3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Arabinosyltransferase C
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EP9A 3CBNA 1YFWA 3MIGA 4YW5A 5ISUA 5IVJA 5I2NA 3PVEA 3H8XA 1UY1A 1WMDA 1UPSA 4QPIB 4ASMB 4HVOA 4Y5TA 1O8SA 2ORZA 5TP9A 3SKVA 3KF5A 1UZYA 4QX0A 5EQ8A 4QXBA 3VV1A 5AA2B 2Q89A 1PX4A 2UY9A 1WLTA 3MW3A 1G9CA 2DE2A 4C1UA 5K8SA 2R9JA 3WT3A 2D44A 1SI1A 3FHIB 3HNYM 3MVYA 1ZRIA 4Z82A 4A2UA 3W20A 4IV3A 1DSNA 5EQ7A 2I0BA 3S7IA 3W58A 5EYGA 1FPLA 2V5YA 1ZYBA 3CHXA 1JZ5A 2UYBA 5AC91 1OF4A 3CVGA 2WZR2 4YPJA 5A70A 1BTJA 1N3WA 1MM6A 2WO7A 1RVF3 2OWTA 3K3NA 4PFWA 3FXRA 2VBBA 3OBRA 3WXPA 1RUI2 3R4DB 3ZN5A 4OENA 2G9GA 1H4HA 3O6IA 1RL3A 5JR7B 4HCWA 3OEMA 3O1TA 1XPWA 1NY72 4BDNA 1IS6A 3WX5A 3R4UA 4R9FA 3CR9A 1A40A 3MVZA 3OGRA 5F2SA 3AKTA 1PC3A 4IESA 1O3TA 1VALA 3VDBA 5A3MA 2QKDA 1KDMA 1AUYA 4OZXA 4POWA 2R16A 3ZFFB 2ZYNA 4AWDA 3K01A 1KD7A 4M4PA 2PBWA 1AVBA 3U78A 3PIJA 2HBTA 3RVHA 4HE2A 1ENQA 3NNGA 3PJQA 1D3KA 5DAQA 1K12A 1W2NA 1NUWA 2FDFA 1HSEA 3JQXA 1AR93 1NYWA 2I4CA 3DEMA 4Q0PA 1CAXA 1JW6A 4RK9A 4XDOA 3VLUA 4Y5SA 2QE3A 5IK7A 4YLZA 5AFEA 3BTXA 4AEJA 3DGTA 2OUHA 5FHOA 4COYA 5I59B 2NMNA 3WDWA 3N6TA 5F7VA 2B4LA 3H1WA 4H8IA 1LOBA 2GN3A 2ZMKA 2D6KA 5FPXA 5FP9A 3TEWA 1GSLA 3NNMA 1NV3A 2CWSA 4IV3C 2ZEWA 4QM8A 3IT8A 1RMU1 3KHCA 1XRUA 1LR5A 2H98A 4G9SB 1NUKA 2JX9A 5DG1A 4OUMA 1YEWA 1S2EA 3I2OA 2ZEXA 1ZZ9A 4RHV3 3OY8A 3ZDSA 4QFNA 5DZFA 2Q1ZB 2R0HA 1KDKA 2D3IA 1UU6A 5C4WB 3FZVA 2D43A 2ZEZA 4M01A 4P9GA 1B40A 1UZ0A 4QKNA 3FXUA 1MY0A 4YVSA 1SPIA 2Q2CA 4G8HA 4TLGA 1QXPA 4CEWA 3NV4A 3D1RA 1YJKA 4CP2A 1I6AA 1ZTYA 4IXLA 1MS0A 4B7KA 3HD8B 1GOGA 4WM7B 2Z69A 2F5XA 3OO6A 1H2KA 4XTMA 1WD4A 2DVAA 5FZ6A 5HPOA 1F5JA 1GZTA 2VZQA 1LENA 3P3PA 4XOGA 1SPPB 3VD5A 4F3JA 3J8F3 5FPAA 3WNPA 4NMIA 2JG8A 2GN7A 1ULGA 2EA7A 3H4ZA 5I0SA 1L7LA 4B4RA 5FY1A 4G61A 1SW5A 4OHWA 1EAH2 5E1RA 2X26A 2I07B 4FFFA 1VRH1 4CCEA 2RMU1 5GALA 4GMP1 2XD3A 4HL0A 2EAAA 1GV9A 4QQPA 1CONA 2AREA 1O64A 4AB6A 4CSWA 2XXXA 3MIBA 5A3WA 1AYN1 4X48A 2GH8A 4S2FA 4U4SA 2XBO3 1UL9A 1R9LA 4P02B 5L9RA 4TXWA 2XXQA 1TEIA 1NUXA 1FTLA 1VBE2 3PPOA 4HBNA 1I6BA 1DCSA 3NNLA 4P11A 5JOZA 1UX6A 4FTSA 2OLBA 4IR8A 5ET8A 4AZZA 3AJZA 4PFBA 4LP2B 4MNIA 3TWIA 1AR73 1ZZ7A 3PPPA 2RS32 3C2UA 2I74A 4DINB 3T66A 1ODNA 5CB7A 5ESYA 4ZS3A 3ECQA 2ZA9A 3EKIA 1US4A 5BV6A 4JWYA 1J1LA 1KXGA 1ODMA 2BNNA 4AHYA 1O3RA 3M3OA 4JDMA 1MQGA 3CG3A 1JODA 3RZZA 2LW8A 2ZTNA 3K75B 3OPZA 2RG4A 1JH5A 4JTNA 4L99A 1IZ3A 1FI2A 3VBFB 4IETA 4YICA 3A4UA 1IPSA 4QDQA 4YVSC 1WCKA 3IOTA 5CI5A 1WCDJ 4YGBA 2HAUA 4CEWC 3WSOA 3KN3A 2ZGQA 3VZOA 4JB7A 4MZUA 1S0GA 4E4DX 4JC1A 2XHNA 5IZ3A 3NAPA 4QDRA 1W8HA 1VBD3 2F6GA 3VVFA 1RUJ2 2DWIA 4CVUA 1HSLA 5CBSA 2WS91 3CJIB 4OANA 3BUCA 1UF2C 1UZWA 3Q8CA 3L6HA 3JZVA 2VTXJ 4D6QA 3G3FA 2P3KA 4U4XA 4RN5A 1ZBA3 2JG8C 5BNPB 2I3WA 3L9JT 4P00B 1J1TA 4XKPA 4P9WA 5DDJ3 1L3JA 1RUE3 1HDKA 3I7DA 1LBWA 3POGA 4LONB 4IEVA 4PLOA 4NAMA 3S9NC 3VDDB 4AVTA 1ZZ6A 3GALA 1FQFA 2ID4A 2QVVA 5L9MA 4QSEA 1Q8QA 4I3YA 1LECA 1FMD1 1PX3A 1FJ9A 1DBNA 3ZMOA 1FPBA 3RYDA 1H0BA 1A8DA 2CAUA 1VBC1 1V0AA 3THPA 5T3JA 3X29B 2RKMA 1DGWX 1W39A 3N36A 3QH6A 3LB9A 3GYYA 1BP5A 4DEQA 3TYJA 3O0VA 2OZJA 4NF4B 5FXXA 1UPIA 5A7WA 1B7ZA 4IEWA 4HPKA 5F1QA 1MH4A 4H3WA 2DVDA 4AI3A 3AB0A 2D5FA 1S0DA 1BVP1 3HO7A 1LOAA 3MAMA 4GKXA 5BUUA 1F9KA 5FP4A 1VBA3 1VMHA 1EYKA 4D8MA 4ISQA 5CMCA 1A55A 4UFIA 3RZKA 4DRVA 2IUWA 2YG0A 2YV8A 2XUEA 4AFAA 2IXKA 2FDHA 1QY4A 3MDPA 4FI9A 2XWVA 2RR13 2C9AA 3APBA 2P3NA 1QJY1 1MY4A 3KF3A 5H9SA 1D4NA 3UK9A 2HYXA 3ZXGA 3IFAA 5LRRA 3WEZA 3IB2A 4N07A 3WQ1A 5C6CA 3LPGA 3T09A 1ZBE2 2XJRA 4OXVA 2OWSA 3PMVA 1ZA7A 3S5QA 3CIJA 3SETA 3NAPC 2RM21 5FR3A 4O3BA 3RYKA 1G0HA 2BWCA 2NUVA 5FBPA 1BVVA 3LQCA 1I5PA 5LY2A 4AEMA 2GRVA 4IV1B 4I02A 5LW9A 4XKQA 4LBOA 2P34A 3UN6A 5DVIA 1MZFA 4B4PA 1O4ZA 2RJKA 1XHYA 1S0EA 1B9JA 4JQRA 5FZBA 1SLLA 4DDDA 2VZTA 4A3ZA 4LBQB 3EPEA 4CDWB 2JJKA 4Q4V3 1WVJA 3GZEA 1PO22 1LU2A 1LBCA 4F83A 2BJIA 2VMHA 2D5WA 2FIXA 1OFNA 5I2KB 3WNNA 1YI9A 3MIHA 2A6VA 3GZUC 2I4BA 3WG2A 2DP8A 1GLHA 2QUOA 4R6YA 1C8M3 1MEC1 3D8CA 3N3HA 4B7EA 3I3BA 3Q29A 3SLIA 5FYHA 4O9GA 5FZOA 2VZUA 4OCTA 4GJYA 3SEEA 4BJ0A 2QQKA 4PIYA 3WNKA 5LZ6A 5ICTA 4QPGB 5L9BA 2JKXA 2J1AA 4BDOA 3AZVA 3PD8A 2QQMA 2XOMA 2BJSA 2UYAA 3UYJA 4GWNA 1IS4A 4KU7A 4OQOA 1QEXA 4DXRA 3TCFA 3RG0A 1SLBA 4FP2A 4LHKA 1NI9A 3QLQA 4N53A 1FV2A 1UN1A 3RZGA 5FK8A 3ABZA 1FTOA 5DQ0A 1PZ9A 4OVQA 3TELA 2O84X 1QJX2 4QRZA 4R9GA 4KGQA 4ESWA 2E9QA 2BFUS 5C5TA 3A0NA 5E16A 2Y6GA 4H0WA 5GLWA 4PBQA 1KA1A 5A6ZA 5EJ1B 4RNSA 1BLFA 1MXXA 1UIKA 4UYBA 1FRPA 4ITCA 3FZ3A 2DFBA 3OEBA 1JYTA 5FOBB 1PB8A 1RIRA 5LBCA 1W6NA 4AHXA 1N47A 2HZLA 4CDUC 2X7QA 4GJZA 5EHSA 1EV12 4NN0A 1ZRCA 2AL4A 3AP7A 1O3QA 4BB3A 4UFHA 5FZHA 2VNGA 4C0BA 2P0SA 5KDTB 5L7OA 1GGGA 3H8UA 1RYYA 2V09A 2BZDA 4QSDA 1F5FA 2BU9A 4HVQA 1N1YA 2B5HA 3EQEA 3MBWA 5SV8A 5FXZA 5FV3A 1RDXA 1Y9QA 5HCHA 2GHBA 1LCLA 2VCMA 4BDQA 2ZOEB 3TN92 2QMXA 2UVIA 5A3TA 3DYMA 3VVDA 4D3WA 3RZJA 1YNAA 1PGW1 5FYCA 1W6QB 2Z8EA 1NLQA 5D8AB 4QX2A 5APAA 3PUAA 5LA9A 2BWAA 3FASA 4Z0IA 4RA0A 5LTCA 3K51A 2WNUA 1CPMA 4AK3A 1RKMA 3QCWA 1R6ZA 4AHZA 3ZSKA 3UP9A 4YZ5A 3ZKYA 4NF6B 1URDA 3T2QA 1R091 2VMFA 2ET1A 3AYDA 4COVA 2ZHMA 2SBAA 3DP6A 3E9XA 3K4ZA 5C71A 3PD9A 1RB8G 4NAOA 1F9BA 3G3KA 4XDPA 4Q30B 1Y3NA 1SDXA 4PGPA 3UT0A 2XVGA 1WCUA 4RQPA 2G4IA 2VW1A 4D69A 5H8QA 4BYYA 2GNDA 4N53C 5JEIA 4KWJA 2YBSA 2ZMLA 1SZBA 2H25A 2F7BA 5DVFA 1RUG1 2VD7A 3M3QA 3MI8A 4KG8A 1Q35A 4PGNA 1S55A 1XU1A 5FZ7A 4KCDA 4H6DA 5FWJA 5FMOS 4G77A 4NIAA 5KC6A 1D4M2 3GM8A 3OOXA 4CUCA 3AMPA 3KZ4C 1RUC1 5K0UB 1RUH2 4DUXA 1L7QA 5C3QA 1QOOA 3DECA 4A44A 1B3GA 5DYHA 3FC0A 3DF0A 3M4FA 2XX7A 1JYNA 1A34A 4KQPA 1NNTA 3WD5A 5KBFA 4O8MA 1JZ6A 1FOD2 4PJYA 3EMRA 4CZSA 4YZ4A 5L7OC 2GP3A 2PLV1 2VQTA 1GZ9A 3THIA 2ZBJA 3ZIWA 4CDQA 4TLLB 1COV2 1GV8A 4RD7A 1B05A 3LZZA 4R75A 1M5BA 2WABA 4UT5A 3IOVA 5AFBA 2PELA 1JYXA 2I2SA 4CCJA 3HHFA 4IEZA 5FY9A 3QYTA 1YFYA 4P9YA 2WNUC 1URXA 1BKAA 2J1VA 3TEYA 2BVVA 3EJKA 3OUHA 1KGYA 1UTBB 2ZHNA 2R6GE 3OSRA 2B42B 4W6WA 2XG3A 5JIAA 2XL9A 4GH4A 4BH9A 2FD8A 2E7QA 4G8MA 4OI1A 2QQPA 2ZZQA 4K3FA 1TZOA 4HSJA 4D7YA 4FP3A 1RUNA 1H43A 4W65A 2R043 4L97A 2YU2A 2Y7RA 1NV4A 5CM6A 4H45A 1CAWA 4F2OA 3V64A 4RQPC 2RHPA 1MS9A 4DXSA 3O2AA 1OHFA 3O5SA 1QQP1 1HXS1 4L2NA 5EHDA 2XGXA 5T5LA 3IDEA 5FZ1A 1AF9A 2IVIB 3MZ9A 2Q8CA 2ZX4A 1EY2A 2JG9B 3GCWA 1FSAA 5ET6A 3VD9A 1C5IA 4XFAA 4LE4A 1NCRA 5K2XA 1UX7A 3IJOB 2JDYA 3MF6A 3RS6A 4LIUA 1V6NA 2J22A 1Y4TA 1JTZX 4M3CB 1TVGA 4OQ8A 4OYUA 1PZ7A 4UOJA 3E6DA 2V4VA 1UAIA 2ERFA 4MSVA 1PO13 1MACA 4YB6A 5F37A 1FJ6A 5CFCB 3IO4A 4WM8A 1JEVA 3TEXA 4AFCA 4AAXA 1CWPA 1YJLA 2R7EB 2REGA 3GXAA 1DMBA 3LSEA 4BOWA 4AS5A 2WT2A 2Y5KA 3B00A 1OD5A 2RV9A 1YQ8A 3VBOA 2THIA 1BCXA 4ZONA 2XD2A 2WX9A 2VD3A 1VB4A 1MQJA 4KL1A 2PHLA 2F36A 4Z7EA 4EZHA 3H7MA 3IB0A 4CDQC 3S2VA 2ZHLA 1MY2A 5GLTA 3HEIA 1H4GA 3POYA 2BGPA 5TPAA 5F2WA 5FY7A 1DOTA 2E6VA 2P3YA 2IFRA 3AYCA 2X10A 4BQ1A 1I69A 2OZ6A 2WFF2 4DZ1A 3FN9A 2B8MA 1HRI1 4Q4Y1 2G19A 2AH2A 3KGLA 4TOZA 3UJOA 4GH4C 1A8MA 2F4PA 2OYZA 4MH5A 2Q30A 4AQ6A 3T3YA 4BQYA 4GX3A 3I2IA 4LO6B 4X9TA 2CEYA 1AR83 3CLPA 2KQZA 2CZKA 1AR62 2YC0A 2W5FA 3MC2A 2V72A 1JYVA 4EF2A 1J1NA 3H6VA 5FUNA 4K8RB 4ZY9A 2VZSA 5I5PA 4Q5OA 4YM1A 4BK5A 4LBNA 1X50A 5ITPA 1U5IA 4AVCA 1VE4A 4RA1A 4R9DA 3OBZA 2VOXA 3WVJA 2M8CA 3VKOA 5I56A 2E7AA 1V6OA 2ARCA 4CCCA 1NH7A 3OXNA 1J3PA 1B3FA 3BI3A 4KU8A 1ENSA 5H9PA 3FV1A 2EF6A 2I58A 4WEPA 1JOBA 2VNVA 4IGOA 3NJXA 2DURA 2ZNTA 1WBFA 1NCRC 3O0WA 3OPWA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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