3MUQA

The crystal structure of a conserved functionally unknown protein from vibrio parahaemolyticus rimd 2210633
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
233
structure length
233
Chain Sequence
EHVRLATTTSTYHSGLLDYLLPQFEKDTGYKVDVIAAGTGKALKMGENGDVDLVMTHAPKAEGTFVEKGYGVLPRKLMYNDFVIVGPKADPAKIKDDESVLDVFKEIANKNATFISRGDDSGTHKKEMGFWAQTKIEPNFGGYRSVGQGMGPTLNMASEMQGYTMSDRGTWLAYQNKLDLEILFQGDEKLFNPYQVILVNPERYPTINYQGAKAFSDWLVNPRGQELINGFRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords uncharacterized conserved protein
publication title The crystal structure of a conserved functionally unknown protein from Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
rcsb
source organism Vibrio parahaemolyticus
total genus 77
structure length 233
sequence length 233
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3muqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3muqA02
3HSTA 1P1UA 4R6YA 2XXRA 2VP1A 4FJPA 4TLMB 4GL0A 3TCHA 4IO6A 1DPPA 3IK6B 1Y20A 4P0IA 1UTHB 1SW1A 1OQHA 1MH3A 3OOAA 4GIZA 4OQOA 3M3FA 4KR5A 3KSXA 3MBPA 1DPEA 3FJMA 3C9HA 5HBCA 5AA2B 5IAIA 5H8HB 2Y7IA 1I6AA 2WKYA 2H99A 3A3CA 4NF5A 5L8DA 2ONSA 1AMFA 4DE8A 1OQGA 2QMWA 3GZGA 1B3EA 1B5HA 4RK2A 3F11A 4K3FA 3FIRA 4JWXA 4R75A 4XKQA 2XXQA 1FQFA 3VXCA 2D5WA 4F1YA 3C36A 4YU0A 1SW4A 3KZGA 2O1LA 5L9MA 5ISUA 3B6QA 3KN7A 4GF8A 2RKMA 1GV8A 3N5LA 3KFMA 3MZ9A 5H8NB 4RPNA 1R6ZA 1MH4A 4BDMA 1LBCA 2PVUA 2PT2A 1NNFA 2AL4A 4ZEDA 1B3GA 4I62A 2R6GE 1XS5A 5H8QA 2RCBA 3BFUA 1QW0A 4F29A 5A5XB 3CSBA 3H6VA 3EF7A 3B6WA 1NKXA 3RN8A 1NNTA 3SEYA 3QUFA 4AB5A 4KD5A 4EXLA 5HM4B 4JWOA 2I4CA 4FIMA 1EZ9A 2O51A 3T9UA 3T96B 5AA2D 2D21A 3IR1A 4H8JA 3V5AA 1DTZA 3S9MC 1A54A 1ZKBA 4H6DA 2REJA 1LGBC 3RPWA 1I6QA 3PMVA 2X7QA 1KWHA 5AA4A 1II5A 1S9TA 4KYEA 3JZJA 5FHOA 3K00A 4DCXA 3DP4A 4RY1A 1BP5A 1MQJA 2Q88A 4FATA 1B51A 4H65A 1N7WA 4L17A 4M1VA 3KJ7A 1MXUA 5DEXA 1YTVA 4C1UA 1MY4A 4R2FA 3DELB 1SDXA 2ABHA 2I3VA 4GRKA 2F78A 4FE8A 3PPOA 4GOTA 4KI0E 3G7WA 2V84A 1QKBA 2NWJA 4LZ8A 2XXTA 4NEDA 2DSFA 2QPQA 1SW5A 3DP6A 4LZ5A 5DVFA 4OTEA 3T93B 1MQDA 3RNNA 1FCKA 5LOMA 3EPEA 4ELPA 5I2NA 4I8CA 3KN8A 5DVJA 3OENA 5CMCA 2QS2A 3K6UA 3WAFA 1T0KA 1B3HA 1A7LA 2I58A 5K2YA 2I6EA 2UVHA 1FTLA 1QJMA 4LQ2A 4GVOA 2F7BA 4N6PA 4F39A 3FUZA 3OSQA 5ITPA 1SQYA 5I59B 2H4IA 4Q30B 4ZEBA 4X9TA 4QFOA 4G68B 4Q0CA 1DOTA 3E13X 2XXYA 3RT8A 1UIUA 1MDQA 4XKPA 5TP9A 5TPAA 3BFTA 4UACA 3IORA 4RXLA 4AB6A 3VLUA 1LLSA 1TFDA 1JETA 1FTMA 2DYXA 1LB9A 2E1SA 3MZBA 2Y7WA 2HXWA 2YLNA 3GBAA 3THIA 4ZZAA 5I58A 1MDP1 3O29A 5TU0A 3TKDA 3TTKA 3RQTA 3MP6A 4QFPA 1DMBA 5FHMA 3RLFE 1S7YA 2I48A 3KEIA 3FATA 4YB5A 4F3SA 3CFLA 1P1NA 1PBPA 4LONB 1Z7NE 1QUIA 4YAHX 3CRBA 3FJGA 2H98A 4F1UA 2HAVA 2ZYOA 1FQAA 1N0TA 3MUQA 3PPPA 4LP2B 2QSXA 3L6HA 2XD3A 2F5XA 3MW0A 5I57B 3IB2A 3PGFA 3Q29A 3E4RA 3HN0A 1B7ZA 2HCAA 5KCJB 2DWJA 1USYH 3MAMA 4JXIA 1LFIA 3TTMA 2RF1A 1PEBA 2A5TA 4NF6A 3PU5A 3LBSA 3K6VA 5AA3A 4XKNA 3T9XB 2F34A 4ISUA 3O66A 1QVSA 3EHSA 3N6TA 2RINA 3DM0A 2DE4A 4NF4B 1RYXA 1B0LA 1ZMGA 4QRZA 1IITA 4JSDA 3CSGA 4XIGQ 1LBBA 1L5TA 3BBRA 3FV2A 5J1DA 5L9OA 4OEUA 3MWBA 1M5BA 1B9JA 4RK9A 2RC7A 1SI1A 3OO7A 2AIXA 4DIGA 3USDA 3PD9A 2ZYKA 5FTHA 2QS3A 2YJPA 3KOTA 3O6IA 3DP8A 3TQWA 3HPIA 4R6HA 3PMWA 2OJTA 3CG3A 4O3AA 2Q9TA 4YICA 3TUSA 4IO3A 1UIVA 3HV1A 4P11A 4OFLA 5F7VA 2I0CA 1FQBA 5I2KB 1D3KA 3O2AA 3EHUA 1LAFE 4KYSA 1A40A 4NF8B 3VVEA 4EQ9A 2QJEA 3H6TA 4R9GA 1H76A 3MP8A 1A8FA 4C0RA 1HSEA 2Y84A 1D9VA 2Q2CA 4ZECA 4BDNA 1JQFA 1R9LA 3GBBA 1BTJA 1H3DA 4DZ1A 4ELOA 4WEPA 4O3BA 4RA1A 3QXMA 4RPOA 2I3WA 3OMBA 2ZYNA 3KN3A 5CBRA 1POTA 4H67A 4JB7A 4ONYA 3MQ9A 4ZE9A 2G29A 1QULA 2HAUA 5DT6A 2NXOA 3ECRA 1MS7A 3MPLA 3Q25A 3SDFA 1B05A 3LC8A 2F35A 3W9WA 1VSOA 4R73A 5KDTA 3CFXA 2B3BA 3TYHA 3TFLA 4R72A 3A3UA 1MY3A 1IEJA 2DQVA 2GHBA 2GFEA 3TMGA 4U1OA 2DE3A 3KG2A 4G77A 3OELA 4KCCA 4U4XA 4F31B 2I49A 1OVTA 2DVZA 4YKJA 1J1NA 3TZAA 1HSLA 1URDA 4XKRA 1R1NA 1GTKA 3HHFA 1MQIA 2Y7KA 3QYTA 4LATA 2BJJX 2ZNSA 4X48A 2V3UA 1SYHA 3PPRA 3CI8A 3IX1A 3W9VA 1ZJLA 3LSXA 5CRYA 4OMBA 1P1OA 4WKMA 1O64A 2OK2A 1B4HA 4OXVA 3L6GA 1URSA 1BKAA 4QSCA 4GLIA 4F2QA 4IGTA 3IOWA 4ZDMA 5JTYB 5JEIA 3KSJA 1F9BA 1N3XA 4BDQA 3TCGA 2THIA 3IOTA 3BKIB 4JBZA 2RC8A 1MY0A 2ZYMA 5BUUA 2ONKE 2XHDA 4LZ7A 3W15C 1UQWA 4GFRA 4HCYA 4TQUQ 3U1OA 3SESA 2O84X 3CIJA 4YKIA 4ZZEA 2V3TA 1URGA 3OD7A 3ONMA 4IO5A 4GD5A 3TTNA 3ILUB 1GGGA 2AYSA 4FEBA 4PFUA 3I5OA 3S9EA 4QSEA 4F3GA 3K01A 4RNSA 3PPQA 4G4PA 4QFLA 2PMSA 5ELVA 1O7TA 2B3FA 2VOZA 1MQHA 3T9HB 3MVZA 2QRYA 4OEVA 4YZZA 3IJXB 1D9YA 1LFHA 2O6AA 1M5EA 4IB2A 4THIA 2QL3A 1SYIA 2UXAA 4BDOA 5KZTA 3VE1B 1SVXB 3V89B 2XX8A 5CMKA 3RTWB 2XXWA 4H5GA 1QKAA 1B5JA 2ZNUA 3SEVA 5I56A 4GL8A 3U94A 5DYHA 1SD3A 2XXVA 2ZMBA 1Z7ME 3VLVA 2I0BA 5H8FA 1JEVA 4EXKA 4LQ5A 4U2RA 3S9LC 1LAXA 3MP1A 3RY3A 1A99A 3D4GA 2RCAA 3MVYA 5B70A 3M3KA 2PBWA 4C1TA 2P2AA 4H1XA 4GXAA 5F1QA 1TWYA 3VFJA 3I6VA 4NF5B 1JW1A 1ZTYA 2V3QA 2HQ0A 3TDJA 2M8CA 4IO7A 3SEXA 3DLNA 3H3GA 1MQGA 4RJZA 4U22A 1BLFA 3MVWA 2ANJA 3FXUA 1Y4CA 4ESWA 1LCTA 2OWTA 4F19A 1B1HA 4M4GA 2Z8DA 3N6UA 1Y3PA 1B32A 3RGYA 4DDDA 1WDNA 4EDPA 1VE4A 2NOOA 2D3IA 1O63A 3HHGA 3VDFA 1GR2A 3EN3A 3Q28A 4R74A 4WEDA 5H8QB 4R6KA 1A55A 3M3LA 3ZS6A 4DXCA 4MLVA 1N76A 4BDRA 3SERA 3QSLA 1UTBA 1MRPA 1M5DA 4OHNA 1ZU0A 2IEEA 1B52A 2XXXA 1IIWA 3K4UA 4H8IA 3T9VA 1H45A 3FASA 3FXRA 3IB0A 3MZ1A 3Q27A 4GWOA 1RKMA 4XTCQ 1EZOA 4YMAA 1UTHA 4BLAA 1ZLQA 1B7UA 3EHTA 3KJTA 3HO7A 4I9DA 2G93A 1XVXA 3S4UA 1IXIA 4FORA 1IUDA 3K6WA 1BIYA 5AA4B 4JSOA 5AA1A 3O6HA 2HZLA 1MM6A 4NMYA 1FTOA 4JDFA 2R71A 2UVJA 2VGQA 3C32A 3TQLA 4ZS9A 3FJ7A 2GH9A 4IO4A 3VVDA 3MPKA 1AL3A 3EQ1A 4Q8RA 4EQ7A 1FW0A 1N84A 3MJNA 3B6TA 1MXXA 1USYE 5DEXB 5CI5A 3G3FA 3OEKA 1IXGA 1LCFA 1Y9UA 1P1WA 5FTIA 5DTBA 2Z8EA 4G8NA 3TODA 1MXWA 3D4CA 1SI0A 1XT8A 5H8NA 1PDAA 1EU8A 3JYRA 2OLBA 3FVKA 3TELA 3TAJA 2FNCA 3K0VA 3K1PA 3MC2A 4R2BA 3T22A 5I2NB 4MH5A 1TT1A 1Y1MA 1RYOA 5A5XA 1JVYA 2VD2A 3Q26A 4PETA 2A5SA 1M5FA 4ESXA 3H03A 1MPBA 4OWDA 4PQJA 1I6BA 4X1BA 2CMOA 3OXNA 4FEDA 3OSRA 1B1XA 1XVYA 3JV9A 3FVNA 3CVGA 2RC9A 3O97A 2REGA 1LSTA 2OWSA 2DP8A 4GXSB 3G3HA 5JK4A 2B65A 4TLLB 5TP9B 3H4ZA 5TPAB 3IOVA 2Y7RA 4NWCA 3P7IA 2DWAA 3KGCA 1Q35A 4EUOA 4G68C 3FXQA 3RT6B 3IO4A 4NTLA 4DXBA 3I3VA 2FYIA 4RYAA 1N7XA 5EHSA 3GXAA 4KCDA 4Z7EA 2XX7A 1US5A 5I58B 3VXBA 1ATGA 3C4MA 5EHMA 4DXUA 3OO9A 1B3FA 2E0SA 2XXIA 3K6XA 1PBQA 3LUYA 2O7UA 2UVIA 4HTGA 1AH5A 3K1NA 2VD3A 1JNFA 3FZVA 1A8EA 4F22A 2Z22A 3UN6A 3U93A 3PUWE 4DLDA 3PV0E 3O9PA 2OBGA 2LAOA 3PUXE 1Y4TA 1ANFA 4MLQA 1EH3A 1SW2A 3SKPA 2A5TB 4NF6B 3U8QA 3PD8A 4R9FA 2PT1A 2ZNTA 4PP0A 5CMBA 3WAEA 3SEUA 4POWA 3V83A 3HCQA 3VLWA 1JW4A 4PE5B 2VHAA 3H06B 1N3WA 4OFJA 4U1ZA 5I59A 4OVJA 3E9XA 2YPNA 4NWDA 5L9SA 4KHZE 4G68A 4ND9A 4QFNA 3PPNA 4P0GA 4KQPA 3B7DA 4E0XA 2GRVA 4OETA 5CM6A 3QK6A 3R26A 2DXYA 2DE2A 2XX9A 1PC3A 4NE4A 5HPQA 1IZ1A 1TFAA 3O6GA 1Q1KA 2UVGA 1CE2A 3N26A 4AQ4A 4F3PA 2FA7A 3IAZA 3TPAA 4EF2A 4MBPA 1H43A 1DSNA 1JW5A 2DOJA 4ZE8A 4I1DA 4KFQA 4KYDA 2F6PA 4KPTA 1US4A 1PB8A 2F8DA 3OO8A 4G8MA 3CR9A 1FQDA 4H0WA 2Z8FA 4FAJA 4YB6A 1TXFA 2ESNA 2XXUA 4LVQA 2AL5A 2ONRA 1NL5A 3FGSA 2PYYA 5K2XA 2OZZA 1MY2A 3UGWA 1OLAA 4QHQA 1LAHE 3U92A 2HFBA 1B6HA 5I57A 2O68A 2P1SA 1CB6A 4IGRA 5KCJA 1WVJA 5ITOA 3S9NC 2CZLA 1EZPA 3H6WA 1FQCA 5ICTA 4OFOA 5KDTB 2PX1A 3KBRA 3PUYE 1AIVA 4ELQA 3ZSFA 1VR5A 4O3CA 3GLBA 3T66A 4NF4A 1GVCA 1QUJA 3R7XA 1M5CA 3QUJA 4U4SA 1NMUA 3RTFB 1IXCA 2NVUB 2O1MA 3C33A 3LSWA 1OIBA 2P0SA 1JEUA 1FTJA 3H6UA 3QIMA 4EQBA 5ICQA 3UIFA 1Y3NA 3ILTB 1B0HA 4H5FA 1VFDA 2DS9A 4OENA 2H9BA 3G3KA 1B7HA 4IY5A 4F18A 1N04A 4OESA 4ECFA 5CBSA 1MG1A 1PB7A 1D4NA 5I2KA 3OEMA 1B58A 1FTKA 2Q89A 4MFIA 3M8UA 5IKBA 2GHAA 4NF8A 1MY1A 4LUBA 1P1QA 4F2OA 2UYFA 3UORA 2O7IA 1P99A 4N07A 3ZKLA 2OCUA 3PMXA 4YKKA 2V25A 1QUKA 1SBPA 3IOUA 3LSFB 5H8SA 2H5YA 1XOCA 3TEPA 4QSDA 5FHNA 4F3BA 2DXRA 2Q8JA 4WXJA 3UA8A 1Y1ZA 1IQ7A 4Q5TA 3VV5A 3KOSA 4UA8A 1B46A 1LB8A 4IO2A 3IB1A 4GQOA 4N13A 4PFWA 1YAEA 4YMBA 4HCWA 3G3IA 1ELJA 3CFZA 1LAGE 3MVXA 3PUVE 1IXHA 1AOVA 2X26A 1XC1A 1MPDA 2DWIA 2F6GA 1NNPA 1POY1 2R9JA 1B3LA 4QFKA 4U23A 3LR1A 1OMPA 5M2VA 2KLFA 4X1DA 4JWYA 1MPCA 1MXZA 2HEUA 2O69A 1XHYA 5DVIA 5AA2A 1JVXA 5H8HA 5CC2A 2ZXTA 3N94A 5I84A 1MM7A 4POXA 2X7PA 4YKPA 2Y7PA 4OERA 2HZKA 4BDLA 1WODA 3AXFA 3H7MA 5B7DA 3G3JA 3A09A 3SETA 1NH7A 1FQEA 1NFTA 2DWHA 2I4BA 2QS4A 2UYEA 4LA9A 3K1MA 4FECA 4TOZA 3FVGA 3C35A 1NNKA 3FVOA 1B4ZA 1MXYA 1OVBA 1DTGA 1YPNA 5I56B 4OYVA 4MF3A 3FD3A 1NH8A 5H8FB 4E0WA 1B2HA 3FV1A 3OO6A 3UP9A 2Q2AA 3UK4A 4IY6A 3IO6A 4ELRA 3TTLA 3S2VA 2QMXA 4Z0IA 2XD2A 5JTYA 1MXVA 4F1VA 3QAXA 3ODBA 4G8HA 3K02A 1H44A 1HSJA 1PB9A 4HW8A 4ZEIA 4QF9A 3O28A 3TCFA 1I69A 3TTRA 3V8XB 3VVFA 5BWJA 3CG1A 2XXHA 2ALUA 2V93A 1S50A 4ZEFA 1R9QA 2F7CA 1Y3QA 4HS7A 3ZKKA 1B40A 1OLCA 2F97A 2NUVA 4XXUA 2Z23A 2QS1A 3LSLA 1YCJA 3RUMA 4PFYA 1B5IA 3SEWA 5EYFA 2XXPA 2DVCA 3R6UA 3E3KA 2H25A 3C31A 4YB7A 1ZBMA 1LFGA 3PUZE 5AE4A 4OZ9A 3G3GA 3K2DA 2F36A 5CMMA 4ZEKA 4DCYA 2F7AA 3C34A 3U72A 1VFEA 4EF1A 2W7YA 2IA4A 3IJOB 1ZIUA 1UTBB 4G2ZA 3IL1B 4PFTA 4U21A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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