3TFLA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 129
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tflA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tflA01
3KG2A 4OBMA 1OIBA 3TZAA 4RPNA 3DP6A 3OOAA 1B0HA 3T66A 1IXIA 4DLDA 4R75A 3FUZA 1B5HA 4EDPA 5BUUA 3UA8A 1BLFA 2Q2AA 4NF4B 4TLLB 1LFGA 3ZSFA 4PQJA 1IZ1A 1QKBA 1MXUA 4ZDMA 3MUQA 3TUSA 4PP0A 3AXFA 3H6UA 5CI5A 1US4A 1LB8A 4OEVA 4Q30B 4KYDA 4H1XA 2LAOA 4DE8A 1TWYA 3VV5A 2CZLA 1MXYA 2YPNA 4YMAA 3FATA 3C36A 1MY1A 3Q29A 2H25A 1B5IA 4KYEA 1XHYA 3G3KA 3K0VA 4GXSB 4F1UA 3WAFA 3H6TA 2M8CA 4LA9A 3N5LA 3W15C 3ECRA 4G68A 4ELQA 1NNPA 2PYYA 4GL8A 2O7UA 2AL5A 3ODBA 1PDAA 3TQLA 1D9VA 4WEDA 1EZOA 2NUVA 2ONKE 2GHBA 4P0GA 1NNKA 3CG1A 3MP6A 3M3FA 4RXLA 1LAXA 3FGSA 2AL4A 3FJGA 5AA3A 1PB7A 1XC1A 1QKAA 3OSRA 4LZ5A 2NWJA 3PU5A 4MFIA 3PMWA 1UIVA 1QULA 3EHTA 5DEXA 3KSJA 1LCTA 5DVJA 1M5EA 1GV8A 2YJPA 1MPDA 1YTVA 3E3KA 1TFAA 1H43A 4RY1A 2XXXA 1S50A 5F7VA 5KZTA 2QS3A 5I2KA 3IO4A 1DMBA 4R74A 3K1PA 3UP9A 1KWHA 3DELB 3VE1B 1LAHE 4XIGQ 3MJNA 2DWHA 1ELJA 4R6HA 2Q8JA 3HPIA 4ZE8A 4OETA 3QIMA 3QAXA 3SKPA 3O6IA 4YU0A 5HM4B 3Q26A 4GOTA 4YZZA 5JTYB 4EF2A 4LATA 4BLAA 1B58A 2XXIA 2XX8A 4F2QA 4IGTA 2Z22A 4ONYA 2DS9A 4M4GA 5CMMA 4ZS9A 4BDNA 4NF6B 1B7HA 4H8IA 1UTBB 3K4UA 3SERA 4H0WA 2Y7IA 4C1TA 1SI1A 2DVCA 3TYHA 3RUMA 1MG1A 3D4GA 1MH4A 1URSA 5KDTB 2B3FA 3H7MA 4F29A 4G68C 5FHMA 4BDQA 5A5XA 1AOVA 2DXYA 1GTKA 1NH7A 5J1DA 3TEPA 1P1QA 1ZU0A 2I48A 4FAJA 3K2DA 1B0LA 1L5TA 2ZNUA 3MP8A 4C1UA 4QF9A 2PBWA 3IR1A 1UTHA 3VLVA 2UVGA 3MBPA 5AA1A 1D3KA 3PMXA 4LQ5A 1P1NA 4H67A 2REGA 1B3LA 3SEYA 4X9TA 1LAFE 4N6PA 1VFDA 3Q28A 3O9PA 3MC2A 4X1BA 1MPBA 3ZKLA 2GHAA 3MPKA 1LLSA 2B65A 2OZZA 3OSQA 3T96B 2B3BA 3KN8A 1MY3A 2Q88A 4R73A 4NF4A 4NMYA 1Q1KA 3G7WA 4F3GA 3O29A 1B05A 4QFNA 1IEJA 3RN8A 4IGRA 4HW8A 4F31B 1SI0A 3IOWA 2NVUB 1HSLA 4LUBA 1HSEA 1IITA 3MVWA 2AIXA 3O28A 2VD2A 1A7LA 1LFHA 2VHAA 1VSOA 3B7DA 4MF3A 1Y3NA 5L9MA 2XX7A 4F18A 3HN0A 3KJ7A 5TPAA 5EHSA 1Y1ZA 2I4CA 3C32A 1URGA 1OVBA 2DP8A 3TTRA 1A99A 5FTHA 1YCJA 3ILUB 1MQGA 4U1ZA 1PB9A 2UYEA 4KI0E 4IB2A 1DPEA 4QFKA 3MP1A 1MH3A 3FVNA 3P7IA 4IY6A 1FQBA 2BJJX 2O69A 4ELOA 1JVXA 4RYAA 1LBBA 1QUJA 1BIYA 3OELA 1N04A 1DTZA 5EHMA 1USYE 2RC8A 3CI8A 3TDJA 5IAIA 2I3VA 5DVFA 3W9VA 1R1NA 4DXBA 5I2KB 4F3SA 5TU0A 3LSWA 3GBAA 2I3WA 3HO7A 2O6AA 2F7CA 2XXTA 1SVXB 4TLMB 4GRKA 3TKDA 1AIVA 2PVUA 1ZKBA 1B32A 3UIFA 2XXWA 3CSBA 2O68A 2Z8DA 4JWYA 1UQWA 2O1MA 1IUDA 3B6TA 1O7TA 2OLBA 1Y9UA 1TT1A 4DIGA 1EU8A 2F6GA 2IEEA 3OXNA 3TTNA 1IXGA 4U2RA 1LCFA 2V3UA 1N0TA 2QS1A 1IIWA 2GH9A 2V25A 3K01A 2Q89A 4NF8A 5A5XB 5AA2B 3FVKA 5JTYA 3VXBA 1LB9A 2UVIA 5I56B 2A5TA 2Y7RA 1A54A 2XXVA 2YLNA 1M5CA 4Q0CA 3MVYA 3O97A 2GFEA 4OFJA 1POTA 4Z0IA 3L6GA 4OVJA 3USDA 2E1SA 3VFJA 2F6PA 5KDTA 3U93A 4E0XA 3C4MA 4LZ8A 4N07A 3MWBA 4YKIA 1Z7NE 3IJXB 4Q8RA 2XX9A 1IXHA 4OHNA 4Q5TA 4KHZE 1BTJA 1MDQA 4YKJA 4DE9A 3V83A 3SEUA 4N13A 4OXVA 5ELVA 2XXHA 1HSJA 2I4BA 4RPOA 1FQDA 3KEIA 1M5BA 2HEUA 4EXLA 2DE2A 1NKXA 3CIJA 2X7QA 3CG3A 3I6VA 4OFOA 3IL1B 4WKMA 4BDLA 3TQWA 3M3LA 1R9QA 4F19A 4OTEA 3OMBA 5TPAB 4MBPA 3MW0A 4XKRA 4PFWA 2RF1A 1N3WA 2HAVA 1AL3A 4RNSA 2VOZA 4MLVA 1JEUA 2F78A 3PE5A 4K3FA 2FA7A 3EHUA 4IO4A 4ECFA 1SQYA 4R6YA 4XKPA 1DSNA 4POWA 3IOUA 1NNTA 2I0CA 3S9MC 1B2HA 3OENA 3IB2A 1FTJA 5H8QB 1O64A 1DOTA 4KFQA 1M5FA 4QSCA 3JV9A 4OESA 4QHQA 4FECA 3IORA 4ZZEA 1AMFA 3PUWE 1XS5A 4GIZA 4HS7A 1QJMA 2PX1A 4OEUA 3VDFA 3LUYA 2DVZA 4ZEIA 4R2BA 1B52A 4U23A 3C9HA 3RGYA 4ZECA 2NOOA 1JETA 3UK4A 2H9BA 4G8NA 3C33A 1SYIA 2XHDA 1IXCA 3T9HB 2OCUA 3HHFA 2Z8FA 4H5GA 4EXKA 4JSOA 5ISUA 3RQTA 3FV1A 1A8EA 3LSLA 3U1OA 3VLUA 3W9WA 2G93A 1MQDA 3N94A 1B7ZA 1LSTA 3ILTB 2OJTA 3S4UA 1PB8A 2ZNTA 4GLIA 1ATGA 4Z7EA 1Y1MA 3WAEA 2FYIA 2VGQA 1M5DA 4QRZA 4KD5A 3TTKA 3PPRA 4IO2A 5K2YA 3T9VA 3TCHA 2OBGA 4NF8B 4KYSA 1MS7A 3K00A 1PC3A 2QL3A 3CFLA 2DOJA 3H4ZA 2A5TB 2CMOA 1MPCA 4ZEFA 4WXJA 2DSFA 1YPNA 3E9XA 4JSDA 2XD3A 4FEDA 2HXWA 2DWIA 1SW5A 3VXCA 4GQOA 1A8FA 4X1DA 2ZYMA 2I58A 3OD7A 5AA4A 1ZMGA 3KGCA 4HTGA 1NNFA 4NWDA 4R9GA 3TAJA 5I2NB 3FVOA 5BWJA 4XKQA 5AA2A 2P0SA 3PUYE 2H4IA 5I56A 5DT6A 3RT6B 2O7IA 3MVXA 4RK2A 4ELRA 2RC7A 1B4HA 1B9JA 1JW1A 5H8HA 2O84X 2ALUA 4YKKA 2RINA 2ONSA 2HFBA 1UIUA 3Q27A 2DE4A 1BP5A 4KPTA 4EUOA 3A3CA 5CMCA 2QMXA 3DP4A 3BFTA 3THIA 3KN3A 4OQOA 1JEVA 2Q9TA 3H03A 2AYSA 4O3CA 1GVCA 2I6EA 1P1WA 4AB6A 4ZEDA 5ITOA 4YB7A 2GRVA 3EHSA 5DTBA 1B7UA 1US5A 4DDDA 2QJEA 5AA2D 5CMBA 1T0KA 3V5AA 3FASA 2HAUA 2I0BA 2D3IA 3A09A 5IKBA 2F97A 5H8FB 4YAHX 4YB5A 4NEDA 5DVIA 3MQ9A 3N6UA 3VLWA 1NFTA 3H3GA 4XKNA 4FJPA 5LOMA 4GFRA 3NXHA 5H8SA 1OLAA 3KOTA 5HPQA 3SEVA 3G3HA 3BBRA 2ZYOA 3B6WA 1B3GA 3RLFE 5K2XA 1JVYA 1MXWA 1URDA 1S7YA 5FTIA 4OENA 3ZS6A 1MY0A 4ZEBA 2QMWA 4AQ4A 3KN7A 3LBSA 4XTCQ 3SEXA 1ZJLA 3CRBA 2DWAA 4EQ9A 1RYOA 2Z8EA 4YMBA 3OEMA 2Y84A 4PFTA 4F1YA 2H99A 3NROA 4GL0A 4P0IA 3G3JA 3TCGA 1AH5A 5HBCA 4H5FA 1XVYA 1VE4A 5L8DA 3OO9A 5H8QA 2Y7PA 1QUIA 1B4ZA 3CFXA 4POXA 3M3KA 5CC2A 3FXUA 3HHGA 1EZPA 1Z7ME 4FE8A 1ZLQA 3KFMA 3G3IA 4ND9A 1SD3A 4EF1A 1Y3QA 4FORA 5ICQA 4THIA 3ONMA 1S9TA 2ABHA 4U1OA 2UVJA 3IB1A 2ZXTA 3OO7A 2H98A 2HZKA 3PPNA 5DYHA 1FTLA 3ZKKA 4HCWA 4LONB 2V93A 5I84A 4FEBA 3BKIB 3H06B 5CBSA 4RA1A 4G77A 4X48A 3TFLA 2QS2A 4LVQA 5CRYA 4DXCA 2P2AA 1JW5A 3O66A 3H6WA 5AA4B 1RYXA 2RC9A 1SDXA 2QRYA 1MQJA 2I49A 5CMKA 2DYXA 2ZYNA 2THIA 3VVFA 1B40A 5CM6A 3PMVA 3GZGA 2F35A 1JQFA 4JB7A 5FHNA 3SETA 4G8HA 3R26A 1FTOA 4ISUA 3PV0E 2P1SA 4U4XA 1D9YA 5H8HB 3S2VA 2XD2A 1R9LA 1MM7A 3QK6A 4UA8A 3IX1A 1PEBA 3SEWA 2XXPA 3IOTA 3K6WA 2V3TA 1J1NA 4M1VA 5I58B 3S9EA 4AB5A 3R6UA 3LSFB 4F3BA 2D5WA 1OQGA 1N84A 1DPPA 5I2NA 4QFLA 2RCAA 1SW4A 3S9NC 3O6GA 3FXRA 2ZNSA 3V89B 2F7AA 4DXUA 4ESWA 4ZEKA 1B46A 1POY1 4GD5A 1Y4TA 4U21A 2R6GE 3N6TA 2QPQA 2PMSA 3V8XB 3LSXA 3FV2A 4FIMA 2ONRA 1O63A 3TELA 2DE3A 3LR1A 3KSXA 4F3PA 5KCJA 2Y7KA 3LC8A 3IJOB 4MH5A 5TP9B 4I9DA 4LZ7A 1GR2A 4IO5A 1PBPA 4YICA 1B1XA 4TOZA 4KR5A 3L6HA 1WDNA 1N3XA 2A5SA 1FTKA 3IO6A 4FATA 2X7PA 4OMBA 5M2VA 1FQAA 4TQUQ 3E4RA 3K6XA 4RK9A 1XVXA 3A3UA 5H8FA 4LP2B 4RJZA 4ESXA 3MPLA 2E0SA 3C34A 4IO6A 1OQHA 2FNCA 3RPWA 3F11A 4DCXA 3CSGA 3FD3A 3OO8A 4C0RA 1P99A 3U94A 3K02A 1N7WA 4I1DA 4R72A 1MXZA 1MQIA 2UYFA 3FIRA 2HQ0A 5B70A 1B5JA 1FW0A 4PE5B 5JEIA 4QSEA 2F8DA 4PETA 1P1UA 3JYRA 3TODA 5I57B 3IAZA 5CBRA 3EN3A 4ZZAA 1WVJA 2O1LA 3T93B 3CFZA 2QSXA 5I59A 1H44A 3UGWA 3BFUA 5H8NB 3VVEA 1IQ7A 1BKAA 3EPEA 1RKMA 3MAMA 3TPAA 3N26A 3PUZE 3QUFA 1NMUA 3RY3A 3G3FA 2UVHA 3U8QA 2QS4A 1LGBC 3U92A 3CR9A 1MQHA 1MM6A 1XT8A 3C31A 4ZE9A 2ESNA 1LAGE 3TMGA 4R2FA 2D21A 3MZ9A 3O6HA 1B3EA 3K1NA 4F2OA 3MVZA 1NH8A 3KJTA 2HCAA 2HZLA 3PD8A 1FTMA 3EF7A 1I6BA 4OERA 1MY2A 2KLFA 2PT2A 1R6ZA 3QFIA 4BDMA 4U22A 3HCQA 2OWTA 4H65A 3CVGA 2OK2A 1MXXA 2Z23A 1QW0A 3RT8A 4ELPA 3Q25A 3HV1A 1Y3PA 2R9JA 5L9SA 1OLCA 1Q35A 3PUVE 3VVDA 2V84A 1H45A 4GF8A 2XXRA 3TCFA 2XXQA 4I8CA 5I58A 4BDRA 2DWJA 1VFEA 5KCJB 1YAEA 3U72A 1B3HA 1B1HA 4G8MA 4F39A 2OWSA 3I3VA 5FHOA 1II5A 3OO6A 4JWXA 3FJMA 1USYH 2XXUA 2WKYA 3S9LC 3D4CA 1N76A 1I6AA 4NF5A 1H3DA 2DXRA 4H6DA 4YKPA 4KQPA 4P11A 3C35A 3RNNA 3JZJA 3KBRA 2VP1A 3OEKA 3PPOA 3PPQA 3K1MA 4MLQA 3E13X 1OVTA 2H5YA 1I69A 3K6VA 1H76A 1SW2A 2Y7WA 5TP9A 2Q2CA 4O3BA 4GWOA 4QFPA 1TFDA 1I6QA 4JBZA 3UN6A 1WODA 2F7BA 4JDFA 1Y4CA 3IB0A 4G68B 4NE4A 1FQFA 3B6QA 5ICTA 2VD3A 1B51A 3TTMA 1P1OA 1ZTYA 1MRPA 2PT1A 3PD9A 3T9XB 1N7XA 2NXOA 4EQBA 3UORA 4OWDA 1NL5A 4PFUA 1ANFA 2ZMBA 2ZYKA 4IO3A 4QFOA 4GVOA 3G3GA 3QXMA 3O2AA 1FQEA 5I59B 4OYVA 4NWCA 1ZBMA 4JXIA 2W7YA 3KOSA 1XOCA 1LFIA 5DEXB 3SESA 1QUKA 4DZ1A 2XXYA 4R9FA 1OMPA 4G4PA 1SBPA 1EZ9A 1GGGA 3T22A 3TTLA 1FCKA 3RTWB 5F1QA 2DQVA 4YB6A 2F36A 4EQ7A 4HCYA 5JK4A 2X26A 5I57A 5EYFA 1B6HA 1A40A 1TXFA 1Y20A 4L17A 3RTFB 5L9OA 4IY5A 1QVSA 3FZVA 3IOVA 1FQCA 3SDFA 4F1VA 5H8NA 4BDOA 4LQ2A 4WEPA 4GXAA 4JWOA 3HSTA 3OWQA 1A55A 4QSDA 2REJA 1MY4A 3T9UA 5AE4A 3GBBA 2F34A 1EH3A 1MDP1 3KZGA 4I62A 3R7XA 3PUXE 4IO7A 1F9BA 4R6KA 1JW4A 2O51A 3GXAA 1ZIUA 1LBCA 4F22A 3FXQA 3OKZA 3FJ7A 4OFLA 3MZ1A 3PGFA 3IK6B 3I5OA 4NTLA 1VR5A 3M8UA 5B7DA 5ITPA 3EQ1A 2IA4A 1MXVA 1JNFA 4H8JA 3PPPA 4PFYA 2RCBA 1DTGA 3DLNA 3FVGA 2UXAA 3QSLA 4O3AA 2R71A 4E0WA 1D4NA 3DM0A 1SW1A 3DP8A 3H6VA 2G29A 2V3QA 4XXUA 1B3FA 3GLBA 1CB6A 1PBQA 1SYHA 2RKMA 4U4SA 4DCYA 4NF6A 1UTBA 2F5XA 1UTHB 4OZ9A 4UACA 3QYTA 1CE2A 4G2ZA 3MZBA 3K6UA 4KCDA 3QUJA 3MEJA 4KCCA 4NF5B 2ANJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KG2A 4OBMA 3GZDC 1OIBA 3TZAA 4RPNA 5A7LA 2LCVA 3DP6A 3OOAA 1B0HA 3T66A 2XA5A 1IXIA 4DLDA 3RZZA 4MCTA 4R75A 2XI8A 3FUZA 1B5HA 4EDPA 5BUUA 3UA8A 1BLFA 2Q2AA 1VPWA 4NF4B 4TLLB 1LFGA 3ZSFA 4PQJA 1IZ1A 1NUWA 1QKBA 3GUUA 1MXUA 4GHJA 4ZDMA 3MUQA 3TUSA 4PP0A 1KA1A 3LUZA 3AXFA 2WYKA 3H6UA 4PCDA 5CI5A 2EWTA 1US4A 1LB8A 4OEVA 1RDZA 2YBDA 3SR4A 4Q30B 2M4HA 4KYDA 1RZSA 4H1XA 2LAOA 4DE8A 1TWYA 3VV5A 2CZLA 2CZHA 1MXYA 2YPNA 3OMTA 4YMAA 3FATA 3C36A 4O8BA 5DW8A 1MY1A 3Q29A 2H25A 2KEKA 4WVLA 1B5IA 4KYEA 3G5GA 3FYAA 4GBWA 1XHYA 3G3KA 3K0VA 4GXSB 4F1UA 4PBQA 2OX3A 2QVRA 3WAFA 3H6TA 2M8CA 1NV1A 4LA9A 3N5LA 3W15C 3ECRA 1IMDA 4G68A 4ELQA 1NNPA 2PYYA 4GL8A 2O7UA 2AL5A 3ODBA 1PDAA 3TQLA 1D9VA 4WEDA 1EZOA 2PXBA 2NUVA 2ONKE 1Y9QA 2GHBA 5DSXA 4P0GA 3B50A 1NNKA 3CG1A 3MP6A 1BDHA 3M3FA 4RXLA 1LAXA 3FGSA 2AL4A 3FJGA 5AA3A 3B7HA 1PB7A 4OVRA 1XC1A 1QKAA 4HRAA 3OSRA 4LZ5A 3PU5A 2NWJA 4MFIA 3PMWA 1UIVA 2H8RA 1QULA 3EHTA 4PAKA 5DEXA 3KSJA 1LCTA 1JH9A 1M5EA 5DVJA 1GV8A 2YJPA 4ER0A 1VDWA 3GYYA 1MPDA 1YTVA 3E3KA 1TFAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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