5A5XA

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
420
structure length
420
Chain Sequence
RVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
total genus 138
structure length 420
sequence length 420
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA02
4POWA 2Q8JA 5CMCA 3T66A 2DE2A 1XHYA 1BP5A 2OBGA 2O68A 4H5GA 1US5A 1OIBA 1DTGA 1NNKA 3B6TA 4WEPA 3PMVA 1MDP1 1LAGE 4EXKA 1B3GA 1POTA 3QXMA 1A54A 3GBBA 1EU8A 4N6PA 4DXBA 3OSQA 4OHNA 4H8IA 2P2AA 3TDJA 4R72A 1SD3A 3SEUA 3QK6A 4X48A 3CFZA 4HTGA 3T9VA 1FTJA 1VE4A 2H99A 3SETA 2XXWA 2G93A 3MBPA 2KLFA 1SI1A 3H06B 4LATA 3KGCA 4Q0CA 1DOTA 4F31B 3ECRA 4OVJA 2AL4A 1FQBA 3IB1A 4THIA 4ZZEA 1MY2A 1Q1KA 2BJJX 3TCFA 1YAEA 1PBQA 1US4A 5AA2A 1EZPA 2VOZA 4NF8A 4JWYA 4YB6A 3TUSA 1LB9A 4IO2A 4POXA 3S4UA 4HS7A 4WXJA 5ITPA 4GOTA 2QL3A 1I6BA 3TMGA 2H25A 4F2QA 1RKMA 2Y84A 4E0WA 3I6VA 1N7XA 3S2VA 3CFLA 4JDFA 1BLFA 1B40A 1FQCA 4UACA 4BDLA 4AB5A 2XX9A 3MW0A 4PP0A 4K3FA 3B7DA 2F78A 4GRKA 3B6QA 5DVJA 3PGFA 1BIYA 5J1DA 5CMMA 1BTJA 4IO6A 1TFDA 3H6UA 3FXUA 2VHAA 4HCYA 4F3SA 3GZGA 4H5FA 4RA1A 1I6QA 4MLVA 2OCUA 3W9VA 1IIWA 1URDA 2F7BA 4GIZA 3M3FA 3TODA 2PVUA 4UA8A 4QFKA 3PMWA 5DVFA 1P1UA 1BKAA 2M8CA 1XVYA 2NVUB 3VXBA 4IB2A 4YKKA 3OO8A 3Q29A 4ELPA 2XXPA 3DLNA 3PMXA 3V5AA 3O6GA 2X26A 1MQDA 1SW4A 1HSJA 3FZVA 2UVHA 3FVGA 4H65A 2REGA 3FGSA 1OMPA 1IZ1A 1S50A 4OMBA 1B0LA 4YAHX 1PEBA 3RGYA 1FQFA 4U1ZA 1FW0A 1XOCA 3O97A 1VR5A 1A7LA 4R6KA 4H8JA 3HCQA 4EUOA 3C32A 5CBSA 2B3FA 3V83A 1OQGA 3TAJA 4OESA 4FIMA 2F6PA 2V84A 2O7UA 4EF1A 4PQJA 4YMAA 2NXOA 3KN7A 2DE4A 4LVQA 2A5SA 4IGTA 1Y3PA 1ZIUA 2HQ0A 3TEPA 1FTKA 1B46A 3IJOB 4LZ5A 5IAIA 1J1NA 3OENA 1LSTA 2RKMA 2Y7RA 2ZYNA 1UTBB 3A3UA 3OEMA 2RINA 3L6GA 1MM7A 1GV8A 2VP1A 3KEIA 1PDAA 5TPAB 3G3FA 4QSCA 4G8NA 5I2NA 1URGA 4DXUA 5H8QB 4FORA 3C35A 3G3HA 4FJPA 2DVCA 4OFJA 4LQ5A 1M5DA 1M5CA 1PB8A 2I0BA 4O3BA 1MPDA 1B5IA 4DDDA 4F3PA 1DPPA 3MAMA 2AL5A 4AB6A 2DS9A 1B3LA 3IB2A 1N84A 3CFXA 1QVSA 2HEUA 1Y3NA 4KYSA 2XHDA 3FATA 3IOUA 3ONMA 2VGQA 1Q35A 2D5WA 2Z23A 1MY3A 2DSFA 4QFOA 2UYEA 3THIA 2QSXA 2D3IA 1D9VA 1B5HA 1MXYA 2V3TA 4E0XA 2GRVA 1I6AA 1A55A 2XXTA 1MPBA 4X1DA 4HCWA 1B3FA 3FXRA 1IUDA 1ZTYA 2Z8FA 4BDNA 1LAXA 4FEDA 5F7VA 2HAUA 1R9LA 4NWDA 1HSLA 4Z7EA 4KCDA 2I6EA 3LSXA 3TFLA 3W15C 4R9FA 3DP4A 1SVXB 5HM4B 5BUUA 2PT2A 3CVGA 4F3BA 2Q88A 4XTCQ 1EZOA 3KSXA 2A5TB 4IO5A 3OOAA 1JVXA 3T9XB 2REJA 3LBSA 3BFUA 2OLBA 3QUJA 2O84X 4EQBA 1UIVA 3TYHA 2CMOA 2GHBA 5TPAA 1SW5A 5ICTA 2XD2A 4R6HA 3HV1A 5H8QA 1KWHA 3IO6A 3GXAA 3PUXE 4RY1A 3RLFE 3K1PA 2YLNA 4U1OA 5CC2A 4OFOA 1MH3A 2XXXA 2HXWA 1OVTA 1D4NA 3I3VA 2W7YA 5DT6A 1IXIA 5EHMA 4QFLA 5H8SA 1XVXA 2OK2A 2Z8EA 3MP6A 4YKJA 2UVJA 4GD5A 1Y1ZA 1XS5A 4BDRA 1MXWA 3UP9A 4BDQA 1MQIA 4TQUQ 4M4GA 5IKBA 1ZKBA 4G2ZA 2VD3A 2H9BA 2V3UA 2Q89A 2F8DA 3R26A 1NKXA 3H4ZA 2ZYMA 3EHSA 1JEUA 4RPNA 2H98A 3U8QA 3USDA 3FVOA 2R9JA 3JYRA 3TTKA 1DSNA 1NH7A 1ZLQA 1F9BA 1LCTA 2Y7PA 3TQWA 1II5A 1B05A 1JNFA 4JXIA 1JETA 4WKMA 1HSEA 4YB7A 4NF5B 3H6VA 3C31A 2A5TA 4N07A 2XXIA 2E0SA 4M1VA 3U1OA 1SQYA 5H8FA 5I84A 5KCJB 3FXQA 3VXCA 1MXXA 3K6WA 3VLWA 5KDTB 1Z7ME 1DPEA 2O1MA 3SEYA 3H6TA 5H8NB 4U2RA 3VV5A 1NH8A 1MS7A 4F1UA 3FUZA 5AE4A 3PUYE 1P1WA 3H03A 3F11A 4F1VA 3ILUB 4RPOA 2O51A 3MPLA 1SW1A 3QSLA 1B6HA 1FTLA 2F7CA 3PD9A 5ITOA 4TLMB 4QRZA 3K6UA 5ELVA 4QHQA 1MY1A 3MPKA 2E1SA 3L6HA 4KR5A 1M5FA 4TOZA 2Y7IA 4FATA 2DWJA 3N6TA 3WAFA 4QFPA 1A40A 1SBPA 3N94A 4U4SA 4RYAA 4BDOA 1MXZA 3SEVA 1TWYA 3WAEA 3CI8A 5DEXB 1MQHA 1P99A 3SEWA 4P11A 5ISUA 1FQAA 3N6UA 3PPRA 3RTFB 1CB6A 4P0IA 3O6HA 1DTZA 3IOWA 1P1QA 3BKIB 2Q2CA 1OVBA 3JV9A 3TTRA 2RCBA 4R2FA 1RYOA 1LCFA 1MG1A 4H1XA 4NF5A 5AA2D 1B3HA 5I58B 4ECFA 3QAXA 5CRYA 5KCJA 1N7WA 1Y4CA 3TPAA 2O1LA 3T93B 3LSWA 4NWCA 1UIUA 1NFTA 4IO4A 5KDTA 1Y4TA 3OELA 5H8NA 3CG3A 1P1NA 2ZYOA 4U21A 3IOTA 4FECA 4Q30B 2HFBA 4R9GA 4OTEA 2V3QA 5EHSA 3SESA 1IXHA 1LBCA 2AIXA 1B7ZA 5DYHA 3MJNA 3K4UA 1S9TA 1PB7A 4G68C 3E13X 1ZMGA 2X7QA 1MM6A 2UVGA 4XKNA 1Y1MA 3OO6A 2HZLA 3H6WA 2Y7KA 4OYVA 1QKAA 3KBRA 4DE8A 1MPCA 5I56B 1MXVA 3CRBA 3FIRA 1ZJLA 1MY0A 1H43A 3M8UA 3TTNA 1EH3A 2F97A 3BBRA 1USYE 3EPEA 3RT6B 4XXUA 2D21A 4OXVA 4IO3A 5JK4A 1Y20A 3D4CA 3T9UA 3MVXA 3MZ1A 4GWOA 5I58A 1LAFE 2PYYA 3UN6A 5DTBA 1H3DA 5JTYB 3SERA 5BWJA 4GQOA 3KG2A 3W9WA 1NNFA 1QKBA 4R2BA 4R75A 5AA4B 4QF9A 2R71A 3C36A 4HW8A 2DXYA 4OEVA 4DCXA 4MLQA 4X9TA 2FYIA 2THIA 2OWSA 4YKIA 1Y9UA 2Z8DA 3T22A 4NEDA 3FV1A 3S9LC 1A8FA 2QS2A 3S9NC 1AL3A 1PBPA 2PX1A 3IORA 2R6GE 3G3IA 4MF3A 3LSLA 3OMBA 4KD5A 5CI5A 3O28A 2XXYA 4YB5A 4ZDMA 3PU5A 1FQEA 4U23A 4GF8A 3SEXA 3ZSFA 4JWXA 3HO7A 1R6ZA 3C9HA 5L9MA 3RQTA 1OLAA 2WKYA 1LGBC 3C4MA 3HPIA 3KSJA 1FCKA 5FTHA 5A5XB 1LFHA 2HCAA 2H4IA 4GVOA 2F6GA 3MVYA 2QPQA 5I56A 3OXNA 4PETA 2QS3A 1A8EA 4C1TA 3U72A 3VVFA 3RY3A 3I5OA 2I58A 1R1NA 2ESNA 3RTWB 5K2XA 4OQOA 3PUWE 3TELA 4IO7A 2B65A 4R74A 4ZEKA 1AIVA 2DP8A 4NF4B 5I59B 1JVYA 4DIGA 1NL5A 4KYDA 1IXGA 3Q27A 4G8HA 4RNSA 2V25A 3BFTA 5JTYA 3LUYA 3M3LA 4IY5A 4KQPA 3EHUA 3DM0A 3G7WA 5AA4A 4N13A 3G3GA 3PUVE 4BDMA 3K2DA 1Z7NE 4NE4A 4EQ9A 3LR1A 2G29A 5ICQA 2HAVA 1FQDA 1CE2A 3OO7A 2OZZA 1N76A 3V89B 4EDPA 2PT1A 4XKQA 1QULA 2NUVA 4LA9A 3PD8A 2DVZA 3O9PA 1XC1A 1UTBA 3MVWA 3ODBA 2RF1A 2VD2A 2H5YA 1TFAA 4PFYA 2I0CA 2QMXA 4YZZA 4MFIA 3HHFA 3IR1A 2XXVA 2IEEA 4PE5B 4EXLA 1LAHE 2XXQA 2QJEA 3TTLA 3OO9A 5A5XA 3IK6B 4FE8A 2XX8A 2ZXTA 3D4GA 1I69A 2NWJA 3KZGA 3LSFB 4KHZE 3MP1A 1T0KA 4H0WA 1O7TA 2ZNUA 4FEBA 5K2YA 3TKDA 3JZJA 4H67A 1R9QA 3S9MC 1JW1A 3K01A 2LAOA 4OERA 1B3EA 4PFTA 4GFRA 4NF4A 4ND9A 5I59A 2ZYKA 4F18A 1DMBA 3E9XA 2YPNA 3ZKKA 3TCGA 3E3KA 4F3GA 2Q9TA 2ZNTA 3HHGA 4ZEDA 5EYFA 3TQLA 2I3WA 3SDFA 2XXRA 5FHOA 2Z22A 4PFUA 4DLDA 1S7YA 4ZE8A 3A09A 3N26A 4YKPA 1GVCA 4ZE9A 3MUQA 4I9DA 1SYHA 4RK9A 1B1HA 1H45A 3E4RA 4LQ2A 4ZEBA 4I62A 4QFNA 1VFDA 4Z0IA 3O66A 1VFEA 5CMBA 1AMFA 2ONRA 1JW5A 2DXRA 2F35A 1JQFA 5TP9B 3C34A 2UVIA 3RUMA 3IO4A 5I57B 2ZNSA 1SI0A 2O6AA 1D3KA 1FTOA 1B4HA 1N3WA 1H76A 3R6UA 4O3CA 1LB8A 2FNCA 3IL1B 3T96B 1ATGA 2ANJA 2FA7A 4ZEIA 5DVIA 3K02A 3VE1B 4OEUA 2ALUA 1IITA 3FD3A 2F5XA 4F19A 3KN3A 3DELB 5CMKA 4I1DA 4H6DA 1O64A 4LUBA 5FHNA 4EQ7A 4ESWA 3MZBA 3A3CA 3SKPA 4ELOA 4GL8A 4F1YA 4Q8RA 1B9JA 5JEIA 3K6VA 3DP6A 4LONB 2ZMBA 4GL0A 1ZBMA 1RYXA 4RK2A 1N04A 4R73A 3VLUA 3IOVA 2QS1A 3G3JA 5F1QA 3B6WA 2UXAA 3CR9A 3PV0E 1SDXA 4G77A 2DWIA 4XKPA 2P0SA 4QSDA 2AYSA 4O3AA 4G68B 1B58A 3MWBA 2DWAA 3KJTA 3FJGA 5H8HB 1M5BA 3CSBA 1LLSA 1NMUA 2QMWA 1ANFA 5B7DA 3HSTA 2O7IA 3K00A 1B52A 3K1NA 3ZKLA 3Q28A 3KJ7A 3UK4A 1ZU0A 4AQ4A 3VFJA 4KPTA 3FASA 1B0HA 4L17A 5TP9A 2XX7A 1IXCA 1QW0A 4OZ9A 3K0VA 1MXUA 5I57A 4GXAA 1WVJA 4ZECA 1YTVA 4JB7A 2RC7A 2XD3A 3UORA 4IGRA 1LBBA 5FHMA 1UQWA 1B4ZA 2F34A 4RJZA 1PC3A 4XKRA 5L9SA 3RNNA 1NNTA 2ABHA 4NMYA 4JBZA 2I49A 1QJMA 2DQVA 1MRPA 1TXFA 1XT8A 5I2KB 4BLAA 5B70A 3DP8A 2F36A 2YJPA 1POY1 4JSDA 5HPQA 1LFGA 1QUJA 4G4PA 3FJMA 5DEXA 3H7MA 5I2NB 4KCCA 2DE3A 4C1UA 3ILTB 4QSEA 2OJTA 4G68A 3OSRA 5KZTA 1OLCA 1MH4A 2I3VA 1USYH 5H8HA 1AH5A 3U94A 1B2HA 1GTKA 2OWTA 4ONYA 4FAJA 3OEKA 3U93A 3M3KA 4YICA 3PPPA 2RC8A 3AXFA 3RT8A 1D9YA 3UIFA 1EZ9A 4G8MA 5HBCA 4Q5TA 4PFWA 1IQ7A 2PMSA 1LFIA 3UA8A 3P7IA 2DYXA 4C0RA 4DZ1A 3GLBA 3FVNA 2QRYA 2NOOA 3Q26A 3T9HB 1UTHB 3MC2A 1WDNA 3UGWA 3MP8A 1B7HA 3IX1A 4ISUA 3QYTA 2RC9A 3HN0A 4ESXA 4NF6B 5TU0A 5FTIA 1H44A 4WEDA 2F7AA 1MQGA 1FTMA 4KFQA 3Q25A 5I2KA 3TZAA 1SW2A 1TT1A 3FJ7A 3EHTA 3IAZA 3IJXB 3VLVA 5L9OA 4ZS9A 3O6IA 2DWHA 2ONSA 3IB0A 1P1OA 1L5TA 3RPWA 4F2OA 1AOVA 1YPNA 4OFLA 4OWDA 1ELJA 1IEJA 2QS4A 3PPOA 3RN8A 3C33A 2I4BA 4EF2A 1YCJA 2Q2AA 4JWOA 4LZ8A 4LZ7A 3V8XB 3QIMA 1B5JA 3LC8A 3CIJA 1O63A 1VSOA 3N5LA 1B51A 4RXLA 1B7UA 1QUKA 3GBAA 2X7PA 4OENA 4ELRA 4U22A 3H3GA 2ONKE 2XXUA 3PPNA 3KN8A 4JSOA 1JW4A 3O2AA 4ELQA 1GR2A 2Y7WA 1MQJA 4TLLB 2HZKA 4P0GA 2B3BA 4X1BA 3S9EA 3CG1A 3MVZA 1OQHA 3KOSA 4ZZAA 1UTHA 4MH5A 4MBPA 3U92A 2I48A 1A99A 1PB9A 1MY4A 3MQ9A 4OETA 2GHAA 2I4CA 4IY6A 3K6XA 4NF6A 1B32A 3TCHA 4DCYA 4XIGQ 2CZLA 1Y3QA 3EN3A 5AA1A 4YMBA 4KYEA 3FVKA 3R7XA 3KFMA 3QUFA 3KOTA 1GGGA 4F39A 1WODA 1N3XA 2XXHA 4I8CA 3EQ1A 2GH9A 3ZS6A 2UYFA 4F22A 2PBWA 5CBRA 1M5EA 5H8FB 1URSA 2P1SA 2GFEA 2IA4A 3VDFA 4R6YA 2RCAA 2V93A 1NNPA 2DOJA 3MZ9A 5LOMA 3O29A 4ZEFA 1MDQA 2O69A 3OD7A 4NTLA 4KI0E 3VVDA 4YU0A 3PPQA 3TTMA 5CM6A 1JEVA 4DXCA 3CSGA 1N0TA 3K1MA 3FV2A 5AA2B 1B1XA 3VVEA 1SYIA 3EF7A 5AA3A 5M2VA 3PUZE 4NF8B 4F29A 4GLIA 4GXSB 3G3KA 5L8DA 4LP2B 1QUIA 4U4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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