5I2KA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA02
5H8NB 4LP2B 3FUZA 1B51A 3B6TA 4PFYA 1WVJA 1BKAA 1IZ1A 1VSOA 3FVGA 4G68B 1OQGA 2OWTA 3LBSA 4DZ1A 1MPBA 2LAOA 2Y7KA 4NF8A 5AA3A 2DSFA 5AA1A 2UVGA 5IAIA 2XXUA 4PFWA 4R74A 4GXSB 4QFPA 3FVKA 4XKQA 3THIA 1MQIA 3IJXB 4IB2A 2QSXA 4F18A 3IO6A 4ELOA 1UIUA 3OD7A 1MG1A 1HSLA 2R9JA 1P1UA 3VXBA 1MQJA 4PE5B 3W15C 3MQ9A 1MY0A 2O1MA 3K0VA 3RUMA 3LSFB 5EHMA 3RTFB 5A5XA 4Q0CA 2DYXA 4QSEA 3PPOA 1WODA 4GL0A 4FEBA 4WEPA 4U21A 4LUBA 4G2ZA 5L9SA 1N3XA 3CIJA 4RNSA 1MXXA 4U4XA 3PPNA 1A55A 4ELQA 2ZNTA 3V8XB 1XVXA 5H8FB 1JW5A 4OETA 1MXVA 3LSWA 3HN0A 3E13X 4R9GA 3PV0E 3PD9A 2PT2A 1GR2A 5DVFA 2REJA 2VP1A 4R6YA 1FQCA 3CR9A 3K6VA 5DT6A 2ESNA 4KCDA 1JETA 3EN3A 3PGFA 2ONRA 4JWYA 1LCTA 2F78A 1SBPA 4RY1A 4LATA 5M2VA 4F29A 2HQ0A 4F3GA 4OYVA 4KQPA 3TODA 1N3WA 3RGYA 2HCAA 2H4IA 3BFTA 4NF8B 4G8MA 3FVOA 4KCCA 1B7HA 2O7UA 4GOTA 1USYE 2H99A 2W7YA 3IO4A 4OFLA 2HEUA 3UIFA 2E1SA 3B7DA 3K01A 5H8SA 2XD2A 5CM6A 1ELJA 2VGQA 1QKBA 2E0SA 2RKMA 4F3SA 3M3LA 2HFBA 1RYOA 2QPQA 1JVYA 4XXUA 4GQOA 4OFOA 5A5XB 4IY6A 3KN3A 2Y7WA 3MZ1A 5KDTB 4GD5A 4LA9A 1SYIA 3I3VA 2ZMBA 2XXPA 3TTNA 1LAGE 4YB6A 1L5TA 1CB6A 1B0HA 4NF4A 3H6VA 1UTHA 4X1DA 5H8QB 3LSLA 4EQ7A 3O9PA 3E3KA 4OEUA 1VFDA 3KFMA 2PBWA 1B3FA 1T0KA 3OO7A 4N13A 2P0SA 4ZEIA 1B5HA 4ZDMA 4DLDA 4X48A 3Q28A 3VE1B 3IL1B 5JK4A 1LBCA 1FQFA 4OMBA 1IQ7A 3IB1A 3Q25A 3C4MA 2VD3A 2Q2CA 2RF1A 4RPNA 3C9HA 1GTKA 3GZGA 4U1ZA 2F36A 3DP4A 3SEXA 1BLFA 1B58A 4JSOA 4H1XA 1SQYA 4YU0A 2XX9A 3FASA 2Q2AA 4KYDA 3TTKA 1UTBA 1P1NA 3GLBA 3K4UA 2V3TA 1Y9UA 4ELRA 3QSLA 1B52A 4AB6A 4G8NA 4XKRA 2CZLA 3PMWA 4OERA 1NNTA 1M5FA 2Q88A 3UP9A 4TLLB 3TCHA 4EDPA 1NH8A 3G7WA 1B40A 2XXRA 5I2NB 4H5GA 1DTGA 4I1DA 2P1SA 1PB8A 3G3FA 4NF4B 3MC2A 1QW0A 3V89B 1I69A 4QFLA 2QJEA 5CRYA 3R7XA 3FVNA 1OLCA 3CI8A 5AA2A 4QRZA 4LQ5A 3N94A 1JNFA 3U93A 3TEPA 3DP8A 2DE2A 2O1LA 3TZAA 1B05A 5AA4A 3ILUB 3ZKKA 3HSTA 4F22A 3EQ1A 3MVXA 3FJMA 5DVJA 3HCQA 1VFEA 4OZ9A 3CVGA 4ZZEA 2NOOA 3MPKA 3MWBA 2DE3A 3K6WA 3P7IA 4HCWA 2ZYOA 4KI0E 1M5CA 4LONB 4FIMA 3EPEA 4YKKA 3I5OA 3TMGA 4ISUA 2KLFA 1FQAA 3SEUA 4N07A 4QFOA 1MPCA 3A3CA 4Q5TA 2R6GE 3HPIA 3TFLA 2V25A 4MBPA 4PFTA 1UTBB 4ELPA 4Q8RA 4ZE9A 5ITPA 2ZYMA 4OXVA 1PBQA 3PUVE 4IO5A 1MPDA 3O2AA 2Q9TA 2PX1A 4GWOA 1N7XA 1URSA 4ZEDA 2YLNA 1GV8A 1URDA 1ZJLA 2ABHA 5DEXA 3PUWE 1POTA 2UVHA 4F1UA 3ODBA 2X26A 5H8HB 4KD5A 1SW4A 3MPLA 2I6EA 1I6QA 1ATGA 1FW0A 3G3KA 3N6TA 4NWDA 3G3HA 5TU0A 1N84A 1SYHA 2QS2A 2UVIA 5AA4B 1SI0A 2OZZA 4NEDA 4EXLA 4ONYA 4YMAA 3I6VA 4ESXA 3LUYA 2F6GA 1TFDA 3K1MA 3S4UA 3A09A 3CSGA 1LFHA 2NUVA 4OESA 1A7LA 4JSDA 3Q26A 4RK9A 3MJNA 4QFNA 5ELVA 1IEJA 3T9UA 3RTWB 4RJZA 2F6PA 1IXGA 1H3DA 3RNNA 1QULA 2RC7A 2NXOA 1XHYA 3ILTB 1OQHA 5FHOA 3TQWA 4ECFA 4KFQA 1PEBA 5I58A 4G4PA 3UA8A 1J1NA 3O6GA 3SEWA 4G77A 3TELA 4Z0IA 2CMOA 1B5IA 2DVCA 2BJJX 5ICTA 4U23A 3E4RA 4OFJA 4GLIA 1MY4A 2ZNUA 2GH9A 2AYSA 3JZJA 3SERA 3U1OA 3TPAA 4F3BA 1P1WA 1S7YA 3EHTA 2I48A 2I49A 2DWHA 3EHSA 5DEXB 4KYSA 1Y4CA 2PMSA 4GIZA 1OVTA 1LFIA 1LAHE 5JTYA 4H67A 4YB7A 3KGCA 2XXTA 1A8FA 3T22A 3PU5A 3CFXA 1NNKA 2FA7A 4O3AA 1PBPA 1LFGA 4PFUA 2XXVA 1YTVA 5CMKA 4DIGA 3BBRA 4NF5A 2DXYA 1OLAA 3SEVA 1II5A 1NNPA 4I8CA 1FTJA 3O28A 1F9BA 2QS3A 2I4CA 4DCYA 3USDA 3C36A 2QRYA 2XX7A 4HS7A 3UN6A 5HPQA 5CBSA 3VLUA 3C33A 4BDMA 4O3CA 1NMUA 3QYTA 4R6HA 3E9XA 3IR1A 1FTKA 4BDRA 1N7WA 2R71A 3M8UA 1TFAA 4F39A 1A40A 1NKXA 1VE4A 1EU8A 3CG1A 5DYHA 5TP9A 5I58B 3OSQA 5KCJA 4R75A 3N26A 2AL4A 4WXJA 2QMXA 3FXQA 2DWIA 5AE4A 1M5BA 2F7AA 5CMCA 1PC3A 4F1YA 3ZKLA 3L6GA 5J1DA 3UORA 3TTRA 4R6KA 4ZECA 2GHBA 3U8QA 2DOJA 1A99A 1XT8A 4ZZAA 4ZEBA 3CFLA 3QUFA 3MBPA 3QXMA 1B1HA 1IXIA 1DPPA 3SETA 5L9MA 2VHAA 3VLWA 1XS5A 5JTYB 3TTMA 5CBRA 4F31B 4BLAA 2I58A 3ONMA 4G8HA 1DSNA 1ANFA 5I59A 3H6TA 4HTGA 3VVFA 1PDAA 4XIGQ 1URGA 2DWJA 4RPOA 4ND9A 4YKJA 1B7ZA 2G93A 4EQ9A 1N04A 4XKNA 4NF5B 2Q8JA 3PUYE 2REGA 3T96B 1HSJA 1B2HA 1NH7A 3L6HA 4RK2A 1Y20A 3H7MA 4F2OA 3PUXE 4G68C 4ZEKA 3GBBA 4N6PA 3PD8A 3TYHA 3MP8A 4RA1A 4MF3A 4R2FA 5EHSA 3BFUA 5IKBA 3K1NA 1EZOA 5TP9B 3FD3A 1B0LA 3FATA 1LBBA 2THIA 4GL8A 1MY3A 1ZIUA 2A5TA 4E0WA 4NTLA 4LZ7A 1EZPA 4IO3A 2YPNA 4PETA 4XTCQ 3PPPA 4I9DA 2QL3A 3VDFA 3K6UA 1JQFA 2Y7RA 5AA2D 4AB5A 1JEUA 1MY1A 3WAFA 4R72A 2V3QA 3DLNA 3OO9A 2V3UA 3R26A 1H43A 3VVDA 1SW5A 1SW1A 2F8DA 2AIXA 2UYFA 4MLQA 1MXUA 3IOTA 2F97A 2O84X 3KJTA 2Z23A 5CMBA 4H8JA 3LC8A 1YCJA 4H65A 3FZVA 5I59B 2QS4A 1AMFA 4X1BA 3VVEA 1B4HA 3K00A 2GFEA 3PMXA 2V84A 3TAJA 2RCAA 3N6UA 3LR1A 2IEEA 1ZMGA 4C0RA 1R6ZA 3IAZA 2F34A 1MH4A 2XXQA 3OENA 2DVZA 4NMYA 1UTHB 3VXCA 3OOAA 3O66A 4BDOA 4HCYA 1BTJA 5ICQA 2OJTA 2O7IA 2O68A 3PPQA 5K2XA 2ZYKA 2F7BA 4OVJA 2RC8A 1O63A 3OSRA 1Y1MA 3KG2A 4GF8A 4LVQA 3FIRA 1FTMA 1NFTA 2V93A 3HO7A 2Y7IA 2Z8FA 1RYXA 4IO7A 1MM7A 3IK6B 2VD2A 3CFZA 1AOVA 1D4NA 1B6HA 1S50A 4JWOA 3VLVA 4YMBA 5I2KA 2A5TB 5FHNA 1M5EA 2Z8EA 3Q27A 2FYIA 4LZ5A 3IB0A 1O64A 4OTEA 4FEDA 4JDFA 4QSCA 1FTOA 3K02A 3DP6A 3IB2A 3IJOB 2F7CA 3PMVA 4IO2A 3MUQA 3TDJA 4MFIA 3OXNA 4JXIA 4EUOA 1IXCA 1Y4TA 1ZLQA 3IORA 1BP5A 1H44A 5I57A 2HZKA 1QUIA 4FE8A 1LAFE 3C35A 3CRBA 1POY1 4G68A 3KN7A 4DXBA 2VOZA 3W9VA 3KBRA 4QF9A 2HZLA 3M3KA 1P1QA 4KR5A 4R9FA 3K1PA 5B70A 4C1UA 3RT6B 3M3FA 1B5JA 4Z7EA 2Z22A 1ZU0A 3FJGA 5LOMA 4UA8A 4YKIA 3KJ7A 4ZE8A 4BDQA 5AA2B 4L17A 5FTHA 4DXCA 4U1OA 5I84A 1MS7A 4IO4A 5JEIA 2UVJA 3GXAA 2P2AA 4TOZA 5DVIA 1GGGA 3FXUA 5FTIA 1N76A 4QFKA 3RLFE 4U22A 1SW2A 3QK6A 2XXHA 2OLBA 5I2KB 3BKIB 3MAMA 4FAJA 4P0IA 1MXZA 3FV1A 4YKPA 1MQGA 4E0XA 4H5FA 3JYRA 2XXWA 3S9NC 4QHQA 2I0BA 1P1OA 5DTBA 1QUKA 2YJPA 2ALUA 1LCFA 1JW1A 3KSXA 2OWSA 3KOTA 1OVBA 2OK2A 2XXIA 4ZEFA 3HV1A 4IGTA 1WDNA 1IUDA 4OQOA 1DTZA 4JBZA 5I57B 3RQTA 1LGBC 3U92A 2F35A 4ZS9A 3ECRA 1SD3A 3T66A 5BWJA 1MY2A 2DS9A 4C1TA 1JVXA 3LSXA 2HXWA 4M1VA 2PYYA 5CC2A 4H6DA 3O29A 3SESA 3HHFA 1OIBA 1US5A 2PT1A 1A54A 2RC9A 1LSTA 4NF6A 1FQDA 1DPEA 4PP0A 4EF1A 2XXXA 4JWXA 4PQJA 4P11A 3H4ZA 3K6XA 3IOWA 4AQ4A 3PUZE 3TTLA 4FATA 3RT8A 4FORA 1GVCA 3S2VA 5KDTA 3IX1A 4POXA 3RY3A 3OELA 2X7QA 3H06B 1B1XA 3C32A 5BUUA 2M8CA 4YZZA 3EHUA 1R9LA 4EXKA 3VFJA 1D9YA 1SI1A 3MVZA 3OEMA 1ZBMA 1QVSA 5H8QA 1LAXA 4KHZE 1AIVA 2ONKE 1B9JA 1FCKA 2OBGA 3CSBA 1VR5A 4JB7A 3MVWA 3H03A 2ONSA 2XHDA 1UQWA 5F7VA 2Z8DA 4WEDA 1Z7ME 4MH5A 3H6WA 2QS1A 4EF2A 3TUSA 4TQUQ 3A3UA 1QKAA 2I3WA 1MDQA 4YAHX 4BDLA 1B4ZA 3S9MC 4OHNA 2DE4A 2DQVA 1EH3A 3HHGA 2D3IA 3C34A 1QUJA 1B46A 3F11A 3IOVA 1TWYA 4KPTA 1Z7NE 2RINA 1AL3A 3U72A 2DXRA 1ZTYA 1XC1A 4U2RA 4Q30B 3SEYA 1MQDA 5FHMA 1NL5A 4NF6B 1TXFA 4RYAA 1LB8A 2IA4A 3KZGA 4QSDA 3U94A 2DWAA 1Y3PA 1P99A 4IO6A 3G3GA 4POWA 3FGSA 1YAEA 1PB9A 3QIMA 2G29A 3GBAA 3W9WA 2ZNSA 5I2NA 2I3VA 2AL5A 1YPNA 3T9VA 1UIVA 4DCXA 1EZ9A 3T93B 3KOSA 4OENA 4TLMB 3V83A 4K3FA 1MDP1 3S9LC 2D21A 1S9TA 2OCUA 3SKPA 2UXAA 4WKMA 2ZXTA 3TKDA 2H25A 4DXUA 1B3LA 3VV5A 1A8EA 2B3BA 4RXLA 2PVUA 1JEVA 5HBCA 4H8IA 5KCJB 4I62A 1Q1KA 4XKPA 3K2DA 4P0GA 4R2BA 3DELB 3TCFA 2A5SA 4UACA 2FNCA 4F1VA 3O97A 4EQBA 1ZKBA 3N5LA 4YICA 3FV2A 4KYEA 1AH5A 1I6BA 1CE2A 1MM6A 1QJMA 1SVXB 1LB9A 2GHAA 3CG3A 3UK4A 3B6QA 2X7PA 2F5XA 1B3EA 1M5DA 3RPWA 5K2YA 3O6HA 4X9TA 4OEVA 2XXYA 4GVOA 2Y7PA 3V5AA 1IIWA 3H6UA 2I0CA 1MQHA 3T9HB 1HSEA 5TPAA 2QMWA 1Y1ZA 1LLSA 1NNFA 1JW4A 5CMMA 3C31A 3H3GA 4F2QA 3OEKA 3MP1A 3O6IA 5H8HA 1USYH 1BIYA 4DDDA 1RKMA 2HAVA 2H5YA 2B3FA 3S9EA 4DE8A 2WKYA 3FJ7A 2XD3A 3KSJA 4NWCA 1KWHA 3IOUA 5ITOA 1OMPA 2I4BA 2DP8A 4BDNA 3B6WA 5ISUA 1Y3NA 1FTLA 4F3PA 1N0TA 3EF7A 3Q29A 1D9VA 1B3GA 1R9QA 3RN8A 4NE4A 3R6UA 3G3IA 5I56A 4GXAA 3D4GA 5F1QA 1MRPA 4R73A 1MH3A 1FQEA 4IY5A 2Y84A 5L8DA 1D3KA 5H8NA 3OMBA 3KEIA 3SDFA 1TT1A 2NWJA 5B7DA 5HM4B 3AXFA 2H98A 1R1NA 4FJPA 2UYEA 3DM0A 4LZ8A 3UGWA 4F19A 2B65A 4GFRA 1B7UA 1XOCA 3JV9A 1DOTA 4THIA 2NVUB 1Y3QA 5TPAB 3MW0A 1MXWA 4GRKA 3FXRA 1IITA 3WAEA 2GRVA 1SDXA 2O51A 2HAUA 3KN8A 3TCGA 3D4CA 1B32A 2ANJA 3OO8A 3G3JA 4HW8A 1H76A 2O6AA 3MZBA 1O7TA 1I6AA 3QAXA 3MP6A 1H45A 2ZYNA 5EYFA 1US4A 3ZSFA 5CI5A 3MZ9A 1Q35A 2XX8A 3PPRA 4IGRA 4LQ2A 4YB5A 4FECA 4O3BA 3MVYA 1IXHA 1FQBA 5KZTA 4H0WA 3TQLA 1PB7A 1XVYA 2H9BA 2D5WA 5L9OA 4MLVA 5H8FA 3T9XB 4M4GA 4U4SA 3OO6A 1DMBA 5I56B 3QUJA 2O69A 1B3HA 2Q89A 4ESWA 3ZS6A 2RCBA 4OWDA 1MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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