4Z7EA

Soluble binding domain of lmo1422 abc-transporter
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
EITIAGKLGAEPEILINMYKLVIEDETDLKVNVKPNMGKTSFVFNALKSGDIDIYPEFTGTVLETFLKENAKTHDPEEVYTQARDGLAKDFDMTYLKPMKYNNTYALAVSPEFAKENNLEKISDLGPVSDQVKAGFTLEFKDRSDGYKGIQDKYGLTFSNLKTMEPKLRYNAIKSGDINLLDAYSTDSELAQYKLKVLEDDQQLFPPYQGAPLMLTKTLDKYPELKKPLNKLAGKITDDEMRKMNYEVNVNGKSAYTVAKDYLKDQGIIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Lmo1422 protein
publication title Crystal Structure of the Substrate-Binding Domain from Listeria monocytogenes Bile-Resistance Determinant BilE
doi rcsb
source organism Listeria monocytogenes egd-e
total genus 98
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4z7eA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4z7eA02
2X7QA 3ZS6A 4U1OA 3CG3A 3N6TA 4QSCA 2E0SA 1MXVA 4F1YA 5L9SA 1IXCA 1R6ZA 1MXZA 3MVZA 3MC2A 1HSJA 4IO7A 1SI0A 1CB6A 3RUMA 4R73A 1TFDA 4C0RA 4C1TA 3TYHA 2NUVA 1KWHA 4O3CA 1MXXA 3C36A 4FEBA 2RF1A 2PX1A 4YKIA 3S2VA 3KOTA 1S9TA 5L9OA 1A54A 1XVYA 1D9YA 1JEVA 1LCTA 2X7PA 1IXGA 2I4BA 3HN0A 4JWXA 4ELQA 3RN8A 3S9MC 5I57B 1LAFE 3SEXA 2DE3A 1PB8A 1YTVA 1SI1A 1MQIA 5CBSA 2Z22A 3Q27A 1SD3A 2ZMBA 4ZEDA 3QUFA 4IO3A 4O3AA 1MY1A 3QYTA 1XHYA 1Z7NE 3M3KA 2UXAA 1PEBA 3A3UA 4XTCQ 2H25A 5CMCA 4GL8A 1RYXA 3TCGA 1B1XA 3FZVA 5B7DA 2IEEA 4PQJA 3N26A 1FQBA 1LFGA 4X1DA 3TCFA 1EU8A 2I6EA 2OCUA 3A3CA 2RCBA 4OVJA 3GBAA 1WVJA 3TTLA 2D3IA 1OQHA 1B0HA 2A5SA 4ZE9A 5I58B 1QJMA 3O97A 2NWJA 4BDMA 1PDAA 2XX7A 3TTKA 1B5HA 3O6GA 3M3FA 4GF8A 1SDXA 2FYIA 2B3BA 3LSWA 3Q28A 4LONB 2HFBA 4MBPA 3VV5A 1B3FA 1B3LA 2VGQA 1OLCA 4QFKA 1NH7A 1UQWA 2DWJA 1II5A 1VFEA 2UYFA 5I2KB 1A40A 3BFTA 1NKXA 2V3UA 3K6WA 4KYDA 4M1VA 3RNNA 2DQVA 1OVTA 3FVGA 4ZZAA 2AIXA 5I2KA 2Z8FA 2R6GE 5DVFA 5A5XB 3DM0A 1TWYA 2W7YA 1R9QA 5I56A 3O29A 2CMOA 2HXWA 3CFXA 2XXIA 3CVGA 3C4MA 5A5XA 3IO4A 4I8CA 1AMFA 1BTJA 3KBRA 4RA1A 2ZNUA 3TQLA 3L6HA 4FJPA 3K2DA 3H6WA 3KFMA 2DS9A 5HM4B 4ELRA 5H8NB 4DXCA 1LFIA 1AL3A 1ZTYA 1NNPA 5I2NB 1OVBA 5H8NA 4F1VA 1N0TA 3K6UA 4PFUA 5ICTA 5I2NA 3QXMA 3TPAA 3VE1B 1ATGA 3N94A 5KCJB 3ECRA 2Q8JA 4LZ8A 4F3GA 4M4GA 2GH9A 1PBPA 3LSLA 3TTMA 3CG1A 3MZ1A 4U4XA 2ALUA 4IGTA 2H9BA 3PMXA 3T22A 3TAJA 2Y84A 3T93B 4QSDA 2DXYA 2O84X 1GVCA 4BDQA 2F7CA 2PT1A 4WXJA 4UACA 1HSEA 1OQGA 1OLAA 2XXHA 4YAHX 1FCKA 3SESA 3CSGA 3RT6B 4BDNA 4GVOA 2AL4A 2PYYA 2G93A 3UGWA 5HBCA 1QUJA 2R9JA 4KQPA 3MP1A 3MVYA 3LSXA 3PUXE 2ZNTA 4KR5A 4ZE8A 4NMYA 1JVXA 1Y3NA 3PUZE 4XKNA 1LB8A 1FQAA 4QFPA 3S9EA 1MY0A 1P1OA 2HZLA 2Q2AA 3FV2A 5JEIA 3LBSA 4LQ2A 3K1PA 5H8SA 1FTKA 1MH4A 3KN7A 1XVXA 2BJJX 2ZYKA 3CI8A 1LCFA 1NNKA 2HAUA 4P0IA 4ESXA 3FUZA 3OO7A 4JSDA 2Z8EA 1SBPA 2HZKA 2XD3A 3VLWA 4QSEA 1R9LA 3OEMA 5FTHA 4ISUA 5AA1A 4U1ZA 3UN6A 4GOTA 4N07A 4PETA 1NL5A 3JYRA 4HCWA 4FAJA 1M5DA 3OO8A 4RPOA 5ELVA 1A8EA 1H76A 5TPAB 4NF8B 2WKYA 3N6UA 2Y7KA 4IO6A 2B65A 1H43A 2ONSA 2HCAA 4MFIA 4RNSA 4G8MA 3K6XA 1IXHA 3KJTA 4YMBA 4PFWA 4IB2A 4NF8A 5ISUA 2H4IA 3RTFB 2KLFA 2FA7A 1MY2A 2ONKE 3MJNA 2F6PA 3W15C 3DP6A 1RKMA 1LBBA 4JWYA 4KD5A 5L9MA 5H8HA 4ECFA 3D4CA 1Y4CA 1B7UA 2Y7WA 3DLNA 4YB6A 4TLLB 4EF2A 1MPBA 1SW2A 2GFEA 1SVXB 1B5IA 1H45A 3QAXA 1T0KA 1Z7ME 2A5TB 4F2QA 3JV9A 3CSBA 4QRZA 2QJEA 4EQ7A 5AA4A 1HSLA 2A5TA 3TODA 2RC8A 1B32A 4Z0IA 1BLFA 4F29A 3PPRA 3H6UA 4JBZA 5I59B 5H8FB 3TCHA 3C35A 4GXSB 3I5OA 4OWDA 4ZEKA 3MQ9A 3KN8A 4F3PA 2V93A 4F3BA 1IXIA 4X48A 3CIJA 1XC1A 5I59A 1LLSA 5H8FA 2F35A 1B5JA 1B0LA 1JETA 2DVCA 3LR1A 3O28A 4C1UA 4N13A 4ELOA 4EDPA 5JTYB 4GL0A 3SKPA 4R9FA 3K1NA 5LOMA 3OMBA 1B9JA 3FATA 4X1BA 5ITPA 5JTYA 2THIA 1JNFA 4LZ5A 1NH8A 3RPWA 3IOVA 2PT2A 1QW0A 1RYOA 5HPQA 1N84A 4LZ7A 1DPPA 1B1HA 3S4UA 4YKKA 4LUBA 2VD2A 3MP6A 1Y4TA 1A7LA 2UYEA 3CR9A 3IX1A 2R71A 4KFQA 2DE4A 4NTLA 1YPNA 4AB6A 1LB9A 5EHSA 1PC3A 2AYSA 4HTGA 4R2FA 3PUVE 3B6TA 4G2ZA 1URGA 2XXVA 5KZTA 3FGSA 4RYAA 3V8XB 2Q89A 2O68A 4E0XA 3H03A 5CI5A 3WAFA 2Q88A 1B4HA 3SDFA 3QIMA 4ZECA 3G3FA 4WEDA 2UVGA 3P7IA 3K0VA 1AOVA 3FXQA 3E13X 1Y9UA 4H5GA 1Y3PA 2DYXA 3PUWE 2HQ0A 5J1DA 1SW1A 4F39A 3O9PA 4G68B 3KJ7A 5I57A 3PPNA 1PBQA 1B3GA 1A99A 3FVOA 4ESWA 4N6PA 4GWOA 2IA4A 1EZOA 1O64A 2Q2CA 1VE4A 4YMAA 4G68A 3IO6A 1IUDA 1F9BA 2NXOA 1UIVA 3TUSA 4H5FA 1MPDA 2F8DA 4R6HA 2XHDA 3LSFB 1QULA 1MXWA 1B3HA 3VXCA 3RLFE 2QMXA 4OFJA 3FVKA 1PB9A 2O69A 2ANJA 3LUYA 1B2HA 5TU0A 2YJPA 1B51A 1AIVA 5FHOA 5I58A 4PFTA 3T9VA 1B3EA 2X26A 3VFJA 2UVIA 1VSOA 1NMUA 3IOUA 4IGRA 4OENA 2OBGA 4AB5A 1BKAA 4G4PA 3IB1A 1SW4A 4XKRA 3F11A 2GRVA 3Q26A 5ICQA 3IK6B 3HV1A 1NNFA 3WAEA 2I0BA 2DXRA 2OWTA 3IOTA 4GD5A 1DMBA 4LATA 1MS7A 2I58A 1B4ZA 3IB2A 1FTLA 4P11A 1OMPA 1ZIUA 4OMBA 1LSTA 1EZ9A 3EPEA 3IJXB 3IR1A 1QKAA 3U93A 3H6TA 1MXYA 3FV1A 4UA8A 3H4ZA 4JXIA 4R75A 1P99A 1M5CA 4I62A 3HHGA 3TFLA 2NOOA 3MUQA 2RKMA 2ZNSA 3OSQA 2QS1A 4GXAA 3THIA 3IB0A 3KOSA 4LP2B 5CMMA 2V84A 3B7DA 4RY1A 3UIFA 1A8FA 3H3GA 1R1NA 1AH5A 3IJOB 4R74A 1SYHA 4L17A 2I49A 3DP8A 5CRYA 3HCQA 4EXKA 4F1UA 1N04A 3U72A 3C9HA 3R7XA 4YB7A 3M3LA 1J1NA 4QFLA 2O1LA 1P1UA 3PPQA 4R9GA 4QHQA 4RJZA 5EHMA 2G29A 4OHNA 3EQ1A 3OO9A 4MF3A 3A09A 3RQTA 1BP5A 5KCJA 4IO4A 1EZPA 4H8IA 3FJ7A 4YB5A 3HO7A 4XXUA 2OJTA 4FECA 3ZKLA 1Q1KA 3VVEA 3UA8A 2F5XA 4KCDA 3R6UA 4HW8A 2HAVA 1DOTA 3QSLA 3MWBA 4FATA 3T9UA 3G3JA 1FQFA 4U2RA 5AA2B 3SETA 2OLBA 4LA9A 1M5FA 4ZEBA 5KDTB 5AA3A 3FD3A 4H0WA 1VFDA 1WDNA 2ESNA 3PV0E 2H98A 1FTJA 3MZ9A 4I1DA 2REGA 3HSTA 3QUJA 4FE8A 1B05A 3K01A 5KDTA 4NWCA 2Y7RA 3MVXA 2NVUB 4NWDA 4IO5A 3VLUA 1LFHA 2B3FA 3RTWB 4RXLA 4Z7EA 3OOAA 3EHUA 4R6YA 2P0SA 2QS2A 4GLIA 1BIYA 2F7BA 5CMBA 1UTBB 2GHBA 5CMKA 2ZYNA 5DVIA 3S9LC 4IY6A 3TDJA 3ZKKA 1FW0A 4GQOA 3O6IA 2F78A 4H6DA 3BFUA 1QUIA 3I3VA 3IAZA 1MDP1 2XXPA 4ZZEA 3S9NC 3USDA 5L8DA 4XKPA 5CBRA 2QS3A 2V25A 2DP8A 2XD2A 4YZZA 3Q25A 3FIRA 2XX9A 3QK6A 3M8UA 5IAIA 4OETA 3D4GA 4H8JA 5DEXB 1N7XA 4POXA 5TPAA 2FNCA 2DWAA 4DLDA 5DEXA 4KCCA 1LBCA 1US4A 4HCYA 4YKPA 1NFTA 2ZXTA 5CM6A 4G8HA 3O2AA 4WKMA 4G77A 3VXBA 4MLQA 3KSJA 4IO2A 2M8CA 1MM7A 4PP0A 2VP1A 2LAOA 2VOZA 3OSRA 3ILTB 3BKIB 1B58A 5DTBA 5B70A 1USYE 1POY1 4BDRA 2DSFA 1Q35A 2DWIA 2H5YA 3V5AA 3B6QA 4NF5B 5F1QA 4R72A 4NEDA 1MH3A 3H7MA 4XKQA 4FEDA 3GXAA 1ZKBA 4NF5A 3C32A 3PD9A 2F97A 4KYEA 4EF1A 2QRYA 2ONRA 3PMVA 1UIUA 1ZBMA 4OEUA 4K3FA 2RC7A 4MLVA 4OYVA 4ZS9A 3C34A 1M5EA 1YAEA 3HPIA 1WODA 2I48A 3N5LA 1N3WA 4TOZA 1FQCA 3EN3A 4NF6B 2OWSA 4DE8A 2Q9TA 1SW5A 3TTRA 1LGBC 1VR5A 1FQEA 4KHZE 2F36A 4JB7A 4NF6A 1UTHB 3UORA 4TLMB 2I3VA 3TEPA 3CRBA 2VD3A 5AA2D 2XXUA 4QFNA 4DXBA 5I84A 2O7IA 1UTHA 1B6HA 3K00A 1JW4A 1FTOA 4U4SA 2YLNA 3SEVA 3W9VA 4OESA 1P1QA 2F7AA 3T96B 3G3IA 4OXVA 1DTGA 5K2XA 2O7UA 5JK4A 1B46A 2PBWA 4OEVA 1FTMA 2QS4A 4ELPA 2RC9A 4FIMA 3FXRA 1B52A 2OK2A 1CE2A 4MH5A 3U92A 3OENA 1I6AA 3PPPA 4YICA 2Y7IA 5IKBA 4ZEIA 1MDQA 1MQJA 4OTEA 3RGYA 1Y3QA 4DCYA 4G68C 4F19A 3B6WA 1B7HA 1IEJA 1JW5A 4H65A 3SEWA 1DPEA 3K02A 4OFLA 1MQGA 2D21A 2O51A 1MRPA 1Y20A 4YKJA 1YCJA 1MQDA 1ZU0A 3H6VA 2DWHA 3JZJA 4OFOA 4WEPA 3RY3A 4I9DA 1FQDA 2H99A 2V3QA 5ITOA 1ZMGA 5EYFA 1NNTA 1I69A 2UVJA 3I6VA 4LQ5A 4KPTA 4OQOA 1TXFA 5BUUA 1TT1A 2REJA 1S50A 2RINA 4Q30B 4ZDMA 3LC8A 4DIGA 4EXLA 3PGFA 3U1OA 3HHFA 1XT8A 2D5WA 4RK2A 5I56B 1I6QA 1I6BA 1JVYA 1O7TA 5TP9B 3IOWA 3FJMA 4ND9A 2HEUA 2I3WA 3MPLA 2DOJA 4ZEFA 1QVSA 1P1NA 2RCAA 4POWA 1MY3A 1O63A 5TP9A 4EQBA 4AQ4A 2ZYMA 4BLAA 4X9TA 1D4NA 4G8NA 1P1WA 1PB7A 4THIA 3AXFA 2XX8A 4F31B 4DXUA 1JW1A 3RT8A 2Z23A 1US5A 2P2AA 4BDOA 4H1XA 4PE5B 3TQWA 2F6GA 2UVHA 3U8QA 3K4UA 2O1MA 3MAMA 2QMWA 3KEIA 2XXXA 3EF7A 1Y1ZA 1URSA 3V83A 3PUYE 3OELA 3C31A 2QPQA 3MP8A 1JEUA 3KG2A 1USYH 2VHAA 3IL1B 3R26A 2PVUA 3TZAA 3TKDA 3TELA 1POTA 4GRKA 1SQYA 4F22A 3Q29A 2OZZA 4HS7A 4ONYA 4QFOA 3H06B 1LAGE 4FORA 3O6HA 4O3BA 4GFRA 1IIWA 3KSXA 3E3KA 4U21A 5AA2A 3SEUA 3VVDA 1GR2A 3CFLA 3FASA 3GBBA 2QL3A 3MPKA 1N76A 5FHMA 3DP4A 4KI0E 4Q0CA 3TMGA 4NE4A 2XXQA 3VLVA 3E4RA 4U23A 2XXRA 5H8QB 1IQ7A 3ONMA 3KZGA 1EH3A 1URDA 4R2BA 3G3HA 3VVFA 1XS5A 1DSNA 3V89B 2P1SA 2ABHA 2AL5A 3MVWA 1MQHA 5H8QA 5DT6A 3FJGA 1SYIA 3L6GA 2V3TA 3K6VA 3MW0A 4F2OA 3PMWA 1QUKA 3E9XA 1UTBA 1A55A 1L5TA 1MXUA 4BDLA 3OD7A 1IITA 4R6KA 1N7WA 3SERA 3G3KA 4P0GA 3UP9A 4DDDA 2I0CA 4OERA 3PU5A 5BWJA 2ZYOA 4OZ9A 3DELB 1MM6A 3ZSFA 2DVZA 2CZLA 3VDFA 2O6AA 4DZ1A 1B40A 1ANFA 4H67A 1ZJLA 3G7WA 3W9WA 1GTKA 1IZ1A 1DTZA 1MY4A 3MZBA 1ELJA 3UK4A 3G3GA 1GV8A 3C33A 3GZGA 3IORA 3PD8A 4JSOA 4U22A 1Y1MA 3SEYA 5H8HB 2QSXA 3GLBA 1XOCA 3TTNA 4LVQA 4GIZA 5F7VA 5AE4A 1MG1A 3ODBA 2XXYA 4YU0A 4F3SA 1LAHE 1S7YA 5FHNA 4EUOA 1ZLQA 2GHAA 3EHSA 5AA4B 3T66A 5K2YA 4EQ9A 1QKBA 1D3KA 4E0WA 4JDFA 3T9HB 3U94A 5M2VA 3ILUB 3FXUA 3CFZA 4Q8RA 5DYHA 2XXWA 5FTIA 2I4CA 4IY5A 5CC2A 4DCXA 3OO6A 4KYSA 1M5BA 2PMSA 3OEKA 3KN3A 3FVNA 1B7ZA 3KGCA 4NF4B 4Q5TA 3BBRA 4JWOA 2Y7PA 2YPNA 4XIGQ 4RK9A 3T9XB 2F34A 2Z8DA 3PPOA 1H44A 2DE2A 1H3DA 4NF4A 1LAXA 1D9VA 4F18A 1MPCA 3MBPA 4TQUQ 4RPNA 2E1SA 1GGGA 1N3XA 5DVJA 4QF9A 1TFAA 3O66A 4PFYA 3EHTA 2XXTA 3K1MA 3OXNA 1JQFA 1OIBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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