The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
92
|
structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Caspase-7
|
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C2K B; 2XZT B; 4DCJ B; 3SIP B; 3RJM B; 2HBZ B; 2CNO B; 2H4Y B; 2QLB B; 1RWX B; 2CNN B; 3EDQ B; 1GFW B; 1QTN B; 3D6M B; 3GJS B; 4JB8 B; 2CNL B; 3R5J B; 2Y1L B; 3NS7 B; 3QNW B; 1RHQ B; 1ICE B; 4ZVO B; 1SC3 B; 2H5J B; 4LSZ B; 4DCP B; 1RHK B; 2H5I B; 3GJT B; 2H54 B; 3P4U B; 4ZVT B; 2H65 B; 5K20 B; 1RHR B; 3KJF B; 1F9E B; 1RHU B; 2XYG B; 4ZVR B; 3R6L B; 1RWO B; 2H48 B; 1I3O B; 1BMQ B; 4ZVS B; 2QL9 B; 1RWP B; 1PAU B; 3EDR B; 3R6G B; 3GJR B; 3D6H B; 2QLJ B; 2CDR B; 1RE1 B; 2CJY B; 2HBR B; 3R7B B; 1RWW B; 2CJX B; 2Y0B B; 2XZD B; 2C1E B; 3R7N B; 2HBQ B; 5IC4 B; 2FQQ B; 1RWM B; 4ZVQ B; 1I51 B; 3R7S B; 1SC4 B; 3D6F B; 2C2O B; 1RHM B; 2H51 B; 3GJQ B; 1QDU B; 2QL5 B; 4DCO B; 1IBC B; 2CNK B; 5IC6 B; 3IBF B; 2H4W B; 2C2M B; 2P2C B; 1PYO B; 1NME B; 1RWN B; 2HBY B; 3KJN B; 1RWK B; 4ZVU B; 1SC1 B; 1RHJ B; 2QLF B; 2DKO B; 1RWV B; 3IBC B; 3P45 B; 2C2Z B; 2XYH B; 3KJQ B; 2XYP B; 4ZVP B; 2QL7 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KS2 A; 5D4O A; 4P74 A; 2XMM A; 1S48 A; 2OSR A; 3UCG A; 4CZC A; 3MGJ A; 4NLU A; 3MDF A; 4WTO B; 2L48 A; 2DHH A; 3A12 A; 1YWX A; 1VQ8 S; 4CQ1 A; 2PMW A; 5BYR A; 4D3H A; 3G8S A; 4EK2 A; 2HQD A; 3CVK A; 2OSQ A; 4N76 A; 2LVW A; 4QPX A; 2AW0 A; 2BX6 A; 4NLS A; 4LRE A; 1SVD A; 3BSA A; 2XUL A; 1X7V A; 4DFJ A; 2I1R A; 2XMJ A; 4LIW A; 1R6Y A; 1IKX B; 2AF6 A; 1VS3 A; 5K8N A; 3VGV A; 2OPP B; 2MQN A; 1CC8 A; 2K3K A; 4N7T A; 5HO4 A; 1RTH A; 1VQL S; 1RSC A; 2AKW B; 2ZBC A; 3O8W A; 3UQS A; 1XC9 A; 3OHA A; 2XY5 A; 2OD4 A; 4RWW A; 4PWD A; 5H9E J; 2WBM A; 1JWW A; 1N34 J; 1WUU A; 1XNR J; 2YWF A; 5KG3 A; 2HKE A; 3MUT P; 1RDR A; 5A2Q U; 2C2R A; 2QA4 S; 4RW7 B; 1BQN A; 3PFO A; 1U49 A; 3QJL A; 4KRW A; 4U7C A; 3L7P A; 3HHL B; 5LJ3 Y; 5E2Q A; 3MUV P; 2QSW A; 3G6E S; 1QJH A; 5ETV A; 4JI0 F; 4KO0 A; 2FJE B; 1HNW J; 2KI2 A; 1N5Q A; 1DAX A; 4DR3 F; 5T7L A; 1OWX A; 3SYZ A; 3OTC A; 2NCK L; 2CG4 A; 3ZZU A; 5K20 B; 3DLB A; 4MKY A; 2ZDP A; 3QT8 A; 2GQ2 A; 2B5J A; 3OL8 A; 1XNQ J; 3PG9 A; 3C6U A; 2QLJ B; 2KZM A; 4OYA A; 1TL3 B; 3MED A; 2GJI A; 4HDH A; 4X64 J; 2NYH A; 4Y2M A; 5K5M A; 2GGP A; 5E7O B; 2NXN A; 1RAA B; 1WEZ A; 4OZ3 A; 2UXC F; 3LTO A; 2E44 A; 2ASY A; 5D4L A; 1VGY A; 4TVA B; 2QMX A; 1TL7 A; 3FRY A; 2DO0 A; 4XO0 A; 2HLT A; 2H51 B; 1S6P B; 3GJQ B; 4DV2 F; 2GVD B; 3FEX B; 4P2S A; 1MRO B; 2VG5 B; 2FUG 9; 3SCJ E; 4DR6 F; 1HNV A; 1SL2 A; 2E1A A; 1TMJ A; 3MEE B; 2QE5 A; 9ATC B; 2MZT A; 2M0G B; 2W9C A; 2R7V A; 2VON A; 2QYG A; 1YBU A; 2IJR A; 1YRU A; 2IC3 B; 3M2V B; 1RT6 A; 4C98 A; 4QR0 A; 2JRS A; 3T1H F; 3AQO A; 1J5E F; 2HHT A; 3OR2 B; 2Y1I A; 1R27 B; 3W5Z A; 1FNM A; 1MG7 A; 1RJJ A; 2KN4 A; 2R7O A; 1YHQ S; 2JLG A; 2GO8 A; 1DZ5 A; 3QT5 A; 2ZHA A; 2HVI A; 2OEK A; 2WVF A; 1FRJ A; 5MLC V; 8RUC A; 2X1B A; 2D69 A; 1ROF A; 3K5M A; 4IFV A; 4YHH J; 3DRY A; 3KG4 A; 4LFC F; 3L4B C; 2P5V A; 4OX8 A; 4R25 A; 2XTJ P; 4UST A; 2P9G A; 1HBN A; 2FY8 A; 1MMD A; 4G65 A; 3N6L A; 2VFU A; 1X9S A; 2QMU B; 1IKX A; 3BBB A; 4P71 A; 3D54 A; 5FLX Y; 4XDC A; 1XQI A; 3P3D A; 2KM8 B; 2W9A A; 1Z2Z A; 3HPO A; 4OI2 A; 2VUG A; 3QMQ A; 3QLH A; 1OPZ A; 2ZVI A; 4ZJL A; 4DPO A; 1ZA2 B; 5DLF A; 4I2P B; 2CPH A; 4X4T A; 4Z37 A; 1HMV B; 1IKY B; 1WSR A; 2FJB B; 5L1I A; 4F67 A; 5F3Z A; 3ZZY A; 4WP8 A; 2V9K A; 3PJX A; 4UOF A; 1CQM A; 3OT9 A; 4O4R A; 1P6T A; 3FNN A; 4NLQ A; 1IBM F; 3HHL A; 4OX9 J; 2XGQ A; 3T3F A; 5C25 A; 1PC4 A; 2F8M A; 4PUO A; 5E3Q A; 1U6B A; 5GMD A; 2E1P A; 4TLR A; 1VQP S; 3TUZ C; 3BKT A; 3OQ2 A; 4R0J A; 2E1M C; 2XZD B; 4P52 A; 2VQE F; 2V68 A; 2CZV C; 2DHG A; 4TQR A; 1K1S A; 4O44 A; 3NGD A; 3RB3 A; 1NUE A; 2HG4 A; 4DV0 F; 3OVA A; 1KVK A; 2HGN A; 4ETZ A; 3KLG B; 4DL2 A; 2HYI B; 3WX8 A; 1UTA A; 2R7R A; 1S6U A; 4ECZ A; 1FE4 A; 1WOR A; 1XIQ A; 1TL3 A; 5CZX A; 4L3K A; 5KG6 A; 2HHQ A; 1GX5 A; 2XYH B; 3K2Y A; 4FXD A; 2CJQ A; 1KFD A; 5B0E A; 2QZ8 A; 1LWX A; 4E98 A; 2GJF A; 2QFI A; 2GVD A; 1MRO A; 4HEA 9; 2VG5 A; 4DXL A; 1F5B A; 2HW3 A; 1LW0 B; 2YNI A; 2JLE A; 1N32 F; 1HW8 A; 3D9B A; 3BB5 A; 2KL8 A; 3CCQ S; 4ECQ A; 2YY3 A; 2RUG A; 4K2J A; 1HR0 F; 2CQ1 A; 2DJW A; 2IC3 A; 5ETK A; 5EN1 A; 4YFU A; 2M52 A; 2XBP A; 1T95 A; 3M2V A; 4FF4 A; 1F9H A; 4FNH A; 2OPQ B; 2HS4 A; 4JI6 F; 4M63 A; 1RT3 B; 3TZZ A; 2XB2 D; 3MMB A; 1RWW B; 1IBL F; 5CCL A; 3OR2 A; 1SUQ B; 4CM0 A; 4B3S J; 2ZDO A; 4K4Z A; 2D3O R; 3MR3 A; 2FHJ A; 5KFV A; 3EGZ A; 2CQ2 A; 1WTF A; 3BV8 A; 1YX2 A; 3Q0A A; 1U47 A; 2HHW A; 3BO4 A; 1NB2 A; 2DIU A; 1GMW D; 5DG9 A; 1FDB A; 3SCI E; 1U2C A; 1DTT A; 3W5X A; 5IXU A; 3M6X A; 4KHP F; 2Y3Y A; 2DR5 A; 4AL5 A; 2NQP A; 4QIW D; 4DPU A; 4X4Q A; 2KDO A; 3J80 Y; 3EJM A; 2DIS A; 1CBK A; 2DGT A; 1I1G A; 4UQT A; 1AFJ A; 1VI7 A; 3NS6 A; 2BKP A; 4USU A; 4OX7 A; 3OFG A; 1WTB A; 2R7X A; 2G2O A; 2DRD A; 2V8P A; 4FNI A; 3CCS S; 4KHR A; 4OHW A; 4QIV A; 1X60 A; 2DRA A; 2A2D A; 3PR4 A; 4WBF A; 4CCH A; 4FS1 A; 2AYE A; 1KQF B; 3CDA A; 1HMV A; 2B6A B; 1IKY A; 3NXZ A; 4PYD A; 4MT1 A; 5DQG A; 1YRT A; 2FC9 A; 4Y2I A; 4TN2 A; 2XWY A; 4IRK A; 4M95 A; 1T9X A; 3AOB A; 1S76 D; 2HFV A; 1UP1 A; 2ZE2 B; 5DS7 A; 3ICL A; 5D77 A; 1N56 A; 2AJ0 A; 5CHC B; 2ZM6 F; 4DV3 J; 5LXR A; 1UET A; 3CED A; 3MCN A; 4OV1 A; 1RWN B; 1TEL A; 1NPR A; 4EO8 A; 3PW0 A; 2DPI A; 1GNK A; 4ZCM A; 1Z2L A; 1S7H A; 1V3S A; 2XZT B; 2GMH A; 1QUP A; 4OI3 A; 2JEI A; 3QFW A; 1BE4 A; 1RIS A; 4QYZ J; 2LEP A; 3KLG A; 2VBX A; 3MPY A; 3HZE A; 1N33 J; 4PWU A; 4DCP B; 1L3S A; 3GCW P; 4CDI A; 4OJG A; 1Y00 A; 3T1Y F; 2ROG A; 3RRK A; 3ETM A; 5EUH A; 1GK8 A; 2J8A A; 1OS5 A; 2HLU A; 2HFZ A; 3CD5 A; 2CPI A; 4FPI A; 1NK5 A; 4B9N A; 1JIH A; 2HHU A; 1LW0 A; 1UVI A; 3G6X A; 4ILL A; 3OHB A; 5J2Q B; 4DUT A; 3KHL A; 2V94 A; 2C2O B; 4DR5 F; 1DJ0 A; 2Z30 B; 2CNK B; 1TP7 A; 4CO0 A; 2BR0 A; 4NA2 A; 2W7O A; 2OPQ A; 4Z7C A; 2FJA B; 2C2E A; 4B3T J; 3I0R B; 1ZM9 A; 2X51 A; 1AT1 B; 1SUQ A; 1U1Q A; 3OSN A; 4DCJ B; 1ZAX A; 1VK3 A; 4X4S A; 3UDL A; 3VWS A; 3C19 A; 4WCE Q; 3JSY A; 3DRR B; 1QTN B; 5KFY A; 2AX1 A; 2K06 A; 3WC0 A; 1RBL A; 3DDN A; 2Y8Y A; 5A8K B; 3PKM A; 3DHW C; 4JI5 J; 4ID8 A; 4DQP A; 3M9N B; 5ETO A; 5CXT A; 2ALY B; 2MY8 A; 4BCA A; 4B9U A; 4ZVG A; 2COL A; 4OI6 A; 4QPT A; 2BE9 B; 5KOX A; 3W3S A; 4C3M A; 4KSE B; 2XLK A; 3Q8U A; 2UV8 G; 4IUF A; 3J7Z T; 1S6Q B; 3G82 A; 1NK6 A; 2AJ1 A; 1GMU A; 1VMB A; 2V9W A; 2J7K A; 1TK5 A; 4RNN A; 5GAD I; 3P8B B; 1OY6 A; 4CO1 A; 1KEK A; 3H98 A; 2H4W B; 5HVG A; 3GLJ A; 3QRQ A; 2DTJ A; 3ILJ A; 2Z8Q A; 3HVT B; 4KPC A; 1FX4 A; 4ZVU B; 3V6D B; 2B6A A; 2ZH9 A; 5LOQ A; 2HGL A; 3DOM B; 3MPU B; 5SZT A; 2PA3 A; 5DZ6 A; 4LIR A; 1FA0 A; 3QAU A; 1B99 A; 4DS5 A; 4C0H A; 2DT9 A; 1UL3 A; 4NML A; 1ZA1 B; 2ZE2 A; 4TU9 A; 1RHQ B; 2BJD A; 4IDK A; 4MYU A; 4FVC A; 2JVR A; 2R8G A; 1OSC A; 1Q16 B; 4MAK A; 5SUH A; 2A6M A; 4B9L A; 2MQ8 A; 4MH8 A; 1VIX A; 2DXD A; 3LAM A; 4EZ9 A; 2ZEJ A; 4RW8 B; 1NKB A; 5D0G A; 4DL3 A; 4DV6 F; 1Z4U A; 1VC6 A; 2CWX A; 2CQ4 A; 2FD2 A; 1CQN A; 4WYL A; 1V9O A; 4XPE A; 2YKQ A; 1FI4 A; 3W8P A; 2VDI A; 1F9F A; 4IRD A; 3PIP Q; 1NPK A; 1R6V A; 1RLD A; 3C15 B; 2IM2 A; 1PIE A; 1HAR A; 2NPI A; 3GSI A; 2HHS A; 1SJQ A; 1WC3 A; 4FXV A; 4OZN A; 3BDP A; 3H2U B; 3TAN A; 3SBM A; 5HMZ A; 2GQC A; 4RW9 B; 4USV A; 3ZNJ 1; 4NCA A; 4MKA A; 3O2I A; 4J91 A; 4URQ U; 2Q6B A; 2H4Y B; 5J2Q A; 1VQ4 S; 3MM9 A; 2Y9H A; 4N56 A; 2IYI A; 4C8L A; 1VC0 A; 1KOH A; 1ICE B; 2RIL A; 3IAM 9; 2EC2 A; 2AZ1 A; 3IXQ A; 1NK9 A; 3R2C J; 3I0R A; 4RW4 B; 1IVZ A; 2J7U A; 3E2E A; 2J0Q D; 1FDD A; 3J7Y I; 2W24 A; 2G9O A; 3ZZP A; 1BQM B; 3DRR A; 1REG X; 1U6F A; 4NA1 A; 2Y0B B; 4OHX A; 1R8C A; 3R5D A; 5A8K A; 4LQ9 A; 3PRB A; 1FO1 A; 1C1C B; 5GAE I; 4P10 A; 4EUV A; 4UZB A; 3T5K A; 3Q8Q B; 2B4P A; 4CNY A; 3O5T B; 4JV5 J; 3T41 A; 3JS9 A; 3D6T B; 2MKJ A; 2CWK A; 4UZC A; 4U9R A; 3BGU A; 1ZAW A; 4X4O A; 3TAP A; 3W1Y C; 2C3M A; 4CWB A; 4DR2 J; 1W25 A; 1RI7 A; 3BGO P; 3DLK B; 2KXF A; 1OYD A; 2CQG A; 3M8S A; 3RB0 A; 3KWM A; 4RNM A; 2W2P P; 3DKD A; 4I64 A; 3CJT A; 3I4P A; 4WPA A; 3R27 A; 4K0K F; 1U8W A; 3T6J A; 5BJR A; 3V6D A; 1CUL B; 2XLJ A; 3RB4 A; 3OTO F; 3UD3 P; 2POK A; 2CJ9 A; 2KYX A; 3K5N A; 2WHO A; 1B64 A; 2OGU A; 1X4A A; 2EFN A; 3PEH A; 3D2W A; 2BE2 B; 1IKW B; 2HQG A; 1RT1 B; 2XMU A; 3RBD A; 1Q7L B; 1R7I A; 4P6Q A; 2FVR A; 4ILR A; 1IKV B; 3UCU P; 1VQK S; 1ELO A; 3MCS A; 2NUU G; 2R8K A; 1REV B; 4IOB A; 1EQM A; 3PHE A; 1DQ9 A; 2GAH C; 3A1Y G; 4ZCK A; 2KU7 A; 4GVB B; 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2D74 B; 2MHE A; 1KLN A; 2CFX A; 1LEO A; 2OPS B; 2VU5 A; 2O66 A; 4NLV A; 3ELH A; 1C0U B; 1NCL A; 1NHK L; 2E5I A; 4DEZ A; 3T19 A; 4Y65 A; 2BE2 A; 3M8R A; 1IKW A; 3KTQ A; 2MQO A; 3K5P A; 1TKX B; 2QL7 B; 3A8K A; 3SI8 A; 2FJW A; 4RW6 B; 3PY8 A; 4G1P A; 1T94 A; 1U2R A; 2QO3 A; 2ZJR Q; 3CUN A; 5H1S V; 1CLF A; 1IKV A; 3EDQ B; 2E7W A; 1DHM A; 1REV A; 2IJN A; 2ACY A; 1MW7 A; 3QO9 B; 1SPB P; 5A0Y B; 3GU0 A; 2RKI B; 5D6G A; 2D3U A; 2UXD J; 3GPA A; 7AT1 B; 1U2F A; 1JLF B; 1NDL A; 1XBW A; 1QUV A; 1K9M T; 4OZ2 A; 5M2P A; 5KG1 A; 1M5P C; 4YR2 A; 2QX0 A; 3ZZR A; 5CCM A; 4RKU C; 1WNE A; 1T9T A; 3AXM A; 5KFZ A; 4O3P A; 2LDI A; 1Q53 A; 3HX9 A; 4Y0F A; 3N4W A; 4M5L A; 3FSI A; 3FBE A; 2FZG B; 5DZ7 A; 3BO2 A; 4LF4 F; 4IFY A; 3W2W B; 1XMO F; 2B0G A; 3AH6 A; 1RZM A; 5KFA A; 2N4C A; 3TAM A; 4ILM A; 2RAQ A; 3QT7 A; 5DQI A; 1R0A A; 1S59 A; 4ZLJ A; 4DUZ J; 3KK1 B; 4D3G A; 4WZM A; 5KFQ A; 2PI5 A; 2XNR A; 3D0H E; 2DPJ A; 3MEG A; 3FC9 A; 5H9F K; 1XER A; 2ZKU A; 4QBU A; 2C2K B; 5D3G A; 5KG7 A; 2PI4 A; 1S12 A; 4DX8 H; 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