4FECA

Crystal structure of htt36q3h
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 120
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fecA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fecA02
3IOTA 3SKPA 1GR2A 5H8SA 1SDXA 4Q0CA 4PE5B 1IQ7A 3PPOA 1YTVA 2F97A 1MQHA 1HSEA 2AL4A 3PD9A 1JW1A 4QSEA 1OVTA 2DP8A 3V5AA 3Q26A 1MXUA 3ZKLA 3FATA 5TU0A 4H0WA 2FYIA 3R6UA 5AA4A 2AIXA 3C35A 5AE4A 1EU8A 3E13X 3TQLA 2I4BA 4R6KA 2H25A 1B51A 1ZBMA 3IL1B 1ANFA 3EN3A 4L17A 5AA2B 2V3TA 3PV0E 5IKBA 4NWCA 2ONRA 4GXSB 4LZ8A 3WAEA 4GIZA 3VVDA 1H43A 4NF8B 2F78A 2D21A 5CC2A 4R72A 1NNKA 3TDJA 1B3GA 4O3BA 4ZZEA 4NF4A 5CBRA 3OEKA 2CMOA 3TEPA 3RN8A 3K2DA 2GFEA 3MP8A 2DWJA 2NWJA 2XX7A 2XXUA 4FEDA 4G4PA 4OENA 3CFZA 1PB8A 4ECFA 1MPCA 3VLWA 3VDFA 4GL0A 3IO6A 3QAXA 3IK6B 3GLBA 3PPQA 3RTFB 4X1BA 3FIRA 4U22A 3FVGA 1GGGA 1GVCA 1NMUA 2UVJA 2R71A 3GBAA 1B9JA 5J1DA 2VGQA 2DS9A 2VP1A 3H06B 4PQJA 4H5GA 3CVGA 4YICA 1MY4A 5BUUA 1ATGA 2PT1A 2D3IA 3GZGA 2A5TB 3VVFA 3K6XA 1M5DA 3V8XB 4F2QA 4WEDA 1L5TA 1A8FA 2Z8EA 3DP8A 4PP0A 5F7VA 5HM4B 1IUDA 3N94A 3QIMA 4LVQA 3BFTA 1SW2A 4DXBA 1US4A 5CBSA 5I2NA 1GV8A 2Q89A 2O84X 5AA2A 3LR1A 4LATA 2QS1A 3VV5A 1FQFA 1F9BA 2Z8DA 5CMCA 4NTLA 1RYOA 2DXYA 2D5WA 3SETA 1N76A 3P7IA 5DVFA 2I0BA 4F18A 3EPEA 3LBSA 3K1PA 1P99A 4NF5A 1O64A 2Y7WA 3DELB 3K1NA 2YJPA 2F7CA 1IXGA 1ZU0A 2QMXA 2RC9A 3OD7A 1MY2A 1N04A 2I58A 5KDTA 4ELPA 1P1WA 2ZYMA 1IIWA 2DE2A 5K2XA 4H6DA 4F39A 2NOOA 1O63A 3FV2A 3TCHA 4AB6A 4G77A 1PC3A 4RXLA 4UA8A 1A55A 4R73A 3O97A 1B3FA 4BDRA 3KN8A 4EUOA 4LP2B 4GVOA 3UK4A 2O1MA 3MP6A 3TTRA 4OEVA 3L6GA 2ALUA 3C36A 1MDQA 1QW0A 5AA2D 5H8NB 4Q5TA 5FHMA 1EH3A 2E0SA 5B7DA 2ONSA 5H8HA 3T9UA 1LAXA 4TOZA 3K6WA 5CRYA 4ZECA 5DVIA 1JQFA 4F1YA 3Q29A 1QUKA 4LQ5A 4DLDA 2HEUA 3T93B 5KCJA 2UXAA 4G68C 5H8FB 2PMSA 2RKMA 2XD3A 1AOVA 5I57A 3OSQA 2XXWA 1MG1A 1IXIA 5I56A 1FTMA 4QSCA 2F8DA 1LBCA 5ICQA 4C1TA 1LLSA 4U4SA 3PUZE 1BTJA 4M4GA 4F29A 4H65A 1A40A 3PD8A 3I6VA 3KGCA 1POTA 1SVXB 4PFTA 2H4IA 1IITA 1MQDA 5H8QA 1H3DA 3E3KA 4KHZE 3TCGA 4RPNA 5L9MA 3TELA 3EHSA 4Z0IA 1MQIA 3MVZA 4EXLA 1SQYA 4KI0E 3FJGA 1MY3A 1QULA 3LSWA 1I69A 3O28A 1JVYA 5DEXA 4MBPA 4N6PA 3ZS6A 4H5FA 3S9EA 1Z7ME 3O9PA 3G3KA 1LAGE 4PETA 2O7UA 4P11A 4KYDA 4HCWA 3OEMA 4KR5A 3O6GA 3K02A 1B52A 3CI8A 3PUXE 4OTEA 1XOCA 4N07A 5LOMA 1URDA 1JETA 4F1VA 5I2KA 4F2OA 3RUMA 1A54A 2O69A 2F36A 1OIBA 4DE8A 3RT8A 3U92A 3JYRA 2OZZA 4EXKA 4DZ1A 2H98A 4KCDA 1CB6A 4KFQA 4JWOA 2DVCA 1XC1A 5JTYB 1LBBA 3W9WA 1NNPA 3TUSA 2XXVA 2OWSA 3TQWA 1LAFE 1MQGA 4U21A 1OLCA 2ANJA 2R6GE 5H8FA 4XKPA 4G8HA 1B2HA 4H8IA 5CMBA 1H76A 4NF6B 1FTKA 1USYH 1WVJA 1IZ1A 2V3QA 3PPNA 5I58B 3W9VA 3K1MA 2GHAA 4P0GA 1MPDA 5DTBA 3H7MA 3R7XA 1MM6A 1QJMA 4F1UA 3PU5A 2PYYA 3OOAA 3CG1A 1MM7A 4WKMA 3OSRA 5ISUA 3N26A 3KEIA 5TPAA 3MJNA 2H5YA 2GRVA 4YAHX 3VVEA 3KFMA 3K01A 3SEYA 3PMXA 3SEWA 4R2BA 3TCFA 5AA3A 3S4UA 2O6AA 4RNSA 4F19A 1B58A 2ZYNA 3EF7A 3QYTA 1US5A 3Q27A 4TQUQ 1FTJA 3HSTA 5BWJA 5JK4A 3CSGA 4JSDA 3CFXA 2F35A 4OWDA 4IGTA 3K4UA 3MC2A 3T9XB 1QKAA 1HSJA 4NE4A 4H67A 3A3CA 4IO3A 2R9JA 2I4CA 2QS3A 5TP9B 3ONMA 3PPRA 4PFYA 2QS4A 2F34A 4BDMA 3B6QA 3VLUA 1B7HA 1PEBA 2XD2A 4POXA 1M5CA 1MXYA 4XIGQ 3FZVA 3U8QA 1PDAA 3OELA 1Y4CA 2REGA 1USYE 1R9LA 2E1SA 2UYFA 4OERA 1DSNA 5L9SA 3K6UA 1ZMGA 2RCAA 3KSJA 4G68B 4I8CA 3ECRA 3HCQA 1EZOA 1TXFA 1TT1A 3TMGA 1S9TA 1MY1A 1Y1MA 1D3KA 1GTKA 2HQ0A 3KOSA 5ICTA 3SDFA 4DXUA 1JW4A 1BLFA 2G29A 1IEJA 3RT6B 4ESXA 1S7YA 1VFEA 4WXJA 4I1DA 3VXBA 4OVJA 2DE3A 2I0CA 2RCBA 3SEUA 3Q25A 1TWYA 3L6HA 4NWDA 4EF2A 1B4HA 3KN7A 1MS7A 4BDOA 4JB7A 3KBRA 2ESNA 4KCCA 5ELVA 3N6UA 5L9OA 4X48A 1B1HA 2O68A 2OLBA 3G3JA 1YPNA 3CSBA 4UACA 1I6AA 1NH7A 4POWA 1MXZA 3PMWA 3OO6A 1SW1A 2ZXTA 2DVZA 3U72A 1LFGA 1B7ZA 3TKDA 1FQEA 1II5A 1URSA 4OFOA 1TFAA 1BP5A 1I6BA 4OEUA 3EHTA 4P0IA 3QUJA 2HAVA 1Y4TA 3M3FA 3B6WA 2XXIA 2I49A 3I5OA 4O3CA 3G3FA 4FAJA 2DWHA 4OHNA 1WODA 2REJA 5I84A 3TODA 1N84A 1A99A 3PUVE 4X1DA 3K6VA 4RY1A 2DXRA 3Q28A 3O29A 4OFLA 3FVOA 3S9NC 4PFUA 1PBPA 3FXQA 3RNNA 3VFJA 4U4XA 3CFLA 4NF8A 3D4GA 3OO9A 3SEXA 2ZNSA 1LB9A 1LFHA 4MLVA 4FEBA 4G68A 1TFDA 2I48A 4M1VA 1BKAA 2ZMBA 1DOTA 4FIMA 4ZE8A 3FVNA 4OZ9A 1B46A 2V25A 2Q8JA 2QSXA 3HHFA 4YKKA 3PGFA 2DYXA 4I62A 3LSXA 1ZJLA 4KQPA 5ITOA 1SYHA 3R26A 1MPBA 1ZIUA 3UORA 2XXYA 4C1UA 2P0SA 2B3BA 4FORA 4IGRA 1UTBB 1O7TA 4H8JA 4ZEBA 4FE8A 2DE4A 4X9TA 2Q2CA 4DCYA 4XKRA 4LONB 4GD5A 5K2YA 4BDNA 1PBQA 5I59B 1MXVA 3OO7A 4DIGA 4XKNA 1JVXA 4LZ5A 2OBGA 1MRPA 2HZLA 2F6PA 2A5TA 3FJMA 4ZEKA 2Z8FA 2M8CA 1Q35A 1NH8A 3MP1A 2PVUA 4XXUA 3MW0A 2HZKA 3ILUB 2P2AA 1VSOA 1FQAA 1JNFA 1NL5A 4G8NA 4IO5A 5EYFA 2Y7PA 5CMKA 3E9XA 4ZS9A 3THIA 1AIVA 2RC7A 1BIYA 1NKXA 1Y3NA 3HO7A 3PUYE 5FHOA 3H3GA 1XVYA 1D4NA 3SEVA 1B5HA 2OJTA 4GL8A 3WAFA 2G93A 1ELJA 3ILTB 3OENA 3G3HA 2FNCA 2KLFA 3PMVA 4QFPA 4QHQA 1B0LA 3QSLA 3S2VA 2NUVA 3CIJA 1OQHA 4WEPA 3KOTA 2DWIA 2UVHA 2NVUB 4EF1A 4LQ2A 1N3XA 3FGSA 2X26A 4U1OA 5EHSA 4YB7A 3IOVA 2F5XA 2OK2A 3MVYA 5KZTA 2OCUA 1VFDA 3G3GA 3VLVA 2NXOA 3TAJA 5CMMA 1LFIA 2LAOA 4N13A 1SYIA 1Y1ZA 3G3IA 3H6WA 4R6YA 5B70A 4JBZA 3BKIB 5AA4B 2X7PA 1QUJA 3LC8A 4YMAA 2HFBA 2XX9A 4DCXA 5H8NA 1JEVA 1FQBA 2OWTA 1S50A 1QVSA 1B0HA 3UIFA 4R75A 4HCYA 2XXQA 1RYXA 5CM6A 1FCKA 4JWYA 1HSLA 3QUFA 4YKJA 1EZ9A 2DSFA 1ZKBA 3FV1A 3O6HA 2Y7IA 3IR1A 4JWXA 4KPTA 4NF4B 1A8EA 4C0RA 5L8DA 3LSFB 3FXRA 1NNTA 3KJ7A 1B32A 3IX1A 4E0XA 1JW5A 3H03A 3SESA 4F22A 3EHUA 1B5JA 1PB9A 3ODBA 4I9DA 1ZTYA 4R2FA 2Y84A 4THIA 3CR9A 1LGBC 4DXCA 4R74A 4U2RA 1MH3A 3IOWA 1P1QA 3DLNA 1R1NA 3T66A 1MXWA 3HV1A 1Y3PA 1P1UA 1MY0A 4BLAA 3JV9A 2I6EA 4YB6A 3TTNA 4YB5A 1UIVA 5DT6A 2V84A 3K00A 3KG2A 3GXAA 3OMBA 4IO7A 4RK9A 1FW0A 4G2ZA 4BDLA 2QPQA 1NFTA 4NEDA 3MVXA 1YAEA 2UYEA 5FTHA 1MDP1 3H6VA 1LCFA 2I3WA 1JEUA 3HN0A 2DWAA 4OQOA 1SI1A 1M5BA 3U94A 3U93A 2UVIA 4GLIA 3PPPA 2VHAA 1R6ZA 3G7WA 4OXVA 4F31B 5M2VA 1H44A 3IB2A 1B40A 2XXRA 1VR5A 3FJ7A 4JXIA 5I2NB 2F6GA 3C31A 5JTYA 1B3EA 4ND9A 4EQ9A 3E4RA 3AXFA 3H6UA 1SBPA 1ZLQA 1B3HA 2PX1A 1A7LA 1H45A 5DVJA 1Y9UA 4NF5B 4RK2A 1SD3A 3USDA 1DTZA 2HXWA 4GRKA 4MH5A 5HPQA 3KN3A 3KJTA 4NF6A 3ZSFA 3CG3A 2AYSA 3DP6A 3OO8A 5I58A 2H9BA 1KWHA 3VXCA 4U23A 3IB0A 5KDTB 3B6TA 5A5XB 4QFNA 4MF3A 3W15C 4IO4A 4H1XA 2ZNUA 4ZE9A 3LUYA 2QRYA 1UTHB 2THIA 2QMWA 5FTIA 1N7WA 3KZGA 4GQOA 3FVKA 1XHYA 3IAZA 4AB5A 1T0KA 2XXPA 3A09A 3LSLA 1B3LA 5AA1A 3UP9A 2V93A 1FTOA 3C9HA 3A3UA 2V3UA 3I3VA 4KYSA 3SERA 1QKBA 3M3LA 3MZBA 5CI5A 1MXXA 2X7QA 3QXMA 4ISUA 2CZLA 5TP9A 4KYEA 4G8MA 4XTCQ 3BFUA 3MAMA 4ELRA 2FA7A 1N7XA 4DDDA 5H8HB 1EZPA 2XX8A 2GHBA 4FECA 3OXNA 1XT8A 3H6TA 3FASA 3N5LA 3BBRA 4ONYA 2IA4A 2UVGA 4YZZA 3IO4A 4GXAA 1AH5A 2GH9A 1M5EA 4TLMB 1B4ZA 3TTKA 4ESWA 1P1NA 3VE1B 3TFLA 4RA1A 5KCJB 4QRZA 3MWBA 4HW8A 2O7IA 5I57B 1Y3QA 5HBCA 1FQCA 1WDNA 1OQGA 1DMBA 5I56B 3S9LC 1XS5A 4F3PA 4OESA 2PT2A 2IEEA 3M8UA 4YMBA 3MZ1A 1D9VA 1B7UA 5FHNA 4GOTA 1LCTA 4U1ZA 2B65A 4LA9A 3IJXB 1OVBA 5H8QB 4OETA 4MFIA 2BJJX 4XKQA 2PBWA 4E0WA 1B6HA 3H4ZA 3O66A 4HS7A 1DTGA 2XXTA 3B7DA 3EQ1A 5A5XA 3QK6A 2B3FA 2A5SA 1N3WA 4ZZAA 1UTHA 2Q9TA 1B05A 4FJPA 5DEXB 4ZEIA 2VOZA 1P1OA 1B5IA 2Q2AA 4IO6A 2ZNTA 1SW5A 3C4MA 2XHDA 2XXHA 5F1QA 4ELOA 1LAHE 1D9YA 4YU0A 1N0TA 3FXUA 4RJZA 3CRBA 2I3VA 4YKIA 5DYHA 2RC8A 4IY6A 2YPNA 4QFLA 4Q8RA 5I2KB 4GFRA 3K0VA 3RLFE 1SI0A 3RGYA 3UGWA 1J1NA 3D4CA 2WKYA 3F11A 3T96B 2HAUA 1QUIA 2ABHA 3TTLA 1MH4A 1AMFA 4QF9A 3IJOB 3M3KA 4ZDMA 3TZAA 4Z7EA 3C34A 4ZEDA 4RPOA 1FTLA 3O2AA 1M5FA 4QSDA 2RINA 4QFKA 1NNFA 3MUQA 4TLLB 3C32A 1MQJA 3O6IA 3KSXA 1PB7A 5ITPA 3UN6A 1AL3A 4GF8A 2Y7RA 2QJEA 3TYHA 2QS2A 2Q88A 4OFJA 3C33A 1R9QA 1URGA 4IO2A 4RYAA 3MBPA 1DPEA 1YCJA 2QL3A 5TPAB 1IXHA 2O51A 4JDFA 4NMYA 2O1LA 3MPKA 4OYVA 4EQ7A 4KD5A 5EHMA 3S9MC 4LUBA 4JSOA 3HPIA 3GBBA 1VE4A 4BDQA 2Z23A 4GWOA 1UTBA 2H99A 3JZJA 3RPWA 4Q30B 4OMBA 4MLQA 3PUWE 2XXXA 1UQWA 3MPLA 3DM0A 5I59A 4EDPA 1CE2A 3T9VA 2Z22A 2YLNA 3V89B 3UA8A 2AL5A 3IB1A 4HTGA 4F3BA 3U1OA 3TTMA 4K3FA 1XVXA 1OLAA 3RTWB 1SW4A 4IY5A 1I6QA 3N6TA 4R6HA 4ZEFA 5JEIA 3TPAA 4F3SA 2HCAA 3FD3A 2Y7KA 4LZ7A 1IXCA 1LSTA 2VD3A 2VD2A 3FUZA 3ZKKA 2F7BA 1POY1 1Y20A 2W7YA 2DQVA 1DPPA 3V83A 2DOJA 3HHGA 3MQ9A 3T9HB 4R9FA 3DP4A 5IAIA 2RF1A 4PFWA 1OMPA 4AQ4A 3IORA 1UIUA 1FQDA 2ZYOA 4EQBA 4FATA 3MZ9A 4IB2A 4QFOA 4F3GA 1RKMA 1Q1KA 1LB8A 4YKPA 1Z7NE 2ZYKA 2ONKE 3RQTA 3T22A 4R9GA 2F7AA 3RY3A 4ELQA 4O3AA 3MVWA 2P1SA 3IOUA 1B1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IOTA 3SKPA 1GR2A 5H8SA 1SDXA 4Q0CA 4H45A 4PE5B 5ET5A 1IQ7A 3PPOA 1YTVA 2F97A 1MQHA 1HSEA 4NQ8A 2AL4A 1RDXA 3PD9A 1JW1A 1K9YA 4QSEA 1OVTA 2PCRA 2DP8A 4XF5A 3V5AA 3Q26A 1MXUA 3ZKLA 3FATA 5TU0A 4H0WA 2FYIA 3R6UA 5AA4A 2ZZXA 2AIXA 3C35A 5AE4A 1EU8A 3E13X 3TQLA 2I4BA 4PFBA 4R6KA 2H25A 1B51A 1ZBMA 3IL1B 1ANFA 3EN3A 4P1EA 4L17A 2GQ1A 5AA2B 2V3TA 3PV0E 5IKBA 4NWCA 2ONRA 1IMAA 4GXSB 4LZ8A 3WAEA 4GIZA 4PAKA 3VVDA 1H43A 4NF8B 2XWOA 2F78A 2D21A 5CC2A 4OA4A 4R72A 2QVUA 1NNKA 3TDJA 1B3GA 4O3BA 4ZZEA 4NF4A 5CBRA 3OEKA 2CMOA 3TEPA 3RN8A 3K2DA 2GFEA 3MP8A 3KBZA 2DWJA 2NWJA 2XX7A 4XEQA 4P9KA 2XXUA 4FEDA 4G4PA 4OENA 3CFZA 1PB8A 4ECFA 1MPCA 3VLWA 3VDFA 2CEXA 4I3YA 4GL0A 3IO6A 3QAXA 3IK6B 3GLBA 3PPQA 3RTFB 4X1BA 3FIRA 2XWKA 4U22A 2VT5A 3FVGA 1GGGA 5I7IA 1GVCA 1NMUA 1FPDA 2UVJA 2R71A 3GBAA 1B9JA 5J1DA 2VGQA 2B4MA 3NOHA 2DS9A 2VP1A 3H06B 4PQJA 4NF0A 2FIXA 4H5GA 3CVGA 4YICA 1MY4A 5BUUA 1ATGA 1XI6A 2WEFA 2PT1A 2D3IA 3GZGA 4N8GA 2OX3A 2KR0A 1FBPA 2A5TB 3VVFA 3K6XA 1M5DA 2KQZA 3V8XB 4F2QA 4WEDA 1L5TA 1A8FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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