JWN A; 4K59 A; 2HG4 A; 3J80 U; 2V8G A; 3BPS P; 1RAB B; 3J7A N; 3S01 A; 4DV3 J; 3DC2 A; 2IJR A; 1R8H A; 5HVG A; 1BD6 A; 2ZH1 A; 4WXW A; 3HVA A; 3CJK A; 1RCX B; 2ERR A; 2J9D A; 1P27 B; 2DNG A; 3MM8 B; 2RB7 A; 3ICL A; 3M6W A; 3JSM B; 2YQ3 A; 2MST A; 1YTY A; 3T9N A; 5B0G A; 3N6M A; 2W9B A; 3M32 A; 1AFI A; 3F73 A; 2CFX A; 3C6U B; 3PIO Q; 1FHT A; 5KFW A; 1U25 A; 4LF6 J; 4RW9 B; 1YBA A; 2NRE A; 4DFK A; 2RVJ A; 3NG8 A; 4OZL A; 3QJJ A; 4OV6 A; 3PYD A; 2Q66 A; 3GR1 A; 5CQG A; 1XIQ A; 2R7W A; 1SUQ A; 3VAK A; 3RBZ A; 2HVD A; 3OFG A; 1U1P A; 3HFK A; 5CCM A; 4F4Y A; 3PKY A; 2V94 A; 1VQY A; 4O3O A; 3L7P A; 1EHW A; 4UQT A; 5CCL A; 1TKT A; 3V4I A; 3M1V B; 2IRU A; 1GTE A; 1NKE A; 4OFZ A; 1U6F A; 3M8W A; 5J2P B; 3CCM S; 4CCH A; 4EU0 A; 4LSL B; 4OYO A; 4O44 A; 1UAW A; 5C24 B; 1TL1 A; 3FK4 A; 5KFL A; 2ZUG A; 3RUB L; 4JI2 J; 1V3R A; 3Q8U A; 4QWC A; 2MQN A; 2AJQ A; 3EPG A; 1JLA B; 1TKD A; 4RUB A; 2B8P A; 3WBZ A; 1K8A T; 2QLF B; 5IV4 A; 3DLJ A; 5KT7 A; 3GSD A; 2R8K A; 2FVC A; 3BM7 A; 5L39 A; 4LRF A; 1VI7 A; 1NJW A; 4DR5 F; 2YKM B; 2CPH A; 2J7W A; 2BE2 A; 5K8P A; 3QMQ A; 4ZVG A; 3EE3 A; 4FS1 A; 3M7V A; 5IWA J; 1CVJ A; 4UF4 A; 1QAI A; 3RB6 A; 2QIF A; 4EUV A; 4YR0 A; 1W7W A; 1UWA A; 2O67 A; 5BYR A; 1DQ9 A; 3D3B J; 1A7G E; 1FVS A; 2BAN A; 3CGI A; 1FKP B; 2UXC F; 4DI6 A; 5AE2 A; 4K0K J; 3PG9 A; 4CQ1 A; 1S9G A; 4XK8 C; 5F9L A; 2UVW A; 4B9M A; 3MCN A; 3EGV A; 2VKR A; 4NOH A; 2J9E A; 3MPW A; 2ZVI A; 3MPU B; 3KLH A; 1Z2Z A; 1MNE A; 4DL0 C; 1HHT P; 4IQX A; 3OR1 A; 1JNZ B; 4H4K A; 4OZ0 A; 5C5J A; 4RBT A; 1TR0 A; 5KFU A; 1VHI A; 3FSI A; 1PO6 A; 3CC7 S; 1X4B A; 1J5O A; 2K7K A; 2CPX A; 4G1I A; 3LOU A; 3IS9 B; 1VBY A; 2LU1 A; 3DXB A; 1S72 S; 2BJ3 A; 2NYI A; 3K58 A; 1S4E A; 1CJK B; 2RS2 A; 1BLU A; 2RNE A; 3J81 U; 4LJM A; 5DDO C; 2CNK B; 3DOK A; 3R2D J; 2OEJ A; 4CNY A; 1KQG B; 1L5U A; 5KT3 A; 1SL0 A; 1KKH A; 4RO0 A; 2AYB A; 1OY6 A; 4K4U A; 1NK4 A; 2CQ3 A; 2UP1 A; 2VQF J; 2E9Z A; 1S1X B; 3GMG A; 1LW2 A; 4UZB A; 1C1C B; 3B4M A; 3E01 B; 1EKR A; 2XEX A; 1VIX A; 1S6U A; 5A8W A; 3R1L A; 4XDC A; 1JLC A; 4EZ9 A; 4LQ3 A; 4H4M B; 3DHW C; 5GAE U; 3BSA A; 2D7S A; 5E33 A; 4AUK A; 2Q1L A; 2M0G B; 4QU6 A; 3HPO A; 1UJ5 A; 4OZN A; 1LFW A; 2CG4 A; 4OI4 A; 3DM2 A; 4C8M A; 5DLF A; 2XLI A; 5ITH A; 4PWD B; 5GMD A; 1RWV B; 3M30 A; 2H54 B; 5A6P A; 1F0X A; 2E1P A; 2YNH B; 1FD8 A; 1SQG A; 2DXD A; 2GML A; 4LF9 F; 2HND B; 5DGB A; 1UP1 A; 2F3J A; 3MI7 X; 4XTT A; 5F8H A; 5B0C A; 1UFK A; 1GK8 A; 4ATN A; 2HBY B; 1S6O A; 1MLA A; 2IM3 A; 1XMO J; 2C2R A; 3EJM A; 1ELO A; 3I0R B; 4HTJ A; 2DHH A; 5EX3 A; 2WHO A; 4A8O A; 4ZP6 A; 4ZK7 M; 5IS2 A; 4AE5 A; 4KO0 B; 2QMW A; 2YNG B; 4OZ1 A; 5HQM A; 3AOB A; 3O6Q A; 4DCO B; 1CJV A; 1HQE A; 4B3S J; 4CLU A; 4ELV A; 1Q8I A; 1RAJ A; 4DUY F; 3CCZ A; 2EFP A; 5KT4 A; 2ILZ A; 2A6M A; 2GQ2 A; 1DQA A; 5L38 A; 2MHE A; 2CQ0 A; 3RYL A; 4I6W A; 3M8Y A; 4WKR A; 3HHL C; 4J9K A; 1V6H A; 1DJ0 A; 4HHH A; 1K1S A; 1YJT A; 1B7Y B; 1B99 A; 3ADA C; 4ILL A; 2X7I A; 3GJR B; 3HKW A; 3I55 S; 3TJA A; 2XMM A; 4FKX A; 1RHM B; 1JX4 A; 5BYQ A; 3B8H A; 2J0S D; 4DG1 B; 4ECV A; 1B0P A; 1MU2 A; 2JVR A; 1EP4 B; 4DR3 J; 4RWX A; 3M8S A; 1ZAX A; 3KG1 A; 2B9E A; 1RK8 A; 3HT3 A; 4NLG A; 2E1R A; 4NAS A; 3JSB A; 2C2E A; 4I67 A; 3PO5 A; 2Q6C A; 3I6P A; 4LFC J; 4WE1 A; 5DQH A; 4F36 A; 5HO4 A; 1VBK A; 3VAL A; 4ZVT B; 1SC3 B; 1FEH A; 4AYB D; 3RBD A; 1U4B A; 3HD1 A; 3L09 A; 4IDK B; 3W5Y A; 1FES A; 2E7V A; 2Z2M A; 4TQS A; 3FKB A; 1F1B B; 2Q43 A; 2BUN A; 2LDI A; 4RBU A; 3HVT A; 4I2P B; 3V81 A; 2RT3 A; 4EBE A; 3H40 A; 2K1R B; 1WC6 A; 3M9O B; 4C8K A; 3IGV A; 2M3D A; 4ES2 A; 3NY0 A; 3HHL B; 2OO4 A; 2WCX A; 3D67 A; 4OJG A; 4CM0 A; 1F9H A; 3H2L A; 2ZHO A; 4FP9 A; 1WI6 A; 3PEH A; 2DRA A; 1RAG B; 2DCU B; 4U9R A; 2V9W A; 1Y3K A; 2GFF A; 4MK9 A; 3IN5 A; 5LMU F; 4BHQ A; 1NDP A; 3IRX A; 4Y2A A; 4C98 A; 4X4T A; 2EBG A; 4UY8 T; 4M5G A; 1S1T B; 3CMA S; 1X4C A; 4RNO A; 2XSJ B; 4ELT A; 4U8Y A; 3PRB A; 4ICL A; 1WF2 A; 2WW4 A; 5E3Q A; 1S76 D; 1WHW A; 4ZP9 A; 1CJT B; 2UUC J; 2E7X A; 3T5K A; 4GVB A; 5ETS A; 4PQU B; 2V4R A; 1FNO A; 3ET6 B; 3PNI A; 1PGZ A; 2EG1 A; 2A6O A; 3Q8Q B; 3R6L B; 4ED8 A; 1UA0 A; 2EKN A; 2ZD1 B; 3HJV A; 4H4O A; 3CJQ A; 5LT5 A; 3I4P A; 3KFW X; 1RGV A; 4U6P A; 2EBE A; 1UW4 A; 4ZJO A; 3KHR A; 2SXL A; 5D3G A; 4RW8 B; 1K73 T; 1N34 F; 2ZHB A; 3HHN B; 2ZHA A; 4JI0 J; 5ETQ A; 1WSV A; 1U7L A; 2XY6 A; 4ES3 A; 2VFT A; 2IMW P; 1M1G A; 4P9S A; 4UUW A; 2QE5 A; 1U45 A; 4DQS A; 4PG8 A; 2W9A A; 1B0V A; 3GIM A; 3LAL A; 5LSO A; 2RH3 A; 2W7A A; 3KDO A; 1S1U B; 5KT6 A; 3GG0 A; 4PQA A; 2CAD A; 2FVP A; 2DGS A; 1M5P C; 3K17 A; 1ROF A; 3UD4 P; 1VDH A; 1RT7 A; 2DXF A; 2RD5 C; 4GKJ J; 2VQE F; 2VG6 B; 2QLJ B; 2MHN A; 1YJ7 A; 1X5P A; 4USU A; 3HMJ G; 2YWE A; 3QGI A; 1UEV A; 4CLY A; 3M2V B; 3QNW B; 2NYH A; 3FBC A; 2YH1 A; 5F8I A; 4PAB A; 2HVH A; 3BKT A; 1TP7 A; 1RHJ B; 3I0S B; 2Y0B B; 4FF1 A; 1T11 A; 4G1Q A; 3DLK B; 2B51 A; 1GEH A; 2ZBI A; 1P1L A; 4J9O A; 4P7V A; 4F7V A; 3CJ5 A; 2LXI A; 4V19 J; 1RHR B; 2FGC A; 1FX4 A; 1WTB A; 1LNQ A; 4KGM A; 1SC4 B; 1YRT A; 2ASD A; 2WB1 D; 2R7S A; 1IUJ A; 4WFN Q; 4K4S A; 2COL A; 1RT5 B; 3HM9 A; 1PSD A; 4NXN F; 3LW5 C; 2HVE A; 1SXL A; 2M88 A; 1HD0 A; 3SZ2 A; 4MH8 A; 1S97 A; 3IWN C; 1BHN A; 4DR6 F; 4KYZ A; 1X0F A; 4ECQ A; 4TXS A; 4B3M F; 1VQS A; 2PI5 A; 3SXL A; 3V5R A; 3LTO A; 3TUP A; 4R0J A; 1YJW S; 1IN0 A; 1WD6 A; 2V2V A; 4F3Q A; 4WFY A; 1IM6 A; 5GAH U; 1NSQ A; 2GO9 A; 4WPA A; 1HBM A; 1SUQ B; 2HVI A; 3U1M A; 4WP8 A; 4ED5 A; 2GC8 A; 3Q89 A; 4DX7 A; 1RTJ A; 4F4W A; 1FE0 A; 2W2M P; 2G1H A; 3P8B B; 3TVK A; 4YS2 A; 1WF1 A; 3V4I B; 3V6K A; 1RWO B; 3GFH A; 2LU2 A; 4URG A; 3R7N B; 1GX6 A; 3KWM A; 3H4D A; 1YBU A; 3KJF B; 4X4R A; 4YHH J; 1ZM9 A; 4LRD A; 1G7C B; 4O44 B; 2IVM A; 1HNX J; 2ZBP A; 3BYP A; 4H4K C; 1WKK A; 4PKD B; 1IKW A; 3IG1 B; 4A4J A; 2OPS A; 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3T6J A; 1G4C A; 1VLO A; 3WX4 A; 2AV5 A; 3C15 B; 2CZ9 A; 1VRQ C; 2GJF A; 4ZIW A; 2LA4 A; 1IR2 A; 2AZ1 A; 2Z56 B; 3AY0 A; 5JXS A; 2V2Q A; 4OYZ A; 2MYF A; 4KFB A; 2KJV A; 3HDS A; 2XCP A; 3CD5 A; 2XI3 A; 4DUY J; 2CPF A; 2VDI A; 1TFY A; 3AD8 C; 1RWW B; 1FJ7 A; 1GMW A; 1I94 F; 4WIQ A; 2UXD F; 1LWE A; 2KYX A; 2YWK A; 1HNI B; 5J1E A; 1Y9O A; 2HHU A; 3BSC A; 4KGZ B; 5HRO B; 2XM3 A; 3VAM A; 4FYW B; 2VG5 A; 1JLQ B; 4R8U B; 2HQD A; 4CO1 A; 1ZZF A; 2NSB A; 4C3K A; 4F04 B; 2QZ8 A; 4ELU A; 3LWM A; 3R6G B; 4F50 A; 5K5M A; 1GFW B; 1HI8 A; 1N0U A; 5D78 A; 4WK3 A; 5DO2 A; 3OTO F; 1CPZ A; 2MGZ A; 4C8Y A; 1N5Y B; 4LRA A; 1S12 A; 2JH3 A; 2HS3 A; 4BLG A; 2IA6 A; 2KT3 A; 4HLB A; 3TVZ A; 1EAY C; 5IXU A; 2FVR A; 4YOE A; 1SJ3 P; 1CJV B; 1HWI A; 1OPZ A; 1DUR A; 3TR5 A; 3ZTP A; 2LQJ A; 1HD1 A; 4N5S A; 2OKQ A; 2J5A A; 3AT1 B; 1DTQ A; 2JNJ A; 1FRL A; 2FZC B; 3H5X A; 4JV5 F; 3PEJ A; 5C42 A; 4F67 A; 1RB0 A; 1IBM F; 2G1D A; 2DHS A; 3FDS A; 1TK5 A; 3T9Z A; 3NOC A; 4BC7 A; 1SVD A; 3FRZ A; 4PG4 A; 4LIR A; 5F9N A; 4DPO A; 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