The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYHHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Caspase-3 subunit p17
|
| publication title |
Molecular insight into the role of the leucine residue on the L2 loop in the catalytic activity of caspases 3 and 7
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
|
| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2012-01-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CJY B; 5IC4 B; 1RHM B; 1RE1 B; 1BMQ B; 1F9E B; 1I51 B; 1RWX B; 2C2Z B; 2DKO B; 1RWO B; 1QTN B; 3SIP B; 4ZVR B; 3D6F B; 4DCJ B; 3D6H B; 2XYG B; 1PYO B; 3IBC B; 1RWV B; 3GJS B; 1ICE B; 2QLF B; 1NME B; 4ZVU B; 3KJN B; 1RWM B; 2QLB B; 2XZD B; 2H54 B; 4ZVO B; 1IBC B; 3EDQ B; 2XYP B; 2C1E B; 2Y0B B; 1RWN B; 2QL7 B; 4LSZ B; 4DCP B; 2C2O B; 3P45 B; 3D6M B; 3R7N B; 3R7S B; 2H5J B; 2CNN B; 1RWW B; 2CNO B; 2H5I B; 2C2M B; 2HBQ B; 2XZT B; 4ZVT B; 3R6G B; 2CNL B; 1RHQ B; 3GJR B; 1RWK B; 3GJQ B; 1QDU B; 3R7B B; 5IC6 B; 1I3O B; 3IBF B; 3KJQ B; 1SC4 B; 3P4U B; 4DCO B; 2FQQ B; 1SC3 B; 2H48 B; 1RHK B; 3QNW B; 3NS7 B; 3EDR B; 2XYH B; 5K20 B; 1PAU B; 2H4W B; 1SC1 B; 3GJT B; 2HBY B; 2QL5 B; 3KJF B; 4ZVQ B; 2CJX B; 1RHJ B; 2CNK B; 2H65 B; 2HBR B; 1RHU B; 3RJM B; 2C2K B; 1GFW B; 2HBZ B; 2QL9 B; 3R6L B; 4JB8 B; 4ZVS B; 2CDR B; 2Y1L B; 3R5J B; 4ZVP B; 2H51 B; 2QLJ B; 2P2C B; 1RHR B; 2H4Y B; 1RWP B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JYA J; 2NXJ A; 3MTJ A; 5L38 A; 1RP5 A; 2IPO B; 1JLA B; 2LXU A; 4BC9 A; 4B02 A; 2UXD F; 4KAI A; 5CYQ B; 2D3Z A; 3LPY A; 1UWB A; 3QSY B; 2FYX A; 4FXD A; 4DL0 C; 4BBY A; 2YKN A; 4Q2L A; 2W8K A; 2Q1L A; 1RKJ A; 4IUF A; 4I7F B; 1WTF A; 4CO5 A; 1K8A T; 2DHG A; 3U1N A; 2E1P A; 1U1L A; 5CXT A; 2PE8 A; 1SJQ A; 3HK2 A; 1TV6 B; 1EET A; 1IKY B; 1U2C A; 2PA8 D; 3TAR A; 3DU5 A; 3B8H A; 2UXB J; 1TL1 A; 1C4A A; 2HBQ B; 1FKA F; 2MQ8 A; 2B4V A; 4YN3 B; 2O5D A; 4J9L A; 3RB3 A; 1YIT S; 4F2R A; 2KT5 A; 1S48 A; 4RW6 A; 4BC7 A; 4KRW A; 3T5J A; 1LV5 A; 4KHR A; 2GQQ A; 5HLF B; 2YNG A; 5EX0 A; 2BE9 B; 5ETM A; 5HJX A; 1RWP B; 1SJR A; 1FKP A; 1Y11 A; 2CQI A; 2DNR A; 2CAD A; 3ET6 B; 3KG0 A; 1IJE B; 3CC7 S; 1PC5 A; 2BQR A; 4JI2 J; 3D6F B; 1SIW B; 3IWL A; 3RRK A; 5BJR A; 3KLE A; 3TZY A; 5C24 B; 3HHN B; 5D77 A; 5CZV A; 1RTI A; 3NGK A; 4LRE A; 3NAH A; 1JLE B; 2XYP B; 6FDR A; 4NCA A; 3B78 A; 2XWY A; 3BR8 A; 5DGB A; 1SL2 A; 2KDO A; 3RAQ A; 3PEJ A; 3Q0A A; 4KQZ A; 2VPX B; 3AFG A; 1C1C B; 4DDF A; 4J9O A; 2HWT A; 3QIP B; 1RTJ B; 4U9R A; 3DOK B; 4MFB A; 4AUK A; 4W98 A; 4C0H A; 5J1N A; 1UW4 A; 5J2Q B; 5AXM A; 2UUC F; 4LFA J; 4UST A; 3MCS A; 3HD2 A; 3TO8 A; 4CT9 A; 4NCG A; 9ATC B; 3GJT B; 2CJB A; 3Q24 A; 3PEH A; 1AZS A; 3DDI A; 5T7L A; 4LF1 A; 2HAI A; 2FJE B; 2IIH A; 4RNO A; 2VDI A; 4OZL A; 2CVE A; 1JJ2 R; 4Y6I A; 3AH6 A; 1ZAW A; 4UUW A; 2Z4P A; 3ZTP A; 4AXI A; 3ILO A; 3KHL A; 2PEB A; 5ETP A; 4F3O A; 1PSD A; 3HM9 A; 3TQ1 A; 3GWC A; 2XLI A; 5KFK A; 3T9Z A; 1LEO A; 2Z30 B; 4HDH A; 2UZA A; 2NQP A; 3CIM A; 3RGI A; 2VON A; 3PAC A; 2FHO B; 1UFL A; 2C2O B; 1N34 F; 2DNM A; 4EK2 A; 4DV5 F; 1WSR A; 2V8P A; 2MKH A; 2ZHB A; 6FD1 A; 4IR1 A; 5EX3 A; 3OSP A; 2HVD A; 4DL5 A; 1KD1 T; 4ECR A; 4J5O A; 3H0P A; 3TAQ A; 3IAM 9; 4B9T A; 5GMK a; 2G13 A; 2K7K A; 2KG1 A; 4XO0 A; 2ZZN A; 2KO1 A; 4ED5 A; 1K0T A; 2ZH1 A; 1KQF B; 1I5O B; 3IR6 B; 1UWB B; 5EUH A; 4M5I A; 3MEG A; 4JI3 F; 2YKN B; 5KT4 A; 3O2I A; 2AEJ A; 4NLU A; 5IT4 A; 1RBL A; 4JI7 J; 2AJ4 A; 5IC4 B; 3KLH A; 3DRP A; 2LQ8 A; 1RE1 B; 3HZG A; 2ZC3 A; 1LK7 A; 1JIH A; 3AXM A; 1NPR A; 2GCF A; 2DO0 A; 1EET B; 4LT6 A; 2BE2 A; 3BSC A; 2DD8 S; 4MYU A; 1EB0 A; 2ASL A; 3JB9 k; 3HHD A; 3NCQ A; 2JEG A; 5GAH U; 4LFB F; 3DI6 A; 3B82 A; 4RW6 B; 4HKQ A; 1VQ9 S; 2DY1 A; 3TVY A; 4UOC A; 1RIS A; 3GON A; 2CQ4 A; 5GAH I; 2W8L A; 3N5B A; 2CNO B; 2AMC B; 1I1G A; 4TYB A; 1U1O A; 2YNG B; 4DMZ A; 1PC4 A; 4LBH A; 1FKP B; 3NCR A; 3ENA A; 4QU6 A; 1BXN A; 4ZKA A; 3SQO P; 3FBB A; 3LP0 A; 2DIU A; 1R6Y A; 4QOT A; 2CQG A; 2VQE J; 3TAM A; 3QID A; 3ZZ0 A; 3N9U C; 3EGW B; 2WVD A; 1RTI B; 4EWT A; 3N6M A; 1VQO S; 2WHO A; 4PQU A; 4OZ1 A; 4EO6 A; 2E1R A; 2RDI A; 2YBV A; 4CIO A; 3K5N A; 2MZS A; 5FLX Y; 1UL3 A; 3M9M B; 1FJG F; 1Q8B A; 4ZJQ A; 1Q1K A; 3KK3 B; 4F50 A; 1N52 B; 4MFB B; 3FQL A; 1GTE A; 3IBW A; 5KFD A; 3T1Y F; 3OUY A; 1S12 A; 3CT9 A; 2FZC B; 2BV3 A; 3G8Q A; 1Q5Y A; 1J2V A; 3Q8U A; 1GH8 A; 1HMV A; 4NCG B; 3CMQ A; 1YLX A; 4J9R A; 1AZS B; 3OVS A; 5DZ7 A; 2CPX A; 5T7L B; 2BJ8 A; 2RQM A; 5ETV A; 4WXW A; 3PX6 A; 4DSK A; 2UP1 A; 4NZ0 A; 1BC6 A; 4RUC A; 4IOB A; 5B0B A; 2XGP A; 2ZNZ A; 4M8L A; 1N5Y A; 1XER A; 1W2B R; 1WF0 A; 4K2X A; 2AP6 A; 2ROE A; 3SQG A; 4O44 A; 4J9P A; 1BQN A; 2B4O A; 3CWJ A; 1D3W A; 1NCL A; 1S4F A; 4LRF A; 1BMQ B; 3IRX B; 1YHQ S; 3QYY A; 1RWX B; 5ETL A; 2LYV A; 1ELO A; 1IUJ A; 3TAP A; 2B8Q A; 2XS5 A; 1TU0 B; 3S6E A; 5L9X A; 4FDF A; 4LF6 J; 3GYX B; 3UO0 A; 2V2Z A; 1H0H B; 2OO4 A; 2Z0G A; 2CPZ A; 4DR1 J; 3PFE A; 1WDD A; 1S6Q A; 4C3K A; 1FO1 A; 5A8K A; 4DBQ A; 1NK9 A; 2Y0B B; 4K4X A; 3MPV A; 4Y2I A; 3HHL C; 2MEW A; 3DFE A; 3MEG B; 2KXN B; 3VV2 B; 4C48 A; 3D6T B; 1M5O C; 2C2M B; 2QMX A; 4P52 A; 2LA4 A; 1JLG A; 1ZZN A; 1WOO A; 3CD6 S; 3KLH B; 3DRP B; 1QAI A; 3CJS A; 5J2N A; 2RSQ A; 1U1Q A; 4DXL A; 2VG5 A; 2O66 A; 1U0S A; 2BYC A; 2HRY A; 2RB7 A; 3W5Z A; 2BE2 B; 4CO0 A; 2IJN A; 1Q78 A; 2EFV A; 4K4Z A; 1D09 B; 2ZH3 A; 3DI6 B; 1X9S A; 2P9E A; 1RHM B; 3NNC A; 2DO4 A; 3NGS A; 1DUR A; 1FJE B; 2FC9 A; 1EP4 A; 1RWO B; 2NR0 A; 4U7U D; 4J37 A; 2LCW A; 4UW2 A; 4G6V B; 2OD4 A; 4PEO A; 3H90 A; 3C3L A; 2EFN A; 1MN7 A; 1CC7 A; 3BN7 A; 1CVJ A; 1T9X A; 1B0T A; 1L3V A; 2QLB B; 4L3N A; 3ISN D; 3Q8R B; 2OEK A; 1H73 A; 3IGV A; 3BM7 A; 3DRS A; 5L46 A; 3QGG A; 1WTB A; 1KOO A; 3IC1 A; 2QL7 B; 2XUL A; 2HRU A; 2KVI A; 1VK3 A; 4ZS6 A; 3LP0 B; 4CRJ A; 4EU0 A; 2XBP A; 3TAM B; 4WTY A; 5KAK A; 1JLF A; 4GKK F; 2XMT A; 4DL3 A; 3BKF A; 3Q83 A; 1NPK A; 3D7S B; 2Z57 B; 1TMM A; 4EBE A; 1CJT A; 4PQU B; 5LSO A; 4AE5 A; 2H48 B; 1XR7 A; 2IBK A; 4DPO A; 4NLP A; 1XNR F; 4J7C A; 4W4M A; 2D9O A; 3K89 A; 2G0C A; 3H98 A; 3IG1 A; 2LMI A; 3D1O A; 3OUY B; 2EI5 A; 4UY8 5; 2BQ3 A; 3MUV P; 1RT4 A; 1KSP A; 1IWG A; 3VQT A; 2W4D A; 1UJ5 A; 1HMV B; 3T5H A; 1XMQ F; 2J7U A; 4PWU A; 1JJC B; 1FFG B; 3Q22 A; 1P9Q C; 2QZ8 A; 4RWX A; 1S0V A; 4ELU A; 5F8J A; 4AD6 A; 2HHX A; 3TZX A; 3IP0 A; 4FVC A; 1GK8 A; 5D4N A; 3QAU A; 5A2Q Y; 5D4L A; 1FRH A; 3R27 A; 1XTZ A; 3SQG B; 2GQ2 A; 4O44 B; 1NJY A; 2A1B A; 4N8O A; 1NKC A; 1BQN B; 4ECQ A; 3CDA A; 4IH5 A; 3GJQ B; 4RNN A; 2V8H A; 2QFI A; 4Z7Y A; 2Y1R I; 4DN0 A; 4OJH A; 2JX2 A; 3DNC A; 4NLD A; 5A6W A; 4F04 B; 2DRB A; 1JNR B; 1PYS B; 1VLY A; 2CPH A; 1ZTT A; 4IOC Q; 5AXL A; 2KYZ A; 1WEY A; 1O51 A; 2AJQ A; 5CAA A; 5IXU A; 3VAM A; 3NRB A; 5DGA A; 3CJ8 A; 1YJ7 A; 1HLW A; 3QO9 A; 1H98 A; 2CJ9 A; 3CJR A; 2AD9 A; 3IGN A; 4KH1 B; 5KFH A; 1S6Q B; 5A8K B; 1WJ9 A; 1CC8 A; 2MPU A; 2A2D A; 4YB5 A; 4HI2 A; 2J5A A; 5LJ5 Y; 1ITP A; 4NLT A; 3DDK A; 2Z2Z A; 2YH0 A; 4FBT A; 1JLG B; 5K8N A; 1MML A; 3M8S A; 1CUL A; 2N7Y A; 3BYP A; 3IR7 B; 4K0K J; 4JI1 F; 3M05 A; 1TK5 A; 5J2N B; 2YKM A; 4DQQ A; 3OJS A; 2VG5 B; 3P45 B; 2QE5 A; 3J7A 1; 4UQG A; 1FA0 A; 2ZE2 A; 1QE1 A; 3D2W A; 1PKU A; 1X4H A; 4OV1 A; 3MHY A; 3HDS A; 1IBK F; 4B3T F; 4CO1 A; 1VQ7 S; 1RU2 A; 2QT7 A; 3KTQ A; 4Y2M A; 2LXI A; 2PT0 A; 3ZXW A; 1WOP A; 3QGI A; 4DS5 A; 4OX9 F; 1KEK A; 1EQ0 A; 1SJF A; 3R9L A; 4DX6 A; 4DV4 F; 5IWA J; 1GQE A; 2DR6 A; 2QA4 G; 5KFP A; 2G1H A; 2YH1 A; 3ONQ A; 3X3U A; 2DCU B; 4HYK A; 4P2F A; 1HWI A; 3DRS B; 1U1N A; 1FRL A; 2UUA J; 3IWX A; 2ZH4 A; 1B7Y B; 1RSC A; 1U02 A; 3M6W A; 3OBI A; 2RHQ B; 5K8M A; 4F02 A; 1HWJ A; 2EC0 A; 3PO5 A; 1FRI A; 2EG2 A; 2MQO A; 2IFX A; 4JI8 F; 3CVK A; 2P8I A; 2A18 A; 2M2B A; 2PMZ D; 1CJT B; 2YQ0 A; 3JQK A; 4NPO A; 2Y8W A; 2L9W A; 4NOH A; 2OML A; 2QYC A; 2Q6B A; 3A3N B; 5CA5 A; 1KTV A; 2UVW A; 1K1Q A; 5F41 A; 1RAH B; 2UXD J; 1B0V A; 2JHE A; 4WCE Q; 1VQP S; 2LEA A; 5E7O B; 3IG1 B; 2LEP A; 2JJ4 D; 1SC3 B; 3BGF A; 4NEY A; 1UVJ A; 3UQS A; 1RT4 B; 2FZG B; 2AX1 A; 2EVZ A; 2W2Q P; 3K58 A; 2JVR A; 2CZV C; 4WFA Q; 1GNK A; 3QT7 A; 5J1E A; 3R1H A; 4TVA B; 1QSY A; 3SBM A; 5HMW A; 5F3Z A; 5HVG A; 1HBU A; 4Y65 A; 4F0M A; 4LBI A; 1U45 A; 3BSN A; 5HO4 A; 3US5 A; 2X3D A; 4J90 A; 5KFU A; 3KKF A; 3FC9 A; 1VFJ A; 3S01 A; 4GVL A; 1W2I A; 1JMT A; 3R5C A; 1UPM B; 5F8M A; 3KHR A; 3GB0 A; 3SCL E; 2VU5 A; 5DQI A; 4UOF A; 2FJA B; 3ETO A; 4LBP A; 1Q82 T; 4ZK7 M; 2H1Y A; 3RAX A; 1C0U A; 3QJL A; 2AJF E; 4EYI B; 2VPW B; 3KK2 A; 1XMB A; 2FJV A; 1DQ9 A; 3IN5 A; 3EXY A; 4Y2C A; 4C97 A; 4ALZ A; 3LP2 A; 3QZ7 A; 1AYE A; 3LW5 C; 3NXZ A; 2XS2 A; 3LAK A; 3W8P A; 3RW6 A; 3QO9 B; 5HVH A; 1KON A; 1C1B B; 2F63 A; 2CNL B; 2MZJ A; 4FXW A; 1QDU B; 3PR5 B; 5FDL A; 1WI6 A; 3BKU A; 2ZJQ Q; 2B4U A; 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1KQS R; 3MMB A; 3JYT B; 3MOJ B; 2MYF A; 5J1E B; 2RE1 A; 4K7Q A; 2W9C A; 3WHI A; 3JSR A; 3K8V A; 3UCG A; 3FGV A; 1HBU B; 4NYO A; 2ERR A; 4CLS A; 1KHW A; 3T6B A; 2F9J A; 4LFB J; 3NL0 A; 1O5J A; 1MU2 A; 3QT6 A; 3OHA A; 3W9H A; 4R8U A; 4UF4 A; 4L72 B; 3J7Z T; 2H5E A; 1KTQ A; 3ZZY A; 3GMG A; 1C0U B; 4IFY A; 4OHZ A; 1K1S A; 3KK2 B; 1FKO A; 1AFJ A; 2ALY B; 3G86 A; 1QSS A; 5IFM A; 3GII A; 2KHC A; 1HFE L; 3LP2 B; 3UD3 P; 3GV8 B; 3A1Y G; 4KTQ A; 4G1I A; 3FSX A; 1WUU A; 1AUD A; 5FDL B; 1VRQ C; 5AXN A; 2FLO A; 2D3O 1; 4KH0 B; 1ZM4 A; 2M8H A; 5L9N A; 5DM7 Q; 1U6F A; 4WZM A; 3V6J A; 1SH3 A; 2LVW A; 1FEE A; 1EX8 A; 1FJG J; 4DR5 F; 5DET A; 1N5V A; 2HGL A; 1FWK A; 5JMN A; 3OR2 B; 2ZVS A; 4ANC A; 1H74 A; 3CJ2 A; 3T1Y J; 1TKT A; 1GAO A; 3H59 A; 2XI3 A; 2DGV A; 3HJF A; 2RNE A; 1KFD A; 2I0X A; 1AT1 B; 1WNE A; 2Y0S D; 2A6O A; 3M9N B; 3UN5 A; 4KE5 A; 5HSP A; 2XO6 A; 1FDN A; 3MD1 A; 5IV4 A; 4X66 F; 4PG7 A; 1FER A; 3R5B A; 4J9Q A; 2IY5 B; 3M6V A; 1VK8 A; 3TNV A; 3A8K A; 2GS8 A; 1YX2 A; 1WC1 A; 1HNZ J; 1U47 A; 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