4IGTA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist za302 at 1.24a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA02
3WAEA 3RNNA 3HO7A 2QMWA 2HAVA 3D4CA 4PFWA 3SEYA 3M8UA 4NF6B 2NWJA 2XD3A 1US4A 2QMXA 4KFQA 1ATGA 1B4HA 2QL3A 4O3CA 3A3CA 1MPBA 3H03A 5KCJB 2Q88A 1DTZA 2QSXA 4YMBA 1ELJA 3FVGA 3SKPA 3T93B 3Q28A 4JXIA 4U4XA 4EF1A 3QAXA 4IO2A 3UN6A 2V3TA 2OCUA 2ZYKA 3PPQA 4YZZA 2Q8JA 1FTKA 3ILTB 3TEPA 1SW2A 2F7CA 5H8HA 5I56A 3OO8A 1MXXA 1BLFA 3KSXA 3FXRA 1FTJA 1N76A 1PC3A 2XXXA 4O3AA 5HBCA 4G2ZA 4YKIA 1SQYA 4G8HA 2AIXA 4QRZA 4ELOA 1MDQA 3VXCA 5JK4A 1FTMA 3UORA 2RINA 3I6VA 3G3FA 1OQHA 2RC9A 4MFIA 2O84X 4DDDA 2RCBA 1JQFA 1PB9A 4EQ7A 2O7UA 3MPKA 1OVBA 4GWOA 4LZ7A 4RK2A 4XIGQ 4OESA 1ZU0A 4BDMA 4QF9A 1OLAA 2ZMBA 2Z8FA 5H8NB 2H25A 3E4RA 2RCAA 4YMAA 3HPIA 2YJPA 1URDA 3O66A 3OO7A 4GXAA 3QIMA 4ZS9A 4THIA 3K0VA 4RXLA 3IAZA 3MAMA 2O7IA 4QSDA 3E3KA 3O6IA 4MLQA 3KN8A 3SESA 4F22A 3GBAA 5CI5A 4R9GA 2AYSA 4I62A 1O64A 4NF5A 3M3LA 3IX1A 3KJTA 1UQWA 1MY0A 1MPCA 1NNTA 2ZNSA 4HTGA 2H99A 2H9BA 4O3BA 4TOZA 3H6VA 4XXUA 5CMBA 3OOAA 4F39A 3MVWA 4R73A 4DE8A 4QFOA 1FQFA 2O68A 3RGYA 1Y3QA 1BIYA 2Z8DA 3Q26A 3KBRA 1RYXA 3B7DA 4TQUQ 4XKPA 2XX9A 2IEEA 4QFNA 3UK4A 2REJA 5CMMA 3HHGA 4IGRA 3MJNA 3H6TA 1I6QA 2HFBA 4OHNA 3KFMA 1BTJA 3MVXA 1JW5A 2ANJA 5EYFA 1RKMA 2R71A 3C35A 5TU0A 4QSCA 1M5DA 4YKKA 3Q25A 1D9VA 2NOOA 5AA4A 4RA1A 3W9WA 1SVXB 1URGA 3DM0A 1IZ1A 1MQHA 4OFLA 2ZYOA 2B3BA 3RLFE 4N07A 3MP1A 3G3GA 5K2YA 1LB8A 3CIJA 4C0RA 2XXUA 2GHAA 3FIRA 3F11A 4ISUA 4H1XA 3S9EA 1P1WA 1PEBA 1LGBC 4QFKA 2PT2A 4G8MA 3TCHA 3DP8A 1UTBA 1VFDA 2D3IA 2DXYA 3PMVA 3H06B 5EHSA 3K01A 5HPQA 2YPNA 3I3VA 4R6YA 4H8JA 3O97A 5TP9A 3U1OA 1N7XA 3PUYE 1NH8A 3QSLA 3MW0A 4R75A 1IUDA 4UACA 1A99A 4AB5A 1US5A 1ZTYA 5KZTA 4G68A 3SEUA 1VFEA 3TCFA 1WDNA 4U22A 1H3DA 4H6DA 3MZ9A 3U72A 1P99A 4KYDA 3FZVA 2A5TA 2Q89A 3TYHA 5KDTA 4OERA 3PPNA 1N7WA 1QKAA 1Q1KA 1TFAA 3U93A 4X1DA 4H67A 2Z8EA 1LAFE 2AL5A 3PUWE 1DMBA 2XX8A 5FHOA 3PD9A 1B0LA 5EHMA 4NF4B 3G3JA 3C32A 4WEPA 2RC8A 4YKJA 1CB6A 3O28A 3K6WA 1R6ZA 3TTMA 1A40A 4MBPA 2V93A 4ELPA 1SW4A 3THIA 5TPAB 2XXTA 1JW4A 2IA4A 4OYVA 1FQCA 1IQ7A 3C31A 1B51A 5CBRA 3OEKA 1MXZA 1LBBA 1S50A 2XXYA 3TTNA 1GVCA 3O6HA 2HZLA 3C36A 3FVKA 1Y1MA 1WODA 4YICA 2H5YA 5H8QA 3T96B 3T9XB 1MY2A 3EPEA 1PDAA 4F19A 4IO6A 3ZSFA 2NUVA 3K00A 2O69A 1MQDA 2P0SA 2XX7A 4KPTA 4LATA 4QSEA 2DWAA 1EZPA 4OQOA 1IXCA 3OMBA 4U1OA 3IOTA 3ODBA 3R26A 4IO4A 1Y4TA 5DVJA 2I4CA 4FAJA 2VD2A 1ZJLA 4LZ8A 4X9TA 4XKRA 5CMCA 1FQBA 4GIZA 3ONMA 2GHBA 3IK6B 3G3HA 3IO6A 3MZBA 2THIA 4QFPA 1IXIA 3AXFA 1O63A 1XT8A 2ZYMA 5F7VA 2X7QA 1DPEA 1XS5A 3IR1A 5IKBA 1JETA 2P2AA 1OMPA 3SEVA 3PUXE 4GD5A 1NL5A 3SERA 3E13X 2O1LA 4KHZE 5CBSA 3QUFA 4ECFA 3C4MA 2HAUA 5AA2B 3LC8A 2GFEA 2H4IA 3K02A 1MM6A 4I8CA 4KYSA 3T9VA 4DXUA 3B6WA 4YU0A 1LAHE 1UTHB 3JZJA 3UA8A 1YTVA 4POXA 3JYRA 5DVIA 3UGWA 4M1VA 4EDPA 3H6UA 5I2KA 3IOWA 4ZECA 3H6WA 1S9TA 1B7UA 4DLDA 3CFXA 1I69A 4GL8A 3CI8A 2I3WA 3SDFA 2E0SA 3O29A 4LVQA 5JTYB 3M3KA 1PB8A 4C1TA 1SI0A 1B2HA 4F29A 3S9NC 2Z22A 3FJGA 2Q9TA 3TODA 1M5EA 4MLVA 3FXQA 2Q2CA 1NNKA 1UIVA 5IAIA 3BBRA 3QUJA 3W9VA 4H0WA 2UXAA 4G68C 4IGTA 4BDOA 5B70A 2DWHA 4AQ4A 1QUJA 2DVZA 4FORA 4F2QA 1LBCA 4DCYA 5A5XB 3MQ9A 4RK9A 2QJEA 2A5SA 4BDLA 5H8FA 3KSJA 4ZEKA 4PFYA 4DZ1A 3TUSA 2ABHA 2PBWA 4RYAA 1Z7NE 1HSJA 4F18A 2VD3A 1JW1A 3CSBA 1DOTA 2D21A 1B1HA 3VVFA 4JWOA 3N6TA 4NWCA 2RC7A 1NMUA 2VHAA 3EHUA 1I6BA 4NF8B 3MUQA 1S7YA 3RQTA 1N04A 1LSTA 1JNFA 4PE5B 2DYXA 5BWJA 3KEIA 2Y7WA 5AE4A 2QRYA 1A54A 3Q27A 1VR5A 1EZ9A 2BJJX 4PP0A 4FJPA 4MF3A 3PUVE 3VVDA 3T9HB 1JEUA 1EH3A 3OELA 1LFIA 4ZEFA 3FD3A 2F7BA 3UIFA 4KI0E 5I58B 3FATA 4OVJA 1B9JA 3KOSA 1SBPA 3S4UA 5ICTA 1M5BA 4RPOA 1IXGA 3DELB 1AL3A 4KYEA 2HZKA 4PETA 2FNCA 2AL4A 4AB6A 5M2VA 5LOMA 4U1ZA 4GF8A 4ZZAA 3KZGA 1FTLA 4EQ9A 2B3FA 5I2NA 5ITOA 3TMGA 2I6EA 3VE1B 5DTBA 4YB5A 4F1YA 1LCTA 3GBBA 5L9MA 3SEXA 1MQJA 1IXHA 4GFRA 1OVTA 5FTHA 5I59A 4ZEDA 3KJ7A 3TZAA 4QHQA 1H45A 4FEDA 2REGA 2PX1A 3TPAA 5DEXB 4E0WA 1SD3A 2ALUA 5ELVA 5CRYA 4NF6A 2DE4A 1B05A 4GVOA 1P1NA 3E9XA 1DPPA 1B1XA 5KCJA 1M5CA 1BKAA 3OD7A 4JSOA 1B3LA 1FQAA 3V83A 4YB7A 5FHMA 4XKNA 1XVYA 2ONRA 4L17A 3RY3A 3MVYA 4R6HA 3HSTA 3QK6A 1LAGE 1MXWA 5AA3A 3K1PA 4H5FA 3B6TA 4IO5A 3GXAA 3VLVA 3CRBA 3CG1A 4LA9A 4F3BA 3TKDA 3B6QA 1F9BA 3LR1A 2I3VA 2ZNUA 1IITA 4G77A 3RPWA 3MPLA 2Y7PA 1B46A 3VFJA 1MG1A 2DSFA 3HV1A 1B5HA 3EHTA 1AOVA 4LP2B 3UP9A 1EU8A 2H98A 3KN7A 1J1NA 1JEVA 4EUOA 1Y9UA 1FCKA 2Y7IA 4NEDA 4IB2A 1GTKA 4GQOA 2NVUB 3HHFA 5CC2A 1GV8A 3RN8A 3U92A 4XTCQ 4TLMB 3TTKA 4BDQA 2FA7A 4FIMA 1B32A 4NF8A 3CVGA 3OSRA 4IY5A 2P1SA 1R9QA 5ITPA 4F1UA 1HSEA 1R1NA 1Y20A 5H8NA 4EXKA 3BFTA 1FQDA 1MDP1 1QKBA 5FTIA 1LAXA 3CFLA 1QUKA 5I56B 2HCAA 4LONB 4P0IA 2Z23A 4RNSA 1N0TA 1B3EA 1GGGA 2O51A 2GRVA 4JDFA 2FYIA 2OBGA 1Z7ME 1POTA 1SW1A 3A3UA 3D4GA 3PD8A 4KCDA 4OENA 1POY1 4EF2A 5AA2D 4R6KA 4POWA 1PBPA 4OETA 1NNPA 1N3WA 4F3GA 2R6GE 3RTWB 4KD5A 3IB0A 1KWHA 4G8NA 1B7ZA 1BP5A 4LQ5A 2V84A 3CSGA 3O2AA 3C34A 3TAJA 3T9UA 1GR2A 1B0HA 4H65A 4ND9A 3IO4A 2XXHA 1N84A 1YPNA 3O9PA 1ZLQA 5L8DA 1B58A 5I57B 3FJ7A 4NWDA 1P1OA 1MXYA 3BFUA 2PT1A 3MP6A 1O7TA 1OIBA 3K6XA 2QS2A 5BUUA 3LSWA 3U94A 4PFUA 2CZLA 3K2DA 1OLCA 2V3UA 2GH9A 3C33A 3RT6B 1MH4A 1NKXA 4NF5B 4JBZA 1B3HA 4DXCA 3EQ1A 3VLUA 1LB9A 1MY4A 3K6UA 3TCGA 1EZOA 2OWTA 2UVHA 1QUIA 1N3XA 1Y1ZA 1ZMGA 3PPOA 1QULA 3Q29A 4HCYA 4NMYA 2UVJA 1H43A 1DSNA 2DP8A 4E0XA 3CR9A 3FGSA 3QYTA 4Q30B 2XXVA 3ZS6A 3OEMA 4Q8RA 1B40A 4ELQA 1D9YA 3FUZA 4GRKA 1DTGA 2DQVA 4BDNA 3U8QA 3BKIB 4RY1A 5DT6A 3JV9A 4Z7EA 3VLWA 4PFTA 2UVGA 1MPDA 2DWIA 4H8IA 3TQWA 3FJMA 2WKYA 3PMXA 5CM6A 3FV2A 1LFHA 5AA4B 1IIWA 3H4ZA 1AMFA 1QJMA 2X26A 1LFGA 4ZE9A 1XOCA 1ZIUA 3R7XA 3W15C 4BDRA 3ILUB 3LSLA 1MQIA 2XXPA 2QS4A 4HW8A 2HQ0A 2I0CA 4BLAA 1PBQA 2QS3A 1T0KA 1UTBB 4NF4A 5JEIA 3OO9A 4ZEIA 4P0GA 2O6AA 3QXMA 3PV0E 3MWBA 3KN3A 4RPNA 5TP9B 3PMWA 3L6HA 4F31B 5TPAA 3EF7A 3DLNA 4U21A 1JVYA 1B3GA 4WXJA 4G68B 2F35A 3FXUA 1B6HA 5DVFA 3VVEA 4H5GA 4HS7A 3USDA 4JWYA 3IJXB 2O1MA 1MXUA 1PB7A 2A5TB 2E1SA 3MC2A 5KDTB 3IOVA 3TTLA 3N26A 4OMBA 5AA1A 4OEUA 2Y7RA 4JB7A 4ESXA 1MXVA 2XHDA 1MM7A 2R9JA 1QVSA 3IORA 5I57A 1I6AA 3RUMA 2LAOA 5ISUA 2OLBA 2YLNA 4GOTA 2G29A 3H7MA 3VDFA 1SYHA 3SEWA 4NE4A 4OWDA 3IB1A 2PMSA 3K4UA 4DIGA 2I48A 2F5XA 5DYHA 2DVCA 1USYE 4X1BA 2DXRA 3S9LC 3FASA 1MQGA 5CMKA 2KLFA 1NNFA 2DE2A 4Q0CA 4ZE8A 1MRPA 3DP6A 3V89B 2F6PA 4IO3A 1H44A 4F1VA 5H8QB 2V3QA 4ESWA 3GZGA 2OWSA 3EHSA 2XD2A 5ICQA 3V5AA 2XXIA 2I58A 3VXBA 1P1QA 5AA2A 3G7WA 1XVXA 2CMOA 1QW0A 1TFDA 4F3SA 1ANFA 1UTHA 4N6PA 3LBSA 2PVUA 1LLSA 4OTEA 1AH5A 3WAFA 2DWJA 4IY6A 4FECA 4GLIA 2M8CA 3KG2A 5F1QA 1URSA 3CFZA 4KR5A 4PQJA 3T22A 4ZDMA 3PGFA 1Q35A 1MY1A 1NH7A 1B7HA 3RT8A 1FTOA 3ZKKA 4U2RA 1FW0A 2UVIA 3IJOB 4WEDA 4DCXA 5JTYA 1HSLA 1MH3A 4TLLB 4OEVA 3FVOA 5B7DA 3EN3A 2QS1A 1A7LA 4I1DA 2VGQA 1A8EA 4YB6A 3HCQA 3H3GA 3OO6A 1NFTA 5I84A 1XC1A 3ZKLA 1B52A 4JWXA 4WKMA 4RJZA 1XHYA 2I0BA 1SI1A 2ONSA 4ZEBA 1Y4CA 1MS7A 4OZ9A 3TTRA 3M3FA 2Q2AA 5A5XA 3MZ1A 4NTLA 1M5FA 1B4ZA 3VV5A 5H8SA 3IL1B 1SYIA 4N13A 4R72A 2XXRA 1ZBMA 4MH5A 5FHNA 5I2KB 2F97A 2DS9A 1USYH 4LQ2A 2HEUA 4FATA 1II5A 3R6UA 1MY3A 4GL0A 2B65A 1WVJA 1SW5A 3FV1A 2OK2A 4EQBA 3G3KA 4R74A 4LZ5A 3OENA 4R2FA 3IOUA 1B3FA 2RKMA 4OFOA 4GXSB 2I4BA 1ZKBA 2DOJA 4DXBA 4KCCA 4FEBA 2F8DA 5H8HB 1VSOA 4K3FA 2F78A 2F7AA 4HCWA 1SDXA 4JSDA 1B5JA 3RTFB 1OQGA 3DP4A 3ECRA 4EXLA 2OJTA 5K2XA 1RYOA 3LSFB 3LSXA 1CE2A 5H8FB 4ELRA 3TQLA 1Y3PA 5I58A 1H76A 4Q5TA 3PU5A 3S2VA 2PYYA 3K6VA 4R2BA 3FVNA 4U23A 3IB2A 5HM4B 2ONKE 4X48A 1L5TA 2W7YA 3I5OA 4Z0IA 1AIVA 2F6GA 2ESNA 3C9HA 2XXQA 3N94A 4P11A 3A09A 3L6GA 2X7PA 4U4SA 3HN0A 4G4PA 5L9SA 2Y84A 3G3IA 2V25A 1IEJA 3N5LA 5L9OA 4FE8A 3O6GA 1A55A 3KOTA 1D3KA 4I9DA 4YAHX 1YAEA 2ZNTA 3S9MC 4UA8A 4ZZEA 2RF1A 2HXWA 2F34A 4F3PA 2D5WA 2VOZA 1JVXA 4YKPA 5DEXA 1B5IA 4R9FA 2QPQA 3SETA 4IO7A 4XKQA 4OXVA 1Y3NA 1R9LA 2ZXTA 3KGCA 1TT1A 2I49A 5J1DA 3TFLA 2ZYNA 3MVZA 4ONYA 2VP1A 4F2OA 3MBPA 3TELA 2OZZA 2G93A 2NXOA 3N6UA 4QFLA 2XXWA 3PUZE 1LCFA 1UIUA 1TXFA 3OSQA 3PPRA 4C1UA 3PPPA 1D4NA 4M4GA 1FQEA 5I2NB 2Y7KA 3V8XB 2DE3A 3K1MA 3TDJA 3OXNA 2UYFA 4OFJA 3P7IA 3K1NA 1A8FA 3T66A 3CG3A 1P1UA 1TWYA 4KQPA 1YCJA 4LUBA 2UYEA 1VE4A 3GLBA 3LUYA 2F36A 3MP8A 5I59B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WAEA 3RNNA 3HO7A 2QMWA 2HAVA 3D4CA 4PFWA 3SEYA 3M8UA 1FPBA 4NF6B 2ZZXA 2QVUA 2XD3A 1US4A 2NWJA 2QMXA 4KFQA 1ATGA 1B4HA 2QL3A 4O3CA 3A3CA 1MPBA 1K9YA 3H03A 4O7IA 5KCJB 2Q88A 1DTZA 2QSXA 3BIGA 4YMBA 1ELJA 3FVGA 3SKPA 3T93B 1FPGA 1IMDA 4OVSA 3Q28A 4JXIA 4U4XA 4EF1A 3QAXA 3HFUA 4IO2A 3UN6A 2V3TA 2OCUA 1XI6A 2ZYKA 3PPQA 4YZZA 2Q8JA 3ISPA 1FTKA 3ILTB 2HXRA 3TEPA 4N8GA 1SW2A 5IZ3A 2F7CA 5H8HA 2QVRA 1DK4A 5I56A 3OO8A 1MXXA 1BLFA 1RDZA 3KSXA 3FXRA 1FTJA 1N76A 1PC3A 1IMBA 2XXXA 4O3AA 5HBCA 4G2ZA 4YKIA 1SQYA 4PFRA 4G8HA 2AIXA 4QRZA 4ELOA 1MDQA 4HE1A 3VXCA 4X04A 2CEXA 5JK4A 1FTMA 3UORA 2RINA 3I6VA 3G3FA 1OQHA 2RC9A 4MFIA 2O84X 4DDDA 2RCBA 1JQFA 1PB9A 4EQ7A 2O7UA 3QMFA 4MNPA 3MPKA 1OVBA 4GWOA 4LZ7A 4RK2A 3E79A 4XIGQ 4OESA 1ZU0A 4BDMA 3IFCA 2CZHA 4QF9A 1OLAA 2ZMBA 2Z8FA 5H8NB 1YYZA 2H25A 4PFBA 3E4RA 2RCAA 4YMAA 4PCDA 3HPIA 2YJPA 1URDA 3O66A 3OO7A 4GXAA 3QIMA 1NV2A 4ZS9A 4O7MA 4THIA 3K0VA 4RXLA 3IAZA 3MAMA 2O7IA 4QSDA 3E3KA 4GWXA 3O6IA 4MLQA 3KN8A 4HXVA 3SESA 4F22A 3GBAA 5CI5A 4R9GA 2AYSA 4I62A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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