The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
CASPASE-3 SUBUNIT P17
|
| publication title |
In Silico Identification and Crystal Structure Validation of Caspase-3 Inhibitors without a P1 Aspartic Acid Moiety.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2010-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KJF B; 1PYO B; 4ZVO B; 2CJX B; 1RWW B; 1RWN B; 1PAU B; 4DCJ B; 5K20 B; 2XYP B; 5IC6 B; 1RHJ B; 3NS7 B; 1BMQ B; 1RHM B; 2FQQ B; 2C2K B; 2XYG B; 2H4W B; 4ZVP B; 2C2M B; 5IC4 B; 1RWP B; 2C1E B; 2H54 B; 2CJY B; 3QNW B; 4DCP B; 3R7B B; 2C2O B; 1RWO B; 3EDQ B; 1SC4 B; 4JB8 B; 3RJM B; 1RE1 B; 3D6H B; 2HBZ B; 2H5J B; 3D6F B; 3IBC B; 4ZVS B; 2HBQ B; 2QLF B; 3EDR B; 3GJS B; 2H5I B; 3KJQ B; 2HBR B; 1I51 B; 1RHK B; 2CNK B; 2XZD B; 4ZVU B; 3GJT B; 2Y0B B; 3P4U B; 2H51 B; 2QL5 B; 2QL7 B; 3D6M B; 2HBY B; 4ZVQ B; 1F9E B; 2DKO B; 1RHU B; 2CNO B; 1SC1 B; 2QLB B; 2CNN B; 3P45 B; 2H65 B; 3IBF B; 2CDR B; 2C2Z B; 3GJR B; 2Y1L B; 3R6L B; 1GFW B; 2H48 B; 3SIP B; 2XYH B; 2P2C B; 2H4Y B; 3R7S B; 1RWK B; 4ZVR B; 1RHR B; 2QLJ B; 1SC3 B; 1NME B; 1RWV B; 3R5J B; 1QTN B; 1RHQ B; 4ZVT B; 2XZT B; 3KJN B; 1I3O B; 1ICE B; 2CNL B; 3GJQ B; 3R6G B; 3R7N B; 1IBC B; 4DCO B; 2QL9 B; 1QDU B; 1RWM B; 1RWX B; 4LSZ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1R0A A; 2UP1 A; 4M95 A; 1JK9 B; 3CO9 A; 1NDK A; 3R9L A; 1M1K T; 4E98 A; 3W5Y A; 4RW6 A; 1EX8 A; 4LF6 J; 3SEO A; 3BKF A; 3OL8 A; 4NLP A; 1HBN A; 5GMD A; 1QUP A; 3M30 B; 5E2Q A; 2XHW A; 3BGL A; 2H1Y A; 2PSZ A; 4ZJO A; 1NK0 A; 4NML A; 3PHE A; 3V6H A; 1RT1 B; 3MAQ A; 4CYU A; 4PWW A; 1S77 D; 4TQS A; 3U02 A; 2IM1 A; 1D8Y A; 3POT A; 1FO1 A; 2V8H A; 5IT4 A; 2CZV C; 1VQL S; 2RML A; 2K3K A; 5HAT A; 3KHH A; 1VYA A; 2ZH4 A; 5KOW A; 1DQ8 A; 3F73 A; 1IBK F; 1S12 A; 1SV5 A; 4LFA J; 2YWE A; 5F8H A; 2XLI A; 1QM9 A; 2KVQ E; 3AD8 C; 4YUD A; 2AQ4 A; 2JEF A; 4YB1 P; 3OR2 A; 4IYQ A; 2XWY A; 3TVK A; 1Y9O A; 3P49 B; 1NB2 A; 5U47 A; 5J2P A; 1U0S A; 2GMJ A; 3DOM B; 4RW9 B; 3HHL C; 1K1S A; 4LRB A; 1NSK L; 4MMO A; 2KT3 A; 1U02 A; 1RSC A; 1MMN A; 2FHJ D; 2FGO A; 5HBM A; 1OQ6 A; 4U7C A; 3MD1 A; 3DLK A; 2AEF A; 4NA1 A; 1O6X A; 2PE8 A; 1PBU A; 2G4B A; 2IA6 A; 2EPI A; 1UKU A; 1RAE B; 2HBR B; 2RB7 A; 1V5I B; 3TO8 A; 2FPH X; 3KHG A; 5DLF A; 3KHL A; 4OHY A; 1MU2 B; 8AT1 B; 1WC3 A; 1AFI A; 1S48 A; 1U45 A; 4FPR A; 3M6X A; 1OYE A; 4ZVE A; 5I42 B; 3D0H E; 1Q79 A; 4ECQ A; 2CQ0 A; 2AZ1 A; 3J80 Y; 1NRK A; 4ZVT B; 4OYO A; 3UPF A; 1N34 J; 4IH6 A; 2DTJ A; 1KRP A; 1U09 A; 1HHQ A; 5LT5 A; 4H4K C; 4F36 A; 3BGR B; 1RWW B; 3NG8 A; 1M1H A; 4P6Q A; 1YX2 A; 1R3N A; 1H0H B; 4QZV B; 4EEY A; 1IKX A; 4ZCL A; 3DRS A; 4OI1 A; 2Q1L A; 8ATC B; 3KTQ A; 3SYZ A; 1WG1 A; 3SQG A; 3UO0 A; 1F0X A; 4OHZ A; 4NEY A; 1TL5 A; 3PKY A; 5KG5 A; 3HHD A; 4KAI A; 3CD5 A; 2IJR A; 3G6X A; 4C48 A; 2ZZN A; 3PW0 A; 1QVG R; 4KGK A; 1UCN A; 3H2L A; 2CNN B; 3FSX A; 4FBT A; 4TY8 A; 2C3P A; 3NXZ A; 3EZ5 A; 2IM2 A; 4HAC B; 1S4E A; 4DQI A; 4XIU A; 2Y9H A; 2H3E B; 3JSM B; 3W64 A; 3UCZ P; 3RRK A; 2Y0S D; 2EFQ A; 1RWV B; 2QA4 S; 1U6F A; 1BUX A; 3QT8 A; 2YX4 A; 1ZM2 A; 5ADZ A; 4DQQ A; 3J81 Y; 1Y3J A; 4ZIT A; 2RF2 A; 2CJX B; 2BKO A; 3DOL A; 2B6A A; 2B4P A; 3U1L A; 5JMN A; 2FIU A; 3KYL A; 2FUG 9; 2A6M A; 3THP A; 1C4A A; 3BS9 A; 1U2R A; 3CO0 P; 5GAE U; 3BSN A; 2H5J B; 1C0T A; 2DYA A; 3ILJ A; 1FTC A; 4DR2 J; 5HRO A; 3CVK A; 1X4D A; 3LGH A; 2VBZ A; 3BPD A; 3LA0 A; 2WON B; 4ZPC A; 1SL2 A; 4IO9 Q; 4ELT A; 2XCA A; 5HI7 A; 2DNN A; 4JI6 F; 2ATL A; 2PC6 A; 1DBD A; 4F4X A; 1WF2 A; 1U2F A; 1N8R T; 3BGO P; 3ZTQ A; 3T1H F; 1RZM A; 2JC0 A; 3G82 B; 3RAX A; 1OIA A; 2Y8Y A; 4C3L A; 3U1N A; 1XR7 A; 2W4P A; 2MXY A; 2ASD A; 5IM0 A; 3AOD A; 1DZ5 A; 1XWL A; 1H7W A; 1LWE A; 3GZ7 A; 2N3L A; 4P2F A; 2YNF A; 4FKX A; 1IM6 A; 4P73 A; 3NWG A; 2HZV A; 1DHM A; 5DQH A; 1VRU B; 4ETX A; 3PRB A; 3R5B A; 4NLG A; 2HHP A; 1T05 A; 2YNI A; 2HIQ A; 2MQ8 A; 2CQ3 A; 3KK3 A; 1UA0 A; 4KFB A; 1TL7 B; 1N54 B; 1PSD A; 3W60 A; 1VQ7 S; 1A9N B; 3G4S S; 3GWC A; 4CO4 A; 2D3Z A; 1X9S A; 3KKF A; 5J2Q A; 3CCW A; 1AUD A; 4UY8 5; 5GAG I; 3W9H A; 2YY3 A; 3TJ9 A; 4DHV A; 5DO2 A; 2QLJ B; 5A76 A; 5B0B A; 4PRF A; 2F1F A; 4I0W A; 1S1U B; 2OMO A; 1NHU A; 3VR1 A; 1W2B R; 5DG7 A; 3CJ2 A; 4JI1 F; 1VK8 A; 5M2U A; 1M5P C; 1ZZF A; 4IH5 A; 2B51 A; 3Q86 A; 2C2D A; 3VVT A; 2BR0 A; 3UVJ A; 1WNE A; 1B3T A; 4NLS A; 5ETK A; 4M1K A; 2KJV A; 5EX3 A; 2ZBC A; 4WYW A; 1HIY A; 5D4O A; 5B0D A; 2ROP A; 4LF2 A; 1VQ9 S; 3GFZ A; 3LAK A; 3Q8U A; 4DR1 F; 1RTI B; 1KVI A; 1IBM F; 3DLG A; 1Y3K A; 2GQC A; 3G87 A; 3Q8V A; 2XSJ A; 3I0R A; 2MQQ A; 4C98 A; 1RAC B; 4KHM A; 4DV7 J; 1PBA A; 2R7X A; 2PD1 A; 1OSC A; 4KO0 A; 2MLY A; 3HDS A; 3KFW X; 3KUE A; 5KOX A; 4PXD A; 3BR9 A; 2AYB A; 1WC1 A; 4NPO A; 2VDI A; 1VMB A; 1HA1 A; 3Q2S C; 2ZKU A; 1RXO B; 2VKZ G; 2DCU B; 1SBR A; 4J9V A; 2MZQ A; 4LF8 J; 4PWD A; 1RT7 B; 2WHO A; 2ZJQ Q; 3EXY A; 1IBC B; 4DCO B; 1SH0 A; 4LFB F; 4NI2 B; 3D0I E; 3NS5 A; 3FZB A; 3LAM A; 4ECR A; 1HQE A; 1LV5 A; 4NLV A; 1R8A A; 3L7O A; 2F63 A; 1P9Q C; 1TUV A; 2C28 A; 1BD6 A; 3MCN A; 2ZVS A; 1YG0 A; 2B3T B; 3WIV A; 3W2W B; 1I94 J; 1PCA A; 5CCM A; 2DH8 A; 4L76 A; 3HHK A; 3W9I A; 2EK6 A; 4O4R A; 6FD1 A; 4CNY A; 1U1Q A; 2RQK A; 3BM7 A; 1UMJ A; 1RTH A; 4QCL A; 3UN5 A; 1JLF B; 1SJR A; 1KTV A; 1JLA A; 1FI4 A; 3GIR A; 1Z1Z A; 3DCA A; 3HFK A; 4LR9 A; 4ZVS B; 5SZT A; 5DZ6 A; 2KN4 A; 1TKT B; 3M1V B; 3CCQ S; 3S1T A; 1XEZ A; 1AT1 B; 3A1Y G; 1RK8 A; 1LWC A; 3SDE B; 5B0C A; 4JI3 J; 4HEA 9; 1Q8K A; 5FDL B; 1HMV A; 1CQN A; 2DKO B; 1VDH A; 5AT1 B; 2WBM A; 3O2I A; 3N0V A; 3D2W A; 2KXF A; 2GIR A; 1TMM A; 3VAL A; 2LQ5 A; 1R0A B; 1H38 A; 2JEG A; 1SKU B; 3TUP A; 4K7Q A; 5HAN A; 4RW6 B; 4Y28 C; 3MTK A; 3VWS A; 1HBN B; 4EBE A; 5J1E A; 3HVW A; 2GAG C; 1RKJ A; 3QFH A; 2P6T A; 3HSG A; 2CIM A; 2POK A; 1KP6 A; 4R8U A; 3KUH A; 4ALZ A; 2UUB J; 3TQE A; 2B7B B; 2BQU A; 4CYU B; 4J37 A; 4D3G A; 2CQB A; 3POT B; 4RBV A; 3GV8 B; 3QPI A; 3O6Q A; 4M5J A; 2KT5 A; 3C14 A; 2Y1I A; 2NPI A; 5A8R B; 2LYV A; 1VQ8 S; 5HP1 A; 4NRU A; 1IQZ A; 3ISN D; 3CDB A; 1DLO B; 2OHD A; 1SV5 B; 1NZA A; 4M63 A; 3S6E A; 2KM8 C; 3GYN A; 3T9N A; 1J2V A; 3PCO B; 4A8F A; 5I3P A; 2J6U A; 1P1L A; 1NSQ A; 2K1R A; 3ENA A; 3OR2 B; 4KE5 A; 3A12 A; 3ILL A; 1CLF A; 3A8K A; 5J2P B; 1IN0 A; 2K3I A; 4ZOS A; 1Q7L B; 4FBU A; 4PXE A; 3HZG A; 1MSW D; 1R0C B; 2IVF B; 3IR7 B; 1CVJ A; 3K7R A; 1CUL A; 1B64 A; 2AGQ A; 5AJ3 F; 5HBM B; 2AW0 A; 3FSY A; 3DLK B; 5FII A; 4EYH B; 4RBU A; 1KVJ A; 4ED3 A; 4B9T A; 4IG0 A; 1N0V C; 1GT8 A; 2C2M B; 5HQL A; 1IVZ A; 1HBO A; 3AQP A; 1O5J A; 3I82 A; 2CVE A; 3SCJ E; 3VGU A; 5AXN A; 2JH3 A; 3V4I B; 2XS7 A; 2HBZ B; 4I1T A; 3VGS A; 2DHG A; 5EWE A; 4YHH J; 1FX4 A; 4N77 A; 2HFV A; 1RU1 A; 4CT9 A; 2W7A A; 5C24 A; 1H98 A; 2JL9 A; 2CQG A; 4B9N A; 3HM9 A; 1YLX A; 2F3J A; 4ED8 A; 2VFU A; 3J7Y U; 3WC0 A; 4DEZ A; 3DN9 A; 2DRA A; 2B9E A; 3PW4 A; 4WTY A; 2OGU A; 5A6P A; 3SIP B; 2P2C B; 2MGZ A; 4C8Z A; 2R7U A; 1X4C A; 5L38 A; 1HYS A; 4EGL A; 1IKX B; 3R6G B; 3IA0 A; 3DRS B; 3OPK A; 2GQQ A; 1NKB A; 1BY9 A; 3UDC A; 2QE5 A; 3SQG B; 2BXJ A; 3BPS P; 2DK2 A; 2MZR A; 3GV5 B; 4USV A; 2CZ4 A; 2W1B A; 5EDW A; 3EVO A; 4K50 A; 4ZPA A; 2ASL A; 4RL1 A; 2AV5 A; 5A2Q U; 3CDE A; 2CPH A; 1YJN S; 4FNI A; 3Q2T C; 3FSI A; 3HVT A; 2JOQ A; 4TY8 B; 2VON A; 3PNI A; 1NK7 A; 4B3O A; 3I9Z A; 3E51 A; 1S76 D; 2L48 A; 4ERD A; 2Z56 B; 3IR6 B; 1HKA A; 3TX0 A; 4MK7 A; 3SQO P; 4YFU A; 1FJG F; 1LK5 A; 2AP6 A; 5HQ8 A; 2CNO B; 2QIF A; 4ZPD A; 4H4M A; 1VR6 A; 3C16 A; 3H0P A; 4TU9 A; 2J7K A; 1JXL A; 1ZPV A; 4WXO A; 4NLO A; 1OYD A; 2KFY A; 2V4J A; 3IGV A; 2RF2 B; 3DOL B; 3KJV A; 2B6A B; 4N8N A; 4NAS A; 1WSR A; 3DDN A; 3HMJ G; 2G1D A; 4B9S A; 1QSS A; 3D1O A; 1FRI A; 2HHX A; 2YKN A; 4FP9 A; 5IXU A; 5CYM A; 2FD2 A; 1OY6 A; 5KG2 A; 1U1M A; 2HNZ A; 2DEJ A; 2ZJP Q; 1C0T B; 2J0Q D; 3GYG A; 2QYG A; 3CUN A; 1VIO A; 3SCK E; 4NX9 A; 1OMS A; 5HRO B; 4YS2 A; 2R7O A; 2OML A; 1YSJ A; 4DPY A; 3QQC D; 2BE2 A; 2U2F A; 2VAS A; 1FX2 A; 4Y2C A; 5KFK A; 5HVH A; 3PAC A; 4NA3 A; 3LTO A; 1QTM A; 1KQG B; 1MML A; 4NLR A; 4XAK A; 3MPD A; 1RCX B; 3OR1 A; 4OX6 A; 4B3M F; 4ZVU B; 2HVZ A; 2P8I A; 4F3M A; 3MFH A; 3SSR A; 5BR8 J; 3LGM A; 4A8Y A; 3C6T A; 1SIZ A; 2XO6 A; 2YTC A; 1N48 A; 3FMW A; 5LSR A; 1RT4 A; 1VQO S; 2I0X A; 5IM0 B; 4USI A; 4UQT A; 1ZYQ A; 4JOU A; 2H4Y B; 3VAJ A; 1FCA A; 4B9L A; 1RHR B; 1LWE B; 4WII A; 4B17 A; 1NK5 A; 2YNF B; 4DN0 A; 1R31 A; 2CNL B; 4ZLJ A; 5C42 A; 4NLX A; 3ET6 A; 1TVR B; 3JQM A; 5DDQ C; 2R7V A; 1JLG A; 3DGV A; 1MWY A; 1VHF A; 1RT6 A; 4P52 A; 1WF0 A; 4ZJL A; 2G0C A; 4C97 A; 2W01 A; 2VDH A; 2Z0G A; 1T05 B; 2QLW A; 2YNI B; 4YB5 A; 3KK3 B; 1UET A; 4KFB B; 4OL8 A; 3FVY A; 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1QAY A; 2CPX A; 5KFA A; 1N5V A; 4DS4 A; 1ZAW A; 2RQM A; 3BN7 A; 2ERR A; 1WDT A; 4OZ1 A; 1S9G B; 4C0H A; 5ETO A; 1UVK A; 4BC7 A; 3HLU A; 1RTH B; 4F4Z A; 2BW2 A; 1JLA B; 3X3U A; 1FT8 A; 5E3P A; 3I9V 9; 3OXL A; 1RAF B; 1P9Y A; 1KON A; 2F9D A; 3H7H B; 4WK3 A; 1LWC B; 4M8L A; 1XK8 A; 1HMV B; 1BQM A; 1RWP B; 1CQM A; 2DXF A; 4HTI A; 1LOU A; 1SJ4 P; 2XO7 A; 4EU0 A; 3QZ8 A; 2HGM A; 3LP0 A; 4NCB A; 3EM1 A; 2DR5 A; 3D3B J; 2LCW A; 3AA9 A; 5GAG U; 1B0V A; 1RB0 A; 5DRK A; 1T9X A; 2LXU A; 4JI7 J; 2WVC A; 1SC1 B; 1XNQ F; 3CJ8 A; 1F1B B; 4OJ3 A; 4U67 Q; 2O5D A; 4K5S A; 5D0R A; 4XPE A; 3MPW A; 5LSL A; 4RUB A; 4R8U B; 4DWI A; 3NBP A; 2G0I A; 3ZZR A; 3SI8 A; 1T3O A; 2L41 A; 1OWX A; 1IXK A; 2MKY A; 3IG1 A; 3TAR A; 1L5U A; 2G2Z A; 4KT0 C; 2QL9 B; 4C11 A; 2Z2L A; 1HHT P; 2BRL A; 2MKH A; 3C14 B; 4K4U A; 5HP1 B; 3A3O B; 4HH1 A; 4KGV B; 2MKK A; 2C2K B; 4HHH A; 2F8H A; 3T5K A; 3PYG A; 4MKV A; 2UZA A; 1SKS A; 3JAM U; 1FD2 A; 4JB8 B; 1M5V C; 3W1Y C; 4Q2L A; 2IHR 1; 2MJN A; 3SV3 A; 3EDR B; 2QA4 G; 3NGU A; 4NLU A; 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