3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
source organism Comamonas testosteroni
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
2QLZA 2VXZA 4HF2A 1Y20A 4NF8A 2X26A 2K86A 3PPQA 1BJAA 2GHAA 4TV7A 4PE5B 4G8NA 4ECFA 3U94A 3VVFA 3HRSA 4RAYA 3G3GA 3K01A 3K6VA 5FGMA 3ERED 3JTGA 1Q1HA 4LJZF 3U2RA 1QJMA 4OTEA 1P1UA 4DCXA 4HQEA 4DIGA 5DDGA 3KEOA 2RDPA 1H45A 3K4UA 1ZG5A 4OFJA 3JSOA 4F29A 5E20A 2XXRA 2THIA 3CJNA 4ZEDA 2D2WA 3QU3A 3K69A 4RJZA 3LC8A 1Y3QA 4E0WA 4LFUA 1J75A 3AAFA 2F5XA 2DQLA 4FECA 2F6GA 2VE9A 4ZZAA 1D4NA 4HAMA 3OENA 5HLHA 4ZDMA 1IXCA 3N4MA 3MZYA 3C7JA 5I2KA 2HFHA 3HYIA 2PJPA 4Q30B 1HW2A 2YLNA 2HFBA 5ICCA 1XHYA 2G93A 4GYGA 1OIBA 1MD0A 2DTRA 3C4MA 4QSCA 3SERA 2KKOA 5I57B 1Q1KA 4MLQA 1B7HA 4IHTA 3IAZA 1XC1A 3LSFB 3IORA 4DLDA 3TGNA 1G3SA 4BAYA 1QUKA 1V4RA 1S29A 4FORA 1TQIA 3SDFA 3BP8A 4OIOF 2OZZA 2O1LA 1M5BA 2STWA 1ZGAA 2EFNA 3LSXA 2DYXA 4OIRF 1IAWA 4AQ4A 3FVKA 4LG0A 2YPRA 1R5GA 4G2ZA 2L4MA 3T5XA 3K1PA 3MVWA 3E3VA 3UK4A 1YQAA 4KFCA 4YB6A 1Z6TA 4LK0F 4I09A 1YTYA 3GZGA 3TMGA 1IXSB 1QKAA 3QK6A 5EYFA 1Z7UA 1B7ZA 3GBBA 1B58A 2I4CA 3FJMA 2VE8A 1G3WA 1Z91A 3HIFA 4OMZA 3GFLA 5I2NB 3MEXA 1MJAA 3G3KA 4ELPA 1UQWA 3TYHA 3T66A 2Q8JA 5E1ZB 1LEBA 3CFXA 5HM4B 4U0VA 3TQLA 2A5YB 4HX8A 2FU4A 4RB0A 3H6UA 3MVYA 4KIGA 2HTJA 5CVUA 1P2FA 1O7LA 5DEXA 2BYVE 3W6JB 3ZMUA 4LZ5A 2ALUA 1B3HA 1GVJA 2HYGD 1B4HA 3I0TA 5K5QA 4U22A 3KLOA 4HYEA 5FD6A 3EETA 1PDNC 2UXAA 2CGPA 3KN3A 3WGIA 3DEUA 5KCJB 4RYAA 4PETA 3MZBA 5HLIA 2XGXA 2CFXA 4GLIA 2UXNA 4PGHA 3T9XB 3HOSA 3IWFA 4UUVA 1PBQA 1RYXA 2PLYA 1B59A 1TQPA 1L5TA 1QVSA 2I48A 3CLOA 4UNOA 2F5EA 4MEXF 2R9JA 3T93B 4AIJA 3F21A 3CUQB 2QYOA 2EK5A 2Y84A 3GLBA 4DNCA 4A5NA 1R9QA 3IJOB 4H6DA 1UTBB 2PBWA 4G7ZF 4AIKA 3TQNA 4U23A 4IXAA 1A8EA 1Y4TA 1NMUA 4HLYA 1L0OC 2HKOA 2XXIA 4KT5C 4G7OF 4OESA 1YLFA 2V1UA 4NF6A 4P55A 5H8FB 1OR7A 5ILSA 3ZN0A 1W5SA 4LGWA 3V7RA 1EH3A 1P99A 4OOIA 2L4AA 1I5ZA 1UHMA 1U5TB 3FXQA 3CG3A 5H8SA 3NRVA 1YPNA 2J5PA 3KBRA 1K6OA 1SDXA 4WXCA 1NNPA 3OO6A 4UA8A 1KU2A 2P7CB 2DWHA 3R6SA 4MBPA 1IN6A 2LNBA 1MQJA 2V9VA 2Z5UA 4FEBA 1RUOA 1POTA 1SD3A 5L8DA 5LBQA 1NNKA 2VD3A 3PFIA 4IGTA 4CHUA 2H25A 4RB1A 3EYIA 1P4XA 2DQRA 1F9BA 2HAVA 2O1MA 4F3PA 2Z3YA 5ICTA 3MZ1A 4OYVA 3MZ9A 2O84X 1R1UA 2W7YA 2O6GE 1AL3A 4NE4A 1B9JA 2OA4A 3I4PA 2P6TA 3LA2A 3C35A 4JSDA 1PC3A 2QL3A 2OAZA 2ZXJA 3BJ6A 2W25A 4B09A 1MH3A 1FLIA 3G7WA 5TP9A 1EH7A 1U3EM 2O03A 1S6LA 3R60A 4IB2A 2YR2A 1D9YA 5H8NA 2L01A 2V3UA 2M5WA 1KWHA 3CSGA 4HW8A 1IRFA 3FVGA 2BV6A 1U6GA 2VP1A 4Q5SF 1BIBA 4ZZDA 4F3GA 2EFWA 4RPOA 1HBXG 3VE1B 5CMMA 2QJEA 3E3KA 1MXXA 1ZN2A 4UHTA 2M8CA 2B3FA 4I8CA 1SYHA 3FX3A 4R75A 2PVUA 2WKYA 2X0LA 3PPRA 1WVJA 1ZG3A 3MP1A 5K5OA 2V25A 1O7FA 3JAMK 2DK8A 3GEZA 1FSHA 3PGFA 3O6BB 2E1NA 1O3SA 2FRHA 4OFOA 4AWXB 1QQIA 1SAXA 5I84A 4A6DA 3FM5A 2JRTA 3H6WA 1ANFA 1R23A 1DSNA 3RKWA 2Q9TA 3GXOA 1IF1A 3QOPA 2AIXA 3RLFE 4GVOA 4P9UA 2O8XA 2K7LA 3B73A 3O2PE 3D0SA 3WTYC 2F7AA 5CMCA 2XASA 3HUGA 1Y3PA 1USTA 1BC8C 2PX1A 1USSA 2Z8DA 3CSBA 4MNUA 2REGA 4JWOA 3ZS6A 1G3YA 3S2VA 2QPQA 4EJWA 3GW2A 1B32A 2CMOA 1MY4A 5DD8A 1XCVA 3EYYA 4BDQA 4KMFA 3FXUA 4WX9A 3DP7A 4I0AA 1KYWA 4EVIA 2R7FA 4ASNA 3LQRA 2HEUA 4QFPA 4F19A 3K0VA 2NUVA 1F5TA 4BHCA 2ZJ2A 4KN7X 3GYHX 4ESBA 2AL5A 2QQAA 1HW1A 4LB5A 5BUUA 2IA4A 3EDPA 2G9WA 5FHMA 1US5A 4RGRA 3QSLA 4WXJA 2FNPA 4I01A 3DV8A 5AIPA 1P4AA 3V8JA 1MXYA 2GHBA 4KR5A 5EHSA 1T0KA 4JWXA 2V84A 5J8FA 1R7JA 3O9PA 4Y17A 1IXIA 2Q88A 1R58A 3VB2A 3CRBA 5HDNA 3D4CA 3R6UA 1TWYA 1B2HA 4MQ9F 1DPPA 1LFIA 1UIVA 5ILVA 2V3QA 3JTHA 3PD8A 2QS3A 1CGPA 3C33A 1O57A 4EJVA 3I59B 2QMWA 5F64A 2F5CA 3CR9A 4A0YA 4P5OA 1G3TA 3COAC 1GHCA 4QLCU 1B7UA 5JK4A 5HDGA 3QUJA 4H8IA 1EZ9A 1M5DA 2EFOA 1BI3A 2O69A 1LAXA 4RGSA 3R7XA 2PT2A 1URGA 3MBPA 3K1MA 3K00A 4ESFA 3HOTA 4QWQA 1YO5C 4FEDA 1J2XA 3H03A 2DOJA 1K79A 3VVEA 4F1VA 2VC0A 3PMXA 2OU2A 4FE8A 1H44A 4HX7A 4YKKA 4EJUA 1D3KA 5BS6A 2H99A 5CMKA 2CG4A 1JXSA 3ZKKA 4BDMA 3H3UA 1JE8A 5F1QA 1USYE 2K4BA 4R2BA 4KYWA 3V89B 3HPIA 2H98A 5J8CA 2UVJA 2XD3A 4BH9A 3OO8A 4GOTA 2NNYA 1YYVA 3KN7A 5HS9A 5L3GA 1D3YA 2IEEA 2FSWA 2H6CA 3E6BA 3C32A 4NWCA 4JQFA 3TKYA 5LOMA 3GUDA 4G8XA 1NNFA 2A5TB 4U4XA 1MY3A 3EQLF 3LAPA 4R6KA 2HZKA 2COMA 1B9MA 2ZBKA 5FD5A 2XAHA 3HRTA 1YTVA 3EHSA 3OSRA 1FW0A 2XKOA 1QBJA 5H8HB 4F3BA 1MY2A 1WKMA 1Z1DA 3ILTB 3KFWX 1EV7A 1RKMA 3GWZA 4DCYA 1JVXA 3KE2A 3IKTA 3I64A 1M5FA 2I58A 4BDLA 5E8GA 4PQJA 1OVTA 3ABUA 3C31A 1HXDA 3TEPA 2I49A 4QHQA 2Y0MA 1LJ9A 1JEUA 4C0RA 1OYIA 3SEWA 3DM0A 1DTZA 5KZTA 1OLCA 3RYPA 3QXMA 3FIRA 3HTUA 4UVBA 2VC1A 2P2AA 3U8QA 4MF3A 2AL4A 4KA4A 5TPAA 4LMYA 2Y75A 4B8XA 1CF7B 1MPBA 4FJPA 3JAMZ 2UXXA 1KU9A 4KYEA 3KETA 5D8KB 2PYYA 2QWWA 1R36A 2V79A 4U7DA 1TQMA 3BY6A 4U88A 1LB2A 4CXFA 2YX4A 5HLGA 3V83A 3VXBA 1MDQA 3BROA 4YIFA 4ELQA 1POY1 4F31B 5K5RA 5KDTB 2H6BA 5ICQA 1K78B 1ULYA 4PDKA 1FZPB 2UWMA 3IL1B 4GL8A 1AH5A 2ZYNA 2HGCA 2HOEA 4ZYEA 1VTNC 4L9JA 1MQGA 2OWSA 4YB5A 3ZMDA 3M1EA 3MCZA 5TRDA 1TLHB 1L3LA 4TOZA 1REPC 4KHZE 3PPNA 5ISUA 5J6XA 3F11A 1A40A 5CYVA 1II5A 2E0SA 4O5VA 4CGZA 4OQOA 4U2RA 3ULQB 3GVAA 4ONYA 4H65A 3L2CA 4AD9A 1MY1A 4X9TA 2QMXA 4EQBA 5FTIA 3ECHA 3FHZA 4HZFA 4M6XA 2MD5A 4AVPA 2DWIA 2EFPA 3E6CC 2A07F 3DELB 1DPEA 3GZ6A 4S05A 5CVJA 2D45A 3C36A 4G94A 2O0YA 3Q9SA 2DXRA 1S3JA 1N3XA 3KEIA 1BN5A 3C34A 2JSCA 4EV0A 3MP8A 4HOBA 3TCFA 1R00A 1QW0A 1STZA 2QQ9A 5J1DA 4OERA 3U9GA 3T96B 1LB8A 4MH5A 2XROA 1JQFA 5KCJA 2OLBA 1XD7A 3ONMA 1P1OA 3SXYA 1GXQA 2KLFA 2OCUA 3EF7A 1Y0UA 3T0YA 2XIGA 4LLLA 3O2AA 4IY6A 4PGGA 2CWEA 1QPMA 2Y7KA 3WE3A 4OHNA 3T22A 1EZPA 1PUEE 1TBXA 2Y48A 3H3GA 2UZKA 1G4DA 2PT1A 1ZTYA 3G3IA 4LQ5A 4BDRA 3VVDA 2QS4A 5DUIA 4LA9A 4P0IA 3MW0A 1NFTA 1XMKA 4GQOA 2D21A 2Z8FA 1IITA 1K7AA 5LRRA 1OLAA 3WGGA 5H8FA 4DDDA 3EHTA 4ZZEA 4YKPA 3TDZC 4I2OA 1ZGJA 1U5TA 3ZN1A 1H76A 2I0BA 1AIVA 1B0HA 3Q29A 2H27A 1KQ8A 1VFDA 2Y7PA 2FNCA 3EQ1A 3HCQA 3VDFA 4NB5A 1XB4A 3KP5A 4BNCA 1BKAA 4ISUA 3VXCA 3WODF 3F8MA 4LLGF 3C1DA 3L00A 5DV5A 4FX4A 3KEQA 1JHFA 4LVQA 4KIFA 4I02A 1MG1A 2DI3A 1ZRCA 3IR1A 5DEQA 3THIA 2VOZA 2XHDA 3ROUA 2ZNYA 4MFIA 4O6JA 4ND9A 3ELKA 2L02A 5IKBA 3SEXA 5AA3A 4A2UA 1IQ7A 4I0BA 4IHSA 1FOKA 4GXSB 4UVAA 5KVRA 5DD4A 2REJA 3U92A 1A54A 1QUIA 3S9EA 4Q5TA 2P7VB 2O6AA 2LF7A 2O61A 1JNFA 5HOOA 3OXNA 1FBUA 2HEOA 1Y4CA 1B1HA 3V8XB 4WXDA 4CYDA 2E1CA 1GV8A 1AMFA 1MRPA 3B6WA 1LAHE 2VBYA 2MA3A 2UVGA 4GF8A 4ZEBA 4PFUA 1XSDA 1B3LA 4HDVA 4WCGA 4F7ZA 4C1UA 1N3WA 3VV5A 3FZVA 1EH6A 2E7XA 1OPCA 2PMHA 3F6OA 3BKIB 1I1SA 1FP2A 4R79A 2F36A 5LGTA 2PEXA 3J7AO 1JHHA 1SW1A 1R9LA 4Q4ZF 2EA2A 5TPAB 4HQMA 5DVFA 1Z6RA 2ACJA 3I5OA 1Y3NA 2HR3A 4BDNA 4PFTA 5HDKA 2NAZA 2PMSA 1UTHA 4RY1A 1S9TA 4MEYF 3T8RA 4M9ZA 3Q28A 4GXAA 2QBYA 1A55A 3NEUA 3KP2A 5JR3A 5ED4A 3GFJA 2ONSA 3D4GA 1XGNA 4OIPF 3S9LC 2D3IA 3FJ7A 2L54A 2M1BA 2HXWA 4QSDA 2M87A 4RB2C 4PFYA 1FBQA 3OSQA 1KA8A 1SYIA 3BPVA 1N04A 3UGWA 3G3FA 3SEYA 4YICA 4KUMA 2VODA 2F34A 2IA0A 1WWXA 3TTKA 3RDIA 1YFHA 4HS7A 1UCRA 5K2YA 3O29A 2GZWA 2JPCA 4LK1F 5H6RA 3P7NA 3M3LA 4YMAA 3ODBA 2EWNA 4RGXA 1B40A 3GF2A 1FP1D 5IT9K 1ZIUA 3RY3A 1W7PB 3BOQA 4IY5A 3T8TA 3M8EA 1PP8F 2E7WA 1XOCA 1P1QA 2OK2A 4QFLA 5D8LB 3MC2A 3I59A 3Q9VA 2O68A 3OELA 3LR1A 2VOPA 5CRYA 3CI8A 2MH2A 1SD4A 1ZU0A 3EPEA 1ZARA 1QKBA 1PBPA 4G68B 4DXUA 2DS9A 3V4GA 2RC4A 1QULA 3KOTA 3ECRA 2P8TA 5TJJA 3IL2A 1TXFA 2X7PA 3UA8A 2I3WA 1US4A 3WGHA 1A99A 4XKRA 2HQNA 2DE4A 4WF2A 3B7DA 2F8DA 3F8NA 3EN3A 2OZUA 1OQHA 4I98B 4OU0A 3IK6B 4KCCA 4KNYA 2NOOA 3I3VA 4M74A 1LSTA 1LBCA 4DXCA 3PU5A 5BPDA 1R1NA 3LFKA 3J80K 3IRQA 3B6TA 1B52A 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