5I2NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA02
1B5IA 4QSEA 3B7DA 1Y4TA 1OQHA 5AA1A 1SVXB 5EHMA 4OEUA 1DMBA 1JW1A 3IO4A 2PBWA 3CFZA 1BTJA 1AIVA 4DXCA 2PVUA 2RINA 2HZKA 4ECFA 2ZYKA 4UACA 3KOSA 4TOZA 4YKPA 2RC7A 1MM6A 4G68C 4HW8A 2ALUA 3GZGA 1UQWA 5JTYA 2QSXA 2IEEA 1M5DA 1N84A 3OSRA 3CG3A 1IXHA 1B0LA 5H8HB 4KYDA 3RUMA 5CMBA 3MJNA 2RF1A 4M4GA 1JVXA 4EXKA 2H99A 3VFJA 4IB2A 3E13X 4OTEA 2I3VA 3U1OA 1A54A 1XVXA 4NF4A 4MFIA 5I84A 2PT2A 5AA2A 2DXRA 1UTHB 1SW1A 3KJTA 4ND9A 3C34A 2RKMA 4DLDA 3JYRA 3FXRA 5AA4A 1LAHE 4G4PA 5B70A 2QL3A 2B3BA 3B6TA 2O1LA 4HCWA 2UVGA 3TQWA 3ILUB 4BDOA 3BFUA 4QFPA 3MZ9A 3TTRA 5KCJA 2AIXA 4R9FA 2VHAA 1H3DA 2DWJA 1YCJA 1P99A 1MDP1 1EH3A 3TZAA 4ZE8A 2OZZA 1SBPA 3KN3A 5IAIA 3QAXA 3OD7A 3VLWA 3RLFE 3OXNA 3VVFA 1LBCA 2OWSA 4EQBA 3O6HA 3VLUA 5FHOA 2OK2A 3HPIA 4MH5A 1EZPA 5DEXB 5EYFA 3H06B 3M8UA 5TP9B 5I56A 4ZEIA 1LGBC 1J1NA 1JEVA 4EUOA 3H6WA 3TKDA 4XKNA 3RTFB 3PGFA 3RT6B 2V3UA 1UTBA 3O28A 1MQDA 3LSWA 2ABHA 5HPQA 4GVOA 1I69A 3RPWA 1D9VA 3CRBA 4U21A 1ANFA 3U72A 2REGA 1CE2A 2UYFA 3N6UA 3U92A 3FXQA 4E0XA 4F31B 4U1OA 1MQIA 4GF8A 3IOVA 3MVWA 3BKIB 3FJMA 3M3LA 2F7AA 2Z8DA 1FQBA 4NF6B 4FATA 1ELJA 4YB7A 1MG1A 1IITA 3S2VA 4LQ5A 2Q9TA 3LSXA 2XXPA 3GBBA 5FHNA 4H8IA 1D4NA 3L6GA 4U1ZA 1LLSA 2UVJA 3IOWA 2XXQA 2DWHA 4NE4A 1OIBA 4WXJA 1B2HA 1USYE 5M2VA 2XHDA 3F11A 4KFQA 2PMSA 3U93A 3L6HA 3R6UA 4GRKA 3MAMA 1B3GA 1GGGA 1VSOA 1S50A 3PUXE 3MW0A 1B9JA 3ZSFA 1PB8A 1N3WA 4YAHX 3TYHA 1B46A 4H5GA 5H8NB 3R26A 4GWOA 2Y7WA 3KJ7A 2M8CA 1B51A 2A5TA 4R75A 3LUYA 4R74A 1QUKA 1N3XA 2OLBA 1QULA 5ITOA 3O97A 2B3FA 4H8JA 1LAXA 3DM0A 2F36A 1EZ9A 2I48A 2XXUA 3PUZE 1M5EA 3B6QA 1OMPA 4XKRA 2F6PA 1MQJA 1XT8A 2X7QA 1SW5A 4F39A 3CSGA 2FYIA 4TQUQ 1R6ZA 4DXUA 3LC8A 1SD3A 1NKXA 3VE1B 3RNNA 5K2XA 3OMBA 5TPAA 3UK4A 4H6DA 4O3AA 3EHTA 3OELA 2Q8JA 3K6VA 1FCKA 4BDNA 3S9NC 5H8HA 5JK4A 3V8XB 3LSFB 2DXYA 3HHGA 5I57B 2Y84A 2HAUA 2VGQA 2P2AA 4OEVA 2OCUA 5JEIA 3CFLA 1WVJA 3PMXA 3WAFA 2V3QA 3PU5A 4LQ2A 3USDA 4F2OA 1ZBMA 4U4XA 4P0GA 3G7WA 2QS2A 4QHQA 1QUIA 1UTHA 3TELA 3GBAA 1SW4A 3IORA 3PUYE 1B32A 4GL8A 2VD3A 3Q28A 4F3GA 1VFEA 2DYXA 3K4UA 2Q89A 5DYHA 2ZNSA 3E4RA 5I2KB 1JW4A 3O6IA 1MXZA 2F7CA 1LBBA 2DP8A 4GXAA 2FNCA 4ISUA 1JNFA 4THIA 2O7UA 4YZZA 3LSLA 4ZECA 4EQ7A 2VOZA 4LUBA 1TFAA 2F78A 4YMBA 1DSNA 2QS1A 3O66A 4NF8B 3K00A 3FASA 4G8NA 3TFLA 3HHFA 4ZZAA 3MWBA 3DP4A 4QFKA 4NTLA 2XXYA 2I49A 2ZMBA 3W9WA 1MPCA 3H7MA 4BDLA 3S9MC 1CB6A 2I4CA 4HTGA 2F34A 5DEXA 5TP9A 3SESA 1Y3PA 3CSBA 2DWAA 2XXXA 4F3PA 3BFTA 1I6BA 4KHZE 1PB9A 3A3UA 2REJA 4F2QA 1LCFA 3H4ZA 4DCYA 4FORA 4LVQA 4F1YA 2NUVA 4O3BA 3UIFA 1MY4A 4OERA 4IO3A 3TAJA 3CFXA 4TLLB 3PPQA 2F97A 5L9MA 2O51A 1GTKA 1D9YA 4G68B 4NF6A 4P0IA 4KCCA 4ELOA 4EDPA 2HAVA 1N0TA 4Z0IA 2QRYA 3Q29A 1R1NA 1SYHA 1JETA 4HS7A 1MPDA 2ZYOA 1Y4CA 4C1TA 1XOCA 5K2YA 4FEDA 2RCBA 1BLFA 3C33A 4WKMA 4C0RA 1LB8A 2DQVA 3C36A 4EXLA 5L9OA 2I0BA 3QIMA 3FVGA 1SYIA 1TWYA 2I4BA 3HCQA 3PMVA 3FIRA 5H8NA 5I58A 2ZYMA 2H5YA 4WEPA 3QYTA 3EQ1A 3TTKA 4ZE9A 4OFOA 2XXWA 3KN7A 4FAJA 2W7YA 4YICA 1XS5A 1PBPA 4BLAA 3MC2A 2DE2A 5DTBA 2E1SA 3K02A 3MVZA 2I58A 4ZEDA 1IUDA 4G8MA 4G2ZA 1D3KA 2GRVA 5DVJA 1PB7A 4OETA 3TCGA 1MS7A 4QRZA 2XD2A 1FTMA 3FJGA 3S9LC 2GHBA 4RPOA 3T96B 3OOAA 5CM6A 1P1NA 3H6VA 2O6AA 3KN8A 4YKJA 4PETA 1MXUA 2AL5A 2THIA 3M3KA 3T9UA 4FECA 1DTZA 4N6PA 3QSLA 1LFHA 3GLBA 1TT1A 4RY1A 1POY1 2IA4A 3OO9A 2QMXA 4YU0A 4GXSB 5A5XA 2XXVA 1MPBA 3IJXB 4X1BA 1DPPA 2ONKE 5F1QA 1UIVA 3OSQA 2X7PA 2RCAA 1IXIA 4BDMA 2O7IA 5L9SA 3FZVA 3EF7A 1US5A 3CVGA 2XXHA 2OBGA 4MLVA 1B3HA 1JW5A 5I59B 1N7XA 5I2KA 3FATA 5CBRA 3KSJA 4X9TA 3JZJA 2XXRA 5KDTB 3KZGA 1R9QA 1OLCA 4RXLA 3MZBA 4MBPA 1NMUA 3TEPA 2P1SA 1OVTA 2AL4A 3FJ7A 1SI1A 3LR1A 2ONSA 3H3GA 4U23A 3QK6A 1II5A 4F19A 1YTVA 1Q1KA 3DELB 3K1PA 3SEWA 3MBPA 4ZS9A 1DPEA 1AMFA 4JSOA 4GLIA 1VE4A 4DDDA 1QW0A 1MQGA 1NNFA 1FQEA 1YAEA 1O64A 3IOTA 3Q27A 4KD5A 4YKIA 3S9EA 1MY3A 3VV5A 4YMAA 3C4MA 3FVOA 4ESWA 3O2AA 3RN8A 2ZYNA 1GV8A 3K0VA 4EQ9A 2DOJA 4AB5A 3FUZA 3PPNA 1DTGA 4AB6A 1XC1A 4EF1A 1S7YA 3FVNA 3MP8A 4R6HA 3U8QA 5BWJA 3TCHA 4PFYA 3H6UA 4DE8A 5CBSA 1NNPA 1WODA 1EU8A 4FIMA 2DVCA 3CIJA 1M5BA 2KLFA 2DS9A 3SEVA 4AQ4A 1B1XA 4MF3A 4OZ9A 4IO5A 2NWJA 1LCTA 4Q8RA 2Z22A 3PMWA 3BBRA 4H5FA 2ANJA 2YPNA 1Y1MA 4NF4B 3TPAA 1NH7A 1EZOA 1GVCA 1HSLA 3D4GA 1Y3NA 3DP8A 4IO4A 3IX1A 5ELVA 2HXWA 2D3IA 1PDAA 4KYEA 3A09A 4GQOA 2QS3A 3I5OA 1PBQA 2QPQA 1QVSA 2DWIA 4PE5B 5AA4B 4OYVA 3QUJA 1IEJA 3UA8A 3HO7A 2XX7A 4DXBA 4PFUA 2Q88A 3V89B 4IO2A 1TFDA 4JB7A 1LAFE 5KCJB 1ATGA 1ZLQA 3G3KA 1LSTA 4QFLA 1SDXA 4YKKA 2P0SA 1Y1ZA 1ZU0A 3IB1A 3W15C 2D5WA 4DIGA 3CG1A 4RNSA 3IB2A 5AA2D 1BKAA 4NMYA 4Q5TA 4YB5A 4PFWA 4ELPA 2XX9A 4OFLA 4KPTA 3HV1A 1O63A 2H98A 4LONB 1B3EA 1Z7ME 3RGYA 4G8HA 1MH3A 1I6AA 3FV1A 1B5JA 5EHSA 3CI8A 3MPLA 5I56B 3A3CA 3U94A 3KGCA 4C1UA 2NOOA 1Q35A 3G3GA 5B7DA 4FJPA 1UTBB 3IB0A 4U22A 1N76A 4IO6A 4OFJA 1HSEA 3KBRA 4F3SA 2OJTA 4OXVA 3K6XA 2Z8FA 3IO6A 3MP1A 4FEBA 1BP5A 4HCYA 5HM4B 4PQJA 3SKPA 2YLNA 3PD9A 3KEIA 5IKBA 4P11A 1POTA 2H25A 1VFDA 1TXFA 2E0SA 4N13A 2HFBA 1NH8A 1B3LA 1NNKA 4LZ5A 2NVUB 3GXAA 4R72A 4H67A 1NL5A 4KQPA 3OO7A 4ESXA 4ELRA 3ECRA 1B52A 3TODA 4NF5B 2F7BA 4OWDA 1KWHA 2QMWA 1YPNA 1S9TA 5KZTA 5H8FB 3Q25A 3VVEA 1JQFA 1HSJA 3IOUA 5H8QB 1Y3QA 3IK6B 3K6WA 5CMMA 1B4ZA 2CMOA 4X1DA 2G93A 5CMCA 3RQTA 1OQGA 3FGSA 2O68A 3ZS6A 1H76A 4ZEFA 3QXMA 5BUUA 1B40A 2A5TB 2F35A 4KR5A 4WEDA 3D4CA 4XTCQ 3TTMA 2QS4A 4ONYA 5CC2A 3TTLA 2R71A 3V83A 1FQDA 2H4IA 3LBSA 4GOTA 4LA9A 1UIUA 1MH4A 2CZLA 3SEXA 4Q0CA 2WKYA 3MUQA 4OMBA 4I62A 2DSFA 2XXTA 3TQLA 4QF9A 3SERA 3VXCA 3FXUA 2XD3A 1DOTA 1M5FA 1AH5A 5TPAB 3CR9A 3UORA 2XXIA 4H65A 2XX8A 5J1DA 3KOTA 3SDFA 4XKPA 3T9HB 1MY0A 1ZKBA 1QKAA 4OESA 3MPKA 1B58A 5L8DA 3T9XB 3PV0E 1B0HA 4KYSA 1IXCA 3C9HA 1LFGA 3EPEA 3S4UA 1FQFA 5ITPA 1F9BA 1WDNA 1FTJA 2O84X 1A8EA 5DVFA 1B4HA 4BDRA 5LOMA 3G3HA 3QUFA 1FTKA 3OEMA 2ESNA 4XKQA 3TDJA 5I2NB 1B6HA 3RY3A 4NEDA 2V3TA 2Q2AA 3PD8A 1B7HA 4GL0A 1FQAA 5FTIA 2I6EA 2O1MA 5TU0A 1A8FA 1B3FA 5FTHA 1AOVA 1N7WA 5I57A 1Z7NE 4OQOA 1MXXA 3OENA 1A55A 1IXGA 3UGWA 1R9LA 5AE4A 4R6YA 1BIYA 2PX1A 1XVYA 3C31A 3IL1B 4IGTA 3H03A 3B6WA 4JDFA 3E9XA 5AA3A 3OEKA 2UYEA 1M5CA 2ZNTA 3N6TA 4I8CA 2F8DA 4Q30B 4QSDA 4F3BA 3ZKKA 1H43A 2Y7RA 2Z23A 4F29A 2UVIA 2Q2CA 4RA1A 3C35A 4N07A 1URDA 2HEUA 2Z8EA 3TCFA 2V25A 2F6GA 1B7ZA 1USYH 4UA8A 4NF8A 3K1MA 4M1VA 4LATA 1JVYA 4NWDA 3R7XA 1QKBA 1T0KA 3G3JA 2ZNUA 2YJPA 5DVIA 3T93B 3N94A 3N5LA 4QFOA 5DT6A 1A40A 4EF2A 4XXUA 1A99A 3VDFA 3MZ1A 1N04A 4ZDMA 1A7LA 4ZZEA 3T66A 1RKMA 2Y7KA 3PPRA 2RC8A 3SEYA 1RYXA 1PC3A 1Y20A 4POWA 4QSCA 1O7TA 1P1WA 1I6QA 4NF5A 4RPNA 1QUJA 1ZTYA 2DE3A 3V5AA 2HZLA 3PPOA 1QJMA 5H8FA 3KSXA 3P7IA 4MLQA 1SQYA 3DLNA 4NWCA 5H8QA 1OVBA 1P1OA 1FTLA 3G3FA 3OO8A 4JXIA 5ISUA 4ELQA 5JTYB 3IR1A 2H9BA 3W9VA 4PP0A 4TLMB 4G68A 5I58B 1OLAA 4O3CA 3K1NA 1MRPA 4KI0E 3TUSA 3ODBA 3K2DA 2V93A 3VXBA 2R6GE 2RC9A 4R2BA 2GHAA 4RK2A 1NNTA 1LAGE 3ONMA 4GD5A 2B65A 3RTWB 3MP6A 3VLVA 1PEBA 2UXAA 3MVXA 3THIA 1P1UA 2G29A 3IAZA 1MXVA 2UVHA 5AA2B 4JWOA 4LP2B 2GH9A 2AYSA 4I9DA 3E3KA 4K3FA 3I3VA 3IJOB 4QFNA 3EN3A 4E0WA 4R2FA 2LAOA 2QJEA 4IY6A 3JV9A 1JEUA 2VP1A 1URSA 1VR5A 2GFEA 4DZ1A 2FA7A 2Y7PA 2R9JA 4JWYA 1Y9UA 3AXFA 1B05A 3MQ9A 4BDQA 4IGRA 3OO6A 4R9GA 3K6UA 1IZ1A 1GR2A 4XIGQ 1SI0A 2X26A 1IQ7A 1FW0A 3N26A 3PUWE 3O6GA 4JBZA 2D21A 1LFIA 5A5XB 1MY1A 2PT1A 2Y7IA 1H45A 1FTOA 5I2NA 3Q26A 4IY5A 4POXA 1ZIUA 3DP6A 5F7VA 3FV2A 4OVJA 5CRYA 4RYAA 1B1HA 3SETA 1MM7A 1NFTA 1B7UA 4RJZA 1MXYA 3K01A 4L17A 1MY2A 3T22A 4IO7A 1XHYA 3G3IA 4G77A 1SW2A 4ZEBA 1AL3A 1LB9A 2I0CA 3HSTA 4JWXA 1P1QA 2V84A 4I1DA 2O69A 4R73A 3O29A 2OWTA 3VVDA 5H8SA 3TTNA 4H1XA 2F5XA 4H0WA 1RYOA 3KG2A 2ONRA 1L5TA 4F1VA 1MDQA 4OENA 2VD2A 4KCDA 2NXOA 1MXWA 5CI5A 5FHMA 3PPPA 3I6VA 3C32A 2DVZA 3EHSA 1B5HA 5ICQA 1URGA 4F18A 5I59A 2HQ0A 3UP9A 1MQHA 4PFTA 2PYYA 4FE8A 3ILTB 3WAEA 5KDTA 4OHNA 4Z7EA 3EHUA 4LZ8A 1ZMGA 3RT8A 1FQCA 4RK9A 4U2RA 3FVKA 3HN0A 4F1UA 4YB6A 2I3WA 4DCXA 1US4A 5HBCA 4GIZA 3ZKLA 1ZJLA 3FD3A 1H44A 4ZEKA 2ZXTA 2HCAA 3TMGA 1IIWA 3MVYA 3SEUA 2DE4A 4X48A 2A5SA 4LZ7A 4R6KA 4U4SA 3T9VA 5ICTA 3M3FA 4GFRA 3O9PA 3UN6A 3H6TA 4JSDA 3PUVE 3KFMA 5CMKA 2BJJX 4F22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B5IA 4QSEA 3B7DA 1Y4TA 1OQHA 5AA1A 3EKIA 1SVXB 2ZZXA 5EHMA 4OEUA 2GQ1A 1DMBA 1JW1A 3IO4A 2PBWA 2XWOA 1BTJA 3CFZA 1AIVA 4DXCA 2PVUA 2RINA 2HZKA 4ECFA 2ZYKA 4PAIA 3KOSA 4TOZA 4UACA 4YKPA 2RC7A 1MM6A 4G68C 4HW8A 2Q74A 2ALUA 1JP4A 3GZGA 1UQWA 4PF8A 5JTYA 5EYGA 2QSXA 2IEEA 1KZ8A 1M5DA 1N84A 3OSRA 3CG3A 1IXHA 5LDZA 1B0LA 5H8HB 1SPIA 4KYDA 3RUMA 5CMBA 3MJNA 2RF1A 4M4GA 1JVXA 4EXKA 2H99A 3VFJA 4O7MA 4IB2A 3E13X 1NUZA 4OTEA 2I3VA 3U1OA 1A54A 4P8BA 2HPGA 1XVXA 4NF4A 4MFIA 1LBYA 5I84A 2PT2A 5AA2A 2DXRA 1UTHB 4NF0A 4JVCA 1SW1A 3QMFA 3KJTA 4ND9A 3C34A 2RKMA 4DLDA 3JYRA 3FXRA 4NHBA 1DCUA 5AA4A 1LAHE 4G4PA 5B70A 2QL3A 2B3BA 3B6TA 2O1LA 4HCWA 2UVGA 2QFLA 3TQWA 1DBZA 3ILUB 3T0JA 4BDOA 3BFUA 4QFPA 3MZ9A 5ET8A 3TTRA 5KCJA 2AIXA 4R9FA 2VHAA 2WX9A 1H3DA 2DWJA 1YCJA 1P99A 1MDP1 1EH3A 3TZAA 4ZE8A 1KA0A 2OZZA 1SBPA 3KN3A 5IAIA 3QAXA 3OD7A 2WBBA 3VLWA 4XF5A 3RLFE 3OXNA 3VVFA 2FIEA 1LBCA 2OWSA 4EQBA 3O6HA 3VLUA 5FHOA 2OK2A 2QVUA 3HPIA 4MH5A 1EZPA 5EYHA 5DEXB 5EYFA 3H06B 3M8UA 2DDKA 5TP9B 5I56A 4ZEIA 1LGBC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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