5A5XB

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
total genus 141
structure length 417
sequence length 417
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB02
3EN3A 4F1YA 2OK2A 3BFTA 2VP1A 1MPDA 5K2XA 4MLQA 4R74A 3O97A 1IZ1A 5TPAB 4GL8A 1FTLA 1VFEA 2B3FA 5TU0A 1MPCA 5JTYB 4ND9A 2RCBA 1WODA 2NWJA 3VVFA 4LA9A 3OD7A 1SYHA 2V25A 3FJGA 3C36A 3GBAA 1MQJA 3ZKLA 3PUXE 2I58A 2H98A 3KG2A 4POWA 5JTYA 3SEUA 3IK6B 2E1SA 3S9MC 1DSNA 2ZMBA 4IO7A 3K6XA 3ZKKA 4GL0A 4JSOA 4NWCA 4U1OA 4HS7A 1MRPA 3TFLA 2RKMA 4N13A 4HTGA 3MZBA 4YU0A 3K1NA 4ZE9A 5FHOA 2XD2A 2G93A 2XXIA 3MQ9A 2YJPA 3HV1A 3RTWB 5J1DA 1MQGA 3T96B 2DWHA 3G3KA 1S50A 4R2FA 2YPNA 2I0CA 1POY1 1VSOA 4RNSA 3U92A 4HCWA 5F7VA 3VFJA 4C1UA 3TEPA 3QUJA 2F6GA 4GFRA 4IB2A 2ZNUA 4U2RA 3KEIA 2UYFA 2LAOA 2HXWA 1NNKA 1ZKBA 3KOSA 1A54A 3OO8A 2D21A 1US4A 1NL5A 3PD9A 1SW1A 3KJTA 1XS5A 1VR5A 3K6WA 4KYEA 5JEIA 2Z8FA 2AIXA 4OFOA 5I56B 3MP6A 1B3GA 1UQWA 3PMVA 3RNNA 3I5OA 3W15C 3TTKA 1OVBA 4DCXA 5LOMA 3CRBA 4KFQA 2UVGA 1URDA 3IO6A 4GOTA 1Z7ME 3QIMA 1WDNA 3HCQA 5H8QA 4K3FA 1SD3A 2ONRA 1LGBC 2Q88A 2HFBA 3M3LA 3PGFA 2Q2CA 2DSFA 4YKIA 4F3SA 2NOOA 3FD3A 2XX7A 1A8FA 2Z23A 3SEXA 1POTA 2GRVA 4RPOA 3SERA 4LP2B 1NH7A 2O51A 4FJPA 1USYH 2H5YA 1MXYA 1B6HA 2WKYA 3C31A 4IO2A 3OEMA 1M5CA 4F29A 1QJMA 4QSCA 4R9FA 4O3CA 4GRKA 3FVNA 2D3IA 1LLSA 3QSLA 4MH5A 1NMUA 3BKIB 3T9VA 3H3GA 3TQWA 2R6GE 3RT8A 4KD5A 4YKPA 1MY4A 2ZYOA 3FIRA 4H8JA 4N07A 3RN8A 2I3WA 4EF2A 2DP8A 5F1QA 1D9YA 3DM0A 3T9HB 3PD8A 3BFUA 1A99A 3CR9A 4OESA 4U21A 2I4BA 1KWHA 4I62A 4RYAA 1II5A 4G8HA 1NH8A 4O3BA 5DYHA 1D4NA 2XXXA 4Z0IA 1B2HA 3CFZA 3IOTA 1A8EA 3O9PA 1BIYA 1SI1A 5AA2A 5I2NA 4U22A 1UTBB 1N0TA 3ILTB 2F97A 3M8UA 4BDRA 1URGA 1B5JA 3TMGA 3RQTA 3ZS6A 1EZ9A 4DDDA 4BDMA 4G68B 5ELVA 2V3QA 2KLFA 4RXLA 3TELA 4EUOA 4RA1A 2CZLA 3FJMA 1N7XA 2FA7A 3U93A 2OWSA 1FTJA 4MLVA 3G3FA 3N6UA 4G68A 2PMSA 3U8QA 2AYSA 4AB5A 4QFKA 3IJXB 5FHNA 2PT2A 3KSJA 3G3JA 3KSXA 4ISUA 3H6UA 5FHMA 3UP9A 4NF4A 4ZEBA 2YLNA 4EXKA 4YMBA 3IO4A 2Q2AA 4Z7EA 2F34A 3D4GA 1YCJA 2ZYNA 3CG1A 4E0WA 1J1NA 2QMWA 4POXA 1M5EA 3MPKA 3O28A 1IXHA 4EQBA 3CI8A 1NNTA 1OIBA 4YAHX 1VFDA 1JETA 1S7YA 4P11A 3LSWA 4DXBA 4M4GA 1FQBA 2O6AA 5IKBA 4QSEA 1VE4A 5I58B 4FEBA 5K2YA 2ANJA 3SESA 4NF8A 4FECA 4JB7A 2Y7RA 3A3UA 3LUYA 4H65A 4XTCQ 4BLAA 3K6UA 3DP8A 3EHTA 3O6HA 4OERA 1F9BA 4ZZEA 1NFTA 2A5TB 4C0RA 3G3GA 4QFNA 4RY1A 3N94A 5DEXA 3KGCA 3K0VA 2O68A 4JXIA 3HSTA 3DELB 2A5TA 2OBGA 2PBWA 3JZJA 2ESNA 4EF1A 4LZ5A 2RC7A 2X7PA 3R26A 3FXUA 2DXYA 3VVDA 1WVJA 4RK9A 1DOTA 3IOVA 3VXBA 2HZLA 5H8NA 1XVYA 4X9TA 1FTOA 1OMPA 1L5TA 2O1MA 2DQVA 4G8MA 3VXCA 5A5XB 1SQYA 2V93A 1I6QA 4GQOA 2XXHA 3I3VA 2FYIA 2X7QA 3C35A 1R9QA 4IGTA 4P0GA 4IGRA 3TTNA 1P1WA 4YICA 1XHYA 4O3AA 1P1QA 5CMMA 2PVUA 4DCYA 5CRYA 3C32A 3TYHA 1ZTYA 2HQ0A 3FV1A 1H3DA 1MG1A 3OSRA 2XX9A 1B3FA 5HBCA 3E13X 1SBPA 1QVSA 2F35A 1Z7NE 2XXUA 2RF1A 5TPAA 1QKBA 4GXAA 3QK6A 1MXZA 1OLCA 2UVIA 1UTHB 2QRYA 1JW4A 2GHBA 3TCHA 2RC8A 1MXVA 1BLFA 2PT1A 3O66A 3HO7A 5ICQA 2W7YA 3B7DA 4F18A 3D4CA 1DPPA 5L9OA 2QS1A 5I59B 4OTEA 1TXFA 2VD2A 3JYRA 4Q0CA 4RK2A 3S9EA 2THIA 3TODA 4F39A 3SETA 3KZGA 5FTIA 3I6VA 5ITPA 5CBRA 4LUBA 1Y3PA 2O1LA 4PQJA 2CMOA 4OEUA 1R9LA 1RYOA 4IY5A 1XVXA 1MPBA 4YMAA 1N84A 4PFUA 2XXQA 1OLAA 2NUVA 1EH3A 3MVWA 3EHUA 1XC1A 1TT1A 4XKNA 1GGGA 1B46A 2FNCA 3DP4A 4LVQA 1FQCA 2DS9A 2Y7PA 3VLWA 5HPQA 4NMYA 2F8DA 3UGWA 1FCKA 2Q9TA 3TAJA 5L9MA 4R73A 1MM7A 2PYYA 3C33A 2Z22A 2BJJX 3T22A 2R71A 2DWJA 1N3XA 4H5FA 4WKMA 3MP1A 3LSLA 5KCJB 1HSEA 1SDXA 3KOTA 1MS7A 4JWXA 4QRZA 4XKQA 1SW2A 2V3UA 1D3KA 3HPIA 2F7BA 4QSDA 2Z8EA 1AL3A 5AA1A 2F5XA 5KCJA 3FV2A 4Q5TA 5CM6A 3PMWA 1N3WA 1IEJA 4ESWA 1LCTA 4IO3A 5I56A 4OWDA 3TDJA 3C34A 4KQPA 1BP5A 1DMBA 1O64A 3U72A 1Y4CA 3N26A 4AB6A 1ZIUA 3Q27A 3HN0A 4OVJA 3OEKA 4ZEKA 3ZSFA 4R9GA 2P1SA 3PMXA 1ELJA 1DTGA 1OVTA 3IJOB 1B40A 2VD3A 5BWJA 4LZ7A 4EDPA 2ZNSA 1PEBA 2Y7WA 4HW8A 1PB7A 3FUZA 4IO4A 1B3HA 4LONB 1ZBMA 2DOJA 4LZ8A 5L8DA 4R6KA 1B58A 4WXJA 2Y7KA 3MP8A 5TP9B 1OQGA 1B1HA 5H8FB 3CSGA 1B32A 1N7WA 2F7CA 1MH4A 3H6VA 3TPAA 3IB1A 3TCGA 3OO6A 2DYXA 2G29A 3JV9A 3WAFA 3DLNA 1JQFA 1MQDA 1MDP1 3PUVE 5TP9A 1N76A 1PBPA 1B7HA 1TFAA 4NE4A 3PV0E 2XX8A 3MVXA 4R6YA 4ZDMA 1RKMA 3GBBA 3S9NC 4BDOA 2H9BA 4KCCA 3IAZA 1P99A 3KN3A 5DTBA 3LC8A 3TQLA 2DE2A 1ATGA 1B9JA 4XKRA 3HHFA 1MM6A 4OMBA 1QULA 3UN6A 3K01A 1JEUA 1PBQA 3R7XA 4Q30B 1LBBA 2OJTA 3IB2A 3Q26A 4WEDA 2XXTA 2VOZA 1B4ZA 3FVGA 4G4PA 4H1XA 2ONSA 4M1VA 2NVUB 1IIWA 4ESXA 2B65A 4FIMA 3M3KA 4U1ZA 1UTBA 4FAJA 4G2ZA 1MXUA 3H06B 3QXMA 3B6WA 3AXFA 2UYEA 2Y7IA 3CIJA 3UIFA 3U1OA 1B51A 1H45A 4UACA 4THIA 4JWOA 1MY3A 4ELQA 4GD5A 3C4MA 1Y3NA 1MQIA 4KCDA 1ANFA 1LB8A 1LFIA 5B7DA 4NWDA 2QL3A 3RUMA 2HAUA 1O63A 5AA3A 1MH3A 1S9TA 1EZPA 3OMBA 4XXUA 1IXCA 2I6EA 2QJEA 3QUFA 2QPQA 3L6HA 1FQEA 5I57B 1QUIA 1IQ7A 1PC3A 5AA4B 5KDTB 2DE4A 3W9WA 1B4HA 3VE1B 4XIGQ 2ZYMA 2F78A 1MY1A 5JK4A 1MY0A 4EQ7A 4DLDA 1B0LA 3H7MA 5L9SA 5I57A 3MW0A 5DVFA 2DVCA 3EF7A 1B7ZA 5AA4A 5KDTA 4NF5B 4UA8A 2H25A 3SEWA 3SEYA 3FZVA 2QS3A 3B6QA 4OQOA 1EU8A 1LFGA 1I6BA 5BUUA 3EHSA 5HM4B 1YTVA 5I58A 3K02A 4G8NA 1MQHA 1H44A 5DVIA 4YB7A 5CI5A 1M5DA 3Q29A 3ODBA 5AA2D 3KFMA 3K6VA 5ICTA 1GV8A 1Y1MA 3P7IA 3TTLA 1QUJA 2UVHA 1JEVA 3CFXA 1P1OA 1Y9UA 1LAXA 1Y3QA 4GIZA 1YPNA 4PFWA 3LSFB 3T93B 5B70A 4PP0A 2XHDA 3FVOA 1SYIA 4F1VA 2OZZA 3RLFE 2P0SA 4H6DA 3THIA 3MC2A 1JVYA 3T9UA 1HSLA 1PB9A 4ZZAA 5H8HB 2GFEA 1B52A 1H43A 4OFJA 2AL5A 3SEVA 4OYVA 2ZYKA 3HHGA 4TLMB 1ZU0A 4I1DA 4ZEDA 3B6TA 3IR1A 5H8HA 2UVJA 1AH5A 3VDFA 1B7UA 1MXXA 4ZEIA 4L17A 2I48A 2F6PA 3R6UA 3LR1A 4GVOA 1JW1A 5FTHA 5A5XA 1DTZA 2RC9A 3OENA 4ELPA 3KBRA 3KN7A 3USDA 1DPEA 4P0IA 4GLIA 3C9HA 3CSBA 3H6WA 4F3BA 3GZGA 1I69A 4GXSB 4FE8A 4OENA 3E4RA 1BKAA 4YKJA 4NTLA 3UORA 2QMXA 3VV5A 4F3PA 2AL4A 3UA8A 4YB5A 3H4ZA 3OSQA 4NF6B 4G77A 4ECFA 1B5HA 3OELA 1LAGE 3MBPA 4ZEFA 3S2VA 2ONKE 4LQ2A 1NNFA 4X1DA 3FASA 3PPPA 4H67A 1UTHA 3CFLA 4NF6A 4NEDA 4DXCA 1FQDA 1QKAA 2IA4A 5I59A 1QW0A 3BBRA 4BDQA 1ZJLA 5ISUA 3LSXA 1SW5A 2I3VA 3GLBA 5DT6A 1XT8A 5EHMA 2QSXA 1MY2A 2XXPA 4DE8A 2XXWA 3N6TA 5CMCA 4U23A 1T0KA 2E0SA 2GHAA 3K1MA 5CMBA 2IEEA 4F1UA 1JW5A 3OO9A 1B0HA 2H4IA 4H0WA 1FTKA 1B5IA 3FJ7A 2DWIA 3S4UA 4EQ9A 1FQAA 4X1BA 5CC2A 3QYTA 2F7AA 4ELRA 2HZKA 3LBSA 3RGYA 3RY3A 5ITOA 2NXOA 1HSJA 3SDFA 3MPLA 3MUQA 5I2KB 3FXRA 1MDQA 4I9DA 3VVEA 3PUYE 4KHZE 5H8QB 4F2OA 3IX1A 3FXQA 3L6GA 1QUKA 3T66A 1LFHA 3SKPA 5I2KA 1Q35A 2OWTA 3H6TA 2A5SA 1UIVA 2DWAA 1A55A 3TKDA 4GF8A 1US5A 4JSDA 1P1UA 5M2VA 1H76A 2I49A 3ONMA 1YAEA 3MVYA 4EXLA 1B05A 4IO5A 3RTFB 1SW4A 1O7TA 3EQ1A 1P1NA 2M8CA 2VGQA 4GWOA 5KZTA 3O6GA 4KYSA 4IO6A 2XD3A 4H5GA 3ECRA 1A7LA 1M5BA 4QF9A 1AMFA 4KR5A 1TWYA 4N6PA 5EYFA 3V83A 2B3BA 3PPQA 1EZOA 3VLVA 2DE3A 3PPRA 4TOZA 1USYE 1B1XA 1MXWA 2ABHA 5H8FA 5I84A 3IOWA 4Q8RA 4C1TA 1FTMA 1ZLQA 3FVKA 4ONYA 4F19A 1I6AA 1ZMGA 4LATA 1URSA 3EPEA 3E9XA 4QFPA 2UXAA 4G68C 3MVZA 4E0XA 3IOUA 3K1PA 3U94A 3Q28A 4JDFA 1N04A 4X48A 3PPOA 1PB8A 2RINA 2O7UA 2XXRA 5AA2B 5I2NB 4HCYA 4F31B 1PDAA 3V89B 3TZAA 2HEUA 3M3FA 4FEDA 3O2AA 2HAVA 1FW0A 1GTKA 4KYDA 2VHAA 1CB6A 2I0BA 3G3IA 4PETA 1LBCA 4U4XA 1IXIA 2ALUA 3RPWA 1OQHA 2O84X 3WAEA 1R6ZA 3G7WA 3V5AA 4JWYA 4QHQA 3PUWE 4FORA 4BDNA 4PE5B 4DZ1A 3K2DA 3E3KA 3MZ1A 1Y20A 1LAHE 1SVXB 2Z8DA 4LQ5A 4RJZA 1AOVA 3OOAA 4R72A 1AIVA 4NF4B 2RCAA 4ELOA 3OXNA 1IXGA 1GR2A 3T9XB 2V3TA 4MBPA 3OO7A 4MFIA 4KPTA 4F2QA 3RT6B 4U4SA 4H8IA 1NNPA 3DP6A 1LCFA 2PX1A 4TQUQ 1IUDA 4I8CA 4F22A 4AQ4A 2Q8JA 4OXVA 4PFYA 2XXYA 1FQFA 3QAXA 4JBZA 3MJNA 4KI0E 4XKPA 3PUZE 2REJA 1JNFA 4NF8B 2ZNTA 3CVGA 1GVCA 3TTRA 4PFTA 3IB0A 3K00A 1IITA 4MF3A 4YB6A 1UIUA 1A40A 3G3HA 3IL1B 3V8XB 1LSTA 2GH9A 1NKXA 1B3EA 4NF5A 2HCAA 4FATA 3KN8A 4QFOA 1LAFE 4R6HA 3F11A 2F36A 1TFDA 4YZZA 3KJ7A 3MAMA 3MWBA 4ZE8A 4BDLA 1BTJA 2QS4A 1B3LA 5DEXB 4DXUA 3ILUB 1LB9A 4TLLB 2X26A 2I4CA 4WEPA 5IAIA 3Q25A 2OLBA 4OFLA 3VLUA 2Q89A 1CE2A 5CBSA 1Y4TA 3FATA 5AE4A 2P2AA 3TCFA 2DVZA 3O29A 2XXVA 2QS2A 2ZXTA 2DXRA 2V84A 3TTMA 3MZ9A 3O6IA 2D5WA 5H8NB 3K4UA 4R75A 1Y1ZA 4F3GA 3GXAA 5CMKA 2O69A 4QFLA 3H03A 4OEVA 5H8SA 4RPNA 3UK4A 3FGSA 4ZS9A 4IY6A 2Y84A 4R2BA 4DIGA 3IORA 1Q1KA 4ZECA 3PPNA 3TUSA 2OCUA 4OZ9A 1XOCA 3A09A 4OETA 3A3CA 4OHNA 3W9VA 1M5FA 1JVXA 1RYXA 2REGA 4YKKA 3PU5A 2H99A 3CG3A 5EHSA 2O7IA 2R9JA 1SI0A 1D9VA 1R1NA 3S9LC 5DVJA 3N5LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FJ6A 3EN3A 2ZZWA 2PCRA 4HE0A 4F1YA 2OK2A 3BFTA 3LUZA 2VP1A 1MPDA 5K2XA 4MLQA 4R74A 3O97A 1IZ1A 5TPAB 4GL8A 1FTLA 1VFEA 2B3FA 5TU0A 1MPCA 5JTYB 4ND9A 2RCBA 1WODA 2NWJA 3VVFA 2F3DA 1RDZA 4LA9A 3OD7A 1SYHA 2V25A 3FJGA 3C36A 3GBAA 1MQJA 3ZKLA 3PUXE 2I58A 3T0JA 2H98A 3KG2A 4POWA 5JTYA 3SEUA 3IK6B 3T1BA 2E1SA 3NOHA 3S9MC 1DSNA 2VPNA 2ZMBA 4IO7A 3K6XA 3ZKKA 4GL0A 4JSOA 4NWCA 4U1OA 4HS7A 1MRPA 1LBYA 4P1EA 3TFLA 2RKMA 4N13A 4HTGA 4H46A 3MZBA 4YU0A 3K1NA 1FPEA 4ZE9A 5FHOA 4NF0A 2XD2A 2G93A 2XXIA 3MQ9A 2YJPA 3HV1A 3RTWB 5J1DA 5IZ3A 1MQGA 2XWIA 3T96B 2DWHA 2VPOA 3G3KA 1S50A 4R2FA 2YPNA 2I0CA 1POY1 4PGPA 1VSOA 4RNSA 3U92A 4HCWA 5F7VA 3VFJA 4C1UA 3TEPA 2DDKA 3QUJA 2F6GA 4GFRA 4IB2A 2ZNUA 4U2RA 3KEIA 2UYFA 2LAOA 2HXWA 1NNKA 1ZKBA 3KOSA 1A54A 3OO8A 2D21A 1US4A 1NL5A 3PD9A 1SW1A 3KJTA 1XS5A 1VR5A 2FIEA 3K6WA 4KYEA 5JEIA 2Z8FA 2AIXA 4OFOA 4GBWA 5I56B 1NV7A 3MP6A 1B3GA 1UQWA 3PMVA 3RNNA 2KQZA 3I5OA 1FBPA 3W15C 3TTKA 1OVBA 4DCXA 5LOMA 3CRBA 4KFQA 2UVGA 1URDA 3IO6A 4GOTA 1Z7ME 3QIMA 1WDNA 3HCQA 5H8QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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