1MQHA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine at 1.8 angstroms resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEALEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords glutamate receptor 2
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA01
4Q8RA 4M1VA 1MPCA 4DE8A 3MAMA 4JBZA 2LAOA 2I48A 2ZYNA 2QMXA 4OENA 4EQ9A 1MXZA 2DOJA 2V3TA 2F7AA 1JW5A 1H3DA 4OVJA 1LAHE 4GD5A 4DZ1A 3MP8A 1NFTA 1II5A 4FATA 2NUVA 1LSTA 2HFBA 3O97A 3QUFA 3O6IA 2O7UA 4YZZA 3RTWB 1M5DA 4ZEKA 4Z7EA 1SDXA 1JETA 1MDQA 1Q1KA 4ZEBA 4QSEA 5ITPA 2QS2A 2VHAA 2XD3A 4G77A 5DVJA 3H03A 1ZJLA 2G29A 3QK6A 4DXCA 3CVGA 1MQJA 4YAHX 1B52A 2Q9TA 5J1DA 2GFEA 3TDJA 4IO4A 3KFMA 3V83A 3OENA 4G2ZA 3EPEA 4IB2A 3TMGA 2F36A 1FQAA 5JK4A 1MQHA 4F2OA 3E9XA 4O3BA 1H45A 2XX8A 3T96B 1FQDA 4MLQA 3C36A 3C35A 4KYDA 2NXOA 1LBCA 3IO6A 4H1XA 4JWOA 3LSFB 3VXBA 5DTBA 3TKDA 4BDLA 5KCJB 3JZJA 4NF8A 4XKRA 1A54A 3TYHA 1IXCA 5TP9B 3GXAA 3RT6B 3BBRA 1IEJA 4RYAA 4NF6B 4TLMB 1FCKA 3HHGA 4DCXA 5FHNA 3T22A 5I2KB 2RC7A 1N76A 2AL5A 2F5XA 3A09A 3OO6A 3IB1A 4KD5A 3VLUA 1D4NA 1MH4A 2HCAA 4ZZAA 1P1NA 3E13X 3RPWA 4FAJA 3K2DA 1MXVA 2Q8JA 3CSBA 5I57B 1I6AA 3OEKA 3IOWA 3FV2A 5AA4B 1PB7A 5FHMA 3H6WA 5H8SA 1TFAA 2REGA 4PFTA 4Q30B 3T9HB 4PFUA 4C1UA 3IOUA 1ZU0A 1ZIUA 3U8QA 1VE4A 3IX1A 2F6PA 3OO8A 2FYIA 3WAEA 3K0VA 3DELB 1Y4TA 2XXWA 4KYEA 4DIGA 3FASA 4I62A 2VGQA 1USYH 1B46A 4LA9A 1B5IA 3B6QA 5CI5A 3K6WA 1CB6A 4F3SA 5ELVA 3EF7A 3R26A 1UTHA 4G68A 4DDDA 1Y3PA 1TXFA 2B3BA 4QHQA 4FORA 3T93B 3GBAA 2OWTA 5AA1A 4IO6A 3PUWE 4NWDA 3C32A 3E3KA 1I6QA 1B7HA 2I3VA 4F1VA 5I56A 3IORA 3Q26A 3Q25A 1MXYA 3PPQA 3UGWA 1GTKA 4WEPA 1HSJA 2ZXTA 2ESNA 5HBCA 3VFJA 4U4XA 2HAVA 3LR1A 1BP5A 3K1PA 4U2RA 3N5LA 5DYHA 4OMBA 1DMBA 2AL4A 3G7WA 1B4ZA 4KCDA 2OLBA 4YKPA 5AA3A 4I9DA 2BJJX 3MPLA 4IGTA 4H67A 5LOMA 5CBRA 3KSXA 2QL3A 2HEUA 2O51A 1MXWA 4X1DA 3W9VA 1OMPA 1B1XA 2PT2A 4MF3A 1VSOA 2FNCA 5H8QB 1AOVA 3KN8A 3RUMA 2XX7A 2UVHA 4P11A 3MVZA 4KYSA 1JEVA 1P1OA 1NMUA 4F2QA 5DVFA 4GF8A 2QS1A 3C34A 4EXKA 1US4A 4F19A 4RY1A 2DS9A 4THIA 2UXAA 1XOCA 2F97A 3UORA 2Z22A 3S9LC 5H8NB 1A99A 3RGYA 3SDFA 3RN8A 4LZ8A 1LCTA 4GLIA 3FD3A 4IY5A 4BDOA 2DWIA 1NH8A 3TQLA 4YMBA 2V3UA 3HN0A 3QYTA 4OYVA 2O7IA 2GRVA 3FUZA 3MUQA 1B7ZA 4R6YA 3MZBA 1US5A 4QSDA 2R6GE 1UIVA 1N84A 2THIA 2I4CA 3IB0A 3K1MA 3HHFA 1IZ1A 3PPPA 4H8JA 2QS3A 2VD2A 5KCJA 2OBGA 4POWA 4EF1A 1EU8A 3L6HA 3MBPA 5TP9A 5ICTA 2O68A 3TCGA 1NKXA 4NF6A 2NOOA 3IOVA 3QIMA 2Z8DA 3U1OA 2Z23A 1URDA 1T0KA 1L5TA 4I1DA 3IJXB 4MBPA 5I2KA 3H3GA 3SEYA 1EH3A 5L9SA 1NNFA 2NVUB 1UIUA 1AMFA 1XVXA 2X7QA 3LUYA 1H76A 1QKBA 3PUZE 1OQHA 4QFNA 3TQWA 1FTOA 4PE5B 1B0HA 5I57A 3G3GA 3K1NA 3ODBA 3FJ7A 2DVCA 3EN3A 4EXLA 5KZTA 4ZS9A 4NE4A 2I58A 3M3LA 4EF2A 1MXXA 2I4BA 4OQOA 3TCFA 2RCAA 4ESXA 1R1NA 3DP6A 1DPPA 1A8FA 4U22A 2HZKA 5FTIA 3FXRA 2F8DA 4UA8A 4XXUA 3SEUA 3KSJA 3RNNA 4PQJA 2GHAA 3VXCA 5H8HB 3HCQA 5I59B 3VV5A 1SW1A 3JYRA 4XKNA 1Z7ME 3OD7A 1GVCA 1B1HA 3C9HA 3G3IA 1A40A 3S9MC 3RQTA 1QUIA 3RT8A 4WKMA 3O6GA 1LAFE 1Z7NE 5B7DA 3A3UA 1SW2A 5TU0A 2RC8A 3PMVA 1ANFA 4NTLA 1ELJA 1AL3A 2XD2A 1OLCA 4U1ZA 3HSTA 3SETA 3Q28A 1YAEA 2DXRA 4Q0CA 3U94A 5DVIA 3E4RA 3TFLA 1N3WA 4WXJA 3G3HA 1I6BA 2G93A 2HAUA 3WAFA 3A3CA 3FIRA 4RJZA 2V93A 4ELPA 4FEBA 5CC2A 1GR2A 1SI0A 4ZZEA 5L8DA 3KJTA 1R6ZA 1LAGE 5CM6A 1B2HA 3T9XB 1DTZA 1S9TA 4F3GA 3KEIA 1HSEA 4LUBA 5ISUA 2DWAA 5H8QA 4XKQA 3K6XA 1MDP1 5HPQA 2M8CA 1EZ9A 1POTA 3EHTA 2DWHA 3FXQA 4F29A 3MVWA 3ILUB 4OHNA 4U4SA 2IA4A 1BKAA 3KBRA 3MQ9A 5F7VA 4EQ7A 3K6VA 3UA8A 2DE4A 4FJPA 2QS4A 3DLNA 3MP1A 3G3JA 2HZLA 1PEBA 3IK6B 1OQGA 4GXAA 1SI1A 4R2FA 5H8NA 5L9MA 3OOAA 1XHYA 3H06B 3O6HA 1F9BA 3N26A 4QFPA 4OXVA 3RTFB 4F1YA 5H8FB 4GL8A 1Y9UA 5FTHA 4KCCA 5FHOA 4BDRA 1N0TA 3LSWA 4O3AA 1MY4A 2QMWA 4YKJA 4GFRA 2X7PA 1JEUA 3W15C 2P0SA 4TQUQ 2FA7A 4MLVA 2I6EA 1NNPA 1RYOA 3M8UA 4QF9A 3THIA 4WEDA 1NL5A 2I3WA 1NNTA 5AA2D 1IXIA 2O84X 2V84A 4F18A 3PMXA 2RC9A 2H5YA 2VP1A 2ZNTA 3S2VA 2UVGA 2ONSA 4P0GA 2RKMA 4BDMA 4R9FA 5BWJA 2XXVA 2OJTA 2PYYA 3V8XB 2H4IA 4DLDA 1MS7A 4ZDMA 3PUXE 3ILTB 1SYIA 5CRYA 4YMAA 5CMKA 1D9YA 1OVBA 3UN6A 2HXWA 2ONKE 4DCYA 1O63A 3I3VA 3RLFE 4OESA 1LLSA 4MH5A 2O1LA 3EQ1A 5CMBA 2CMOA 4F3BA 3LSLA 3FVGA 1N04A 4G8NA 1FTMA 3FXUA 2A5SA 4EUOA 1QUKA 2ZYOA 4R6KA 1KWHA 2QJEA 4ESWA 4M4GA 2Y7RA 1WVJA 4BDQA 4LVQA 3EHSA 2ZYMA 5B70A 2OWSA 1P1UA 2PBWA 4IGRA 2B65A 3IOTA 1ZTYA 5CMCA 3O28A 1QW0A 3CR9A 4JXIA 3PU5A 3BKIB 5K2XA 3B6WA 3IO4A 1SW5A 1H44A 4KI0E 5H8HA 5I59A 3V89B 4O3CA 1B6HA 4QRZA 2UVIA 4JB7A 1VFEA 2ANJA 3P7IA 4GXSB 2AYSA 4IY6A 3KJ7A 3VLVA 1D3KA 3SEXA 2XXUA 2Q89A 1PB9A 4H65A 2DXYA 4NF4B 1BTJA 2H98A 1H43A 1O64A 2UYFA 3FVOA 2PX1A 2R71A 5I2NB 4JWYA 3IJOB 2VD3A 4H5GA 1MPDA 4G68C 3PPNA 4F22A 2O69A 3IL1B 3EHUA 4R75A 4X48A 3C4MA 4YB5A 4OFJA 4LONB 1Y3NA 2DP8A 2RF1A 2YPNA 4ZEIA 2YLNA 3KZGA 5AA2B 2Z8EA 3PPOA 1JVXA 2OCUA 5CBSA 4LZ7A 3QAXA 2QRYA 3OSQA 4KR5A 4NF5B 2XXTA 2OZZA 3S9NC 1P99A 4L17A 4YB7A 4AQ4A 1TWYA 4YKKA 1FQCA 2CZLA 1PB8A 3VVDA 1SBPA 5A5XB 4JSOA 5HM4B 1DPEA 3DP8A 4KHZE 4KPTA 4DXUA 1JW4A 4EQBA 3KOTA 1MH3A 3TTRA 5H8FA 1MY1A 1JQFA 4F31B 4IO7A 1MXUA 2XXHA 1XC1A 2GH9A 4PP0A 2AIXA 4FECA 3R6UA 2DE3A 1JNFA 3SESA 4OFOA 3N6TA 4ECFA 2KLFA 3H7MA 4AB5A 4RK2A 1VR5A 1MRPA 5CMMA 3PPRA 2XXPA 3T9VA 4FEDA 4R74A 1YTVA 4RXLA 5AA4A 1AH5A 4G4PA 1MY3A 3ZKKA 2I49A 5I58B 2ZYKA 3TEPA 2Y7IA 1TFDA 3FJGA 4H5FA 3H6VA 1B5HA 1LCFA 2XXIA 1M5BA 3O9PA 2B3FA 4U23A 1MY2A 1ZLQA 3IB2A 2ONRA 3QXMA 3K4UA 1NH7A 3O2AA 1QKAA 5ICQA 1B51A 4N07A 1A7LA 4X9TA 1MM6A 1FQEA 5L9OA 1UQWA 1AIVA 5TPAB 2YJPA 1IUDA 2F6GA 4E0XA 2F35A 3QSLA 4H8IA 1MY0A 3C33A 3KG2A 4F3PA 4OETA 3KN7A 4YU0A 4IO5A 4LZ5A 4N6PA 1S50A 3HO7A 1S7YA 5JTYB 1Q35A 1Y4CA 3OO9A 1ATGA 2ZNUA 2XXRA 1B05A 1NNKA 4HCYA 3SEWA 1IXGA 4XKPA 4LATA 4OZ9A 3U93A 1SD3A 4H6DA 4R72A 2D3IA 1URGA 5KDTB 4C0RA 4I8CA 1HSLA 3USDA 3PD9A 4RA1A 2DQVA 2OK2A 4Q5TA 1QUJA 3UIFA 2V3QA 3OEMA 1JW1A 1SW4A 3O29A 3OSRA 3TELA 3L6GA 4ND9A 3ZSFA 1QULA 2H9BA 4QSCA 4HCWA 1FTJA 4ZECA 3PUVE 3CI8A 2ABHA 2W7YA 5JEIA 1MG1A 1B3EA 1LFHA 1Y20A 3N94A 3F11A 2ZMBA 3K01A 2X26A 4G8HA 4LQ5A 5F1QA 3S4UA 3KGCA 4P0IA 1B32A 5BUUA 3CFXA 4ELOA 2I0BA 3G3KA 3MWBA 1M5CA 1B0LA 3UK4A 2ZNSA 4NF4A 2XX9A 4ZEDA 2E1SA 1B4HA 3DM0A 3FV1A 5I2NA 4QFLA 4PFYA 1FTKA 4BDNA 4F1UA 1MPBA 2O6AA 3OXNA 4BLAA 1B3LA 1OLAA 1WDNA 1EZOA 3D4CA 3K02A 3TUSA 4GWOA 1EZPA 2P1SA 5IAIA 1PC3A 2QPQA 1A8EA 4YICA 1USYE 2RCBA 2QSXA 4JDFA 3KN3A 3TAJA 5DEXB 1TT1A 4GQOA 5AA2A 3TZAA 1ZMGA 3R7XA 4KFQA 4K3FA 3M3KA 4GRKA 4NF5A 4JSDA 4R2BA 3G3FA 1LB9A 3MZ9A 3MP6A 5A5XA 3AXFA 4POXA 4GVOA 4RPNA 4GIZA 1FTLA 1B58A 3KOSA 3Q27A 2Y7PA 3PV0E 3VVFA 3PMWA 3TCHA 1QVSA 1BLFA 4FE8A 3SKPA 3MJNA 3LBSA 3OMBA 2V25A 1LAXA 5ITOA 4OEVA 3I6VA 1LB8A 1PBPA 3S9EA 3U92A 3PGFA 2I0CA 3SERA 1MQDA 2H99A 3MZ1A 3IR1A 2H25A 2RINA 3FVNA 3FATA 3ZS6A 3M3FA 1ZBMA 1DOTA 2D5WA 1I69A 4HW8A 4TOZA 5M2VA 1FW0A 3ECRA 1Y3QA 2F7BA 1O7TA 3TODA 4FIMA 3HPIA 2ALUA 2XHDA 4PFWA 4YKIA 3JV9A 5I58A 1B3FA 4ISUA 4TLLB 1B9JA 1UTBB 1OIBA 2A5TB 3CFZA 3IAZA 3FVKA 1M5FA 2XXYA 3Q29A 4U1OA 1JVYA 3I5OA 1XS5A 2F7CA 4MFIA 1BIYA 2REJA 3T9UA 5TPAA 1A55A 3PD8A 1M5EA 1Y1MA 1WODA 1MQGA 5EYFA 2DWJA 1VFDA 5JTYA 4EDPA 1IITA 4OWDA 3OELA 5AE4A 2IEEA 3GBBA 3FGSA 1N7WA 4ZE9A 4XIGQ 4F39A 1MM7A 3TTNA 2R9JA 3DP4A 4X1BA 5K2YA 3H6UA 1ZKBA 1B7UA 4R73A 2Q2AA 2DSFA 1OVTA 1B5JA 2XXXA 4R6HA 3MVXA 1RYXA 5KDTA 1B40A 4NEDA 4ZEFA 3GZGA 1N7XA 2PMSA 3OO7A 3VVEA 1SYHA 3K00A 4QFOA 4NWCA 3UP9A 1CE2A 3TTLA 1YPNA 1LFGA 2PVUA 4IO2A 4LP2B 4QFKA 3C31A 3B7DA 3H6TA 1LGBC 3PUYE 4NF8B 3B6TA 3H4ZA 3CG1A 2P2AA 1SVXB 5DT6A 4Z0IA 4OTEA 1R9LA 4U21A 1XVYA 2F34A 3O66A 3V5AA 3TPAA 1B3HA 3LC8A 4N13A 4YB6A 3K6UA 1FQFA 2UYEA 3D4GA 4OEUA 5EHSA 3FJMA 1R9QA 1Y1ZA 1POY1 4JWXA 5EHMA 4GOTA 4HTGA 1IQ7A 4GL0A 2WKYA 1IXHA 1B3GA 1XT8A 3CFLA 2NWJA 2Z8FA 1J1NA 3SEVA 4H0WA 2GHBA 4ONYA 1IIWA 2Q88A 2HQ0A 1FQBA 4PETA 5DEXA 2Y84A 3TTMA 4UACA 4DXBA 2UVJA 2VOZA 3ZKLA 1GV8A 3W9WA 3MVYA 4KQPA 4OERA 3CRBA 3QUJA 1PDAA 2PT1A 4HS7A 3CG3A 2E0SA 3T66A 4ELQA 3FZVA 3HV1A 5I84A 1MQIA 1YCJA 4ELRA 4C1TA 1UTHB 3BFTA 4G68B 2D21A 2Q2CA 4LQ2A 3GLBA 2DYXA 4AB6A 1LBBA 4NMYA 4G8MA 4RK9A 2F78A 1D9VA 1RKMA 4XTCQ 5I56B 4RNSA 3MPKA 2Y7WA 3TTKA 2DVZA 1GGGA 1DSNA 3U72A 4E0WA 2DE2A 4RPOA 3VE1B 4IO3A 3VLWA 1URSA 4OFLA 4ZE8A 1LFIA 1PBQA 2XXQA 4R9GA 3RY3A 1QJMA 3LSXA 1SQYA 3CIJA 2Y7KA 3CSGA 2O1MA 1P1WA 3MC2A 3VDFA 3MW0A 1DTGA 1P1QA 5IKBA 3ONMA 1UTBA 3N6UA 1N3XA 2A5TA 3BFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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