2QS2A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp318 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A02
4LUBA 3IB2A 2F35A 4UACA 3MVXA 1LFHA 1NH7A 4DXBA 2QS4A 1FTLA 1RKMA 2Y84A 3ZS6A 3SESA 3L6GA 3PGFA 3CFLA 2IEEA 2DE2A 4XKQA 1VSOA 1LCTA 3SERA 2NUVA 2DS9A 1FTOA 1D3KA 2V84A 5CBRA 4OMBA 2Q2AA 4F1UA 1B6HA 4EF2A 3I3VA 5CMKA 3W9VA 1FTMA 2HEUA 2Y7KA 1XC1A 3OO6A 5DVJA 4IO2A 2PT2A 1NNTA 1OLAA 3FXQA 2DXRA 4QF9A 5TP9B 3DM0A 1A40A 5L9MA 2AYSA 2OCUA 4HS7A 1EU8A 2HAUA 1A7LA 2DYXA 5H8NB 3PMVA 3PUZE 1UTBB 5KDTB 1DTGA 3B6QA 2Q8JA 1M5EA 3MP8A 3G7WA 4OESA 5CC2A 2A5TB 3D4CA 4NF4A 4XKPA 4ELRA 3K6WA 3KSXA 2XD3A 3K1PA 4KR5A 2PYYA 1BIYA 3KJ7A 4X1DA 3PPRA 3FIRA 2Z22A 3CSGA 2CMOA 3TQLA 2UVHA 3T93B 1QUJA 1LAFE 2Y7PA 4X1BA 1BLFA 2UXAA 1JW4A 1LB9A 5DEXB 3KFMA 2RCAA 4F18A 3FGSA 2V93A 2R6GE 3UK4A 4PETA 1ATGA 1LBCA 3SDFA 4FEBA 4Q0CA 1Y1ZA 3R6UA 4RPOA 4Z7EA 1P1OA 1M5FA 3BFUA 3DLNA 2DQVA 1ZTYA 4F2QA 5AA2A 3LC8A 1SI1A 2XHDA 5EHSA 1A8FA 5CMBA 4WEPA 2QMXA 3PUWE 2OK2A 4GQOA 1O64A 1MQHA 4F39A 2XD2A 5TPAB 1PB7A 3EHTA 3U94A 3AXFA 4XTCQ 1YAEA 3TFLA 1MQGA 4DXCA 1EZ9A 4P0IA 4NF6B 5I2NB 3V5AA 1Z7ME 3UORA 2H99A 4TLLB 1USYH 5H8SA 2D3IA 1O63A 4ZE9A 3Q28A 1LAXA 4OEVA 3QK6A 4GL8A 3TKDA 1PBQA 5BWJA 3FZVA 2RINA 4N13A 1P1NA 3H4ZA 4PFWA 4MBPA 5H8FA 5IKBA 1BKAA 3FXRA 1MQDA 1R9LA 4XKNA 1MY3A 2I6EA 1HSEA 3MVWA 4BDLA 4DXUA 5ISUA 4NE4A 2ESNA 4QSEA 1NNFA 4H0WA 3B6WA 3TTMA 3TCHA 1M5DA 5FHMA 3IK6B 4NWCA 1MG1A 4OQOA 3PMXA 2F97A 2Q88A 1EH3A 4QRZA 1FQAA 3SEYA 3S9NC 5H8HB 1SDXA 3OMBA 1SW4A 1JETA 1TFAA 3N26A 3A3UA 5I56A 3PUYE 3QAXA 2F8DA 1LBBA 5JEIA 3O6IA 3DP8A 2PMSA 1XT8A 1Y1MA 1H44A 1VFDA 1OVTA 5L9OA 1VFEA 4IY5A 3MZBA 1B1XA 1LB8A 1MPDA 3DP4A 3O28A 4I9DA 1URSA 3TQWA 3CFZA 5I58B 1A55A 4AB6A 5I59A 3M3KA 3TTKA 3C32A 3L6HA 3SETA 1WDNA 3MZ1A 2O69A 3K1MA 4JDFA 1FQEA 4DCXA 5AA2D 3KEIA 1RYOA 5JTYA 2VOZA 3MVYA 1Y3PA 1FTJA 3O6HA 5DT6A 2H5YA 2ZYKA 4U4SA 1B05A 4ZE8A 4YICA 4GVOA 5L9SA 4U4XA 4YMAA 4IY6A 4RA1A 3T96B 5DTBA 1ANFA 3IB1A 4E0WA 2THIA 3K4UA 3MZ9A 1DPPA 4F3PA 1DMBA 4LZ8A 3TELA 4YB5A 2UYFA 5CBSA 1Y4CA 2F7AA 3PPPA 3IO4A 4G68B 1PB9A 1R6ZA 2QS1A 2B65A 4HW8A 1UIVA 5TU0A 1FQDA 1Y20A 4EF1A 3OELA 3G3JA 4I62A 4FJPA 3E3KA 3R7XA 4QHQA 3PPNA 3HCQA 2B3FA 2VHAA 1NMUA 4ZZAA 3QUFA 1Q1KA 3A09A 4RK2A 2HXWA 3PPQA 3TODA 1MXVA 1MPCA 3ILUB 1AIVA 2YLNA 3RT6B 2HZKA 3PUXE 1H43A 1FQCA 1NKXA 2H9BA 4JBZA 2V3UA 3CVGA 3RQTA 3KZGA 3EPEA 5TP9A 4C1UA 3LBSA 4LP2B 3TTNA 2E0SA 2QJEA 2DWJA 2Y7RA 4AB5A 2HQ0A 3K01A 3RT8A 5H8NA 4LQ5A 1UTBA 5KDTA 1S7YA 3O66A 4BLAA 3OENA 1DPEA 3TTRA 2DOJA 2UVIA 4H65A 4O3BA 3IX1A 2XXPA 1N76A 2A5SA 3TCGA 1US5A 4ZECA 4KQPA 1JEUA 2PBWA 5KCJB 3W9WA 3GXAA 5B70A 3RTFB 3GBAA 1GR2A 3JYRA 1MXXA 3RNNA 1B7ZA 4RY1A 1WVJA 3MC2A 4R6YA 3T22A 2E1SA 2XXIA 1JNFA 1B5JA 3OXNA 2HCAA 1P99A 3O29A 2PX1A 3HHGA 1PDAA 2M8CA 1PC3A 1QKAA 1Q35A 3KGCA 3FJMA 2OBGA 2F34A 3EN3A 3C9HA 1JW1A 3CR9A 3E4RA 2HZLA 3IOUA 2NXOA 4U1ZA 4PFUA 1R9QA 2ZYNA 2ALUA 1S50A 3EHUA 3RPWA 4NF5B 2O7UA 4OZ9A 3JZJA 3HN0A 4LONB 2VGQA 2V3QA 3K6UA 4WKMA 2OWSA 3K02A 4NF8A 1MM7A 2CZLA 1B32A 1H76A 2I0BA 1A54A 3R26A 2XX8A 1MXZA 4KCDA 4F1VA 2RKMA 4NEDA 3D4GA 4Q5TA 1GV8A 2DVZA 3TAJA 3BKIB 3VFJA 3T9UA 4NF6A 4KFQA 5I2NA 3FJGA 1B1HA 5CRYA 3EQ1A 1B46A 4OFLA 4QFKA 4R75A 4HCWA 4PP0A 4ZEFA 1JVYA 4OFJA 3K2DA 3UA8A 3RLFE 1I6BA 3I6VA 4IO3A 4GRKA 1A99A 3PV0E 3G3KA 3CG1A 1GGGA 1D9YA 2I4CA 4NMYA 1URGA 1IXIA 3VE1B 3OD7A 1MRPA 5J1DA 1LFGA 3ONMA 1PEBA 1URDA 4XIGQ 5IAIA 4G77A 1D9VA 2GH9A 4F22A 3DP6A 1SQYA 3MPKA 3UN6A 1MS7A 2XXWA 4R9GA 3O6GA 4JB7A 1P1WA 1B51A 1YTVA 3E9XA 4OERA 1EZOA 4H1XA 1UTHB 1VR5A 2FYIA 4M1VA 4LVQA 4EDPA 2O68A 4F29A 2QS2A 1EZPA 3QUJA 4OETA 1Y9UA 4KHZE 5H8HA 3H06B 2D5WA 5I57B 4POXA 5H8QB 4JSDA 1B3HA 5L8DA 2H25A 3K6XA 1DTZA 3V89B 3MQ9A 4OFOA 5A5XA 3G3GA 1LFIA 3BBRA 3MAMA 3P7IA 1SW1A 4ELPA 1FQFA 2O84X 3VDFA 1XVYA 2F6GA 2REJA 4GIZA 5I58A 1ZJLA 4F1YA 4PQJA 3LSXA 1AMFA 4X9TA 4JSOA 1SI0A 4FIMA 3FD3A 4O3CA 1XHYA 2RC7A 4R9FA 3TMGA 3N6TA 4ZDMA 4Q8RA 5EHMA 2I3VA 4ISUA 5FHNA 3SEWA 1CE2A 3SEUA 4DE8A 3K0VA 3ZKKA 1LCFA 1MXYA 1I69A 1SVXB 3ILTB 1RYXA 3MP6A 4HTGA 5KZTA 2W7YA 3N5LA 2Z8EA 2PT1A 1IITA 4PE5B 2OZZA 4ONYA 4H8JA 4GXAA 2QL3A 1FQBA 3Q27A 4DDDA 3VVDA 4JWXA 4Z0IA 2VD2A 5I84A 2QS3A 3CG3A 2GHBA 2Z23A 1SD3A 5B7DA 1MXUA 4QFNA 4NWDA 4P0GA 5AA4B 4EUOA 4YMBA 1IIWA 3KSJA 1SW5A 4OTEA 5I2KB 3MW0A 1D4NA 1FW0A 3IJOB 3CI8A 3CSBA 3E13X 4BDMA 4IO5A 3MJNA 4KYDA 3K1NA 4QSCA 3FJ7A 4U21A 2UVJA 4YZZA 4QFLA 3T9VA 2ZXTA 4EXLA 3N6UA 4TLMB 2DVCA 2XX7A 3EF7A 4ZEKA 3PU5A 4C1TA 2V3TA 3A3CA 3GBBA 3OEMA 3IOTA 1J1NA 1MDQA 4YKPA 5KCJA 2DXYA 1JVXA 3K6VA 2PVUA 2NOOA 4KYEA 3IOVA 1AOVA 3HSTA 4JWYA 3FXUA 2YJPA 4LQ2A 4DCYA 2XXUA 1QVSA 1HSJA 3O2AA 1MQIA 1TFDA 2BJJX 4OENA 3LR1A 4IO6A 4YKIA 1USYE 4K3FA 1GTKA 2Y7IA 1MH3A 1B4ZA 2O6AA 2XXXA 2ZYMA 3KOTA 4RJZA 3H3GA 1HSLA 4YAHX 1B3FA 4MH5A 3IL1B 2XXRA 3OO9A 4ESXA 1M5CA 1US4A 3T9XB 4NF5A 3MPLA 2Y7WA 3RGYA 2ZNUA 3O9PA 4YB7A 1TWYA 1OQGA 1II5A 4AQ4A 3H7MA 3VLUA 1M5BA 2VP1A 4F3GA 4KPTA 5FTIA 2H4IA 3VLWA 4XKRA 2V25A 1H45A 1B0LA 2RC9A 5H8FB 4PFYA 5CMCA 3H03A 1S9TA 1N0TA 1MQJA 3H6TA 4BDQA 1B7UA 2B3BA 4DLDA 5FHOA 4ND9A 2DWHA 1POTA 2Q89A 2ZMBA 3U72A 1ZU0A 4QFPA 5AA3A 3PPOA 3LUYA 3S9EA 1IUDA 3S9MC 4I8CA 4FORA 3KBRA 3USDA 1BTJA 3S9LC 3PMWA 2DE4A 3KN3A 1QW0A 1FTKA 3MBPA 1CB6A 4Q30B 3TDJA 2DWIA 4YB6A 3FVKA 4IB2A 5ICTA 5DVFA 5I56B 4NTLA 1YPNA 4F3BA 2REGA 2A5TA 2ONRA 3V8XB 1H3DA 3OO8A 3QYTA 4F19A 1MXWA 4OHNA 4F3SA 2QRYA 3FVNA 2R9JA 4N07A 3IAZA 1IXGA 1UTHA 2X7PA 5I59B 3SEXA 2F78A 1NFTA 1NH8A 1N04A 1ZLQA 5ELVA 5M2VA 1B4HA 3HHFA 3S2VA 1WODA 1MY4A 1MY2A 4ZS9A 2G93A 3G3FA 5DEXA 4ZZEA 3FVOA 3H6VA 3FV1A 1PB8A 5F7VA 5I57A 5H8QA 2Q9TA 3HO7A 4ECFA 3B7DA 3HPIA 3TYHA 1I6AA 2O1LA 3IJXB 3C4MA 2AL5A 4MFIA 4LATA 3ECRA 1P1QA 3M3LA 1SYHA 2I48A 3KN7A 2I49A 5DVIA 3OSRA 3RTWB 2R71A 1JQFA 4YKJA 3TUSA 1N7WA 1IXCA 3VV5A 2ZYOA 5TPAA 4KI0E 1T0KA 2XXTA 3KJTA 2F6PA 4EQ7A 3PD8A 3ZKLA 3C36A 2ZNTA 2F7BA 3MVZA 3MP1A 3U93A 2XXHA 4RK9A 2H98A 5F1QA 2ONSA 2ANJA 2F5XA 3SEVA 3KG2A 4WEDA 4E0XA 4ZEBA 3VLVA 1VE4A 4G8NA 4R2FA 4H5GA 5AE4A 1O7TA 4IO4A 3ZSFA 3IORA 2O51A 4ELQA 1P1UA 1B52A 2XX9A 5LOMA 4RXLA 1B9JA 2DSFA 5AA1A 1XVXA 1XOCA 1B2HA 1NL5A 1N84A 4OVJA 4DIGA 4G68C 2Z8FA 1OQHA 3WAEA 2ZNSA 3BFTA 4G8HA 3LSWA 5AA4A 2ONKE 2RC8A 1IQ7A 4I1DA 4KD5A 2Q2CA 2X7QA 4H67A 3K00A 3GZGA 4H6DA 4OWDA 5CM6A 1OIBA 4GFRA 4F2OA 5I2KA 2QSXA 1GVCA 2FNCA 5FTHA 3KOSA 2IA4A 3I5OA 4BDRA 1KWHA 4QFOA 2UYEA 4U1OA 4R2BA 4XXUA 3THIA 3G3HA 4O3AA 2NWJA 2AL4A 1PBPA 4G2ZA 4GOTA 1TXFA 2O7IA 3G3IA 2LAOA 4JWOA 1MM6A 3IB0A 1B3GA 3C33A 1QJMA 2I58A 3PUVE 3UIFA 2RCBA 3TEPA 4GL0A 4ESWA 4R6HA 4F31B 1DSNA 4UA8A 4IGRA 4M4GA 3SKPA 3LSFB 3CFXA 2GRVA 4NF8B 3FUZA 4EXKA 1QULA 2WKYA 4LZ7A 3S4UA 3VVEA 4FAJA 1N3WA 3VVFA 4QSDA 1LAGE 1OMPA 1POY1 5JK4A 3VXBA 3IOWA 1I6QA 3FATA 2VD3A 2HAVA 2UVGA 3TTLA 2P1SA 1ELJA 1Y4TA 4RNSA 1DOTA 4H8IA 3Q25A 2G29A 3T9HB 1JW5A 1LAHE 4IGTA 2GHAA 3H6WA 4G68A 1MDP1 1JEVA 2P0SA 3HV1A 1B58A 4HCYA 5ICQA 2AIXA 3PD9A 3DELB 3LSLA 4R73A 4IO7A 3C31A 3RN8A 4G4PA 2OLBA 4POWA 1YCJA 3MWBA 3TPAA 5HPQA 3OOAA 4OEUA 4FE8A 4NF4B 4RPNA 3Q29A 5HM4B 3KN8A 1B5IA 1L5TA 1AH5A 2XXYA 3WAFA 1B3EA 3M8UA 1Z7NE 1UQWA 2GFEA 2Z8DA 1Y3QA 1B5HA 1MH4A 4U22A 5EYFA 3RUMA 1MPBA 2QMWA 4P11A 1F9BA 2HFBA 3FASA 4H5FA 5K2YA 4GXSB 4THIA 3CIJA 4U23A 4C0RA 3JV9A 2F36A 1Y3NA 3CRBA 1MY0A 1SBPA 2XXQA 5A5XB 3W15C 3FVGA 1LLSA 3O97A 5K2XA 4R72A 3TCFA 5CMMA 2I4BA 2DP8A 4X48A 3VXCA 5AA2B 2NVUB 3FV2A 3TZAA 2OJTA 1IXHA 4U2RA 1ZMGA 4JXIA 4MLVA 4FATA 2P2AA 3RY3A 2DE3A 2OWTA 3IR1A 3ODBA 1R1NA 3U1OA 5HBCA 3UGWA 3UP9A 2D21A 1IZ1A 4KCCA 4EQ9A 1SW2A 3U8QA 4GLIA 4OYVA 3QXMA 1A8EA 1NNKA 5ITPA 1B0HA 3V83A 1FCKA 1N7XA 4PFTA 4RYAA 1QKBA 3M3FA 4G8MA 3GLBA 1QUKA 4LZ5A 4MF3A 2I3WA 4ELOA 3QIMA 1OVBA 4ZEIA 1BP5A 4OXVA 2F7CA 1LSTA 4GWOA 2KLFA 2YPNA 4TQUQ 4FECA 3U92A 3N94A 2X26A 1B40A 2O1MA 3Q26A 4DZ1A 1TT1A 3QSLA 3H6UA 2FA7A 3MUQA 2I0CA 3OEKA 4YU0A 1QUIA 1NNPA 2QPQA 2XXVA 1UIUA 5DYHA 4WXJA 4GD5A 4ZEDA 1XS5A 4EQBA 4BDOA 3C34A 4KYSA 1IEJA 1SYIA 1ZBMA 4BDNA 1B3LA 1N3XA 3C35A 3EHSA 3OO7A 3B6TA 4L17A 1LGBC 4N6PA 1OLCA 5CI5A 2DWAA 3F11A 5JTYB 4LA9A 4GF8A 2RF1A 4TOZA 5ITOA 3OSQA 4FEDA 1ZKBA 4R74A 3IO6A 1ZIUA 4R6KA 1B7HA 3T66A 2ABHA 1MY1A 4MLQA 4YKKA 1AL3A 5BUUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LUBA 3IB2A 2F35A 4UACA 3MVXA 1LFHA 1NH7A 4PAFA 4DXBA 2XWIA 4N4UA 2QS4A 1FTLA 1RKMA 2Y84A 3ZS6A 3SESA 5EQAA 4P56A 3L6GA 3PGFA 3CFLA 2IEEA 2DE2A 4XKQA 1VSOA 1RDZA 1LCTA 3SERA 2NUVA 4MNCA 2DS9A 2Y5KA 1FTOA 3RPLB 1D3KA 2V84A 5CBRA 4OMBA 2Q2AA 4F1UA 1B6HA 4EF2A 3I3VA 5CMKA 3W9VA 1FTMA 4N8YA 2HEUA 2Y7KA 1XC1A 3OO6A 5DVJA 4IO2A 2PT2A 1NNTA 1OLAA 3FXQA 2DXRA 1RDYA 2MKZA 4QF9A 5TP9B 3DM0A 1A40A 5L9MA 2AYSA 2OCUA 4HS7A 2F3DA 1EU8A 2HAUA 1A7LA 2DYXA 5H8NB 3PMVA 3PUZE 1UTBB 5KDTB 4PGNA 1DTGA 3B6QA 2V4CA 2Q8JA 1M5EA 3MP8A 1FBFA 4P47A 3G7WA 4OESA 4PC9A 1NV0A 4PAIA 5ET5A 5CC2A 2A5TB 1Q9DA 3D4CA 4NF4A 4XKPA 4ELRA 3K6WA 3KSXA 2XD3A 3K1PA 4KR5A 1YXIA 4UABA 1KZ8A 2PYYA 1BIYA 3KJ7A 4X1DA 3PPRA 3FIRA 2FVZA 2Z22A 3CSGA 2CMOA 3IFCA 3TQLA 5F24A 1FBDA 2UVHA 2HPGA 3T93B 4MAGA 1QUJA 1LAFE 2Y7PA 5EQ7A 4X1BA 1BLFA 2UXAA 1JW4A 1LB9A 5DEXB 3KFMA 2RCAA 4F18A 3FGSA 2XXKA 1FBPA 4NQ8A 2V93A 4PFBA 2R6GE 4GBWA 3UK4A 4PETA 1ATGA 1LBCA 3SDFA 4FEBA 2QVVA 4Q0CA 1IMDA 1Y1ZA 3B50A 3R6UA 4RPOA 4Z7EA 1P1OA 1M5FA 3BFUA 3DLNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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