1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
1B5JA 2B65A 3H3GA 4ZE9A 4GVOA 3LBSA 1Y3QA 3IOTA 4NWCA 2RC8A 4NF8B 4ZEKA 3QUFA 3Q27A 4JXIA 3GLBA 3QUJA 3C31A 1URDA 1RYXA 4C0RA 1AIVA 1A8EA 1M5FA 3CRBA 1FTLA 3RUMA 4Q30B 3VVEA 3FD3A 3UK4A 1N76A 4IGTA 2I4CA 4F2OA 4GXSB 1GR2A 2RCAA 1QUKA 4KYSA 5DVIA 5KDTA 2F5XA 3T9HB 1URGA 3RT6B 2ALUA 2HAUA 3KG2A 4QFPA 1JW5A 2ONRA 5B7DA 5LOMA 4OWDA 4OFLA 4JWYA 5AA2D 3OO8A 4MFIA 2E0SA 3KGCA 2DE4A 1XHYA 1DTZA 3FJMA 3IOVA 2B3FA 3GBBA 3CSGA 3PPPA 4POWA 2HAVA 2AL4A 3IO6A 1QULA 1MY1A 1IXGA 3M3KA 4NMYA 4MH5A 3I5OA 3MZBA 1M5EA 3KFMA 4GL0A 2DWAA 1N7XA 4X1BA 3DP8A 2H5YA 2HZKA 2V3UA 3O6GA 2UVGA 3FJGA 1H44A 4AQ4A 3JV9A 2DWJA 3K6VA 3N5LA 2Y7KA 2I0CA 1ZBMA 4P0GA 2DVCA 4YB7A 3SEYA 1B52A 1QUJA 4NEDA 2F78A 5J1DA 1LFIA 3V83A 4RPOA 2RC9A 2F6GA 3H06B 2WKYA 2PMSA 4F1YA 1SW4A 4X48A 1LAGE 1ZLQA 4R6YA 5H8HA 3DP6A 5I58A 3GZGA 3HHFA 2F34A 1OIBA 1MXUA 1B3EA 2H25A 2ONSA 1B9JA 2B3BA 3S9EA 4BLAA 4PFYA 5TP9B 1DPPA 1NKXA 4PFUA 5TPAA 2FNCA 1I6BA 3CG3A 4F1VA 4R6HA 3EPEA 1B6HA 4R2FA 1GTKA 2V3TA 5ICTA 1NNPA 3IB1A 1IXHA 4POXA 1NNKA 4KFQA 3PPNA 2CMOA 2QMXA 4R6KA 3M8UA 1SDXA 1B2HA 1TFAA 5L9OA 1US4A 2REJA 3OEKA 1N04A 4GOTA 4G68B 4LONB 1B3LA 3OENA 5JEIA 1GV8A 3K1PA 4C1TA 3VXBA 3CFXA 5DEXB 4LQ2A 1ZMGA 2AIXA 5I2KB 3SEUA 2UYFA 2FYIA 3SDFA 1B4HA 3T9XB 3OO6A 1A55A 5I2NB 5F1QA 2F6PA 4O3CA 3C34A 4X9TA 1F9BA 4WXJA 3KOTA 1EZ9A 5IKBA 3K01A 3T66A 1FQCA 1POY1 5DVJA 4LZ5A 5K2XA 2O7IA 2GH9A 4YKIA 3IORA 2UVJA 5B70A 3IX1A 4E0XA 3MC2A 1M5DA 4ECFA 1MY3A 1SD3A 5KCJA 4WEDA 4F3PA 2ZMBA 4H1XA 2DQVA 1BLFA 4XKRA 4ESXA 5DT6A 2XXPA 3U94A 3KN8A 2DE3A 1B5HA 4G68C 3TUSA 3SERA 1P1UA 4IO5A 4H67A 1Y20A 3HO7A 3C33A 1B1HA 1II5A 2XX7A 3H6TA 2DE2A 4R75A 1B40A 1YAEA 2Z8DA 2Y84A 2X7QA 3E13X 2ESNA 2GHAA 2Z23A 2AL5A 3P7IA 2IEEA 3H6UA 4U4XA 5CI5A 3G3HA 3QAXA 1VE4A 3GBAA 2ZXTA 4GD5A 2OLBA 2ZYOA 1WVJA 2Q88A 2THIA 4DXUA 1LCTA 2O51A 4OHNA 5KDTB 5DTBA 2Q8JA 3U8QA 2YPNA 3MUQA 2XXUA 1UTHA 1N3XA 4OTEA 1DOTA 2DP8A 1D4NA 1FQFA 1JW4A 4GWOA 2O1LA 2VHAA 3ILUB 3PUVE 4NWDA 4JWOA 4HS7A 5ISUA 3TAJA 3HN0A 4I62A 2CZLA 3MVZA 1B7HA 5CC2A 3TCFA 2UXAA 1HSJA 4QSCA 4RXLA 2R71A 3VLUA 3LSLA 3OSQA 3U72A 4EQ9A 1QUIA 3EHTA 3TODA 1LSTA 1FTJA 2RF1A 5H8NA 1D9YA 1VFDA 4BDOA 4PE5B 4TOZA 4TLMB 5L8DA 3UGWA 3FUZA 4R73A 3L6HA 2OWSA 3MPLA 1FTKA 2E1SA 1B3GA 2Y7IA 2Q2CA 5L9SA 4BDNA 3H6VA 1MY4A 1S9TA 4N07A 3TZAA 4QRZA 3Q28A 5I84A 3MJNA 5BUUA 3FATA 4ZEBA 1JQFA 2NVUB 5ELVA 1A7LA 3KOSA 4N13A 5H8HB 3CFLA 1HSEA 5I58B 5AA1A 4LVQA 1ANFA 4F31B 4IO4A 3B6QA 5AA4A 3SEWA 1AL3A 3TQWA 5H8QA 3K2DA 3VLVA 1URSA 5TPAB 1OLAA 2XHDA 2PT1A 3VV5A 3IOWA 4OYVA 2F7CA 4I9DA 3EHUA 2QMWA 3FV2A 1B1XA 1SYHA 4GIZA 2PBWA 2PT2A 3BBRA 1HSLA 3TTNA 1SI0A 4F39A 3EN3A 4KYEA 1OMPA 1PB9A 3IO4A 2QS3A 1AMFA 1ELJA 2ZNTA 1IXIA 4ELRA 1PC3A 4H6DA 3T93B 3IOUA 3MP8A 3K02A 3FVOA 1B0HA 1JVYA 4GLIA 3G3FA 5CBRA 1R9QA 3FVGA 4EF2A 1A40A 3OO7A 2XXTA 5CMCA 3VE1B 1H43A 4HCWA 4HW8A 5M2VA 2V84A 3LSWA 2D21A 4XIGQ 4LATA 2DXRA 3PPRA 2XXWA 5KZTA 1P1WA 1IEJA 5FTIA 1OVBA 3MZ9A 4GRKA 5JK4A 3RGYA 4F3BA 4M4GA 2GHBA 4XKPA 2P2AA 4FEBA 3S9LC 3O97A 5H8SA 3G3KA 3CIJA 2RCBA 2HQ0A 3IR1A 4K3FA 4YAHX 1O63A 1PB7A 2DYXA 4C1UA 4OXVA 3TFLA 4G77A 2HZLA 1B5IA 2R6GE 3DM0A 3R7XA 4YB5A 2RC7A 4DCXA 2A5TA 1D9VA 4KHZE 3VLWA 2W7YA 2Q9TA 4ISUA 1LAHE 4G8HA 3IAZA 2ZYNA 3MPKA 5AA2A 2VD3A 5CMKA 3L6GA 4YMBA 3PV0E 4EQBA 3PU5A 1GVCA 3O6IA 2OBGA 5H8FA 3QIMA 2DWIA 1LFHA 1Z7NE 3LC8A 1D3KA 3ODBA 1B7UA 3KSXA 4RY1A 3SEXA 1B05A 2X26A 1LAXA 3R26A 3ZKKA 1LAFE 4LZ7A 4H65A 3PPQA 1UTBB 1RYOA 3PMXA 2AYSA 2XX8A 4Z7EA 1LB8A 1ZIUA 4ELPA 2XXXA 1UTHB 3HV1A 4QSEA 4MLQA 3UP9A 3QK6A 1SVXB 5ITPA 4DE8A 1Y4CA 1CB6A 3OEMA 4NF8A 2PVUA 4BDLA 2F35A 4JB7A 3ILTB 1BIYA 4NF6A 3U1OA 1MS7A 3Q26A 3I6VA 3K0VA 4ELOA 5DVFA 2NWJA 5I56A 3M3LA 2DS9A 1QKBA 2Z22A 2QSXA 2PX1A 1JETA 1XVXA 1B7ZA 3PD8A 1SYIA 4BDRA 1UIUA 1FQEA 1NNTA 1NH8A 4GL8A 1OVTA 4MLVA 5H8NB 3B7DA 2F8DA 4LP2B 2I4BA 2Z8FA 4RA1A 3OELA 1POTA 1NL5A 2RINA 1RKMA 3K1NA 2QS1A 2Q89A 1QJMA 1CE2A 4P11A 1Q35A 2FA7A 3Q29A 1A8FA 2BJJX 3TQLA 3IK6B 2XX9A 3U92A 5K2YA 1EZPA 3ECRA 1M5BA 3N94A 3VXCA 4ZEDA 3LSXA 4ZEFA 2OJTA 1PBPA 2XXIA 2F36A 2HXWA 2QPQA 5AA4B 5H8QB 3F11A 1TWYA 2R9JA 3O6HA 3K6UA 3O66A 3S9MC 4OVJA 3HHGA 4NF4A 1FQBA 1OLCA 3EHSA 4QFKA 2ZNSA 4EXLA 3CFZA 4H8JA 1B46A 4PFWA 4DXBA 3M3FA 1A99A 3OMBA 4E0WA 3VDFA 1R6ZA 1MY2A 5ITOA 1Y9UA 2I3VA 4M1VA 3UORA 2ZYMA 2I58A 4EUOA 4R72A 2NUVA 3JZJA 3B6WA 3BFTA 2OK2A 1ZJLA 1JEVA 4DLDA 3KJ7A 4QFOA 5EHMA 1Z7ME 3G7WA 5FTHA 5DYHA 4I8CA 4ESWA 1FTMA 3KN3A 3T96B 3E4RA 2XXQA 2ZNUA 1B0LA 3ZSFA 3MQ9A 4WKMA 3MW0A 4PP0A 4OENA 3KBRA 3H03A 1JEUA 4IY6A 2NXOA 1P1NA 2GRVA 3TTMA 4ZDMA 3K4UA 3IL1B 1Y1ZA 2IA4A 1MQHA 3EQ1A 1EH3A 4KI0E 1MQGA 4JDFA 3S2VA 3E9XA 1IQ7A 4H0WA 2M8CA 4ZZAA 3ZKLA 4F2QA 2YJPA 3MP6A 4YKJA 1UQWA 1S7YA 2ABHA 1JVXA 3C36A 4IGRA 3FXUA 1FQAA 3CI8A 3D4CA 2O69A 4HCYA 4QFLA 1LGBC 1YCJA 4ZEIA 4R2BA 5DEXA 5I59A 4KCDA 3FXRA 4BDQA 3O29A 1FW0A 4U2RA 3FASA 1DMBA 1BKAA 2A5TB 4DZ1A 4Q8RA 1N84A 4LQ5A 4OETA 3FVNA 2Y7WA 4FE8A 2LAOA 2I49A 3TTLA 5CMMA 2YLNA 4ZECA 3TMGA 1MPCA 3OO9A 5HM4B 1P1OA 2QS4A 4ND9A 3MVXA 1IXCA 3O9PA 4YICA 2ZYKA 5H8FB 1PEBA 4IO2A 3RQTA 2V25A 2QS2A 5HPQA 4QHQA 3S4UA 3SETA 2D5WA 1IITA 1N7WA 4AB5A 2UYEA 2QJEA 2DOJA 3G3JA 4NF5A 2KLFA 1H76A 4R74A 1MXYA 4U23A 5CM6A 3PUYE 5JTYA 3LR1A 3KJTA 1ATGA 3W9WA 1SBPA 4G8MA 4YZZA 2Y7PA 1DPEA 3EF7A 4NE4A 2DSFA 4F18A 1LBBA 4H5GA 1A54A 4OESA 4QFNA 2XD2A 4ZS9A 1Y3NA 4NF6B 4TLLB 3PPOA 1JNFA 2V3QA 4RYAA 2PYYA 1R9LA 1YTVA 4OEUA 1PBQA 3AXFA 4ZE8A 2Q2AA 3OSRA 4JSDA 1MXXA 4EQ7A 4TQUQ 3MVWA 4IY5A 3K6WA 5I56B 3TCHA 1B51A 1NNFA 1MXWA 4YB6A 4RNSA 3OXNA 4LZ8A 4KD5A 3O28A 3FIRA 3MP1A 3OD7A 1Y3PA 5I57A 1B32A 4KCCA 3RTWB 5AA3A 2OWTA 1IIWA 2F97A 3MAMA 3PUZE 2O84X 1R1NA 3GXAA 4OEVA 3KEIA 3USDA 3C35A 1Y4TA 5A5XA 1I6QA 5ICQA 1LB9A 4DCYA 4F22A 3TPAA 1XS5A 1DSNA 4I1DA 1N3WA 4F3GA 4Q0CA 4LA9A 4KR5A 4EF1A 4F19A 3VFJA 3RY3A 1TFDA 1MRPA 2HCAA 3HSTA 3IJXB 5KCJB 3SESA 3CSBA 1PB8A 3I3VA 4JWXA 4PQJA 1YPNA 1SW2A 3RN8A 1MQDA 1SQYA 3U93A 2RKMA 4EDPA 3HCQA 3H4ZA 4DIGA 2VD2A 3BKIB 3K00A 3A3UA 3MWBA 4GQOA 1MM7A 3A3CA 4NF4B 2XD3A 3IB2A 1ZKBA 3N26A 2VGQA 4OERA 1H45A 1LCFA 2O6AA 1O64A 2XXHA 1VFEA 4U1ZA 4H5FA 2O1MA 2GFEA 1EU8A 3QYTA 2REGA 4R9FA 3FXQA 3G3IA 3TTRA 1US5A 4BDMA 2OCUA 4UACA 4FEDA 1XVYA 5FHNA 4G4PA 2P0SA 4JSOA 1IUDA 4YKKA 1LFGA 2ONKE 1SI1A 3T9VA 2QRYA 2DXYA 1KWHA 3RPWA 4RK2A 4L17A 3IJOB 1MH3A 1DTGA 1AH5A 3K1MA 3RLFE 3VVFA 3RT8A 4GXAA 4FAJA 3D4GA 3SKPA 4XKQA 1LBCA 2D3IA 3QXMA 1MY0A 3V8XB 4WEPA 3MVYA 3DLNA 1I6AA 1N0TA 1AOVA 4RPNA 2VOZA 3R6UA 1UIVA 1MH4A 1XT8A 5HBCA 1BTJA 3PMVA 3VVDA 4FECA 3T22A 5I59B 3CR9A 4F3SA 1JW1A 3FV1A 4G8NA 3TELA 4ZZEA 4P0IA 1OQHA 3FGSA 3PUXE 1NFTA 5EYFA 5AE4A 1ZTYA 3KN7A 3RNNA 1WODA 3ONMA 4JBZA 2NOOA 3N6TA 4U4SA 4F29A 2G93A 1MDP1 1MG1A 3OOAA 1SW1A 2V93A 3N6UA 1FTOA 5CMBA 4OFOA 2XXYA 5EHSA 3T9UA 3PUWE 1L5TA 3C4MA 1FCKA 2QL3A 4XKNA 2DVZA 1IZ1A 3BFUA 2OZZA 3W9VA 4IO6A 3WAEA 1FQDA 2I48A 1PDAA 1TXFA 1B4ZA 2I3WA 3W15C 4DXCA 2I0BA 3IB0A 3CG1A 2Z8EA 4NF5B 5BWJA 4IB2A 4R9GA 4DDDA 2HFBA 4KPTA 2VP1A 3V89B 2UVHA 3FJ7A 5JTYB 5IAIA 4U1OA 4FORA 5FHMA 3K6XA 4FIMA 4XTCQ 1MDQA 4NTLA 1MXZA 2DWHA 4FJPA 4LUBA 1T0KA 1MQIA 4KYDA 4O3BA 1LLSA 3H7MA 4QSDA 2X7PA 3MBPA 2A5SA 4GFRA 1J1NA 2G29A 1H3DA 3DELB 4MBPA 4OZ9A 1TT1A 4F1UA 4H8IA 3TDJA 4G2ZA 5TP9A 1Q1KA 3JYRA 1P99A 3C32A 4PETA 3KSJA 1UTBA 3LUYA 2F7BA 3RTFB 3S9NC 2ANJA 5I57B 1EZOA 1VR5A 1GGGA 3O2AA 2O68A 3FVKA 3FZVA 1OQGA 5CBSA 1MQJA 2H9BA 3PD9A 4UA8A 3CVGA 3UIFA 4YKPA 4OMBA 4MF3A 1B3FA 3WAFA 4X1DA 3TYHA 3UN6A 3DP4A 4XXUA 1NH7A 5A5XB 3V5AA 1P1QA 1B3HA 5L9MA 1XC1A 4YMAA 3LSFB 4G68A 1QKAA 4ELQA 4THIA 2H4IA 5CRYA 3C9HA 3ZS6A 2Y7RA 4RJZA 2XXVA 2XXRA 5TU0A 2UVIA 2O7UA 1XOCA 3MZ1A 3QSLA 1NMUA 3HPIA 2P1SA 1QVSA 2I6EA 5F7VA 4IO7A 4U21A 4OFJA 1USYH 2F7AA 1M5CA 3TKDA 3TCGA 1SW5A 4PFTA 5I2KA 4YU0A 4AB6A 4GF8A 1MXVA 3H6WA 5I2NA 1BP5A 2H99A 1O7TA 3E3KA 3PMWA 4ONYA 4Z0IA 1S50A 3PGFA 3UA8A 4HTGA 4KQPA 5AA2B 2HEUA 3THIA 1VSOA 4N6PA 5FHOA 1WDNA 2H98A 4OQOA 3A09A 3G3GA 1I69A 3Q25A 4IO3A 3KZGA 1MM6A 4U22A 1USYE 1MPDA 1QW0A 4O3AA 4QF9A 1ZU0A 3SEVA 1B58A 1Y1MA 4EXKA 4FATA 4RK9A 3B6TA 1MPBA 4Q5TA 3TTKA 3TEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F3DA 1B5JA 1KA1A 2B65A 3H3GA 4ZE9A 5EQAA 4GVOA 3LBSA 2WX9A 4G61A 4OA4A 1Y3QA 4H46A 3IOTA 4NWCA 2RC8A 4NF8B 4ZEKA 3QUFA 1IMBA 2CZIA 3Q27A 4JXIA 3GLBA 3QUJA 3C31A 1URDA 4O7IA 4PFIA 1RYXA 4C0RA 1AIVA 1A8EA 1M5FA 3CRBA 1FTLA 3RUMA 4Q30B 3VVEA 3FD3A 1IMCA 3UK4A 1N76A 4IGTA 4MIJA 4PC9A 2I4CA 4F2OA 4GXSB 1GR2A 2RCAA 1QUKA 4KYSA 5DVIA 5KDTA 2F5XA 3T9HB 1URGA 3RT6B 2ALUA 2HAUA 3KG2A 4QFPA 1JW5A 2OWZA 2ONRA 5B7DA 2VPOA 5LOMA 4OWDA 4OFLA 4JWYA 5AA2D 3OO8A 4MFIA 2E0SA 4NHBA 3KGCA 5LDZA 2DE4A 1XHYA 4GWXA 1DTZA 3FJMA 3IOVA 4OVPA 2B3FA 3GBBA 3CSGA 3PPPA 4POWA 2HAVA 4JVDA 2AL4A 3IO6A 1FBFA 4PTKA 1QULA 2JJKA 1BK4A 1MY1A 1IXGA 3M3KA 4NMYA 4MH5A 3KC1A 3I5OA 3MZBA 1M5EA 3KFMA 4GL0A 2DWAA 4MCOA 1N7XA 4MEVA 4X1BA 3DP8A 2H5YA 2HZKA 3E78A 2V3UA 3O6GA 2UVGA 2XWIA 3FJGA 1H44A 1NUXA 4AQ4A 3JV9A 2DWJA 3K6VA 3N5LA 2Y7KA 2I0CA 1ZBMA 4P0GA 4NGUA 1FBHA 4P9KA 2DVCA 4YB7A 5EYGA 3SEYA 1B52A 1QUJA 4NEDA 2F78A 5J1DA 1LFIA 3V83A 4RPOA 2RC9A 2F6GA 3H06B 2WKYA 2PMSA 4F1YA 1SW4A 4X48A 4N81A 1LAGE 1ZLQA 4R6YA 5H8HA 3DP6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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