1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
1GGGA 1FCKA 2QRYA 4FATA 5DVJA 1OLCA 1B1HA 4BDOA 4F2OA 4GD5A 3IB1A 1LBCA 3PMXA 3FZVA 2FA7A 4G68C 3M3KA 5LOMA 1H76A 4TQUQ 5DTBA 4DXBA 4RY1A 2PX1A 3OD7A 2I49A 3R7XA 3S9LC 5EYFA 4XKNA 4OMBA 4ND9A 2Y7RA 2UVGA 3MZ1A 3N6TA 5CC2A 3HO7A 5DT6A 4HTGA 2NXOA 3FXRA 3IO4A 4GLIA 5FTIA 1USYE 3VE1B 3EPEA 3G3FA 4H0WA 2O1MA 2XXXA 4NF5B 2I4CA 3IJOB 1ZMGA 4NF8A 1MY1A 4OWDA 3C31A 3FJMA 1MQHA 3E3KA 3ZKLA 4RPOA 2XXPA 1PBQA 4ZDMA 2HEUA 2Z8DA 3T9VA 2HZKA 2XHDA 4I8CA 1Y3PA 2ZNUA 2OWTA 3N26A 5JEIA 1Y3QA 1B3FA 4LP2B 2QL3A 1XHYA 2D5WA 3GBAA 1A8FA 3HSTA 4R6KA 1D4NA 2Q2CA 3M8UA 4G77A 1YTVA 3KJ7A 3USDA 2R6GE 1OQGA 2G93A 2HCAA 4KR5A 1NL5A 4OYVA 3QXMA 1B1XA 1H45A 3C33A 4ZEBA 2R71A 4ESWA 4H65A 4GOTA 1P1NA 2GHAA 2DE3A 5TPAB 2ABHA 4JXIA 3OO6A 1B3EA 4F3PA 3FGSA 1M5CA 3FXQA 2QPQA 2V93A 3RUMA 4GRKA 3FATA 3H6TA 3EQ1A 4LQ5A 3KN7A 3PD8A 1OVTA 2DE2A 1VE4A 2UVIA 3K02A 3HN0A 2QS1A 3T93B 1QW0A 4G68B 3TEPA 1SW2A 2M8CA 5H8HB 3CFXA 2H98A 2V3UA 3F11A 4OENA 4GIZA 2HQ0A 3EF7A 3DELB 3TYHA 4FECA 1UIUA 1Y4CA 3ZS6A 3CFLA 1GV8A 2XXIA 1IXHA 4F31B 4GWOA 5BWJA 5JK4A 1ZU0A 4FEDA 4G2ZA 5H8NB 1AIVA 3T9XB 1B3LA 2RC8A 4ZECA 3VLVA 2W7YA 2V84A 5F1QA 3JZJA 3MWBA 4R6HA 1B6HA 2ZNSA 4OQOA 4BDRA 1KWHA 4R9FA 1JEVA 4P11A 3EN3A 3L6GA 4GXAA 5K2XA 3FV1A 2O69A 2E1SA 1N3WA 3K6VA 5CI5A 1PB7A 1NKXA 1XS5A 4RYAA 4R72A 2OCUA 3MC2A 2GH9A 1B7UA 3U8QA 4OFOA 4WEPA 2YPNA 4BDLA 3IOTA 4PFWA 2Q9TA 2H9BA 1FTJA 4JWOA 3MVXA 4PFYA 3G3IA 1ANFA 3MPLA 5TP9B 2I3VA 3MW0A 2XXYA 3S4UA 1EZPA 2DXRA 3SESA 2DE4A 2XD3A 2CMOA 3S9NC 3FVKA 1Y1ZA 4FJPA 4F1VA 4DZ1A 2R9JA 3O6IA 4P0GA 1BP5A 3OO8A 1OMPA 4OFLA 1IXGA 2DXYA 3D4GA 4MFIA 4ISUA 4F22A 4IO5A 1ZIUA 5KZTA 1M5EA 3SEYA 4LATA 3S9MC 3O2AA 1MG1A 3N6UA 3EHTA 3MVZA 4DCYA 2RC9A 3R26A 4NWDA 3BFUA 3HV1A 4F2QA 2V3QA 2QS3A 1CE2A 4KPTA 1UTHA 3DP8A 5M2VA 3LUYA 3V83A 3H03A 1N84A 3UN6A 4LONB 3FJ7A 1B5JA 1QUJA 3ONMA 3RGYA 3OXNA 1ZTYA 1IQ7A 1B32A 2XXWA 3AXFA 3VLUA 4LZ8A 2VD3A 3K0VA 3RLFE 5H8QB 3HCQA 2O6AA 1N7XA 4POXA 1GVCA 3SEWA 5L9OA 3IX1A 1VFDA 3RY3A 3TZAA 1YAEA 1N04A 3I6VA 4EF1A 4GQOA 3HHFA 4R2FA 4O3CA 3K4UA 2I6EA 4HCWA 5L8DA 4R2BA 4EQ7A 4NTLA 1ZBMA 2G29A 4U23A 4F3SA 1D3KA 2B65A 1Y3NA 4NF4B 1LFHA 4WXJA 1WDNA 3PUXE 1USYH 1MXYA 1B5HA 3CSGA 3QIMA 1BKAA 2OJTA 1B4HA 1B51A 3ILUB 2RCAA 2O68A 5TU0A 4M1VA 3I5OA 2DWHA 3QUFA 4H67A 3KFMA 4EQ9A 4DLDA 2HAUA 4E0WA 5ICQA 1NNFA 5AA4A 4HW8A 4DE8A 4H5FA 1AL3A 2XXQA 1O63A 3VV5A 5DEXA 3W15C 2IEEA 3SKPA 4U4SA 2QMWA 1CB6A 3LSLA 5I59B 1I69A 3C34A 3RTFB 2FNCA 1FTMA 1WODA 2QJEA 3IB0A 3H06B 4Z0IA 3T96B 3T22A 4EF2A 3H3GA 4HS7A 3VDFA 1A7LA 3KEIA 4FIMA 4XTCQ 4IGRA 1NFTA 1FTOA 3PGFA 1Q35A 4ZEKA 4IY6A 3O9PA 1Y1MA 4PETA 1TT1A 1Y9UA 3MBPA 1LGBC 5ICTA 1OLAA 2OWSA 4QFOA 4L17A 3Q28A 4X48A 3DP4A 3SERA 1B05A 4XKRA 4QSEA 2AYSA 1TXFA 4F1YA 1P1UA 3PPPA 5I2NA 3O28A 3N94A 1POTA 4N07A 2ESNA 3KOTA 1XT8A 3H6UA 3LBSA 1MM6A 2F36A 1TFDA 1JEUA 2HZLA 1BTJA 3SDFA 1H43A 2DQVA 5I56A 3U92A 1MPBA 4PE5B 3OMBA 2UVJA 4PFUA 3O6GA 4BDMA 3CVGA 3C9HA 4R6YA 2D3IA 5I57B 5CM6A 2XXUA 5I58B 3K01A 4HCYA 1XVXA 2DSFA 5BUUA 3UGWA 1M5FA 2KLFA 2X7PA 4OERA 4F3BA 2GHBA 4WKMA 3IR1A 5DYHA 2F7CA 4QFPA 3S2VA 3B7DA 4IO2A 3V8XB 5H8SA 3KN3A 3TQWA 3TKDA 2E0SA 1MDQA 4LQ2A 2ONSA 4ZZAA 1II5A 3Q29A 4ZS9A 4ZEFA 3OELA 3LSWA 1LFIA 3OO9A 3QUJA 3N5LA 4KQPA 2XX9A 1SI1A 3K6XA 2FYIA 3CG1A 2Y7WA 4AB6A 4NF6B 4FE8A 3FXUA 5KDTB 2VD2A 1NNTA 1SBPA 3TCHA 4YU0A 3RPWA 4KHZE 3Q25A 4YMAA 5K2YA 4EXLA 1LSTA 5I2NB 4ONYA 4LUBA 1Y4TA 4LZ5A 3PPQA 3IAZA 2F97A 4QSDA 4NWCA 5I2KA 4Q0CA 1NH8A 4H5GA 4F18A 1FQFA 1BLFA 1VSOA 1PB9A 2Z8EA 2Q8JA 1IITA 4QSCA 4R73A 2Y84A 3B6WA 4EDPA 4Q5TA 2REGA 5A5XA 2DYXA 1P1OA 2A5TA 1FTLA 3VVFA 1OQHA 2Q88A 3KGCA 5CMMA 3CIJA 3S9EA 2DVCA 3CR9A 3H4ZA 4LVQA 4YKKA 1MY4A 2X7QA 2OBGA 2P2AA 1O7TA 4F3GA 4DCXA 5HM4B 3HPIA 4NF8B 3EHUA 3PD9A 4XIGQ 3IK6B 4MLVA 5ELVA 1MXWA 2VHAA 1WVJA 3LC8A 1NNKA 1SYIA 3VXBA 1JW1A 1DPEA 3U72A 2H25A 1URGA 2UXAA 5ITPA 3H6VA 1A8EA 4JB7A 1B52A 4EQBA 1A40A 3MZ9A 3GBBA 5EHSA 4BDQA 3P7IA 3TTKA 1YCJA 3B6TA 5AA2D 1EH3A 3WAEA 1N3XA 4FAJA 5CBSA 2REJA 4KI0E 5CMBA 4YMBA 2UVHA 1UTBA 3K1PA 5EHMA 2PT2A 4FORA 4H8IA 4DDDA 3PU5A 4KYDA 2CZLA 3PUWE 3ZKKA 3PPOA 4RK9A 2F34A 3U94A 1GTKA 1B7HA 4TLMB 3MP8A 3G3GA 3FD3A 2XX7A 3QAXA 4AQ4A 1MPCA 1S9TA 4M4GA 4OEVA 3G3KA 2I4BA 3RTWB 1MDP1 5DVFA 4ESXA 3EHSA 1JVYA 1B40A 1DOTA 3PUVE 2XXHA 5FHMA 4F19A 1L5TA 4PFTA 3TTMA 3LSFB 4MLQA 4PP0A 1DTGA 1B0HA 3IO6A 3E4RA 2O1LA 4OVJA 1AOVA 4BDNA 3G3JA 3PMWA 3I3VA 2Y7KA 1SYHA 1ATGA 2I58A 1NNPA 1UTBB 5AE4A 1B3GA 2XXTA 2YLNA 2Y7PA 3RT8A 2ZMBA 4C0RA 2A5SA 3FJGA 5AA3A 3SETA 4KD5A 3L6HA 1FW0A 5AA2A 2V25A 4P0IA 1IXCA 4C1UA 4U21A 3SEVA 1O64A 4QHQA 1QKBA 1B4ZA 3TPAA 4F1UA 2F7AA 1IEJA 3ZSFA 1FQCA 3MJNA 2PYYA 1MY2A 3FIRA 3KBRA 3K1NA 2XD2A 3B6QA 1HSEA 2AIXA 4WEDA 2NVUB 3R6UA 4MBPA 1MQGA 2RKMA 1P99A 4YICA 1PB8A 5I84A 4GF8A 1MQIA 1ZJLA 1IIWA 1D9VA 5JTYA 5H8FA 4I1DA 3G7WA 4N13A 3G3HA 2X26A 1XOCA 1P1WA 2GFEA 4YKIA 1RYXA 1QULA 1MY3A 3JYRA 4XKPA 4I62A 3TMGA 1DPPA 2O7UA 1UTHB 5FTHA 3VVDA 3OSQA 1B0LA 3FVOA 1GR2A 2NUVA 1DMBA 4MF3A 1N7WA 4IY5A 5CBRA 3CI8A 4ZE9A 3OO7A 4O3AA 4XXUA 1MY0A 1SQYA 2XXRA 3T66A 5HPQA 3RN8A 3UA8A 1SDXA 4PQJA 3A3UA 2O51A 3K6WA 4ELRA 4KFQA 2H4IA 4QFNA 2ONRA 1D9YA 1MH4A 4GL8A 4DXCA 4ECFA 1EU8A 3BBRA 1SD3A 1MXUA 2DS9A 1BIYA 4E0XA 4NF5A 5L9MA 3KN8A 2PMSA 3A3CA 2P0SA 2F8DA 4U1OA 3MP6A 1OVBA 2I48A 1SW1A 3FV2A 1MS7A 5ITOA 3K1MA 2PBWA 2VGQA 2DWJA 3JV9A 4MH5A 3MVWA 1AH5A 3O29A 1LLSA 2GRVA 4UA8A 3ECRA 2DP8A 4OETA 4AB5A 4IGTA 1FQAA 3FASA 5AA4B 3SEXA 1UQWA 1I6QA 4YB7A 4G8MA 1MPDA 1POY1 2LAOA 5DEXB 5TPAA 5FHNA 2DVZA 3MAMA 4Q8RA 1JETA 3W9WA 3KSJA 3HHGA 3TTNA 4R75A 3KOSA 3TUSA 3U1OA 3DLNA 3H7MA 2QS4A 2AL5A 3LR1A 1S50A 4Z7EA 3C32A 3U93A 4FEBA 4G4PA 2OK2A 2ONKE 4ZE8A 2B3FA 2ZYOA 3IORA 4OTEA 3MZBA 1ZKBA 3TELA 4G68A 2DOJA 3PMVA 2UYEA 1LCFA 1MXZA 5H8HA 1J1NA 2QMXA 4IO3A 5KCJA 4GL0A 4TLLB 3Q26A 4R74A 3K6UA 4KCCA 4NE4A 1H44A 3TFLA 4YB6A 3D4CA 3MQ9A 2HXWA 1SW5A 2NWJA 2ZYMA 5H8NA 4JSDA 4YKPA 5F7VA 1IZ1A 3RT6B 1QKAA 1PEBA 3SEUA 1LAGE 4JSOA 3BFTA 3CG3A 4N6PA 3UK4A 5IAIA 1R6ZA 5I56B 1NH7A 1MRPA 3K2DA 2VOZA 1XVYA 1Z7NE 2PT1A 1PC3A 4KYSA 3GZGA 1MQJA 3TCGA 3CSBA 4THIA 1JW4A 3VXCA 4ZEDA 2HFBA 3Q27A 4RXLA 3T9HB 1A54A 1QJMA 1DSNA 2Z22A 4H6DA 2ZXTA 5CMCA 4OXVA 4YB5A 3TDJA 1LCTA 2THIA 5L9SA 3PUZE 5TP9A 4TOZA 3IOVA 3O6HA 4QRZA 3KG2A 5B70A 3VFJA 4OESA 1PDAA 4I9DA 3OEKA 2UYFA 2PVUA 1N0TA 3PV0E 5IKBA 4IO7A 3E9XA 4IB2A 5KCJB 3DP6A 4Q30B 2YJPA 1I6BA 4QFKA 2Y7IA 5J1DA 3KJTA 1Q1KA 4U4XA 1PBPA 4U22A 1LB8A 4RPNA 3ILTB 1A55A 3TODA 1Z7ME 4YKJA 3VVEA 1HSJA 1URSA 2ANJA 3TQLA 3PPNA 4EUOA 4ELQA 3M3LA 2ZNTA 4GFRA 4KYEA 4POWA 1FQBA 1H3DA 3KSXA 4EXKA 3W9VA 1DTZA 5I2KB 2F78A 4OFJA 3K00A 3IJXB 5CMKA 2DWIA 1US5A 4F29A 2D21A 4UACA 5A5XB 1B3HA 4ELPA 2A5TB 1LFGA 2I3WA 5AA1A 1M5BA 4GVOA 3UORA 2IA4A 4IO4A 4X1BA 4H1XA 2V3TA 1S7YA 4XKQA 5H8QA 2RC7A 1EZOA 4R9GA 1US4A 1QVSA 3C36A 2RCBA 4C1TA 1YPNA 2I0CA 1HSLA 2Z8FA 3MPKA 3PUYE 3OSRA 2Q2AA 3IL1B 3FUZA 1LAXA 3OENA 4QF9A 1JW5A 3TTRA 1VR5A 1B5IA 2QS2A 4NF4A 3T9UA 1URDA 3IOWA 1B7ZA 1R1NA 2Z23A 3CRBA 5B7DA 1B2HA 4NEDA 2XX8A 4JWXA 1FTKA 2F5XA 1JVXA 3RNNA 1N76A 1TWYA 3IOUA 1SVXB 2P1SA 2OLBA 3OEMA 3UP9A 4U2RA 2H5YA 1B46A 1F9BA 3FVNA 1FQEA 1LAFE 4ZEIA 3C35A 2RF1A 2NOOA 4RJZA 2B3BA 1JNFA 3QSLA 1R9QA 3KZGA 5CRYA 4RNSA 1NMUA 4OZ9A 4YAHX 2Q89A 1MQDA 5I59A 2O7IA 2F35A 4IO6A 4BLAA 4NMYA 3RQTA 1RYOA 1MXVA 3E13X 1XC1A 2OZZA 4K3FA 4JWYA 2HAVA 3TCFA 4H8JA 4RK2A 1RKMA 4F39A 3WAFA 1I6AA 3IB2A 4U1ZA 3GLBA 5HBCA 2XXVA 3BKIB 3C4MA 1ZLQA 2QSXA 3GXAA 2F7BA 4G8NA 1IUDA 1QUIA 1VFEA 1MM7A 1MXXA 1SW4A 4DIGA 4KCDA 2F6GA 4X1DA 4LZ7A 3H6WA 3TAJA 1P1QA 3A09A 4JBZA 4X9TA 2ZYKA 4JDFA 3DM0A 3CFZA 4G8HA 3LSXA 5DVIA 4DXUA 3FVGA 4ZZEA 2O84X 1MH3A 3MVYA 4O3BA 1LAHE 2ALUA 2VP1A 1EZ9A 5FHOA 4LA9A 5AA2B 4RA1A 2AL4A 3M3FA 1T0KA 5I57A 5I58A 4YZZA 2I0BA 4OEUA 1LBBA 1QUKA 1JQFA 1TFAA 4OHNA 3VLWA 1UIVA 1SI0A 3O66A 1ELJA 2F6PA 2H99A 3THIA 3TTLA 3V89B 1OIBA 1FQDA 3V5AA 1A99A 1R9LA 2RINA 3OOAA 3PPRA 1LB9A 2WKYA 1B9JA 5ISUA 3UIFA 5JTYB 5H8FB 2DWAA 3MUQA 3QYTA 1Y20A 1B58A 2ZYNA 4ELOA 3O97A 1M5DA 2BJJX 4GXSB 4NF6A 3ODBA 1IXIA 3MP1A 4QFLA 3QK6A 5KDTA 1AMFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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