3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
2XXHA 3IB1A 2XD3A 3W9WA 1MH4A 4U23A 5DYHA 2F35A 2OWSA 2RC9A 4RK2A 1P1WA 3B7DA 1QJMA 4DLDA 4JWXA 1AOVA 3AXFA 2DOJA 4YAHX 5CI5A 3DP4A 1R9LA 3C9HA 2H5YA 1DOTA 4F39A 5KZTA 3LSLA 2I0CA 3CR9A 4YMBA 4G68B 5TU0A 2I4CA 1SYHA 1WODA 2F7AA 4OQOA 3L6HA 1N84A 1P99A 5L9OA 4ELPA 3U1OA 4WEDA 4PFUA 2ZYKA 1MY4A 3LSFB 4OHNA 1MQIA 3KBRA 3OELA 3HHFA 4LZ7A 1TWYA 4EUOA 1I6AA 4PFTA 3DP8A 4QFKA 4RPOA 1B4HA 3T93B 3QYTA 3G7WA 3V83A 5AA3A 4IO5A 4IO6A 3O9PA 1B4ZA 2ABHA 2OZZA 4GF8A 3VLVA 3W15C 2ZYNA 2QPQA 3H4ZA 1PEBA 3TDJA 2UVGA 4AB6A 1ELJA 3OOAA 3CFXA 4ECFA 3I3VA 3MQ9A 3UORA 5CMCA 1MY3A 1B1XA 1B05A 2XXTA 1B2HA 1URDA 1O7TA 2I0BA 1JQFA 4KFQA 3R6UA 4ZEDA 1H3DA 1P1NA 1XS5A 1I6QA 2QS1A 3G3HA 2W7YA 1LCFA 3TTLA 4FORA 3K6UA 2E1SA 4ISUA 3SEYA 1NL5A 3E9XA 2HQ0A 3RGYA 1IXHA 2VD2A 4BDQA 3T22A 2A5TA 3VXCA 5AA2B 2Z8EA 1US4A 2DXRA 2O1LA 1GTKA 3FVNA 4R75A 3FD3A 5KDTA 4R72A 3U8QA 4G8MA 1Y3PA 3TPAA 1B58A 3EPEA 2Q9TA 1IXGA 2UYFA 2F5XA 2IA4A 2Y7PA 2V25A 2B3FA 3S4UA 2PT1A 3SERA 4P11A 1XVYA 4GL8A 2DYXA 3K1MA 4ELQA 1MXUA 4OFOA 2PBWA 4FECA 3IB0A 4F3PA 2NOOA 1LAHE 4R74A 3N6UA 1A8EA 2G29A 5I2NA 3KEIA 1VE4A 1FTKA 3PMXA 1A40A 3FV1A 1MDP1 3K1PA 2AL4A 4H1XA 3C33A 2FYIA 3KGCA 3FASA 2HAVA 3O97A 5FHNA 1Y4TA 1OQHA 3OMBA 1TT1A 3OEMA 3TEPA 5I57A 2DS9A 4Q0CA 1IUDA 4GLIA 3O6IA 1Y9UA 4ZEBA 3ILUB 1MQJA 3BFTA 2UVHA 3CVGA 4OYVA 5ICQA 4JDFA 4UA8A 5AA4B 2VHAA 1AH5A 4QHQA 5BUUA 2AL5A 3O66A 4ZS9A 4OVJA 3OO8A 2D3IA 4QSEA 1EH3A 4AB5A 3M8UA 1QUKA 3IK6B 1FQFA 4RXLA 3JV9A 4DXUA 3TQLA 2ZNUA 3MP6A 2ONRA 4GQOA 4KPTA 4ESWA 1US5A 3FJ7A 4NWCA 5H8HA 3RTFB 2DE3A 5CRYA 3N26A 5CBSA 2R71A 5DVJA 2I6EA 1LSTA 2O6AA 3CFLA 3U72A 5CM6A 3GZGA 4XKRA 2Y7RA 4R9GA 4PETA 3MJNA 3VLWA 4FEDA 1DPEA 1B3LA 4H67A 1MQHA 1MPCA 1USYH 5H8NB 1B3GA 4NF5B 4GXAA 5KCJB 3UA8A 4O3AA 1VFDA 3I6VA 3FGSA 1WVJA 3OSQA 5I84A 1JEUA 3IOWA 2H99A 4KYEA 1H76A 3OO7A 3VVEA 1B52A 1ZU0A 4X1BA 1MM7A 4EXKA 2QS3A 3OD7A 4NF4B 5AA2D 1ZBMA 2RINA 3PUYE 4EQ7A 1MY2A 4JWOA 4OERA 1OQGA 4C1TA 4RPNA 1B3HA 1LFIA 4GD5A 3V89B 2ZNTA 4LA9A 3PD9A 1Q1KA 4LZ8A 3CG1A 3TAJA 1XT8A 1IXIA 4E0WA 3S9MC 4NEDA 3HPIA 1FW0A 3PV0E 4EQBA 4IY5A 4DXCA 1MXZA 4AQ4A 1H43A 3MPLA 5EHSA 1SW1A 2NWJA 3GBAA 3FUZA 3ONMA 4OZ9A 4ZE8A 3MC2A 3CSGA 3DELB 3DLNA 3M3LA 4OEVA 2GFEA 2FA7A 1LAFE 3O6GA 2FNCA 5I59B 3HCQA 4TLLB 3LBSA 1UTHB 3G3KA 4C0RA 1IITA 4U21A 2NUVA 3JYRA 2GHBA 1TFAA 3JZJA 1LLSA 5CMKA 5AA2A 3SESA 4LP2B 2NVUB 1BKAA 2RC8A 3O2AA 3QUFA 4QRZA 1GGGA 3RT8A 3OO9A 5IKBA 3U92A 2ESNA 1Q35A 2DE2A 3E13X 3FATA 3PMWA 4JWYA 3TMGA 1N0TA 4OMBA 2HCAA 3MP8A 1P1QA 4LQ2A 4U4XA 1FQBA 4MH5A 2O7UA 5AA1A 2O51A 1PB7A 1N7XA 4IO4A 2Y7KA 3IJOB 4OETA 1MDQA 3T9UA 4ELRA 2DWJA 3FZVA 5ICTA 2NXOA 1ZJLA 2Z8FA 4LZ5A 3TTKA 3H3GA 3CIJA 3H7MA 1NNTA 2DWIA 3RTWB 4I62A 3K0VA 3IOVA 3S2VA 2YPNA 4KD5A 3IJXB 2ANJA 2BJJX 1B51A 5A5XB 2PT2A 3PUVE 2GHAA 4F3GA 4OWDA 4HCYA 4YB5A 4MF3A 1LCTA 1BLFA 1MH3A 2QRYA 1UIVA 3RNNA 2DVCA 5AA4A 1SDXA 2RKMA 4WXJA 2HAUA 2I58A 4YKPA 1RYXA 2REJA 3S9EA 3BFUA 3FXUA 1XVXA 3MP1A 4G68C 4FJPA 3MVZA 4LATA 2E0SA 1II5A 3FXQA 2R9JA 3H6UA 2F7CA 3USDA 1A99A 5ITOA 4IO2A 4JB7A 4ZEKA 1T0KA 5L8DA 1FQCA 1ZLQA 1AMFA 3MAMA 1LAXA 2KLFA 1MQDA 3KG2A 3P7IA 4NMYA 3G3FA 1DMBA 1LGBC 2H4IA 1MXWA 2H98A 1SI0A 3M3KA 4K3FA 1BTJA 1DSNA 3C31A 1EU8A 4PP0A 1USYE 2V3TA 3MPKA 5H8NA 1CE2A 4FAJA 4NF5A 5CC2A 1MPBA 2Y84A 4XIGQ 5KCJA 2F36A 4YB6A 1N3WA 1JEVA 1Y3NA 3BBRA 1EZ9A 1OLAA 5ITPA 3B6WA 3QSLA 2O7IA 4GIZA 3IB2A 4KCCA 1SW4A 2UVJA 1FQEA 2OJTA 1IQ7A 3PPOA 3SDFA 4NF4A 1JW4A 3MBPA 5H8SA 3FVOA 1PB9A 1EZOA 3QAXA 4DDDA 2XXQA 4Z7EA 1FTLA 2O68A 4QFOA 5LOMA 5JTYB 3N6TA 3C35A 3RN8A 3L6GA 3GXAA 2DQVA 4EXLA 1DTGA 2OBGA 1JNFA 2A5SA 4H65A 2VGQA 2XX7A 5ISUA 3Q25A 4BDOA 4IB2A 4WKMA 2PYYA 3PGFA 1Y20A 1NMUA 4YICA 3TQWA 3RUMA 1R9QA 4ZECA 3C4MA 2XXRA 4GFRA 1SVXB 4Q5TA 4G8NA 5I59A 2F97A 2ZYOA 1BP5A 1SW2A 1UTHA 1B5IA 4ND9A 3SEWA 4YKKA 2P2AA 2Q8JA 1D4NA 1O63A 1SI1A 3PU5A 1OVTA 3LUYA 2M8CA 3DP6A 4NWDA 2GH9A 1POY1 4IY6A 5TP9A 1NH8A 1LFHA 3UN6A 3K6XA 2O69A 1NFTA 1MPDA 4RJZA 4H5GA 3C36A 3TFLA 1MY1A 5DEXB 5CMMA 3SEUA 2I3VA 4U22A 3IO6A 3VDFA 3TELA 4H8IA 4DXBA 1B7HA 5I2KB 3SKPA 3MVYA 4F3SA 3PPNA 1QUJA 2QMWA 4KYSA 3Q26A 4ZDMA 1B7UA 1FQDA 1M5DA 3ZKLA 1P1OA 3OEKA 4OFLA 1MS7A 2HXWA 1JETA 4F31B 2REGA 2R6GE 1S50A 3T9VA 4HCWA 5F7VA 1D9YA 4BDRA 1OIBA 1GV8A 4H5FA 3VLUA 3MUQA 2H25A 3TKDA 4QFPA 1XOCA 1IZ1A 2WKYA 5A5XA 1GR2A 3RPWA 4U4SA 4I8CA 2Q88A 1AL3A 4FIMA 1POTA 4QSDA 4LONB 4MFIA 3TZAA 1ANFA 2QS2A 1DPPA 3K6WA 3D4CA 1Z7ME 1B7ZA 3K01A 3O29A 1ZIUA 3R26A 1MXXA 4F1VA 4POXA 2XX8A 3KFMA 1B0LA 1M5CA 2F78A 3KOTA 4DE8A 5I58B 3KJ7A 4P0GA 3TYHA 4N07A 3G3IA 2XHDA 2IEEA 4ZZEA 4R6KA 1OLCA 2Z22A 4I9DA 3VFJA 3FVGA 4G68A 4U1OA 3RLFE 5K2XA 4F29A 4RK9A 4GL0A 2RF1A 3Q27A 3TCFA 5FHOA 5J1DA 5JK4A 4JSOA 1ZKBA 1GVCA 3V8XB 4M1VA 1R1NA 2HZKA 2ALUA 3FJMA 1NNFA 4G2ZA 3LR1A 5DTBA 2H9BA 3M3FA 1HSEA 3KZGA 2F8DA 4TOZA 4H0WA 3VVFA 3MVXA 1UIUA 1YTVA 2B65A 2Y7IA 3ECRA 4PQJA 4YU0A 1DTZA 2VOZA 4F2OA 4GWOA 3K00A 5JTYA 1A55A 1JW1A 3TTMA 2XXIA 2D5WA 2ZXTA 4DIGA 1IIWA 5ELVA 3GLBA 5I56B 1NH7A 4EQ9A 2Z8DA 3VE1B 4NE4A 1TXFA 4QFNA 4BLAA 3IORA 4RY1A 4ONYA 2ZNSA 4XKNA 5JEIA 3IOUA 1M5EA 4BDLA 3PUWE 4NTLA 4O3BA 2ZYMA 3UIFA 3PPRA 4R6HA 3CG3A 3ILTB 4UACA 1PBPA 1JW5A 4OESA 1PBQA 3I5OA 4XXUA 3FV2A 4M4GA 1RYOA 2V3QA 1FCKA 4YZZA 1L5TA 1I6BA 1FQAA 3WAFA 5DEXA 4C1UA 5H8QB 3Q29A 5TPAB 4XKQA 4YMAA 5I2KA 3H6TA 1MG1A 4RYAA 3E4RA 2F6PA 3IO4A 3TCGA 3N94A 1UQWA 2PMSA 5AE4A 2I3WA 2ONSA 4G77A 2VD3A 3OXNA 3V5AA 5DVIA 3TCHA 4N13A 4BDMA 1MRPA 3EHUA 4LQ5A 3E3KA 3KSJA 4Z0IA 1ZTYA 3FJGA 1YAEA 3CSBA 3R7XA 3PPQA 3N5LA 2OCUA 3B6QA 4IO7A 5F1QA 4OTEA 1UTBB 4FATA 3GBBA 1QW0A 3H03A 4PE5B 4NF6B 1P1UA 3CFZA 3O28A 2QMXA 1QKBA 4YKIA 5H8HB 4R2BA 2OK2A 4X9TA 3KSXA 1URGA 2XXYA 1LB9A 3H6VA 1VFEA 4KCDA 1PDAA 3G3JA 1TFDA 3LSWA 5I58A 5EYFA 3EF7A 4TLMB 4BDNA 2HFBA 1B5JA 1A8FA 2XXPA 3FIRA 2AIXA 1B3EA 1B9JA 4DZ1A 4YKJA 2X7PA 3O6HA 1LBBA 4OXVA 1OVBA 3OSRA 4U2RA 3QUJA 3T66A 3HV1A 3K6VA 5L9MA 3CRBA 4G4PA 1B32A 3D4GA 4NF8B 1S9TA 3OENA 4ESXA 4F2QA 3KN8A 4OENA 4ZZAA 1N7WA 3DM0A 4XKPA 2XXWA 2XXXA 4R2FA 4I1DA 3QIMA 4ZEFA 4GRKA 3TTRA 1HSJA 1M5BA 4EDPA 3SEVA 1N3XA 1Y3QA 3RQTA 1N76A 3EQ1A 2YJPA 4MLVA 2Q89A 4DCYA 1O64A 4XTCQ 2VP1A 1B6HA 1A7LA 3IX1A 1M5FA 1QKAA 2XX9A 2Z23A 3KOSA 5I56A 1URSA 2YLNA 4MBPA 3FXRA 1N04A 5DT6A 2AYSA 1MXVA 3H06B 4QFLA 5H8FB 3ODBA 4LUBA 4HTGA 5HPQA 3LC8A 2F7BA 3MZBA 3MZ9A 1KWHA 2F34A 3UK4A 4HW8A 4IGRA 4L17A 1PC3A 1FTJA 4POWA 1SW5A 3MWBA 3PUZE 2LAOA 3CI8A 1J1NA 2UXAA 4N6PA 2XXUA 2X7QA 4U1ZA 2QL3A 3T9HB 4GXSB 3F11A 3K1NA 1FTMA 1R6ZA 2P0SA 4KYDA 5H8QA 2V3UA 2V93A 5TPAA 4TQUQ 1MQGA 1WDNA 1SD3A 3EHTA 1CB6A 4MLQA 5DVFA 3EN3A 5B7DA 3UP9A 3G3GA 3ZS6A 3A3CA 3KJTA 2OWTA 1SQYA 1QVSA 3THIA 4R73A 4JSDA 3LSXA 1SBPA 4F19A 3MW0A 1A54A 1Y4CA 3ZKKA 4E0XA 3HO7A 1F9BA 1MXYA 2RC7A 2I48A 4F3BA 5L9SA 3PUXE 2DE4A 4R6YA 1B46A 4X1DA 4OEUA 4R9FA 3SETA 1XC1A 1UTBA 5B70A 3S9LC 5CMBA 3T9XB 4ZE9A 1PB8A 3EHSA 3TODA 4KQPA 4NF6A 3KN7A 2DWHA 1B0HA 4O3CA 4QF9A 4IGTA 3U94A 3RY3A 4KI0E 3A3UA 4OFJA 4F1UA 1HSLA 4DCXA 1VSOA 1ZMGA 1ATGA 2XXVA 1EZPA 5M2VA 5FTIA 3HN0A 4FE8A 4THIA 5BWJA 2Q2AA 1S7YA 1QUIA 2G93A 1B1HA 3KN3A 2O84X 4RNSA 1RKMA 4KHZE 2PVUA 4KR5A 1B3FA 4JBZA 3K2DA 1NNKA 1I69A 2Y7WA 5HM4B 4PFWA 4NF8A 3QK6A 2PX1A 2QSXA 2THIA 2UVIA 1YPNA 2XD2A 3TTNA 1BIYA 3A09A 2GRVA 1VR5A 4H8JA 4Q30B 2OLBA 3Q28A 4WEPA 3HSTA 3PD8A 2DWAA 2P1SA 2I49A 3IAZA 3S9NC 3K02A 1H45A 2F6GA 3VVDA 5FTHA 3PPPA 2DXYA 4PFYA 4FEBA 3C32A 1FTOA 4YB7A 1OMPA 3W9VA 2A5TB 3ZSFA 4IO3A 4P0IA 1LFGA 1D9VA 3K4UA 3FVKA 2HZLA 5KDTB 3HHGA 3OO6A 5H8FA 1IEJA 4ELOA 2ZMBA 4G8HA 3IR1A 5CBRA 3QXMA 2RCAA 4F1YA 2D21A 2O1MA 3H6WA 2V84A 2X26A 1Y1ZA 1NNPA 4QSCA 2B3BA 1MM6A 3PMVA 5TP9B 1MY0A 1LBCA 2ONKE 1Y1MA 4ZEIA 4LVQA 2Q2CA 2HEUA 1NKXA 3MZ1A 3SEXA 1QULA 4GVOA 1B5HA 2QJEA 5I2NB 4F18A 5HBCA 2QS4A 4H6DA 2CZLA 5K2YA 1SYIA 3IOTA 1H44A 1JVYA 4X48A 4F22A 5EHMA 1AIVA 1JVXA 1XHYA 1IXCA 3C34A 5I57B 3B6TA 1YCJA 2CMOA 1B40A 2DP8A 4EF1A 3T96B 2DVZA 2UYEA 1LAGE 5FHMA 3RT6B 4JXIA 3U93A 3VV5A 4EF2A 3MVWA 4RA1A 3VXBA 4Q8RA 5IAIA 2DSFA 3BKIB 3WAEA 2I4BA 4HS7A 3UGWA 2RCBA 1D3KA 3TUSA 4GOTA 1LB8A 3IL1B 1Z7NE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXHA 3IB1A 2XD3A 3W9WA 1MH4A 4U23A 5DYHA 2F35A 4UABA 2QFLA 2XXKA 2OWSA 2RC9A 4RK2A 1P1WA 3B7DA 1QJMA 4DLDA 5EQ8A 4JWXA 2P3NA 1AOVA 3AXFA 1NV6A 2DOJA 4YAHX 1Q9DA 5CI5A 3DP4A 1R9LA 4N91A 3C9HA 1FPEA 2H5YA 1DOTA 4F39A 5KZTA 3LSLA 2I0CA 3CR9A 4YMBA 4G68B 5TU0A 2I4CA 1SYHA 1WODA 2F7AA 1FBCA 4OQOA 3L6HA 1N84A 1P99A 5L9OA 4ELPA 3U1OA 4WEDA 4PFUA 2ZYKA 1MY4A 3LSFB 4OHNA 1MQIA 3KBRA 3OELA 3HHFA 4LZ7A 1TWYA 3FBPA 4EUOA 1I6AA 4PFTA 3DP8A 4QFKA 4RPOA 1B4HA 3T93B 3QYTA 3G7WA 3V83A 5AA3A 4IO5A 4IO6A 4NAPA 3O9PA 1B4ZA 2ABHA 2OZZA 2Q74A 4GF8A 3VLVA 3W15C 1RDYA 3QMFA 4QBAA 2ZYNA 2QPQA 3H4ZA 1PEBA 3TDJA 2UVGA 4N81A 4AB6A 1ELJA 3OOAA 3CFXA 3I3VA 3MQ9A 4ECFA 3UORA 2PCRA 1G0IA 1JP4A 2ZZVA 5CMCA 3RPLA 1MY3A 1B1XA 1B05A 2XXTA 1B2HA 5J16A 1URDA 1O7TA 2I0BA 1JQFA 4N17A 1FJ9A 4KFQA 3R6UA 4ZEDA 1H3DA 1P1NA 1XS5A 1I6QA 1LBVA 3E79A 2QS1A 3G3HA 2W7YA 4H46A 1LCFA 4N6KA 4FORA 3K6UA 3TTLA 2E1SA 4N8YA 4ISUA 3SEYA 1NL5A 2CEYA 3E9XA 2HQ0A 3RGYA 1IXHA 2VD2A 4BDQA 5ESYA 3T22A 2A5TA 3VXCA 5AA2B 2Z8EA 1US4A 2DXRA 2O1LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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