4F3BA

Glutamate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/substrate
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA02
1USYE 4JB7A 4PP0A 4U4SA 2HXWA 3IO6A 3PV0E 4KYEA 1O7TA 1XHYA 4EQBA 1JNFA 2NUVA 4F2QA 1R6ZA 1UTHA 1QW0A 3OO9A 3B6TA 2QS1A 1Z7NE 4H1XA 4DXCA 3TUSA 3CIJA 3A09A 2FA7A 5HBCA 4KFQA 2HZKA 4ELPA 2AIXA 3DELB 3CG3A 1QJMA 1FQBA 1MY0A 1FTOA 2A5SA 3H06B 1IITA 3S9EA 1JEVA 2O69A 3SEXA 1VFDA 3HSTA 1POTA 4ND9A 5ITOA 1ZLQA 5BWJA 1B58A 2XXXA 3QIMA 5H8HA 4GQOA 1LAHE 3D4GA 3RGYA 4F39A 3M3KA 2QPQA 2ZNUA 1QUKA 2F5XA 2Z8DA 3JZJA 2UVGA 1JEUA 3TODA 4NF5B 1LCFA 3IJOB 3T9HB 4R9GA 2HAVA 3RLFE 1B40A 5I56A 4ZEFA 3WAFA 3PU5A 3Q29A 3TMGA 3OEKA 1EZOA 1FQAA 3USDA 2ZYNA 3R26A 1A8FA 4H0WA 4X1DA 5B7DA 4RPNA 1GR2A 1DSNA 4QRZA 2YJPA 4I62A 1OLAA 5CMKA 1OQHA 1LAGE 4EXKA 4C0RA 4F2OA 4F1VA 3KEIA 4NF6B 3SEVA 3VVDA 3ILTB 1JW1A 2LAOA 3E4RA 4JBZA 4LATA 1D9YA 2I3VA 3TDJA 3SEUA 2PMSA 3O6GA 4JSOA 1UTHB 4FATA 3K4UA 4QFOA 4BDQA 3MC2A 4YZZA 3FASA 5H8FB 4AB5A 3CR9A 1ELJA 3O97A 3SEWA 5BUUA 1MDQA 1FTMA 2UVHA 4MF3A 4QSEA 2RC8A 1RYOA 4YKJA 1OVBA 1IXGA 3FJMA 3IB2A 2FNCA 1DMBA 4NWDA 3MZ9A 3CFXA 5H8HB 5AA1A 1Y20A 4F3PA 1LGBC 3KOTA 5F1QA 1P1NA 2Y7WA 4R72A 3N5LA 4FECA 5JEIA 3H3GA 3QUFA 3IX1A 3RPWA 4HCWA 1Z7ME 3A3UA 2REGA 3V8XB 2B65A 1FQFA 3VXBA 1EH3A 4G2ZA 4NE4A 3PUWE 3FJGA 5CBSA 2R9JA 2QSXA 1P1QA 5I56B 3KJ7A 1P1UA 3MVZA 3OO8A 1SD3A 4OVJA 3IOTA 4UA8A 4Q0CA 5DVIA 4Q8RA 3Q27A 1B4ZA 2XXUA 3LC8A 3TCFA 2ESNA 4IO2A 1L5TA 2KLFA 1N0TA 4OWDA 4N13A 1MXUA 2H25A 2A5TB 5AE4A 4H67A 2I4BA 3LBSA 4TLMB 1B0HA 5L9MA 2HQ0A 2GFEA 1A55A 1I6QA 3H6VA 1LB9A 2RCBA 4QFPA 4GFRA 1BTJA 5DT6A 1MH4A 5AA2D 1B5HA 1POY1 1QULA 1SDXA 4LQ2A 2DWIA 2WKYA 3IOWA 4OETA 3SKPA 4RK9A 3TKDA 4DCXA 3FXUA 4GVOA 1DTGA 1LB8A 2D21A 4OFOA 3T9UA 5CBRA 3OSRA 1B3GA 2ZYOA 3PD9A 2VOZA 1P1OA 1B1XA 2G29A 1FTJA 3QAXA 4HW8A 1URSA 2H99A 5DTBA 1URDA 2RINA 5I2KA 1MY3A 2H4IA 3VDFA 4P0GA 2XXRA 1QVSA 4BDMA 2XXWA 4R74A 1EZ9A 3DM0A 4QF9A 2I4CA 1M5CA 3EF7A 3PMVA 1KWHA 5HPQA 5IKBA 3O28A 1LLSA 5DVFA 1JQFA 2H98A 4JDFA 4EQ7A 2I0BA 4NF8A 1B7HA 4KYSA 3H4ZA 3EHSA 4YMBA 5FHNA 1XT8A 4ZEIA 2HZLA 4FIMA 3FGSA 3H6WA 4EXLA 1CB6A 2V3TA 3KN3A 3C35A 3CG1A 1MRPA 4BDLA 2B3FA 2QS4A 4PE5B 2UYEA 2DXRA 3KG2A 3S9NC 2BJJX 3UK4A 1PEBA 1B3EA 2ONKE 2X7QA 4P11A 3SESA 1DOTA 1MM7A 3B6QA 4DXBA 3BFUA 3IK6B 3OMBA 3G3GA 2Y7IA 4RA1A 4DCYA 4DXUA 4GWOA 4MLVA 5FHOA 3RTWB 3IR1A 1B1HA 2F97A 4OENA 1GV8A 4H65A 1A54A 4U1OA 4OYVA 4WXJA 5KCJB 3MAMA 4G68A 3KN7A 2P0SA 4X9TA 3W9VA 5CMBA 3WAEA 1FTKA 1N3XA 1LFHA 1EZPA 3K02A 2OWSA 3FXRA 2X26A 3FV2A 1LAXA 3PUXE 1PBQA 5I2KB 2VP1A 2CZLA 5I57A 3N26A 2QMWA 4EUOA 2DWHA 1HSEA 4ONYA 3HPIA 1NKXA 1WVJA 1B46A 2HFBA 4ELRA 2GHAA 5ELVA 1II5A 2AYSA 1UIVA 4O3BA 1ZU0A 1B3FA 1OVTA 4NF8B 2G93A 1YCJA 4H6DA 1HSJA 2O6AA 3C32A 3T9VA 5JK4A 4MFIA 3MBPA 2R71A 4ZE9A 5CI5A 1NNFA 1JETA 2ZNSA 3K1MA 1IZ1A 5F7VA 2DOJA 2DWAA 5AA4B 1SYIA 2UVIA 2XX9A 4HS7A 3R6UA 3V89B 3G3HA 4ZEKA 4LQ5A 3UP9A 3ZKKA 4KYDA 3IOVA 5I84A 4EDPA 4WEPA 3RQTA 3R7XA 3MZBA 3RT6B 3IAZA 4RK2A 1QKBA 4G68B 2Q88A 3GZGA 2DP8A 4PFWA 3PPQA 4ZECA 3IORA 4PFYA 2V3UA 1LFGA 3RT8A 1MM6A 1BLFA 1ANFA 1URGA 2O7IA 4BLAA 3ZSFA 3O9PA 5I57B 1D4NA 1AOVA 4FORA 5TP9A 1A40A 2OZZA 4R6KA 3O2AA 3K01A 4F22A 4LVQA 2HCAA 3TEPA 5M2VA 2I58A 3QUJA 5I2NA 2OJTA 1VSOA 3FV1A 2F6PA 4DZ1A 2XD3A 5ISUA 3TELA 2F7AA 4XIGQ 3EN3A 3ZS6A 3HHFA 1FW0A 4IY5A 3EQ1A 4OTEA 1SYHA 3PUVE 1B32A 1SBPA 1LFIA 1GTKA 1SI1A 3V5AA 3FUZA 3JYRA 2NXOA 2F8DA 5CMCA 2Q2CA 4R6HA 5TU0A 5TPAB 4M4GA 1XVXA 1VE4A 3BBRA 2DXYA 4R2BA 3CFLA 1A7LA 4GOTA 2CMOA 4ZZEA 4KD5A 3JV9A 4NTLA 4QFKA 3DP6A 2Z22A 3LSLA 4QSDA 3FD3A 4XXUA 4ELOA 2ZNTA 4U4XA 1O64A 3TYHA 1RKMA 4YU0A 1USYH 4H5GA 4GRKA 2ONRA 4H5FA 5H8SA 1MXXA 5H8NA 4LA9A 4Z0IA 1MQHA 4O3AA 3E9XA 2P2AA 4F18A 1US5A 5IAIA 1B5JA 3BKIB 4NF4A 4UACA 2PYYA 3H6UA 3GBAA 5TP9B 4HTGA 4KPTA 4LONB 2Z8EA 1PB7A 4OFLA 4U23A 5I2NB 4IO5A 5CMMA 2RF1A 3PPNA 5KDTA 3LSXA 1OLCA 1XC1A 1Y3QA 4YKPA 1DPPA 1Y4CA 4THIA 3VFJA 3QYTA 3FZVA 3IL1B 1A99A 2OK2A 3G7WA 1N7WA 3H6TA 1ZMGA 3OD7A 3UGWA 4L17A 4EF1A 3VVEA 3BFTA 1CE2A 4ZZAA 2QRYA 3IO4A 5A5XA 3VXCA 1IXIA 2YLNA 2PVUA 4NEDA 4G8MA 3CFZA 3KGCA 1B5IA 1TWYA 3UORA 4G68C 2O84X 4N6PA 4F1UA 4FJPA 1Y9UA 5K2YA 2QL3A 3MP6A 3KZGA 4MH5A 3MWBA 2W7YA 1TT1A 3SERA 3I3VA 3L6HA 4FE8A 4G4PA 2ZXTA 2XX8A 5H8NB 4TQUQ 3S9MC 4IGTA 4LZ8A 4U1ZA 3KBRA 3HHGA 1I6AA 1MPDA 4R73A 1R9LA 2NOOA 4NF4B 1Y4TA 1B9JA 1I69A 5H8QA 4XKRA 3FVGA 5ITPA 3P7IA 1M5BA 3KN8A 1VR5A 3HO7A 3L6GA 1LBBA 4XKQA 4KR5A 2REJA 2QS3A 2FYIA 3SETA 3H7MA 2D3IA 1M5FA 2VGQA 5KDTB 2YPNA 2XX7A 1MQIA 2H5YA 2OLBA 1GGGA 4OFJA 1SVXB 3K6UA 2F7CA 1JVXA 4KHZE 1Y3NA 4P0IA 3CI8A 1F9BA 1MG1A 3W15C 3LSFB 4YMAA 1LAFE 3LUYA 1OIBA 1JVYA 3MW0A 3KJTA 3RY3A 4QFNA 2XXYA 5L9OA 5A5XB 2I49A 3UN6A 4JWOA 2IA4A 3K6XA 3N6UA 3PPPA 5ICQA 2I6EA 2PBWA 4KCCA 4AQ4A 5CRYA 4OHNA 1P1WA 1AIVA 3I5OA 4OMBA 4F1YA 3PMXA 4KI0E 1N84A 2ZMBA 3ODBA 1B6HA 2DQVA 1LSTA 1QUIA 3K6WA 3MP1A 1PDAA 3THIA 3Q25A 3MJNA 1AL3A 1TXFA 5L9SA 4C1TA 3F11A 2UXAA 1S50A 2NVUB 5H8QB 1MXVA 1FTLA 4Q30B 3ZKLA 4JXIA 4YAHX 2F7BA 3B6WA 3VE1B 1N04A 2ABHA 3KSJA 4ELQA 3K1PA 4IB2A 3TQLA 2F34A 3MVYA 2ANJA 4NWCA 1WODA 2Y84A 1YPNA 4F29A 1SW1A 3TTNA 4ZEBA 2F6GA 3K0VA 4DLDA 3CSGA 4YICA 1BKAA 3VLWA 3MPKA 3KSXA 4MBPA 2DE4A 3C31A 4U2RA 3PPOA 4LZ7A 3ILUB 5J1DA 4OZ9A 3UIFA 2PT1A 5K2XA 4XTCQ 4GLIA 2Q89A 3E3KA 4JWYA 1XVYA 2V93A 5LOMA 2I3WA 1RYXA 3FXQA 2XXIA 3N94A 4OERA 1LCTA 4NF5A 2VHAA 3PGFA 4LP2B 2O51A 1NH7A 2H9BA 4OEUA 5CC2A 3W9WA 1SW5A 3UA8A 2GHBA 4I1DA 3VLVA 3IOUA 4ESXA 1MDP1 4ESWA 2DVCA 1IIWA 1R9QA 1YTVA 1Y1ZA 1MY2A 3O29A 3LSWA 4U21A 2ZYKA 1MXZA 1M5EA 3OELA 2GH9A 4PETA 3MPLA 3D4CA 1N7XA 1ZJLA 4E0WA 4C1UA 4YB5A 1MXYA 2Q9TA 1YAEA 4X1BA 3IB1A 1J1NA 3B7DA 3RN8A 1MY1A 2D5WA 2UVJA 1TFDA 4FAJA 3U8QA 2ALUA 1NFTA 4LZ5A 1NL5A 1B51A 1US4A 4ZEDA 5H8FA 4H8IA 2DE3A 3I6VA 3G3IA 1PB8A 3Q26A 3RTFB 1SI0A 4OXVA 4PFTA 3TCHA 3C4MA 3PD8A 1FCKA 2XXVA 4PQJA 2DS9A 5AA2A 1B3LA 1IUDA 1AH5A 3AXFA 3GXAA 4ISUA 3T22A 4YKIA 3EHUA 2XD2A 3KFMA 3O6HA 4I9DA 3FVKA 2QJEA 4POXA 4GL0A 4HCYA 4KQPA 4YKKA 4BDRA 2OWTA 2Y7KA 3MZ1A 1PBPA 4MLQA 3EHTA 1S7YA 3FATA 5DVJA 1VFEA 4GXAA 3IB0A 5B70A 5I59A 5AA3A 1DTZA 4GIZA 4QFLA 3C33A 2HEUA 2F35A 3U94A 3SDFA 5FTHA 3HN0A 4R75A 3QXMA 3H03A 4F19A 4IY6A 3S4UA 1DPEA 1IXHA 4GD5A 5JTYA 4PFUA 4YB6A 2VD2A 2IEEA 1JW4A 3CVGA 2DWJA 3K6VA 2A5TA 1Y3PA 3U1OA 2UYFA 4LUBA 3TTKA 2PX1A 1H3DA 4ECFA 1NH8A 3OO7A 3G3JA 3ONMA 3HV1A 2VD3A 3GBBA 1UTBA 4F3GA 4GF8A 1N3WA 3TTMA 4AB6A 1NMUA 3FJ7A 1B7ZA 1SQYA 2R6GE 2XXQA 2Y7PA 1A8EA 3RUMA 4ZS9A 1JW5A 1SW4A 5AA2B 4BDOA 2DVZA 4KCDA 2NWJA 3C34A 2XXTA 4R6YA 3VLUA 1D9VA 2B3BA 3CSBA 1IXCA 1NNKA 3C36A 2RC9A 4R2FA 1MQJA 1PC3A 1H44A 4JSDA 4F3BA 4G77A 3TAJA 2I0CA 3QSLA 2XXHA 2O1LA 1R1NA 1NNPA 4RJZA 2F78A 5I59B 4IO4A 1XOCA 3TTLA 3OOAA 2RCAA 1QUJA 2ONSA 3O6IA 2I48A 4OQOA 4POWA 4X48A 2V84A 4TOZA 1OQGA 3TFLA 1MY4A 3K2DA 1FQEA 4RPOA 4F3SA 2E1SA 3LR1A 5EHSA 2AL5A 3GLBA 2DYXA 3PPRA 3RNNA 1OMPA 5JTYB 3DP8A 1UQWA 4YB7A 1B4HA 1B52A 5I58A 2ZYMA 1MH3A 2Q2AA 4JWXA 3T9XB 5KZTA 2F36A 3VVFA 1UTBB 2V25A 4QHQA 4H8JA 3MP8A 1Y1MA 4DIGA 1S9TA 4RXLA 4ZE8A 5EHMA 5FHMA 1I6BA 3FVOA 1ZTYA 1ZIUA 4K3FA 4FEDA 5DYHA 2O7UA 3PUZE 4GL8A 3C9HA 5ICTA 1ZBMA 4G8NA 1BP5A 3Q28A 1P99A 3TTRA 1LBCA 2E0SA 1H45A 4DE8A 5KCJA 4XKNA 1ZKBA 2P1SA 2GRVA 4EQ9A 4F31B 4OESA 3TPAA 1QKAA 4QSCA 3T66A 3V83A 1MS7A 1T0KA 5L8DA 3OXNA 3T93B 2Z23A 4RYAA 4M1VA 3DLNA 4RY1A 3G3FA 3EPEA 4Q5TA 3U92A 4WEDA 1ATGA 3CRBA 2DE2A 4IGRA 3PUYE 1AMFA 3MVXA 5DEXA 3PMWA 5I58B 1M5DA 2Z8FA 4BDNA 1MPCA 2O1MA 4NMYA 1NNTA 1EU8A 1D3KA 3HCQA 4IO7A 1BIYA 5CM6A 2HAUA 3IJXB 2RKMA 2XXPA 5AA4A 3M3FA 3O66A 3OENA 4Z7EA 4N07A 1O63A 2QS2A 2OBGA 3OEMA 5HM4B 4E0XA 3OSQA 4IO6A 4R9FA 4WKMA 1IQ7A 3KOSA 4DDDA 3T96B 3E13X 3VV5A 1H76A 3N6TA 2O68A 1TFAA 4O3CA 3U93A 1N76A 4EF2A 1B05A 4XKPA 3U72A 1H43A 2PT2A 1B2HA 1HSLA 2AL4A 1WDNA 2Y7RA 2X7PA 3OO6A 4G8HA 3M3LA 2Q8JA 2DSFA 3K1NA 3K00A 3ECRA 3S9LC 1FQDA 1MXWA 3S2VA 4TLLB 3QK6A 2RC7A 1B0LA 4RNSA 2THIA 1IEJA 1MQGA 1XS5A 3FIRA 4U22A 2V3QA 4IO3A 1Q35A 1MPBA 3MVWA 5EYFA 3TCGA 3A3CA 1Q1KA 3TZAA 4I8CA 1FQCA 4OEVA 2OCUA 2QMXA 1GVCA 1PB9A 1UIUA 5DEXB 3G3KA 4ZDMA 3MQ9A 3M8UA 3DP4A 3FVNA 2XHDA 3MUQA 1B7UA 1MQDA 5TPAA 5FTIA 3TQWA 4GXSB 1B3HA 4FEBA 1SW2A 3SEYA 2M8CA 4NF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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