4F2OA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA02
1TFDA 5I57A 3R26A 5FHMA 1MY3A 1LAFE 5ELVA 3KZGA 4TLLB 4M4GA 4XXUA 4C0RA 5ICTA 3VXBA 3QUFA 3PPOA 3RTWB 1I6AA 1MXWA 1ZLQA 2HQ0A 2XXXA 2F35A 4P11A 4WEDA 3CI8A 4JWXA 4ZEDA 3SEUA 1YPNA 4XTCQ 4KYEA 4XKNA 5KDTA 3N6TA 4C1TA 4QSCA 3V89B 3LSLA 3V8XB 3T96B 3N5LA 4O3BA 3PD9A 3B7DA 4P0GA 2QJEA 3ODBA 2CZLA 4XIGQ 1IIWA 3CG3A 2ZYMA 5DVFA 3C36A 5KCJA 3E13X 4OXVA 2QS1A 4DLDA 4H5GA 5I2KA 4I1DA 1MPBA 2Q8JA 3FIRA 4BDMA 4P0IA 2UYFA 2I0CA 1MS7A 2IA4A 3PPRA 4GOTA 4ZE8A 3AXFA 1SVXB 2PMSA 4EQBA 2RF1A 3BKIB 5F1QA 3BFUA 3RT8A 1BP5A 3TQLA 4OZ9A 1PB8A 2ZNTA 4RY1A 3PUWE 1B3EA 5ICQA 2I3WA 1QKBA 3EPEA 3UK4A 4ELQA 1DOTA 4KD5A 5KZTA 3FVKA 4OENA 4FAJA 2UVIA 3TTRA 1Z7ME 3LBSA 4M1VA 1II5A 4AB6A 1Y1ZA 2Q89A 2WKYA 1ELJA 3D4GA 3OEKA 2Z23A 1B58A 1URDA 5TU0A 1D9VA 1D4NA 1M5EA 2PT2A 1XOCA 2DYXA 4LATA 3S9NC 1A55A 2FYIA 3TMGA 3W9WA 3ONMA 1I69A 1XVXA 3E3KA 2ONKE 1B9JA 2O84X 4PQJA 2HCAA 5AE4A 4EXKA 1S9TA 4R6KA 3MPKA 3TUSA 1MM6A 2UVJA 1H44A 3HN0A 3B6TA 4EXLA 4YKJA 1EH3A 3UP9A 5IAIA 2XXWA 4R74A 4ZZEA 5DEXB 4L17A 3MZ9A 1N3XA 3MP6A 4O3CA 3TPAA 3ILTB 3RLFE 4G68B 5H8HB 3FVGA 1MY2A 1NNFA 3M3FA 4QSDA 3G3IA 4WEPA 4MH5A 5HBCA 3VVEA 3IO6A 1MH3A 4R9GA 4F2QA 2QMWA 4NE4A 3T9VA 1WODA 3U72A 3IO4A 3KN8A 1JVXA 1OIBA 4K3FA 2O6AA 4JXIA 4AQ4A 3G3HA 1B0LA 2AL4A 3H6TA 3FD3A 3Q26A 2AL5A 3A09A 3PUZE 3W9VA 2ZNSA 3T22A 3KG2A 5I84A 3QYTA 3I5OA 1URGA 4YZZA 4OYVA 3RN8A 4X1DA 3TTMA 3MBPA 2F78A 1N04A 1UTHA 4G77A 2XXRA 1FTLA 4NWCA 3ZS6A 1VSOA 1YTVA 3VVFA 2NUVA 5CC2A 4DZ1A 1Y4CA 1ZKBA 4JWYA 1OLCA 1F9BA 2B3BA 4Q8RA 5A5XA 1Y9UA 2PBWA 3USDA 1B1XA 4Z0IA 1DMBA 3FZVA 1MQGA 1B6HA 3O66A 5CMKA 2DWJA 1UQWA 4G8HA 3LUYA 1FTOA 5F7VA 4U23A 4RPNA 2HAUA 3U94A 1O63A 1LAXA 4NF5A 4FE8A 4IY5A 2QS4A 5AA2A 1Y3QA 4GL8A 1B5IA 3FGSA 1QUKA 4X1BA 4QFOA 2W7YA 1B5JA 1LGBC 4BLAA 4RPOA 1LCFA 2UVGA 4MBPA 4DIGA 1P1QA 4PFTA 2XX8A 5H8QB 2A5SA 3IB1A 3DELB 4QRZA 1H76A 1URSA 1I6QA 3A3CA 4NF4B 3Q28A 4H8IA 2Y7KA 3MJNA 1NNTA 1MY4A 1Y4TA 4KFQA 4F1YA 3MW0A 1ANFA 3U93A 3IR1A 4F3SA 3T93B 3C32A 3G3JA 4BDNA 4NF6B 3OD7A 1MQJA 1XT8A 2H25A 2LAOA 5EYFA 4YU0A 3L6HA 4PFUA 2NWJA 1QW0A 3MQ9A 1IZ1A 2VOZA 3OEMA 1P1OA 4R2FA 2ZYOA 1PDAA 5CMCA 2NXOA 3O6IA 1Y20A 5BWJA 4H8JA 1M5BA 1P99A 4ONYA 4AB5A 1FTKA 1AIVA 2PT1A 4U2RA 1AOVA 3TTNA 3FUZA 3O6GA 1LLSA 2ZYKA 4GQOA 4YB5A 3THIA 4U1ZA 5I59A 3SESA 4LVQA 4GRKA 3FASA 1AL3A 1GV8A 1LFIA 1MQDA 5ITPA 4PP0A 1PEBA 3LSXA 1MM7A 1WVJA 1US5A 2I3VA 2QS2A 2OK2A 2OJTA 4JDFA 3RTFB 3RY3A 4GWOA 4QHQA 1VE4A 2PYYA 4LQ2A 1QVSA 3PUYE 4DDDA 4X9TA 1T0KA 2RINA 1N76A 2YJPA 3RQTA 2ZYNA 1PBPA 3IOTA 4KCCA 4BDRA 1R9QA 3EN3A 4F18A 3ILUB 3K2DA 2F8DA 3MVWA 5I56B 5AA4B 2DE4A 4KR5A 5JTYA 3KOTA 3U8QA 4GIZA 1N0TA 2Q88A 2RC8A 5DVIA 1SW5A 1MPCA 1XS5A 2DP8A 3RNNA 3K6UA 2Y7PA 3EHUA 1LB9A 3TTKA 2GH9A 4OEUA 3HV1A 1B3HA 3Q25A 2F5XA 1IITA 3C9HA 3FXUA 3VDFA 2OWSA 4H1XA 1A8EA 3KFMA 5TPAB 2RCAA 1MXVA 2Z8EA 1L5TA 3S2VA 5H8NB 3UA8A 1JVYA 3DP4A 3FVNA 3OOAA 2GHBA 5DVJA 5J1DA 3DM0A 5CRYA 4F3PA 1VFEA 1B7HA 3OXNA 5AA3A 1EZOA 1UTBB 5DT6A 1YCJA 2DXRA 3G3KA 2XXQA 2G29A 4QFNA 5TP9B 4MLVA 4OERA 2GRVA 5I58A 3KGCA 4U1OA 2ESNA 4HCWA 3CSBA 3PPQA 4OWDA 4DXBA 4ZECA 1B4ZA 3KOSA 3U1OA 4Q5TA 1NH8A 3FV2A 1MY1A 4YMAA 4BDLA 1VFDA 3SEXA 1GVCA 1LFGA 4XKRA 2ONRA 4RA1A 4GF8A 2Q9TA 1OMPA 4LZ8A 3C31A 1TXFA 5FHOA 3K1PA 3MP1A 3TCHA 3SDFA 5L9OA 3IAZA 1BKAA 2CMOA 3HCQA 1MDQA 2X7PA 3JZJA 3FATA 1QJMA 5DYHA 5H8FB 3PMXA 3GLBA 1KWHA 3OO6A 3E9XA 3SKPA 3S9EA 4ELPA 2V3QA 3C4MA 4F19A 2Y84A 2V3UA 3T9UA 3S4UA 2H98A 4KYDA 5CI5A 2REJA 5HPQA 3GBAA 1NMUA 5I57B 4TQUQ 1IUDA 3LSFB 2F36A 1M5FA 4F3GA 4WXJA 2X26A 3A3UA 4DE8A 2VP1A 1N3WA 1Q1KA 3TCFA 3IB0A 1DPEA 4Q30B 4YKPA 3HHGA 3CRBA 4YMBA 1A99A 3H6UA 4NF8A 4N13A 1SD3A 2F6GA 3QIMA 5AA1A 3MVXA 5KDTB 5M2VA 4R6YA 2A5TA 3O6HA 3TQWA 1SYHA 4ND9A 2NOOA 1P1UA 1UIVA 1SDXA 4KI0E 4GLIA 4GXAA 2HXWA 1BTJA 3SETA 4RNSA 4RXLA 3HPIA 3QUJA 5KCJB 3ZKKA 4QSEA 3TEPA 5I2KB 4YKIA 4H0WA 1D3KA 1S50A 1MH4A 1POY1 4IGRA 4XKPA 3K01A 2F7AA 4MF3A 2THIA 3VLWA 1LCTA 1A54A 2ZXTA 4I8CA 1JETA 2PVUA 2VHAA 1P1WA 3ZKLA 1MXYA 4F39A 3TTLA 2BJJX 2HEUA 2O1LA 4RK9A 3CIJA 5I2NA 3FJMA 1JW4A 1OVTA 1GGGA 3KSJA 5AA2D 4OTEA 2QS3A 3OMBA 2DVZA 1SI1A 1FQBA 1QUIA 2RC7A 2F6PA 3GBBA 2YPNA 2E1SA 3OSQA 1B3FA 1SYIA 4R9FA 1FQAA 2F34A 3B6WA 3UN6A 3VXCA 3H06B 2DQVA 2F7BA 2OWTA 4YAHX 4LP2B 2ALUA 3VE1B 4H65A 3PPNA 2ABHA 2O68A 4FATA 2QRYA 1SW4A 4U21A 3DLNA 4OFOA 2XX9A 3DP8A 3IOWA 3IK6B 1H3DA 2Y7RA 5FHNA 3N94A 4TLMB 3IB2A 4OFJA 1HSEA 4QFPA 3K1MA 5ITOA 2O7IA 2B3FA 1IEJA 1ATGA 3CR9A 4HW8A 2I4CA 3MPLA 1FQCA 3D4CA 4O3AA 3PMWA 1FQEA 1R6ZA 3KJTA 5JK4A 1LAHE 2XXUA 4TOZA 1MPDA 2XD3A 4KHZE 4GVOA 3V83A 4H5FA 1RYOA 4KQPA 4IY6A 1MQHA 2P1SA 2OCUA 2XXIA 4GXSB 4LONB 1S7YA 2HZKA 4N07A 3MVZA 1DTZA 1MXZA 3I6VA 4NMYA 2DE3A 1ZTYA 3GZGA 1BLFA 1TT1A 3MZ1A 5FTHA 2DWAA 1HSLA 1VR5A 3FJ7A 2FNCA 3FJGA 4ESWA 3O9PA 2H4IA 3MAMA 1DTGA 3QK6A 4H6DA 1JNFA 2I0BA 1GR2A 2XXVA 3E4RA 1Z7NE 1PB7A 2D3IA 4YB6A 1ZU0A 4ESXA 3BBRA 1JW5A 1FTMA 3MP8A 1QKAA 3C34A 3TCGA 5CBSA 1WDNA 1OQGA 4ELOA 2F7CA 4FJPA 4F1UA 3MUQA 3R6UA 3H6VA 3TFLA 4H67A 4F1VA 3O97A 3GXAA 3O28A 3PMVA 1UTHB 2PX1A 1MXUA 4JSDA 1AH5A 4JWOA 4F22A 1NL5A 2F97A 5LOMA 2I49A 1H45A 1TWYA 3TODA 2E0SA 1B46A 2REGA 2XXYA 5K2YA 2Z8FA 1FW0A 1JW1A 4EF1A 4FECA 4IB2A 1B3GA 3CSGA 4QFKA 3UGWA 3N26A 5A5XB 3EHSA 4R6HA 4GFRA 3Q29A 4Q0CA 1NH7A 1IXGA 3KJ7A 2KLFA 4G68C 3M8UA 1A40A 3Q27A 4ISUA 1JEUA 4F31B 2XHDA 2FA7A 4RYAA 4IO4A 3VVDA 4IO2A 4EQ7A 1QULA 4NF5B 3CG1A 3H6WA 1B2HA 4R73A 1FQFA 5AA2B 4EDPA 4IO3A 3TKDA 1SW2A 2DSFA 4FEBA 2R6GE 2OZZA 5CBRA 3OO9A 5JEIA 4POWA 4G8MA 2XXPA 3MC2A 4POXA 2Y7IA 2O1MA 1B52A 3RPWA 1ZMGA 3RUMA 3S9LC 2Q2AA 3M3KA 5DEXA 2ZMBA 3QAXA 1DSNA 1CB6A 1PB9A 4G68A 5H8HA 1H43A 1RYXA 3VLUA 1M5CA 2H99A 4YICA 3K00A 3PD8A 3CVGA 3KN3A 1ZBMA 3ZSFA 1SBPA 1BIYA 3LR1A 4UA8A 2XXHA 1NNPA 3FXQA 2RKMA 4G2ZA 1FQDA 1MXXA 1B05A 3K6WA 3RGYA 3IX1A 5CMMA 4FEDA 4F2OA 3HO7A 5B70A 4QFLA 2DWHA 1SQYA 3L6GA 3PU5A 5DTBA 5B7DA 3LSWA 2HZLA 1USYH 3IOVA 1CE2A 4F29A 1NKXA 3CFZA 1PBQA 3IORA 1B32A 1IXIA 1IXCA 3G7WA 1RKMA 2VD3A 3M3LA 4HCYA 5I59B 3OO7A 1B40A 3UIFA 4C1UA 3OSRA 3H7MA 2R71A 1J1NA 1PC3A 3IL1B 3PUVE 2O69A 4QF9A 2ANJA 2XD2A 2Y7WA 3K6VA 3R7XA 3T9HB 4BDQA 4LQ5A 2DOJA 2O51A 1R1NA 4LZ7A 1FCKA 3TDJA 1Q35A 1JEVA 5EHMA 4X48A 5L9MA 4MLQA 2V84A 3RT6B 2HAVA 4OQOA 1USYE 3LC8A 3JV9A 4OHNA 2I4BA 1LBCA 4OEVA 2XX7A 5JTYB 3ECRA 1I6BA 3H03A 1OLAA 2QL3A 1M5DA 1B51A 4FIMA 4JBZA 3H3GA 5H8QA 2IEEA 4EF2A 2YLNA 1N84A 3TELA 1XVYA 2Z8DA 3SERA 5EHSA 3PGFA 2OLBA 1LFHA 4ZEFA 4NF4A 3C33A 3EQ1A 2UVHA 1ZJLA 4PFWA 2I6EA 4R75A 2H9BA 4ZZAA 4PETA 3CFLA 1SW1A 1XC1A 1D9YA 2OBGA 4R2BA 1NNKA 2NVUB 4PFYA 4NF6A 1EZPA 1TFAA 2Q2CA 3IJXB 4DXCA 4ELRA 2HFBA 4OVJA 3QXMA 4I9DA 4ZDMA 5K2XA 3T66A 4FORA 4IGTA 3PV0E 3K0VA 2P2AA 4ZEKA 3OENA 4JSOA 5H8SA 3PUXE 1HSJA 1NFTA 2R9JA 1US4A 5I58B 2H5YA 5IKBA 1YAEA 3CFXA 2B65A 1Y3NA 5L8DA 3EHTA 2GHAA 4ZEIA 4G8NA 1LAGE 1EU8A 4I62A 2V3TA 2XXTA 4DCYA 5L9SA 4NWDA 4DXUA 3KN7A 1MG1A 3C35A 4E0XA 1N7WA 1A8FA 2V25A 4PE5B 5HM4B 4U22A 1R9LA 1QUJA 4Z7EA 4HS7A 3TAJA 2O7UA 2AYSA 1N7XA 3VV5A 4GD5A 3O29A 5CMBA 2G93A 1B1HA 4BDOA 3OO8A 4LA9A 1MRPA 3I3VA 4ZE9A 1OVBA 1MY0A 1MDP1 4GL0A 1XHYA 3K6XA 4ZEBA 3V5AA 4LZ5A 5BUUA 2DXYA 3O2AA 2I48A 1A7LA 4ZS9A 3K1NA 5AA4A 5I56A 1Y1MA 3K4UA 3FXRA 3H4ZA 1Y3PA 3MZBA 3WAEA 5FTIA 4ECFA 5ISUA 1ZIUA 3VLVA 4WKMA 3G3FA 3FV1A 2AIXA 4E0WA 3G3GA 3IJOB 3BFTA 1MQIA 3S9MC 4NF8B 3SEYA 4XKQA 1LBBA 3IOUA 2A5TB 1DPPA 3T9XB 3K02A 3B6QA 1OQHA 2QMXA 2QPQA 4N6PA 4NTLA 3HSTA 2RC9A 5TPAA 1B7ZA 3U92A 2DVCA 1B7UA 4U4XA 1IXHA 2X7QA 2UYEA 2Z22A 5H8NA 1B4HA 1SI0A 2GFEA 3JYRA 3DP6A 3FVOA 4JB7A 1FTJA 2I58A 3HHFA 1UTBA 1O7TA 4HTGA 4THIA 4KCDA 4KPTA 4IO6A 2ONSA 5TP9A 1LB8A 3UORA 2ZNUA 5I2NB 3MVYA 1UIUA 3KSXA 3TYHA 4RK2A 4DCXA 1B5HA 4G4PA 4OETA 4OFLA 2UXAA 1IQ7A 3F11A 2D5WA 2D21A 4OESA 3KBRA 4MFIA 3P7IA 3N6UA 4IO7A 2VGQA 4IO5A 4KYSA 2QSXA 3OELA 3SEWA 1GTKA 1B0HA 2M8CA 3MWBA 3VFJA 2DWIA 4U4SA 1LSTA 3W15C 2DS9A 1EZ9A 3PPPA 3EF7A 1B3LA 4NEDA 5CM6A 3TZAA 4RJZA 2DE2A 3KEIA 4F3BA 5H8FA 2RCBA 1POTA 4EQ9A 4OMBA 3SEVA 4EUOA 2VD2A 1P1NA 4LUBA 1AMFA 2V93A 4YB7A 1JQFA 4YKKA 3WAFA 4R72A 2P0SA 4UACA 3QSLA 1O64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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