1MXXA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 um brw)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA01
2O69A 5IAIA 4LZ8A 1H76A 2QMWA 4R75A 4F3GA 2LAOA 1JQFA 4IO3A 2F6GA 1MY2A 3UP9A 2UVJA 2UVGA 1M5BA 3S4UA 2D3IA 2REGA 2A5TA 2PX1A 4AQ4A 5DTBA 2XXWA 5ELVA 3HSTA 3KOSA 5BUUA 5I59A 1SYIA 5KCJA 3HPIA 1T0KA 4F31B 2I4BA 5HBCA 3M3FA 1L5TA 3CR9A 4NF6B 4QRZA 3N5LA 3B7DA 3AXFA 2ZYOA 4ZEBA 3PPNA 4IO5A 4FEBA 3E3KA 4FATA 4RPNA 5FHOA 3S9EA 3CFLA 3O6GA 2G29A 1JW4A 3IJOB 4F3SA 1B1HA 2R6GE 2I6EA 1S7YA 4ELQA 4ISUA 1B0HA 3IJXB 4NF4A 5H8NB 2V3UA 3KZGA 4H8IA 2HEUA 4GD5A 3IL1B 2GFEA 3RTWB 3LC8A 3IOUA 3O2AA 5BWJA 4BDRA 3LSFB 3QXMA 3H6TA 3M3KA 1N04A 2V3TA 3E4RA 4BDQA 3KEIA 2DE4A 3E9XA 1LFGA 4H5FA 4XKQA 4FECA 1BIYA 4YICA 3IK6B 3MPKA 3TCGA 1MM6A 2H25A 3RUMA 4PE5B 1P1QA 1OLAA 3OEMA 2OLBA 4EQ9A 4KYDA 3OMBA 1CE2A 4U1ZA 3FXRA 2XXTA 1US4A 4AB5A 3G3JA 3SKPA 4NF8A 4YMAA 3FVOA 1FQCA 2XXXA 4OFLA 1Y3NA 4OHNA 3FJMA 3O28A 4LATA 2FYIA 5FHMA 1UTHA 3N6UA 4XKNA 3GBBA 3IOVA 3IORA 3W9WA 5I59B 5KCJB 2PT2A 2GHAA 2BJJX 5DEXB 1B40A 4O3BA 3RNNA 3MBPA 5JEIA 1US5A 1XOCA 4GOTA 1VFDA 1MPDA 4WEPA 1IQ7A 5FHNA 5DYHA 4BDNA 4ZZEA 1VE4A 1BP5A 1RYXA 4EXLA 3GLBA 4EF2A 4YKKA 3DP6A 5AA4B 4WEDA 1UIUA 2UYEA 2QMXA 2O7UA 1R9LA 4O3CA 2E1SA 1Q1KA 1BKAA 5H8SA 4OYVA 2XXVA 3TTKA 1B5IA 1WODA 1ATGA 2ZNUA 1LBBA 1GGGA 3HHFA 3KBRA 1S50A 4WKMA 2DWHA 4C0RA 4H8JA 2XXUA 1LFHA 5B7DA 4LQ2A 2ZYKA 5TP9B 3L6HA 3UGWA 3IAZA 5H8QB 2YLNA 3C35A 2RF1A 4ZEDA 1DPPA 1PBQA 5CM6A 3VLUA 1LCTA 1ZTYA 4U4XA 3MPLA 3OEKA 2H99A 5AA2A 5LOMA 1NH8A 2I3WA 2UVIA 5A5XB 3MC2A 2GRVA 2YJPA 2R9JA 4JSDA 1A40A 1A8FA 1NNKA 4R6HA 2Y7RA 2F36A 5I2NA 2H98A 3UIFA 1M5CA 4FJPA 4OMBA 4RK2A 3C9HA 2AYSA 4NWDA 5AE4A 1USYE 1LSTA 2O68A 1URSA 1TWYA 1IXGA 1RKMA 1SYHA 4IO2A 2Q8JA 1GR2A 3TTLA 4DCXA 4ELRA 3V83A 3TTRA 3W9VA 2Z22A 1OQHA 3R7XA 3PUYE 4PFTA 1OQGA 2V84A 3EHSA 2F34A 1IXHA 3KSXA 3CIJA 3FVGA 1QUIA 3LSXA 3U8QA 1B3EA 3S2VA 2O84X 3CSBA 4ZE9A 4XKRA 3U94A 2OCUA 4MFIA 3H06B 4IO4A 4R72A 3MP6A 4EUOA 5HM4B 5ICTA 1FTMA 1JW1A 2ESNA 2ABHA 4U2RA 2I4CA 2DP8A 1POTA 3ZKLA 3VXCA 5L9MA 3S9MC 1ZBMA 4R6YA 3T9XB 1XVYA 4M4GA 4OZ9A 4ZE8A 1B2HA 1P99A 1MPBA 1PEBA 4OENA 3Q29A 1ZU0A 1Z7NE 2HFBA 4Q0CA 1M5EA 1LBCA 1D9VA 1XVXA 3L6GA 3UN6A 1FCKA 2Y7WA 3QK6A 4ZS9A 5K2XA 1LAGE 2XXQA 2XX8A 1A54A 1N3XA 3PPOA 4GWOA 3RT6B 4NF6A 2FNCA 2PYYA 4PQJA 4PETA 3USDA 4NWCA 5B70A 1EZOA 4XXUA 3DP4A 1SBPA 3ZS6A 4MLQA 5AA2B 1B7UA 4IY5A 1B7HA 4LZ7A 1M5FA 2ZYNA 4I8CA 4POWA 4DXBA 1VSOA 1FTLA 4MLVA 5H8NA 4OEVA 4KR5A 1URGA 4G68B 3TODA 4HW8A 1XC1A 3FD3A 2ZMBA 2X7QA 3MZ9A 3HCQA 3V89B 3PPPA 4F22A 4IGRA 2IA4A 4MF3A 3C31A 1MRPA 4MBPA 3SESA 3SDFA 1LB8A 4LA9A 1B58A 3A09A 1WDNA 3D4GA 1OMPA 4F19A 1Z7ME 1GVCA 4NEDA 4R73A 4F1YA 1Y3PA 2Q2AA 2ZNSA 1PB9A 3MWBA 1I6AA 1B51A 4KHZE 3THIA 4IO7A 1URDA 4F2QA 3TEPA 1SW4A 1MDP1 3PPQA 3RGYA 2NOOA 3C34A 2W7YA 1S9TA 4NF5B 2DQVA 2HZKA 4ZEKA 2OK2A 2NUVA 3MVZA 3UORA 2HAUA 4X48A 3MZ1A 3FXQA 3MVYA 1DTGA 3CSGA 4UACA 5CC2A 2DVCA 1GTKA 1Y4TA 5TPAB 4R74A 3V5AA 4GRKA 1MXUA 4KQPA 3KJ7A 5DVFA 4AB6A 3MQ9A 4BDOA 2XXPA 5DEXA 3DM0A 4RXLA 3BBRA 2XXYA 1FTJA 1SVXB 5CRYA 4YKIA 1MQJA 3TFLA 3EQ1A 4R2FA 5DVIA 5AA1A 4PFYA 5EHMA 4EQBA 3RPWA 1H44A 4Z0IA 4F3BA 1O63A 2H5YA 3TMGA 2P0SA 2HZLA 1SQYA 1MQIA 1LLSA 4BLAA 5AA4A 3N94A 1PDAA 1B7ZA 3H7MA 1Y3QA 1IXCA 4GXAA 1D9YA 2OZZA 4P0IA 4EF1A 3WAEA 1P1WA 2XXRA 1N7WA 3BFTA 1A7LA 5AA2D 1B0LA 2Y7PA 4NTLA 2RC8A 3MW0A 2M8CA 5ICQA 3LUYA 1QKBA 4FORA 1POY1 5TP9A 3T96B 2I0CA 1B46A 1YPNA 4N6PA 4RY1A 1NFTA 2B65A 3FJGA 5H8QA 2F5XA 1NNFA 2HAVA 3U72A 4O3AA 4Q5TA 2PBWA 1JETA 4YB6A 1MQDA 1I6QA 4DLDA 3TCHA 1MXYA 3IB2A 5JTYB 4IY6A 5A5XA 3W15C 3TQWA 3CG1A 1DPEA 3FIRA 1ZJLA 2AL5A 5I2KB 2REJA 1MY4A 1QVSA 1B52A 4GF8A 4I9DA 4QFKA 3IX1A 4XIGQ 1OLCA 3FXUA 4GLIA 2IEEA 4Q8RA 2O51A 2I49A 3C4MA 4QFOA 4FE8A 1DTZA 2O1LA 4ZEIA 3SEVA 1I6BA 1HSLA 3OSQA 1B3FA 4H0WA 4DXCA 3LSWA 1QUKA 2VP1A 4L17A 1SI0A 3CVGA 1B3GA 3PUXE 4QFNA 3ILTB 4DXUA 1R6ZA 4F2OA 3OXNA 1B4HA 3HV1A 1A99A 2DVZA 4OFJA 4QSDA 4MH5A 1SW1A 2F7BA 1MY0A 3KOTA 1Y1ZA 1PBPA 5H8HB 3OO9A 4JSOA 4M1VA 5EYFA 3LSLA 4LONB 3H4ZA 1AOVA 4JWXA 2Y7KA 2Z8DA 1N7XA 2AIXA 3IO6A 3SERA 1LAFE 1LGBC 4P11A 2XHDA 4F39A 5CI5A 3ECRA 4PP0A 2QS4A 3HHGA 1DSNA 1MXXA 1PB8A 3GXAA 2XXHA 3EPEA 3VVEA 3UA8A 1P1OA 1B4ZA 1TFDA 2DYXA 2E0SA 2RINA 1B3HA 4OQOA 1LAXA 3PUZE 2AL4A 1N0TA 4G4PA 4OFOA 1DOTA 4G68C 2H4IA 2Z23A 4DE8A 3TTMA 1VR5A 3PMVA 4N13A 3K01A 3ZSFA 3KGCA 5L8DA 1N84A 3SEWA 1AH5A 1M5DA 4P0GA 2RCBA 2D21A 5HPQA 3KN7A 2VOZA 4G68A 2DXYA 1H45A 3K1MA 2Q88A 4OEUA 5I57B 3MZBA 1SD3A 4U4SA 1JW5A 4GXSB 4GFRA 3VVFA 3TUSA 1TT1A 1Q35A 1FW0A 3ZKKA 5DT6A 4JDFA 4OERA 2ZNTA 4RJZA 3JYRA 4ZEFA 3K1PA 4LQ5A 3OOAA 3VV5A 2ONSA 1ANFA 1LCFA 2O6AA 2ONRA 1NNTA 1USYH 1A55A 4U22A 4PFWA 2F8DA 1MXVA 2Z8EA 4GL8A 3OD7A 4TLLB 4KYSA 3C36A 3EN3A 2NVUB 3EHUA 3TCFA 4E0XA 4F1UA 4NF5A 1KWHA 2ONKE 1ELJA 2XX9A 4UA8A 1UIVA 3TDJA 3H6UA 3BFUA 3TELA 3OENA 5TPAA 3MJNA 3FV2A 4H65A 2UYFA 3UK4A 3Q26A 3CRBA 4LUBA 3M3LA 4WXJA 1PB7A 2I0BA 3KG2A 1UQWA 1NNPA 3KFMA 3V8XB 2WKYA 1FQFA 3FUZA 1R9QA 3B6WA 3MUQA 4U1OA 3K4UA 4FEDA 1Y20A 5IKBA 1WVJA 4RK9A 3H03A 2F35A 2CZLA 1IUDA 2DE3A 4QSEA 2ZXTA 3G3IA 3FV1A 4H5GA 5KDTB 1MG1A 4POXA 5F7VA 1MQHA 2DXRA 3K00A 1UTBB 4FIMA 4KPTA 4LVQA 2B3BA 3O97A 2Y7IA 2V93A 4GVOA 3RY3A 3S9NC 1B5HA 2OWTA 2VHAA 4JB7A 3SEXA 4G77A 2P1SA 1EH3A 3VFJA 1MXWA 4ESXA 3IOWA 1H43A 1HSJA 4HCYA 3H6VA 1OIBA 5EHSA 4G8NA 1MPCA 3FJ7A 4BDMA 2X26A 2HQ0A 3OO7A 5CBSA 1PC3A 4OWDA 1AL3A 3K6WA 1ZIUA 4KCCA 2YPNA 3QAXA 2CMOA 1Y9UA 5JTYA 3U93A 3TQLA 4DZ1A 3R6UA 1AIVA 4QSCA 5I2KA 5FTIA 2HXWA 3Q25A 3KSJA 4KD5A 4TQUQ 3PPRA 5FTHA 2RC7A 4DIGA 4ZZAA 1IZ1A 4BDLA 3H6WA 2PT1A 3Q27A 2Q89A 1FTOA 4RPOA 2QSXA 3LR1A 1ZKBA 1H3DA 4YB7A 3O66A 1N3WA 1AMFA 1MDQA 2A5SA 4YU0A 4F1VA 5I58B 1YCJA 1MQGA 3O6IA 3U92A 2GH9A 3ILUB 3PMWA 4RA1A 3VLVA 4TOZA 2KLFA 3RLFE 2PMSA 5TU0A 3U1OA 1NL5A 5M2VA 2ZYMA 3TKDA 5H8HA 1MY1A 2ANJA 1B5JA 4OXVA 1LFIA 4DCYA 1JNFA 2F78A 4YKJA 4C1TA 4G8MA 1MS7A 2DWIA 4DDDA 1QW0A 1YAEA 5CBRA 4LP2B 4OTEA 1IEJA 3RTFB 4F18A 5I56B 1XT8A 3TPAA 3DELB 3K2DA 2I48A 3T9HB 3IO4A 5L9SA 3T22A 3EF7A 2VD3A 3O6HA 3K1NA 1IXIA 4JWYA 2XD3A 2RKMA 1ZLQA 3T9VA 2F97A 3RQTA 3CG3A 3RT8A 3ONMA 2GHBA 4NMYA 4F3PA 4R6KA 4JWOA 3FGSA 5L9OA 3QUJA 3JZJA 2PVUA 3PU5A 2QPQA 4I62A 1MM7A 2DE2A 2XD2A 4H67A 3LBSA 1I69A 4F29A 1O7TA 3EHTA 3HO7A 1ZMGA 3TAJA 2THIA 3TZAA 2V3QA 1HSEA 4N07A 1Y4CA 2UXAA 4G2ZA 1BLFA 4QF9A 3IR1A 5ITPA 4YKPA 4YZZA 5I57A 3A3UA 4KCDA 5K2YA 1A8EA 2QS2A 2DSFA 1QUJA 2QJEA 4GQOA 4ELPA 4U21A 2A5TB 4HCWA 3FATA 3C32A 4I1DA 2I58A 4QHQA 3A3CA 4H6DA 1JVYA 5I84A 2DWAA 4YMBA 3QSLA 3T93B 3B6TA 3FVNA 3GZGA 4IB2A 3B6QA 1SI1A 1LAHE 3T9UA 2VD2A 1CB6A 2FA7A 3PMXA 1D3KA 1GV8A 3VLWA 3JV9A 3GBAA 3DP8A 1MH3A 1F9BA 2NXOA 3CI8A 3CFXA 4EQ7A 1D4NA 4OETA 1MH4A 2RC9A 4THIA 2Q9TA 2F7CA 2QRYA 5JK4A 3OELA 3VE1B 3PGFA 4X1BA 1II5A 3C33A 1B1XA 1XHYA 4NF4B 1EZ9A 4ESWA 4XTCQ 3G7WA 1BTJA 2QS1A 3FVKA 1EZPA 3MP8A 2XX7A 3OSRA 1MXZA 3KN8A 2OWSA 3SEYA 1RYOA 2O1MA 3O29A 1R1NA 1SDXA 3PUWE 3MVWA 4R9GA 4R2BA 2NWJA 5KDTA 2DOJA 3PD9A 2H9BA 4G8HA 3MP1A 3OO6A 3RN8A 3SETA 4X1DA 1UTBA 5KZTA 3G3HA 1TXFA 1FQAA 4RNSA 5CMMA 5CMKA 2D5WA 2V25A 5AA3A 2X7PA 2ALUA 2XXIA 3Q28A 3T66A 1JVXA 3TTNA 3BKIB 1QKAA 3WAFA 1QJMA 3K0VA 4JXIA 4NF8B 3R26A 4KFQA 3VDFA 3N26A 3VVDA 1TFAA 1FTKA 4JBZA 1B6HA 4HTGA 1SW5A 2QL3A 5F1QA 4KI0E 3P7IA 1UTHB 5ISUA 3I6VA 3I5OA 4GL0A 4X9TA 5H8FA 1IITA 2Z8FA 4QFLA 4C1UA 1JEUA 3QYTA 5CMCA 3TYHA 1FQDA 3VXBA 2I3VA 4Z7EA 3KN3A 1N76A 4EDPA 4ELOA 4YB5A 1OVBA 3G3GA 3FASA 4Q30B 4ZECA 3PD8A 3MAMA 4R9FA 2HCAA 4XKPA 3M8UA 4ND9A 3SEUA 2Y84A 3O9PA 1B9JA 4IGTA 4ZDMA 2O7IA 4LZ5A 3IB0A 2OJTA 3QUFA 4HS7A 3K6UA 2RCAA 3HN0A 4YAHX 2F6PA 4ECFA 3G3KA 3N6TA 1IIWA 3QIMA 5DVJA 2Q2CA 5I58A 2DS9A 2DWJA 4IO6A 1O64A 2UVHA 3MVXA 3K6VA 3FZVA 4GIZA 1J1NA 3D4CA 1VFEA 1DMBA 1EU8A 3PUVE 4QFPA 1QULA 4H1XA 3IB1A 1LB9A 5CMBA 2R71A 3I3VA 1YTVA 1B32A 1XS5A 4OVJA 5I56A 1P1NA 2B3FA 1B05A 3IOTA 1NMUA 1P1UA 3G3FA 4OESA 3E13X 3K02A 2P2AA 4PFUA 5I2NB 4U23A 5J1DA 1FQEA 3DLNA 1MY3A 2VGQA 3F11A 4EXKA 3PV0E 1OVTA 3ODBA 1NKXA 3OO8A 1NH7A 4K3FA 5H8FB 1FQBA 1SW2A 3H3GA 4ONYA 4RYAA 3KJTA 2OBGA 4FAJA 3S9LC 1B3LA 5ITOA 3CFZA 1Y1MA 4E0WA 4TLMB 2G93A 4KYEA 1JEVA 2F7AA 4NE4A 3K6XA 2QS3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3N6UA 4XKNA 3GBBA 3IOVA 3IORA 3W9WA 5I59B 5KCJB 2QFLA 2PT2A 2GHAA 2BJJX 5DEXB 1B40A 4O3BA 3RNNA 1LBZA 3MBPA 5JEIA 1US5A 1XOCA 4GOTA 1VFDA 3E78A 1MPDA 4WEPA 1IQ7A 5FHNA 5DYHA 4BDNA 4ZZEA 1VE4A 1BP5A 1RYXA 4EXLA 3GLBA 2VPNA 5F24A 4EF2A 5EQ9A 4YKKA 4H46A 3DP6A 5AA4B 4WEDA 1UIUA 2UYEA 2QMXA 2O7UA 1R9LA 3QMFA 4P47A 4O3CA 2E1SA 1Q1KA 1BKAA 2CZHA 5H8SA 4OYVA 2XXVA 3TTKA 1B5IA 1WODA 1ATGA 2ZNUA 5IGAA 1LBBA 4X8RA 1GGGA 3HHFA 3KBRA 1S50A 5I5PA 4WKMA 2DWHA 4PAKA 4H8JA 4C0RA 2XXUA 1LFHA 5B7DA 4LQ2A 2ZYKA 5TP9B 3L6HA 3UGWA 3IAZA 5H8QB 2YLNA 3C35A 2RF1A 1DCUA 4ZEDA 1DPPA 1PBQA 5CM6A 3VLUA 1LCTA 1ZTYA 4P3LA 4U4XA 3MPLA 3OEKA 2H99A 5AA2A 5LOMA 1NH8A 2I3WA 5EYGA 2UVIA 5A5XB 3MC2A 1FBEA 3CHGA 2GRVA 2YJPA 2R9JA 4JSDA 1A40A 1A8FA 1NNKA 4R6HA 2Y7RA 2F36A 3MSTA 5I2NA 4NN3A 2H98A 3UIFA 1M5CA 4FJPA 4OMBA 4RK2A 3C9HA 2AYSA 4NWDA 5AE4A 1IMEA 1USYE 3SZPA 1LSTA 2O68A 1URSA 1NV7A 1TWYA 4PBHA 1IXGA 1RKMA 5IZZA 5EQAA 1SYHA 4PCDA 4IO2A 1NV5A 2Q8JA 1GR2A 3TTLA 4DCXA 4ELRA 3V83A 3TTRA 3W9VA 2Z22A 1OQHA 3R7XA 3PUYE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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