2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
3JV9A 3KJTA 4R75A 3MVWA 3C35A 1GV8A 3M3KA 3IL1B 2DS9A 1MY1A 3TPAA 1N7XA 2A5TA 5FTIA 5TP9A 2ANJA 4U21A 5CBRA 1USYH 4XTCQ 3USDA 1MQJA 2OK2A 1FW0A 4I1DA 2UVGA 5HBCA 4AB6A 4G8NA 4XXUA 1IXCA 2UVIA 4IO4A 1KWHA 4ZE9A 3FUZA 2O68A 1SW4A 4YB7A 1H45A 2DXYA 1JW4A 2PMSA 2M8CA 4ELPA 4JWOA 4F18A 1FTJA 4ZECA 3FV1A 1POY1 4O3BA 3CSBA 1B1XA 2PYYA 5K2XA 5IKBA 1N0TA 1I6AA 5H8QA 4KFQA 3QUJA 4E0WA 1B0HA 3VE1B 1GGGA 3H3GA 1MXWA 2XD3A 1JW5A 2VD2A 4HW8A 2G29A 5KZTA 1NFTA 4JBZA 2AL5A 1VFDA 3V83A 3VV5A 3K4UA 4FE8A 2OJTA 3KBRA 1SI0A 3RTWB 4C1TA 4POWA 5H8NB 2H99A 2Q2CA 1N7WA 1OVTA 2H4IA 4R2BA 2O7UA 2XXTA 5EHSA 1SW2A 3GBBA 4U4XA 4GXAA 4R9FA 2O7IA 1ZTYA 5M2VA 3SEVA 1MXVA 3E4RA 1B5HA 2O69A 1R9LA 3MZ1A 1LLSA 1I6BA 5DEXA 1RYXA 1LAGE 2IA4A 5KDTB 4FEBA 3TAJA 1MXXA 4G8MA 1JW1A 1ZBMA 1JEVA 2Q89A 2G93A 2QS4A 3VXBA 3V89B 1IXHA 3K1PA 5ISUA 4GXSB 4M4GA 3UP9A 3IO4A 4JSDA 1B6HA 3DP4A 2Z22A 4ISUA 3HHGA 3RTFB 3RUMA 4WKMA 3TQWA 4DXBA 1B3HA 3OD7A 4ESWA 1US4A 2HZKA 1QKBA 2V3QA 1MM7A 2RKMA 5ITPA 5I2KA 5KCJB 2QRYA 2RINA 4QSEA 3S4UA 2F7CA 1B5IA 4NEDA 3JYRA 2HAVA 4Q5TA 3QIMA 1QUJA 5I2NA 1AOVA 1NH7A 2ABHA 1WVJA 4F2QA 4IGRA 1Y1ZA 4OYVA 1PB8A 2R71A 4OMBA 3IJOB 5HM4B 2F7AA 3T9HB 4G4PA 3UN6A 4QFNA 2YLNA 1B3EA 3ONMA 3KN7A 5K2YA 3R26A 3ZS6A 2F35A 1HSJA 2Y7IA 3IOWA 3KZGA 2REGA 3FATA 1OLCA 4HTGA 1D9VA 4QFLA 5ICTA 1WDNA 4H67A 3W15C 3S9NC 3CFZA 3OOAA 2DP8A 3OEKA 3G3HA 2VHAA 3ILTB 3PV0E 5A5XA 3HO7A 3TTKA 3OENA 4H5GA 3IOTA 4POXA 2FNCA 3VLWA 4LQ2A 1IXIA 2Y7WA 2V3TA 3SESA 4O3AA 1Y3NA 3QUFA 1VFEA 5AE4A 2UVJA 2GH9A 3FJ7A 3FXRA 2ALUA 2THIA 3RQTA 2DOJA 2V25A 1XHYA 2HCAA 3H4ZA 2O6AA 3GBAA 1YAEA 3TTNA 4OWDA 1XVYA 3MP8A 3FXQA 1CB6A 3H6UA 3LSXA 2XXUA 3SEWA 1OIBA 3N6TA 1O7TA 2Z8FA 3K1MA 1Y1MA 4QFPA 1ATGA 1B4ZA 1P1WA 4EQBA 4TOZA 3IX1A 1L5TA 2O51A 4YKJA 5H8SA 5I57A 4NF5A 4R74A 1FQBA 2PX1A 3EN3A 3T22A 4X48A 1MY0A 1D9YA 4NTLA 1QUIA 3TCFA 4R72A 3H06B 4OENA 3M3LA 3PMVA 5B70A 4GD5A 5L8DA 4QSDA 3TTMA 5TU0A 4FATA 2F78A 1Y4CA 3TEPA 2VP1A 2Z8DA 4YMAA 3RT8A 3O9PA 2NXOA 4GF8A 1P1UA 2XXWA 3SEYA 2F97A 4Q8RA 3R7XA 3A3UA 4RYAA 4LZ7A 3GXAA 1QUKA 3RPWA 2DVZA 1MDP1 3IOUA 1EH3A 4XKQA 5JTYA 4JWYA 5EHMA 2ZYNA 2Y7PA 1URSA 3T66A 3K00A 1GR2A 3O2AA 3K01A 1M5EA 2D21A 4GOTA 2RCBA 1B1HA 4P0IA 4RNSA 4G68A 1Y3PA 4DIGA 4F29A 1JQFA 3CVGA 4KHZE 3KSJA 3ILUB 4K3FA 2XXQA 1MPDA 3O29A 3SDFA 2P2AA 4M1VA 3RLFE 4FORA 4TQUQ 4QSCA 2WKYA 5KDTA 3TQLA 3EHSA 3BFUA 4U23A 1BTJA 4UA8A 5LOMA 3OO8A 2RC7A 5I59A 4GL0A 1FQFA 1A40A 4QFKA 3ZKLA 1YTVA 2GHAA 1FTMA 1LBCA 4XIGQ 1LFGA 2E1SA 1D4NA 4LZ5A 3C33A 2I58A 2ESNA 3LBSA 4R6KA 4GFRA 2QS3A 4ND9A 3KEIA 1PBPA 3IB2A 1QW0A 3CRBA 5KCJA 5I58A 1SI1A 3CR9A 3V8XB 1UTHB 1CE2A 1II5A 5DT6A 3TCHA 1P1OA 3O6HA 1BIYA 4OXVA 3MW0A 3B6TA 1OQGA 3TFLA 4RK2A 3FVNA 4NF8B 5EYFA 3K6VA 3S2VA 3KN8A 4F1YA 1N3XA 1NNKA 3MBPA 3KOTA 3TKDA 2ZYMA 1SYIA 3DM0A 4QHQA 3FVGA 1URGA 2XXRA 1MPBA 5ITOA 2R9JA 3H6VA 5DTBA 1BP5A 4ZEIA 2OBGA 3DLNA 1MQDA 1S7YA 4H8IA 4U4SA 2DWHA 1Y4TA 3S9EA 5DYHA 3C31A 3B7DA 2UXAA 3DELB 4NF4B 2YPNA 1NH8A 3AXFA 1Q35A 2F5XA 1R6ZA 1D3KA 3RNNA 2RF1A 3N94A 4ZEDA 2HEUA 4DCYA 3S9MC 4KQPA 1N84A 5H8FA 3MJNA 4H8JA 3CFXA 1MXUA 2ZNUA 2PVUA 3RY3A 4R73A 3Q26A 2D3IA 1YCJA 3DP6A 5CC2A 4C0RA 3N26A 3I5OA 1GVCA 3SEUA 1XC1A 2I48A 4OHNA 4PFTA 3PPNA 4N13A 3VFJA 4XKPA 5I56B 2A5SA 3A09A 2OCUA 5H8HA 3CIJA 5I84A 3BBRA 3IOVA 4Z0IA 1LAXA 4BLAA 3BFTA 1UIUA 4OFJA 3IO6A 2OWTA 4KYEA 3UGWA 4U2RA 3FXUA 4LZ8A 4OERA 3TCGA 4BDQA 1LB8A 1UIVA 1XOCA 1DTZA 3IB0A 3RGYA 5CMMA 1SW1A 3DP8A 3FD3A 1UTBB 4Z7EA 4NF6B 3G3GA 3MPLA 3T9XB 1MG1A 1JNFA 4U1OA 3MVXA 2B3BA 4YKPA 1JETA 1A8FA 3MVYA 1FTLA 3TODA 5AA1A 2GFEA 4LP2B 3WAEA 2NUVA 2P0SA 4DZ1A 1EZ9A 2Y7RA 3L6HA 3WAFA 2DSFA 4I8CA 1B7HA 2XXVA 2QMXA 5J1DA 4OTEA 4I9DA 1JVYA 2I0BA 3Q28A 3C36A 1B9JA 4TLMB 4IY6A 4ZEFA 3SEXA 2V3UA 4ESXA 4F3GA 1B51A 1SVXB 2P1SA 1MDQA 2A5TB 3TYHA 5TP9B 1XS5A 3OXNA 3VVDA 1MH3A 4GRKA 3OSRA 1A55A 5AA2B 2DE3A 1LAFE 3SKPA 4NWDA 2IEEA 1AH5A 1IIWA 2DVCA 3ECRA 2W7YA 4YZZA 3MZBA 4YAHX 4PE5B 4HCWA 1A8EA 1EZOA 3MZ9A 1A99A 2DE2A 1B7UA 1SDXA 2FYIA 2CZLA 2UVHA 4YU0A 3T96B 1HSEA 5H8QB 4H65A 1NKXA 5CMKA 2HAUA 4EQ7A 1N76A 3OO9A 1F9BA 2X7QA 2B3FA 1EZPA 4GL8A 1NMUA 1B0LA 2ONSA 3VDFA 3I3VA 1VR5A 3THIA 1OQHA 4PQJA 1SYHA 1PB7A 4GIZA 4LATA 3P7IA 4FJPA 3UA8A 3BKIB 2H98A 5IAIA 1BKAA 1VSOA 2PT2A 4OEUA 1FTOA 4AQ4A 1URDA 4OVJA 4DXUA 1TXFA 3Q25A 3K1NA 2KLFA 2F7BA 3EF7A 4PFUA 1DOTA 2HFBA 3G3FA 2Z8EA 3VXCA 2B65A 1B3GA 5DEXB 4U22A 4N07A 3U8QA 3CSGA 2FA7A 2XXXA 1MRPA 1SD3A 3T93B 2X26A 2OWSA 3E13X 4H6DA 4JB7A 1H43A 1ZKBA 3G3IA 3LR1A 4PP0A 3D4CA 1O64A 1XVXA 4ZEBA 1FCKA 3PUXE 4NE4A 1OLAA 4KYSA 2E0SA 1I69A 4X9TA 2NOOA 1QKAA 1IUDA 3GZGA 3G3KA 4ZS9A 5HPQA 2F36A 4E0XA 4GQOA 4JWXA 4F19A 1ZU0A 4JXIA 1B7ZA 2XXHA 5H8NA 1IEJA 4F3BA 3MC2A 2ONRA 4F1VA 1B3FA 1VE4A 3G7WA 1NNFA 1JEUA 4ZDMA 3ZSFA 2DE4A 5I2NB 4OETA 5CBSA 1EU8A 3FASA 4F3PA 1MY4A 2ZYOA 4PETA 3KFMA 2V93A 2I49A 3UIFA 4NWCA 2I4CA 1IQ7A 3VLUA 1LAHE 5CRYA 1XT8A 1TFDA 3PPOA 1PDAA 4KR5A 1S9TA 3PUZE 2I6EA 2VOZA 1UTBA 3OELA 3T9VA 1ZMGA 4NF6A 2PT1A 2OZZA 3C4MA 3IK6B 4EF1A 2DQVA 1B05A 4H0WA 3A3CA 3E9XA 4BDOA 1AIVA 1PB9A 4N6PA 5A5XB 3ZKKA 5JEIA 3KOSA 5ICQA 1LCTA 2QJEA 3VVFA 2Y84A 1NL5A 2NVUB 5L9MA 1Y20A 4IO7A 1US5A 1MY3A 1TT1A 3HV1A 3IJXB 2BJJX 3T9UA 2PBWA 1R9QA 4G77A 4R6YA 3PD9A 3CG3A 4P0GA 4MLQA 5FHMA 3IR1A 5BUUA 2O1MA 1LFIA 4IO2A 1H3DA 1B52A 1FTKA 4F3SA 1MQIA 3PMXA 4JSOA 1GTKA 2QS1A 4DLDA 2O84X 2REJA 1MXZA 1ZIUA 3FZVA 4F22A 2UYEA 3CI8A 2RC9A 4L17A 4AB5A 2Q2AA 3TELA 5AA2A 3U1OA 5I57B 4R6HA 2F34A 4NF5B 2VD3A 3MQ9A 1PBQA 2VGQA 2HQ0A 1JVXA 4DXCA 3L6GA 3O6GA 4X1DA 2UYFA 4C1UA 3R6UA 2F8DA 1H76A 1MY2A 5B7DA 4LQ5A 1MXYA 2F6GA 3N6UA 3FV2A 4ZEKA 3OEMA 3U94A 1P99A 2QSXA 4Q30B 1P1NA 4RPOA 4ECFA 1T0KA 4BDNA 1FQDA 2Y7KA 4F2OA 4G8HA 4EUOA 2GHBA 2ZYKA 4OFLA 1QVSA 4H1XA 5JTYB 3QXMA 1OVBA 1O63A 5CMCA 4MF3A 1B3LA 1SQYA 3IB1A 2HXWA 2XX7A 1B2HA 4ONYA 3Q27A 1H44A 3Q29A 4H5FA 2DYXA 3HPIA 3OO7A 2I4BA 5AA4B 1ZLQA 5FHNA 5AA2D 4G68B 1QULA 1A54A 4R2FA 4F39A 2H5YA 1YPNA 3I6VA 3M3FA 4QFOA 2H25A 1TFAA 2X7PA 1Z7ME 3PD8A 2YJPA 4FAJA 3PPPA 4MFIA 1FQAA 3U72A 1ZJLA 1N04A 3TUSA 3TMGA 1DMBA 2Q8JA 5FHOA 2XX9A 3ODBA 1J1NA 5TPAB 3N5LA 4MLVA 1S50A 1AMFA 2Q88A 4YB5A 1Z7NE 4TLLB 3UORA 4LONB 4IO5A 4UACA 4YKIA 1P1QA 4OFOA 3OO6A 4RPNA 4RA1A 3G3JA 1MPCA 3CFLA 5I59B 4ELRA 4YICA 2DXRA 4O3CA 3HSTA 4IB2A 4PFWA 4WXJA 1LBBA 3FJMA 1MM6A 2AL4A 4PFYA 3LSFB 4MBPA 3K6WA 3HN0A 4ELQA 3H6WA 4RK9A 4YMBA 4G2ZA 3HHFA 3O66A 4EF2A 2XHDA 4GWOA 3MVZA 2RC8A 5I58B 1R1NA 1LSTA 2I3VA 1ANFA 5ELVA 1I6QA 1WODA 2NWJA 2R6GE 3EHTA 2DWJA 3SERA 2XXPA 3KG2A 4HCYA 3MP6A 2F6PA 3C9HA 3H7MA 3TZAA 3MAMA 5JK4A 3FIRA 2V84A 4X1BA 4F31B 3K2DA 1N3WA 2CMOA 3TDJA 2I0CA 2QL3A 4FECA 3QYTA 4KI0E 4ZZAA 1LB9A 1M5DA 3EPEA 1MS7A 4OQOA 1M5CA 1RKMA 3LC8A 4EXLA 4BDMA 1MH4A 3FGSA 3U93A 4F1UA 3IORA 3SETA 4IY5A 4EXKA 1AL3A 3JZJA 2XX8A 1FQEA 3PGFA 2O1LA 2XXYA 4WEDA 4I62A 4EDPA 4OEVA 1UTHA 5F7VA 2XXIA 4RXLA 4RY1A 3K6UA 1Y9UA 1B58A 5CI5A 4IO6A 3EQ1A 4YB6A 3W9WA 2AIXA 5DVJA 5H8FB 3U92A 3M8UA 1M5FA 4OZ9A 3RN8A 4NF8A 4KPTA 2Q9TA 3MUQA 3PUVE 3O28A 3MWBA 2QPQA 2Z23A 3O6IA 1POTA 1A7LA 2QMWA 4OESA 3H6TA 3K0VA 1Q1KA 3KJ7A 4U1ZA 4IGTA 5H8HB 4KCCA 1IXGA 3D4GA 3QK6A 1MQHA 4THIA 4LA9A 3PU5A 3K6XA 1PEBA 4MH5A 1B5JA 4Q0CA 1IITA 4GVOA 3PMWA 3TTRA 3VLVA 4FIMA 4RJZA 1NNPA 4NF4A 5BWJA 1B4HA 4QRZA 1B40A 3OMBA 3K02A 2ZNSA 4P11A 4YKKA 1DTGA 3GLBA 4NMYA 3MPKA 4HS7A 2ZNTA 3VVEA 1LCFA 2GRVA 3QSLA 1LGBC 4KCDA 3KN3A 3LSLA 3S9LC 1MQGA 2RCAA 5I2KB 2OLBA 4LVQA 4IO3A 1PC3A 2DWAA 2I3WA 3FVOA 2HZLA 1BLFA 3PPQA 4GLIA 2AYSA 4DCXA 5CMBA 3V5AA 3PUWE 4EQ9A 3IAZA 1USYE 5DVFA 5AA3A 5AA4A 4KYDA 5I56A 3PUYE 3UK4A 1SBPA 4ELOA 5DVIA 5L9SA 3TTLA 5FTHA 3B6WA 3KGCA 3C32A 1TWYA 1RYOA 1DSNA 3QAXA 3LUYA 1B32A 4G68C 2D5WA 1SW5A 3B6QA 4DE8A 3H03A 2XD2A 2ZXTA 4XKNA 1M5BA 3PPRA 1LFHA 4R9GA 4FEDA 3HCQA 4JDFA 1HSLA 2QS2A 5CM6A 5TPAA 3E3KA 2H9BA 4ZZEA 4LUBA 3EHUA 3RT6B 3KSXA 3FJGA 2LAOA 1Y3QA 4BDLA 1DPEA 5F1QA 2ZMBA 5L9OA 4BDRA 3OSQA 3O97A 2DWIA 3FVKA 1DPPA 4KD5A 1B46A 3W9VA 2ONKE 3LSWA 3MP1A 1ELJA 1FQCA 3CG1A 3C34A 4WEPA 4XKRA 1OMPA 1UQWA 4DDDA 1QJMA 4QF9A 3F11A 1NNTA 4ZE8A 1IZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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