1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
5DVJA 1B46A 1LAHE 4DXCA 2Z22A 3TCGA 2QS3A 3R7XA 1FQFA 4I9DA 1Y3QA 1ANFA 4KFQA 4YICA 4GL0A 4F29A 1H45A 3FV2A 5H8NB 1FQAA 4PP0A 1ZJLA 2KLFA 4F1UA 3MWBA 3MVZA 3KG2A 2Q2AA 1ZU0A 1Y1ZA 5KCJA 3H7MA 1H43A 4TLMB 3MC2A 2F7BA 1OVBA 3H6TA 4YB7A 1B6HA 4OHNA 2X7QA 1FTMA 2V3QA 2X26A 1LBCA 4PFWA 4DZ1A 5ICTA 2DXYA 1D9YA 4YKJA 1MPCA 3OEMA 2G29A 4TQUQ 2Z8DA 3O66A 1A99A 1LSTA 1WODA 3TPAA 1PDAA 1J1NA 1KWHA 1QVSA 3RNNA 3G3IA 1IXIA 4KPTA 4N6PA 2PMSA 5KDTA 1B05A 1B4ZA 3MBPA 2RKMA 3CIJA 1B5IA 1A55A 3PGFA 4QRZA 5AA3A 4LZ5A 3GLBA 4DCYA 1TT1A 4G68A 3G3HA 2A5TA 4YKIA 3UA8A 4EXLA 2F6GA 2B3BA 3C9HA 3PU5A 1N76A 1BLFA 4KYSA 3SDFA 4P0GA 1MY2A 2F34A 3FJMA 2I49A 3OO8A 3B6QA 2VD2A 3Q28A 5H8NA 1OLAA 3F11A 1QKAA 1DPPA 3HCQA 2OCUA 1MXUA 3PPPA 3K02A 1TWYA 2R6GE 3HN0A 3LSLA 5I57B 5TPAB 3FIRA 4YB5A 1NH8A 2V3TA 4F39A 2GRVA 1NL5A 2XXWA 2I58A 4DXUA 1O7TA 1H76A 3KN8A 3FVOA 3ZSFA 4GL8A 2Z23A 2Z8EA 2O6AA 3K1NA 1MY3A 4FJPA 2RF1A 4Z0IA 2IEEA 4ISUA 4KYEA 1SYHA 2H5YA 3SEWA 4F19A 3R26A 4FATA 3EHSA 3E9XA 4YAHX 3CSGA 4GF8A 3IJXB 1JW4A 2ZNTA 1WDNA 4RA1A 3SEXA 3FD3A 1P1NA 1Y4CA 2I6EA 4OFOA 4ZZEA 1AH5A 2PYYA 2R9JA 5LOMA 5AE4A 1LCFA 2W7YA 5AA1A 2XX8A 2P1SA 3RGYA 3CFZA 4E0WA 1OLCA 4LONB 1XHYA 2QS1A 2H98A 2VGQA 4HCYA 4G2ZA 4G77A 1FQDA 3PUXE 1JVXA 4RPOA 5EHMA 2DWIA 1B5HA 3D4GA 3A09A 3DELB 2LAOA 1TFAA 1JVYA 1OQHA 5TP9A 3OO6A 4GRKA 5I59A 1FQEA 1B1HA 4HCWA 3LC8A 4KCCA 4LQ2A 3IB1A 4R9GA 1MRPA 4H6DA 1PB8A 1LAFE 3OSRA 4ZDMA 3FUZA 2H99A 5I56B 1OVTA 3MP6A 1WVJA 2DVCA 4OEVA 2HQ0A 3OENA 3SEVA 4LA9A 2Y7RA 1B0LA 1POTA 1SW5A 4TLLB 2UXAA 3KFMA 3S4UA 3RTFB 3VE1B 4DDDA 5CMBA 3KOSA 2XD3A 5CBSA 1QULA 1UTHB 5I58A 4PFYA 3VDFA 2FNCA 4H5FA 3T22A 1Z7NE 3A3CA 4UA8A 2DOJA 3O2AA 3O9PA 1S7YA 1OIBA 2O69A 2ZXTA 4P0IA 4I62A 3S9MC 1HSJA 3PD8A 4NE4A 4ELPA 3HV1A 4GWOA 3C33A 4R75A 3U93A 3EHUA 3FJGA 3K6WA 1SI0A 3DM0A 3UK4A 3L6HA 3MPLA 5DVFA 1M5BA 2VD3A 4DXBA 2F5XA 3KSXA 4I8CA 1MM7A 1Y1MA 2RC9A 4OERA 3TAJA 3DP4A 2DYXA 3ODBA 2D21A 4ESXA 4JDFA 1B7ZA 4RY1A 4NWDA 4U22A 3RPWA 3LR1A 1URGA 1Q35A 2HXWA 3TUSA 5I56A 2XXIA 3TMGA 1R6ZA 3KBRA 1B58A 2DE4A 3PMWA 5B70A 2AIXA 3KEIA 4NF8B 4H5GA 3BKIB 5KZTA 1IIWA 1M5DA 1LFHA 1B52A 3H03A 3KJ7A 4LP2B 3C36A 1IZ1A 4JB7A 3UN6A 1LFIA 3N94A 4O3BA 2Y84A 1A8EA 3V83A 4LUBA 3MP1A 2OWTA 1B4HA 4H65A 2F6PA 3LSFB 2GH9A 2ONRA 1R1NA 4IY6A 4BDNA 3TTNA 4GFRA 2I3WA 3W15C 3N5LA 1N7WA 4POWA 3G3JA 4U2RA 3TDJA 2I4CA 2GHBA 1EZ9A 2F7CA 1AIVA 3O29A 4JWOA 4R6YA 1L5TA 4PFUA 1RKMA 3IL1B 4OZ9A 4YU0A 2O84X 3O28A 4H67A 1Y3NA 1LB8A 1MQJA 3HHGA 1USYH 2ZYMA 4ELRA 3PMXA 3JV9A 5L9OA 2F36A 5CI5A 5KDTB 4BDOA 1O64A 4NEDA 1MQGA 2QRYA 3MVYA 4EQ7A 1ZLQA 4R6KA 2OZZA 5F7VA 4G68B 1MS7A 3C4MA 2I0CA 5IKBA 1GV8A 1US5A 2XXQA 3VVFA 3FATA 1JW1A 3Q27A 4NF8A 1RYOA 4MLQA 2M8CA 3KOTA 3SETA 4NF6B 3K01A 5I84A 5BUUA 4G8NA 1NNTA 4JBZA 2I3VA 3E3KA 1DPEA 2E0SA 1UIVA 1TXFA 3FJ7A 4BLAA 1Y4TA 3LSXA 3TYHA 1AL3A 4NTLA 1SD3A 3PUZE 4WXJA 5H8QA 4ND9A 1BP5A 2ESNA 5I2NA 3Q25A 2RC8A 3VXCA 2F35A 3WAFA 3IR1A 5H8FA 4THIA 4U23A 4Q30B 3M3LA 3K00A 2XX7A 3OEKA 2QPQA 3TCHA 2VOZA 4LATA 4QFOA 3IORA 1H3DA 3EHTA 5AA2D 1QW0A 2ABHA 4U4XA 1A40A 1B7UA 3AXFA 3T66A 4PETA 1SW1A 3K6VA 3OELA 4ESWA 1LB9A 3TELA 4FE8A 2OK2A 1I6QA 4PFTA 3PPQA 5IAIA 4R73A 1M5EA 1GVCA 4ZEIA 3PPRA 3T9VA 4O3CA 3N6TA 4HTGA 1SYIA 3IO6A 1O63A 4ZECA 3O6IA 4NF6A 1NNPA 3QSLA 3DP8A 5FTIA 5H8SA 3TTKA 2HZKA 3BFUA 4FECA 2E1SA 4NF4B 4GXAA 4EUOA 1N04A 1ZKBA 2DQVA 4F1YA 4PQJA 5FTHA 4K3FA 3V8XB 1MXXA 4ZEBA 4EQBA 4F3BA 3PMVA 2V84A 2O7IA 1S50A 5I2KB 1LCTA 3MPKA 4OVJA 3TQLA 5TP9B 5I59B 3T96B 2NVUB 1YCJA 4R2BA 5CMKA 1P1QA 3H6VA 2Q2CA 5DT6A 4AQ4A 4KD5A 2P0SA 4QFLA 3T9UA 1NFTA 2B3FA 1B3LA 1VSOA 3MZ1A 3EQ1A 4HW8A 1EZPA 2XXXA 4ZS9A 3OOAA 1DMBA 2XXUA 4LZ7A 1A54A 1JQFA 4YKPA 4KYDA 2Q9TA 4EQ9A 5CC2A 3OO7A 4POXA 1IXCA 4XKQA 5I58B 5AA4B 1IXGA 4I1DA 4F3GA 5EHSA 4OMBA 3G3GA 4IO4A 4EDPA 4QFPA 5L9MA 3B7DA 2DVZA 1N7XA 1URDA 3H06B 3IX1A 4RNSA 3PPNA 2HFBA 5M2VA 1MDP1 3G7WA 5FHNA 2XXHA 2Q88A 1MXWA 3IK6B 4NF4A 3IJOB 2ZYNA 2DSFA 3TZAA 3S9NC 1MH3A 3LBSA 2I4BA 2O1LA 3C31A 4GQOA 1DTGA 3TFLA 2PT1A 1XOCA 5I2KA 3U1OA 3IB2A 5EYFA 2AL4A 4ZE8A 3W9WA 5TU0A 1GR2A 4RPNA 1XC1A 3RLFE 3G3FA 3K4UA 4C1TA 4F18A 1US4A 4U1ZA 3R6UA 4KR5A 4G4PA 4Q5TA 3USDA 4F3SA 3HSTA 2ONKE 3I5OA 1SW2A 4FEBA 4LZ8A 1FQBA 3SESA 2RINA 2DE3A 5DTBA 1S9TA 4HS7A 5FHOA 4P11A 1IXHA 1FCKA 4ZEKA 3TTRA 5AA4A 4JSOA 3QAXA 5K2YA 2XX9A 3RY3A 1SVXB 3KN7A 4FEDA 4WKMA 1DSNA 1LAGE 3TODA 4MF3A 4RJZA 3Q26A 1MQDA 4GOTA 2ZNUA 1LLSA 3IOVA 1P1WA 4U4SA 4OFLA 4OQOA 4E0XA 1B2HA 1NKXA 2RCAA 1ZMGA 3VVDA 2DXRA 1RYXA 3U8QA 3TEPA 3RN8A 4YZZA 1D3KA 3C35A 1BKAA 1F9BA 3QK6A 3ECRA 1PEBA 4NF5B 3VLVA 4IO7A 2ZNSA 3M8UA 3MAMA 3SEUA 2X7PA 3QIMA 4FORA 3ZKKA 4NWCA 3CFXA 3E13X 3WAEA 1B1XA 4U1OA 1BIYA 1EZOA 2VHAA 2V3UA 4KI0E 4C1UA 3CG1A 3CRBA 1DTZA 4JSDA 4X9TA 4YB6A 1P1OA 1ZTYA 2AL5A 2UVHA 3TTLA 4G68C 1I6BA 3PPOA 3E4RA 2DWAA 5L8DA 1MH4A 3TTMA 1LFGA 5FHMA 3L6GA 2XXRA 3GBBA 4F2QA 4YMAA 3JZJA 2OLBA 1YTVA 2AYSA 3PUYE 4MLVA 1Y9UA 1FTKA 2YJPA 1OQGA 2OJTA 1A8FA 4GXSB 3OD7A 3T9XB 4IO5A 5K2XA 5CMMA 1ZBMA 3T93B 5H8QB 5J1DA 1B5JA 1NMUA 3B6WA 5I2NB 5DEXB 3B6TA 5ISUA 4OFJA 4FAJA 1D9VA 1JW5A 1MQHA 3K1MA 5CMCA 1CB6A 4WEDA 5H8FB 3TCFA 4C0RA 1IUDA 1QUJA 4NF5A 4OWDA 4QHQA 3HO7A 4F1VA 2FA7A 3ONMA 2XXPA 2REJA 3ILTB 3LUYA 1Y3PA 4LQ5A 2PVUA 3K1PA 4N13A 3G3KA 1PB7A 3FZVA 1B3HA 4JXIA 2D3IA 5HPQA 1FTLA 1MPDA 2H9BA 2THIA 2YPNA 3EPEA 4DLDA 3U94A 5HBCA 1XS5A 1LGBC 3FXQA 4F31B 4ZE9A 2HCAA 3MQ9A 2V93A 3SERA 2ZYKA 2UVJA 4L17A 4QFKA 3IOUA 2QS4A 3ZKLA 3K6XA 3QUJA 3U72A 1FQCA 1JETA 3O97A 3FVNA 3GBAA 1N84A 5AA2B 4X48A 1MG1A 4QSCA 4XKRA 4IO3A 4Q8RA 1SBPA 3FXRA 1M5FA 2REGA 3CFLA 5DEXA 3O6HA 4KCDA 2Y7WA 1AOVA 1ELJA 1JNFA 3N26A 1I69A 2Y7IA 1SI1A 4QSDA 1UTBA 1HSEA 4R72A 3RT6B 4RK9A 5JTYB 1MY0A 2I0BA 4RYAA 3I3VA 2XXYA 2NWJA 3EF7A 1II5A 1PC3A 4X1BA 4FIMA 2QMWA 4M4GA 4DIGA 1URSA 2O51A 4OETA 1MY1A 3QUFA 2DE2A 4DE8A 3M3FA 3OO9A 1NNKA 1POY1 2DWHA 4OESA 3CR9A 1VE4A 1MY4A 2H25A 2UVIA 3S2VA 2YLNA 3W9VA 4EF1A 1T0KA 2F8DA 4JWYA 4IY5A 3S9LC 4IGTA 3RUMA 3PD9A 3JYRA 1NH7A 3K0VA 3RT8A 3GXAA 4F2OA 2GFEA 4XXUA 4PE5B 5L9SA 3CSBA 1B3FA 1MXYA 2HEUA 4R2FA 1R9QA 2Y7PA 5H8HA 4RK2A 4UACA 2ZMBA 5HM4B 1Y20A 4GVOA 3FV1A 4OEUA 4AB5A 2VP1A 4MBPA 2QSXA 1UIUA 3IOTA 3TQWA 1PB9A 1LBBA 3C32A 4GIZA 1Z7ME 3KSJA 5AA2A 2NUVA 5DYHA 2UVGA 4YKKA 1DOTA 3H3GA 3VVEA 1B3EA 2FYIA 4N07A 2Q8JA 2DP8A 4GD5A 3C34A 2OBGA 3FVGA 3V5AA 5JTYA 1B9JA 3MW0A 3PV0E 3H6WA 1FTOA 3IOWA 4LVQA 4M1VA 2PBWA 1N3WA 4O3AA 4WEPA 1XT8A 2ALUA 3ILUB 1QKBA 2F7AA 4YMBA 4KHZE 3KGCA 1D4NA 3BFTA 3ZS6A 3TKDA 2CMOA 2B65A 2I48A 1XVXA 2XD2A 3MP8A 4OXVA 5B7DA 4QSEA 4F3PA 1AMFA 4TOZA 1H44A 2DWJA 3VLWA 1A7LA 3K2DA 3UORA 3QYTA 3PUVE 2ZYOA 3FXUA 5A5XB 2UYEA 3OMBA 4G8HA 3VLUA 4F22A 1USYE 1MPBA 1TFDA 2P2AA 5F1QA 2O7UA 5ITPA 3MZBA 3IB0A 5CBRA 4X1DA 2XXTA 1ZIUA 4ELOA 1BTJA 3EN3A 5JK4A 1GGGA 3Q29A 2WKYA 4IGRA 4XIGQ 2PT2A 5CM6A 1NNFA 2IA4A 1P1UA 3MVXA 3CVGA 2PX1A 1VFDA 1SW4A 1N0TA 5ITOA 4OYVA 3FVKA 4DCXA 1XVYA 5I57A 3VV5A 3M3KA 5TPAA 3VXBA 4ZZAA 3K6UA 4U21A 1B40A 2D5WA 1OMPA 2XXVA 3THIA 2ANJA 1VFEA 3O6GA 4H8JA 1SDXA 1N3XA 3V89B 4R9FA 2Y7KA 2V25A 1B7HA 2RCBA 1QUKA 3S9EA 3MJNA 3CG3A 3KJTA 2NXOA 2A5SA 2NOOA 2Z8FA 4ECFA 2RC7A 1P99A 1HSLA 1YAEA 4H1XA 2GHAA 2Q89A 4EXKA 3IAZA 4QFNA 5A5XA 3N6UA 1MDQA 1B32A 1SQYA 1CE2A 3BBRA 1MXVA 1ATGA 2H4IA 1R9LA 3CI8A 1I6AA 2OWSA 5JEIA 1PBQA 4JWXA 2CZLA 4Z7EA 3U92A 4RXLA 1MXZA 4GLIA 4R74A 2O68A 4ONYA 3SEYA 1QUIA 3DP6A 2HAVA 1Q1KA 1MQIA 4IB2A 5ELVA 2QL3A 4H8IA 2ONSA 4KQPA 2HAUA 2QJEA 1M5CA 3OXNA 4XTCQ 3VFJA 1EH3A 1FTJA 3MZ9A 4XKNA 2UYFA 3GZGA 3LSWA 3HPIA 2BJJX 3I6VA 3UGWA 2QS2A 2R71A 2G93A 4BDRA 4BDLA 5ICQA 1PBPA 3RTWB 4IO2A 3KZGA 4G8MA 3H6UA 1JEVA 1MM6A 2F78A 4H0WA 4NMYA 3P7IA 3MUQA 5BWJA 3HHFA 2QMXA 3OSQA 1IQ7A 3FASA 3PUWE 1VR5A 4Q0CA 3UP9A 1UTHA 1B3GA 5DVIA 1B51A 5KCJB 1UTBB 3FGSA 3KN3A 4ZEDA 3H4ZA 1IEJA 4MFIA 4XKPA 3D4CA 3MVWA 1JEUA 4ZEFA 3A3UA 1IITA 4OENA 2DS9A 1EU8A 1FW0A 4EF2A 1GTKA 2HZLA 3T9HB 3UIFA 1UQWA 4BDQA 4BDMA 4IO6A 3SKPA 1B0HA 4QF9A 4R6HA 4AB6A 3IO4A 3RQTA 4OTEA 4MH5A 3QXMA 2F97A 1YPNA 2XHDA 1LAXA 2O1MA 5CRYA 5H8HB 4ELQA 2A5TB 3DLNA 1QJMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DVJA 1B46A 2Y5KA 1LAHE 2HHMA 4DXCA 2Z22A 3TCGA 2QS3A 3R7XA 1FQFA 4N8YA 4I9DA 1Y3QA 1ANFA 4PGPA 4KFQA 4YICA 4GL0A 4G61A 3PTYA 4F29A 1H45A 3FV2A 4O7IA 5H8NB 1FQAA 4PP0A 1ZJLA 2KLFA 4PGNA 4F1UA 3MWBA 3MVZA 3KG2A 2Q2AA 1ZU0A 1Y1ZA 5KCJA 3H7MA 1H43A 4TLMB 4HE0A 3MC2A 2F7BA 1OVBA 3H6TA 4YB7A 1DK4A 1B6HA 5EYGA 1RDXA 4OHNA 2X7QA 1FTMA 4PBQA 2V3QA 2X26A 1LBCA 1KA0A 4PFWA 4DZ1A 5ICTA 4PF8A 2DXYA 1D9YA 4YKJA 1MPCA 3OEMA 2G29A 4TQUQ 2Z8DA 3O66A 1A99A 1K9ZA 1LSTA 4OVQA 1WODA 3TPAA 2CZIA 1PDAA 1J1NA 1KWHA 1QVSA 1NV4A 4N6DA 3RNNA 3G3IA 1IXIA 4KPTA 4N6PA 2PMSA 5KDTA 1FBHA 1B05A 1B4ZA 3MBPA 2RKMA 3CIJA 4OVTA 1B5IA 1A55A 3PGFA 4QRZA 4O8MA 4LZ5A 5AA3A 3GLBA 4DCYA 1TT1A 4G68A 3G3HA 2A5TA 4YKIA 3UA8A 4EXLA 2F6GA 2B3BA 3C9HA 3PU5A 1N76A 1BLFA 4KYSA 3SDFA 2GQ1A 4P0GA 1MY2A 2F34A 3FJMA 2I49A 3OO8A 3B6QA 4PFBA 2VD2A 3Q28A 5H8NA 3FBPA 4PC9A 1OLAA 3F11A 1QKAA 2VPOA 2XA5A 1DPPA 3HCQA 1QGXA 1IMAA 2MKZA 4GWYA 2OCUA 1MXUA 3PPPA 3K02A 1TWYA 2R6GE 3HN0A 3LSLA 5I57B 5TPAB 3FIRA 4YB5A 1NH8A 2V3TA 4PBHA 4MX6A 4F39A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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