5I56A

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
288
structure length
286
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 286
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A02
2ZYOA 5H8QB 2UVJA 3TUSA 2F6GA 1A8FA 2XXVA 2NOOA 1EZOA 1H44A 1MY1A 4YZZA 3SERA 3KFMA 3TYHA 2XD2A 1Q1KA 3F11A 3H6VA 3OEKA 2F5XA 3IO4A 4YAHX 3E4RA 5ITPA 1B5JA 1RYXA 1D9YA 4U1OA 3CSBA 4MFIA 4EF1A 4ZEKA 3MWBA 2QS4A 1LFIA 2V25A 3B6QA 4GOTA 3K2DA 3PUWE 5I56B 4WEPA 3VV5A 1B7UA 2HZKA 4TOZA 2DVCA 4NTLA 1B58A 3QSLA 2Y7WA 2Q89A 5IKBA 1MRPA 4F31B 1DSNA 1B3HA 3H3GA 1WVJA 3OSRA 4DCXA 4AB6A 4EQ9A 1UIVA 3FUZA 3KSXA 3EHUA 3IX1A 3TFLA 4HW8A 4XXUA 3ONMA 2O84X 2O1MA 4KFQA 5I56A 5L9MA 4EXLA 4JSOA 1Y3QA 1OLCA 5BUUA 3DP6A 3K1MA 5ELVA 2A5SA 3UK4A 2P2AA 1M5FA 1QULA 4U22A 2O68A 2O7UA 1N84A 3PMXA 1ZMGA 1S9TA 3OSQA 3C4MA 3RTWB 1ATGA 2D3IA 3O9PA 1Y3NA 3MC2A 4X1DA 3RN8A 4THIA 3C33A 2Z8EA 5JTYB 2ZYNA 1ZJLA 4XKQA 4NF4B 3V8XB 1BP5A 4BDQA 2XX9A 4YMAA 4EDPA 1P1QA 3T66A 2ZNSA 4OWDA 2DP8A 2F78A 3R7XA 2Q2CA 2OLBA 2XXHA 2Y7IA 3TPAA 1P1OA 2H5YA 1FQEA 2O6AA 2WKYA 2UVHA 1US5A 2Z22A 3IJXB 2M8CA 1QVSA 1A40A 1B3GA 4E0XA 5I59B 1Z7NE 2DS9A 1H43A 3FVNA 1TFAA 1JW5A 1B0LA 1FTMA 2F97A 3FD3A 3IOTA 3IB2A 2D5WA 5ITOA 4OFOA 3MPKA 1USYE 3EQ1A 4MF3A 5JTYA 3FJ7A 3ZKKA 2QL3A 4WKMA 1FTOA 1B32A 1XVYA 4KR5A 3BFUA 5AA2D 3PPNA 4RY1A 3C31A 3USDA 4RA1A 4P0IA 2GHBA 4OETA 4BLAA 2V3UA 3N5LA 2R9JA 1MQDA 4FAJA 3IK6B 4ZZAA 1URDA 4F3PA 1P1UA 3E9XA 4YKJA 2D21A 1UTBB 3TDJA 5I59A 4ZECA 1FQAA 2Q9TA 3L6HA 4IY5A 1MQJA 5A5XB 4G8MA 5ICQA 1CE2A 3TMGA 1QKAA 2B65A 2Q88A 4U4SA 5LOMA 3TQWA 3MAMA 3TQLA 4U2RA 3O28A 1LBBA 5I58A 3CFLA 1BIYA 3VVFA 5HPQA 1DPEA 4OYVA 3VLWA 3K6XA 4LP2B 3OO7A 4BDNA 2P0SA 2QS1A 3KOTA 5FHOA 3H7MA 3UP9A 2ZYKA 4RK2A 2F35A 1MG1A 1UTBA 4GL8A 1IEJA 4ELRA 2F7CA 4OTEA 4I9DA 1MPBA 3LUYA 1PBQA 1LFHA 2QS3A 2RC7A 1FTKA 2DWHA 4QHQA 4OEVA 1N04A 3MVZA 4LONB 2ANJA 5H8FB 3O2AA 2PBWA 2I0BA 4PFWA 3LR1A 2XXPA 1ZBMA 1BKAA 4Q8RA 3V5AA 5FHNA 4NMYA 1DOTA 1VFEA 5CMMA 2ZXTA 1HSLA 2XD3A 1B7ZA 2ABHA 3VDFA 3OOAA 2DE4A 1M5BA 3FV2A 4BDRA 4QFPA 4HCWA 1YTVA 3PPQA 1POTA 1LAXA 1FQFA 4R6KA 3VVDA 2XXIA 2QS2A 2V3TA 3JV9A 4ONYA 4G8NA 3CFZA 3QXMA 3CVGA 2QRYA 4G68B 3TCGA 5F7VA 4GXSB 3G3JA 3K6VA 3UA8A 3DM0A 2DQVA 5H8FA 2I0CA 1BTJA 3IR1A 3TELA 3DP4A 3K6UA 3SEUA 3MJNA 1S7YA 3FJMA 4JSDA 3FASA 3QK6A 1LB8A 3PD9A 5AA3A 4F19A 2O51A 1Y1MA 3KN8A 2F7BA 4PFUA 4GFRA 3CG3A 5EHMA 4U1ZA 4R72A 4OESA 5EHSA 4H65A 1MQHA 4I8CA 4ZEFA 2DWAA 3H6WA 4F1YA 1JEVA 1QW0A 3A09A 4G68A 3VFJA 5DEXB 3HPIA 4H0WA 1D4NA 1LLSA 3R26A 4ELPA 4R73A 3GBAA 1I6QA 4NF6B 4M4GA 3HV1A 1IQ7A 1GTKA 3OO6A 5AA2A 2HAUA 3WAEA 2DWJA 3OEMA 3TKDA 2XX8A 1FQCA 1DMBA 4YMBA 3RT8A 3SETA 1EZ9A 1JVYA 3OXNA 3G3KA 4IGTA 1SW4A 3BBRA 2AL5A 5K2XA 1IITA 1MPCA 2IA4A 1S50A 3K1PA 4F29A 1CB6A 4XIGQ 4H8IA 1HSJA 5DEXA 1HSEA 1LBCA 1T0KA 4RK9A 2LAOA 1B3EA 3LSXA 1A55A 1Y4CA 2OK2A 3O6HA 4GIZA 1QUIA 4KYDA 2HAVA 1Y20A 3SESA 3GBBA 3KN7A 1OLAA 3VVEA 2ESNA 1A7LA 4NWCA 1FW0A 3H6UA 3C34A 2XXUA 3MW0A 1NNKA 5KCJB 4QFNA 4PQJA 1FQDA 5H8QA 2HCAA 2RINA 1FTLA 1B2HA 3K4UA 1KWHA 1OQGA 4R6HA 1OIBA 1RYOA 1ZLQA 4LZ7A 2OJTA 4FIMA 3QUFA 1ZIUA 2P1SA 4AB5A 3FXQA 3TODA 3CSGA 5I84A 4MH5A 5CRYA 1MXVA 2VHAA 4OQOA 1B40A 3KZGA 4ND9A 1MM6A 5KZTA 3PPRA 3MVXA 1NNTA 4OZ9A 1ZTYA 5H8SA 2B3BA 2V84A 4EF2A 4OVJA 1DPPA 3A3UA 4TQUQ 5AA4B 3IB1A 5KCJA 3FJGA 2F6PA 2V93A 4F3SA 2I49A 2RCBA 4ZEIA 2NXOA 1N7WA 1SD3A 4MLVA 3DELB 2VGQA 1TXFA 3QIMA 4JBZA 3HN0A 3TTLA 3Q26A 3B6TA 1UTHB 4FECA 4ZE8A 1O63A 1B1HA 4MBPA 3M3LA 1NNPA 3MZ9A 4OXVA 1DTGA 1N0TA 4KQPA 1SVXB 2XXRA 4YICA 3T9VA 4FORA 3OO9A 2FA7A 4DDDA 1SW5A 2RCAA 3Q25A 4MLQA 4GQOA 4GD5A 2PT1A 4I1DA 1B3FA 4G2ZA 3M3KA 5I2KB 1PC3A 3W9WA 1USYH 4LVQA 2DXYA 3PUZE 4WXJA 3H4ZA 5CMCA 4F18A 1MXXA 3TCHA 4RNSA 4KCCA 2UVIA 2AIXA 1JEUA 4F3GA 1B9JA 3JZJA 2ZYMA 3ODBA 2DE3A 4RPOA 5I2NB 4GLIA 4PFTA 3C32A 3TTKA 3TEPA 3SKPA 4HCYA 4QFLA 3MUQA 5DT6A 3N26A 1SBPA 1SYHA 1PB9A 4NF4A 4ESWA 5DVIA 3C9HA 4IGRA 1N3WA 1POY1 1Q35A 3N94A 1H3DA 1EU8A 4RXLA 2AYSA 2HXWA 5I57B 3KG2A 2ONKE 2O1LA 4QFOA 1OQHA 3TTMA 5I2KA 3KBRA 3MPLA 2YLNA 1JW4A 1NNFA 1LCTA 1NFTA 2UXAA 4TLMB 5CBRA 5JEIA 4H1XA 5DTBA 4H5FA 4RYAA 4QF9A 4GXAA 3GLBA 2E0SA 2R6GE 5TPAB 1RKMA 1B3LA 2REGA 4YB5A 4EQ7A 3O97A 5IAIA 4IO7A 2X7PA 4C0RA 5B7DA 1II5A 3Q28A 1ELJA 1B5IA 1TFDA 1AOVA 2Y7RA 3OENA 1LSTA 1MY0A 3O6GA 3U8QA 4IO6A 2RC9A 2Z23A 3GZGA 1R9QA 3B6WA 5I57A 2PT2A 4X9TA 4QSCA 2FYIA 4HS7A 2X26A 3RNNA 4L17A 4LQ5A 4RJZA 2XXQA 4H67A 4UACA 1B4ZA 1PDAA 4Z0IA 4IB2A 4OMBA 3N6TA 3MP1A 5A5XA 1NH8A 2CZLA 3OO8A 4KHZE 2Y84A 1WODA 4IO3A 2G93A 4G77A 2DE2A 3T96B 4P11A 5FTIA 4KD5A 3OELA 1JW1A 2G29A 2V3QA 2HZLA 1JNFA 1H76A 4NE4A 1GR2A 3HO7A 3U72A 1QUKA 2HQ0A 5TU0A 3IJOB 2W7YA 4Q30B 4YB7A 4ESXA 5M2VA 4KYEA 1B7HA 2Q8JA 4NF5B 3LC8A 2X7QA 4DIGA 1PBPA 1MPDA 5JK4A 1M5EA 4R2BA 4N6PA 1QKBA 1N76A 4EQBA 3PU5A 3RY3A 2ZMBA 3PUXE 4H6DA 1SQYA 2I3VA 1MXZA 3Q27A 3L6GA 2A5TB 3IOVA 2I6EA 4GL0A 1A8EA 4PFYA 3V89B 1JETA 2H99A 3ZKLA 4JDFA 4NEDA 1P99A 2DWIA 4R6YA 1A99A 1B6HA 5CBSA 4C1TA 4M1VA 3SEVA 4PETA 2GRVA 1LGBC 4AQ4A 3MBPA 1LCFA 4N07A 4O3BA 1LAGE 2REJA 5BWJA 1EZPA 3ECRA 3G3IA 5L9OA 1OVTA 4POWA 2GFEA 2HFBA 2PX1A 5DVJA 2OWSA 1AL3A 3RT6B 5ISUA 1B0HA 1FQBA 3QUJA 4ZE9A 4LZ8A 1PB8A 1M5DA 2OZZA 3IORA 3B7DA 3U93A 2GH9A 3IO6A 3MQ9A 2DSFA 3PUYE 1IXCA 4KCDA 1XT8A 4ZEBA 1QUJA 4Z7EA 3I3VA 4YKIA 3IB0A 1ZU0A 3IAZA 2UYEA 3ZSFA 3S9EA 2O69A 3H6TA 4OFJA 4F3BA 3QAXA 1TT1A 3HCQA 3S9MC 4HTGA 3BFTA 2I4CA 1B51A 4OHNA 4E0WA 3VLVA 4DZ1A 1L5TA 4X48A 1MY3A 1XVXA 3H06B 4DCYA 3FVKA 1VR5A 1AIVA 3VLUA 3RQTA 4LZ5A 3RUMA 5CMBA 4F39A 4EUOA 1GGGA 3C36A 1AMFA 1YPNA 4FEBA 3WAFA 1P1NA 3R6UA 1DTZA 3UGWA 3IL1B 1LB9A 4ELOA 1MDQA 2RC8A 1GVCA 3G3HA 3E3KA 3DP8A 4NF6A 3QYTA 1MQIA 1VE4A 3G3FA 2NVUB 2VD3A 5CC2A 3K1NA 3T9HB 2F7AA 4LUBA 3CRBA 3FVGA 1SI1A 4U21A 3FGSA 3FVOA 1IXIA 4OERA 4R9FA 1N7XA 4K3FA 1B52A 1URGA 5DYHA 1SI0A 3K0VA 3KOSA 4XKPA 1B5HA 3PD8A 2QSXA 3PPPA 5CI5A 1ANFA 4XKNA 1JQFA 3MZ1A 5HBCA 3VXBA 1URSA 4KI0E 5AA1A 2PYYA 1MXWA 3S2VA 4ZEDA 5L9SA 4IY6A 4R75A 4GVOA 2ZNTA 1I6BA 1MDP1 1SW1A 2H4IA 5FTHA 2OBGA 2DYXA 3KJ7A 1Y1ZA 4IO2A 3D4GA 4YU0A 1OMPA 3PUVE 3CG1A 4R9GA 4I62A 3TTRA 4F2QA 1MS7A 4FATA 3HHGA 1J1NA 4ZS9A 4PP0A 2F8DA 3K01A 3RLFE 4BDMA 4DXBA 1FCKA 5TP9B 3I5OA 1O7TA 3RTFB 5K2YA 1Z7ME 3G3GA 1IXHA 1Y4TA 1B05A 3THIA 2RF1A 3H03A 3I6VA 3PMVA 2DXRA 3OMBA 1FTJA 1R6ZA 3PV0E 2NWJA 4OEUA 1F9BA 3RPWA 4F1VA 2XXWA 4GF8A 4DLDA 1MM7A 1VFDA 3RGYA 3MP6A 3S9LC 4H8JA 2QMXA 1AH5A 5FHMA 3HSTA 1H45A 1QJMA 4KYSA 2YPNA 3U1OA 3KEIA 3O66A 1XS5A 2Y7KA 3OD7A 4RPNA 3U92A 4FJPA 3U94A 2OCUA 2O7IA 4C1UA 1MXUA 3IOUA 1VSOA 4LQ2A 5AA4A 4DE8A 3FXRA 2E1SA 3S9NC 1R9LA 3M8UA 3Q29A 3MVWA 3T9UA 1US4A 4JWXA 3EN3A 2XHDA 5TP9A 1IZ1A 3T93B 4ZDMA 4OFLA 1N3XA 4YB6A 3SEYA 3G7WA 3KSJA 1JVXA 5CM6A 1NH7A 1IIWA 3MVYA 3PGFA 3BKIB 3M3FA 5ICTA 1UTHA 4Q0CA 3T22A 2NUVA 4Q5TA 1OVBA 3W15C 3ZS6A 1B46A 3VXCA 2I3WA 5DVFA 3KJTA 4R74A 3CIJA 1UQWA 2H98A 3DLNA 4IO4A 1B4HA 5I58B 2B3FA 3K02A 3CI8A 1BLFA 2RKMA 3TTNA 2KLFA 4NWDA 1D3KA 4X1BA 2GHAA 4G8HA 1IXGA 1SW2A 4U23A 3TCFA 4P0GA 3O6IA 5I2NA 3EHSA 4UA8A 1I6AA 2HEUA 2VOZA 3ILTB 1NMUA 4PE5B 3SDFA 3SEWA 4OENA 1R1NA 4JXIA 4FE8A 3AXFA 4QSEA 5CMKA 2UVGA 4DXCA 2ONSA 1XHYA 3MP8A 2PMSA 4F2OA 4JB7A 1YCJA 3KGCA 1D9VA 4XTCQ 2DVZA 1WDNA 3FATA 2I4BA 3JYRA 4GWOA 2XXTA 4R2FA 3O29A 2QMWA 3TZAA 1LAHE 3MZBA 2H9BA 2XXYA 2YJPA 2H25A 3E13X 4BDLA 3FV1A 3K00A 2AL4A 4ZZEA 2ONRA 2F36A 4TLLB 5TPAA 3V83A 4QRZA 4ISUA 1UIUA 4O3CA 5H8NB 3FIRA 1MH4A 2THIA 4EXKA 4ECFA 1XOCA 4POXA 3CR9A 4BDOA 2XXXA 4F1UA 2QJEA 3LSLA 2ALUA 4G68C 1MY4A 1ZKBA 2OWTA 3LSWA 4F22A 3LBSA 4DXUA 4QSDA 1YAEA 2R71A 3T9XB 1LAFE 3TAJA 4O3AA 1PB7A 2UYFA 5J1DA 3ILUB 1MQGA 1Y3PA 1SDXA 2DOJA 3EPEA 2Q2AA 3N6UA 1SYIA 1NL5A 3HHFA 5KDTB 1O64A 3GXAA 4H5GA 2I48A 1I69A 5B70A 5H8HB 5H8NA 3CFXA 1MXYA 4G4PA 3K6WA 4NF5A 3UN6A 4YKKA 1XC1A 4JWYA 4XKRA 4NF8B 3S4UA 3LSFB 4LA9A 4JWOA 4WEDA 1M5CA 3SEXA 4LATA 5AA2B 1EH3A 3VE1B 1LFGA 1P1WA 3A3CA 2A5TA 1PEBA 3UORA 2ZNUA 2FNCA 3UIFA 2Y7PA 2Z8FA 3EHTA 2I58A 2BJJX 3PPOA 1IUDA 4ELQA 5KDTA 1Y9UA 1A54A 4KPTA 5H8HA 2F34A 3EF7A 1B1XA 4QFKA 1TWYA 1GV8A 2QPQA 2VD2A 2XX7A 2Z8DA 2VP1A 3KN3A 5L8DA 2IEEA 5HM4B 2CMOA 2PVUA 4N13A 4NF8A 3P7IA 1NKXA 1MH3A 3PMWA 1MY2A 5EYFA 4IO5A 3IOWA 4YKPA 4GRKA 3W9VA 4FEDA 5F1QA 3FZVA 3D4CA 5AE4A 3FXUA 3C35A 4U4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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