4ESXA

Crystal structure of c. albicans thi5 complexed with plp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
310
structure length
309
Chain Sequence
GSHMSTNKITFLLNWEAAPYHIPVYLANIKGYFKDENLDIAILEPSNPSDVTELVGSGKVDMGLAMVHTLAAKARGFPVTSIGSLLDEPFTGICYLEGSGITSDFQSLKGKRIGYVGEFGKIQVDELTKHYGMTPDDYVAVRCGMNVAKYILEGTIDCGIGIECIQQVELEEALKEQGKDSNDAKMLRIDKLAELGCCCFCTILYIANDKFIAENPQAVKKFLKAIKRATDYMLAHPREAWAEYGNFKPTMQTDLNTKKFQRCYAYFSESLYNVHRDWRKVNNYGKRLDILPENYVPNYTNEYLSWPEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Pyrimidine biosynthesis enzyme THI13
publication title Thiamin pyrimidine biosynthesis in Candida albicans : a remarkable reaction between histidine and pyridoxal phosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Candida albicans
total genus 112
structure length 309
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4esxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4esxA01
4KR5A 4F31B 4EF2A 4IO6A 4KQPA 1JW5A 1LAFE 1UIUA 2ZXTA 4C0RA 4KPTA 1N04A 3OEMA 4OESA 2O69A 3H03A 2R9JA 2PYYA 3MVZA 3FJMA 1P1UA 5I2NB 1IZ1A 2R6GE 1ZTYA 2ZMBA 1ELJA 3KN7A 4LATA 1UTBA 3MVWA 5CI5A 3M3LA 3IL1B 3A3UA 4LP2B 5KDTB 3O66A 4GD5A 1GVCA 3H6VA 3TKDA 3FASA 3GBAA 1Y1ZA 4OYVA 5JK4A 3MPLA 1S50A 4FIMA 1OLCA 2P1SA 3OENA 3TCFA 3K1NA 4DZ1A 2DWAA 3HPIA 2HCAA 2ESNA 5HBCA 1QKAA 5BUUA 4NF6A 1MXWA 3E13X 4GXAA 4DDDA 3OEKA 3FXRA 1P1OA 1FQCA 1H45A 1RKMA 2QSXA 4Q5TA 1BP5A 3IK6B 3B6WA 1MM6A 1DSNA 3VVFA 3DP4A 5A5XB 4OMBA 2E1SA 3RQTA 1TFDA 4F19A 5B7DA 3FGSA 1NL5A 2QS1A 3U1OA 3PPRA 2I58A 4G2ZA 3QYTA 3A3CA 2XXRA 4R9GA 5H8FA 2REJA 3SKPA 4OQOA 1B0HA 5DVIA 1LAXA 3KOTA 5TPAA 3KSJA 1B52A 4GF8A 3KJ7A 1O63A 4KCCA 1SW5A 4RY1A 3S9NC 3ZSFA 2Y7RA 1SW1A 3OO6A 4KYDA 4BDMA 2VHAA 4BDNA 2W7YA 4X48A 4ZE9A 2O7IA 2Q9TA 1LFHA 5ICQA 3KFMA 3LSLA 4GXSB 3N94A 2UYEA 4ELQA 4XTCQ 5JTYA 2XX9A 5TP9A 1OQGA 4IB2A 3TODA 4JWXA 2F36A 3B6QA 1M5BA 2PT2A 4FATA 1N7WA 4QSCA 4E0XA 3IORA 4IY6A 2YLNA 3KN3A 3KG2A 4M4GA 4R75A 3O6GA 1EH3A 2YPNA 3RGYA 2I3VA 4HW8A 3MW0A 2I3WA 3QIMA 3RT8A 5I56A 2GRVA 2UVIA 4RPOA 5DTBA 2ANJA 4K3FA 4OHNA 2QPQA 3DP6A 1ZU0A 3PGFA 1O64A 3FV2A 5KZTA 3LUYA 4FEDA 3TZAA 4QFLA 4JWOA 2F97A 1N3XA 2F7CA 3A09A 4YKJA 1NH8A 4G8MA 3UK4A 4LQ5A 3T9XB 1DPEA 1Q1KA 1A99A 2NOOA 3PPNA 2D21A 2AL5A 4E0WA 2XXPA 1US4A 1URSA 4N07A 2F5XA 3P7IA 1A7LA 4LZ7A 4Q8RA 3AXFA 4FEBA 2M8CA 1MH3A 1EZOA 1FCKA 3IAZA 2WKYA 3S9MC 4MH5A 1MXYA 3IB1A 3TMGA 3CVGA 3VLUA 2PT1A 4NE4A 4JBZA 3C34A 3FXQA 3TPAA 4PETA 4LONB 5ELVA 3MZ1A 4MBPA 4JXIA 2Z8EA 2Q2CA 1JEVA 3MP1A 1H3DA 5F1QA 2DYXA 2F78A 4TLMB 4OFJA 2HXWA 1GTKA 5DEXA 1MDP1 2ZNUA 3MVYA 2UXAA 2Q89A 4BDOA 1BLFA 4H5FA 2ZYKA 1KWHA 3K1PA 4LZ5A 4ZEFA 3VVDA 5A5XA 2H25A 4GLIA 4JSDA 1MY4A 2DXYA 4XKQA 1JNFA 3MVXA 1MY3A 1UTBB 3PD9A 3D4CA 2OJTA 3EN3A 3IJXB 1XS5A 2RC8A 3IO4A 3PUZE 2XXHA 3TEPA 5IAIA 2QL3A 2UVJA 1MY2A 3PMXA 4YAHX 4YKPA 1IXGA 2I0CA 3DLNA 2G93A 3K6UA 2FYIA 3QK6A 4GWOA 4NMYA 4DE8A 4GOTA 4TLLB 1USYE 4NF6B 2F6GA 3K6WA 2X7QA 3K6XA 3VLWA 1MPBA 3U92A 1JW1A 2XXTA 2GFEA 3PUVE 1B3EA 3CI8A 4I8CA 1BIYA 4HS7A 3Q29A 2OLBA 5FTHA 5H8SA 1WVJA 4N13A 1SVXB 1CB6A 4WEPA 3FD3A 4UACA 3TTNA 3KZGA 3RLFE 4F3GA 2ONKE 2I49A 1AIVA 3RT6B 1JEUA 2IEEA 4WXJA 1JETA 1VSOA 3G7WA 3JV9A 5H8FB 4QSEA 3KEIA 5TPAB 1MQJA 4FE8A 3T9HB 3GBBA 3Q27A 4R6YA 4AQ4A 4DLDA 4JDFA 2R71A 4U4SA 4HCWA 4KYEA 1SBPA 4I9DA 2ONSA 4Z0IA 3TYHA 5BWJA 1II5A 3TCGA 3I3VA 2G29A 5M2VA 4G68C 3G3JA 2YJPA 3K4UA 2GHBA 4NF4A 2BJJX 5B70A 3IR1A 4F2QA 1XVXA 2H98A 1USYH 3U94A 4G4PA 4F18A 3K1MA 1A54A 5JTYB 4EXKA 3QSLA 1QJMA 1B3GA 1FTMA 2RKMA 3Q28A 3UN6A 3T93B 3S4UA 1OLAA 1B5JA 1B05A 3GXAA 5L8DA 1D3KA 4QRZA 1BKAA 1NFTA 3VFJA 3O28A 3CFLA 3LBSA 5I56B 5I84A 3FXUA 3QXMA 3TTMA 4ELPA 5FTIA 1EU8A 3R6UA 3SERA 5H8QA 4EDPA 2Y7KA 3SESA 3K2DA 1JVXA 1US5A 3ZKLA 3LSFB 4PFTA 1OVTA 2QRYA 4KFQA 5DT6A 1LGBC 1MQGA 4ECFA 4EQ7A 4F29A 4EUOA 2NWJA 4XKNA 1Y3NA 4ESWA 2Y7PA 1B40A 1PBPA 1LBCA 1SYHA 4ZS9A 1J1NA 2F7BA 4G8NA 4OEVA 1A55A 4N6PA 1R1NA 1LAHE 3KSXA 4Q0CA 3HHGA 3C31A 2Z8DA 3KBRA 2QMXA 3DELB 4HTGA 4AB6A 5CMBA 1GR2A 2F35A 5FHOA 3O2AA 4Z7EA 1QKBA 1B4ZA 1SI0A 3ECRA 4FAJA 2DP8A 3K6VA 3UIFA 5FHMA 1QW0A 3MPKA 2A5SA 3PV0E 1SW2A 4GIZA 2A5TA 3I5OA 2Q2AA 3Q25A 3WAEA 1MS7A 1Y20A 4R73A 5DEXB 1ZLQA 2D5WA 1L5TA 1SQYA 1VE4A 1IXIA 3FVGA 3N6UA 3OO8A 3TELA 4DCXA 4DIGA 4PFWA 1H43A 3M8UA 1B1HA 4RPNA 1B9JA 3N26A 1XHYA 3IOUA 3RTWB 3KJTA 4OTEA 1MPDA 1GV8A 2REGA 3L6HA 1AH5A 3MC2A 3ILTB 2ZNTA 3S9EA 3CR9A 2QJEA 4ZE8A 5AA4A 3SEUA 4LA9A 4GRKA 3C9HA 4ZEBA 1Z7NE 1NMUA 1ZBMA 2DVZA 4QFKA 4H8IA 4R2FA 1VFDA 4H0WA 1YTVA 2DVCA 5CRYA 2DSFA 2ZYMA 3N6TA 3IOTA 3FJGA 2F6PA 1MXXA 3ZKKA 2Q88A 3O6IA 2QS4A 1PB7A 3IO6A 4KYSA 1MXUA 4PFYA 4F2OA 5I57A 1JVYA 3H7MA 3DM0A 3GLBA 3T9VA 2ALUA 1MQDA 4LVQA 2QS3A 1MQIA 3FVOA 3E4RA 3V8XB 1XC1A 5ITPA 2RCAA 1UTHA 3RY3A 2NUVA 5AA1A 2IA4A 1MQHA 1DTZA 4TQUQ 3TTRA 4FORA 3U72A 1OQHA 5CBSA 1N0TA 1QUKA 3B7DA 5EHMA 3ILUB 4NF4B 3RN8A 2XXWA 3D4GA 1URGA 3EPEA 4LUBA 3VV5A 3MBPA 5TU0A 1Y4CA 4H5GA 4YMBA 5DVFA 4U23A 1M5FA 1MXVA 3M3KA 2ONRA 3C35A 1MH4A 3UORA 2AYSA 4R72A 1WDNA 4ELOA 4THIA 2THIA 4G68A 1R6ZA 4YB6A 1Q35A 1LB9A 3TQLA 4OFLA 3G3KA 4L17A 3BBRA 2VD2A 2XD3A 3VXCA 4ESXA 1IEJA 3LR1A 1FTLA 3MQ9A 1VFEA 1TT1A 1B4HA 4IO3A 3H4ZA 3FVKA 5H8QB 3OMBA 1N3WA 1D9YA 4F3BA 3DP8A 2OZZA 4QSDA 4O3AA 4KD5A 1RYXA 1RYOA 3C32A 1UIVA 3FVNA 4IGRA 3RUMA 3SETA 4RK9A 4JWYA 4DXUA 4KI0E 1FTOA 3C33A 4U1OA 5I58A 3TCHA 5EHSA 1FQDA 2DWHA 1B5HA 1B7UA 1NKXA 3O97A 4F1VA 3N5LA 5H8NA 3MJNA 1LCTA 3G3GA 3VXBA 1ZMGA 3PD8A 3ODBA 2Z8FA 3CSBA 5EYFA 2HZLA 1NNKA 3PMWA 1URDA 1MG1A 1PB8A 3IB2A 4F22A 3OELA 4EQ9A 1N76A 4YICA 3OO9A 4OXVA 4ELRA 2HAUA 2DXRA 2P0SA 4IO7A 1S7YA 4U4XA 2A5TB 1LAGE 1MRPA 4R6KA 3KGCA 3RPWA 2LAOA 2VGQA 3R26A 2GH9A 1FTKA 3SEWA 3TTLA 2Z22A 4NF8A 4Q30B 2ABHA 4QFPA 1ANFA 1QUIA 1Y3QA 2O68A 4WKMA 4BLAA 2V3TA 4F1UA 4F3PA 3KOSA 4IO2A 3MUQA 3H6UA 2H9BA 1FQBA 4POWA 3QUJA 4U22A 5L9OA 1Y4TA 5AA4B 5FHNA 2O1LA 2RF1A 3T96B 4ZEDA 1XOCA 2X7PA 1T0KA 1TWYA 4DXBA 4ZECA 3S2VA 5ISUA 5K2YA 3TDJA 1P99A 3SEXA 1PEBA 1IQ7A 2V84A 4MF3A 3TQWA 2I0BA 3IOVA 3K02A 2HZKA 4NF5A 3UA8A 3FJ7A 1QULA 2QS2A 4PP0A 1LCFA 4G8HA 2KLFA 5HM4B 5I57B 1GGGA 2HQ0A 4O3BA 2H4IA 3G3HA 3O6HA 4ZZEA 4F39A 3HN0A 3MZBA 1IUDA 4G77A 5AA2D 1B3LA 3W9VA 3PPOA 4GFRA 4YZZA 2DS9A 1FQAA 2Z23A 4H8JA 3FIRA 2I4CA 1UTHB 2DQVA 2P2AA 2XXVA 2XD2A 1B58A 2F8DA 1LB8A 1PB9A 3OSQA 4PFUA 2PVUA 1B3FA 1BTJA 1XVYA 1DOTA 4RA1A 1IITA 2XX7A 3C36A 1B7HA 4WEDA 5IKBA 3CG1A 1DPPA 1Z7ME 3IX1A 3T22A 1I6QA 3SEVA 2FNCA 1LFIA 1Y1MA 4OETA 2RCBA 2V93A 4IY5A 3R7XA 3E9XA 5I2KA 1B2HA 4G68B 5ITOA 2RC9A 4F1YA 1P1WA 4POXA 5ICTA 4EXLA 3CSGA 2DE4A 2O7UA 2B3FA 1MPCA 1H44A 1R9LA 3L6GA 2XXUA 1FTJA 3V83A 1H76A 3CFXA 3S9LC 4C1UA 2NXOA 4ZDMA 1TFAA 4HCYA 3BFUA 1MY0A 4GVOA 3K00A 1OMPA 4H1XA 4P0IA 5I58B 1HSLA 5AA2A 4XKPA 4YKKA 2RC7A 2V3UA 2DE2A 1NNPA 5H8NB 3TFLA 2PBWA 1D4NA 1OVBA 1M5CA 4R6HA 2OWSA 1JQFA 4ZZAA 1FW0A 4RYAA 5KCJA 4X1DA 2CZLA 2XX8A 1WODA 4BDQA 3LSXA 1YCJA 5CMKA 1ZKBA 4OZ9A 4LQ2A 2H5YA 3PPQA 3O29A 1VR5A 1OIBA 3T9UA 2B65A 2UVGA 4R2BA 1B46A 1P1NA 2O1MA 1NH7A 1LLSA 1CE2A 1NNTA 4ONYA 2XXXA 4AB5A 3UP9A 1SW4A 3UGWA 2GHAA 2AIXA 3FZVA 4OENA 2DWIA 3CRBA 4NF8B 3E3KA 4QFNA 1MXZA 1MM7A 4H6DA 2UYFA 3K01A 1M5DA 5CC2A 1I69A 5DYHA 1F9BA 1B32A 3B6TA 5I59B 1TXFA 5CM6A 5H8HA 3WAFA 3SDFA 4RJZA 5AA3A 3BFTA 2ZYNA 1FQEA 2PMSA 2Y84A 2XXQA 1SDXA 2Q8JA 1SYIA 3JZJA 4YMAA 3C4MA 2HAVA 3EHUA 4NWCA 4BDRA 4IGTA 4JB7A 4FECA 1LFGA 2I4BA 1A8FA 1A40A 1AMFA 1I6AA 4NF5B 2E0SA 1IXCA 4M1VA 3RNNA 1PC3A 4P0GA 3VLVA 1IXHA 1POTA 3MWBA 1A8EA 4H65A 3LC8A 4OWDA 2O6AA 3ZS6A 3G3IA 1B5IA 3SEYA 1FQFA 2V3QA 3THIA 3PU5A 3OOAA 2HEUA 4XIGQ 3MZ9A 3HV1A 1SD3A 2X26A 1N7XA 5I2NA 1R9QA 5CMCA 1B6HA 1PDAA 3PUXE 1IIWA 1XT8A 4KCDA 3H06B 4U21A 4NEDA 4MFIA 3VE1B 2DOJA 3T66A 5KDTA 2F7AA 3BKIB 4F3SA 1POY1 4RK2A 3EHTA 3CFZA 3KN8A 4IO5A 4GL8A 4DCYA 5F7VA 5L9SA 4PE5B 2RINA 1EZ9A 3G3FA 3U93A 5J1DA 2F34A 4I62A 2OK2A 2FA7A 1JW4A 4P11A 4ND9A 4DXCA 1ZIUA 3HSTA 3IB0A 3MAMA 2HFBA 3M3FA 4NTLA 2QMWA 3FATA 4PQJA 3K0VA 3V89B 3CIJA 4RNSA 5I2KB 4IO4A 2I48A 1ZJLA 4BDLA 4JSOA 1Y3PA 4XXUA 3TTKA 3U8QA 2ZNSA 1YPNA 3EHSA 2PX1A 2O84X 1AL3A 3F11A 1B1XA 3O9PA 4O3CA 1AOVA 4ZEKA 3LSWA 2VD3A 4LZ8A 1Y9UA 5K2XA 2OBGA 2XHDA 4NWDA 3USDA 3HO7A 3JYRA 4ZEIA 2OWTA 1B7ZA 1MY1A 2OCUA 1QUJA 4H67A 4R9FA 2AL4A 4QFOA 2XXYA 1S9TA 1SI1A 4OVJA 5AA2B 3W15C 3FUZA 3VVEA 3RTFB 1O7TA 1YAEA 3OSRA 4R74A 3Q26A 4GQOA 2O51A 2CMOA 4MLQA 2VOZA 4OFOA 3ONMA 1PBQA 1LSTA 3FV1A 5JEIA 5KCJB 3PUWE 5I59A 1M5EA 4TOZA 2V25A 5CMMA 4EF1A 2VP1A 4U2RA 4GL0A 3HHFA 3PPPA 4XKRA 3GZGA 4YU0A 1NNFA 4I1DA 1ATGA 3H6TA 3OO7A 3EF7A 3IOWA 2Y7WA 3PMVA 2I6EA 3MP6A 5CBRA 4X9TA 2DE3A 3VDFA 4KHZE 1HSJA 3OXNA 4RXLA 1DTGA 1B51A 3IJOB 4EQBA 1P1QA 2UVHA 3EQ1A 4ISUA 2B3BA 2DWJA 1D9VA 1N84A 3W9WA 2ZYOA 3CG3A 1LBBA 4YB5A 3OD7A 4UA8A 2H99A 3PUYE 5TP9B 4C1TA 4YB7A 4X1BA 3I6VA 3HCQA 1B0LA 4QHQA 1I6BA 5DVJA 2XXIA 5LOMA 5L9MA 4YKIA 4MLVA 5AE4A 4U1ZA 5H8HB 3H3GA 2D3IA 5HPQA 3QAXA 2NVUB 3MP8A 1MDQA 3QUFA 4OEUA 1B3HA 4FJPA 1HSEA 3H6WA 3TUSA 3V5AA 4OERA 2Y7IA 1EZPA 1UQWA 1QVSA 4QF9A 1DMBA 3TAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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