4F1V | Genus

Total Genus 119

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	119
sequence length	372
structure length	372
Chain Sequence	MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Phosphate-binding protein
molecule keywords	Putative alkaline phosphatase
publication title	The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas fluorescens
total genus	119
structure length	372
sequence length	372
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-05-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4f1vA02
3.40.190.260	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	4f1vA01

3HSTA 3KOSA 1D4NA 2GRVA 2XXTA 1PBQA 3T93B 4U23A 2OBGA 3PPQA 3VDFA 2Q89A 5AA1A 1UTBB 1B5IA 1IXGA 4KI0E 2UVGA 4JBZA 1B7UA 4ECFA 3MZ1A 1B2HA 5L8DA 2ESNA 2VHAA 4ZZEA 2H98A 4ZE9A 2O84X 4YB5A 2HAVA 3FJGA 4IO7A 4JSOA 4H0WA 4N6PA 4RPOA 1B32A 3KOTA 4U2RA 2CZLA 5H8QB 2RINA 4YB7A 3USDA 1OQHA 4G68B 4PFWA 2PBWA 2X7QA 5CBSA 3OO9A 4NE4A 3ILTB 2A5TB 1A40A 1S7YA 4H8IA 3MAMA 4KCCA 1YAEA 1H45A 1DPEA 3PGFA 2DE2A 2ZNSA 2VD3A 1M5DA 1N7XA 1ATGA 2V3TA 1M5CA 1USYE 5H8SA 4ELPA 4YKJA 4ZECA 3V83A 4KCDA 3K1NA 4PFUA 4OTEA 3DM0A 1SVXB 3GBBA 4POXA 1NNFA 4NF6B 3T96B 1QULA 3TDJA 3ZKLA 3V89B 1JEUA 1NH7A 3MW0A 4G2ZA 1SQYA 2F36A 2F78A 1OLCA 3LSFB 2OWSA 3IOWA 4F19A 1FQAA 2IEEA 3QIMA 5F7VA 2UVIA 4N13A 2XXWA 3DELB 2Y7WA 3TQWA 2DSFA 1MRPA 1GV8A 1NFTA 3IB1A 4X48A 4RJZA 4BDOA 2BJJX 4YMAA 3FV1A 3IJOB 5TP9B 2GHBA 1LCTA 3DLNA 3JYRA 3SEWA 2E0SA 5H8NB 1O63A 1P1NA 2I4BA 3V5AA 1N3XA 3TCHA 3SKPA 2H25A 2RKMA 5FTHA 4FORA 5DTBA 2XX7A 3SEYA 1H43A 3PMXA 2Z22A 1II5A 2O6AA 2I48A 4IO4A 3C32A 4F1YA 3OO7A 2QRYA 1TFDA 4JXIA 2ZXTA 4NF5A 3TMGA 3VE1B 5I56B 3VV5A 4O3AA 1ZU0A 2ZNUA 3M3LA 4KPTA 2XD2A 1Z7ME 3PUVE 1ELJA 2ZYNA 4JDFA 5FTIA 5A5XA 3CR9A 4RK9A 2P0SA 1XS5A 4WKMA 3H4ZA 1NKXA 1A8EA 1AMFA 1B58A 5HPQA 3G3GA 4NF8B 3IO6A 4YU0A 3LUYA 2Z8EA 1QUKA 2NVUB 3ODBA 1HSLA 2P1SA 4MLQA 5ISUA 2Q2AA 4R9GA 5KZTA 1H76A 1EZPA 1LSTA 4GQOA 3FV2A 4H1XA 4F3GA 3IAZA 3DP4A 5EHSA 5CMKA 4H6DA 3MVZA 5AA2A 3EPEA 4KYDA 2Y7RA 3PV0E 4G8MA 4E0XA 3K01A 2VGQA 3PUYE 4RK2A 5I59A 2D3IA 1FQBA 3UIFA 4X9TA 2F97A 1PB8A 1IQ7A 3CFLA 3K6VA 5K2YA 4FEBA 4ELQA 1QJMA 3WAFA 1WVJA 5B7DA 2QMXA 2YPNA 4YKPA 4LA9A 1MXUA 5L9OA 3IJXB 4OXVA 4RA1A 1B9JA 3GBAA 3FJMA 5FHNA 5DYHA 2RCAA 4G77A 1MPDA 3L6GA 4R2FA 1FQCA 3PD8A 4C1TA 5DVJA 1SI0A 1URDA 2HCAA 3E9XA 3HPIA 3U1OA 3LSWA 4XKRA 4XKNA 3IORA 1LBBA 3U94A 4RPNA 3EHSA 4GWOA 3PUWE 4WXJA 3EQ1A 4DXBA 3TKDA 4LQ5A 4M4GA 2H9BA 1PC3A 1Y9UA 3MC2A 2OLBA 3EHUA 5I57A 1MM6A 2WKYA 3N26A 3FVKA 4LP2B 4QFKA 3GXAA 3W15C 3PPPA 3BKIB 3FXUA 1OIBA 4DXUA 1LAHE 2O7IA 5I2KA 2PVUA 3H6UA 1R9QA 1IITA 2PT2A 1EZ9A 4DCXA 4OWDA 4EUOA 1CE2A 3GLBA 1LB9A 1IXIA 3MVYA 4I62A 3K6XA 3PU5A 1CB6A 3C4MA 2F8DA 3MWBA 3D4GA 3MZBA 1B7ZA 2XXXA 4EXKA 3G3FA 3DP6A 2I0BA 4L17A 2Q8JA 3H3GA 1JW4A 1US5A 3VFJA 3O6IA 1ZMGA 5HM4B 1B4HA 2I4CA 5KCJA 4LATA 1H44A 4ZDMA 1JETA 1SW5A 3H06B 3FATA 4OFJA 2YJPA 1P99A 5DEXB 4OETA 1MQIA 2R71A 2DS9A 4NF4A 3U93A 4ESXA 1FQEA 2XXUA 2Z8FA 2AL4A 3TELA 4XTCQ 3MP1A 2F34A 3TYHA 1DTGA 3IOUA 4G68C 3H6TA 2QS1A 1DSNA 3RUMA 3TTRA 1B52A 1GR2A 3PPOA 1B3GA 1FQDA 3N6TA 2HEUA 4IB2A 1ZKBA 2O68A 4X1BA 2NOOA 1B6HA 2F6GA 3U8QA 5DVIA 1VSOA 4NEDA 2RC7A 4UA8A 4MBPA 1MQGA 3IB2A 3S9LC 1SW1A 3KN3A 1UTHA 4F1UA 2X26A 4DLDA 4F3SA 3H6VA 3Q27A 3K6WA 4O3CA 4GF8A 4LUBA 1US4A 5JEIA 4F3PA 1VFEA 1JEVA 4GD5A 3F11A 3C34A 4LONB 2FNCA 3QXMA 3MUQA 3OEMA 4ZS9A 3S9EA 4PFTA 3A09A 1LCFA 2ZNTA 1FCKA 3HO7A 1I6QA 2UVHA 2HQ0A 1O7TA 4MF3A 4GIZA 3VLVA 4IGTA 3IL1B 1PEBA 5B70A 1TWYA 3Q25A 4GXAA 5L9MA 1I6AA 2ONKE 1OVBA 2QMWA 4TOZA 4U4XA 3I3VA 1M5BA 3TCGA 4R6YA 2R6GE 3MPKA 4ZZAA 3CSGA 1S9TA 5BWJA 1WDNA 1MXYA 1IEJA 1SYIA 2QS3A 3EHTA 3A3CA 1JW1A 3UP9A 4P0GA 3T22A 2XX9A 3QUFA 3FUZA 4IO6A 1MPCA 4TLMB 4XKQA 4G68A 4C0RA 4EXLA 4FECA 3WAEA 4POWA 3O9PA 4WEPA 3MVXA 2PYYA 4BDMA 5ICQA 4ELOA 1UQWA 2A5TA 2XXPA 3K2DA 4KYSA 2OK2A 1PBPA 3O66A 1LLSA 4YICA 4QFLA 2I0CA 1MY2A 1I69A 5I58A 4OFOA 2B3FA 4KHZE 1N84A 5KDTB 1USYH 1AIVA 1FTOA 4EF2A 4BDLA 3VVDA 3KBRA 2AL5A 1GVCA 3K0VA 4NF6A 5BUUA 3R26A 1B0LA 1GTKA 1XVXA 3IB0A 1A55A 1LFIA 2OZZA 2DWHA 3O2AA 4U1OA 1MG1A 3KJ7A 4XXUA 5ICTA 1B05A 1VE4A 1N76A 3SEXA 2DXYA 1B1XA 4AQ4A 3RNNA 3S4UA 4LVQA 3S2VA 5AA2D 3KSXA 4FIMA 5CI5A 2XXYA 3C9HA 1ZTYA 3FGSA 3LC8A 2V3UA 2D5WA 3T9VA 3TCFA 2REJA 4R75A 4OENA 4NF5B 3RTWB 3KSJA 4RYAA 4FATA 5IKBA 1IXHA 3HHGA 2PX1A 3MP8A 2I58A 3UK4A 4PQJA 4E0WA 4H5FA 4IGRA 3DP8A 3O28A 3TTNA 2OJTA 3FXRA 3D4CA 1IUDA 1B1HA 4QSEA 4TQUQ 2VP1A 4GVOA 5CMMA 1B40A 2B65A 2KLFA 2ZMBA 4R2BA 4F18A 4ZEDA 3A3UA 3VVFA 5FHOA 5H8FA 3Q26A 1SW2A 5TPAB 2NUVA 3V8XB 3K1MA 4H67A 1B5JA 4R72A 1MDP1 3SERA 4LZ7A 5CMBA 2QS2A 5AA2B 4KQPA 4XIGQ 5CRYA 1SW4A 1QVSA 1MXXA 4PFYA 2XD3A 4NF8A 2UYEA 4FE8A 1MXVA 3K4UA 1LBCA 2X7PA 3SESA 3OO6A 3QSLA 4NWDA 1VR5A 1IIWA 1P1QA 1ANFA 2HXWA 4G4PA 1A99A 4ZE8A 2XXQA 2F6PA 2QPQA 1PDAA 2DYXA 3TAJA 2VOZA 3K02A 3KN8A 2Y7KA 2A5SA 3G7WA 4F2QA 3CFZA 2OWTA 3G3JA 1BIYA 4X1DA 2DQVA 2DWAA 2V3QA 4C1UA 5H8HB 4UACA 1OQGA 2AYSA 5TU0A 4KFQA 4OYVA 1FTMA 3CFXA 1ZJLA 1FQFA 2Q2CA 4H5GA 4EF1A 4RNSA 1B3FA 3CG1A 1N04A 3OSRA 4YZZA 5JTYA 3UORA 3U72A 3ZSFA 1YCJA 1NNTA 3CIJA 3KJTA 3CVGA 1JVYA 4G8HA 3M8UA 1MDQA 4OQOA 1Y4TA 5DVFA 3T9HB 3KFMA 3KEIA 2XXIA 3FJ7A 4LZ5A 4M1VA 4ESWA 4R73A 3JV9A 4AB5A 3B7DA 3TZAA 2F7BA 4THIA 4QSDA 3HV1A 3Q28A 1AH5A 2M8CA 1Y3NA 5I2KB 4DZ1A 1TXFA 4F31B 3UN6A 3OSQA 4XKPA 2RCBA 2QJEA 3T9XB 1KWHA 1SDXA 4OEUA 2E1SA 1LAGE 3ILUB 4Q30B 3MQ9A 1PB9A 4JWYA 1B7HA 5CMCA 1RYXA 3ONMA 3TFLA 3HHFA 1DTZA 2DVZA 2QL3A 1F9BA 4F22A 3TTLA 3OMBA 5I2NA 5L9SA 2I6EA 4HCYA 4IO3A 3RT8A 4HW8A 1YTVA 3FD3A 4AB6A 5ITOA 2CMOA 4GOTA 5AA4B 5K2XA 3W9VA 3T66A 3BFUA 1EU8A 2DXRA 1R9LA 1XC1A 1UIVA 3OEKA 4OMBA 4DXCA 1L5TA 3W9WA 5EYFA 1OLAA 2B3BA 1OMPA 3P7IA 1R6ZA 3C31A 4NF4B 3FVOA 2I3VA 1A8FA 4MH5A 3H7MA 4Q0CA 1Y3QA 4JB7A 2REGA 4DE8A 3O6GA 3G3HA 1B4ZA 3E3KA 4WEDA 2LAOA 3ZS6A 5CM6A 1LAFE 2YLNA 3OELA 2H4IA 4QFOA 1I6BA 5DEXA 1T0KA 3BFTA 1MXWA 4IY6A 5EHMA 4EQBA 1MXZA 2Q9TA 1FTKA 1Q1KA 2V84A 1Z7NE 1FTJA 4BDRA 2G29A 4LZ8A 1P1WA 4YAHX 1P1UA 1P1OA 2GFEA 3FXQA 1NNKA 1JNFA 3FIRA 1DPPA 5AE4A 2F7AA 3B6TA 4BDQA 3RGYA 3N5LA 1HSJA 1EH3A 1MY1A 3B6WA 4EQ7A 5DT6A 2ONSA 3SEUA 4TLLB 3O97A 1NH8A 3M3KA 1SI1A 5JK4A 4P0IA 4R9FA 3KG2A 4PP0A 4EDPA 1B5HA 1M5EA 2DWIA 2F35A 2DOJA 2ZYMA 1UTBA 1JQFA 4QSCA 3QYTA 3RPWA 3QUJA 3M3FA 2DVCA 4JWXA 4NMYA 4QFNA 4KD5A 4NWCA 4NTLA 4R6HA 1QKAA 4DIGA 4OESA 5HBCA 3LBSA 2VD2A 3VLUA 3SEVA 4RY1A 3RLFE 5J1DA 3K6UA 3QK6A 3ECRA 4YMBA 5H8QA 2HZLA 3BBRA 4OFLA 4OZ9A 3FVNA 3PMVA 2Z23A 1D3KA 5I58B 1Q35A 3PPRA 1A54A 3SDFA 1XOCA 5LOMA 1R1NA 4FJPA 4F39A 2ONRA 4FAJA 1MPBA 3Q29A 1TT1A 2XHDA 3EF7A 1B3LA 4N07A 2PMSA 3C33A 1B51A 4JSDA 3TQLA 2GH9A 2O7UA 2AIXA 1MQJA 3U92A 3I6VA 1B3EA 3MPLA 4QRZA 4HCWA 2UVJA 5KDTA 3G3IA 4U4SA 2HAUA 2F5XA 3EN3A 4GL8A 1O64A 1N7WA 4DDDA 1POY1 5CBRA 5CC2A 1LFGA 4FEDA 3CRBA 1BTJA 5IAIA 3HN0A 1NL5A 4EQ9A 1J1NA 1MS7A 3OO8A 1LB8A 2UYFA 1MM7A 1IZ1A 3H6WA 3CG3A 2XXVA 5TP9A 1RKMA 3PD9A 1D9YA 3FASA 3IOVA 5H8NA 3UGWA 1N0TA 3MJNA 2RF1A 1RYOA 5ITPA 1BKAA 2XXHA 2R9JA 2Y7IA 3IO4A 5A5XB 2O1LA 3TUSA 1QW0A 1URGA 3IK6B 1LFHA 2DP8A 3IR1A 2G93A 3K00A 4RXLA 5AA3A 1AL3A 4GRKA 2ZYOA 1TFAA 4QFPA 4HS7A 5H8FB 1POTA 5I56A 2DWJA 3ZKKA 1PB7A 3VVEA 4QF9A 3E4RA 3C36A 3N94A 1LAXA 1JW5A 3MZ9A 1LGBC 1ZLQA 1M5FA 2XXRA 3KN7A 3TPAA 2HFBA 1OVTA 3H03A 1ZIUA 5F1QA 5TPAA 4I9DA 1WODA 3E13X 5FHMA 5I59B 4GFRA 1NNPA 3O29A 2NWJA 4GL0A 4F29A 3TTKA 1UIUA 3G3KA 3VXCA 3RT6B 4U21A 4ND9A 4GLIA 1MQDA 3FZVA 1B0HA 2V93A 2NXOA 1B46A 4YKIA 4R74A 1Y3PA 2D21A 2THIA 4O3BA 2Y7PA 1FTLA 4ZEKA 3MP6A 3C35A 3OOAA 1XT8A 3THIA 3OENA 2QSXA 2ZYKA 4JWOA 2QS4A 1MH3A 4MLVA 3HCQA 3R7XA 1Y1MA 5JTYB 1BP5A 1DOTA 4G8NA 1URSA 3GZGA 1AOVA 4IO5A 4ZEBA 5H8HA 3AXFA 4YB6A 3CSBA 3FVGA 1BLFA 1H3DA 1DMBA 3TTMA 3N6UA 4PE5B 1MY0A 3UA8A 2Q88A 4IY5A 5I57B 3RQTA 3MBPA 2Y84A 3I5OA 2GHAA 2PT1A 4U22A 3JZJA 2UXAA 4I8CA 3VXBA 4KYEA 4IO2A 1MH4A 4MFIA 3LSLA 2HZKA 4QHQA 3R6UA 4H8JA 3K1PA 3LR1A 4ONYA 3T9UA 2RC8A 2ALUA 1QKBA 3RY3A 4ELRA 1S50A 1VFDA 3S9NC 3TODA 4ZEIA 1JVXA 2H99A 4F1VA 4OVJA 2XX8A 4OEVA 2P2AA 4GXSB 1XVYA 3PPNA 4HTGA 3IOTA 4YKKA 1IXCA 5I2NB 4P11A 1N3WA 1SYHA 4KR5A 3VLWA 3MVWA 4DCYA 4Q8RA 2Z8DA 3IX1A 1MQHA 2I3WA 1ZBMA 3PUXE 4ISUA 4Q5TA 3RN8A 5M2VA 2F7CA 4PETA 4Z7EA 3OXNA 1HSEA 1FW0A 3TEPA 2W7YA 4OHNA 2OCUA 3O6HA 1SD3A 2FYIA 2V25A 1SBPA 5KCJB 3SETA 4H65A 2DE3A 4BDNA 4U1ZA 1MY4A 2IA4A 2O69A 5AA4A 1A7LA 1MY3A 3LSXA 4R6KA 1GGGA 4F3BA 4ZEFA 1Y4CA 4K3FA 3QAXA 5ELVA 1B3HA 1NMUA 3L6HA 3S9MC 3PMWA 2ANJA 2O51A 4I1DA 3RTFB 3CI8A 1QUJA 4OERA 4Z0IA 3B6QA 4F2OA 1Y20A 3KZGA 2FA7A 3OD7A 1EZOA 1YPNA 2ABHA 2H5YA 2RC9A 5I84A 3PUZE 1UTHB 1D9VA 2I49A 1XHYA 1Y1ZA 2O1MA 4LQ2A 2DE4A 1QUIA 4BLAA 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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