5AA2B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPPLKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 143
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B02
2DQVA 3OXNA 4LATA 1MH4A 1LAFE 2PMSA 3EF7A 3OELA 5DVFA 3DM0A 2V93A 3ZSFA 4G8HA 5AE4A 2XX8A 1BTJA 1H43A 4ESXA 1BP5A 2X7QA 4POXA 3MC2A 1FTMA 3A09A 1S7YA 3T96B 2WKYA 1IZ1A 4U4XA 4OEVA 4G77A 1RYOA 3FZVA 3SETA 1VFEA 2XD2A 1EH3A 3S9EA 5H8QB 3KJTA 4GOTA 4R2BA 5EHSA 1LAHE 3KSJA 4EF1A 3RTFB 3C34A 1NMUA 4BDQA 1IXHA 2P1SA 2H4IA 3MPKA 5L9MA 4N07A 1ELJA 1NH8A 1P1UA 1F9BA 2W7YA 2OLBA 4YZZA 1QKAA 2AIXA 1RKMA 2A5SA 1JW1A 3BKIB 2VGQA 1NL5A 4GRKA 1B9JA 4THIA 5DYHA 4OMBA 1URSA 2ABHA 1Y1MA 1A40A 1B3HA 4LZ7A 1MS7A 2O1MA 3EN3A 4JWYA 4X1DA 4XKPA 3PMWA 1NNKA 3LSLA 5KCJA 1UTHA 2VD2A 3V8XB 5F7VA 4BLAA 1MXZA 4QSCA 4BDMA 2HXWA 2X26A 1SW1A 1SI0A 4IY5A 4C0RA 1B1XA 5BWJA 3CR9A 2NUVA 4Q0CA 2PVUA 5JTYA 1ZMGA 1B7HA 3FJ7A 3QXMA 1MQGA 1B51A 5FHNA 4FEDA 3OENA 3LC8A 2XXTA 2I4BA 3FVKA 5I84A 1B2HA 1LB8A 4ONYA 2V84A 3W9WA 3PGFA 5TP9A 3VVEA 4TLLB 5DEXA 3EQ1A 3CFZA 4PFUA 1SW2A 1FTKA 3BBRA 1M5EA 1LCFA 2Y7RA 1SBPA 4RPOA 4FJPA 1ZJLA 5TPAA 3HPIA 4OYVA 3OSQA 4R73A 2UYEA 3PPRA 4ELPA 1B40A 4JXIA 2Y7IA 3RY3A 3TTLA 3IB2A 3G3JA 1B5JA 3KZGA 5I56B 1MM6A 2FNCA 1P1NA 4ESWA 5I58A 4UACA 4GL0A 3PUXE 2QRYA 3GLBA 1I6BA 2VHAA 2LAOA 3M3LA 3RT6B 3LSFB 4AB6A 1H44A 4NEDA 3MW0A 2H25A 2I58A 1FTOA 4PQJA 1IXIA 3IL1B 2QMWA 2HZKA 3S9NC 3Q27A 2V3TA 5KDTA 1VR5A 3Q25A 3MP6A 3V83A 3PMVA 4YAHX 1VFDA 3ZS6A 2RC9A 5A5XA 5H8FA 2OZZA 3IOTA 3G3KA 4KD5A 3N5LA 1H3DA 1TXFA 1MRPA 2ZMBA 4R6YA 3TYHA 4LVQA 4YKIA 3IK6B 1TFAA 5CRYA 1EZPA 4F1YA 1IXCA 1I6AA 4RYAA 1B3LA 5EHMA 3TODA 1SW4A 3I5OA 1IUDA 5CBRA 1DSNA 3S4UA 1JETA 2I6EA 4G2ZA 4YU0A 2YLNA 1WDNA 1JVYA 4NF6A 5CMCA 1QKBA 3SKPA 3EPEA 2F36A 4MLVA 2IA4A 4LZ5A 4JBZA 4ZE9A 3O28A 3F11A 4JSOA 3GXAA 2KLFA 2PYYA 3FUZA 4LQ2A 1GR2A 1MXXA 3KBRA 3C35A 2G93A 4P11A 2ONRA 1PEBA 4MFIA 2HFBA 1MDQA 2ZYOA 4QHQA 4EXKA 1NNFA 3MBPA 1DPEA 3EHSA 3IO4A 2XXPA 4WKMA 3S2VA 1IIWA 4MF3A 4YKPA 1SDXA 4GLIA 1CB6A 4WEPA 3Q28A 4G4PA 3FV2A 4FE8A 4R9FA 4KCDA 5CBSA 3UK4A 4IGTA 1Y1ZA 3I3VA 3H06B 3QIMA 1LLSA 3OD7A 5FTIA 2H5YA 2Q89A 5JEIA 4R75A 4F1UA 3RLFE 1A54A 1PB8A 3CVGA 3SEXA 3ILUB 4LZ8A 1Z7ME 3E3KA 1H76A 1UTBA 1DMBA 4OESA 2ALUA 4WEDA 3H6VA 3OO6A 3B7DA 4I62A 2ONSA 4Q30B 5CMKA 5EYFA 3PV0E 2Q2AA 3IX1A 2RC7A 2ZYKA 3KSXA 4DCXA 3OSRA 1ZTYA 3PUWE 1Y9UA 2OCUA 4KYDA 1WVJA 4UA8A 4O3BA 1XVXA 4GF8A 1GGGA 3IO6A 1B6HA 3DP6A 3UA8A 3UP9A 1I6QA 4BDNA 1N7XA 3PUYE 3PUZE 3PMXA 4RA1A 3BFUA 1UIUA 2Y84A 1B52A 1JW4A 3QSLA 3M3KA 3O6HA 3VLWA 4OEUA 1LBCA 3T9HB 3H4ZA 3S9LC 1B5IA 2I0BA 3U93A 5AA2B 4I8CA 4N13A 2XXYA 1MXYA 3C32A 3JZJA 2O1LA 2XX9A 3IAZA 4YMBA 4DLDA 4G68B 1QJMA 3IR1A 3RN8A 1IXGA 4QF9A 5K2XA 1USYE 4KCCA 1QUKA 3HSTA 1AH5A 3O6GA 4WXJA 5JK4A 5L9SA 4F3BA 2QS1A 3C31A 4NF5A 1M5BA 2ZNSA 3K6VA 3MWBA 3GBBA 1HSLA 4ZEBA 3GZGA 3CRBA 4N6PA 1FTLA 1GV8A 1TFDA 2REJA 4FEBA 2F7CA 3VXCA 3QK6A 4NWDA 1LB9A 1I69A 4QSDA 2FYIA 4P0GA 1HSEA 3KG2A 4GL8A 2VP1A 2XXXA 3R26A 3VVFA 3AXFA 3RNNA 3MPLA 3T9XB 5DVJA 2DXYA 3TMGA 3T66A 3MVZA 1P1OA 2QS4A 4HCYA 4U2RA 5I2NA 1Q35A 1J1NA 5H8QA 4ZEIA 3VXBA 3U72A 1MY3A 4EF2A 3CSGA 3EHTA 3LBSA 1QULA 3FJMA 1POY1 1B1HA 3JYRA 3CI8A 4TOZA 1UTHB 5FHOA 4OZ9A 3K1PA 1USYH 4YB7A 4I1DA 5CC2A 2Y7KA 5FTHA 4ISUA 2I48A 2QL3A 2Q88A 2UVGA 4O3AA 2VD3A 4EXLA 2O68A 4KFQA 4F2OA 4R74A 3T9UA 1O7TA 4RXLA 4OETA 4F18A 1IQ7A 1IEJA 1LGBC 4IO5A 2GH9A 3OO8A 3QUJA 2RC8A 1B0HA 2XX7A 3VV5A 2R71A 3FASA 1QW0A 5DEXB 3Q29A 3SESA 4ZS9A 5DVIA 3N26A 2O84X 3MZ9A 3D4CA 4KR5A 2I3VA 5TPAB 2DWIA 2F7BA 2XD3A 4X48A 4O3CA 3TPAA 3K4UA 1EU8A 4F1VA 1LAGE 3IOWA 3P7IA 3KN8A 5J1DA 2V25A 3GBAA 1XOCA 5B7DA 1B7UA 1XT8A 4RK2A 5DTBA 4H5FA 2XXVA 4IGRA 1MPDA 1NKXA 5CMMA 1PBQA 5I58B 1H45A 3CG1A 1PB9A 4ZZEA 4ELOA 4IB2A 2A5TA 4EQBA 1MXUA 1OQHA 5AA3A 1SYIA 1R1NA 1MG1A 4F39A 2GRVA 3O66A 4C1TA 5BUUA 1Y4CA 5DT6A 4MLQA 3CFXA 4QFNA 4R6HA 2XXQA 3DELB 2F34A 4KYEA 4PFWA 1US5A 3I6VA 1SW5A 1SD3A 5HM4B 4IO7A 4QFKA 5I57A 1R9QA 2UXAA 2I3WA 5I2KB 5A5XB 2D3IA 5H8FB 4Z7EA 1DPPA 1PBPA 4ND9A 3IOUA 3C36A 3LR1A 3U92A 1LFGA 2DP8A 2THIA 4LA9A 1PC3A 2OK2A 4BDRA 2ZYNA 3K1NA 2DVCA 3RGYA 3V5AA 2XXHA 1DTZA 1JEVA 1II5A 5H8NA 4M1VA 4H8IA 2P0SA 4NF6B 3HN0A 4OFJA 3B6TA 1EZ9A 4NF8B 4R72A 2HZLA 1A55A 3FXRA 3VVDA 1UQWA 1FQAA 4LUBA 1ZIUA 3DLNA 3WAEA 4DIGA 4R2FA 1LSTA 3PD9A 4XKNA 2R6GE 2CZLA 2UVHA 1MXVA 2F78A 3K0VA 3UN6A 1OLCA 3W15C 1NH7A 1DTGA 1QUJA 1OLAA 3E13X 4G68C 2PX1A 3U94A 2GFEA 2UVJA 3TCFA 4RPNA 5LOMA 4XKQA 2B65A 2O7IA 4ECFA 3IORA 2H98A 2DXRA 5I59B 5HBCA 3UIFA 2ESNA 4H1XA 3L6GA 2I0CA 4GD5A 3A3UA 4LQ5A 1TT1A 2HEUA 3IB0A 4ELRA 2NWJA 4HS7A 3TDJA 2F6GA 1JEUA 4PETA 1MQDA 4EQ7A 4EDPA 2Y7PA 1MDP1 3BFTA 1B46A 2HAVA 2O69A 4DXBA 3TTNA 4RJZA 1UTBB 1SVXB 1AOVA 1N3WA 2DVZA 4NE4A 3MUQA 3V89B 4F22A 2QS3A 2OWSA 3O97A 1YTVA 2AL5A 1MY1A 5CMBA 2V3QA 3E9XA 3MP8A 4I9DA 2ZXTA 3KGCA 2IEEA 2YJPA 2NVUB 3SERA 2Z8DA 4GXAA 3SEVA 3UORA 4R6KA 5CI5A 3TELA 2B3FA 3O9PA 2Z22A 1Q1KA 4AQ4A 4YB6A 1A7LA 3CFLA 1VSOA 4RNSA 5ICQA 4KPTA 2G29A 5TU0A 1FQCA 1R6ZA 3A3CA 4YMAA 1Y3QA 4IO2A 4HW8A 5AA2D 4BDOA 3JV9A 1A8FA 1T0KA 4H8JA 2I4CA 5H8HB 3ZKLA 1RYXA 5IKBA 1B05A 1JW5A 4RY1A 4M4GA 2Q8JA 2DWJA 3QYTA 3L6HA 4G8MA 3FV1A 4XXUA 3RTWB 2GHAA 4NF4A 4U1OA 4LP2B 1B7ZA 1MY0A 1US4A 1Z7NE 4OFOA 4FIMA 3HV1A 3KJ7A 1MQHA 3FATA 2F97A 4FAJA 3T22A 4NF5B 5AA4A 1MPCA 4GXSB 4TQUQ 2XXUA 3K02A 2AYSA 5CM6A 3SDFA 3SEUA 4GQOA 1JNFA 2F35A 4F19A 3QAXA 3C9HA 1Y3NA 1FTJA 3ZKKA 4XKRA 3KOTA 3FVGA 3TCGA 3MVYA 2F6PA 4ZZAA 5ISUA 3EHUA 4Q5TA 1SQYA 2R9JA 5L9OA 1YCJA 4JWXA 1S50A 4OERA 3N6UA 3TKDA 1XS5A 1AIVA 1D9VA 2Q2CA 4NTLA 1VE4A 4OFLA 1Y3PA 1QUIA 3FVOA 1BLFA 2Y7WA 1GTKA 3KN7A 1B3FA 1Y4TA 2D5WA 4K3FA 4IY6A 2F8DA 1ATGA 3RPWA 2P2AA 1MH3A 1TWYA 3MVXA 3FVNA 4JDFA 1MY2A 4ZE8A 3S9MC 4OVJA 2HAUA 2F5XA 2YPNA 4RK9A 4F29A 3DP8A 4U21A 3MAMA 5I2NB 3KEIA 1QVSA 1FQDA 1R9LA 3FJGA 2NXOA 3VE1B 1PB7A 4L17A 3IB1A 4F3GA 3ODBA 4JWOA 3H6UA 3C33A 3FD3A 1P1QA 1N7WA 3R6UA 2Z23A 3HHFA 3OMBA 5KCJB 4ZDMA 4GIZA 3VLVA 2GHBA 4DXUA 3O29A 3K6XA 4E0WA 3N6TA 1L5TA 4QFLA 2ZYMA 2QSXA 2DWAA 4FORA 5JTYB 3ECRA 4F2QA 3H6TA 4H65A 2B3BA 4KYSA 3OO7A 4P0IA 4R9GA 4ZECA 4YICA 1YPNA 3R7XA 1OVBA 3TTMA 3TCHA 4PFYA 5TP9B 3ILTB 2RF1A 2F7AA 2RCAA 1CE2A 3OO9A 4OWDA 3VDFA 4IO4A 2ZNTA 1BIYA 3MQ9A 3OEKA 4ZEKA 5H8SA 1A99A 4NMYA 1N76A 1SYHA 1IITA 4FECA 5B70A 3TQLA 1AL3A 2A5TB 1XHYA 1BKAA 1FQBA 4H67A 1N0TA 4E0XA 3RQTA 5HPQA 3OOAA 1N84A 3B6QA 3TAJA 4DE8A 3C4MA 2BJJX 1UIVA 3USDA 1FCKA 1P1WA 1LFIA 1XVYA 4XIGQ 2O51A 3RUMA 4OXVA 2DE3A 1JQFA 4QSEA 3E4RA 3T9VA 2NOOA 2QMXA 5L8DA 3VLUA 5AA1A 5I57B 3B6WA 1NNPA 5KDTB 4DXCA 3PPOA 3MP1A 2UVIA 4QRZA 2REGA 3HHGA 4JSDA 3TFLA 5I56A 1URDA 3T93B 1AMFA 4G8NA 5FHMA 1D3KA 4OENA 3PUVE 4DDDA 4IO6A 5ELVA 2X7PA 1SI1A 3DP4A 3TTRA 4IO3A 4KHZE 1ZBMA 3FXUA 3IOVA 3TQWA 1KWHA 2HCAA 4POWA 4F31B 1N04A 2DE2A 2DSFA 2Z8FA 4OHNA 3SEWA 2XXWA 1Y20A 4DCYA 5H8NB 3MVWA 1OMPA 4FATA 3HCQA 5M2VA 3THIA 5F1QA 4X9TA 2RCBA 2XXIA 4Q8RA 4H5GA 3UGWA 5I2KA 3H6WA 4U23A 3G3FA 4ZEFA 4X1BA 3MZ1A 3IJOB 2O6AA 4YB5A 3PPNA 4Z0IA 2I49A 4EUOA 4GFRA 4ZEDA 5ICTA 3M3FA 4DZ1A 2QS2A 5ITPA 3K00A 1WODA 3W9VA 2M8CA 1OQGA 3LSXA 1M5FA 3VFJA 3PPQA 3K6WA 3OEMA 4NWCA 1OVTA 2Z8EA 1MXWA 1LCTA 3TZAA 1MM7A 2O7UA 3LUYA 3QUFA 2ONKE 2HQ0A 2DYXA 4NF8A 2DWHA 1D9YA 4F3SA 4QFOA 1NFTA 3FIRA 3FGSA 5KZTA 2DE4A 4HCWA 4PP0A 3LSWA 2CMOA 1B0LA 3IJXB 3U8QA 1B3EA 3N94A 3D4GA 3PD8A 1JVXA 4ELQA 1PDAA 3KFMA 2D21A 1M5CA 3H7MA 1MPBA 2E1SA 3O2AA 4LONB 4U22A 1MQJA 3ONMA 1LFHA 1S9TA 4TLMB 1M5DA 3G7WA 3PU5A 5I59A 3KN3A 2QJEA 1FW0A 3KOSA 2DS9A 3G3IA 1ZKBA 2PBWA 3HO7A 1POTA 4OQOA 1URGA 4YKKA 3K1MA 2OBGA 4BDLA 3CG3A 1EZOA 4GVOA 2QPQA 2DOJA 1B4HA 1XC1A 4KQPA 5ITOA 5K2YA 1FQEA 3O6IA 4EQ9A 3RT8A 3TEPA 3U1OA 1D4NA 1GVCA 1MQIA 4U1ZA 3G3HA 1FQFA 1LBBA 4H6DA 1MY4A 2OWTA 4OTEA 3K2DA 1LAXA 4MBPA 2H99A 1B58A 4JB7A 4QFPA 2XXRA 4NF4B 4F3PA 2AL4A 4AB5A 2FA7A 2UYFA 2OJTA 1B32A 3H3GA 3TUSA 3CSBA 1ANFA 3K01A 3MZBA 2ANJA 2PT2A 3G3GA 3H03A 1B5HA 4YKJA 4XTCQ 1O64A 5AA4B 1NNTA 5H8HA 1B3GA 3TTKA 3K6UA 4GWOA 3Q26A 1P99A 1ZU0A 3FXQA 1O63A 3CIJA 1N3XA 3WAFA 2VOZA 4C1UA 3M8UA 2H9BA 2RKMA 1DOTA 5IAIA 4KI0E 2ZNUA 5AA2A 2PT1A 4PFTA 2Q9TA 1YAEA 1OIBA 1HSJA 2E0SA 2V3UA 3MJNA 4MH5A 4PE5B 4H0WA 3SEYA 1ZLQA 4G68A 2RINA 1B4ZA 4HTGA 2XHDA 1A8EA 3PPPA 4U4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DQVA 3OXNA 4LATA 1MH4A 1LAFE 2PMSA 3EF7A 3OELA 5DVFA 3DM0A 2V93A 3ZSFA 4G8HA 2R8TA 5AE4A 2XX8A 3RPLA 1BTJA 1H43A 4ESXA 1BP5A 2X7QA 5IGAA 4POXA 3MC2A 4N6KA 1FTMA 3A09A 1S7YA 3KBZA 5EQAA 3T96B 2WKYA 1IZ1A 4U4XA 4OEVA 4G77A 1RYOA 3FZVA 3SETA 1VFEA 2XD2A 1EH3A 3S9EA 5H8QB 3KJTA 4GOTA 4R2BA 4PF8A 5EHSA 1LAHE 3KSJA 4EF1A 3RTFB 3C34A 1K9YA 1NMUA 4BDQA 1LBVA 1IXHA 2P1SA 3FXBA 2CEXA 2H4IA 3MPKA 5L9MA 4N07A 4I3YA 1ELJA 1NH8A 1P1UA 1F9BA 2W7YA 2OLBA 4YZZA 1QKAA 2AIXA 1RKMA 2A5SA 1JW1A 3BKIB 2VGQA 1YZ0A 1NL5A 4GRKA 1B9JA 1RDXA 4THIA 3NOHA 5DYHA 2FIXA 4OMBA 1URSA 2ABHA 4OA4A 1Y1MA 4XFEA 1A40A 1B3HA 1Q9DA 4PDDA 1FPKA 4LZ7A 1MS7A 2O1MA 3EN3A 4JWYA 4X1DA 4LN5A 4XKPA 3PMWA 1NNKA 3CHGA 3LSLA 5KCJA 1UTHA 2VD2A 3V8XB 5F7VA 4BLAA 2OWZA 1MXZA 4QSCA 4BDMA 2HXWA 2X26A 1SW1A 4O7MA 1SI0A 4IY5A 4C0RA 4PFBA 1FPEA 1B1XA 4PDHA 5BWJA 3CR9A 2NUVA 1G0HA 4Q0CA 2PVUA 5JTYA 1ZMGA 1B7HA 3FJ7A 3QXMA 1MQGA 3LUZA 1B51A 1NV3A 5FHNA 4PAKA 4FEDA 3OENA 3LC8A 2XXTA 3T1BA 2I4BA 3FVKA 5I84A 1B2HA 1LB8A 4ONYA 4MX6A 2V84A 3W9WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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