5CBRA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA02
3LSLA 2ANJA 4G2ZA 4PQJA 3VXCA 1NNKA 5J1DA 1P1OA 5L9SA 4H5GA 3MP1A 3F11A 2XD2A 4EDPA 3SERA 2XXYA 5I56B 2DVZA 3UGWA 1O64A 3IK6B 3USDA 4ZZAA 2X7QA 2A5TB 1SQYA 3K01A 2ESNA 4RYAA 5AA3A 1Y3PA 4KCCA 5L8DA 4O3AA 4H65A 4XKRA 4MH5A 4UACA 3CG3A 3E4RA 1XT8A 1QW0A 2B65A 3ODBA 4JWYA 3RY3A 4H5FA 5CMBA 2HAUA 3IORA 4JDFA 4U21A 4XKNA 1PB8A 3CFXA 3H6UA 3U94A 1FTLA 5H8HA 3V89B 2XXRA 4DXUA 1LAHE 3K6XA 3T9VA 3Q25A 5CI5A 1GV8A 2ALUA 1MG1A 3MUQA 5KZTA 3CR9A 4EF1A 2ZYOA 2M8CA 3IX1A 1UTHB 3SETA 2ZNSA 3OMBA 5H8NB 4R72A 3VDFA 4U2RA 2PVUA 2F8DA 4OEUA 1A7LA 4HCWA 3O6HA 4DIGA 3FJMA 4NF6B 1MM6A 4X1DA 3KJTA 3PD9A 1UTBB 1FQEA 1FQAA 2I4CA 3TTMA 5H8FA 2PT2A 3C35A 2O51A 1SW4A 5H8SA 4QRZA 4NTLA 2ZYNA 3IB1A 1N84A 5K2YA 2ZYKA 2ONKE 1B52A 4POXA 3K6VA 3KOSA 2A5SA 3Q28A 5I59A 3VVDA 3SEWA 2UVIA 4JSDA 5TP9B 2UXAA 5AA2B 2Z8EA 4H8JA 3TUSA 5DVIA 1S9TA 1R9LA 2FNCA 2RINA 3TTLA 4BDRA 4R9FA 1Y20A 1VFEA 3FV2A 3OSRA 2PBWA 3PUZE 3PPPA 3K1MA 4WEDA 1A8EA 2O68A 3DP6A 1B3GA 3IJOB 1UIVA 4EF2A 1B9JA 2DWJA 3G3HA 4ISUA 2F34A 1ZJLA 4HTGA 3RTWB 4JWXA 3ECRA 5A5XA 1ZTYA 4I9DA 3CVGA 1LAFE 3FIRA 3JV9A 1SW2A 3KZGA 3PGFA 3VVEA 1ZU0A 3MVYA 1XVYA 3PUWE 1HSJA 4OESA 3U92A 4N07A 4M1VA 1QKAA 3HV1A 1MXXA 2X26A 4NF5A 2VD2A 3L6GA 3TFLA 3V5AA 5I2KB 2OJTA 4GXSB 4XIGQ 4TLLB 2O7UA 3JZJA 1MH3A 1VSOA 1XOCA 4QSEA 4NWCA 4E0WA 1PC3A 4R75A 3E9XA 1NFTA 4R6HA 2HXWA 3R7XA 2V93A 4GL8A 3QSLA 4AB6A 4LQ5A 1MXWA 3VVFA 4DZ1A 1XHYA 1FQBA 5DVFA 3H06B 2UVGA 4ZEBA 3A09A 1Y9UA 4FEDA 2IA4A 4KHZE 4RK9A 1OMPA 1B1XA 1ZLQA 4I8CA 1DOTA 4F29A 4MLVA 3OO8A 2V3QA 2VD3A 4IO4A 2B3BA 2Q2AA 3O6IA 5CRYA 2I6EA 1IXIA 4FIMA 1BTJA 4WXJA 3KN3A 1URGA 4H1XA 4P11A 4PFYA 3C31A 3K1PA 4IO6A 1D9VA 3Q27A 3MVWA 4FEBA 5TPAB 4THIA 4R2FA 3TEPA 1EZPA 3D4GA 1AMFA 1LCTA 1QUJA 1UQWA 3FZVA 1RKMA 1MY2A 4OXVA 1MXYA 1I6BA 3QK6A 2DYXA 1OLCA 2O1MA 3S9MC 4AQ4A 4JWOA 3KN8A 4C0RA 5JK4A 4RPOA 4GOTA 4O3BA 3RQTA 4XTCQ 5H8QA 3EHTA 5F1QA 4OEVA 3UORA 3DP4A 5DEXB 1Q1KA 4PETA 1GTKA 2Y7PA 3EPEA 1SBPA 5FHOA 1MM7A 1A8FA 3PU5A 1O7TA 4IO7A 2VP1A 4ZE9A 2Y7WA 3K1NA 3V8XB 3O9PA 4KI0E 4LQ2A 1TFDA 4WEPA 3MC2A 5HPQA 1LBBA 3B6WA 4ESWA 4F1UA 4DE8A 3WAFA 4ZS9A 4G8HA 1MPBA 4X9TA 1NH7A 1PDAA 3B6TA 3V83A 5B70A 1H76A 3ZS6A 1IEJA 3QXMA 4NF8B 2ZXTA 3BFUA 1MXVA 4GXAA 4XKPA 4UA8A 2E1SA 4FJPA 1QUKA 4OFLA 2XXWA 2ZMBA 2OK2A 3ILUB 3CSBA 1NNPA 1RYOA 2I58A 3PPRA 5JTYA 3O2AA 4LZ7A 3KEIA 3P7IA 1LFGA 1ATGA 1N0TA 3PV0E 1Y4CA 3I3VA 1D4NA 4X1BA 1H3DA 2OBGA 3VLUA 1P99A 1H44A 1QVSA 1RYXA 3E13X 2F5XA 2UYEA 1XC1A 2Q88A 2H99A 3RPWA 4F1YA 4QFLA 4DLDA 3CFLA 5KDTA 1MPDA 4X48A 1US4A 3DLNA 3SESA 2DE4A 1URSA 4R6KA 1MXZA 3K0VA 4G68A 4QSDA 4YICA 1MY4A 3EHSA 1JW1A 2Z8DA 1USYE 4G8NA 2HEUA 5ELVA 4BDQA 1TWYA 4ONYA 5KCJA 3MAMA 4LZ5A 4PFUA 3M3FA 1SW1A 4NF4A 2QS3A 3QAXA 3OSQA 3QUJA 2I0CA 3SKPA 1Y4TA 4YKPA 3IB2A 4IGTA 3GBAA 2I0BA 5I2NA 3MP6A 4KQPA 4KYEA 3U8QA 2AL4A 1B7ZA 2HAVA 4TQUQ 1SW5A 5IKBA 2AL5A 5CM6A 1B32A 1US5A 1I6QA 2F7CA 3FD3A 5CBSA 3RTFB 3KSXA 2DWIA 1P1NA 3OENA 3PPNA 1GVCA 4YMBA 1B7UA 3HN0A 1FTMA 4P0GA 4LZ8A 4TLMB 3RT8A 5H8FB 1JETA 1MY1A 4IO3A 1DMBA 2PX1A 4RXLA 5ICTA 4H0WA 1M5BA 2H25A 5AE4A 3K02A 4ELRA 1L5TA 3S9NC 3RT6B 4Q5TA 3LSXA 1JQFA 4P0IA 1PBQA 1A40A 4F31B 3QIMA 2QSXA 3WAEA 5I59B 3O6GA 1PEBA 1IITA 2NWJA 1MPCA 3M3KA 1JEUA 4RY1A 4IY5A 4G8MA 1LSTA 2I3VA 1Y3NA 1OVBA 3TODA 4ND9A 1MXUA 1TXFA 3MP8A 1TT1A 3UA8A 1A99A 3N94A 2OWTA 2WKYA 3R26A 3GZGA 2F6GA 3N6UA 2OCUA 1FQFA 4EXKA 3HHGA 1HSEA 4KYSA 3FVOA 4K3FA 3ZKLA 1B5HA 1ELJA 4MFIA 5AA4A 4JB7A 1M5FA 1CB6A 4LVQA 3BKIB 5A5XB 1H45A 4NEDA 5AA2A 1N76A 2D5WA 4LATA 1MS7A 5AA2D 3LSWA 4NF5B 4KD5A 2Y7IA 1NMUA 3IB0A 5CMCA 3M8UA 4QFNA 1DTGA 1B05A 4GWOA 1MQJA 2F78A 4JBZA 2DOJA 1DSNA 3C36A 2XX8A 1SYIA 5ITOA 3TMGA 3Q29A 4ZEFA 5CC2A 4MF3A 3H4ZA 1M5EA 3C32A 2XXPA 1IXCA 3OXNA 1OLAA 1B1HA 1JW4A 1PB7A 2V3TA 4XKQA 3OOAA 1OIBA 1GGGA 1AIVA 3CI8A 4N13A 2Y7RA 3H6WA 1N7WA 3CG1A 5BWJA 4RPNA 3TCGA 2GHBA 2F36A 4ZEKA 2HQ0A 1D3KA 3D4CA 2I4BA 5EHSA 4OERA 1NH8A 4YMAA 1JW5A 3DELB 3MVXA 2GHAA 3IOWA 3OEMA 3CFZA 4I1DA 5LOMA 3KBRA 3B6QA 2X7PA 2XXIA 4F39A 3H6TA 2G93A 2DS9A 1N7XA 1IIWA 1OQHA 4OFOA 4Q30B 1YCJA 3GBBA 3TCHA 1XVXA 3RUMA 3K4UA 2VGQA 4OENA 2CMOA 3TAJA 1YPNA 1UIUA 3VXBA 4QFOA 1SVXB 1B58A 5I57A 2RC8A 5AA1A 2QMWA 5CMMA 2D21A 4GL0A 1OQGA 1XS5A 1B3FA 4KYDA 4Z0IA 4Q0CA 4U1OA 4KFQA 3HPIA 2O84X 5L9MA 4YKJA 3T9XB 5H8QB 1FTKA 4I62A 4G68C 2H9BA 5FHNA 4PFWA 2DWHA 5TU0A 1ANFA 2XXTA 4TOZA 4ZZEA 4F19A 3HSTA 4NWDA 5DT6A 2ONSA 4U22A 1NKXA 4BDLA 1B7HA 1SI0A 2H98A 5I58B 5FHMA 4U4XA 1LFHA 1A54A 1WODA 4GVOA 1POTA 1LFIA 4ELPA 1JEVA 3U72A 3UIFA 1CE2A 3IAZA 5F7VA 1T0KA 2YPNA 3K6UA 5DTBA 1WVJA 4HS7A 1DTZA 1LLSA 1QUIA 4POWA 3FUZA 3FVNA 4JSOA 1AL3A 2ZYMA 3S4UA 4QF9A 2NOOA 3H03A 4OHNA 4G4PA 4H8IA 3C4MA 2F35A 3KJ7A 4F3GA 4C1UA 2GRVA 3EQ1A 2CZLA 2HZLA 3N26A 3PPOA 2RC9A 1QKBA 3LR1A 4PFTA 1NNFA 4BLAA 1IUDA 3MWBA 1IXGA 1FQCA 1M5DA 3TKDA 1R6ZA 2O1LA 3G3IA 4ELOA 3O28A 3ILTB 4EUOA 3R6UA 2XXHA 1Q35A 3KG2A 3K6WA 5JTYB 4IB2A 2PMSA 1EZOA 3DP8A 3S9EA 2QS1A 1H43A 4NE4A 1WDNA 2KLFA 5IAIA 1VFDA 1D9YA 4Z7EA 3G3KA 3EF7A 1MQHA 2XX7A 1Y3QA 1SD3A 1I6AA 3TDJA 5KDTB 2NVUB 3T93B 1FTJA 4XXUA 2DVCA 4ESXA 3BFTA 1SI1A 4ZE8A 5EHMA 1EH3A 1NL5A 2ZNTA 4G68B 4YAHX 1B46A 2XXXA 4MBPA 3PUYE 3I6VA 3C9HA 3W9WA 4OWDA 2HFBA 4EXLA 3H3GA 1B5JA 5KCJB 3EN3A 4R74A 4F2QA 1ZIUA 1B0LA 3GLBA 3IOTA 4RNSA 3S2VA 2XXQA 4NF4B 1B3LA 2FA7A 2O7IA 2RCAA 1PBPA 3TPAA 4R2BA 3N6TA 5K2XA 4YB6A 4U23A 5EYFA 3MZBA 2VHAA 2D3IA 2IEEA 2HZKA 4DDDA 5I2NB 3G3GA 3SDFA 2G29A 3MVZA 5DVJA 1MDP1 2QPQA 5H8HB 4OMBA 1LBCA 3LC8A 1JNFA 5M2VA 3GXAA 1MQIA 1EZ9A 4ZEDA 5I56A 4F18A 3PUXE 4FAJA 2XX9A 2XD3A 3LSFB 1POY1 2DSFA 1AOVA 1P1UA 2A5TA 1N04A 4KPTA 3IOVA 3TTRA 4ZDMA 4QFPA 1AH5A 2Y7KA 2YLNA 2O69A 1MQDA 2H4IA 3TYHA 3FXQA 4QSCA 1QULA 4EQ7A 3OD7A 1N3WA 1DPPA 3T66A 5B7DA 4GF8A 3FV1A 2NXOA 3UP9A 3LBSA 1EU8A 3KOTA 2ONRA 3FXUA 5HM4B 3MPKA 3FASA 2Z23A 2P2AA 3AXFA 3TZAA 1S50A 3IJXB 3MPLA 3T9HB 4AB5A 3N5LA 2XXUA 3ONMA 3IR1A 3M3LA 2QL3A 3TTNA 1URDA 2H5YA 1B4HA 1QJMA 2NUVA 1A55A 3ZKKA 4YKKA 1UTHA 3G7WA 3HHFA 4OQOA 1B6HA 4OZ9A 2XHDA 5H8NA 3FJGA 4DXBA 4LONB 2DE3A 3MQ9A 1P1WA 3TQLA 1Y1ZA 2V3UA 3MZ1A 1LB9A 4NF6A 2QJEA 3H6VA 3CSGA 1DPEA 1USYH 4LP2B 1HSLA 5L9OA 2P0SA 2XXVA 5JEIA 1UTBA 2LAOA 2I49A 3W15C 3MW0A 2Q9TA 4GQOA 1FW0A 1LCFA 3IO4A 2O6AA 3PMWA 3RNNA 5CBRA 5AA4B 5ISUA 1ZMGA 2GH9A 1FCKA 1B5IA 1FTOA 2R71A 3BBRA 3L6HA 3HO7A 1ZKBA 2DE2A 3QUFA 3UK4A 1LB8A 4DCYA 5ITPA 2OZZA 3IL1B 3FXRA 4L17A 2PT1A 3OELA 3K2DA 4EQBA 3UN6A 3JYRA 4NMYA 3TELA 2F97A 5HBCA 1YTVA 2FYIA 1PB9A 4IO5A 5BUUA 3FVGA 3A3CA 5TP9A 2ABHA 1SDXA 3SEYA 2B3FA 4YB5A 4KCDA 1Y1MA 2Q2CA 2V84A 4RA1A 3TQWA 2R9JA 2P1SA 3O97A 4H6DA 3MZ9A 4GD5A 3IOUA 2W7YA 4ZEIA 3RN8A 1IQ7A 2E0SA 3QYTA 3VFJA 4GRKA 1LAXA 2RC7A 5CMKA 4R6YA 1B3HA 1OVTA 1Z7NE 4YU0A 2UYFA 4F3BA 2QS2A 2R6GE 4GIZA 2DXYA 1I69A 4GFRA 4YKIA 4FATA 3VLWA 3T22A 4BDNA 4DCXA 3OO6A 2ZNUA 4OYVA 3T9UA 1Z7ME 3DM0A 4RJZA 3E3KA 3PPQA 2QRYA 5I2KA 4OETA 3O66A 1BP5A 1MY3A 4GLIA 3CRBA 1BLFA 1B4ZA 4EQ9A 2V25A 1R9QA 4MLQA 3CIJA 2I3WA 4F3SA 2F7BA 2Q89A 4BDMA 4N6PA 4IY6A 5I57B 4Q8RA 4U1ZA 1MH4A 1MDQA 2DP8A 4BDOA 4PP0A 2Z8FA 4OVJA 5I84A 4F2OA 3EHUA 3G3JA 3PD8A 1P1QA 4O3CA 4OTEA 1JVYA 2OWSA 1LGBC 1O63A 3HCQA 4ZECA 1M5CA 3OEKA 3OO7A 1F9BA 2QMXA 2DWAA 3C33A 2DXRA 2RCBA 3K00A 2GFEA 4F3PA 4FE8A 1BKAA 3ZSFA 1BIYA 3RLFE 5TPAA 1B2HA 4IGRA 1GR2A 2UVHA 5FTIA 4LUBA 2I48A 3TTKA 5FTHA 3SEUA 3KSJA 2REGA 2DQVA 2AYSA 1B0HA 4R73A 4OFJA 3Q26A 4WKMA 1IZ1A 3FJ7A 4YZZA 2AIXA 3U93A 4KR5A 3MJNA 3TCFA 3T96B 2Z22A 1LAGE 1S7YA 3OO9A 2REJA 2RKMA 3W9VA 4ECFA 3FATA 4LA9A 3I5OA 1SYHA 5I58A 5DEXA 3KFMA 3VV5A 3FVKA 3SEXA 2Q8JA 4C1TA 3KN7A 1II5A 1FQDA 4QHQA 1ZBMA 4DXCA 3PMXA 2THIA 1B51A 3U1OA 1YAEA 1IXHA 4QFKA 4U4SA 2HCAA 4FORA 3IO6A 4IO2A 4G77A 4ELQA 4HW8A 4PE5B 3SEVA 5ICQA 4HCYA 1JVXA 1MY0A 1J1NA 1MRPA 3PUVE 2PYYA 1TFAA 3VE1B 4H67A 3VLVA 3THIA 3MBPA 4E0XA 2F7AA 2QS4A 3C34A 4RK2A 1MQGA 2Y84A 2BJJX 2UVJA 3G3FA 3RGYA 1B3EA 3S9LC 2F6PA 2YJPA 4FECA 1VR5A 4NF8A 1R1NA 2VOZA 4JXIA 3H7MA 2RF1A 4F1VA 3O29A 1KWHA 3B7DA 3A3UA 4M4GA 4YB7A 4F22A 5DYHA 1N3XA 3FGSA 1NNTA 1VE4A 3LUYA 4R9GA 1B40A 2OLBA 3KGCA 3PMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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