5AA4B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 145
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B02
2R9JA 2F97A 4AB5A 1IUDA 2DE3A 2DXYA 2B65A 2W7YA 3CSGA 3H6VA 2A5SA 5I2NA 1HSEA 3K1MA 5LOMA 4F29A 2ONKE 4FE8A 5I2KB 2LAOA 4F19A 2XXVA 3QAXA 3Q26A 4JBZA 3GXAA 5JTYA 5AA4B 2I3VA 1LFIA 4LZ8A 1Y3PA 5CMBA 1M5DA 3UK4A 3GBAA 1Y4CA 5AA1A 1O63A 3IOWA 4U4SA 3UA8A 4OYVA 1XVYA 2GRVA 4F39A 4RK2A 5TP9A 4KR5A 3E3KA 1SYIA 3M8UA 1A54A 3T22A 3ZKKA 1MQJA 1D9YA 3TCFA 4OENA 4OESA 1TXFA 3GBBA 1MQGA 1LCFA 4R6HA 4GFRA 3Q27A 3SEXA 4UACA 2PT1A 3G3FA 1NFTA 1LFGA 1YTVA 1ZJLA 5IKBA 3FXUA 3IR1A 1P99A 1YAEA 2Z23A 4KYDA 2NVUB 2O68A 4NF6A 3CIJA 2Z8FA 1N84A 4HTGA 3QXMA 1SYHA 1QW0A 3ILTB 2V93A 2QJEA 2HAVA 3LSXA 2G93A 1ZMGA 1B05A 1FQDA 3S9LC 4I9DA 4F22A 5DTBA 1QKAA 1ANFA 1DSNA 2ZNSA 3FATA 4DDDA 4U1OA 3CFZA 2Q88A 2E1SA 5BUUA 4DCXA 1AMFA 4POXA 2O7IA 3SEYA 1M5CA 4U4XA 2HCAA 4WEPA 4ELPA 2YLNA 2UYFA 3L6HA 4EQ7A 1B5IA 1FW0A 1NH7A 3R26A 1RYXA 3MW0A 2PYYA 1LFHA 2OK2A 1XS5A 1LBCA 3H4ZA 3IJXB 4BDMA 2F5XA 1Y1MA 2XXQA 3VE1B 3IO6A 1N7WA 2Q2CA 4IGRA 3C9HA 1BLFA 2Q89A 5H8HB 2I4CA 1UTBB 3VVDA 1USYH 1SD3A 3Q25A 5CMCA 4WKMA 2A5TB 3RT6B 1QJMA 4FAJA 5JK4A 2X7PA 2F8DA 1OQGA 1P1NA 4R6KA 4AQ4A 3ONMA 3U93A 1I6AA 5IAIA 3PUWE 2OLBA 4Q8RA 1I69A 4IO5A 3LBSA 4ND9A 2F34A 1Z7ME 3OD7A 3UN6A 4YKIA 4MH5A 2REGA 5L9SA 3B6QA 3HV1A 2GHBA 3KG2A 4IO4A 3IB2A 4KD5A 4LP2B 1M5FA 4OVJA 4EUOA 3B7DA 2ZXTA 3MWBA 4QFNA 3R6UA 2PMSA 4EF1A 2QS3A 3S4UA 2HZLA 5L9MA 2AL5A 1MXZA 3OSRA 3OO7A 5EYFA 1Y9UA 5L9OA 1SVXB 4JSOA 2NOOA 1MDQA 3UORA 3IK6B 2R71A 4Z0IA 4G8MA 5FTHA 3C36A 2ZYNA 2R6GE 1US5A 4H5FA 2NXOA 1MXWA 2Y7IA 4ELOA 1MS7A 3MVWA 3KEIA 3K6XA 4FECA 3AXFA 2UVGA 4YMBA 3MUQA 3VVFA 4YKJA 3RGYA 2OWSA 4OFOA 4KYEA 3PPRA 2XXYA 1B51A 4XKRA 4ZEIA 5I59B 1HSJA 3SKPA 1B7UA 4MBPA 4OTEA 2HQ0A 1LB8A 3L6GA 3FZVA 2O1MA 3OO6A 3C34A 3V89B 4OERA 4O3AA 5FTIA 1FTOA 4H1XA 1URSA 4QHQA 1D9VA 3S9MC 1DPEA 4NF4B 3ZS6A 4QFLA 3O6GA 4HCWA 1ATGA 4JWXA 2F35A 4ZE8A 4LZ7A 5JTYB 3BKIB 3A09A 1Q35A 3G3GA 3JZJA 1MM6A 4TOZA 3CSBA 1ZKBA 2XXIA 1POY1 4QFPA 5AA3A 4XKPA 3O9PA 1N76A 1H3DA 3QUJA 1NNTA 1USYE 1A8EA 1VFEA 2DVCA 3H6TA 4P0IA 1FQEA 3HHFA 3JYRA 4DXUA 3ECRA 1P1OA 4GXSB 5H8SA 4X9TA 4C1UA 2PT2A 4FEDA 3PPPA 3P7IA 1B5JA 2I0CA 2QRYA 3MVZA 4M1VA 1GTKA 5H8HA 5B70A 4L17A 2A5TA 2WKYA 2Y84A 3B6WA 2F7AA 3KSXA 2D21A 3SESA 3KOTA 3SETA 3LUYA 4RJZA 2UVJA 1LAFE 3C31A 4OZ9A 3RUMA 2V25A 3N6TA 4PETA 2RF1A 4GQOA 2OWTA 2ANJA 4G77A 5EHMA 2AYSA 1QKBA 3K01A 3QK6A 2UXAA 4QSDA 1MQDA 2OBGA 3K1PA 4PFUA 4OMBA 5FHNA 3O66A 2FA7A 3FV1A 2DWAA 2QMXA 5CM6A 4RPNA 1GV8A 4G8HA 3DELB 3KSJA 1SW4A 4GLIA 3FVOA 1N3XA 3KZGA 3W15C 3QYTA 3V83A 4F1YA 3K02A 4KQPA 2PX1A 3WAEA 2O51A 5I59A 2D3IA 3K2DA 3DM0A 1MH4A 5ITPA 1B3HA 1A40A 4F3GA 4Q0CA 4OWDA 1MY2A 1OLAA 3OXNA 3VVEA 4K3FA 3SDFA 1NNKA 2DVZA 4MFIA 1P1UA 4NF4A 2ABHA 4O3BA 1JEVA 3FJ7A 1B0LA 4NMYA 1ZU0A 2V84A 4YAHX 4DCYA 4KPTA 2P1SA 3MP8A 1PBPA 4YICA 1ZBMA 2UYEA 3FJGA 4ZE9A 5CMMA 4R2BA 2E0SA 4ECFA 2ZNTA 2Q8JA 1H76A 1I6QA 1MH3A 1WODA 2F6GA 2ZMBA 3I3VA 5CBRA 1PEBA 5HM4B 3OOAA 3PD9A 3EN3A 2Y7WA 2F36A 1MPCA 3KN7A 1IEJA 2RC9A 4F18A 3IO4A 4R72A 1AH5A 4OEVA 4GF8A 3TKDA 3VXBA 1DTZA 3TELA 2IEEA 3PUYE 3TTRA 4ZECA 3M3FA 2HZKA 3VLWA 4QFKA 2H9BA 3KBRA 2QS2A 3FD3A 4H67A 4NWCA 1A55A 1HSLA 4ZEFA 3CFLA 1GVCA 3O97A 1B2HA 4I62A 4GXAA 3U8QA 3G3IA 4H5GA 1Z7NE 1US4A 1YPNA 1VR5A 4H8JA 3RTWB 2DE2A 5ELVA 3H06B 2PVUA 1QUIA 4F2OA 2KLFA 3N94A 3V5AA 4PFTA 1IXHA 4ZEDA 1SW5A 5H8QB 4F1VA 4RPOA 4BDQA 4ISUA 3VV5A 4FIMA 4NF8B 1RKMA 1I6BA 4TLLB 3KOSA 3N6UA 5EHSA 4GL8A 3MAMA 1O7TA 4WEDA 2G29A 1MPDA 5ICQA 3RPWA 2DQVA 2DWHA 3VFJA 3HCQA 5H8NB 4U1ZA 4M4GA 3MBPA 2FYIA 5H8FB 1FQBA 4OHNA 3HSTA 3VLUA 4E0XA 1MQHA 1LAHE 3CFXA 5BWJA 1LGBC 1VE4A 3TQWA 2ZNUA 1JW1A 3OO8A 2H25A 2GH9A 3S9EA 3TZAA 3DP6A 4R9FA 3ZSFA 3MPLA 3TEPA 1SI0A 5B7DA 3D4GA 1R1NA 1MG1A 3RLFE 1B7ZA 1N0TA 1MRPA 1BIYA 4IY6A 1Y3NA 5CBSA 3TMGA 3MC2A 1MDP1 1B1XA 2RINA 2XXXA 1D4NA 1FTMA 3MPKA 3E4RA 1OVBA 1IXIA 1MXYA 1NL5A 1IQ7A 4RNSA 1P1WA 2XD2A 2DSFA 3PUZE 2XHDA 3MVYA 3TODA 3RY3A 4NWDA 1LB9A 1XOCA 4BDOA 1CE2A 1B32A 4EF2A 4P0GA 4GIZA 3CG1A 5KCJB 4PFYA 4YMAA 3PPQA 3IOVA 3UGWA 4F31B 5DVJA 3EHTA 1R6ZA 4Q5TA 3K6UA 1FCKA 2DYXA 1FTJA 1AL3A 1NKXA 3PPNA 5CC2A 1A8FA 4KFQA 1QULA 3DP4A 2ONRA 2VOZA 1LAGE 2VHAA 2I58A 3U72A 3BFUA 4ZZEA 1F9BA 2D5WA 3MP6A 3C35A 3LSLA 2ZYOA 3SEWA 2Y7KA 3O6IA 3T66A 1T0KA 3O28A 1OIBA 3TQLA 1EZPA 3W9WA 3MZ9A 1XC1A 2I0BA 3W9VA 1XT8A 3VXCA 5DYHA 1IZ1A 2I49A 1MM7A 1NH8A 4GD5A 3TCGA 3MQ9A 1MY4A 1UTHB 2DOJA 3D4CA 2QS4A 4DLDA 5H8QA 4G68C 3N26A 4R75A 1B1HA 3FVNA 1A99A 1SW1A 4NF8A 1MQIA 1PB7A 4OQOA 4IO6A 1RYOA 4JWOA 5KZTA 1JQFA 4O3CA 2H98A 4AB6A 5AA2B 1B5HA 2X26A 2HFBA 3OENA 2BJJX 2ONSA 1O64A 4G2ZA 5AA2D 3OMBA 5DT6A 3IL1B 1H45A 4N13A 4EDPA 1EZ9A 1R9LA 1TWYA 3IJOB 5H8NA 5HBCA 1MXUA 2H99A 1NMUA 1VSOA 4Z7EA 5H8FA 4FJPA 1VFDA 4YU0A 1S7YA 1IXCA 1MXXA 3I6VA 4RY1A 4FORA 4EXKA 5TPAA 4U22A 2V3QA 1II5A 2Z8EA 3H6WA 5FHMA 5K2YA 1PB9A 3ODBA 3SEVA 4ESXA 2CMOA 1B52A 1ELJA 3UIFA 4ZZAA 3T9XB 1SBPA 4QF9A 2O84X 3H7MA 2DWJA 1FTLA 3I5OA 4FEBA 2Q2AA 4GRKA 3H03A 1LAXA 4NF5A 4C1TA 4NE4A 3WAFA 2THIA 1OQHA 2PBWA 5CI5A 4JXIA 3IOTA 4PFWA 1DPPA 3O2AA 4DXCA 3PV0E 3H6UA 3KN3A 4XTCQ 1L5TA 2XXUA 5ISUA 3LC8A 1IXGA 2DE4A 1IITA 2QL3A 1N3WA 1SI1A 2OCUA 2NWJA 4IO2A 4MLVA 4R9GA 4OFLA 4OETA 4LQ5A 2FNCA 4HW8A 3C4MA 3BBRA 4PQJA 2DS9A 3CVGA 4XIGQ 2XX9A 1B7HA 1BTJA 5KCJA 2IA4A 2DWIA 1GGGA 2VP1A 1XVXA 1GR2A 3QIMA 2RC8A 3EQ1A 4F2QA 4G68A 4DZ1A 1FQFA 3H3GA 4JDFA 4U23A 4G8NA 1UQWA 3LSFB 1B3LA 2XD3A 1JVXA 1B46A 1OVTA 3VDFA 5F7VA 5I57A 1LLSA 3U92A 4R74A 4GWOA 4LQ2A 3IORA 1FQCA 2F7CA 1S9TA 1NNFA 4F3PA 3G3HA 2CZLA 5L8DA 4ELQA 1SW2A 2NUVA 1UTHA 3IOUA 3MVXA 4HCYA 3HN0A 4MLQA 1J1NA 4FATA 3T93B 2VD2A 5CMKA 4U2RA 3IAZA 4ZDMA 3FGSA 4I1DA 5A5XA 5AA2A 1OLCA 4RXLA 1Y4TA 2YPNA 1DTGA 1JVYA 3T96B 2XXWA 4X48A 4YZZA 1S50A 2I4BA 5ITOA 3E9XA 4U21A 3CR9A 1QVSA 1LCTA 2OJTA 3FJMA 4HS7A 1Q1KA 1B58A 1JEUA 4ELRA 5K2XA 4RK9A 5CRYA 3IB0A 3SEUA 2ESNA 4KCDA 2X7QA 2XX8A 1KWHA 4QRZA 1A7LA 2QPQA 4UA8A 2H4IA 4G4PA 3PUVE 3TCHA 3KN8A 2RC7A 2V3UA 1FTKA 4LVQA 3TTKA 4XKNA 1SDXA 1B4ZA 5I56B 3TAJA 2Z8DA 2ALUA 4GVOA 1JW5A 2M8CA 3PPOA 4F3SA 1M5EA 4H65A 5DEXA 5F1QA 1BP5A 1FQAA 3MZ1A 1H44A 2XXTA 3LSWA 3TTMA 4R6YA 1SQYA 3G3KA 4ZS9A 3G3JA 5FHOA 5I58A 3UP9A 3K4UA 1ZLQA 3FVKA 1PDAA 2O6AA 3T9VA 1EH3A 3S9NC 2UVHA 1MPBA 3PMVA 3V8XB 2OZZA 3TUSA 1TFAA 1DMBA 1UIUA 5J1DA 3K6VA 3TPAA 1PC3A 5TPAB 1PB8A 1ZIUA 4H0WA 3O29A 4PP0A 1OMPA 4RA1A 3C32A 2REJA 3QUFA 3CI8A 3DP8A 1PBQA 1N04A 3FASA 3VLVA 3FV2A 3PMXA 1JETA 4POWA 1B3GA 3A3UA 3FXQA 1QUJA 4DE8A 2RCBA 2GHAA 4NF5B 2I48A 2Y7RA 4YKPA 4QSEA 2Y7PA 1N7XA 4TQUQ 2XXPA 2B3BA 3U1OA 3EHSA 1AIVA 3KFMA 2P0SA 5I2KA 1TFDA 3OO9A 1R9QA 4BLAA 4X1DA 2HEUA 1IIWA 2F78A 2AL4A 2RKMA 5AA4A 3Q29A 1Y1ZA 3ILUB 1P1QA 3BFTA 3DLNA 3HHGA 1B0HA 3OSQA 3KJTA 3R7XA 3PUXE 3PMWA 4QFOA 5KDTB 1DOTA 3T9UA 2P2AA 4E0WA 1JNFA 2XXRA 2XX7A 3MJNA 4G68B 1CB6A 3TFLA 3MP1A 1NNPA 4YKKA 4F1UA 3A3CA 1MY0A 4KI0E 1AOVA 4GOTA 5HPQA 4EXLA 1H43A 3CRBA 5I57B 2I6EA 4JWYA 4LUBA 4R73A 4JSDA 4OFJA 2V3TA 5I56A 2O7UA 4N6PA 4IGTA 4IY5A 4PE5B 3PU5A 1M5BA 4JB7A 3RTFB 4YB5A 1QUKA 3RNNA 4MF3A 3GLBA 2Z22A 1EZOA 5I2NB 2XXHA 4LA9A 1UIVA 4X1BA 4KYSA 5AE4A 5A5XB 3OEMA 3TTNA 3G7WA 4NTLA 3F11A 4C0RA 2H5YA 3FIRA 1B3FA 4H6DA 1XHYA 2VGQA 5DVFA 3K6WA 2QMWA 1ZTYA 1B3EA 3RN8A 4ESWA 4XXUA 5TP9B 2Q9TA 1POTA 2F6PA 3K1NA 2YJPA 3KJ7A 1JW4A 4I8CA 2ZYMA 2RCAA 1URGA 3SERA 4DIGA 4QSCA 3RT8A 3QSLA 4TLMB 3HO7A 3MZBA 3K00A 3U94A 3LR1A 3TTLA 4IB2A 3M3KA 4GL0A 1UTBA 4THIA 3ZKLA 5ICTA 4KCCA 3C33A 3E13X 4ZEBA 3T9HB 4RYAA 3O6HA 4ZEKA 2HAUA 4IO3A 2QSXA 3RQTA 4BDRA 4H8IA 4KHZE 4Q30B 1MY3A 4NF6B 3M3LA 4LZ5A 1D3KA 3FVGA 1B40A 4IO7A 5DEXB 1MXVA 4LONB 3CG3A 2AIXA 2GFEA 4LATA 1YCJA 5I84A 2B3FA 2QS1A 3USDA 2ZYKA 1WDNA 4OXVA 4XKQA 5JEIA 1URDA 4BDNA 2I3WA 1LBBA 3OEKA 1Y3QA 1Y20A 3HPIA 3IB1A 5I58B 1MY1A 5DVIA 4DXBA 3K0VA 4BDLA 2UVIA 3KGCA 3Q28A 4NEDA 2O1LA 2O69A 5KDTA 4N07A 4ONYA 4YB7A 4EQ9A 3PD8A 3EPEA 1TT1A 3EHUA 3GZGA 3OELA 4WXJA 3FXRA 3TDJA 3THIA 3JV9A 5M2VA 4EQBA 3N5LA 3EF7A 2F7BA 2DP8A 2VD3A 4P11A 2DXRA 1B9JA 1WVJA 5TU0A 4R2FA 4OEUA 3S2VA 3FUZA 3B6TA 1B4HA 3IX1A 1BKAA 3PGFA 3TYHA 1EU8A 1LSTA 2HXWA 4YB6A 1B6HA 4F3BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R9JA 2P3VA 2F97A 4AB5A 1IUDA 2DE3A 2DXYA 1FBEA 4MJOA 2B65A 2W7YA 3CSGA 4PGNA 1NV5A 3H6VA 2A5SA 5I2NA 1HSEA 1G0IA 3K1MA 5LOMA 3MSTA 1KA0A 4F29A 2ONKE 4FE8A 5I2KB 2LAOA 4F19A 2XXVA 3QAXA 3Q26A 4JBZA 3GXAA 5JTYA 5AA4B 2I3VA 1LFIA 4LZ8A 1Y3PA 5CMBA 1M5DA 3UK4A 3GBAA 1Y4CA 5AA1A 1O63A 3IOWA 4U4SA 3UA8A 4OYVA 1XVYA 2GRVA 4F39A 4RK2A 5TP9A 4KR5A 3E3KA 1SYIA 3M8UA 1A54A 3T22A 3ZKKA 4NAPA 1MQJA 1D9YA 3TCFA 4OENA 4OESA 2CZIA 1TXFA 3GYYA 3GBBA 1MQGA 1LCFA 4R6HA 4GFRA 1KZ8A 3Q27A 3SEXA 4UACA 2PT1A 3G3FA 1NFTA 1LFGA 1YTVA 1ZJLA 5IKBA 3FXUA 3IR1A 1P99A 1YAEA 5EQ7A 2Z23A 4KYDA 2NVUB 2O68A 4NF6A 3CIJA 2Z8FA 1N84A 4HTGA 3QXMA 1NV3A 1SYHA 1IMDA 1QW0A 3ILTB 2V93A 2QJEA 2HAVA 3LSXA 4PAKA 5ET8A 2G93A 1ZMGA 1B05A 4I3EA 1FQDA 3S9LC 4I9DA 4F22A 5DTBA 1QKAA 1ANFA 5ESYA 1DSNA 2ZNSA 2B4MA 3FATA 1JP4A 4DDDA 3QMFA 4HE2A 4U1OA 3CFZA 2Q88A 1EYKA 2E1SA 5BUUA 4NGUA 4DCXA 4JVIA 2F3DA 1AMFA 4POXA 2O7IA 3SEYA 1M5CA 4U4XA 3IFCA 2HCAA 4WEPA 4ELPA 2YLNA 2UYFA 3L6HA 4EQ7A 1B5IA 1NV2A 2PFZA 1FW0A 1NH7A 3R26A 1RYXA 3MW0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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