5H8FA

Structure of the apo human glun1/glun2a lbd
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
274
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 274
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA02
5HM4B 3RGYA 4P0GA 3O2AA 2I4CA 2X7QA 1B3FA 4ONYA 2Q8JA 3K1MA 4YU0A 4E0XA 5TPAB 2Q9TA 4RYAA 5B70A 3FJMA 3SERA 4GL8A 4F3PA 1IQ7A 1R9LA 4P11A 1II5A 4KYSA 3USDA 5DEXB 1FTJA 5EYFA 5HBCA 4F29A 4HS7A 4I8CA 1SYHA 3G3JA 1AIVA 1POTA 4QSDA 1NMUA 3KBRA 5CI5A 4KHZE 1MDQA 2QSXA 5CBSA 4R6YA 4R74A 1FTOA 5ISUA 3E9XA 2DP8A 3M3LA 4NF4A 2X7PA 1MQHA 4FECA 2IEEA 3PPOA 5FTHA 4NF8A 4RK9A 2DQVA 2ZNSA 3JV9A 2O7UA 3SDFA 1UIUA 4RJZA 2Q2CA 3W9VA 4FJPA 2G93A 4XKPA 3OO6A 1M5CA 5TPAA 4OTEA 2Y7KA 1P99A 4H8JA 4YICA 3H4ZA 2R9JA 3SKPA 5DEXA 2F34A 1M5EA 4G68B 3UORA 4I1DA 3CSBA 3UA8A 1LFIA 4LP2B 4Q8RA 2ZYOA 3K6XA 3FXUA 2X26A 5BWJA 4JWXA 2XXRA 1MY1A 1CE2A 2Y7IA 2Q89A 3MBPA 5J1DA 3TCFA 3LR1A 4FORA 4LA9A 4ZE8A 2F5XA 1VFDA 1ELJA 3DM0A 5DVIA 4XIGQ 1UTHA 1P1OA 1B05A 4ND9A 3TMGA 4OERA 3TCGA 1MM6A 3OEKA 4NF6B 2DYXA 4OYVA 4YZZA 2F35A 3E13X 2W7YA 2AYSA 4YMAA 5I57B 4ESXA 1SI0A 1B6HA 4XKNA 3T9UA 3VLWA 1SBPA 4XTCQ 3IOUA 2O1LA 3CI8A 3KGCA 2I3VA 4N13A 3RT6B 3C34A 1I6AA 4O3CA 3TCHA 1JVXA 3G7WA 1PBQA 3RY3A 2HEUA 3S9LC 4QFLA 3UP9A 1H44A 3FVNA 3O28A 4H6DA 1VR5A 4OESA 3IORA 4C1TA 2Q2AA 1MY0A 3C36A 2VOZA 3CRBA 2HZLA 3F11A 4OXVA 1RYXA 4R6HA 3QAXA 4KR5A 1B52A 2V3UA 2V84A 3OOAA 2Y84A 2PT1A 4NF6A 2VGQA 1LB9A 4GOTA 1B7HA 3S9NC 2XX7A 1B51A 3K6UA 1B3LA 1P1WA 3ILTB 3VVFA 4BDMA 5B7DA 5I57A 3C35A 2DWJA 4FEBA 3VLVA 4LZ7A 3SEWA 2ZYNA 1DPEA 1S50A 2RKMA 1MM7A 4KCCA 4FEDA 1NNTA 4HCYA 3U93A 2HFBA 4EF1A 1XT8A 5H8NB 3Q29A 4H5FA 5H8FB 2RCAA 3VVDA 1EZPA 1IXCA 1USYH 4QRZA 3PUVE 1N04A 5F7VA 1TXFA 3HO7A 2ANJA 2Z8FA 1IITA 4KI0E 1IEJA 3KG2A 3LSFB 1MG1A 1Y9UA 3S9MC 2REGA 1QULA 4PE5B 1B0HA 2DOJA 5I84A 2ZNUA 3CG1A 4JSOA 1N0TA 4YB7A 2Z23A 2ONKE 5I56B 5L9SA 4U4XA 1BKAA 4DXBA 4ZECA 3PGFA 1DTGA 4BLAA 3IX1A 4WXJA 1NKXA 3TQWA 3VV5A 4DXUA 3MC2A 5DYHA 3RNNA 5AA2B 1Z7NE 2QMXA 2I48A 1QJMA 1B9JA 2E0SA 2Z8DA 3SEXA 2RINA 5H8FA 3K01A 1TFDA 3LSWA 1A54A 5CMCA 2F97A 4JBZA 2DWAA 1D3KA 1QVSA 3OENA 3K6WA 4EQ9A 3DELB 4EF2A 4ELPA 3DLNA 1A7LA 3O29A 4ZE9A 4HW8A 4LQ5A 4LATA 2PYYA 3PPRA 1GVCA 3FATA 3FV1A 4QFKA 4I62A 1XVYA 4GWOA 4PP0A 1DOTA 2I58A 3ILUB 2QMWA 1LFGA 2UVIA 4O3BA 1MPDA 5I56A 2O68A 4R9FA 1QUJA 4MFIA 4EDPA 1ZJLA 4PQJA 2LAOA 3MWBA 1SQYA 5AA2A 1MH3A 4YB6A 1LBBA 1O64A 4GXSB 4TOZA 4TQUQ 4X9TA 2DS9A 1PB7A 4F19A 1J1NA 3S9EA 4G2ZA 4ELOA 4U2RA 1URSA 3TTLA 3IOWA 3EHSA 3RUMA 4UA8A 3R6UA 1XS5A 3ZSFA 4XKQA 2NVUB 3T93B 2DSFA 3QXMA 3QUFA 2GHBA 4G77A 1UIVA 4U21A 3SESA 1R9QA 1A8EA 3DP6A 3MPLA 1B1HA 5DVJA 1B5IA 3HPIA 3THIA 3IO4A 4MBPA 4K3FA 3FGSA 2RCBA 3SEYA 3TQLA 3CIJA 2G29A 4GL0A 3R26A 4JWYA 1N7XA 3M3FA 5EHSA 1MXXA 5IAIA 2DE3A 4NF8B 5L9OA 3V83A 3FXRA 2XD3A 4NE4A 1IIWA 4G8NA 4F39A 2V93A 2A5SA 4LONB 2HXWA 3MZ9A 2B3FA 3Q25A 4QF9A 5K2YA 4XKRA 3Q28A 4U4SA 3HV1A 2DVZA 3ODBA 5AE4A 5JEIA 1MY4A 1JETA 3E4RA 1P1NA 3UK4A 5I58B 1YTVA 3PU5A 1H3DA 1P1QA 3CSGA 2WKYA 2D3IA 1MPCA 2E1SA 1A55A 4FATA 1DSNA 3FD3A 2DE4A 1MQIA 2F36A 2RC7A 4OEUA 2PVUA 4JWOA 4YKPA 5DVFA 2V3TA 4OEVA 4DLDA 1SW5A 3PPNA 3U8QA 2OBGA 2UVGA 4M1VA 4OETA 4QFNA 3HSTA 3U94A 2O69A 2UVJA 1M5FA 3UIFA 4MH5A 3KFMA 3QSLA 1US5A 4GF8A 1UTHB 4RPNA 1MH4A 1MRPA 3TZAA 4R9GA 2HQ0A 3WAFA 1ZIUA 5HPQA 2OWTA 1P1UA 5I58A 4NWDA 1DMBA 1I69A 2Y7PA 4H67A 1Z7ME 3UGWA 2V25A 2VHAA 3G3GA 4JB7A 3AXFA 5I2KB 2I3WA 5KZTA 3ZKLA 1BLFA 1SI1A 1B3EA 4OMBA 1B2HA 2QPQA 4ZDMA 1MDP1 4QFOA 4KFQA 3N6TA 2D5WA 3IJOB 2NWJA 3T9VA 3CFLA 2XXIA 1GV8A 4X48A 4ZEFA 2VD3A 1MY3A 2QS1A 2ZYKA 3MQ9A 1PC3A 3IOTA 4L17A 5ITOA 2RC9A 1HSLA 1IZ1A 3MJNA 2GH9A 3H7MA 2HAUA 1WVJA 3MZBA 2OWSA 1LSTA 4R75A 2D21A 2HZKA 5I2KA 3TEPA 1B3GA 4NF5A 3OXNA 4KD5A 4BDNA 2P1SA 1SW4A 3H3GA 3N26A 5ICTA 3U92A 3KN3A 4RNSA 4BDOA 4BDRA 3DP8A 4GIZA 1XOCA 4EQBA 1SYIA 3T22A 3BKIB 1KWHA 3EN3A 3CVGA 2YJPA 1DTZA 4X1BA 2CZLA 2YPNA 2Z8EA 3P7IA 3B6WA 2M8CA 5H8SA 1SW2A 1UQWA 2PT2A 3I3VA 3PPPA 4U1ZA 2H99A 3B7DA 4ZEIA 2F6GA 4G4PA 3PV0E 1ANFA 3V5AA 1F9BA 3FVOA 5L9MA 1TT1A 3SETA 1VE4A 4DXCA 3Q27A 3H03A 2REJA 2Q88A 2ALUA 1JW5A 2XXPA 2OJTA 4M4GA 1LFHA 4PFWA 1LAGE 4ELRA 2PBWA 3O6HA 1OVTA 3GBAA 1MXZA 4H5GA 4JDFA 5JTYA 3TDJA 5DTBA 5BUUA 3KZGA 2F8DA 4LZ8A 4F1YA 2H4IA 1MS7A 3C31A 3T9XB 1PBPA 1IXIA 4F18A 4IB2A 1FQDA 4G68C 2BJJX 1ZMGA 2ZMBA 3R7XA 4H65A 5A5XA 1AH5A 4OENA 2F7AA 5I2NA 5I59B 4DCXA 3TAJA 1EU8A 5FHMA 4H1XA 3FJGA 3K00A 1Q35A 4DIGA 3D4GA 1WODA 3PD8A 3KOSA 2DVCA 1YCJA 1ATGA 3L6HA 3RPWA 5FHNA 4F2QA 2GRVA 2I0CA 3OMBA 1R1NA 3T66A 3FVGA 4DZ1A 4RXLA 4KQPA 1FTMA 1PEBA 4RY1A 3IK6B 1MQJA 1AL3A 1NNPA 1LCTA 3TKDA 1XC1A 3E3KA 3KN7A 4IGRA 1MXYA 3OEMA 1Y3QA 2O7IA 1PB8A 4IO7A 3RQTA 4GVOA 4IO4A 3KJ7A 4EQ7A 2FYIA 1N3WA 3K2DA 2B3BA 3IB0A 3QK6A 3GLBA 2XXWA 3B6TA 2P2AA 4NEDA 4Z0IA 3ZKKA 5I59A 1B3HA 2NXOA 1D4NA 1H43A 1ZKBA 2ONRA 3U72A 3VXBA 3G3IA 1N76A 1FQCA 2NUVA 1FQFA 4YMBA 4R73A 5TP9B 3D4CA 3KOTA 1B7ZA 3RT8A 1QW0A 3IB2A 1XVXA 4OFLA 3EHTA 3CG3A 1B5HA 2ESNA 3EQ1A 4F22A 2O84X 1OQHA 5F1QA 3TUSA 5AA1A 2OLBA 2DXYA 4YKJA 2UVHA 5CC2A 3BFUA 3M8UA 4GFRA 3HN0A 4IGTA 1POY1 4LQ2A 2XX9A 1ZTYA 4H0WA 3GBBA 1GTKA 4JXIA 4UACA 1LAHE 4MLVA 3K0VA 3MVZA 2QJEA 4P0IA 3PMVA 3VVEA 3FUZA 2DXRA 4E0WA 4DDDA 1B5JA 4G8HA 1R6ZA 4MLQA 1T0KA 1QUKA 3MP8A 4C1UA 5TP9A 4PFYA 3OD7A 4F2OA 1OVBA 2F7CA 3S4UA 3KN8A 1SDXA 3ZS6A 4OHNA 1Y1MA 1TFAA 3CR9A 2FNCA 3H06B 2I49A 4I9DA 3N5LA 3TPAA 5LOMA 5FTIA 4FE8A 1JVYA 5AA4A 5TU0A 4ZEBA 3TTKA 4PFUA 3TTNA 4GLIA 1URDA 3PD9A 2XXHA 3HHGA 3PUYE 3KSXA 5H8HB 1LAFE 5IKBA 1VFEA 4IY5A 2XX8A 2HAVA 3K6VA 3A3CA 3EF7A 2XXYA 3QYTA 5ITPA 3I6VA 1S7YA 2H9BA 3IOVA 3KJTA 1MY2A 1Y4TA 4ESWA 1SD3A 2O51A 2P0SA 4ZZAA 3PMXA 1PB9A 1B4ZA 4IY6A 2XXTA 1VSOA 4U23A 5ICQA 2CMOA 3LSXA 1PDAA 3IL1B 1IXHA 4OVJA 5CRYA 1ZU0A 3O66A 4Q0CA 3MP1A 2XXUA 2AL4A 1B40A 3G3HA 1IXGA 3G3FA 3JYRA 3RLFE 3KSJA 2OCUA 4YKIA 2YLNA 1HSEA 3FIRA 3BBRA 5H8HA 4F3GA 3TTRA 3VLUA 1Y3PA 2F6PA 3MAMA 1L5TA 1EZ9A 4NTLA 3FXQA 3T9HB 5K2XA 2IA4A 2DE2A 4IO6A 2QS3A 1SVXB 4AB5A 3C33A 1B1XA 4GQOA 2I4BA 2I6EA 4R2BA 4R6KA 4U1OA 3OELA 3K02A 2XHDA 2H5YA 1FCKA 4NF5B 3N94A 2FA7A 2R71A 5KCJB 4ZEDA 1RKMA 4YB5A 1URGA 3K4UA 1QUIA 3V89B 4Q5TA 4KYDA 4KYEA 5L8DA 1B7UA 3TTMA 1USYE 1LCFA 1M5BA 1NL5A 4PETA 2THIA 2Z22A 3RN8A 1B4HA 1O63A 1QKAA 4EXKA 4YAHX 3LBSA 3ONMA 3FVKA 3IB1A 5CMKA 3I5OA 1S9TA 3IO6A 3MVYA 2F78A 2ABHA 2F7BA 5KDTB 4LUBA 3VXCA 3T96B 3VFJA 3MZ1A 3VE1B 1JQFA 4DE8A 4PFTA 3HCQA 3HHFA 1US4A 5FHOA 1ZBMA 3IR1A 1LGBC 5CM6A 2OK2A 3TFLA 4RA1A 2RC8A 1MQGA 4NMYA 1I6QA 1OIBA 3C4MA 3H6VA 1YAEA 3MVXA 5KCJA 5JTYB 4KPTA 4F1UA 2QS2A 4AQ4A 3VDFA 4G68A 2V3QA 3RTWB 3OO7A 1LLSA 4TLLB 2QL3A 2A5TB 3OSQA 4IO3A 2O6AA 3MP6A 4RPOA 1B0LA 4BDLA 4IO2A 3LSLA 2DWIA 1B32A 5A5XB 5I2NB 3S2VA 1NFTA 4KCDA 2AL5A 2GHAA 1Y20A 4QSEA 3CFXA 1MXUA 5KDTA 4WEDA 1FTKA 4ZS9A 2O1MA 4FIMA 2XXVA 4JSDA 3Q26A 1Q1KA 3LUYA 3WAEA 3EPEA 4R2FA 2NOOA 3K1NA 1O7TA 4TLMB 3H6WA 4EUOA 4NWCA 5AA2D 4O3AA 3KEIA 3LC8A 3UN6A 3FZVA 4Q30B 5DT6A 1EZOA 1RYOA 1NH8A 3BFTA 3MPKA 4QFPA 3FJ7A 3H6UA 4GRKA 1BTJA 2A5TA 4IO5A 3FV2A 1UTBB 1NNKA 1ZLQA 3MUQA 4G8MA 3JZJA 4ISUA 4OFJA 4XXUA 1D9YA 2B65A 4QHQA 4LZ5A 2XXQA 3ECRA 4LVQA 3SEVA 5EHMA 3W15C 3FASA 5ELVA 1I6BA 3QIMA 1H45A 1FQAA 3L6GA 3IAZA 2VP1A 1MPBA 1OQGA 4AB6A 1N7WA 3A3UA 1WDNA 4U22A 4C0RA 4F31B 4OWDA 4ELQA 3A09A 3O6IA 3G3KA 4F3BA 1Y1ZA 3C9HA 2HCAA 5JK4A 3OSRA 1JEUA 3H6TA 3EHUA 4Z7EA 2UYEA 1JEVA 2UYFA 1Y4CA 4ZEKA 2H98A 1UTBA 3V8XB 5H8NA 2PX1A 1OLCA 3CFZA 1FTLA 2ZYMA 4POWA 1H76A 2OZZA 2AIXA 2UXAA 2VD2A 2XD2A 4ECFA 3TYHA 1FQBA 2Y7RA 3SEUA 3QUJA 1JNFA 3OO8A 1TWYA 1OMPA 1LB8A 1B46A 3PUWE 1LBCA 4EXLA 1DPPA 1HSJA 3PUXE 2QS4A 2R6GE 4WKMA 3PPQA 1NH7A 3MVWA 3TELA 3O97A 1MXVA 3MW0A 3OO9A 3W9WA 1EH3A 5H8QB 1QKBA 2Y7WA 1LAXA 3GXAA 2XXXA 1JW4A 1N84A 3K1PA 4OQOA 3RTFB 3IJXB 3GZGA 1B58A 5AA4B 1YPNA 4FAJA 3U1OA 4MF3A 1GGGA 1Y3NA 1JW1A 1BIYA 1D9VA 1MXWA 4X1DA 4GD5A 4F3SA 4OZ9A 1GR2A 4POXA 4YKKA 4ZZEA 4H8IA 5M2VA 4GXAA 4HCWA 4N07A 3PUZE 1AMFA 4WEPA 1N3XA 1A99A 3N6UA 2ZNTA 2RF1A 2GFEA 4HTGA 3O6GA 4BDQA 1A40A 5AA3A 2QRYA 3TODA 3B6QA 1SW1A 1FQEA 4F1VA 1FW0A 1M5DA 2KLFA 3PMWA 5H8QA 2ONSA 1OLAA 3M3KA 5CBRA 2I0BA 5CMBA 1XHYA 4QSCA 4NF4B 2ZXTA 2H25A 3C32A 1AOVA 1IUDA 3O9PA 4OFOA 4RK2A 3DP4A 1CB6A 5CMMA 4THIA 1MQDA 4DCYA 1BP5A 1A8FA 4R72A 2DWHA 4N6PA 1NNFA 2PMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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