5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
1UTBA 2IA4A 3KSJA 5TP9A 1TFAA 3IL1B 4X1DA 1SW5A 1I6BA 4WEDA 4N13A 5I56A 1BTJA 5FHMA 2DWAA 5DEXA 1OVTA 5KDTA 3IAZA 2D5WA 2V3TA 2Z8FA 5L9SA 3H6TA 3IORA 1IXGA 5ITPA 5ELVA 1XVYA 1CB6A 3PUZE 5I57A 1NMUA 4ZEDA 3IB0A 4YKPA 1B4ZA 4YKJA 3CRBA 5I2NA 2R71A 5H8QA 2H4IA 2XXXA 4QF9A 2DE2A 2DQVA 2B3BA 4N07A 2QL3A 2UXAA 4PFTA 2VHAA 4MF3A 2REJA 3UIFA 1XS5A 3LSXA 4ZZAA 1JEUA 3N94A 3GBBA 2QMXA 1ATGA 1DOTA 2UYEA 1B3GA 4JSDA 1N0TA 1I69A 3I5OA 4L17A 3VVFA 5L8DA 4ESXA 1MXYA 4OQOA 4TLMB 3SEUA 2HCAA 5BWJA 3K0VA 4IO5A 2Q9TA 3UGWA 4F1VA 3EPEA 3FATA 1MG1A 1XC1A 4ESWA 3G7WA 1OLCA 2RC9A 2QSXA 4UACA 3MP6A 4Z0IA 3JZJA 3S9NC 3CVGA 5H8SA 4PETA 2XD2A 3IK6B 3VVEA 1B51A 3VE1B 1I6QA 1USYH 3ZSFA 3MVXA 3D4CA 3V5AA 2H9BA 2RINA 3MQ9A 3PPNA 3FIRA 4ISUA 3TTLA 3E4RA 1MPBA 3SETA 5CC2A 3SEXA 2RC7A 3OO6A 3SKPA 1XOCA 1J1NA 2FA7A 4KD5A 1IXIA 3MP1A 2XX9A 4WKMA 1WDNA 2I6EA 4R2FA 2XXRA 3PPQA 2ZNTA 3GXAA 1MY1A 3S4UA 4OEUA 5AA2D 1Y3QA 4YMAA 4KCCA 1MY4A 2I4CA 3RTFB 3MZ1A 3U8QA 3W9VA 3IB2A 4AB5A 4NF6A 1AH5A 4FEBA 3Q28A 1USYE 2YLNA 4BDNA 2QS2A 1B3EA 4PFYA 2QS3A 4ND9A 4RK2A 4GLIA 4G4PA 4NMYA 5FTIA 1N04A 3MPLA 1A8FA 1QUIA 2AYSA 5AA4A 1MY0A 3QXMA 5CI5A 1R9LA 1JQFA 2OJTA 4LZ8A 4OESA 1ZLQA 3MJNA 1B2HA 1ZTYA 4QFNA 1URSA 3Q27A 1NNFA 1BIYA 1P1OA 3FV1A 2YJPA 1B5HA 4O3BA 2OWTA 4U4XA 4RPOA 4H5FA 4FATA 4JB7A 3CFZA 4LQ5A 3SEWA 5K2XA 3TODA 1NFTA 1LBBA 1O64A 4RY1A 5M2VA 3O2AA 1MQJA 1MQHA 2P2AA 3A3CA 3UA8A 2XXIA 3FXRA 2UVJA 3B6WA 4MBPA 1B5IA 2Y7PA 2QS4A 2E1SA 1SW2A 1MXXA 3HCQA 4OWDA 2PT2A 1PB9A 1S7YA 3UK4A 3ZKKA 4U1OA 5I84A 3HHFA 3FASA 2D21A 3BBRA 2F78A 4R6HA 4ZEBA 1DPEA 2XXVA 3PUWE 1MQDA 2VOZA 3CSBA 1QUKA 1AOVA 5LOMA 1MY3A 4KFQA 3H3GA 1O63A 1PBPA 1B32A 4I8CA 2B65A 3BFTA 5A5XA 1SW4A 3KEIA 4F1YA 4IY6A 4ELOA 1M5CA 3C34A 5K2YA 4YB6A 5L9OA 1EH3A 3USDA 4LZ7A 2OWSA 3OELA 3TZAA 4RPNA 4E0XA 5BUUA 3LUYA 3K6XA 1B1XA 4UA8A 3T93B 4U4SA 1I6AA 5CBRA 4YB7A 3MP8A 4GFRA 1YCJA 4KYDA 1FTMA 3IOWA 3FGSA 1IQ7A 3QAXA 1NNTA 4F22A 2FNCA 1NKXA 4FJPA 1B7HA 3OO9A 2F97A 2XD3A 4DXBA 2F34A 3RNNA 2PVUA 4ZECA 3PPPA 3C33A 2HEUA 4OFLA 4EXKA 5IKBA 3V83A 5AA1A 3TYHA 4N6PA 4QFPA 3VLVA 1NH8A 4FEDA 1Q35A 3MZBA 3CR9A 3IO6A 2VD2A 2ONSA 5DVFA 1GVCA 3KN7A 2V3QA 4R72A 1FQCA 1A40A 1FTJA 1O7TA 3T22A 4OMBA 4GXAA 1B6HA 5DYHA 5CBSA 3CFLA 3QIMA 4IO2A 3FZVA 2PT1A 1LGBC 3RTWB 1FTLA 2XXWA 4OETA 3MWBA 5F1QA 4JBZA 3O97A 2VGQA 1LAHE 3RPWA 3TUSA 5CMMA 2DVCA 1SVXB 2AIXA 3WAFA 5I58B 4EDPA 5J1DA 4G8NA 2F7BA 4R73A 2O1LA 1CE2A 2GHBA 2A5TA 1VFEA 3FJGA 5FHOA 3T66A 3OOAA 4ZE9A 3O9PA 2IEEA 1KWHA 4OFJA 4LVQA 4ZEIA 4KYSA 1GGGA 2OK2A 1BP5A 3ZKLA 2I0BA 4DCYA 3RN8A 3S9LC 4GD5A 4H6DA 3FVGA 3HSTA 4U2RA 5H8FB 1P1UA 5CRYA 4QRZA 2ZMBA 4OERA 1EZ9A 2A5SA 4OENA 3C35A 4XKRA 2ALUA 4U21A 3DELB 2X7PA 3C9HA 2Z8DA 4QHQA 5B70A 1QULA 1Y1MA 3SERA 2HZLA 1L5TA 4IO6A 2CMOA 3FVNA 4RXLA 3H6VA 1WVJA 2ZYMA 4R75A 3HN0A 4KR5A 3LBSA 3OMBA 2G29A 3DP4A 1ZIUA 2O69A 4DDDA 4GF8A 1JEVA 4IY5A 4XKQA 4NE4A 4ZEFA 5A5XB 3RT8A 2XXTA 1OLAA 3WAEA 4KCDA 2HQ0A 2X7QA 3T9VA 2UVHA 1PDAA 4RJZA 3TCHA 4G2ZA 4QSEA 4BLAA 1ZMGA 3PUYE 3E13X 3PMXA 5I59B 1LB9A 1TFDA 1LB8A 5DTBA 1B52A 3TEPA 2DYXA 3O28A 1YAEA 3CSGA 5ICTA 3G3IA 1R1NA 3CFXA 4PP0A 4BDMA 2THIA 3E3KA 3PU5A 3C32A 3T96B 3IO4A 3OO8A 3V8XB 4G68B 4FECA 3VV5A 2F6PA 2DS9A 4XIGQ 1A7LA 2Y7RA 3PUXE 4G8HA 1P1NA 4GRKA 4AB6A 3OENA 3RT6B 4JWXA 4NF5A 4OEVA 2VP1A 3JV9A 4H1XA 1Z7NE 3OSRA 3N6UA 3ECRA 4BDRA 3DP8A 3BFUA 2X26A 3CI8A 4I9DA 3H6UA 3LR1A 4WXJA 1D3KA 1SYIA 4H67A 4F2QA 2PX1A 3L6HA 3IJXB 5EYFA 3I3VA 1URGA 1A99A 3HO7A 1QJMA 3LSWA 4WEPA 4F3PA 4DLDA 3UORA 4DCXA 1PB7A 1DPPA 3GBAA 4M4GA 2V93A 3G3KA 5AA3A 4LP2B 1QKBA 3KJTA 1YTVA 4DXUA 4EQ7A 1VFDA 1OVBA 3K00A 2A5TB 4PQJA 1EZOA 5TU0A 2AL5A 2I58A 3KN3A 2Z23A 3OEKA 4YU0A 3ILTB 4GXSB 3CG3A 3T9UA 2CZLA 4JDFA 4JWYA 3MBPA 4ZDMA 3UP9A 3EN3A 5I58A 1EU8A 4G8MA 3VVDA 4IO3A 2DE4A 1Y3NA 4EF1A 2G93A 3FV2A 1B05A 1US5A 3FJ7A 3O6HA 3IX1A 2AL4A 1D4NA 2QRYA 1D9VA 3O6GA 4HCWA 4MLQA 3SDFA 2I49A 2V25A 3T9HB 2RF1A 4YB5A 4XXUA 2XXQA 3MUQA 3RY3A 3K02A 4U23A 3W9WA 5H8FA 4G68C 1AMFA 1B9JA 4NF4A 1S50A 2RC8A 4P0IA 3BKIB 3GZGA 5CMCA 2DE3A 1NNKA 2ZNUA 4F3GA 5JTYA 3U72A 4GOTA 5IAIA 3I6VA 3EF7A 1A8EA 2UYFA 2F35A 3OD7A 3MPKA 2DVZA 2Z8EA 3QYTA 1RYXA 3S2VA 3OO7A 3B6TA 4Z7EA 1SD3A 1GTKA 4JXIA 4KHZE 2I48A 3PMWA 3W15C 4DXCA 3FD3A 1Y4TA 3G3JA 2ZYNA 3M3KA 4AQ4A 4ZZEA 3THIA 1MS7A 2H99A 3R7XA 1EZPA 4F29A 4F3BA 4G77A 3S9MC 1AIVA 2QJEA 4X48A 4QSDA 2P1SA 4FE8A 5I59A 1IITA 4X1BA 1FQBA 1MM6A 3KGCA 1MDP1 3RLFE 2DWIA 3VXBA 3TTRA 2XXUA 3TAJA 3TELA 4ZE8A 4OVJA 4OXVA 1NL5A 2LAOA 4NF5B 4Q8RA 1PC3A 3PV0E 2GFEA 4G68A 1MY2A 1SQYA 3H7MA 3S9EA 1Y9UA 4IO7A 1R6ZA 2RCBA 4ZS9A 2PYYA 3E9XA 2R9JA 1JVYA 4LQ2A 5KZTA 1B40A 1MPCA 3R26A 2QMWA 2Y7IA 4RNSA 4FIMA 2REGA 3PD9A 4F31B 4GWOA 4KQPA 3IOTA 1Q1KA 1MM7A 2ESNA 4JSOA 1P1QA 1XT8A 2XX7A 1H44A 2HXWA 2B3FA 1H3DA 2NVUB 4HTGA 2PBWA 2O6AA 4NTLA 4GQOA 4P0GA 1FQAA 1B7ZA 1ZU0A 3O66A 2W7YA 3MC2A 4RA1A 1JVXA 3V89B 1XHYA 2XX8A 2GH9A 1VSOA 4H65A 2H98A 4EQ9A 1Y1ZA 3IOVA 1UTHA 1POTA 5FTHA 4QSCA 2F5XA 2VD3A 1URDA 4O3AA 3VLWA 1UIVA 3IB1A 2ABHA 2DSFA 3B7DA 4BDLA 2O68A 4NF8A 3LSLA 3VFJA 1SW1A 3RGYA 1ZJLA 4LA9A 4RYAA 4F3SA 3DM0A 1B1HA 5F7VA 1PEBA 3FXQA 3M8UA 1FQFA 1N3WA 2UVGA 3UN6A 4NF4B 3OXNA 3K1PA 1QVSA 4H0WA 4HS7A 4M1VA 2Q2CA 4R74A 4DIGA 1B3HA 5JTYB 1ANFA 2O84X 1BLFA 2O51A 1MPDA 3EHTA 1F9BA 4NWDA 4IGRA 3U92A 1MXWA 1B5JA 3MVYA 1IXHA 1JETA 4ONYA 4GVOA 3PD8A 3QK6A 4LATA 3TDJA 3EHUA 1LFGA 2I3VA 1XVXA 2ANJA 4EXLA 2DWJA 5CMBA 1H76A 1T0KA 1LFHA 5H8NB 2ZYOA 4QFKA 3G3GA 3Q29A 1UQWA 3C31A 2Q89A 4H5GA 4R9GA 4HCYA 3VLUA 1N84A 3T9XB 5JEIA 1D9YA 1LCTA 2I0CA 3N26A 5ITOA 2F7AA 1NNPA 2BJJX 1SBPA 1TWYA 4BDOA 1IZ1A 4Q30B 4YMBA 3ZS6A 1SI1A 1OQGA 3MVZA 4EF2A 1JW4A 3KBRA 1GR2A 2H25A 2P0SA 3TQLA 3F11A 3K2DA 5KCJB 1MXZA 1OIBA 5B7DA 4PFUA 1H43A 3QSLA 1RKMA 3DP6A 1A54A 3SESA 1DSNA 1P1WA 2OBGA 3M3FA 2XHDA 1QUJA 5ICQA 4GL0A 4YICA 1IEJA 2O7UA 3K01A 2UVIA 3TTKA 3N6TA 3LC8A 1DTZA 1IIWA 1LAGE 1VE4A 3TCGA 2NWJA 3FJMA 1N7XA 1OMPA 3MVWA 3KSXA 5EHSA 1MQGA 1LLSA 1Y20A 1MH4A 3A09A 5CMKA 3K6UA 2OCUA 4R6KA 2KLFA 3IJOB 1HSEA 5AE4A 1IXCA 3C36A 4XKPA 1OQHA 1UIUA 1FQDA 4YZZA 3DLNA 5H8HB 4YKKA 3AXFA 4FORA 3RUMA 3B6QA 5DVJA 3TKDA 4OFOA 4KYEA 3VDFA 3K6WA 4ZEKA 1LBCA 4TQUQ 3C4MA 1GV8A 4DZ1A 3L6GA 1UTHB 3M3LA 3PPRA 2RCAA 3O29A 2V3UA 2F6GA 3O6IA 5I2KB 1B7UA 5ISUA 3LSFB 1P99A 3SEVA 4NF8B 1ZKBA 2F7CA 3VXCA 4F2OA 3TFLA 3IR1A 4YAHX 3K6VA 4HW8A 1Y4CA 4GL8A 2ZYKA 1B3LA 2FYIA 4F39A 1MRPA 2XXYA 2DXRA 3TCFA 1AL3A 4TOZA 2QPQA 4QFOA 1FTOA 2XXPA 3CIJA 1A55A 5EHMA 1FTKA 4I1DA 4NWCA 3G3FA 3HPIA 3JYRA 5TPAA 3P7IA 3KN8A 4Q0CA 3H03A 4LZ5A 5AA2A 5HM4B 4IO4A 1JW1A 1N7WA 4LONB 2WKYA 3K1MA 3PPOA 2DXYA 4ELRA 1S9TA 1RYOA 3RQTA 3D4GA 1UTBB 4F18A 3PGFA 4OTEA 3TTNA 2GRVA 3KOSA 1MDQA 5TP9B 1QW0A 2Q8JA 4LUBA 2NOOA 3QUJA 1Z7ME 4U22A 3FVKA 3U1OA 4MFIA 4O3CA 1VR5A 3IOUA 5I56B 3KZGA 1LFIA 2XXHA 5DEXB 4I62A 3H6WA 5KDTB 4ELPA 3MAMA 5H8NA 1YPNA 4POXA 1MXUA 5I57B 5CM6A 3R6UA 2Y7KA 3Q25A 4C1TA 3EHSA 3KFMA 4POWA 2Q2AA 2D3IA 5I2NB 5H8QB 2HAUA 3N5LA 3MZ9A 1LAXA 3SEYA 1MXVA 2GHAA 4EUOA 2DWHA 1PB8A 3A3UA 1WODA 4PE5B 3TMGA 2ZNSA 4OZ9A 1IUDA 4YKIA 4ELQA 2OLBA 1Y3PA 4GIZA 1SDXA 4F19A 1B3FA 1R9QA 4MH5A 5KCJA 3EQ1A 2ONKE 2O1MA 3U94A 4DE8A 3GLBA 4QFLA 1POY1 3HHGA 1PBQA 3Q26A 4IGTA 2HAVA 1MH3A 3FVOA 1HSLA 3MW0A 1HSJA 4RK9A 3U93A 2Q88A 3TTMA 4OYVA 4KPTA 3ONMA 4H8IA 1TXFA 2PMSA 2F36A 1B4HA 4C0RA 3PUVE 4XKNA 1FQEA 3PMVA 1LSTA 1FW0A 4KI0E 2QS1A 3KG2A 4R9FA 1B0LA 3HV1A 1N3XA 2NUVA 3FUZA 5FHNA 4EQBA 3OEMA 4BDQA 2E0SA 5DVIA 4F1UA 4R2BA 4THIA 3OSQA 3FXUA 4IB2A 1M5FA 5H8HA 4P11A 5JK4A 4TLLB 4U1ZA 4FAJA 1M5EA 1NH7A 4K3FA 3KOTA 3H4ZA 2DP8A 1DTGA 3G3HA 2HFBA 2H5YA 1QKAA 2I4BA 3KJ7A 2Y7WA 1N76A 4MLVA 1LAFE 2M8CA 3TPAA 4PFWA 1M5BA 1B46A 2NXOA 4XTCQ 1H45A 4NF6B 3QUFA 1M5DA 5I2KA 3TQWA 3H06B 5DT6A 1US4A 2O7IA 1LCFA 5AA4B 5TPAB 4X9TA 2RKMA 4OHNA 5AA2B 1MQIA 2I3WA 3CG1A 1JW5A 1TT1A 2Y84A 4NEDA 2YPNA 1SI0A 5HPQA 3ILUB 1II5A 3ODBA 1DMBA 1B58A 1B0HA 4ECFA 2ZXTA 2HZKA 4H8JA 1BKAA 5HBCA 2OZZA 2ONRA 2V84A 4E0WA 2DOJA 2F8DA 1SYHA 5L9MA 1ELJA 2R6GE 3K1NA 1ZBMA 4JWOA 4Q5TA 1FCKA 3K4UA 4R6YA 4C1UA 1JNFA 2Z22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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