5HPQA

Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from pseudomonas aeruginosa bound to acetate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWLEYRWPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
publication title Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa bound to acetate
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
total genus 85
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA02
3T9VA 3K1NA 4Q8RA 1IXHA 1ELJA 3Q26A 3KSJA 3O29A 3TFLA 3MBPA 4TQUQ 3ECRA 1P1QA 1F9BA 3D4CA 4KD5A 2B3FA 1IXIA 1NMUA 2HZKA 4F29A 3MPLA 5EHMA 3PPPA 2NOOA 1Y20A 4DXCA 2E0SA 3OEKA 3RTFB 4ELOA 2F6PA 4RJZA 3TMGA 4F3PA 2Y7IA 3PUWE 4HW8A 4G2ZA 2XD2A 5LOMA 1R6ZA 2X7PA 2PT2A 1FQAA 4OTEA 2PBWA 4NWCA 3RT8A 1YPNA 5DYHA 1NNPA 4QSEA 4POWA 1Y3PA 1GGGA 3G7WA 4QFOA 3K00A 3RLFE 2FA7A 3TQLA 4NF5B 1MY4A 5HM4B 4ZZAA 4R75A 1MXUA 3CFZA 2DE2A 4RPNA 1MDQA 4Z0IA 2RCAA 1NFTA 1DOTA 4N07A 4PQJA 3T93B 3OOAA 1FTOA 3RQTA 5I57A 1MY3A 3B6WA 4GWOA 3RGYA 4DCXA 1UQWA 2CMOA 2ANJA 1SW4A 2DSFA 4TLLB 3OELA 4L17A 3KN3A 4U4XA 3FJ7A 1SYIA 2P0SA 4NTLA 3MP1A 4G4PA 3UORA 4F31B 4GLIA 3H6TA 4G68B 1VFDA 1XVXA 4UACA 4YICA 1NL5A 3LSLA 2XXRA 5TP9A 3U92A 3E3KA 1XOCA 2QL3A 1B58A 1OQHA 1MY2A 4E0XA 5I2NB 1TFDA 4PFTA 3R26A 4BDMA 1AL3A 4EXLA 3TTLA 3FVOA 5DVJA 4RXLA 5H8QB 1ATGA 1TXFA 5A5XA 3B6QA 2F7CA 3FXUA 4F18A 4F1YA 2GRVA 4RK9A 1J1NA 1JVYA 4ESXA 1EH3A 1AMFA 4JWYA 2F5XA 3FUZA 3K02A 2D21A 4JSDA 1FTMA 3Q29A 1H76A 4ZEFA 2XXYA 4EXKA 2V25A 4ZE8A 3PPRA 3K0VA 2RC8A 3MZBA 2DWIA 1Z7ME 3KOSA 3VLUA 4IY5A 3CI8A 3JV9A 1VE4A 4FIMA 1OLAA 4BLAA 2DE3A 3IR1A 3JYRA 3FJGA 1SYHA 3OENA 1PBPA 2ZNTA 1SQYA 3U93A 4QSDA 3VVFA 2O6AA 2XXXA 3TELA 1MQDA 2RC7A 2F8DA 1B5JA 3FATA 3ONMA 3KG2A 3VDFA 1US4A 5ICQA 4F3SA 2O1MA 5HPQA 1LAHE 1MQGA 1EU8A 1A54A 5ITOA 3TCGA 2HQ0A 4OEUA 3G3JA 3TZAA 4ZEKA 4ISUA 1ANFA 4X1DA 4GXAA 4DLDA 3MWBA 4GL8A 4DXBA 1VR5A 1LAXA 3GZGA 4U1OA 5I2KA 3S9MC 3EHSA 4OERA 4TLMB 1B3LA 3LUYA 4M1VA 1S7YA 2QPQA 4I8CA 1SVXB 3DP4A 2ONKE 3VE1B 2QJEA 4XKPA 4BDRA 1LFGA 4WEPA 1MQHA 5AA2B 1B1HA 3USDA 4X1BA 1GVCA 1UTBA 2I48A 4DIGA 4ELQA 5CBRA 5CRYA 1OLCA 3UN6A 2A5SA 3GLBA 4NF6A 1AOVA 3IOVA 3C36A 1IIWA 4KCDA 1QJMA 3TEPA 5I57B 2F35A 3MVXA 3IO4A 3PV0E 2DS9A 4OZ9A 1Y9UA 1ZKBA 2DWAA 2DOJA 3ZS6A 3S9NC 4WXJA 3KBRA 2QSXA 4XKRA 4LZ5A 1OQGA 4YMAA 1P99A 4WKMA 4JSOA 2Q9TA 3PUVE 5CMCA 1M5CA 1B9JA 3K6WA 2XXPA 1R9LA 1ZMGA 3SEUA 4EQ9A 1POTA 3MZ9A 4GF8A 1L5TA 2DWHA 1JNFA 5I58A 3O6GA 3KOTA 3CRBA 2V3QA 4M4GA 3RT6B 2XX9A 2I58A 3O2AA 5TP9B 2H99A 3A3CA 1N04A 2AL5A 1MXYA 2F78A 1D4NA 3FV2A 4THIA 4ZZEA 4XXUA 2UVJA 3G3HA 3ODBA 5A5XB 4TOZA 3V83A 4FECA 3Q28A 3FVKA 4FJPA 2UVHA 1H44A 2THIA 5B70A 1P1UA 3HHGA 1BIYA 2DE4A 1JEUA 2XXTA 1JETA 4KYEA 4G8MA 2PT1A 2AL4A 3LSXA 2V93A 2X26A 3L6GA 1PDAA 3H6WA 4IY6A 4NE4A 4H5FA 1B05A 5CMMA 2VGQA 3PGFA 1YAEA 2VD2A 4GOTA 3RPWA 3CR9A 3H4ZA 4F1VA 1JW5A 3H6UA 4HCYA 1MH3A 1SW2A 2R9JA 3E4RA 1MM6A 3OO6A 1B2HA 3KN7A 4OFLA 2ZYKA 3U1OA 4NMYA 3TKDA 3QK6A 4NF8A 2OJTA 2G29A 1D9YA 1OVBA 3N5LA 4GD5A 2XX8A 1MXXA 2Q8JA 5EYFA 4R6YA 4EDPA 2ONSA 3IJXB 3EQ1A 4H0WA 3T9HB 3IX1A 4EF2A 4H1XA 4MLVA 1RYXA 1HSLA 5CMKA 5CI5A 5H8NA 4XKQA 2RINA 3I6VA 1NH7A 2LAOA 5I2KB 3OMBA 3TTNA 4FE8A 2HAUA 5F7VA 3O9PA 1A99A 1SI0A 3IOUA 3MPKA 2B65A 2RKMA 1II5A 4ELPA 3HSTA 1A8FA 3GBAA 2ZXTA 4IB2A 3DP8A 2ZYNA 1LB9A 1UTBB 4EQ7A 4RK2A 4U22A 3EF7A 2REGA 3WAFA 1URDA 2XD3A 3FV1A 1MQJA 3KEIA 4BDLA 1P1NA 3UGWA 3IOTA 3K6VA 4NF6B 4F3GA 1LSTA 3A09A 4ZDMA 1B4ZA 3N6UA 3S4UA 3EHUA 3K4UA 1FW0A 1A7LA 1NNTA 4DCYA 4O3AA 4F39A 4LVQA 2Q2CA 3O6HA 1YCJA 3PPOA 1TT1A 5DT6A 4GIZA 1B3HA 3MZ1A 3RN8A 2W7YA 4YB6A 5ELVA 3SETA 3T22A 5F1QA 3T9UA 1QULA 3C4MA 1I6BA 2F6GA 3IB2A 3H3GA 3O28A 1I69A 2DXRA 5K2YA 3DP6A 3IJOB 3BFUA 2FYIA 3IORA 2HAVA 3CSBA 5I58B 3I3VA 5ISUA 2DYXA 2HCAA 1D9VA 4I1DA 5HBCA 1PC3A 4YMBA 1Z7NE 5J1DA 4QFPA 2YJPA 5AA4B 5KCJB 1IZ1A 1N84A 1B51A 1LAFE 4Q30B 3ZKKA 5L9OA 3PUYE 2X7QA 3MVWA 3MQ9A 3C9HA 2OBGA 2Z8DA 4LATA 1A55A 4YKIA 4IO3A 4EUOA 1FTKA 1ZJLA 4KCCA 2QS2A 3PD9A 3FVGA 1M5FA 1EZOA 3V5AA 3JZJA 1EZ9A 3O6IA 2OWSA 1O63A 1JQFA 3E9XA 2OK2A 1SW1A 4OXVA 1LFIA 4POXA 4U23A 4FORA 4PFYA 2A5TA 4JBZA 4EF1A 2PYYA 2H98A 3FXRA 1HSJA 4KYDA 2M8CA 3E13X 5H8HA 3VLVA 4IGRA 4OESA 2DP8A 2H9BA 3WAEA 3G3FA 4IO7A 3CG1A 4P11A 1LBBA 3MP6A 2Z8FA 5AE4A 1B32A 5DTBA 4NF8B 3CSGA 5KDTA 3T9XB 4GQOA 1URGA 4QFNA 4C1TA 1ZU0A 2F7BA 4GL0A 4X9TA 2XHDA 5BWJA 3T96B 1QUIA 3S9EA 1CB6A 5AA2D 1UIUA 1XS5A 5H8NB 4F1UA 1B6HA 3TCFA 3MW0A 2HEUA 3KJTA 3LR1A 2HXWA 1CE2A 1PEBA 5BUUA 3FZVA 1Y4TA 4LZ7A 4OETA 4ZEDA 4C0RA 1B7ZA 3MJNA 5FHOA 2E1SA 2I0BA 5JTYA 4G8NA 5FTHA 3IL1B 3M8UA 1H3DA 3QSLA 3VVDA 3PU5A 2GFEA 1DPPA 1XVYA 3ZSFA 3KZGA 3SEVA 4OHNA 4LONB 2R6GE 5IAIA 1N3WA 4IO4A 4YZZA 3GBBA 4FEBA 2I4BA 3FXQA 3SDFA 4YKJA 2XXHA 1NKXA 3V89B 1B4HA 3TUSA 2GHAA 1PB8A 2Y7PA 3THIA 4RNSA 1USYH 4NEDA 2V84A 3CFXA 5TPAA 1JEVA 3LBSA 2O1LA 3SESA 4U1ZA 1GR2A 3FGSA 1QVSA 5KZTA 2IA4A 5M2VA 2DWJA 1N0TA 3KFMA 3VVEA 1MG1A 1WDNA 3AXFA 4I62A 3M3KA 5L9MA 3BFTA 3EHTA 4RA1A 1MXVA 2OZZA 3MC2A 1DMBA 4R6KA 4O3CA 3SERA 5AA1A 4U21A 4MH5A 2QRYA 1MY0A 2HFBA 4IGTA 1MH4A 3FASA 3C32A 3K1MA 1GTKA 2H25A 2Z8EA 1N7WA 3Q27A 3HCQA 1FQBA 5B7DA 2B3BA 5DVIA 3H6VA 1S9TA 2I49A 2FNCA 4RYAA 1LCTA 1Y3QA 3TCHA 4R6HA 4PE5B 3RTWB 3T66A 4XTCQ 3OO8A 1YTVA 4JWXA 1B1XA 3C33A 3K6UA 5I84A 5EHSA 3TPAA 1IITA 2V3TA 1HSEA 4R2BA 3TQWA 1IQ7A 4KI0E 3S9LC 1SI1A 3SEXA 3U94A 2DXYA 1A40A 1S50A 3DM0A 1GV8A 3O66A 3PPNA 2RF1A 2XXVA 2OCUA 1LAGE 1R1NA 3TDJA 4H5GA 4P0IA 3G3KA 4Q0CA 5H8HB 3UA8A 2KLFA 3MP8A 1Q1KA 2I6EA 3IOWA 1BLFA 2ZYMA 2YLNA 1DSNA 4QSCA 2I4CA 3FVNA 3W9WA 3V8XB 3TYHA 4QF9A 5DEXA 3U8QA 2Y7WA 4H8IA 4G8HA 3HHFA 3TTRA 3VV5A 2GH9A 2UYFA 4R73A 3KN8A 4H8JA 4JB7A 3K2DA 2PX1A 2Y7RA 3W15C 1TWYA 2XXQA 3CFLA 1FQFA 1FQDA 1QKAA 4OENA 1ZBMA 2ZMBA 1JW4A 2HZLA 1D3KA 3K1PA 1N7XA 5FHNA 3RNNA 3BKIB 3K01A 1B46A 1NNKA 2UYEA 5I56A 4O3BA 5H8SA 4PFWA 4KYSA 3C31A 4R2FA 4U2RA 4YAHX 2RC9A 1ZLQA 3R7XA 3RY3A 3FD3A 5JTYB 1Y4CA 2P1SA 2O7UA 3QXMA 5CC2A 2ESNA 4KFQA 4F19A 4G68C 2F36A 4PFUA 2VD3A 1OIBA 2VOZA 3UIFA 3IAZA 3UP9A 3BBRA 1LFHA 2GHBA 2DVZA 5ITPA 3FIRA 1XHYA 4XKNA 3PMWA 3D4GA 1KWHA 4KPTA 5AA2A 4QFLA 3MVYA 5TPAB 1US5A 1I6QA 3SKPA 3IB0A 3VXCA 3OSRA 2Y84A 2PMSA 1AH5A 4F3BA 1MS7A 3HV1A 1RYOA 5H8FA 1IXCA 2H4IA 1MRPA 4LUBA 4KQPA 3RUMA 1P1WA 2OWTA 4U4SA 4ESWA 2NXOA 5I59A 1UTHA 2V3UA 4H67A 5CBSA 2OLBA 3G3GA 4K3FA 3TTKA 3R6UA 1QUKA 2I0CA 4GFRA 2DQVA 1M5DA 3M3LA 4NF4A 3SEWA 1WVJA 4RPOA 4DXUA 4ZE9A 3IK6B 4EQBA 2XXUA 3C34A 5DVFA 1ZIUA 4LP2B 3F11A 4IO6A 4YKPA 4F22A 4E0WA 1SBPA 2F7AA 3HPIA 4IO5A 3LSFB 2O69A 3ZKLA 4ZEIA 4R72A 2O84X 1JW1A 1MPDA 1B3GA 1B7HA 1EZPA 3OD7A 2Y7KA 3SEYA 3LC8A 4MF3A 2REJA 4JWOA 1H45A 1MPBA 3VXBA 2BJJX 1B5HA 2QS4A 4BDQA 4MLQA 1O64A 2ZYOA 4PETA 3N6TA 5K2XA 4F2OA 2AYSA 3UK4A 1VFEA 5AA3A 2NWJA 3P7IA 4QRZA 3VLWA 4PP0A 2Q88A 3VFJA 4OVJA 4FEDA 2XXIA 2Z23A 5DEXB 2G93A 2H5YA 4JDFA 4JXIA 4R74A 3PUXE 3TODA 3QUFA 1MDP1 1NH8A 3I5OA 4X48A 3B7DA 2ONRA 3GXAA 4P0GA 2VHAA 3QAXA 1B40A 4Z7EA 2R71A 1MM7A 3QYTA 1O7TA 3MVZA 3OXNA 1B0HA 2D3IA 4LQ5A 4H65A 4N6PA 3Q25A 3H03A 1VSOA 4NWDA 3IB1A 2YPNA 1QW0A 2RCBA 3EN3A 1URSA 5I56B 3OO7A 1T0KA 2QMWA 4RY1A 1BP5A 2XX7A 2UXAA 4HS7A 4UA8A 2NUVA 1M5BA 1XC1A 1MY1A 3OO9A 4GRKA 5IKBA 3OSQA 4YB5A 3S2VA 1SD3A 1QKBA 4ECFA 3PD8A 4WEDA 4DDDA 1OVTA 3O97A 3HO7A 1B5IA 3KGCA 3PMXA 1FQCA 4MBPA 1WODA 3CG3A 2Q2AA 1SW5A 2QMXA 2ZNSA 4FATA 1M5EA 4MFIA 2UVIA 4YU0A 1B3EA 3OEMA 4YKKA 4IO2A 2QS3A 3LSWA 1B3FA 3HN0A 1Y1MA 1BTJA 1FQEA 4R9GA 4C1UA 1N3XA 3KSXA 4AB6A 3IO6A 2VP1A 4ZEBA 3DELB 2O68A 2D5WA 5H8FB 4NF5A 4H6DA 4LZ8A 1PB9A 1MXZA 5FTIA 4ZS9A 1MPCA 4ELRA 1FCKA 2NVUB 5I59B 1UTHB 1R9QA 5TU0A 5FHMA 1LGBC 2XXWA 4QHQA 4OFJA 3N94A 4DZ1A 1FTJA 2Z22A 5L9SA 1NNFA 4LQ2A 1DTZA 2I3WA 3A3UA 4NF4B 1OMPA 1LLSA 4KR5A 2QS1A 3B6TA 3M3FA 1IXGA 1MQIA 3ILUB 2IEEA 4OEVA 3MUQA 1MXWA 4N13A 4QFKA 1B0LA 1LBCA 2O7IA 3G3IA 1PB7A 3H7MA 1IUDA 1QUJA 2I3VA 2ZNUA 4XIGQ 5L8DA 4F2QA 4G68A 1H43A 2ALUA 4YB7A 1JVXA 1PBQA 3KJ7A 1ZTYA 2F34A 1UIVA 3FJMA 5AA4A 5KCJA 4ONYA 2CZLA 3L6HA 3EPEA 1P1OA 3W9VA 5I2NA 2O51A 5JK4A 4ZECA 4KHZE 1Q35A 4BDNA 1SDXA 1B52A 5ICTA 3QUJA 4DE8A 3CVGA 5H8QA 4I9DA 4LA9A 3QIMA 3TAJA 2F97A 4AQ4A 2A5TB 4G77A 3MAMA 4OMBA 4GXSB 4HCWA 2UVGA 1USYE 3C35A 1IEJA 1N76A 4OYVA 1LCFA 2Q89A 1Y1ZA 1POY1 3PMVA 4OFOA 1A8EA 2AIXA 1BKAA 2WKYA 1I6AA 5JEIA 1LB8A 5CMBA 2ABHA 3CIJA 5CM6A 1B7UA 4BDOA 5KDTB 4OQOA 1AIVA 1Y3NA 2DVCA 3DLNA 4ND9A 1RKMA 3PPQA 4GVOA 3U72A 4R9FA 4AB5A 3K6XA 3TTMA 1DPEA 1TFAA 2P2AA 3PUZE 4FAJA 2PVUA 1DTGA 3ILTB 3H06B 4OWDA 1XT8A 1FTLA 4Q5TA 3N26A 4HTGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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