5BUUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-321 at 2.07 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Synthesis and Pharmacology of Mono-, Di-, and Trialkyl-Substituted 7-Chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides Combined with X-ray Structure Analysis to Understand the Unexpected Structure-Activity Relationship at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA02
1UIVA 2XD3A 3I6VA 1GV8A 3SESA 1FCKA 2DSFA 1J1NA 5DTBA 1GR2A 3K01A 4XXUA 2A5TB 3PUXE 4C1UA 4WKMA 2H98A 4UA8A 1QUKA 3RQTA 4JDFA 4GFRA 1M5BA 4LUBA 3M3FA 3IJXB 3V8XB 2RINA 2VGQA 2OZZA 3FASA 3IB0A 4POWA 3OEMA 1DTZA 3CVGA 2Q9TA 3TAJA 1NNKA 2GFEA 4NF5A 1UQWA 4RYAA 5H8HB 3K0VA 5AA1A 1LLSA 2DWAA 1BLFA 5K2XA 1Q35A 2R6GE 1QW0A 1OQGA 2ZMBA 4YMBA 3KFMA 1ZU0A 2P1SA 1I6BA 1UIUA 3H6WA 4PETA 4YMAA 1JETA 3OEKA 1NFTA 5ITPA 4MLQA 4NWDA 4NE4A 5FHMA 3U1OA 3O9PA 3O97A 1MXZA 1DSNA 1Y20A 1PDAA 3D4CA 1FQFA 1HSLA 2XXRA 4QHQA 4ECFA 1MQGA 4IO2A 4OXVA 3A09A 4XKPA 3ONMA 1FTOA 2R9JA 4LZ8A 4AQ4A 1B4ZA 4Q8RA 3W15C 4POXA 1Q1KA 5F1QA 5H8FB 4YB7A 3R26A 3BFTA 4I8CA 1MM7A 3C4MA 2QS2A 3W9WA 2BJJX 1P1QA 1H43A 4QRZA 3G3FA 4ELPA 4ELOA 4G77A 3N6UA 1MQHA 3L6GA 2DOJA 3SEVA 3TMGA 4F22A 3JZJA 1YCJA 1USYE 2KLFA 2XXVA 1JEUA 4I1DA 3OMBA 1FTJA 3RTFB 2O7IA 2NVUB 3IOVA 3E3KA 4QSEA 1DPEA 4FE8A 5DVJA 2I6EA 4EDPA 3FJMA 2ONKE 1NNFA 3UIFA 4FAJA 3VDFA 2Q89A 4O3AA 5KDTA 1O63A 1VE4A 3TZAA 1FW0A 3O6HA 1SVXB 5A5XA 1BTJA 2ZNUA 4HCYA 1MY0A 3B6TA 3EHUA 2DP8A 2R71A 4F1VA 1AOVA 1B5IA 3JYRA 5TPAA 3LR1A 3T66A 1LB8A 2RCAA 3HPIA 4KD5A 1US5A 4DIGA 1SBPA 2GH9A 1OVTA 3EN3A 4MF3A 3FXUA 4C0RA 4NF5B 3BBRA 4YU0A 3RGYA 4F39A 3O2AA 3C31A 3R6UA 3EPEA 2XD2A 5FTHA 3DP4A 2ZYMA 2HAUA 1KWHA 2E1SA 1MRPA 3UA8A 4OVJA 3P7IA 4HCWA 3PD9A 1YPNA 3UGWA 3Q27A 2H5YA 3MZ1A 1SYIA 3TTMA 4OQOA 3PMVA 1LAHE 4BDMA 3FD3A 4P0IA 1QJMA 2X7QA 1SW4A 2ZYKA 1T0KA 5I2KA 4U22A 1LBBA 4GL8A 3KOTA 1SW2A 5L9SA 4IO5A 3K6UA 2O7UA 2B3FA 2OLBA 3PV0E 2VOZA 3ILUB 3SERA 3F11A 5L9MA 3FVGA 3C9HA 1B2HA 2HXWA 5K2YA 2QJEA 5CMCA 3CIJA 3OOAA 1WDNA 3K6XA 5CM6A 2I4BA 2THIA 3ZS6A 1JW5A 3JV9A 1MY4A 2PX1A 4QFOA 4GQOA 1N0TA 4F1YA 1O7TA 5H8SA 2PT2A 1Y4CA 3MW0A 3RT6B 5KCJA 3EF7A 3HV1A 2O51A 1B3FA 4QFKA 1DMBA 2I58A 5KDTB 4MLVA 5J1DA 5DEXA 3VVFA 5A5XB 3MP8A 2IA4A 3ECRA 3SDFA 1EZOA 4WEPA 1NL5A 2AYSA 1XOCA 4KPTA 5DVFA 1NH8A 2Z8FA 2HQ0A 1VSOA 3CFLA 2REJA 5TPAB 1Y9UA 5DYHA 2I4CA 3FXRA 1Z7ME 4ZE8A 3PPOA 2I0CA 4OFOA 1MY2A 3ZSFA 1USYH 3GXAA 5JTYA 1OMPA 3G3KA 2NWJA 2QMXA 3VV5A 4FORA 4FECA 1H44A 2XXTA 1PEBA 4L17A 3QYTA 4PFWA 2RC8A 3PPRA 4RXLA 2HEUA 4H8JA 3OO7A 4QSDA 2D3IA 1D3KA 3IJOB 1IXGA 4N13A 3RT8A 4KYSA 1SW5A 2OK2A 4TLLB 3CR9A 3TELA 4BDLA 4P11A 4IGRA 4R73A 3O6IA 4DXBA 4R6HA 3Q28A 5B70A 1JNFA 3CRBA 5I2KB 4F1UA 4JSOA 2I49A 1LCTA 2V25A 4RPOA 3QUFA 1R1NA 2V3TA 1XHYA 1O64A 5I2NB 3MZ9A 3GLBA 2CMOA 4UACA 4H1XA 3N6TA 4ISUA 5FHOA 5I58A 1P1UA 2UYFA 3V5AA 1WODA 4PP0A 4LA9A 4XKRA 2G93A 3SETA 3K1PA 2P0SA 3G3JA 4G68C 4U21A 1MXXA 3C35A 2XX8A 2O84X 4NTLA 3S9EA 3FVNA 1SD3A 4R9GA 1MY3A 5KCJB 3PUYE 3FV1A 5L8DA 2V93A 4DE8A 2E0SA 4GOTA 1OVBA 5M2VA 4RA1A 4YKIA 3N94A 3IO4A 5AA2A 5DEXB 3LBSA 3T9HB 4LATA 1TFDA 1A99A 1LAGE 4OESA 2F35A 4ZS9A 1IITA 1M5EA 3B6WA 1MXVA 4GIZA 1OQHA 1VFEA 1LAXA 4Q30B 4R9FA 1EU8A 4XKNA 1PB7A 2DS9A 4DCYA 1NNPA 1S50A 2CZLA 4LONB 1I6AA 3K2DA 2LAOA 3L6HA 3LSLA 2DE4A 2HAVA 3OENA 5JTYB 3N5LA 4H5GA 5ISUA 1US4A 4ZEFA 1B4HA 4ESXA 1FQBA 5H8NA 4NWCA 3MQ9A 2O69A 1CE2A 1BKAA 1IEJA 2B65A 3H6TA 3MPLA 2QS3A 2ZXTA 1FQEA 4OFLA 1UTBA 1B6HA 3VVDA 3V89B 4I62A 2OBGA 3D4GA 3K00A 4ONYA 1B40A 2QMWA 3KJTA 4JSDA 3IB1A 3OO9A 4ZEDA 4U2RA 4ESWA 3MVXA 3VE1B 1URGA 3TFLA 1AMFA 1QKAA 1S9TA 3THIA 4BLAA 2XXYA 4FEDA 3TEPA 2B3BA 3GBAA 4IO7A 2AIXA 3Q25A 4OTEA 1ANFA 1IZ1A 1FTLA 3H6VA 3TQLA 3PD8A 2RC9A 5DVIA 5I57A 1QUIA 3IOWA 5I58B 4LP2B 1IQ7A 3S9MC 3K1MA 4F19A 4F2QA 4K3FA 3T9UA 4OETA 5EYFA 5FHNA 1ATGA 3MUQA 4PFYA 3VLVA 1M5CA 1Y3PA 5TP9A 1ELJA 1NKXA 1TXFA 1GTKA 5AA2B 4WEDA 4EQ9A 1B0LA 2YPNA 1MPBA 4IGTA 3CI8A 1BP5A 4G2ZA 5CBRA 4HTGA 4TOZA 4OYVA 3MVWA 2XXPA 4GF8A 3U8QA 3RLFE 3O66A 1PC3A 4ND9A 2ZNSA 1FQDA 5CI5A 4DCXA 3T96B 4NMYA 3R7XA 3MAMA 5H8NB 3CG3A 1N3XA 1MG1A 4G4PA 1QULA 2ONRA 5AA2D 2UYEA 1SDXA 4PFUA 3I3VA 5CMBA 2HCAA 1H3DA 1MY1A 1PBPA 1LCFA 1OLCA 4LQ5A 1Y1MA 4O3CA 1UTBB 1YAEA 5DT6A 3KN8A 3B7DA 1NMUA 4PQJA 3LUYA 1N3WA 3V83A 3FXQA 3W9VA 1MH4A 1AL3A 4X9TA 1B46A 3T22A 4RNSA 3FV2A 4ZEKA 2DQVA 2PVUA 4HS7A 3IOUA 2Y7IA 3USDA 3N26A 4ZEBA 2ESNA 4BDNA 2DWJA 5TU0A 3SEWA 2Y84A 3SEYA 2IEEA 4G8NA 3ZKKA 5I57B 5EHMA 4EXKA 2PT1A 2ZYNA 2OWTA 3E9XA 3LSXA 1LAFE 5I2NA 5LOMA 2ONSA 4QSCA 5BWJA 3MVZA 4IY6A 3DLNA 5CBSA 3U94A 3FGSA 3UP9A 1TT1A 2XX7A 4EF2A 3A3CA 5JEIA 1N04A 4OEUA 3LSFB 3PPPA 4IO4A 5EHSA 5CRYA 4IO6A 2F97A 5TP9B 2F6PA 2ANJA 3KBRA 3K6WA 3A3UA 3M3KA 2FNCA 1LFIA 2DVZA 3GBBA 1POY1 2G29A 3WAFA 1AH5A 1ZLQA 2RKMA 3TCFA 2DWIA 4XTCQ 5BUUA 3MJNA 1A54A 2ZNTA 3QK6A 3KEIA 1Y1ZA 2OJTA 3E13X 1VFDA 3IAZA 3K1NA 3KJ7A 1B51A 2FYIA 4KYEA 1B3EA 1LFGA 3KN7A 4Q5TA 4OERA 3IL1B 3MZBA 3CFZA 2UVHA 2Y7WA 3G3IA 4YZZA 2F78A 4E0WA 3PMXA 4I9DA 1B7UA 1ZBMA 1JVXA 4F18A 1TWYA 2RC7A 4GWOA 3OO6A 4KR5A 5HM4B 3TKDA 1ZMGA 1JEVA 3FJGA 3C36A 4OZ9A 4F2OA 1Y4TA 4N6PA 3K6VA 3O6GA 3SEXA 2AL5A 1RYXA 4F31B 3IB2A 3MWBA 2ALUA 2O6AA 4U1ZA 4FIMA 1EZ9A 1MPCA 4TLMB 2Q2CA 4MFIA 2F8DA 2Q8JA 1MS7A 1QUJA 3U92A 5CMMA 4XKQA 1I6QA 3VVEA 4IB2A 4OFJA 2VD3A 3T9VA 1VR5A 4BDQA 3PUZE 4YKKA 1JVYA 4IO3A 2RF1A 4KQPA 1URSA 2O68A 4P0GA 2F36A 4X48A 1A55A 5KZTA 4KFQA 2QL3A 1P99A 4MBPA 1SI1A 3OO8A 3H6UA 2V84A 1B1XA 1S7YA 4OENA 1UTHA 4GXSB 2F5XA 3RN8A 1IXIA 2GRVA 3T93B 4F3PA 4G68A 1IIWA 4DXCA 3VXBA 3IX1A 1D4NA 4JBZA 2O1MA 4M1VA 5F7VA 2HZLA 3ILTB 2Z23A 2DE2A 1EH3A 2XX9A 3MPKA 1BIYA 4O3BA 3OSRA 4GL0A 3IORA 1H45A 2VD2A 3FVOA 4KI0E 4DXUA 4GXAA 3CSGA 1MM6A 3IK6B 4U4XA 1MDP1 3C34A 2I0BA 2X7PA 2QRYA 4FJPA 1FTMA 4NEDA 3M3LA 3ZKLA 2XHDA 4RK2A 3IO6A 3E4RA 3DELB 2VP1A 1MQJA 5IAIA 1XC1A 3H3GA 4JB7A 4ELRA 3S9NC 1MPDA 4NF4A 1R9QA 2UVJA 1ZTYA 4EQBA 3SKPA 2O1LA 1FQCA 3UORA 1L5TA 4WXJA 2P2AA 2XXQA 4DLDA 2H25A 3KG2A 4FATA 1ZIUA 3OD7A 4EUOA 1SI0A 4ZZAA 3PPQA 1TFAA 1N84A 3FZVA 1MH3A 2Z8DA 2F6GA 1GVCA 1H76A 5I84A 3RPWA 3HCQA 3QAXA 4QF9A 2Z22A 4OHNA 1B32A 4NF8A 5I59A 1B3HA 3S4UA 1RYOA 3IR1A 5IKBA 4HW8A 3O28A 2NUVA 3FIRA 1XVYA 2F7BA 1NNTA 3G3GA 5AE4A 2D5WA 1CB6A 4G8MA 4ELQA 1URDA 2NXOA 1B7HA 2OWSA 1JW4A 1B58A 3OELA 4ZE9A 4Z7EA 3GZGA 4PE5B 4R74A 1B0HA 5ICQA 3PMWA 3FVKA 1UTHB 1R9LA 1A40A 3DP6A 4LVQA 1N7WA 4IY5A 4G68B 4BDOA 3TTKA 4JWOA 3C32A 3SEUA 4RPNA 4TQUQ 4QFPA 1OIBA 4ZZEA 3TUSA 1XT8A 5AA3A 4H0WA 4M4GA 1B05A 3TTNA 4JWXA 3ODBA 5ELVA 4X1DA 2I48A 3BKIB 2ZYOA 4OWDA 3AXFA 2DXRA 4RJZA 2FA7A 5I56A 3WAEA 1MXUA 4YAHX 1ZJLA 3TODA 1B5HA 2QS1A 3VFJA 3Q29A 2OCUA 3PPNA 3UN6A 1GGGA 1Z7NE 3DP8A 2QSXA 4AB6A 2Q88A 3OSQA 3MBPA 3PUVE 2XXIA 1ZKBA 3PUWE 2YJPA 4NF4B 4LQ2A 2DYXA 1B3GA 1SQYA 2YLNA 3RUMA 2F7CA 5HPQA 2F7AA 3TDJA 3K4UA 1LB9A 3T9XB 2H99A 2DVCA 2XXHA 5H8QA 4Z0IA 4F3SA 1M5DA 1MQDA 4QFNA 1PBQA 4JXIA 4H6DA 4JWYA 3G3HA 4ZDMA 3VXCA 4KYDA 2H9BA 3U93A 3IOTA 3TCHA 4NF8B 5I59B 3O29A 3KSXA 1FTKA 1HSEA 3H4ZA 4YB5A 3UK4A 3HN0A 3TTLA 1WVJA 1YTVA 3MVYA 2QS4A 3HO7A 3KN3A 3RY3A 1N7XA 1HSJA 4F3BA 1R6ZA 4C1TA 1B9JA 1DPPA 4E0XA 4H5FA 2XXXA 2UVIA 1LGBC 1A7LA 2GHBA 4KCCA 2UXAA 2PYYA 2GHAA 2V3UA 1OLAA 1B7ZA 3H7MA 3C33A 3HHFA 2M8CA 1JW1A 4R2BA 2NOOA 1SYHA 3QUJA 4R6YA 2A5SA 4XIGQ 3H06B 3KGCA 1Y3QA 4OEVA 1IXHA 4NF6A 3HHGA 3TYHA 2HZKA 1DTGA 4PFTA 1AIVA 3EHSA 4BDRA 3HSTA 3QXMA 5I56B 3VLWA 3B6QA 2Y7KA 4RY1A 4U23A 4QFLA 1I69A 2UVGA 2HFBA 5CMKA 4YB6A 3LSWA 3DM0A 1N76A 4AB5A 3QSLA 5AA4A 2PBWA 3G7WA 1P1NA 2I3WA 2D21A 3CFXA 2ABHA 4THIA 1PB9A 5ITOA 5JK4A 3OXNA 3TPAA 2DXYA 1MDQA 1LSTA 3TCGA 2XXWA 2V3QA 4H67A 1F9BA 4N07A 5H8QB 1Y3NA 2AL4A 4YKJA 3CSBA 2RCBA 2Q2AA 3FATA 3KZGA 1A8FA 1MXYA 4H65A 3EQ1A 1IUDA 2A5TA 2I3VA 1XVXA 3PGFA 1LBCA 3MC2A 3CG1A 4LZ5A 1IXCA 1B5JA 1XS5A 1B1HA 3K02A 3FUZA 5CC2A 3FJ7A 1QVSA 4KHZE 4R6KA 3Q26A 1A8EA 4YICA 1EZPA 3M8UA 5L9OA 1II5A 4FEBA 4R2FA 2VHAA 1P1WA 4MH5A 3S2VA 5FTIA 1DOTA 5B7DA 3BFUA 4H8IA 5H8HA 3H03A 3TQWA 4GRKA 5ICTA 4EF1A 4R72A 1POTA 4EXLA 1PB8A 2W7YA 3LC8A 1MXWA 1SW1A 4GLIA 4U1OA 2Z8EA 4R75A 3KSJA 3KOSA 2XXUA 4G8HA 1D9YA 1M5FA 3S9LC 2Y7PA 2QPQA 4NF6B 4LZ7A 4X1BA 3MP6A 1JQFA 4DZ1A 2DWHA 4ZEIA 2DE3A 1P1OA 5HBCA 4GD5A 1QKBA 3MP1A 1NH7A 5H8FA 3I5OA 3VLUA 4OMBA 3RTWB 2F34A 2PMSA 4RK9A 1RKMA 4F3GA 3QIMA 1FQAA 5AA4B 4U4SA 3PU5A 1D9VA 2H4IA 4GVOA 3TTRA 4ZECA 2WKYA 1LFHA 1B3LA 4Q0CA 1MQIA 2X26A 3RNNA 4YKPA 4DDDA 3EHTA 1B52A 2REGA 4KCDA 4EQ7A 3U72A 4F29A 2Y7RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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