5CBSA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (r)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8a resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA02
1OVBA 4KQPA 4THIA 5CMBA 3TPAA 1B7HA 3OO9A 4RYAA 3TMGA 1NNFA 3PUXE 3TTRA 4H67A 4XKQA 2Y84A 3M3KA 1AL3A 3WAFA 2O69A 4NWDA 3B6TA 1EZPA 2O7IA 1AMFA 3O29A 5CBSA 5K2XA 4LVQA 1BTJA 3KJ7A 1M5BA 3PPPA 4NF5A 2F5XA 3CFXA 5KCJB 5DTBA 1GTKA 5FHOA 2RCBA 4BDQA 4F29A 2QPQA 2HFBA 3FV1A 3UK4A 2GHBA 1O64A 4QFPA 1B7UA 1XHYA 4RPNA 3IJOB 5ITOA 3UORA 3H03A 2DS9A 2DWIA 2D21A 3CSBA 1GV8A 3MP1A 3CFZA 4IB2A 2VHAA 1CB6A 3KOTA 3T96B 3IOUA 1ZBMA 1QUKA 3FXRA 3TZAA 5ELVA 3Q26A 3S9MC 3GXAA 1FQEA 1B52A 1ZU0A 3GBAA 4GWOA 3HO7A 5TPAA 1N7WA 3V5AA 1R9LA 2NUVA 2DE2A 2YLNA 1DOTA 5DYHA 3K6WA 3LSLA 2FA7A 3N26A 4P0IA 3TTNA 2DXYA 2O7UA 3N6TA 4BLAA 3S9NC 1JW1A 3G3KA 4GOTA 5I2KA 3IL1B 4F19A 3RQTA 2AYSA 1DSNA 2F34A 4M4GA 3SEYA 4C0RA 1TT1A 2OCUA 5I2NA 4ZE9A 5AA2A 4OESA 3CSGA 1UTHA 4OEVA 2YJPA 1EU8A 1IZ1A 3TDJA 1B05A 1IEJA 3V89B 1ELJA 2B65A 3CFLA 4X48A 4YKIA 3VVFA 4H65A 2LAOA 2VOZA 2ANJA 2QSXA 5CMCA 3C34A 5H8NA 1ZMGA 2M8CA 3G7WA 1B0HA 1USYH 2HZLA 2VP1A 2XXPA 3EHSA 2F78A 5H8HB 4FEDA 3O6GA 2QJEA 3ILUB 1UIVA 5DVIA 2XXUA 4ZEDA 3MZ1A 3PU5A 1Y3PA 3S9LC 1LBBA 3K1MA 3W15C 3MVZA 4GXSB 2DWAA 4TLLB 2HCAA 4IO3A 1MG1A 3CIJA 2Q2AA 4OMBA 1AOVA 5TP9B 1M5FA 1XVXA 1MXZA 3EPEA 4I1DA 3K00A 1FTOA 1LFGA 1F9BA 4ZEKA 3TAJA 1QKAA 4G77A 3OSQA 2RF1A 2DWJA 4GD5A 1Y3NA 2A5SA 4FAJA 1MRPA 2Z23A 4I9DA 2Q89A 1MY4A 3TTKA 4G8HA 2F8DA 1B4ZA 3QIMA 4DXUA 3BBRA 4ZEBA 1SYIA 3G3JA 4POXA 1A55A 4Q30B 3TELA 3C4MA 1QUIA 4ZE8A 1I6BA 4IO5A 1H44A 2PT1A 4XTCQ 2XXVA 4ESWA 1RKMA 1A54A 4RJZA 3KSJA 4EUOA 2G29A 1M5DA 4JBZA 1Y3QA 3RGYA 3MC2A 3L6GA 1MPBA 1YAEA 3IJXB 4FATA 4NF6B 2HXWA 5A5XA 2DQVA 3S2VA 3K01A 4OWDA 3TUSA 1GGGA 1ATGA 2X26A 1NH8A 4OTEA 1XOCA 2RCAA 4YMBA 4ELOA 2XXXA 1A40A 3DM0A 3MZBA 3K1NA 4LZ8A 2I49A 3A09A 4NE4A 4QFNA 4U4XA 4P0GA 3RNNA 3C33A 2ALUA 2DOJA 4EQ9A 2ZYOA 3KSXA 2QS4A 4ZECA 2ESNA 2Q2CA 1PB7A 5CM6A 1MQGA 1ZJLA 3JZJA 4HCYA 1UTBA 1FQBA 5CI5A 4F31B 3N94A 3IOTA 5JK4A 4GLIA 4YB6A 1PC3A 4MFIA 1LB8A 4KR5A 1MY2A 3AXFA 5I84A 2H25A 2AL4A 1XT8A 2XHDA 3SEWA 4U21A 1IXHA 4IO7A 2REGA 1A7LA 2PX1A 2ZNSA 4F1UA 5H8QB 2R9JA 3EF7A 1B40A 3KN7A 2ZYNA 3OXNA 4F2QA 3MVWA 2XXIA 4QSEA 5H8SA 3RN8A 5TP9A 4NF8B 3VVEA 1URDA 5EHSA 2CMOA 5I58B 2F7CA 3BKIB 2ZNUA 2H99A 1D3KA 3EQ1A 4QFOA 4LONB 2XXQA 2UYEA 4QFLA 2Q8JA 3B6WA 3VV5A 2PT2A 4DXBA 2I0BA 3CRBA 2UVIA 3ZKKA 4RK9A 4KYSA 2P0SA 2OLBA 2O1LA 3HSTA 2RINA 1SW4A 3FD3A 1USYE 4WEPA 2OWTA 1D4NA 2E0SA 2Y7KA 2X7PA 5ISUA 1B3FA 3IK6B 4JWYA 3O9PA 4YKPA 3LSFB 1DTZA 4ISUA 1OVTA 4O3AA 4ELRA 1NH7A 1B5IA 1AIVA 1M5EA 1MDQA 4KCCA 1WVJA 3E9XA 4G2ZA 3TQLA 2I6EA 4FIMA 2OWSA 4M1VA 2AL5A 3LC8A 1ANFA 4R6KA 4AQ4A 4O3CA 4ND9A 4R6YA 2O68A 4BDMA 1QKBA 1N84A 1IIWA 4NF4B 2R71A 3VFJA 3H7MA 1QW0A 1P1UA 3FUZA 3PMWA 3I6VA 4FJPA 5H8FB 4P11A 4RPOA 1NMUA 2I3WA 5KDTB 4EF1A 5FHMA 1B1XA 4ELPA 1LCFA 1JNFA 4C1UA 4E0WA 1B3GA 3TCHA 1FQAA 3GBBA 3IB2A 3PV0E 4PFUA 3MP8A 3OOAA 3TCFA 3IAZA 5CC2A 2G93A 4DZ1A 2I58A 4O3BA 2NXOA 2UXAA 3KN3A 1P1WA 3KFMA 2PYYA 5CRYA 3K2DA 4G8MA 5IAIA 1HSLA 5B70A 1JETA 5AA4B 2B3BA 3MPLA 1Y4TA 3PD8A 1OLAA 3MVXA 4GXAA 3UN6A 4OXVA 3I3VA 4L17A 1OQHA 3VLUA 1SBPA 3N6UA 3FVOA 3D4GA 3T93B 1BP5A 4QRZA 1PB8A 4OFJA 3HN0A 4H8JA 5JEIA 1PBPA 1LSTA 3K6VA 4DXCA 1R6ZA 4NWCA 1US4A 5H8QA 4BDNA 1BKAA 4F1YA 1LAHE 3SDFA 1SI1A 3IX1A 4GF8A 3CI8A 3M3LA 3G3FA 4RY1A 5KZTA 3KBRA 1MH4A 3R6UA 1BIYA 4LQ2A 1XC1A 4QHQA 4ZDMA 4HW8A 1A8EA 1MXXA 3S9EA 1A99A 1MY1A 3HPIA 2DXRA 4RK2A 3VXBA 2I48A 4ZZAA 3K0VA 2UVHA 3V8XB 1N7XA 4KD5A 4H5GA 2QS2A 3MW0A 4LATA 1B3HA 1Z7ME 5I56B 1JEVA 1N3WA 3U72A 4R74A 1N76A 3KG2A 4XKRA 3IB1A 3FGSA 4PQJA 3WAEA 1JQFA 1B6HA 4UA8A 3C32A 2V3QA 3W9WA 4N6PA 3RT8A 4WXJA 1DPEA 2H5YA 3Q25A 4GL0A 2I0CA 5TU0A 5I59A 1FTJA 3RLFE 2P1SA 2Q9TA 1RYXA 4R73A 5JTYA 1US5A 1P99A 1Z7NE 1D9YA 3N5LA 2XX9A 2E1SA 3SERA 2HAVA 4R2BA 5I57B 3UA8A 3FVGA 3KJTA 4LZ7A 1MXUA 1FQCA 4H8IA 3R26A 4IO6A 2H9BA 2F7AA 3OMBA 2UYFA 4OETA 3IO6A 2ABHA 1POTA 1JW4A 2CZLA 3JV9A 1Y1MA 3R7XA 4LA9A 4KYDA 4PE5B 4NEDA 2PVUA 3HHGA 1PDAA 1I6QA 3MQ9A 3U92A 4NF4A 3B7DA 3FZVA 4OFLA 2ZYKA 1N04A 1AH5A 2IEEA 3CG1A 3IOVA 4G4PA 4R6HA 1TFDA 2XXYA 1MM7A 3H3GA 5KCJA 4F1VA 1I6AA 3FASA 4QSCA 4ZEFA 4KFQA 3UGWA 3VLVA 4AB6A 5CMMA 1OMPA 4Z0IA 4JWXA 3VXCA 4BDOA 1WODA 3O2AA 2D3IA 4JB7A 2O6AA 5AA4A 1L5TA 1OIBA 1B3LA 4DCYA 3KZGA 4K3FA 5FTHA 1VR5A 2ONKE 1LAGE 3K6UA 4IO2A 4EQBA 1IITA 2Y7IA 4KHZE 3CVGA 1P1OA 4AB5A 3K02A 3ZKLA 3FXQA 1D9VA 4POWA 3QUJA 3OEKA 4OQOA 1KWHA 4YB7A 4OZ9A 1NL5A 1TWYA 3FJMA 3OO7A 4MF3A 4JXIA 4F3BA 4LQ5A 4GQOA 1J1NA 1M5CA 1MQDA 1URSA 4F22A 2RC9A 4KCDA 1MPDA 4F3PA 4HTGA 3A3CA 4NMYA 2V93A 4NF5B 3VVDA 1LCTA 4PFTA 3RUMA 3VE1B 2THIA 1IXGA 4LZ5A 2REJA 3G3IA 3TYHA 3TQWA 1SW5A 4YKKA 4U2RA 4EF2A 5H8HA 2RC7A 5FTIA 3TCGA 3U94A 1B32A 1SW2A 1ZTYA 4H1XA 3LR1A 4F2OA 1LAFE 1R1NA 2IA4A 3U93A 4DLDA 4G68C 3TTLA 3HV1A 5TPAB 1Y1ZA 2GFEA 4JWOA 3ZSFA 3UIFA 2BJJX 2OJTA 2ZMBA 3EHTA 5IKBA 1N3XA 1Q35A 1LB9A 4QSDA 3JYRA 2H4IA 2XD3A 3TEPA 4OERA 4QF9A 3BFTA 3BFUA 2I4CA 1JVYA 4JDFA 4Q8RA 1ZLQA 2QS3A 1YCJA 5I2NB 4GIZA 1MXYA 3LSXA 5AA2B 4WKMA 1OQGA 4R2FA 1JVXA 1SQYA 3DP4A 1UTHB 3PUVE 1MQJA 3QAXA 3RPWA 3ONMA 3O28A 1B51A 2OBGA 3GLBA 1MQIA 4R75A 5CBRA 1O7TA 4LUBA 3FVKA 1URGA 1ZIUA 2V25A 3D4CA 3IORA 1S7YA 1TFAA 2XXTA 3MVYA 1IXIA 4YMAA 3MUQA 4F3GA 3FJGA 2PBWA 5J1DA 1HSJA 3CR9A 5AA2D 2Y7PA 1SDXA 3IB0A 3SETA 3LUYA 3PMXA 4OHNA 4RXLA 1JEUA 4XKPA 5LOMA 4EXKA 2DP8A 4NF6A 3LBSA 4RNSA 4U22A 1JW5A 2XX8A 1B0LA 1MY0A 1MQHA 3OSRA 4TLMB 3FV2A 4OFOA 4YZZA 3H6WA 4H5FA 3RY3A 3ILTB 1H3DA 3RTFB 2F97A 2D5WA 3KGCA 5DEXB 4YAHX 3PPNA 1QUJA 2FYIA 4ESXA 4U1OA 3VLWA 2Z8DA 3V83A 3Q29A 3LSWA 1SYHA 4ZS9A 3H6UA 3UP9A 1S50A 3KN8A 4OENA 1NNKA 3G3HA 2DYXA 5L9MA 1Y9UA 2Q88A 5AA1A 1Y20A 3O97A 4KPTA 5HM4B 3RT6B 4I62A 1WDNA 4EDPA 1NKXA 2QL3A 5L9OA 1VFEA 4U4SA 4GL8A 4EXLA 2FNCA 5BUUA 3HHFA 2A5TB 3P7IA 4TQUQ 1FQFA 4MBPA 4YKJA 1Q1KA 1PB9A 1FCKA 1B2HA 1SVXB 4NTLA 1B1HA 3MBPA 3H6TA 2HZKA 1P1NA 1EZ9A 5A5XB 3T22A 1MY3A 2DE3A 1SD3A 4JSOA 4IO4A 2O1MA 1TXFA 4N13A 3U1OA 4HCWA 2VGQA 3E4RA 1H76A 5HPQA 4NF8A 1YPNA 3TKDA 5K2YA 3PPOA 1MS7A 1B7ZA 5I58A 1VSOA 5EYFA 1BLFA 2GRVA 4XKNA 5AA3A 5ICQA 4GRKA 2QMXA 1XVYA 4R9FA 5DVFA 4OYVA 1P1QA 4XXUA 1RYOA 5DT6A 3T9XB 2GHAA 1FTKA 1B4HA 3TFLA 3C35A 1B46A 5F1QA 3SEXA 4F39A 4RA1A 2V84A 4G68B 1UTBB 1VFDA 2B3FA 3RTWB 4PP0A 1UQWA 1SW1A 1IQ7A 3QXMA 3FATA 1PEBA 2XD2A 2DWHA 1LBCA 3MPKA 4I8CA 4DE8A 1NFTA 3G3GA 1ZKBA 3T66A 2XXWA 1H45A 2ZXTA 1B58A 1B9JA 4F18A 4HS7A 5F7VA 3MWBA 2KLFA 1R9QA 4Q5TA 5L9SA 1POY1 3E3KA 3DELB 3SEVA 4DDDA 3A3UA 4ONYA 3THIA 4ZZEA 2Z22A 1B3EA 1LGBC 3PPQA 4N07A 2UVGA 4FECA 3PMVA 1XS5A 4YU0A 2O51A 3H4ZA 1MPCA 2I3VA 3O6IA 2F6GA 3C31A 4X1DA 3B6QA 4FORA 5DEXA 5H8FA 1LLSA 4U23A 3OO8A 5KDTA 1FW0A 4MLVA 3S4UA 3DLNA 4X1BA 3SEUA 4IGTA 3OEMA 3M3FA 2DE4A 1FQDA 3PPRA 4EQ7A 5FHNA 1MDP1 1LFHA 4DCXA 5ITPA 3T9VA 4TOZA 4QFKA 2HAUA 1DTGA 2V3UA 1B5JA 3H06B 4YB5A 5M2VA 4E0XA 3OO6A 4DIGA 3L6HA 1I69A 2QMWA 4G8NA 3IO4A 3FVNA 2OZZA 2WKYA 4MLQA 4KI0E 3KEIA 2V3TA 1A8FA 2A5TA 4ELQA 1II5A 2XXHA 4Q0CA 3K4UA 3MP6A 1Y4CA 3PUZE 1S9TA 5DVJA 2PMSA 3MJNA 2VD3A 2XX7A 1MM6A 2AIXA 1LFIA 5CMKA 1EZOA 2I4BA 3HCQA 2Z8EA 3EN3A 3IR1A 3FXUA 3T9UA 2OK2A 2F35A 4KYEA 2H98A 3OELA 3C36A 3PGFA 1IUDA 1FTLA 4C1TA 2DSFA 3PUYE 2X7QA 5HBCA 3SKPA 1EH3A 2YPNA 3ODBA 3QSLA 4H0WA 5I56A 2O84X 1NNPA 1DPPA 1GR2A 3E13X 4Z7EA 3PUWE 4GVOA 3I5OA 3OD7A 1N0TA 2VD2A 3CG3A 2Z8FA 3TODA 4G68A 4IY5A 2GH9A 5ICTA 2F6PA 3F11A 3H6VA 3MAMA 1H43A 3TTMA 3PD9A 4OVJA 1FTMA 3K6XA 4IY6A 1LAXA 1B5HA 2RKMA 4FEBA 1HSEA 3VDFA 5L8DA 1CE2A 4MH5A 2NWJA 3GZGA 1VE4A 2P2AA 3KOSA 4PFWA 3W9VA 2HEUA 5I57A 1T0KA 4ZEIA 3K1PA 1IXCA 1OLCA 3C9HA 5I2KB 3OENA 2QS1A 1MXVA 2XXRA 4X9TA 5AE4A 1YTVA 1O63A 2Y7RA 4R9GA 3ECRA 3QUFA 1MXWA 3DP8A 1PBQA 2ZYMA 1MH3A 4OEUA 3QK6A 2DVZA 1QULA 2RC8A 3EHUA 4JSDA 3M8UA 1UIUA 5EHMA 2F7BA 2ZNTA 3IOWA 3U8QA 1GVCA 4R72A 3T9HB 4BDRA 2UVJA 3Q27A 1SI0A 5H8NB 4ECFA 2HQ0A 3USDA 3DP6A 4YICA 2F36A 4GFRA 4UACA 3O66A 2NOOA 4IGRA 4FE8A 2ONRA 3Q28A 2W7YA 2DVCA 2R6GE 4U1ZA 1NNTA 4PFYA 3MZ9A 4LP2B 2NVUB 4BDLA 3ZS6A 5I59B 1DMBA 3FIRA 3O6HA 5JTYB 4F3SA 4PETA 2Y7WA 3QYTA 2ONSA 3FJ7A 5BWJA 4H6DA 4XIGQ 5B7DA 1QVSA 3SESA 2QRYA 4WEDA 1QJMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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